Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0708
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0708, 2517 aa
1>>>pF1KA0708 2517 - 2517 aa - 2517 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6553+/-0.00102; mu= 16.7785+/- 0.063
mean_var=165.5433+/-32.705, 0's: 0 Z-trim(110.6): 39 B-trim: 70 in 1/50
Lambda= 0.099682
statistics sampled from 11665 (11701) to 11665 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.359), width: 16
Scan time: 9.390
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4890.1 CUL9 gene_id:23113|Hs108|chr6 (2517) 17077 2469.7 0
CCDS4881.1 CUL7 gene_id:9820|Hs108|chr6 (1698) 3431 507.2 3e-142
CCDS55003.1 CUL7 gene_id:9820|Hs108|chr6 (1782) 3431 507.2 3.1e-142
CCDS2780.1 ARIH2 gene_id:10425|Hs108|chr3 ( 493) 588 97.9 1.4e-19
CCDS10244.1 ARIH1 gene_id:25820|Hs108|chr15 ( 557) 517 87.7 1.8e-16
>>CCDS4890.1 CUL9 gene_id:23113|Hs108|chr6 (2517 aa)
initn: 17077 init1: 17077 opt: 17077 Z-score: 13270.9 bits: 2469.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 17077; 100.0% identity (100.0% similar) in 2517 aa overlap (1-2517:1-2517)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MVGERHAGDLMVPLGPRLQAYPEELIRQRPGHDGHPEYLIRWSVLKCGEVGKVGVEEGKA
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CCDS48 MVGERHAGDLMVPLGPRLQAYPEELIRQRPGHDGHPEYLIRWSVLKCGEVGKVGVEEGKA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 EHILMWLSAPEVYANCPGLLGERALSKGLQHEPAGVSGSFPRDPGGLDEVAMGEMEADVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EHILMWLSAPEVYANCPGLLGERALSKGLQHEPAGVSGSFPRDPGGLDEVAMGEMEADVQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 ALVRRAARQLAESGTPSLTAAVLHTIHVLSAYASIGPLTGVFRETGALDLLMHMLCNPEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ALVRRAARQLAESGTPSLTAAVLHTIHVLSAYASIGPLTGVFRETGALDLLMHMLCNPEP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 QIRRSAGKMLQALAAHDAGSRAHVLLSLSQQDGIEQHMDFDSRYTLLELFAETTSSEEHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QIRRSAGKMLQALAAHDAGSRAHVLLSLSQQDGIEQHMDFDSRYTLLELFAETTSSEEHC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 MAFEGIHLPQIPGKLLFSLVKRYLCVTSLLDQLNSSPELGAGDQSSPCATREKSRGQREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MAFEGIHLPQIPGKLLFSLVKRYLCVTSLLDQLNSSPELGAGDQSSPCATREKSRGQREL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 EFSMAVGNLISELVRSMGWARNLSEQGMSPPRPTRSIFQPYISGPSLLLPTIVTTPRRQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EFSMAVGNLISELVRSMGWARNLSEQGMSPPRPTRSIFQPYISGPSLLLPTIVTTPRRQG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 WVFRQRSEFSSRSGYGEYVQQTLQPGMRVRMLDDYEEISAGDEGEFRQSNNGIPPVQVFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 WVFRQRSEFSSRSGYGEYVQQTLQPGMRVRMLDDYEEISAGDEGEFRQSNNGIPPVQVFW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 QSTGRTYWVHWHMLEILGPEEATEDKASAAVEKGAGATVLGTAFPSWDWNPMDGLYPLPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QSTGRTYWVHWHMLEILGPEEATEDKASAAVEKGAGATVLGTAFPSWDWNPMDGLYPLPY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 LQPEPQKNERVGYLTQAEWWELLFFIKKLDLCEQQPIFQNLWKNLDETLGEKALGEISVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LQPEPQKNERVGYLTQAEWWELLFFIKKLDLCEQQPIFQNLWKNLDETLGEKALGEISVS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 VEMAESLLQVLSSRFEGSTLNDLLNSQIYTKYGLLSNEPSSSSTSRNHSCTPDPEEESKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VEMAESLLQVLSSRFEGSTLNDLLNSQIYTKYGLLSNEPSSSSTSRNHSCTPDPEEESKS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 EASFSEEETESLKAKAEAPKTEAEPTKTRTETPMAQSDSQLFNQLLVTEGMTLPTEMKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EASFSEEETESLKAKAEAPKTEAEPTKTRTETPMAQSDSQLFNQLLVTEGMTLPTEMKEA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 ASEMARALRGPGPRSSLDQHVAAVVATVQISSLDTNLQLSGLSALSQAVEEVTERDHPLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ASEMARALRGPGPRSSLDQHVAAVVATVQISSLDTNLQLSGLSALSQAVEEVTERDHPLV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 RPDRSLREKLVKMLVELLTNQVGEKMVVVQALRLLYLLMTKHEWRPLFAREGGIYAVLVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RPDRSLREKLVKMLVELLTNQVGEKMVVVQALRLLYLLMTKHEWRPLFAREGGIYAVLVC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 MQEYKTSVLVQQAGLAALKMLAVASSSEIPTFVTGRDSIHSLFDAQMTREIFASIDSATR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MQEYKTSVLVQQAGLAALKMLAVASSSEIPTFVTGRDSIHSLFDAQMTREIFASIDSATR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 PGSESLLLTVPAAVILMLNTEGCSSAARNGLLLLNLLLCNHHTLGDQIITQELRDTLFRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PGSESLLLTVPAAVILMLNTEGCSSAARNGLLLLNLLLCNHHTLGDQIITQELRDTLFRH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 SGIAPRTEPMPTTRTILMMLLNRYSEPPGSPERAALETPIIQGQDGSPELLIRSLVGGPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SGIAPRTEPMPTTRTILMMLLNRYSEPPGSPERAALETPIIQGQDGSPELLIRSLVGGPS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 AELLLDLERVLCREGSPGGAVRPLLKRLQQETQPFLLLLRTLDAPGPNKTLLLSVLRVIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AELLLDLERVLCREGSPGGAVRPLLKRLQQETQPFLLLLRTLDAPGPNKTLLLSVLRVIT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 RLLDFPEAMVLPWHEVLEPCLNCLSGPSSDSEIVQELTCFLHRLASMHKDYAVVLCCLGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RLLDFPEAMVLPWHEVLEPCLNCLSGPSSDSEIVQELTCFLHRLASMHKDYAVVLCCLGA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 KEILSKVLDKHSAQLLLGCELRDLVTECEKYAQLYSNLTSSILAGCIQMVLGQIEDHRRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KEILSKVLDKHSAQLLLGCELRDLVTECEKYAQLYSNLTSSILAGCIQMVLGQIEDHRRT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 HQPINIPFFDVFLRHLCQGSSVEVKEDKCWEKVEVSSNPHRASKLTDHNPKTYWESNGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 HQPINIPFFDVFLRHLCQGSSVEVKEDKCWEKVEVSSNPHRASKLTDHNPKTYWESNGST
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 GSHYITLHMHRGVLVRQLTLLVASEDSSYMPARVVVFGGDSTSCIGTELNTVNVMPSASR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GSHYITLHMHRGVLVRQLTLLVASEDSSYMPARVVVFGGDSTSCIGTELNTVNVMPSASR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 VILLENLNRFWPIIQIRIKRCQQGGIDTRVRGVEVLGPKPTFWPLFREQLCRRTCLFYTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VILLENLNRFWPIIQIRIKRCQQGGIDTRVRGVEVLGPKPTFWPLFREQLCRRTCLFYTI
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 RAQAWSRDIAEDHRRLLQLCPRLNRVLRHEQNFADRFLPDDEAAQALGKTCWEALVSPLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RAQAWSRDIAEDHRRLLQLCPRLNRVLRHEQNFADRFLPDDEAAQALGKTCWEALVSPLV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 QNITSPDAEGVSALGWLLDQYLEQRETSRNPLSRAASFASRVRRLCHLLVHVEPPPGPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QNITSPDAEGVSALGWLLDQYLEQRETSRNPLSRAASFASRVRRLCHLLVHVEPPPGPSP
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 EPSTRPFSKNSKGRDRSPAPSPVLPSSSLRNITQCWLSVVQEQVSRFLAAAWRAPDFVPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EPSTRPFSKNSKGRDRSPAPSPVLPSSSLRNITQCWLSVVQEQVSRFLAAAWRAPDFVPR
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 YCKLYEHLQRAGSELFGPRAAFMLALRSGFSGALLQQSFLTAAHMSEQFARYIDQQIQGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 YCKLYEHLQRAGSELFGPRAAFMLALRSGFSGALLQQSFLTAAHMSEQFARYIDQQIQGG
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 LIGGAPGVEMLGQLQRHLEPIMVLSGLELATTFEHFYQHYMADRLLSFGSSWLEGAVLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LIGGAPGVEMLGQLQRHLEPIMVLSGLELATTFEHFYQHYMADRLLSFGSSWLEGAVLEQ
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA0 IGLCFPNRLPQLMLQSLSTSEELQRQFHLFQLQRLDKLFLEQEDEEEKRLEEEEEEEEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 IGLCFPNRLPQLMLQSLSTSEELQRQFHLFQLQRLDKLFLEQEDEEEKRLEEEEEEEEEE
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA0 EAEKELFIEDPSPAISILVLSPRCWPVSPLCYLYHPRKCLPTEFCDALDRFSSFYSQSQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EAEKELFIEDPSPAISILVLSPRCWPVSPLCYLYHPRKCLPTEFCDALDRFSSFYSQSQN
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA0 HPVLDMGPHRRLQWTWLGRAELQFGKQILHVSTVQMWLLLKFNQTEEVSVETLLKDSDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 HPVLDMGPHRRLQWTWLGRAELQFGKQILHVSTVQMWLLLKFNQTEEVSVETLLKDSDLS
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA0 PELLLQALVPLTSGNGPLTLHEGQDFPHGGVLRLHEPGPQRSGEALWLIPPQAYLNVEKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PELLLQALVPLTSGNGPLTLHEGQDFPHGGVLRLHEPGPQRSGEALWLIPPQAYLNVEKD
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA0 EGRTLEQKRNLLSCLLVRILKAHGEKGLHIDQLVCLVLEAWQKGPNPPGTLGHTVAGGVA
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CCDS48 EGRTLEQKRNLLSCLLVRILKAHGEKGLHIDQLVCLVLEAWQKGPNPPGTLGHTVAGGVA
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA0 CTSTDVLSCILHLLGQGYVKRRDDRPQILMYAAPEPMGPCRGQADVPFCGSQSETSKPSP
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CCDS48 CTSTDVLSCILHLLGQGYVKRRDDRPQILMYAAPEPMGPCRGQADVPFCGSQSETSKPSP
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA0 EAVATLASLQLPAGRTMSPQEVEGLMKQTVRQVQETLNLEPDVAQHLLAHSHWGAEQLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EAVATLASLQLPAGRTMSPQEVEGLMKQTVRQVQETLNLEPDVAQHLLAHSHWGAEQLLQ
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KA0 SYSEDPEPLLLAAGLCVHQAQAVPVRPDHCPVCVSPLGCDDDLPSLCCMHYCCKSCWNEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SYSEDPEPLLLAAGLCVHQAQAVPVRPDHCPVCVSPLGCDDDLPSLCCMHYCCKSCWNEY
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KA0 LTTRIEQNLVLNCTCPIADCPAQPTGAFIRAIVSSPEVISKYEKALLRGYVESCSNLTWC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LTTRIEQNLVLNCTCPIADCPAQPTGAFIRAIVSSPEVISKYEKALLRGYVESCSNLTWC
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KA0 TNPQGCDRILCRQGLGCGTTCSKCGWASCFNCSFPEAHYPASCGHMSQWVDDGGYYDGMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TNPQGCDRILCRQGLGCGTTCSKCGWASCFNCSFPEAHYPASCGHMSQWVDDGGYYDGMS
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KA0 VEAQSKHLAKLISKRCPSCQAPIEKNEGCLHMTCAKCNHGFCWRCLKSWKPNHKDYYNCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VEAQSKHLAKLISKRCPSCQAPIEKNEGCLHMTCAKCNHGFCWRCLKSWKPNHKDYYNCS
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KA0 AMVSKAARQEKRFQDYNERCTFHHQAREFAVNLRNRVSAIHEVPPPRSFTFLNDACQGLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AMVSKAARQEKRFQDYNERCTFHHQAREFAVNLRNRVSAIHEVPPPRSFTFLNDACQGLE
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KA0 QARKVLAYACVYSFYSQDAEYMDVVEQQTENLELHTNALQILLEETLLRCRDLASSLRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QARKVLAYACVYSFYSQDAEYMDVVEQQTENLELHTNALQILLEETLLRCRDLASSLRLL
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KA0 RADCLSTGMELLRRIQERLLAILQHSAQDFRVGLQSPSVEAWEAKGPNMPGSQPQASSGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RADCLSTGMELLRRIQERLLAILQHSAQDFRVGLQSPSVEAWEAKGPNMPGSQPQASSGP
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510
pF1KA0 EAEEEEEDDEDDVPEWQQDEFDEELDNDSFSYDESENLDQETFFFGDEEEDEDEAYD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EAEEEEEDDEDDVPEWQQDEFDEELDNDSFSYDESENLDQETFFFGDEEEDEDEAYD
2470 2480 2490 2500 2510
>>CCDS4881.1 CUL7 gene_id:9820|Hs108|chr6 (1698 aa)
initn: 5024 init1: 3399 opt: 3431 Z-score: 2667.3 bits: 507.2 E(32554): 3e-142
Smith-Waterman score: 5973; 51.2% identity (67.5% similar) in 2023 aa overlap (1-1991:1-1678)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MVGERHAGDLMVPLGPRLQAYPEELIRQRPGHDGHPEYLIRWSVLKCGEVGK--VGVEEG
:::: . .. ::::: :.:::.:::::: :::::::: ::: .:. :. : : .
CCDS48 MVGELRYREFRVPLGPGLHAYPDELIRQRVGHDGHPEYQIRWLILRRGDEGDGGSGQVDC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 KAEHILMWLSAPEVYANCPGLLGERALSKGLQHEPAGVSGSFPRDPGGLDEVAMGEMEAD
::::::.:.: :.:::: .::: . : ..: :: . :.::. .. :::.:
CCDS48 KAEHILLWMSKDEIYANCHKMLGEDGQVIGPSQESAG-------EVGALDKSVLEEMETD
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 VQALVRRAARQLAESGTPSLTAAVLHTIHVLSAYASIGPLTGVFRETGALDLLMHMLCNP
:..:..:: ::: : : .:::.::::::::: ::::::.. .:::::::: .:
CCDS48 VKSLIQRALRQLEECVGTIPPAPLLHTVHVLSAYASIEPLTGVFKDPRVLDLLMHMLSSP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 EPQIRRSAGKMLQALAAHDAGSRAHVLLSLSQQDGIEQHMDFDSRYTLLELFAETTSSEE
. ::: :::.:.:::..::::.:...:::::::..::.:.::::: .:: :::..: ::
CCDS48 DYQIRWSAGRMIQALSSHDAGTRTQILLSLSQQEAIEKHLDFDSRCALLALFAQATLSE-
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 HCMAFEGIHLPQIPGKLLFSLVKRYLCVTSLLDQLN-SSPELGAGDQSSPCATREKSRGQ
: :.::::.:::.::..::::::::: ::::::::: :. : :: . :.: . :::
CCDS48 HPMSFEGIQLPQVPGRVLFSLVKRYLHVTSLLDQLNDSAAEPGAQNTSAPEELSGE-RGQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 RELEFSMAVGNLISELVRSMGWARNLSEQGMSPPRPTRSIFQPYISGPSLLLPTIVTTPR
:::::::.:.::::::..: : . :.. : : ::::: .. : ::. . :
CCDS48 LELEFSMAMGTLISELVQAMRWDQA-SDRPRSSARSPGSIFQPQLADVSPGLPAAQAQPS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 -RQGWVFRQRSEFSSRSGYGEYVQQTLQPGMRVRMLDDYEEISAGDEGEFRQSNNGIPPV
:.. :: ::::.: . :. ::..:::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS48 FRRSRRFRPRSEFASGNTYALYVRDTLQPGMRVRMLDDYEEISAGDEGEFRQSNNGVPPV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 QVFWQSTGRTYWVHWHMLEILGPEEATEDKASAAVEKGAGAT-VLGTAFPSWDWNPMDGL
::::.::::::::::::::::: :: :: . : .:: :. ::: :.:.: : :: :
CCDS48 QVFWESTGRTYWVHWHMLEILGFEEDIEDMVEADEYQGAVASRVLGRALPAWRWRPMTEL
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 YPLPYLQPEPQKNERVGYLTQAEWWELLFFIKKLDLCEQQPIFQNLWKNLD-ETLGEKAL
: .::. :: . .:. .:: :::::::::::::: ..: ..: : .::: : : .. :
CCDS48 YAVPYVLPEDEDTEECEHLTLAEWWELLFFIKKLDGPDHQEVLQILQENLDGEILDDEIL
480 490 500 510 520 530
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pF1KA0 GEISVSVEMAESLLQVLSSRFEGSTLNDLLNSQIYTKYGLLSNEPSSSSTSRNHSCTPDP
.:..: .:.:..:: .: .:.. :.: ::.: ..: :::
CCDS48 AELAVPIELAQDLLLTLPQRLNDSALRDLINCHVYKKYG---------------------
540 550 560
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: : . .: . .::
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.: :.:
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590
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:: :
CCDS48 ----------------------LLDAQ---------------------------------
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: :..:: :: :.
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pF1KA0 IDSATRPGSESLLLTVPAAVILMLNTEGCSSAARNGLLLLNLLLCNHHTLGDQIITQELR
.. : .: :.:
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: : : : ...:
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::....:::::..: ::. . :.::: .::.. :::: :...::.: :.:: :.
CCDS48 ---GPAGKILLDLEQALSSEGTQENKVKPLLLQLQRQPQPFLALMQSLDTPETNRTLHLT
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:::.. .:.:::::..:::::... :. :: .:..: :..::: :::::.:. .:::::
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: :::.. .::.:.:: ..: :. ::::.: .:::.:.:: .: ..::.::::::::::
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::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EDHRRTHQPINIPFFDVFLRYLCQGSSVEVKEDKCWEKVEVSSNPHRASKLTDHNPKTYW
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:::::.:::::::::.::.:.::::::::::::::::::::: :::::: . ::::.:::
CCDS48 ESNGSAGSHYITLHMRRGILIRQLTLLVASEDSSYMPARVVVCGGDSTSSLHTELNSVNV
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:::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::.:.:::::::::.:::::::.:
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::: .::::::.:.:::.: ::.: ::: .::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RLFYMVRAQAWSQDMAEDRRSLLHLSSRLNGALRQEQNFADRFLPDDEAAQALGKTCWEA
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.: : .: :: ..: ...: : . :::: .::.:.:: .::..::. ::...::
CCDS48 CEAPPPVVATPRPKGRN-RSHDWSSLATRGLPSSIMRNLTRCWRAVVEKQVNNFLTSSWR
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:::::::. .. :: ..::::::::::.:::..: .::::. :: :::.::::::.:
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::::::. :::: .: :.:::. :. ....::::.::::::.::::::::::. ::::
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::::::::: :::::::: ::::::::.:::::::..:::.::. .:. :: :.:
CCDS48 EGAVLEQIGPCFPNRLPQQMLQSLSTSKELQRQFHVYQLQQLDQELLKLEDTEKKIQVGL
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. :.::: ::::: ...:. : : .:.:::: . :::. .
CCDS48 GASGKEHKSEKEEEAGAAAVVDVAEGEEEEEENEDLYYEGAMPEVSVLVLSRHSWPVASI
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pF1KA0 CYLYHPRKCLPTEFCDALDRFSSFYSQSQNHPVLDMGPHRRLQWTWLGRAELQFGKQILH
:. .:: :::. . .:.:.:.::..::.::.:. : .::::::::: ::::::.: ::
CCDS48 CHTLNPRTCLPSYLRGTLNRYSNFYNKSQSHPALERGSQRRLQWTWLGWAELQFGNQTLH
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:::::::::: .:. . ::::.:: : :: ..: ::. ::::. ::: ::: .:.: ::
CCDS48 VSTVQMWLLLYLNDLKAVSVESLLAFSGLSADMLNQAIGPLTSSRGPLDLHEQKDIP-GG
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::.... . :. . . :::::.::..: ..:..::..::::.::.::::::::..::
CCDS48 VLKIRDGSKEPRSRWDIVRLIPPQTYLQAEGEDGQNLEKRRNLLNCLIVRILKAHGDEGL
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::::::::::::::::: :: : ... : ::.:::::::::::::.: ..:.:::::.
CCDS48 HIDQLVCLVLEAWQKGPCPPRGLVSSLGKGSACSSTDVLSCILHLLGKGTLRRHDDRPQV
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CCDS48 TFR
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CCDS55 AGEGLGRLRDSQDTVAGASDLIRTRTQILLSLSQQEAIEKHLDFDSRCALLALFAQATLS
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:: :::::::.:.::::::..: : . :.. : : ::::: .. : ::. .
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: :.. :: ::::.: . :. ::..:::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS55 PSFRRSRRFRPRSEFASGNTYALYVRDTLQPGMRVRMLDDYEEISAGDEGEFRQSNNGVP
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::::::.::::::::::::::::: :: :: . : .:: :. ::: :.:.: : ::
CCDS55 PVQVFWESTGRTYWVHWHMLEILGFEEDIEDMVEADEYQGAVASRVLGRALPAWRWRPMT
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:: .::. :: . .:. .:: :::::::::::::: ..: ..: : .::: : : ..
CCDS55 ELYAVPYVLPEDEDTEECEHLTLAEWWELLFFIKKLDGPDHQEVLQILQENLDGEILDDE
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CCDS55 ILAELAVPIELAQDLLLTLPQRLNDSALRDLINCHVYKKYG-------------------
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CCDS55 EALVSPVVQNITSPDEDGISPLGWLLDQYLECQEAVFNPQSRGPAFFSRVRRLTHLLVHV
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CCDS55 GLGASGKEHKSEKEEEAGAAAVVDVAEGEEEEEENEDLYYEGAMPEVSVLVLSRHSWPVA
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CCDS55 LHVSTVQMWLLLYLNDLKAVSVESLLAFSGLSADMLNQAIGPLTSSRGPLDLHEQKDIP-
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1830 1840 1850 1860 1870 1880
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CCDS55 GGVLKIRDGSKEPRSRWDIVRLIPPQTYLQAEGEDGQNLEKRRNLLNCLIVRILKAHGDE
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1890 1900 1910 1920 1930 1940
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CCDS55 GLHIDQLVCLVLEAWQKGPCPPRGLVSSLGKGSACSSTDVLSCILHLLGKGTLRRHDDRP
1670 1680 1690 1700 1710 1720
1950 1960 1970 1980 1990 2000
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CCDS55 QVLSYAVPVTVMEPHTESLNP--GS----SGPNPP--LTFHTLQIRSRGVPYASCTATQS
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CCDS55 FSTFR
1780
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CCDS27 SLACQHQFCRSCWEQHCSVLVKDGVGVGVSCMAQDCPLRTPEDFVFPLLPNEELREKYRR
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CCDS27 TYQR---IHEKIQERVMNNLGTWIDWQYLQNAAKLLAKCRYTLQYTYPYAYYMESGPRKK
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CCDS27 LFEYQQAQLEAEIENLSWKVERADSYDRGDLENQMHIAEQRRRTLLKDFHDT
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CCDS10 LGPGGGGGGGGGGGGGGPGHEQEEDYRYEVLTAEQILQHMVECIREVNEVIQNPATITRI
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CCDS10 LLSHFNWDKEKLMERYFDGNLEKLFAECHVINPSKKSRTRQMNTRSSAQDMPCQICYLNY
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CCDS10 PNSYFTGLECGHKFCMQCWSEYLTTKIMEEGMGQTISCPAHGCDILVDDNTVMRLITDSK
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CCDS10 VKLKYQHLITNSFVECNRLLKWCPAPD-CHHVVKVQYPDAKPVRCKCGRQFCFNCG-ENW
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CCDS10 HDPVKCKWLKKWIKKCDD---------DSETSNWIAANTKECPKCHVTIEKDGGCNHMVC
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]