Result of FASTA (omim) for
pF1KA0672
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0672, 818 aa
1>>>pF1KA0672 818 - 818 aa - 818 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 18.6828+/-0.0005; mu= -43.1650+/- 0.031
mean_var=781.6071+/-161.260, 0's: 0 Z-trim(123.6): 279 B-trim: 0 in 0/62
Lambda= 0.045875
statistics sampled from 43538 (43846) to 43538 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.781), E-opt: 0.2 (0.514), width: 16
Scan time: 12.470
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_060524 (OMIM: 608293) rho GTPase-activating pro ( 803) 2325 169.6 5e-41
NP_001006635 (OMIM: 608293) rho GTPase-activating ( 881) 2193 160.9 2.3e-38
XP_011544180 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 835) 1329 103.7 3.6e-21
XP_016878879 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 794) 1323 103.3 4.5e-21
XP_011544179 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 836) 1197 94.9 1.5e-18
XP_011544178 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 872) 1197 94.9 1.6e-18
XP_011544177 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 885) 1197 94.9 1.6e-18
XP_011544176 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 912) 1197 95.0 1.7e-18
XP_011544175 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 913) 1197 95.0 1.7e-18
XP_011538317 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 359) 395 41.7 0.0071
XP_011538313 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 565) 403 42.3 0.0073
XP_016871961 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 552) 402 42.2 0.0074
XP_016871960 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 552) 402 42.2 0.0074
XP_011538314 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 552) 402 42.2 0.0074
XP_016871965 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 414) 395 41.7 0.008
NP_001242955 (OMIM: 610585) rho GTPase-activating ( 608) 402 42.3 0.0081
XP_016871962 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 420) 395 41.7 0.0081
XP_005270071 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 624) 402 42.3 0.0083
XP_011538307 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 624) 402 42.3 0.0083
XP_011538308 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 661) 403 42.3 0.0083
XP_011538315 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 436) 395 41.7 0.0084
XP_011538309 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 637) 402 42.3 0.0084
XP_016871959 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 655) 402 42.3 0.0086
NP_112595 (OMIM: 610586) rho GTPase-activating pro ( 655) 402 42.3 0.0086
XP_011530602 (OMIM: 610586) PREDICTED: rho GTPase- ( 653) 401 42.2 0.009
NP_001036134 (OMIM: 610586) rho GTPase-activating ( 653) 401 42.2 0.009
NP_067049 (OMIM: 610585) rho GTPase-activating pro ( 698) 402 42.3 0.0091
NP_001274734 (OMIM: 610586) rho GTPase-activating ( 663) 401 42.2 0.0091
NP_001242954 (OMIM: 610585) rho GTPase-activating ( 704) 402 42.3 0.0092
XP_011538306 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 704) 402 42.3 0.0092
NP_001242953 (OMIM: 610585) rho GTPase-activating ( 714) 402 42.3 0.0093
XP_011538305 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 720) 402 42.3 0.0094
XP_011538304 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase- ( 720) 402 42.3 0.0094
>>NP_060524 (OMIM: 608293) rho GTPase-activating protein (803 aa)
initn: 1945 init1: 1324 opt: 2325 Z-score: 857.6 bits: 169.6 E(85289): 5e-41
Smith-Waterman score: 2325; 47.5% identity (73.7% similar) in 809 aa overlap (1-788:1-783)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA
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NP_060 MKKQFNRMKQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQIERRLDTVRSICHHSHKRLVACFQGQHGT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
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NP_060 DAERRHKKLPLTALAQNMQEASTQL-EDSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVEKEI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
..::. .:::::::::::::.::.:::: :: :.::.:. :::: ...: .: :.:.
NP_060 VDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDWDSVRARWNQAHKSSG--TNFQGLPSKIDTLK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
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NP_060 EEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHRKALAVLEKTLPEM
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 KAQQEAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLK
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NP_060 RAHQDKWAEKPAFGTPLEEHLKRSGREIALPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKLK
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 KLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKL
:::::::: . ..:. .::::.::::::::::::::::::.::.:: :...::.:::::
NP_060 KLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALKSYLRELPEPLMTFNLYEEWTQVASVQDQDKKL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 QALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNIT
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NP_060 QDLWRTCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKLAQTSDVNKMTPSNIAIVLGPNLLWARNEGTLA
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 EMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPA
:: ...:...:..::::::::::::: :.:::.. . :. .. ..:.: . : : .
NP_060 EMAAATSVHVVAVIEPIIQHADWFFPEEVEFNVSEAF-VPL-TTPSSNHSFHTGNDSDSG
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KA0 DRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDGLRKIQ---SMGVRVMDTN--WVAR-----RGS
.. .:: :.:. : .. ::.. : . : .: . : .: ...
NP_060 TLER----KRPASMAV--MEGDLVKKESPPKPKDPVSAAVPAPGRNNSQIASGQNQPQAA
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
pF1KA0 SAGRKVSCAPPSMQPPAPPAEL--AAPLPSPLPEQPLDSPAA-PA-LSPSGLGLQPGPER
......: . : : : :. :.: : .: . : . :. : :: . .: :
NP_060 AGSHQLSMGQPHNAAGPSPHTLRRAVKKPAPAPPKPGNPPPGHPGGQSSSGTSQHP-PSL
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 TSTTKSKELSPGSAQKGSPGSSQGTACAGTQPGAQPGA-QPGASPS--PSQPPADQSP--
. .. :: . . :.: .. .. . : .. .: .:. : :::.. .:
NP_060 SPKPPTRSPSPPTQHTGQPPGQPSAPSQLSAPRRYSSSLSPIQAPNHPPPQPPTQATPLM
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 HTLRKVSKKLAPIPPKVPFGQPGAMADQSAGQLSPVSLSPTPPSTPSPYGLSYPQGYSLA
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NP_060 HT-----KPNSQGPPN-PMALPSEHGLEQPSHTPP--QTPTPPSTP-PLGKQNP---SLP
650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 SGQLSPAAAPPLASPSVFTSTLSKSRPTPKPRQRPTLPPP-QPPTVNLSASSPQSTEAPM
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NP_060 APQTLAGGNPETAQPH--AGTLPRPRPVPKPRNRPSVPPPPQPPGVHSAGDSSLTNTAPT
700 710 720 730 740 750
770 780 790 800 810
pF1KA0 LDGMSPGESMSTDLVHFDI-PSIHIELGSTLRLSPLEHMRRHSVTDKRDSEEESESTAL
. . . .. : .: : .: . .:
NP_060 ASKIVTDSNSRVSEPHRSIFPEMHSDSASKDVPGRILLDIDNDTESTAL
760 770 780 790 800
>>NP_001006635 (OMIM: 608293) rho GTPase-activating prot (881 aa)
initn: 1963 init1: 1324 opt: 2193 Z-score: 809.7 bits: 160.9 E(85289): 2.3e-38
Smith-Waterman score: 2432; 51.3% identity (76.0% similar) in 772 aa overlap (1-759:1-736)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA
::::::::.::::::::::::::::::::::.:.::. :... : .::.:.::.:::.:.
NP_001 MKKQFNRMKQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQIERRLDTVRSICHHSHKRLVACFQGQHGT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
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NP_001 DAERRHKKLPLTALAQNMQEASTQL-EDSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVEKEI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
..::. .:::::::::::::.::.:::: :: :.::.:. :::: ...: .: :.:.
NP_001 VDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDWDSVRARWNQAHKSSG--TNFQGLPSKIDTLK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
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NP_001 EEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHRKALAVLEKTLPEM
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 KAQQEAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLK
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NP_001 RAHQDKWAEKPAFGTPLEEHLKRSGREIALPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKLK
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 KLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKL
:::::::: . ..:. .::::.::::::::::::::::::.::.:: :...::.:::::
NP_001 KLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALKSYLRELPEPLMTFNLYEEWTQVASVQDQDKKL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 QALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNIT
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NP_001 QDLWRTCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKLAQTSDVNKMTPSNIAIVLGPNLLWARNEGTLA
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 EMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPA
:: ...:...:..::::::::::::: :.:::.. . :. .. ..:.: . : : .
NP_001 EMAAATSVHVVAVIEPIIQHADWFFPEEVEFNVSEAF-VPL-TTPSSNHSFHTGNDSDSG
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 DRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDGLRKIQSMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAP
.. .:: :.:. : .. ::. :.::..:: . . :::.. .::
NP_001 TLER----KRPASMAV--MEGDLVKKE------SFGVKLMDFQ-AHRRGGTLNRK--HIS
480 490 500 510 520
550 560 570 580 590
pF1KA0 PSMQPPAPPAELAAPLPSPLPEQPLDSPAAPALS-----PSGLG-LQPGPERTSTTKSKE
:..::: ::.. .. .:. :: : .: : . : ::. : :. :: . . :
NP_001 PAFQPPLPPTDGSTVVPAG-PEPPPQSSRAESSSGGGTVPSSAGILEQGPSPGDGSPPKP
530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 LSPGSAQKGSPGSSQGTACAG-TQPGAQPGAQPGASPSPSQPPADQSPHTLRKVSKKLAP
.: :: .:: ... .: .:: : :.. . .: . : ::::::.. :: ::
NP_001 KDPVSAAVPAPGRNNSQIASGQNQPQAAAGSHQLSMGQPHNA-AGPSPHTLRRAVKKPAP
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700
pF1KA0 IPPKV---PFGQPGAMADQSAGQLSPVSLSPTPPS-TPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAA
::: : :.::........: : :::: ::. .::: : . :: :.:
NP_001 APPKPGNPPPGHPGGQSSSGTSQ-HPPSLSPKPPTRSPSP----PTQHTGQPPGQ--PSA
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 APPLASPSVFTSTLSKSRPTPKPRQRPTLPPPQPPT--VNLSASSPQSTEAPMLDGMSPG
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NP_001 PSQLSAPRRYSSSLS-------PIQAPNHPPPQPPTQATPLMHTKPNSQGPPNPMALPSE
700 710 720 730 740
770 780 790 800 810
pF1KA0 ESMSTDLVHFDIPSIHIELGSTLRLSPLEHMRRHSVTDKRDSEEESESTAL
NP_001 HGLEQPSHTPPQTPTPPSTPPLGKQNPSLPAPQTLAGGNPETAQPHAGTLPRPRPVPKPR
750 760 770 780 790 800
>>XP_011544180 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase-acti (835 aa)
initn: 1931 init1: 1034 opt: 1329 Z-score: 501.0 bits: 103.7 E(85289): 3.6e-21
Smith-Waterman score: 2251; 45.7% identity (70.9% similar) in 841 aa overlap (1-788:1-815)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA
::::::::.::::::::::::::::::::::.:.::. :... : .::.:.::.:::.:.
XP_011 MKKQFNRMKQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQIERRLDTVRSICHHSHKRLVACFQGQHGT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
.:..: ::::::.::: ..:.:. : .:.::::::. ::..:..:: :: . :. ::...
XP_011 DAERRHKKLPLTALAQNMQEASTQL-EDSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVEKEI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
..::. .:::::::::::::.::.:::: :: :.::.:. :::: ...: .: :.:.
XP_011 VDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDWDSVRARWNQAHKSSG--TNFQGLPSKIDTLK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
:::.::.:.:: :.:::.::::.:.::: .:...: ::.:.::.::::.:..:. .::..
XP_011 EEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHRKALAVLEKTLPEM
180 190 200 210 220 230
250 260
pF1KA0 KAQQ--------------------------------EAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREI
.:.: . :.:::.:: :::::: :::::
XP_011 RAHQGSPLNPLACVDEVWCRCSVPLQLLGSLSWCHLDKWAEKPAFGTPLEEHLKRSGREI
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 AFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLKKLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALK
:.:::::: .::: ::.::::::.. .::::::::::::: . ..:. .::::.:::::
XP_011 ALPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKLKKLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALK
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 SYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKLQALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKL
:::::::::::::.::.:: :...::.:::::: :: .:.::: : :.:::::::.::
XP_011 SYLRELPEPLMTFNLYEEWTQVASVQDQDKKLQDLWRTCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKL
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 SEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNITEMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGE
.. .:::::::::.:::::::::: . ::...:: ...:...:..::::::::::::: :
XP_011 AQTSDVNKMTPSNIAIVLGPNLLWARNEGTLAEMAAATSVHVVAVIEPIIQHADWFFPEE
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 IEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPADRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDG
.:::.. . :. .. ..:.: . : : . .. .:: :.:. : .. ::..
XP_011 VEFNVSEAF-VPL-TTPSSNHSFHTGNDSDSGTLER----KRPASMAV--MEGDLVKKES
480 490 500 510 520
510 520 530 540 550
pF1KA0 LRKIQ---SMGVRVMDTN--WVAR-----RGSSAGRKVSCAPPSMQPPAPPAEL--AAPL
: . : .: . : .: .........: . : : : :.
XP_011 PPKPKDPVSAAVPAPGRNNSQIASGQNQPQAAAGSHQLSMGQPHNAAGPSPHTLRRAVKK
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 PSPLPEQPLDSPAA-PA-LSPSGLGLQPGPERTSTTKSKELSPGSAQKGSPGSSQGTACA
:.: : .: . : . :. : :: . .: : . .. :: . . :.: .. ..
XP_011 PAPAPPKPGNPPPGHPGGQSSSGTSQHP-PSLSPKPPTRSPSPPTQHTGQPPGQPSAPSQ
590 600 610 620 630 640
620 630 640 650 660
pF1KA0 GTQPGAQPGA-QPGASPS--PSQPPADQSP--HTLRKVSKKLAPIPPKVPFGQPGAMADQ
. : .. .: .:. : :::.. .: :: : . ::. :.. :. . .
XP_011 LSAPRRYSSSLSPIQAPNHPPPQPPTQATPLMHT-----KPNSQGPPN-PMALPSEHGLE
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670 680 690 700 710 720
pF1KA0 SAGQLSPVSLSPTPPSTPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFTSTLSKSRPT
. .. : .::::::: : : . : :: . : .. : :.: ..:: . ::.
XP_011 QPSHTPP--QTPTPPSTP-PLGKQNP---SLPAPQTLAGGNPETAQPH--AGTLPRPRPV
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730 740 750 760 770 780
pF1KA0 PKPRQRPTLPPP-QPPTVNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTDLVHFDI-PSIHIELG
::::.::..::: ::: :. ...: .. :: . . . .. : .: : .: . .
XP_011 PKPRNRPSVPPPPQPPGVHSAGDSSLTNTAPTASKIVTDSNSRVSEPHRSIFPEMHSDSA
760 770 780 790 800 810
790 800 810
pF1KA0 STLRLSPLEHMRRHSVTDKRDSEEESESTAL
:
XP_011 SKDVPGRILLDIDNDTESTAL
820 830
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10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MKKQFNRMRQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQQGA
::::::::.::::::::::::::::::::::.:.::. :... : .::.:.::.:::.:.
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10 20 30 40 50 60
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.:..: ::::::.::: ..:.:. : .:.::::::. ::..:..:: :: . :. ::...
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70 80 90 100 110
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pF1KA0 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
..::. .:::::::::::::.::.:::: :: :.::.:. :::: ...: .: :.:.
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:::.::.:.:: :.:::.::::.:.::: .:...: ::.:.::.::::.:..:. .::..
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.:.: . :.:::.:: :::::: :::::
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270 280 290 300 310 320
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:.:::::: .::: ::.::::::.. .::::::::::::: . ..:. .::::.:::::
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330 340 350 360 370 380
pF1KA0 SYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKLQALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKL
:::::::::::::.::.:: :...::.:::::: :: .:.::: : :.:::::::.::
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.. .:::::::::.:::::::::: . ::...:: ...:...:..::::::::::::: :
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450 460 470 480 490 500
pF1KA0 IEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPADRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDG
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pF1KA0 LRKIQ---SMGVRVMDTN--WVAR-----RGSSAGRKVSCAPPSMQPPAPPAEL--AAPL
: . : .: . : .: .........: . : : : :.
XP_016 PPKPKDPVSAAVPAPGRNNSQIASGQNQPQAAAGSHQLSMGQPHNAAGPSPHTLRRAVKK
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 PSPLPEQPLDSPAA-PA-LSPSGLGLQPGPERTSTTKSKELSPGSAQKGSPGSSQGTACA
:.: : .: . : . :. : :: . .: : . .. :: . . :.: .. ..
XP_016 PAPAPPKPGNPPPGHPGGQSSSGTSQHP-PSLSPKPPTRSPSPPTQHTGQPPGQPSAPSQ
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. : .. .: .:. : :::.. .: :: : . ::. :.. :. . .
XP_016 LSAPRRYSSSLSPIQAPNHPPPQPPTQATPLMHT-----KPNSQGPPN-PMALPSEHGLE
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670 680 690 700 710 720
pF1KA0 SAGQLSPVSLSPTPPSTPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFTSTLSKSRPT
. .. : .::::::: : : . : :: . : .. : :.: . .:: . ::.
XP_016 QPSHTPP--QTPTPPSTP-PLGKQNP---SLPAPQTLAGGNPETAQPHA--GTLPRPRPV
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730 740 750 760 770 780
pF1KA0 PKPRQRPTLPPP-QPPTVNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTDLVHFDIPSIHIELGS
::::.::..::: ::: :. ...: .. ::
XP_016 PKPRNRPSVPPPPQPPGVHSAGDSSLTNTAPTASKIVTDV
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pF1KA0 TLRLSPLEHMRRHSVTDKRDSEEESESTAL
>>XP_011544179 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase-acti (836 aa)
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pF1KA0 KSLTLLQAVLPQIKAQQ--------------------------------EAWVEKPSFGK
:.:..:. .::...:.: . :.:::.::
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:::::: ::::::.:::::: .::: ::.::::::.. .::::::::::::: . ..:
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. .::::.::::::::::::::::::.::.:: :...::.:::::: :: .:.::: :
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pF1KA0 NNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNITEMMTTVSLQIVGIIE
:.:::::::.::.. .:::::::::.:::::::::: . ::...:: ...:...:..::
XP_011 VNFRYLIKFLAKLAQTSDVNKMTPSNIAIVLGPNLLWARNEGTLAEMAAATSVHVVAVIE
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::::::::::: :.:::.. . :. .. ..:.: . : : . .. .:: :.:
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pF1KA0 TDNMMLEFYKKDGLRKIQSMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAPPSMQPPAPPAELAAP
. : .. ::. :.::..:: . . :::.. .:: :..::: ::.. ..
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.:. :: : .: : . : ::. : :. :: . . : .: :: .:: ..
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. .: .:: : :.. . .: . : ::::::.. :: :: ::: : :.::.
XP_011 SQIASGQNQPQAAAGSHQLSMGQPHNA-AGPSPHTLRRAVKKPAPAPPKPGNPPPGHPGG
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.......: : :::: ::. .::: : : . :: :.: :..: ..:.:
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pF1KA0 SKSRPTPKPRQRPTLPPPQPPT--VNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTDLVHFDIPS
: : : :. ::::::: . : ..:.: :
XP_011 S-------PIQAPNHPPPQPPTQATPLMHTKPNSQGPPNPMALPSEHGLEQPSHTPPQTP
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pF1KA0 IHIELGSTLRLSPLEHMRRHSVTDKRDSEEESESTAL
XP_011 TPPSTPPLGKQNPSLPAPQTLAGGNPETAQPHAGTLPRPRPVPKPRNRPSVPPPPQPPGV
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>>XP_011544178 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase-acti (872 aa)
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XP_011 MKKQFNRMKQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQIERRLDTVRSICHHSHKRLVACFQGQHGT
10 20 30 40 50 60
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pF1KA0 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
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XP_011 DAERRHKKLPLTALAQNMQEASTQL-EDSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVEKEI
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pF1KA0 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
..::. .:::::::::::::.::.:::: :: :.::.:. :::: ...: .: :.:.
XP_011 VDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDWDSVRARWNQAHKSSG--TNFQGLPSKIDTLK
120 130 140 150 160 170
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pF1KA0 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
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XP_011 EEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHRKALAVLEKTLPEM
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250 260
pF1KA0 KAQQ--------------------------------EAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREI
.:.: . :.:::.:: :::::: :::::
XP_011 RAHQGSPLNPLACVDEVWCRCSVPLQLLGSLSWCHLDKWAEKPAFGTPLEEHLKRSGREI
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 AFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLKKLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALK
:.:::::: .::: ::.::::::.. .::::::::::::: . ..:. .::::.:::::
XP_011 ALPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKLKKLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALK
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pF1KA0 SYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKLQALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKL
:::::::::::::.::.:: :...::.:::::: :: .:.::: : :.:::::::.::
XP_011 SYLRELPEPLMTFNLYEEWTQVASVQDQDKKLQDLWRTCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKL
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pF1KA0 SEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNITEMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGE
.. .:::::::::.:::::::::: . ::...:: ...:...:..::::::::::::: :
XP_011 AQTSDVNKMTPSNIAIVLGPNLLWARNEGTLAEMAAATSVHVVAVIEPIIQHADWFFPEE
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450 460 470 480 490 500
pF1KA0 IEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPADRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDG
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XP_011 VEFNVSEAF-VPL-TTPSSNHSFHTGNDSDSGTLER----KRPASMAV--MEGDLVKKE-
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pF1KA0 LRKIQSMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAPPSMQPPAPPAELAAPLPSPLPEQPLDSP
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XP_011 -----SFGVKLMDFQ-AHRRGGTLNRK--HISPAFQPPLPPTDGSTVVPAG-PEPPPQSS
530 540 550 560 570
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: . : ::. : :. :: . . : .: :: .:: ... .: .:: :
XP_011 RAESSSGGGTVPSSAGILEQGPSPGDGSPPKPKDPVSAAVPAPGRNNSQIASGQNQPQAA
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pF1KA0 PGAQPGASPSPSQPPADQSPHTLRKVSKKLAPIPPKV---PFGQPGAMADQSAGQLSPVS
:.. . .: . : ::::::.. :: :: ::: : :.::........: : :
XP_011 AGSHQLSMGQPHNA-AGPSPHTLRRAVKKPAPAPPKPGNPPPGHPGGQSSSGTSQ-HPPS
640 650 660 670 680 690
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pF1KA0 LSPTPPS-TPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFTSTLSKSRPTPKPRQRPT
::: ::. .::: : . :: :.: :..: ..:.:: : : :.
XP_011 LSPKPPTRSPSP----PTQHTGQPPGQ--PSAPSQLSAPRRYSSSLS-------PIQAPN
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pF1KA0 LPPPQPPT--VNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTDLVHFDIPSIHIELGSTLRLSPL
::::::: . : ..:.: :
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>>XP_011544177 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase-acti (885 aa)
initn: 1949 init1: 1034 opt: 1197 Z-score: 453.4 bits: 94.9 E(85289): 1.6e-18
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XP_011 MKKQFNRMKQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQIERRLDTVRSICHHSHKRLVACFQGQHGT
10 20 30 40 50 60
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pF1KA0 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
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XP_011 DAERRHKKLPLTALAQNMQEASTQL-EDSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVEKEI
70 80 90 100 110
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pF1KA0 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
..::. .:::::::::::::.::.:::: :: :.::.:. :::: ...: .: :.:.
XP_011 VDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDWDSVRARWNQAHKSSG--TNFQGLPSKIDTLK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
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XP_011 EEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHRKALAVLEKTLPEM
180 190 200 210 220 230
250 260
pF1KA0 KAQQ--------------------------------EAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREI
.:.: . :.:::.:: :::::: :::::
XP_011 RAHQGSPLNPLACVDEVWCRCSVPLQLLGSLSWCHLDKWAEKPAFGTPLEEHLKRSGREI
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 AFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLKKLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALK
:.:::::: .::: ::.::::::.. .::::::::::::: . ..:. .::::.:::::
XP_011 ALPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKLKKLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALK
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 SYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKLQALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKL
:::::::::::::.::.:: :...::.:::::: :: .:.::: : :.:::::::.::
XP_011 SYLRELPEPLMTFNLYEEWTQVASVQDQDKKLQDLWRTCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKL
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390 400 410 420 430 440
pF1KA0 SEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNITEMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGE
.. .:::::::::.:::::::::: . ::...:: ...:...:..::::::::::::: :
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450 460 470 480 490 500
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.:::.. . :. .. ..:.: . : : . .. .:: :.:. : .. ::.
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:.::..:: . . :::.. .:: :..::: ::.. .. .:. :: : .:
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: . : ::. : :. :: . . : .: :: .:: ... .: .:: :
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:.. . .: . : ::::::.. :: :: ::: : :.::........: : :
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pF1KA0 LSPTPPS-TPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFTSTLSKSRPTPKPRQRPT
::: ::. .::: : . :: :.: :..: ..:.:: : : :.
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::::::: . : ..:.: :
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:::::::::::::.:.::. :... : .::.:.::.:::.:.
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..::. .:::::::::::::.::.:::: :: :.::.:. :::: ...: .: :.:.
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XP_011 ALPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKLKKLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALK
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pF1KA0 SYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKLQALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKL
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pF1KA0 SEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNITEMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGE
.. .:::::::::.:::::::::: . ::...:: ...:...:..::::::::::::: :
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pF1KA0 IEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPADRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDG
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XP_011 VEFNVSEAF-VPL-TTPSSNHSFHTGNDSDSGTLER----KRPASMAV--MEGDLVKKE-
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:.::..:: . . :::.. .:: .: :..::: ::.. .. .:. :: : .:
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: . : ::. : :. :: . . : .: :: .:: ... .: .:: :
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:.. . .: . : ::::::.. :: :: ::: : :.::........: :
XP_011 AAGSHQLSMGQP-HNAAGPSPHTLRRAVKKPAPAPPKPGNPPPGHPGGQSSSGTSQ-HPP
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pF1KA0 SLSPTPPS-TPSPYGLSYP-QGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFTSTLSKSRPTPKPRQR
:::: ::. .::: : : . :: :.: :..: ..:.:: : :
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:. ::::::: . : ..:.: :
XP_011 PNHPPPQPPTQATPLMHTKPNSQGPPNPMALPSEHGLEQPSHTPPQTPTPPSTPPLGKQN
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>>XP_011544175 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase-acti (913 aa)
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XP_011 MKKQFNRMKQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQIERRLDTVRSICHHSHKRLVACFQGQHGT
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pF1KA0 EADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVERDV
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XP_011 DAERRHKKLPLTALAQNMQEASTQL-EDSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVEKEI
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pF1KA0 IEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSLQPAGAKADALR
..::. .:::::::::::::.::.:::: :: :.::.:. :::: ...: .: :.:.
XP_011 VDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDWDSVRARWNQAHKSSG--TNFQGLPSKIDTLK
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pF1KA0 EEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQI
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XP_011 EEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHRKALAVLEKTLPEM
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pF1KA0 KAQQ--------------------------------EAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREI
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XP_011 RAHQGSPLNPLACVDEVWCRCSVPLQLLGSLSWCHLDKWAEKPAFGTPLEEHLKRSGREI
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 AFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLKKLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALK
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XP_011 ALPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKLKKLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALK
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 SYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQDKKLQALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKL
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XP_011 SYLRELPEPLMTFNLYEEWTQVASVQDQDKKLQDLWRTCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKL
360 370 380 390 400 410
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pF1KA0 SEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAEGNITEMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGE
.. .:::::::::.:::::::::: . ::...:: ...:...:..::::::::::::: :
XP_011 AQTSDVNKMTPSNIAIVLGPNLLWARNEGTLAEMAAATSVHVVAVIEPIIQHADWFFPEE
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450 460 470 480 490 500
pF1KA0 IEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPDMDPADRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDG
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XP_011 VEFNVSEAF-VPL-TTPSSNHSFHTGNDSDSGTLER----KRPASMAV--MEGDLVKKE-
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pF1KA0 LRKIQSMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAPPSMQPPAPPAELAAPLPSPLPEQPLDSP
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XP_011 -----SFGVKLMDFQ-AHRRGGTLNRK--HISPAFQPPLPPTDGSTVVPAG-PEPPPQSS
530 540 550 560 570
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pF1KA0 AAPALS-----PSGLG-LQPGPERTSTTKSKELSPGSAQKGSPGSSQGTACAG-TQPGAQ
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XP_011 RAESSSGGGTVPSSAGILEQGPSPGDGSPPKPKDPVSAAVPAPGRNNSQIASGQNQPQAA
580 590 600 610 620 630
630 640 650 660 670
pF1KA0 PGAQPGASPSPSQPPADQSPHTLRKVSKKLAPIPPKV---PFGQPGAMADQSAGQLSPVS
:.. . .: . : ::::::.. :: :: ::: : :.::........: : :
XP_011 AGSHQLSMGQPHNA-AGPSPHTLRRAVKKPAPAPPKPGNPPPGHPGGQSSSGTSQ-HPPS
640 650 660 670 680 690
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 LSPTPPS-TPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFTSTLSKSRPTPKPRQRPT
::: ::. .::: : . :: :.: :..: ..:.:: : : :.
XP_011 LSPKPPTRSPSP----PTQHTGQPPGQ--PSAPSQLSAPRRYSSSLS-------PIQAPN
700 710 720 730 740
740 750 760 770 780 790
pF1KA0 LPPPQPPT--VNLSASSPQSTEAPMLDGMSPGESMSTDLVHFDIPSIHIELGSTLRLSPL
::::::: . : ..:.: :
XP_011 HPPPQPPTQATPLMHTKPNSQGPPNPMALPSEHGLEQPSHTPPQTPTPPSTPPLGKQNPS
750 760 770 780 790 800
>>XP_011538317 (OMIM: 610585) PREDICTED: rho GTPase-acti (359 aa)
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pF1KA0 AEYHRKSLTLLQAVLPQIKAQQEAWVEKPSFGKPLEE---HLTISGREIA-FPIEACVTM
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. : :. ::::::. .:. .. :. ..:: . . ..: :..:. :: ::::::::.
XP_011 IRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLYLRELPEPV
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. : :..... ... .:. .: : . .::.::.: .::. :::.... :..:::
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:. .:.: :.:::.: ::.: .: :
XP_011 MSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEESKKGVLT
330 340 350
818 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]