Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0706
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0706, 1103 aa
1>>>pF1KA0706 1103 - 1103 aa - 1103 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5046+/-0.00099; mu= 6.3090+/- 0.060
mean_var=300.8398+/-60.051, 0's: 0 Z-trim(115.2): 93 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.073945
statistics sampled from 15658 (15749) to 15658 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.767), E-opt: 0.2 (0.484), width: 16
Scan time: 6.010
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11065.1 KIF1C gene_id:10749|Hs108|chr17 (1103) 7445 808.5 0
CCDS58757.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1791) 3298 366.4 3.3e-100
CCDS46561.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1690) 3279 364.3 1.3e-99
CCDS112.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1153) 2109 239.3 3.7e-62
CCDS111.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1770) 2109 239.5 5.1e-62
CCDS47380.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1749) 1512 175.8 7.5e-43
CCDS54967.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1757) 1512 175.8 7.5e-43
CCDS54968.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1770) 1512 175.8 7.5e-43
CCDS47381.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1805) 1512 175.8 7.6e-43
CCDS55217.1 KIF13B gene_id:23303|Hs108|chr8 (1826) 1469 171.2 1.8e-41
CCDS82598.1 KIF16B gene_id:55614|Hs108|chr20 (1266) 1270 149.9 3.5e-35
CCDS13122.1 KIF16B gene_id:55614|Hs108|chr20 (1317) 1270 149.9 3.6e-35
CCDS56178.1 KIF16B gene_id:55614|Hs108|chr20 (1392) 1270 149.9 3.8e-35
CCDS30963.1 KIF14 gene_id:9928|Hs108|chr1 (1648) 1217 144.3 2.1e-33
CCDS75296.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 726) 993 120.1 1.9e-26
CCDS34235.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 699) 975 118.1 6.9e-26
CCDS75295.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 702) 971 117.7 9.3e-26
CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20 ( 747) 917 112.0 5.3e-24
CCDS44079.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1028) 919 112.3 5.7e-24
CCDS213.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1029) 919 112.3 5.7e-24
CCDS65072.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1304) 826 102.5 6.5e-21
CCDS65071.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1335) 826 102.5 6.6e-21
CCDS6665.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1401) 826 102.5 6.8e-21
CCDS33744.1 KIF15 gene_id:56992|Hs108|chr3 (1388) 823 102.2 8.5e-21
CCDS14401.1 KIF4A gene_id:24137|Hs108|chrX (1232) 813 101.1 1.6e-20
CCDS47324.1 KIF4B gene_id:285643|Hs108|chr5 (1234) 809 100.7 2.2e-20
CCDS72722.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 ( 929) 791 98.6 6.8e-20
CCDS7422.1 KIF11 gene_id:3832|Hs108|chr10 (1056) 769 96.3 3.8e-19
CCDS58555.1 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 ( 833) 741 93.2 2.5e-18
CCDS45709.2 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 ( 852) 727 91.8 7.3e-18
CCDS10789.2 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 833) 691 87.9 1e-16
CCDS32325.2 KIF7 gene_id:374654|Hs108|chr15 (1343) 680 86.9 3.2e-16
CCDS45494.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 687) 671 85.7 3.9e-16
CCDS81988.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 724) 671 85.7 4.1e-16
CCDS45493.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 826) 671 85.8 4.5e-16
CCDS81989.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 848) 671 85.8 4.6e-16
CCDS68768.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2580) 673 86.5 8.6e-16
CCDS34042.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2701) 673 86.5 8.9e-16
CCDS7867.1 KIF18A gene_id:81930|Hs108|chr11 ( 898) 651 83.7 2.1e-15
CCDS81987.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 684) 648 83.2 2.1e-15
CCDS2751.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 725) 648 83.3 2.2e-15
CCDS2752.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 790) 648 83.3 2.4e-15
CCDS32718.2 KIF19 gene_id:124602|Hs108|chr17 ( 998) 592 77.4 1.8e-13
CCDS34430.1 KIFC1 gene_id:3833|Hs108|chr6 ( 673) 570 74.9 6.8e-13
CCDS7171.1 KIF5B gene_id:3799|Hs108|chr10 ( 963) 567 74.7 1.1e-12
CCDS74586.1 KIF5C gene_id:3800|Hs108|chr2 ( 957) 551 73.0 3.5e-12
CCDS8945.1 KIF5A gene_id:3798|Hs108|chr12 (1032) 538 71.7 9.8e-12
CCDS4844.1 KIF6 gene_id:221458|Hs108|chr6 ( 814) 526 70.3 2e-11
CCDS10653.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 ( 665) 518 69.4 3.1e-11
>>CCDS11065.1 KIF1C gene_id:10749|Hs108|chr17 (1103 aa)
initn: 7445 init1: 7445 opt: 7445 Z-score: 4306.0 bits: 808.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7445; 100.0% identity (100.0% similar) in 1103 aa overlap (1-1103:1-1103)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAGASVKVAVRVRPFNARETSQDAKCVVSMQGNTTSIINPKQSKDAPKSFTFDYSYWSHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MAGASVKVAVRVRPFNARETSQDAKCVVSMQGNTTSIINPKQSKDAPKSFTFDYSYWSHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 STEDPQFASQQQVYRDIGEEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGRQEPGQQGIVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 STEDPQFASQQQVYRDIGEEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGRQEPGQQGIVP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 QLCEDLFSRVSENQSAQLSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKSRGSLRVREHPILGPYVQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QLCEDLFSRVSENQSAQLSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKSRGSLRVREHPILGPYVQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LSKLAVTSYADIADLMDCGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQRCHDQLTGLDSEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSKLAVTSYADIADLMDCGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQRCHDQLTGLDSEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VSKISLVDLAGSERADSSGARGMRLKEGANINKSLTTLGKVISALADMQSKKRKSDFIPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VSKISLVDLAGSERADSSGARGMRLKEGANINKSLTTLGKVISALADMQSKKRKSDFIPY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 RDSVLTWLLKENLGGNSRTAMIAALSPADINYEETLSTLRYADRTKQIRCNAIINEDPNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RDSVLTWLLKENLGGNSRTAMIAALSPADINYEETLSTLRYADRTKQIRCNAIINEDPNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 RLIRELQEEVARLRELLMAQGLSASALEGLKTEEGSVRGALPAVSSPPAPVSPSSPTTHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RLIRELQEEVARLRELLMAQGLSASALEGLKTEEGSVRGALPAVSSPPAPVSPSSPTTHN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 GELEPSFSPNTESQIGPEEAMERLQETEKIIAELNETWEEKLRKTEALRMEREALLAEMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GELEPSFSPNTESQIGPEEAMERLQETEKIIAELNETWEEKLRKTEALRMEREALLAEMG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 VAVREDGGTVGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYHIKDGVTRVGQVDMDIKLTGQFIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VAVREDGGTVGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYHIKDGVTRVGQVDMDIKLTGQFIR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EQHCLFRSIPQPDGEVVVTLEPCEGAETYVNGKLVTEPLVLKSGNRIVMGKNHVFRFNHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EQHCLFRSIPQPDGEVVVTLEPCEGAETYVNGKLVTEPLVLKSGNRIVMGKNHVFRFNHP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 EQARLERERGVPPPPGPPSEPVDWNFAQKELLEQQGIDIKLEMEKRLQDLENQYRKEKEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EQARLERERGVPPPPGPPSEPVDWNFAQKELLEQQGIDIKLEMEKRLQDLENQYRKEKEE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 ADLLLEQQRLYADSDSGDDSDKRSCEESWRLISSLREQLPPTTVQTIVKRCGLPSSGKRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ADLLLEQQRLYADSDSGDDSDKRSCEESWRLISSLREQLPPTTVQTIVKRCGLPSSGKRR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 APRRVYQIPQRRRLQGKDPRWATMADLKMQAVKEICYEVALADFRHGRAEIEALAALKMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 APRRVYQIPQRRRLQGKDPRWATMADLKMQAVKEICYEVALADFRHGRAEIEALAALKMR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 ELCRTYGKPDGPGDAWRAVARDVWDTVGEEEGGGAGSGGGSEEGARGAEVEDLRAHIDKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ELCRTYGKPDGPGDAWRAVARDVWDTVGEEEGGGAGSGGGSEEGARGAEVEDLRAHIDKL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 TGILQEVKLQNSSKDRELQALRDRMLRMERVIPLAQDHEDENEEGGEVPWAPPEGSEAAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TGILQEVKLQNSSKDRELQALRDRMLRMERVIPLAQDHEDENEEGGEVPWAPPEGSEAAE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 EAAPSDRMPSARPPSPPLSSWERVSRLMEEDPAFRRGRLRWLKQEQLRLQGLQGSGGRGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EAAPSDRMPSARPPSPPLSSWERVSRLMEEDPAFRRGRLRWLKQEQLRLQGLQGSGGRGG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 GLRRPPARFVPPHDCKLRFPFKSNPQHRESWPGMGSGEAPTPLQPPEEVTPHPATPARRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GLRRPPARFVPPHDCKLRFPFKSNPQHRESWPGMGSGEAPTPLQPPEEVTPHPATPARRP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 PSPRRSHHPRRNSLDGGGRSRGAGSAQPEPQHFQPKKHNSYPQPPQPYPAQRPPGPRYPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PSPRRSHHPRRNSLDGGGRSRGAGSAQPEPQHFQPKKHNSYPQPPQPYPAQRPPGPRYPP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100
pF1KA0 YTTPPRMRRQRSAPDLKESGAAV
:::::::::::::::::::::::
CCDS11 YTTPPRMRRQRSAPDLKESGAAV
1090 1100
>>CCDS58757.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1791 aa)
initn: 2387 init1: 1573 opt: 3298 Z-score: 1912.4 bits: 366.4 E(32554): 3.3e-100
Smith-Waterman score: 3298; 69.3% identity (84.7% similar) in 747 aa overlap (1-734:1-734)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAGASVKVAVRVRPFNARETSQDAKCVVSMQGNTTSIINPKQSKDAPKSFTFDYSYWSHT
::::::::::::::::.:: :.:.::...:.:.::.:.:::: :..::::.:::::::::
CCDS58 MAGASVKVAVRVRPFNSREMSRDSKCIIQMSGSTTTIVNPKQPKETPKSFSFDYSYWSHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 STEDPQFASQQQVYRDIGEEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGRQEPGQQGIVP
: :: ..:::.::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::.:: ::::.:
CCDS58 SPEDINYASQKQVYRDIGEEMLQHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEKDQQGIIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 QLCEDLFSRVSENQSAQLSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKSRGSLRVREHPILGPYVQD
:::::::::.... . ..:::::::::::::::::::::::..:.:::::::.:::::.:
CCDS58 QLCEDLFSRINDTTNDNMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LSKLAVTSYADIADLMDCGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQRCHDQLTGLDSEK
::::::::: :: :::: :::::::::::::::::::::::.:.:::. :: :.. .::
CCDS58 LSKLAVTSYNDIQDLMDSGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFNIIFTQKRHDAETNITTEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KA0 VSKISLVDLAGSERADSSGARGMRLKEGANINKSLTTLGKVISALADMQS------KKRK
:::::::::::::::::.::.: :::::::::::::::::::::::.:.: ::.:
CCDS58 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEMDSGPNKNKKKKK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 SDFIPYRDSVLTWLLKENLGGNSRTAMIAALSPADINYEETLSTLRYADRTKQIRCNAII
.::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::.:::::::::::.:::::::.:
CCDS58 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIRCNAVI
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 NEDPNARLIRELQEEVARLRELLMAQGLSASALEGLKTEEGSVRGALPAVSSPPAPVSPS
::::: .:::::..::.:::.::.:::: : :. ..: :. : ... . .:::
CCDS58 NEDPNNKLIRELKDEVTRLRDLLYAQGL------GDITDTNTVPGG-PKLTNALVGMSPS
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 SPTTHNGELEPSFSPNTESQI---GPEEAMERLQETEKIIAELNETWEEKLRKTEALRME
: . . : : : . : :::.:::.::::::::::::::::::.:::.:::
CCDS58 SSLSALSSRAASVSSLHERILFAPGSEEAIERLKETEKIIAELNETWEEKLRRTEAIRME
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KA0 REALLAEMGVAVREDGGTVGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYHIKDGVTRVGQVD--
:::::::::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::.::::. :
CCDS58 REALLAEMGVAMREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGREDGE
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 --MDIKLTGQFIREQHCLFRSIPQPDGEVVVTLEPCEGAETYVNGKLVTEPLVLKSGNRI
.:: :.:.::.:.::.::: . .:.::::::::::.:::::: :::: .:.:::::
CCDS58 RRQDIVLSGHFIKEEHCVFRSDSRGGSEAVVTLEPCEGADTYVNGKKVTEPSILRSGNRI
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 VMGKNHVFRFNHPEQARLERERGVPPPPGPPSEPVDWNFAQKELLEQQGIDIKLEMEKRL
.:::.:::::::::::: :::: : :.::::: :::.::::.::::.: :::.::
CCDS58 IMGKSHVFRFNHPEQARQERER--TPCAETPAEPVDWAFAQRELLEKQGIDMKQEMEQRL
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 QDLENQYRKEKEEADLLLEQQRLYADSDSGDDSDKRSCEESWRLISSLREQLPPTTVQTI
:.::.:::.:.::: ::::::: : .: .. ... . . . .:. : ::
CCDS58 QELEDQYRREREEATYLLEQQRL--DYESKLEALQKQMDSRYYPEVNEEEEEPEDEVQWT
660 670 680 690 700
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 VKRCGLPSSGKRRAPRRVYQIPQRRRLQGKDPRWATMADLKMQAVKEICYEVALADFRHG
..: : . :. . ::. . : :
CCDS58 ERECELALWAFRK--WKWYQFTSLRDLLWGNAIFLKEANAISVELKKKVQFQFVLLTDTL
710 720 730 740 750 760
>>CCDS46561.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1690 aa)
initn: 2502 init1: 1573 opt: 3279 Z-score: 1901.8 bits: 364.3 E(32554): 1.3e-99
Smith-Waterman score: 3286; 69.6% identity (84.6% similar) in 749 aa overlap (1-734:1-725)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAGASVKVAVRVRPFNARETSQDAKCVVSMQGNTTSIINPKQSKDAPKSFTFDYSYWSHT
::::::::::::::::.:: :.:.::...:.:.::.:.:::: :..::::.:::::::::
CCDS46 MAGASVKVAVRVRPFNSREMSRDSKCIIQMSGSTTTIVNPKQPKETPKSFSFDYSYWSHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 STEDPQFASQQQVYRDIGEEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGRQEPGQQGIVP
: :: ..:::.::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::.:: ::::.:
CCDS46 SPEDINYASQKQVYRDIGEEMLQHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEKDQQGIIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 QLCEDLFSRVSENQSAQLSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKSRGSLRVREHPILGPYVQD
:::::::::.... . ..:::::::::::::::::::::::..:.:::::::.:::::.:
CCDS46 QLCEDLFSRINDTTNDNMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LSKLAVTSYADIADLMDCGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQRCHDQLTGLDSEK
::::::::: :: :::: :::::::::::::::::::::::.:.:::. :: :.. .::
CCDS46 LSKLAVTSYNDIQDLMDSGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFNIIFTQKRHDAETNITTEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KA0 VSKISLVDLAGSERADSSGARGMRLKEGANINKSLTTLGKVISALADMQS------KKRK
:::::::::::::::::.::.: :::::::::::::::::::::::.:.: ::.:
CCDS46 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEMDSGPNKNKKKKK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 SDFIPYRDSVLTWLLKENLGGNSRTAMIAALSPADINYEETLSTLRYADRTKQIRCNAII
.::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::.:::::::::::.:::::::.:
CCDS46 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIRCNAVI
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KA0 NEDPNARLIRELQEEVARLRELLMAQGLS-----ASALEGLKTEEGSVRGALPAVSSPPA
::::: .:::::..::.:::.::.::::. ..:: :. : ..: :.:: :
CCDS46 NEDPNNKLIRELKDEVTRLRDLLYAQGLGDITDMTNALVGM-----SPSSSLSALSSRAA
370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 PVSPSSPTTHNGELEPSFSPNTESQIGPEEAMERLQETEKIIAELNETWEEKLRKTEALR
:: . :. : :.: : :::.:::.::::::::::::::::::.:::.:
CCDS46 SVS----SLHERIL---FAP------GSEEAIERLKETEKIIAELNETWEEKLRRTEAIR
420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 MEREALLAEMGVAVREDGGTVGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYHIKDGVTRVGQVD
:::::::::::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::.::::. :
CCDS46 MEREALLAEMGVAMREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGRED
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 ----MDIKLTGQFIREQHCLFRSIPQPDGEVVVTLEPCEGAETYVNGKLVTEPLVLKSGN
.:: :.:.::.:.::.::: . .:.::::::::::.:::::: :::: .:.:::
CCDS46 GERRQDIVLSGHFIKEEHCVFRSDSRGGSEAVVTLEPCEGADTYVNGKKVTEPSILRSGN
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 RIVMGKNHVFRFNHPEQARLERERGVPPPPGPPSEPVDWNFAQKELLEQQGIDIKLEMEK
::.:::.:::::::::::: :::: : :.::::: :::.::::.::::.: :::.
CCDS46 RIIMGKSHVFRFNHPEQARQERER--TPCAETPAEPVDWAFAQRELLEKQGIDMKQEMEQ
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 RLQDLENQYRKEKEEADLLLEQQRLYADSDSGDDSDKRSCEESWRLISSLREQLPPTTVQ
:::.::.:::.:.::: ::::::: : .: .. ... . . . .:. : ::
CCDS46 RLQELEDQYRREREEATYLLEQQRL--DYESKLEALQKQMDSRYYPEVNEEEEEPEDEVQ
650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 TIVKRCGLPSSGKRRAPRRVYQIPQRRRLQGKDPRWATMADLKMQAVKEICYEVALADFR
..: : . :. . ::. . : :
CCDS46 WTERECELALWAFRK--WKWYQFTSLRDLLWGNAIFLKEANAISVELKKKVQFQFVLLTD
700 710 720 730 740 750
>>CCDS112.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1153 aa)
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10 20 30 40 50 60
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:.::::::::::::::.::::...::...::::.:::::::. :.:::::.:::::::::
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10 20 30 40 50 60
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pF1KA0 STEDPQFASQQQVYRDIGEEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGRQEPGQQGIVP
: ::: ::::..:: :::.::::::::::::::::::::::::::::::.:: .: ::.:
CCDS11 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 QLCEDLFSRVSENQSAQLSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKSRGSLRVREHPILGPYVQD
::::.:: ....: . ..:::::::::::::::::::::::..:.:::::::.:::::.:
CCDS11 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LSKLAVTSYADIADLMDCGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQRCHDQLTGLDSEK
:::::::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::. ::. :.:..::
CCDS11 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
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:::::::::::::::::.::.: :::::::::::::::::::::::....::.:.:::::
CCDS11 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVSKKKKKTDFIPY
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:::::::::.:::::::::::.::::::::::.:::::::::::.:::.:::.:::::::
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pF1KA0 RLIRELQEEVARLRELLMAQGLSASALEGLKTEEGSVRGALPAVSSPPAPVSPSSPTTHN
.:.:::.:::.::..:: ::::. . . : ::. .. :. : . :. .: :
CCDS11 KLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLG----DIIDTSMGSLTSS-PSSCSLSSQVGLTSVT---
370 380 390 400 410
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pF1KA0 GELEPSFSPNTESQIGPEEAMERLQETEKIIAELNETWEEKLRKTEALRMEREALLAEMG
:.. : : :::.:::.:.::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS11 -----SIQERIMSTPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMG
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::.::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::.:::::.: .:: :.:
CCDS11 VAIREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSG
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pF1KA0 QFIREQHCLFRSIPQPDGEVVVTLEPCEGAETYVNGKLVTEPLVLKSGNRIVMGKNHVFR
:.:.::.::: . .:::.::::::: .::::::: :..:. :.:::::.::::::::
CCDS11 AHIKEEHCIFRSERSNSGEVIVTLEPCERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFR
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:::::::: :::. : :::::::.:::.::::.::::.: :::::::..: :.:
CCDS11 FNHPEQARAEREK--TPSAETPSEPVDWTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKK
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:::::::::::::: ::::::::::::::::::.::.::::.:::. .:::::.::::::
CCDS11 EKEEADLLLEQQRLDADSDSGDDSDKRSCEESWKLITSLREKLPPSKLQTIVKKCGLPSS
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pF1KA0 GKRRAPRRVYQIPQRRRLQGKDPRWATMADLKMQAVKEICYEVALADFRHGRAEIEALAA
::.: : ..:::::::::. :: .:.:..:::.:::::::::::: ::::.: ::::::
CCDS11 GKKREPIKMYQIPQRRRLS-KDSKWVTISDLKIQAVKEICYEVALNDFRHSRQEIEALAI
710 720 730 740 750 760
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pF1KA0 LKMRELCRTYGKPDGPG--DAWRAVARDVWDTVG---EEEGGGAGSGGGSEEGARGAEVE
.::.::: ::: : :. :.::::::::::::: :. ..: :: ..:.
CCDS11 VKMKELCAMYGKKD-PNERDSWRAVARDVWDTVGVGDEKIEDVMATGKGS------TDVD
770 780 790 800 810
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pF1KA0 DLRAHIDKLTGILQEVKLQNSSKDRELQALRDRMLRMERVIPLAQDHEDENEEGGEVPWA
::..::::: :::::: ::. ::.:...::..::.::.:.:: ..:... :
CCDS11 DLKVHIDKLEDILQEVKKQNNMKDEEIKVLRNKMLKMEKVLPLIGSQEQKSP--GSHKAK
820 830 840 850 860 870
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pF1KA0 PPEGSEAAEEAAPSDRMPSARPPSPPLSSWERVSRLMEEDPAFRRGRLRWLKQEQLRLQG
: : : .. :. : . . :.. ::::.::. :::::::::::..:::.:...
CCDS11 EPVG---AGVSSTSENNVS-KGDNGELAKEERVSQLMNGDPAFRRGRLRWMRQEQIRFKN
880 890 900 910 920 930
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pF1KA0 LQGSGGRGGGLRRP--PARFVPPHDCKLRFPFKSNPQHRESW-PGMGSGEAPTPLQPPEE
:: . ::: : ::.::.. : ::::::::.::.:: :: : .
CCDS11 LQQQEITKQ-LRRQNVPHRFIPPENRKPRFPFKSNPKHRNSWSPG-------THII----
940 950 960 970
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 VTPHPATPARRPPSPRRSHHPRRNSLDGGGRSRGA--------GSAQPEPQ-HFQ-PKKH
.: . : : . . . ...: . ::. :: :: . : :.: :.:
CCDS11 ITEDEVIELRIPKDDEARKGNKEESQEKGGK--GAFKDPQFPWGSQGMRSQDHIQVSKQH
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pF1KA0 -NSYPQPPQPYPAQRPPGPRYPPYTTPPRMRRQRSAPDLKESGAAV
:. ::::
CCDS11 INNQQQPPQLRWRSNSLNNGQPKSTRCQASASAESLNSHSGHPTADVQTFQAKRHIHQHR
1040 1050 1060 1070 1080 1090
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10 20 30 40 50 60
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pF1KA0 STEDPQFASQQQVYRDIGEEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGRQEPGQQGIVP
: ::: ::::..:: :::.::::::::::::::::::::::::::::::.:: .: ::.:
CCDS11 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 QLCEDLFSRVSENQSAQLSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKSRGSLRVREHPILGPYVQD
::::.:: ....: . ..:::::::::::::::::::::::..:.:::::::.:::::.:
CCDS11 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
130 140 150 160 170 180
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pF1KA0 LSKLAVTSYADIADLMDCGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQRCHDQLTGLDSEK
:::::::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::. ::. :.:..::
CCDS11 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
190 200 210 220 230 240
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pF1KA0 VSKISLVDLAGSERADSSGARGMRLKEGANINKSLTTLGKVISALADMQSKKRKSDFIPY
:::::::::::::::::.::.: :::::::::::::::::::::::....::.:.:::::
CCDS11 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVSKKKKKTDFIPY
250 260 270 280 290 300
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pF1KA0 RDSVLTWLLKENLGGNSRTAMIAALSPADINYEETLSTLRYADRTKQIRCNAIINEDPNA
:::::::::.:::::::::::.::::::::::.:::::::::::.:::.:::.:::::::
CCDS11 RDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVINEDPNA
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pF1KA0 RLIRELQEEVARLRELLMAQGLSASALEGLKTEEGSVRGALPAVSSPPAPVSPSSPTTHN
.:.:::.:::.::..:: ::::. . . : ::. .. :. : . :. .: :
CCDS11 KLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLG----DIIDTSMGSLTSS-PSSCSLSSQVGLTSVT---
370 380 390 400 410
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pF1KA0 GELEPSFSPNTESQIGPEEAMERLQETEKIIAELNETWEEKLRKTEALRMEREALLAEMG
:.. : : :::.:::.:.::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS11 -----SIQERIMSTPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMG
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pF1KA0 VAVREDGGTVGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYHIKDGVTRVGQVD----MDIKLTG
::.::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::.:::::.: .:: :.:
CCDS11 VAIREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSG
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pF1KA0 QFIREQHCLFRSIPQPDGEVVVTLEPCEGAETYVNGKLVTEPLVLKSGNRIVMGKNHVFR
:.:.::.::: . .:::.::::::: .::::::: :..:. :.:::::.::::::::
CCDS11 AHIKEEHCIFRSERSNSGEVIVTLEPCERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFR
530 540 550 560 570 580
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pF1KA0 FNHPEQARLERERGVPPPPGPPSEPVDWNFAQKELLEQQGIDIKLEMEKRLQDLENQYRK
:::::::: :::. : :::::::.:::.::::.::::.: :::::::..: :.:
CCDS11 FNHPEQARAEREK--TPSAETPSEPVDWTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKK
590 600 610 620 630 640
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pF1KA0 EKEEADLLLEQQRLYADSDSGDDSDKRSCEESWRLISSLREQLPPTTVQTIVKRCGLPSS
:::::::::::::: .:
CCDS11 EKEEADLLLEQQRLDYESKLQALQKQVETRSLAAETTEEEEEEEEVPWTQHEFELAQWAF
650 660 670 680 690 700
>>CCDS47380.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1749 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KA0 MAGASVKVAVRVRPFNARETSQDAKCVVSMQGNTTSIINP----KQS-KDAPKSFTFDYS
:. ..:::::::::.: :: ..:::: :.:: : . : ::. . :: :.:::
CCDS47 MSDTKVKVAVRVRPMNRRELELNTKCVVEMEGNQTVLHPPPSNTKQGERKPPKVFAFDYC
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pF1KA0 YWSHTSTEDPQFASQQQVYRDIGEEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGRQEPGQ
.:: .. ..:.:. :.. .:: .: .::.:::.:::::::::.:::..:::. : :
CCDS47 FWSMDESNTTKYAGQEVVFKCLGEGILEKAFQGYNACIFAYGQTGSGKSFSMMGHAE--Q
70 80 90 100 110
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pF1KA0 QGIVPQLCEDLFSRVSENQSAQLSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPK-SRGSLRVREHPIL
:..:.:: ::.:.: .:. . ...::::::::: :.:::::.:: :: ::.:::: .:
CCDS47 LGLIPRLCCALFKRISLEQNESQTFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGSRQSLKVREHKVL
120 130 140 150 160 170
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pF1KA0 GPYVQDLSKLAVTSYADIADLMDCGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQRCHDQLT
::::. ::.:::::. :: .::. :::.:::::::::: ::::::::.:..:: .: .
CCDS47 GPYVDGLSQLAVTSFEDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFNIIITQTLYDLQS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 GLDSEKVSKISLVDLAGSERADSSGARGMRLKEGANINKSLTTLGKVISALADMQSKKRK
: ..:::::.::::::::::....:: : :::::.:::::::::: :::.:::. . : :
CCDS47 GNSGEKVSKVSLVDLAGSERVSKTGAAGERLKEGSNINKSLTTLGLVISSLADQAAGKGK
240 250 260 270 280 290
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pF1KA0 SDFIPYRDSVLTWLLKENLGGNSRTAMIAALSPADINYEETLSTLRYADRTKQIRCNAII
: :.::::::::::::.::::::.:.:::..::: ::::::::::::::.:.: .:..
CCDS47 SKFVPYRDSVLTWLLKDNLGGNSQTSMIATISPAADNYEETLSTLRYADRAKRIVNHAVV
300 310 320 330 340 350
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pF1KA0 NEDPNARLIRELQEEVARLRELLMAQGLSASALEGLKTEEGSVRGALPAVSSPPAPVSPS
::::::..::::.::: .::: : : :..: ::
CCDS47 NEDPNAKVIRELREEVEKLREQL-------SQAEAMK-----------------AP----
360 370 380 390
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pF1KA0 SPTTHNGELEPSFSPNTESQIGPEEAMERLQETEKIIAELNETWEEKLRKTEALRMEREA
::. :.:.:.::.: ::. :::::::::: . .::.
CCDS47 -------ELK-----------------EKLEESEKLIKELTVTWEEKLRKTEEIAQERQR
400 410 420
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pF1KA0 LLAEMGVAVREDGGTVGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYHIKDGVTRVG-QVDMDIK
: ::.... .: :: .::::: :: ..: :.:..:: :::: ....::.
CCDS47 QLESMGISLEMSGIKVG----DDKCYLVNLNADPALNELLVYYLKDH-TRVGADTSQDIQ
430 440 450 460 470 480
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pF1KA0 LTGQFIREQHCLFRSIPQPDGEVVVTLEPCEGAETYVNGKLVTEPLVLKSGNRIVMGKNH
: : :. ::: . .: . ::.: :: : :.:.. ::: :: : :.::. :.::
CCDS47 LFGIGIQPQHCEI-DIAS-DGDV--TLTPKENARSCVNGTLVCSTTQLWHGDRILWGNNH
490 500 510 520 530
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pF1KA0 VFRFNHPEQARLERERGVPPPPGPP-----------SEPVDWN--FAQKELLEQQGIDIK
::.: :.. : . . ::: ::: :.: ::: :.. .. .. .
CCDS47 FFRINLPKRKRRDWLKDFEKETGPPEHDLDAASEASSEP-DYNYEFAQMEVI-MKTLNSN
540 550 560 570 580 590
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pF1KA0 LEMEKRLQDLENQYRKEKEEADLLLEQQRLYADSDSGDDSDKRSCEESWRLISSLREQLP
... .: ::.:: .::. : ::.:::. . .
CCDS47 DPVQNVVQVLEKQYLEEKRSA---LEEQRLMYERELEQLRQQLSPDRQPQSSGPDRLAYS
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CCDS55 -QPGLIPRLCSGLFERTQKEENEEQSFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGSRQTLKVREHS
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CCDS55 VLGPYVDGLSKLAVTSYKDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFKITLTHTLYDV
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CCDS55 KSGTSGEKVGKLSLVDLAGSERATKTGAAGDRLKEGSNINKSLTTLGLVISALADQSAGK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]