FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0641, 1271 aa 1>>>pF1KA0641 1271 - 1271 aa - 1271 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8156+/-0.00109; mu= -4.0981+/- 0.065 mean_var=514.4670+/-108.537, 0's: 0 Z-trim(116.1): 222 B-trim: 92 in 1/54 Lambda= 0.056545 statistics sampled from 16421 (16646) to 16421 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.788), E-opt: 0.2 (0.511), width: 16 Scan time: 5.110 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS58607.1 AATK gene_id:9625|Hs108|chr17 (1271) 8733 728.3 3.1e-209 CCDS45807.1 AATK gene_id:9625|Hs108|chr17 (1374) 8733 728.3 3.2e-209 CCDS46136.1 LMTK3 gene_id:114783|Hs108|chr19 (1489) 1490 137.5 2.5e-31 CCDS5654.1 LMTK2 gene_id:22853|Hs108|chr7 (1503) 1231 116.4 5.8e-25 >>CCDS58607.1 AATK gene_id:9625|Hs108|chr17 (1271 aa) initn: 8733 init1: 8733 opt: 8733 Z-score: 3870.0 bits: 728.3 E(32554): 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CCDS46 TLPFLLIMEFCQLGDLKRYLRAQRPPEGLSPELPPRDLRTLQRMGLEIARGLAHLHSHNY 240 250 260 270 280 290 150 160 170 180 190 200 pF1KA0 VHSDLALRNCLLTADLTVKIGDYGLAHCKYREDYFVTADQLWVPLRWIAPELVDEVHSNL :::::::::::::.::::.:::::::: .:.:::..: ..::.:::: ::::. :.:... 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