FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0676, 1250 aa 1>>>pF1KA0676 1250 - 1250 aa - 1250 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0158+/-0.00099; mu= 15.2815+/- 0.060 mean_var=117.5199+/-23.810, 0's: 0 Z-trim(108.6): 84 B-trim: 317 in 1/52 Lambda= 0.118309 statistics sampled from 10219 (10304) to 10219 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.317), width: 16 Scan time: 5.130 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS43408.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1250) 8297 1428.1 0 CCDS4450.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1233) 6335 1093.2 0 CCDS47136.1 TBC1D9 gene_id:23158|Hs108|chr4 (1266) 5134 888.2 0 CCDS46375.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1140) 3434 598.0 4.4e-170 CCDS82486.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1155) 3137 547.3 8.1e-155 CCDS14522.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX (1120) 1926 340.6 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 QLLSDDETKDDMSMSSYSVVSTGSLQCEDLADDTVLVGGEACSPTARIGGTVDTDWCISF 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KA0 EQILASILTESVLVNFFEKRVDIGLKIKDQKKVERQFSTASDHEQPGVSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 EQILASILTESVLVNFFEKRVDIGLKIKDQKKVERQFSTASDHEQPGVSG 1190 1200 1210 1220 1230 >>CCDS47136.1 TBC1D9 gene_id:23158|Hs108|chr4 (1266 aa) initn: 4910 init1: 2367 opt: 5134 Z-score: 4734.5 bits: 888.2 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5166; 63.1% identity (83.7% similar) in 1286 aa overlap (1-1250:1-1266) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MWLSPEEVLVANALWVTERANPFFVLQRRRGH----GRGGGLTGLLVGTLDVVLDSSARV ::..:::::.:::::.::::::.:.::::.:: : ::::.::::::::::::::::: CCDS47 MWVNPEEVLLANALWITERANPYFILQRRKGHAGDGGGGGGLAGLLVGTLDVVLDSSARV 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 APYRILHQTQDSQVYWTVACGSSRKEITKHWEWLENNLLQTLSIFDSEEDITTFVKGKIH ::::::.:: :: ::::.:::.::::::.::::::.:::::::::..:.::::::.:::. CCDS47 APYRILYQTPDSLVYWTIACGGSRKEITEHWEWLEQNLLQTLSIFENENDITTFVRGKIQ 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 GIIAEENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMPEGEKLVNYYSCSYWKGRVPRQGWLY ::::: :: . . :.: ::::: .:... ::::: ::::::::::::::.::::::.: CCDS47 GIIAEYNKINDVKEDDDTEKFKEAIVKFHRLFGMPEEEKLVNYYSCSYWKGKVPRQGWMY 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 LTVNHLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATLLFPESIRVDTRDQELFFSMFLNIGE :..:::::::::.:.:..::..:::::.::::::::.:. :.:.::..: :::.::::.: CCDS47 LSINHLCFYSFLMGREAKLVIRWVDITQLEKNATLLLPDVIKVSTRSSEHFFSVFLNINE 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 TFKLMEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPH-RNISALKRDLDARAKNECYRATFR ::::::::::.:::::::.::: .:..::. : ...::::::::::::.: ::: :: CCDS47 TFKLMEQLANIAMRQLLDNEGFEQDRSLPKLKRKSPKKVSALKRDLDARAKSERYRALFR 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 LPRDERLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYICFASKEEDACHLIIPLREVTIVEKA ::.::.:::::.:::::::::.:: ::::.:.:::::.::::. : :::::::::::::: CCDS47 LPKDEKLDGHTDCTLWTPFNKMHILGQMFVSTNYICFTSKEENLCSLIIPLREVTIVEKA 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 pF1KA0 DSSSVLPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKTPSKQ------PGSIGSRK ::::::::::::::...:::::::::::::::::::::::.: :: :: .: CCDS47 DSSSVLPSPLSISTRNRMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQQTTSKIYSDKEFAGSYNSSD 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 ASVVD-PSTESSPAPQEGSEQPASPASPLSSRQ-SFCAQEAPTASQGLLKLFQKNSPMED : . ::. : .::... . :. . :: .. .. .:::.: :. .... :: :. CCDS47 DEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDAD-----GERQFNLNGNSVPTATQTLMTMYRRRSP-EE 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 LGAKGAKEKMKEESWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELWLLFSGAWNE .. : ::: .::..:.::: :::.:.::::: ::: :::::::::.:::::::.::: :: CCDS47 FNPKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPESMRGELWLLLSGAINE 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KA0 MVTHPGYYAELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIAALRRVLTAYAFRN .:::::: .::::: :::.:::::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::: CCDS47 KATHPGYYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLPEHPAFQNEMGIAALRRVLTAYAFRN 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KA0 PTIGYCQAMNIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGIFEELTR :.:::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.: CCDS47 PNIGYCQAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGVFEELAR 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KA0 DFLPQLSEKMQDLGVISSISLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKVILQVALAVL :..::: . ::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::.:.::::: CCDS47 DYVPQLYDCMQDLGVISTISLSWFLTLFLSVMPFESAVVVVDCFFYEGIKVIFQLALAVL 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 760 pF1KA0 DANMEQLLGCSDEGEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPPAEVDIFELL :::...::.:.:.:::::.::::::.:.::.:. ::::::..:::.. .: :::::.:. CCDS47 DANVDKLLNCKDDGEAMTVLGRYLDSVTNKDSTLPPIPHLHSLLSDDVEPYPEVDIFRLI 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 810 820 pF1KA0 KVSYEKFSSLRAEDIEQMRFKQRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDIGFSIEELEDLYMVF ..:::::...::. ::::::::::::::.::::.::.:::.: .. .:.:.:::.:: .: CCDS47 RTSYEKFGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLEDTTKRNVVRTIVTETSFTIDELEELYALF 780 790 800 810 820 830 830 840 850 860 870 880 pF1KA0 KAKHLASQYWGCSRTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRELFASLTPWACGSHTPLLAGRM ::.::.: ::: : . :.::::::::::::: ::. .:: : :::::.:. .::.:. CCDS47 KAEHLTSCYWGGSSNALDRHDPSLPYLEQYRIDFEQFKGMFALLFPWACGTHSDVLASRL 840 850 860 870 880 890 890 900 910 920 930 940 pF1KA0 FRLLDENKDSLINFKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKVLYKLH-LP-PALSPEEAESALEAAH :.::::: ::::::.:::.:.:. :::::::::.:::.: :: :. . .: .::.::.. CCDS47 FQLLDENGDSLINFREFVSGLSAACHGDLTEKLKLLYKMHVLPEPSSDQDEPDSAFEATQ 900 910 920 930 940 950 950 960 970 980 990 1000 pF1KA0 YFTEDSSSEASPLASDLDLFLPWEAQEALPQEEQEGSGSEERGEEKGTSSPDYRHYLRMW :: :: . : . ... :: :.... : . ..: : ..: . :.:::.: CCDS47 YFFEDITPECTHVVG-LDSRSKQGADDGFVTV----SLKPDKG--KRANSQENRNYLRLW 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA0 AKEKEAQKETIKDLPKMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASLLLRIGEVG . :....... :::::.:: ::::::::.:::::::: ::.:::: :.:.::::.::::: CCDS47 TPENKSKSKNAKDLPKLNQGQFIELCKTMYNMFSEDPNEQELYHATAAVTSLLLEIGEVG 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KA0 KKFSARTGRKPRDCATEEDEPPAPELHQDAARELQPPAA-GDPQ---------AKAGGDT : : :. ... . .. .: :: : : . :.: :. . :. CCDS47 KLFVAQPAKEGGSGGS------GPSCHQGIPGVLFPKKGPGQPYVVESVEPLPASLAPDS 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KA0 HLGT-APQESQVVVEGGSGEGQGS-PSQLLSDDETKDDMSMSSYSVVSTGS-----LQCE . . . : .. .: .: . .:. :.:.:::.:::: :::::::.:.:: :.:: CCDS47 EEHSLGGQMEDIKLEDSSPRDNGACSSMLISDDDTKDDSSMSSYSVLSAGSHEEDKLHCE 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KA0 DLADDTVLV-GGEACSPTARIGGTVDTDWCISFEQILASILTESVLVNFFEKRVDIGLKI :...::::: .:.. . : . ..: :: :.:::.:::.::: .::..:.: : . .: CCDS47 DIGEDTVLVRSGQGTAALPR-STSLDRDWAITFEQFLASLLTEPALVKYFDKPVCMMARI 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1230 1240 1250 pF1KA0 KDQKKVE---RQFSTASDHEQPGVSG . :... . ...:::.: ..:: CCDS47 TSAKNIRMMGKPLTSASDYEISAMSG 1250 1260 >>CCDS46375.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1140 aa) initn: 3735 init1: 2308 opt: 3434 Z-score: 3167.0 bits: 598.0 E(32554): 4.4e-170 Smith-Waterman score: 3667; 48.0% identity (72.9% similar) in 1247 aa overlap (1-1239:1-1124) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MWLSPEEVLVANAL--WVTERANPFFVLQRRRGHGRGGG-LTGLLVGTLDVVLDSSARVA :::.:::::. ::: :::.... .:.::::::::.::: ::: :::.::.::::.:::: CCDS46 MWLKPEEVLLKNALKLWVTQKSSCYFILQRRRGHGEGGGRLTGRLVGALDAVLDSNARVA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 PYRILHQTQDSQVYWTVACGSSRKEITKHWEWLENNLLQTLSIFDSEEDITTFVKGKIHG :.::: :. :::: .:::.. .::..::.:::.:::.:::.::...::..:::::... CCDS46 PFRILLQVPGSQVYSPIACGATLEEINQHWDWLEQNLLHTLSVFDNKDDIASFVKGKVKA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 IIAEENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMPEGEKLVNYYSCSYWKGRVPRQGWLYL .::::... . .:.: ::.:: .:.. .:..::.::::.:::: ::::::::::::: CCDS46 LIAEETSSRLAEQEEEPEKFREALVKFEARFNFPEAEKLVTYYSCCCWKGRVPRQGWLYL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 TVNHLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATLLFPESIRVDTRDQELFFSMFLNIGET ..::::::::.::::..::: :::: .::....... ..::. :...: ::::::. :. CCDS46 SINHLCFYSFFLGKELKLVVPWVDIQKLERTSNVFLTDTIRITTQNKERDFSMFLNLDEV 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 FKLMEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPHRNISALKRDLDARAKNECYRATFRLP ::.:::::....:.:::.: : : : .: . ::::.:::.:: .:: :::: CCDS46 FKVMEQLADVTLRRLLDNEVFDLDPDLQEPSQ------ITKRDLEARAQNEFFRAFFRLP 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 RDERLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYICFASKEEDACHLIIPLREVTIVEKADS : :.: . ..:.:::::.. : :.:: :..::::::.:. :..:.:::::. .:: .. CCDS46 RKEKLHAVVDCSLWTPFSRCHTTGRMFASDSYICFASREDGCCKIILPLREVVSIEKMED 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 SSVLPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKTPSKQP----GSIGSRKASVV .:.:: :. .: .::..: : .:.::: ::. . :... ...: : . ::.: CCDS46 TSLLPHPIIVSIRSKVAFQFIELRDRDSLVEALLARLKQVHANHPVHYDTSADDDMASLV 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KA0 DPSTESSPAPQEGSEQPASPASPLSSRQSFCAQEAPTASQGLLKLFQKNSPMEDLGAKGA :: . :. . : . :.. : : :. ::. : .. .. . CCDS46 FHSTSMCSDHRFGDLEMMSSQNSEESEKEKSPLMHPDA---LVTAFQQ-SGSQSPDSRMS 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KA0 KEKMKEESWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELWLLFSGAWNEMVTHPG .:..: :. :: :::: :::.:: : : :: ::::::::.:::::: : .....::: CCDS46 REQIKISLWNDHFVEYGRTVCMFRTEKIRKLVAMGIPESLRGRLWLLFSDAVTDLASHPG 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KA0 YYAELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIAALRRVLTAYAFRNPTIGYC ::..:::.: :: :.:::::::::::.::::::::: ::::::::::::: ::: :::: CCDS46 YYGNLVEESLGKCCLVTEEIERDLHRSLPEHPAFQNETGIAALRRVLTAYAHRNPKIGYC 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KA0 QAMNIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGIFEELTRDFLPQL :.:::.::::::: .::::::::::.::::::::.: ::.:: :::..:::: . ::.: CCDS46 QSMNILTSVLLLYTKEEEAFWLLVAVCERMLPDYFNHRVIGAQVDQSVFEELIKGHLPEL 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KA0 SEKMQDLGVISSISLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKVILQVALAVLDANMEQ .:.:.::....:.:::::::::::.::.:::: .::::::.:::.:.:..::::.:: :. CCDS46 AEHMNDLSALASVSLSWFLTLFLSIMPLESAVNVVDCFFYDGIKAIFQLGLAVLEANAED 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KA0 LLGCSDEGEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPPAEVDIFELLKVSYEK : . .:.:.:. .:.:.::.. :..: .::. .:..:....: .:: .:.. :::: CCDS46 LCSSKDDGQALMILSRFLDHIKNEDSPGPPVGSHHAFFSDDQEPYPVTDISDLIRDSYEK 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KA0 FSSLRAEDIEQMRFKQRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDIGFSIEELEDLYMVFKAKHLA :.. .:.::..:.:.:..:.:. :::.:..:.:.. .... :.::.:: .:: .:. CCDS46 FGDQSVEQIEHLRYKHRIRVLQGHEDTTKQNVLRVVIPEVSILPEDLEELYDLFKREHMM 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KA0 SQYWGCSRTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRELFASLTPWACGSHTPLLAGRMFRLLDE : :: : ::.:.::: :: ::::::: :: .:: ..::.::.:: .:: : :::::. CCDS46 SCYWEQPRPMASRHDPSRPYAEQYRIDARQFAHLFQLVSPWTCGAHTEILAERTFRLLDD 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 pF1KA0 NKDSLINFKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKVLYKLHLPPALSPEEAESALEAAHYFTEDSSS : :.::.:: ::. .. ::.:...::.:.::.::.:::: ::.. . CCDS46 NMDQLIEFKAFVSCLDIMYNGEMNEKIKLLYRLHIPPAL---------------TENDRD 900 910 920 930 960 970 980 990 1000 1010 pF1KA0 EASPLASDLDLFLPWEAQEALPQEEQEGSGSEERGEEKGTSSPDYRHYLRMWAKEKEAQK ::: . : . . : :. .: .. ::.. :.. :. .: CCDS46 SQSPLRNPL-------LSTSRPLVF---------GKPNG-DAVDYQKQLKQMIKDLAKEK 940 950 960 970 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KA0 E-TIKDLPKMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASLLLRIGEVGKKFSART . : :.::::.:..::..:::::.:: ::: :.:::.:::::..:::.:::::.. :. . CCDS46 DKTEKELPKMSQREFIQFCKTLYSMFHEDPEENDLYQAIATVTTLLLQIGEVGQRGSS-S 980 990 1000 1010 1020 1030 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KA0 GRKPRDCATEEDEPPAPELHQDAARELQPPAAGDPQAKAGGDTHLGTAPQESQVVVEGGS : ..:. :: . :: .:. .. .:: : .::.::. CCDS46 GSCSQECG-EELRASAP----------------SPEDSVFADT--GKTPQDSQAF----- 1040 1050 1060 1070 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KA0 GEGQGSPSQLLSDDETKDDMSMSSYSVVSTGSLQCEDLADDTVLVGGEACSPTARIGGTV : : . CCDS46 ---------------------------------------------------PEA-----A 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KA0 DTDWCISFEQILASILTESVLVNFFEKRVDIGLKIKDQKKVERQFSTASDHEQPGVSG . :: .:.:.::::.:::. ::::::: .:. :... : . ...: CCDS46 ERDWTVSLEHILASLLTEQSLVNFFEKPLDMKSKLENAKINQYNLKTFEMSHQSQSELKL 1080 1090 1100 1110 1120 1130 CCDS46 SNL 1140 >>CCDS82486.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1155 aa) initn: 3655 init1: 2308 opt: 3137 Z-score: 2893.0 bits: 547.3 E(32554): 8.1e-155 Smith-Waterman score: 3633; 47.4% identity (72.1% similar) in 1262 aa overlap (1-1239:1-1139) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MWLSPEEVLVANAL--WVTERANPFFVLQRRRGHGRGGG-LTGLLVGTLDVVLDSSARVA :::.:::::. ::: :::.... .:.::::::::.::: ::: :::.::.::::.:::: CCDS82 MWLKPEEVLLKNALKLWVTQKSSCYFILQRRRGHGEGGGRLTGRLVGALDAVLDSNARVA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KA0 PYRILHQTQDSQVY---------------WTVACGSSRKEITKHWEWLENNLLQTLSIFD :.::: :. :::: :..: :.. .::..::.:::.:::.:::.:: CCDS82 PFRILLQVPGSQVYSPIACGELLNGSDVYWAIATGATLEEINQHWDWLEQNLLHTLSVFD 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KA0 SEEDITTFVKGKIHGIIAEENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMPEGEKLVNYYSC ...::..:::::....::::... . .:.: ::.:: .:.. .:..::.::::.:::: CCDS82 NKDDIASFVKGKVKALIAEETSSRLAEQEEEPEKFREALVKFEARFNFPEAEKLVTYYSC 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KA0 SYWKGRVPRQGWLYLTVNHLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATLLFPESIRVDTR :::::::::::::..::::::::.::::..::: :::: .::....... ..::. :. CCDS82 CCWKGRVPRQGWLYLSINHLCFYSFFLGKELKLVVPWVDIQKLERTSNVFLTDTIRITTQ 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KA0 DQELFFSMFLNIGETFKLMEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPHRNISALKRDLD ..: ::::::. :.::.:::::....:.:::.: : : : .: . ::::. CCDS82 NKERDFSMFLNLDEVFKVMEQLADVTLRRLLDNEVFDLDPDLQEPSQ------ITKRDLE 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KA0 ARAKNECYRATFRLPRDERLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYICFASKEEDACHL :::.:: .:: ::::: :.: . ..:.:::::.. : :.:: :..::::::.:. :.. CCDS82 ARAQNEFFRAFFRLPRKEKLHAVVDCSLWTPFSRCHTTGRMFASDSYICFASREDGCCKI 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KA0 IIPLREVTIVEKADSSSVLPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKTPSKQP :.:::::. .:: ...:.:: :. .: .::..: : .:.::: ::. . :... ...: CCDS82 ILPLREVVSIEKMEDTSLLPHPIIVSIRSKVAFQFIELRDRDSLVEALLARLKQVHANHP 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 pF1KA0 ----GSIGSRKASVVDPSTESSPAPQEGSEQPASPASPLSSRQSFCAQEAPTASQGLLKL : . ::.: :: . :. . : . :.. : : :. CCDS82 VHYDTSADDDMASLVFHSTSMCSDHRFGDLEMMSSQNSEESEKEKSPLMHPDA---LVTA 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KA0 FQKNSPMEDLGAKGAKEKMKEESWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELW ::. : .. .. ..:..: :. :: :::: :::.:: : : :: ::::::::.:: CCDS82 FQQ-SGSQSPDSRMSREQIKISLWNDHFVEYGRTVCMFRTEKIRKLVAMGIPESLRGRLW 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KA0 LLFSGAWNEMVTHPGYYAELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIAALRR :::: : .....:::::..:::.: :: :.:::::::::::.::::::::: ::::::: CCDS82 LLFSDAVTDLASHPGYYGNLVEESLGKCCLVTEEIERDLHRSLPEHPAFQNETGIAALRR 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KA0 VLTAYAFRNPTIGYCQAMNIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVD :::::: ::: :::::.:::.::::::: .::::::::::.::::::::.: ::.:: :: CCDS82 VLTAYAHRNPKIGYCQSMNILTSVLLLYTKEEEAFWLLVAVCERMLPDYFNHRVIGAQVD 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 690 pF1KA0 QGIFEELTRDFLPQLSEKMQDLGVISSISLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKV :..:::: . ::.:.:.:.::....:.:::::::::::.::.:::: .::::::.:::. CCDS82 QSVFEELIKGHLPELAEHMNDLSALASVSLSWFLTLFLSIMPLESAVNVVDCFFYDGIKA 660 670 680 690 700 710 700 710 720 730 740 750 pF1KA0 ILQVALAVLDANMEQLLGCSDEGEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPP :.:..::::.:: :.: . .:.:.:. .:.:.::.. :..: .::. .:..:....: CCDS82 IFQLGLAVLEANAEDLCSSKDDGQALMILSRFLDHIKNEDSPGPPVGSHHAFFSDDQEPY 720 730 740 750 760 770 760 770 780 790 800 810 pF1KA0 AEVDIFELLKVSYEKFSSLRAEDIEQMRFKQRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDIGFSIE .:: .:.. :::::.. .:.::..:.:.:..:.:. :::.:..:.:.. .... : CCDS82 PVTDISDLIRDSYEKFGDQSVEQIEHLRYKHRIRVLQGHEDTTKQNVLRVVIPEVSILPE 780 790 800 810 820 830 820 830 840 850 860 870 pF1KA0 ELEDLYMVFKAKHLASQYWGCSRTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRELFASLTPWACGS .::.:: .:: .:. : :: : ::.:.::: :: ::::::: :: .:: ..::.::. CCDS82 DLEELYDLFKREHMMSCYWEQPRPMASRHDPSRPYAEQYRIDARQFAHLFQLVSPWTCGA 840 850 860 870 880 890 880 890 900 910 920 930 pF1KA0 HTPLLAGRMFRLLDENKDSLINFKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKVLYKLHLPPALSPEEAE :: .:: : :::::.: :.::.:: ::. .. ::.:...::.:.::.::.:::: CCDS82 HTEILAERTFRLLDDNMDQLIEFKAFVSCLDIMYNGEMNEKIKLLYRLHIPPAL------ 900 910 920 930 940 940 950 960 970 980 990 pF1KA0 SALEAAHYFTEDSSSEASPLASDLDLFLPWEAQEALPQEEQEGSGSEERGEEKGTSSPDY ::.. . ::: . : . . : :. .: .. :: CCDS82 ---------TENDRDSQSPLRNPL-------LSTSRPLVF---------GKPNG-DAVDY 950 960 970 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KA0 RHYLRMWAKEKEAQKE-TIKDLPKMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASL .. :.. :. .:. : :.::::.:..::..:::::.:: ::: :.:::.:::::..: CCDS82 QKQLKQMIKDLAKEKDKTEKELPKMSQREFIQFCKTLYSMFHEDPEENDLYQAIATVTTL 980 990 1000 1010 1020 1030 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KA0 LLRIGEVGKKFSARTGRKPRDCATEEDEPPAPELHQDAARELQPPAAGDPQAKAGGDTHL ::.:::::.. :. .: ..:. :: . :: .:. .. .:: CCDS82 LLQIGEVGQRGSS-SGSCSQECG-EELRASAP----------------SPEDSVFADT-- 1040 1050 1060 1070 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KA0 GTAPQESQVVVEGGSGEGQGSPSQLLSDDETKDDMSMSSYSVVSTGSLQCEDLADDTVLV : .::.::. CCDS82 GKTPQDSQAF-------------------------------------------------- 1080 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KA0 GGEACSPTARIGGTVDTDWCISFEQILASILTESVLVNFFEKRVDIGLKIKDQKKVERQF : : .. :: .:.:.::::.:::. ::::::: .:. :... : . .. CCDS82 ------PEA-----AERDWTVSLEHILASLLTEQSLVNFFEKPLDMKSKLENAKINQYNL 1090 1100 1110 1120 1130 1240 1250 pF1KA0 STASDHEQPGVSG .: CCDS82 KTFEMSHQSQSELKLSNL 1140 1150 >>CCDS14522.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX (1120 aa) initn: 3620 init1: 1876 opt: 1926 Z-score: 1776.1 bits: 340.6 E(32554): 1.3e-92 Smith-Waterman score: 3605; 51.8% identity (77.6% similar) in 1114 aa overlap (1-1102:1-1073) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MWLSPEEVLVANAL--WVTERANPFFVLQRRRGHGR--GGGLTGLLVGTLDVVLDSSARV :::.:::::. ::: :. ::.: .::::::::.:. ::::::::::::: ::::.:.: CCDS14 MWLKPEEVLLKNALKLWLMERSNDYFVLQRRRGYGEEGGGGLTGLLVGTLDSVLDSTAKV 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 APYRILHQTQDSQVYWTVACGSSRKEITKHWEWLENNLLQTLSIFDSEEDITTFVKGKIH ::.:::::: ::::: ..:::..:.::::::.:::.:...:::.:::.::::.::.:::. CCDS14 APFRILHQTPDSQVYLSIACGANREEITKHWDWLEQNIMKTLSVFDSNEDITNFVQGKIR 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 GIIAEENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMPEGEKLVNYYSCSYWKGRVPRQGWLY :.::::.:. . : :: ::.:: ::..: ::.:: ::::.:::::::::::: ::::: CCDS14 GLIAEEGKHCFAKED-DPEKFREALLKFEKCFGLPEKEKLVTYYSCSYWKGRVPCQGWLY 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 LTVNHLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATLLFPESIRVDTRDQELFFSMFLNIGE :..: : :::::::.:..:...: ....:::...... :::.: .. .. .:::::.:.. CCDS14 LSTNFLSFYSFLLGSEIKLIISWDEVSKLEKTSNVILTESIHVCSQGENHYFSMFLHINQ 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 TFKLMEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPHRNISALKRDLDARAKNECYRATFRL :. ::::::: :.:.:.:.: : .: .: :.. :: :. ::..: . : ::: CCDS14 TYLLMEQLANYAIRRLFDKETFDNDPVLYNPLQ------ITKRGLENRAHSEQFNAFFRL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 PRDERLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYICFASKEEDACHLIIPLREVTIVEKAD :. : : : ::.::.... :.: ::.:::::::.. . : .::::::: ..:.. CCDS14 PKGESLKEVHECFLWVPFSHFNTHGKMCISENYICFASQDGNQCSVIIPLREVLAIDKTN 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 SSSVLPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKTPSKQPGSIGSRKASVVDPS .:: . . :: :.: .: : ..:: . :: .. . . : : .: : . .. . : CCDS14 DSS---KSVIISIKGKTAFRFHEVKDFEQLVAKLR-LRCGAASTQYHDI-STELAISSES 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KA0 TESSPAPQEGSEQPASPASPLSSRQSFCAQEAPTASQGLLKLFQKNSPMEDLGAKGAKEK :: :... : .. :.: : :.. . : ..:. .:. .. .: :..: ::: CCDS14 TE----PSDNFE-----VQSLTS-QRECSKTVNT--EALMTVFHPQN-LETLNSKMLKEK 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KA0 MKEESWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELWLLFSGAWNEMVTHPGYYA :::.::.: : : :::: :.:: ::: ::..::::.::::::.::::: :.:.:.: ::. CCDS14 MKEQSWKILFAECGRGVSMFRTKKTRDLVVRGIPETLRGELWMLFSGAVNDMATNPDYYT 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KA0 ELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIAALRRVLTAYAFRNPTIGYCQAM :.::.: : .::::::::::.::.:::::::.. ::.::::::::::.::: ::::::: CCDS14 EVVEQSLGTCNLATEEIERDLRRSLPEHPAFQSDTGISALRRVLTAYAYRNPKIGYCQAM 520 530 540 550 560 570 600 610 620 630 640 650 pF1KA0 NIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGIFEELTRDFLPQLSEK ::.:::::::..::::::::::.::::::::.: :..::::::..:::: :: ::::.:. CCDS14 NILTSVLLLYAKEEEAFWLLVAVCERMLPDYFNRRIIGALVDQAVFEELIRDHLPQLTEH 580 590 600 610 620 630 660 670 680 690 700 710 pF1KA0 MQDLGVISSISLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKVILQVALAVLDANMEQLLG : :. .::.:::::::::.::.:.:::: .::::::.:::.:::..::.:: :...:: CCDS14 MTDMTFFSSVSLSWFLTLFISVLPIESAVNVVDCFFYDGIKAILQLGLAILDYNLDKLLT 640 650 660 670 680 690 720 730 740 750 760 770 pF1KA0 CSDEGEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPPAEVDIFELLKVSYEKFSS :.:..::.: :.:..:::.::.: : . . .:. ..::: .:.. : ::... CCDS14 CKDDAEAVTALNRFFDNVTNKDSPLPSNVQQGSNVSDEKTSHTRVDITDLIRESNEKYGN 700 710 720 730 740 750 780 790 800 810 820 830 pF1KA0 LRAEDIEQMRFKQRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDIGFSIEELEDLYMVFKAKHLASQY .: :::..:: ..:: :::.::.:.:..:.:.. :. .:..::..::..:: . . : : CCDS14 IRYEDIHSMRCRNRLYVIQTLEETTKQNVLRVVSQDVKLSLQELDELYVIFKKELFLSCY 760 770 780 790 800 810 840 850 860 870 880 890 pF1KA0 W--GCSRTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRELFASLTPWACGSHTPLLAGRMFRLLDEN : :: . ..::::::::::.:: .::: :. :.::: ... :: ::::::: CCDS14 WCLGCP--VLKHHDPSLPYLEQYQIDCQQFRALYHLLSPWAHSANKDSLALWTFRLLDEN 820 830 840 850 860 870 900 910 920 930 940 950 pF1KA0 KDSLINFKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKVLYKLHLPPALSPEEAESALEAAHYFTEDSSSE .: ::::::: .... ::.:..:::::.:.:::.::: . ....: :. CCDS14 SDCLINFKEFSSAIDIMYNGSFTEKLKLLFKLHIPPAYTEVKSKDA------------SK 880 890 900 910 920 960 970 980 990 1000 1010 pF1KA0 ASPLASDLDLFLPWEAQEALPQEEQEGSGSEERGEEKGTSSPDYRHYLRMWAKEKEAQKE .. :... :.. . . . : .:.:. : ... ::: .. : . :: .: : ..: CCDS14 GDELSKEELLYFS-QLHVSKPANEKEAE-SAKHSPEKGKGKIDIQAYLSQWQDELFKKEE 930 940 950 960 970 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KA0 TIKDLPKMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASLLLRIGEVGKKF----SA .:::::.::: :::.. :::::.: ::: :..::.:::.:.:::::. :::.:. :. CCDS14 NIKDLPRMNQSQFIQFSKTLYNLFHEDPEEESLYQAIAVVTSLLLRMEEVGRKLHSPTSS 980 990 1000 1010 1020 1030 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KA0 RTGRKPRDCAT--EEDEPPAPELHQDAARELQPPAAGDPQAKAGGDTHLGTAPQESQVVV : . :.. .: . .:..: . : CCDS14 AKGFSGTVCGSGGPSEEKTGSHLEKDPCSFREEPQWSFAFEQILASLLNEPALVRFFEKP 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KA0 EGGSGEGQGSPSQLLSDDETKDDMSMSSYSVVSTGSLQCEDLADDTVLVGGEACSPTARI CCDS14 IDVKAKLENARISQLRSRTKM 1100 1110 1120 >>CCDS14523.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX (632 aa) initn: 2085 init1: 830 opt: 876 Z-score: 811.2 bits: 161.3 E(32554): 7.3e-39 Smith-Waterman score: 2280; 56.0% identity (80.1% similar) in 639 aa overlap (1-635:1-614) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MWLSPEEVLVANAL--WVTERANPFFVLQRRRGHGR--GGGLTGLLVGTLDVVLDSSARV :::.:::::. ::: :. ::.: .::::::::.:. ::::::::::::: ::::.:.: CCDS14 MWLKPEEVLLKNALKLWLMERSNDYFVLQRRRGYGEEGGGGLTGLLVGTLDSVLDSTAKV 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 APYRILHQTQDSQVYWTVACGSSRKEITKHWEWLENNLLQTLSIFDSEEDITTFVKGKIH ::.:::::: ::::: ..:::..:.::::::.:::.:...:::.:::.::::.::.:::. CCDS14 APFRILHQTPDSQVYLSIACGANREEITKHWDWLEQNIMKTLSVFDSNEDITNFVQGKIR 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 GIIAEENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMPEGEKLVNYYSCSYWKGRVPRQGWLY :.::::.:. . : :: ::.:: ::..: ::.:: ::::.:::::::::::: ::::: CCDS14 GLIAEEGKHCFAKED-DPEKFREALLKFEKCFGLPEKEKLVTYYSCSYWKGRVPCQGWLY 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 LTVNHLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATLLFPESIRVDTRDQELFFSMFLNIGE :..: : :::::::.:..:...: ....:::...... :::.: .. .. .:::::.:.. CCDS14 LSTNFLSFYSFLLGSEIKLIISWDEVSKLEKTSNVILTESIHVCSQGENHYFSMFLHINQ 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 TFKLMEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPHRNISALKRDLDARAKNECYRATFRL :. ::::::: :.:.:.:.: : .: .: :.. :: :. ::..: . : ::: CCDS14 TYLLMEQLANYAIRRLFDKETFDNDPVLYNPLQ------ITKRGLENRAHSEQFNAFFRL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 PRDERLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYICFASKEEDACHLIIPLREVTIVEKAD :. : : : ::.::.... :.: ::.:::::::.. . : .::::::: ..:.. CCDS14 PKGESLKEVHECFLWVPFSHFNTHGKMCISENYICFASQDGNQCSVIIPLREVLAIDKTN 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 SSSVLPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKTPSKQPGSIGSRKASVVDPS .:: . . :: :.: .: : ..:: . :: .. . . : : .: : . .. . : CCDS14 DSS---KSVIISIKGKTAFRFHEVKDFEQLVAKLR-LRCGAASTQYHDI-STELAISSES 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KA0 TESSPAPQEGSEQPASPASPLSSRQSFCAQEAPTASQGLLKLFQKNSPMEDLGAKGAKEK :: :... : .. :.: : :.. . : ..:. .:. .. .: :..: ::: CCDS14 TE----PSDNFE-----VQSLTS-QRECSKTVNT--EALMTVFHPQN-LETLNSKMLKEK 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KA0 MKEESWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELWLLFSGAWNEMVTHPGYYA :::.::.: : : :::: :.:: ::: ::..::::.::::::.::::: :.:.:.: ::. CCDS14 MKEQSWKILFAECGRGVSMFRTKKTRDLVVRGIPETLRGELWMLFSGAVNDMATNPDYYT 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KA0 ELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIAALRRVLTAYAFRNPTIGYCQAM :.::.: : .::::::::::.::.:::::::.. ::.::::::::::.::: ::::::: CCDS14 EVVEQSLGTCNLATEEIERDLRRSLPEHPAFQSDTGISALRRVLTAYAYRNPKIGYCQAM 520 530 540 550 560 570 600 610 620 630 640 650 pF1KA0 NIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGIFEELTRDFLPQLSEK ::.:::::::..::::::::::.::::::::.: :..:. CCDS14 NILTSVLLLYAKEEEAFWLLVAVCERMLPDYFNRRIIGSDDFMPLVRIQGQCVIGEK 580 590 600 610 620 630 660 670 680 690 700 710 pF1KA0 MQDLGVISSISLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKVILQVALAVLDANMEQLLG >>CCDS14002.1 SGSM3 gene_id:27352|Hs108|chr22 (749 aa) initn: 457 init1: 191 opt: 561 Z-score: 519.5 bits: 107.5 E(32554): 1.3e-22 Smith-Waterman score: 589; 28.6% identity (57.2% similar) in 570 aa overlap (424-932:32-581) 400 410 420 430 440 450 pF1KA0 LQKTPSKQPGSIGSRKASVVDPSTESSPAPQEGSEQPASPASPLSSRQSFCAQEAPTASQ .:..::: . .. : .:. .. 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