Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0672
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0672, 818 aa
1>>>pF1KA0672 818 - 818 aa - 818 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.0004+/-0.00123; mu= -21.2166+/- 0.074
mean_var=644.2867+/-131.839, 0's: 0 Z-trim(115.5): 121 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.050528
statistics sampled from 15971 (16078) to 15971 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.767), E-opt: 0.2 (0.494), width: 16
Scan time: 5.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45616.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17 ( 818) 5428 411.1 3.8e-114
CCDS82077.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17 ( 812) 5371 406.9 6.8e-113
CCDS82076.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17 ( 774) 5133 389.6 1.1e-107
CCDS32408.1 ARHGAP17 gene_id:55114|Hs108|chr16 ( 803) 2325 184.9 4.7e-46
CCDS32409.1 ARHGAP17 gene_id:55114|Hs108|chr16 ( 881) 2193 175.3 4e-43
CCDS13952.2 SH3BP1 gene_id:23616|Hs108|chr22 ( 701) 872 78.9 3.2e-14
>>CCDS45616.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17 (818 aa)
initn: 5428 init1: 5428 opt: 5428 Z-score: 2162.7 bits: 411.1 E(32554): 3.8e-114
Smith-Waterman score: 5428; 99.9% identity (99.9% similar) in 818 aa overlap (1-818:1-818)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 KAQQEAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KAQQEAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 KLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 QALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 EMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 DRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDGLRKIQSMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDGLRKIQSMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 PSMQPPAPPAELAAPLPSPLPEQPLDSPAAPALSPSGLGLQPGPERTSTTKSKELSPGSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PSMQPPAPPAELAAPLPSPLPEQPLDSPAAPALSPSGLGLQPGPERTSTTKSKELSPGSA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 QKGSPGSSQGTACAGTQPGAQPGAQPGASPSPSQPPADQSPHTLRKVSKKLAPIPPKVPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QKGSPGSSQGTACAGTQPGAQPGAQPGASPSPSQPPADQSPHTLRKVSKKLAPIPPKVPF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 GQPGAMADQSAGQLSPVSLSPTPPSTPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFT
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GQPGAMADQSAGQPSPVSLSPTPPSTPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 STLSKSRPTPKPRQRPTLPPPQPPTVNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTDLVHFDIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 STLSKSRPTPKPRQRPTLPPPQPPTVNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTDLVHFDIP
730 740 750 760 770 780
790 800 810
pF1KA0 SIHIELGSTLRLSPLEHMRRHSVTDKRDSEEESESTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SIHIELGSTLRLSPLEHMRRHSVTDKRDSEEESESTAL
790 800 810
>>CCDS82077.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17 (812 aa)
initn: 3416 init1: 3335 opt: 5371 Z-score: 2140.3 bits: 406.9 E(32554): 6.8e-113
Smith-Waterman score: 5371; 99.1% identity (99.1% similar) in 818 aa overlap (1-818:1-812)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 KAQQEAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KAQQEAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 KLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 QALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 EMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 DRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDGLRKIQSMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAP
:::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDG------MGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAP
490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 PSMQPPAPPAELAAPLPSPLPEQPLDSPAAPALSPSGLGLQPGPERTSTTKSKELSPGSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PSMQPPAPPAELAAPLPSPLPEQPLDSPAAPALSPSGLGLQPGPERTSTTKSKELSPGSA
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 QKGSPGSSQGTACAGTQPGAQPGAQPGASPSPSQPPADQSPHTLRKVSKKLAPIPPKVPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QKGSPGSSQGTACAGTQPGAQPGAQPGASPSPSQPPADQSPHTLRKVSKKLAPIPPKVPF
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 GQPGAMADQSAGQLSPVSLSPTPPSTPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFT
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GQPGAMADQSAGQPSPVSLSPTPPSTPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFT
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 STLSKSRPTPKPRQRPTLPPPQPPTVNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTDLVHFDIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 STLSKSRPTPKPRQRPTLPPPQPPTVNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTDLVHFDIP
720 730 740 750 760 770
790 800 810
pF1KA0 SIHIELGSTLRLSPLEHMRRHSVTDKRDSEEESESTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SIHIELGSTLRLSPLEHMRRHSVTDKRDSEEESESTAL
780 790 800 810
>>CCDS82076.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17 (774 aa)
initn: 5133 init1: 5133 opt: 5133 Z-score: 2046.8 bits: 389.6 E(32554): 1.1e-107
Smith-Waterman score: 5133; 99.9% identity (99.9% similar) in 772 aa overlap (1-772:1-772)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 KAQQEAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KAQQEAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 KLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 QALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 EMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 DRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDGLRKIQSMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDGLRKIQSMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 PSMQPPAPPAELAAPLPSPLPEQPLDSPAAPALSPSGLGLQPGPERTSTTKSKELSPGSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PSMQPPAPPAELAAPLPSPLPEQPLDSPAAPALSPSGLGLQPGPERTSTTKSKELSPGSA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 QKGSPGSSQGTACAGTQPGAQPGAQPGASPSPSQPPADQSPHTLRKVSKKLAPIPPKVPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QKGSPGSSQGTACAGTQPGAQPGAQPGASPSPSQPPADQSPHTLRKVSKKLAPIPPKVPF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 GQPGAMADQSAGQLSPVSLSPTPPSTPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFT
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GQPGAMADQSAGQPSPVSLSPTPPSTPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 STLSKSRPTPKPRQRPTLPPPQPPTVNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTDLVHFDIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 STLSKSRPTPKPRQRPTLPPPQPPTVNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTAV
730 740 750 760 770
790 800 810
pF1KA0 SIHIELGSTLRLSPLEHMRRHSVTDKRDSEEESESTAL
>>CCDS32408.1 ARHGAP17 gene_id:55114|Hs108|chr16 (803 aa)
initn: 1945 init1: 1324 opt: 2325 Z-score: 940.3 bits: 184.9 E(32554): 4.7e-46
Smith-Waterman score: 2325; 47.5% identity (73.7% similar) in 809 aa overlap (1-788:1-783)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA
::::::::.::::::::::::::::::::::.:.::. :... : .::.:.::.:::.:.
CCDS32 MKKQFNRMKQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQIERRLDTVRSICHHSHKRLVACFQGQHGT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
.:..: ::::::.::: ..:.:. : .:.::::::. ::..:..:: :: . :. ::...
CCDS32 DAERRHKKLPLTALAQNMQEASTQL-EDSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVEKEI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
..::. .:::::::::::::.::.:::: :: :.::.:. :::: ...: .: :.:.
CCDS32 VDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDWDSVRARWNQAHKSSG--TNFQGLPSKIDTLK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
:::.::.:.:: :.:::.::::.:.::: .:...: ::.:.::.::::.:..:. .::..
CCDS32 EEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHRKALAVLEKTLPEM
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 KAQQEAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLK
.:.:. :.:::.:: :::::: ::::::.:::::: .::: ::.::::::.. .:::::
CCDS32 RAHQDKWAEKPAFGTPLEEHLKRSGREIALPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKLK
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 KLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKL
:::::::: . ..:. .::::.::::::::::::::::::.::.:: :...::.:::::
CCDS32 KLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALKSYLRELPEPLMTFNLYEEWTQVASVQDQDKKL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 QALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNIT
: :: .:.::: : :.:::::::.::.. .:::::::::.:::::::::: . ::...
CCDS32 QDLWRTCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKLAQTSDVNKMTPSNIAIVLGPNLLWARNEGTLA
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 EMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPA
:: ...:...:..::::::::::::: :.:::.. . :. .. ..:.: . : : .
CCDS32 EMAAATSVHVVAVIEPIIQHADWFFPEEVEFNVSEAF-VPL-TTPSSNHSFHTGNDSDSG
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KA0 DRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDGLRKIQ---SMGVRVMDTN--WVAR-----RGS
.. .:: :.:. : .. ::.. : . : .: . : .: ...
CCDS32 TLER----KRPASMAV--MEGDLVKKESPPKPKDPVSAAVPAPGRNNSQIASGQNQPQAA
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
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......: . : : : :. :.: : .: . : . :. : :: . .: :
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. .. :: . . :.: .. .. . : .. .: .:. : :::.. .:
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CCDS32 ASKIVTDSNSRVSEPHRSIFPEMHSDSASKDVPGRILLDIDNDTESTAL
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CCDS32 KDPVSAAVPAPGRNNSQIASGQNQPQAAAGSHQLSMGQPHNA-AGPSPHTLRRAVKKPAP
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CCDS32 APPKPGNPPPGHPGGQSSSGTSQ-HPPSLSPKPPTRSPSP----PTQHTGQPPGQ--PSA
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pF1KA0 APPLASPSVFTSTLSKSRPTPKPRQRPTLPPPQPPT--VNLSASSPQSTEAPMLDGMSPG
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CCDS32 PSQLSAPRRYSSSLS-------PIQAPNHPPPQPPTQATPLMHTKPNSQGPPNPMALPSE
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CCDS13 SGADMDKRVKKLPLMALSTTMAESFKELDPDSSMGKALEMSCAIQNQLARILAEFEMTLE
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CCDS13 RDVLQPLSRLSEEELPAILKHKKSLQKLVSDWNTLKSRLSQATKNSGSSQGLGGSPGSHS
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CCDS13 HTTMANKVETLKEEEEELKRKVEQCRDEYLADLYHFVTKEDSYANYFIRLLEIQADYHRR
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CCDS13 SLSSLDTALAELRENHGQADHSPSMTATHFPRVYGVSLATHLQELGREIALPIEACVMML
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]