Result of FASTA (omim) for
pF1KA0715
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0715, 1461 aa
1>>>pF1KA0715 1461 - 1461 aa - 1461 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1431+/-0.000487; mu= 19.6619+/- 0.030
mean_var=93.3781+/-19.604, 0's: 0 Z-trim(111.2): 194 B-trim: 1245 in 2/52
Lambda= 0.132725
statistics sampled from 19491 (19738) to 19491 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16
Scan time: 16.980
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011520132 (OMIM: 605855) PREDICTED: probable ph (1107) 2463 483.2 4.9e-135
XP_011520131 (OMIM: 605855) PREDICTED: probable ph (1194) 2463 483.2 5.2e-135
XP_016877926 (OMIM: 605855) PREDICTED: probable ph (1194) 2463 483.2 5.2e-135
XP_016877925 (OMIM: 605855) PREDICTED: probable ph (1352) 2463 483.2 5.7e-135
XP_011520130 (OMIM: 605855) PREDICTED: probable ph (1416) 2463 483.2 6e-135
XP_005268318 (OMIM: 605855) PREDICTED: probable ph (1499) 2463 483.3 6.3e-135
NP_077816 (OMIM: 605855) probable phospholipid-tra (1499) 2463 483.3 6.3e-135
XP_011520128 (OMIM: 605855) PREDICTED: probable ph (1499) 2463 483.3 6.3e-135
XP_011520372 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph ( 739) 1180 237.4 3.2e-61
XP_011520371 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph ( 937) 1180 237.5 3.8e-61
XP_016878085 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph ( 981) 1180 237.5 4e-61
XP_011520366 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1008) 1180 237.5 4.1e-61
XP_005245413 (OMIM: 605867) PREDICTED: phospholipi (1190) 1181 237.7 4.1e-61
XP_005245412 (OMIM: 605867) PREDICTED: phospholipi (1209) 1181 237.7 4.1e-61
NP_065185 (OMIM: 605867) phospholipid-transporting (1223) 1181 237.7 4.2e-61
XP_016878084 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1093) 1180 237.5 4.3e-61
XP_011520363 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1093) 1180 237.5 4.3e-61
XP_011520365 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1093) 1180 237.5 4.3e-61
XP_011520362 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1093) 1180 237.5 4.3e-61
XP_011520364 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1093) 1180 237.5 4.3e-61
XP_011520361 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1105) 1180 237.5 4.4e-61
XP_011520360 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1111) 1180 237.5 4.4e-61
XP_016878083 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1111) 1180 237.5 4.4e-61
NP_079113 (OMIM: 609123) probable phospholipid-tra (1192) 1180 237.5 4.7e-61
XP_016878081 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1192) 1180 237.5 4.7e-61
XP_011520351 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1220) 1180 237.5 4.8e-61
XP_011520350 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1220) 1180 237.5 4.8e-61
XP_011520354 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1220) 1180 237.5 4.8e-61
XP_011520353 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1220) 1180 237.5 4.8e-61
XP_016878080 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1220) 1180 237.5 4.8e-61
XP_011520355 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1220) 1180 237.5 4.8e-61
XP_016878079 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1220) 1180 237.5 4.8e-61
XP_011520349 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1220) 1180 237.5 4.8e-61
XP_011520348 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1257) 1180 237.5 4.9e-61
XP_016878078 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1259) 1180 237.5 4.9e-61
XP_016878077 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1269) 1180 237.5 4.9e-61
XP_016878076 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1294) 1180 237.5 5e-61
XP_011520358 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1322) 1180 237.6 5.1e-61
XP_016857361 (OMIM: 605867) PREDICTED: phospholipi (1191) 1145 230.8 4.9e-59
XP_016857360 (OMIM: 605867) PREDICTED: phospholipi (1210) 1145 230.8 4.9e-59
XP_005268356 (OMIM: 605868) PREDICTED: probable ph (1192) 1111 224.3 4.4e-57
XP_016878082 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable ph (1139) 1105 223.2 9.5e-57
NP_115565 (OMIM: 605868) probable phospholipid-tra (1191) 1105 223.2 9.8e-57
XP_005268357 (OMIM: 605868) PREDICTED: probable ph (1171) 1100 222.2 1.9e-56
XP_005268358 (OMIM: 605868) PREDICTED: probable ph (1139) 1097 221.6 2.7e-56
XP_005268360 (OMIM: 605868) PREDICTED: probable ph (1139) 1097 221.6 2.7e-56
XP_011535782 (OMIM: 605868) PREDICTED: probable ph (1139) 1097 221.6 2.7e-56
XP_005268362 (OMIM: 605868) PREDICTED: probable ph (1134) 1095 221.2 3.6e-56
XP_005268363 (OMIM: 605868) PREDICTED: probable ph (1134) 1095 221.2 3.6e-56
NP_056020 (OMIM: 605868) probable phospholipid-tra (1134) 1095 221.2 3.6e-56
>>XP_011520132 (OMIM: 605855) PREDICTED: probable phosph (1107 aa)
initn: 1959 init1: 1749 opt: 2463 Z-score: 2545.3 bits: 483.2 E(85289): 4.9e-135
Smith-Waterman score: 2685; 48.0% identity (72.5% similar) in 960 aa overlap (461-1392:63-990)
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 FSDKTGTLTENKMVFRRCTIMGSEYSHQENAKRLETPKELDSDGEEWTQYQCLSFSARWA
:.:: .: ::. :: . . : : :
XP_011 WECEPPCAIAFHPDRSRWWPPSMWARSSAPAQRLARYQEADSEEEEVVP-RGGSVSQR--
40 50 60 70 80
500 510 520 530 540
pF1KA0 QDPATMRSQKGAQPLRRSQSARVPIQGHYR--QRSMGHRESS-QPPVAFSSSIEKDVTPD
... :..... ..:.::.. .: : .:. ..: : . .:::: .:::.:::
XP_011 ---GSIGSHQSVRVVHRTQSTK----SHRRTGSRAEAKRASMLSKHTAFSSPMEKDITPD
90 100 110 120 130 140
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 KNLLTKVRDAALWLETLSDSRPAKASLSTT-SSIADFFLALTICNSVMVSTTTEPRQRVT
.:: :: . : . .. : :: :.. :::.::::::.:.:.. .:: .:
XP_011 PKLLEKVSECDKSLAVARHQEHLLAHLSPELSDVFDFFIALTICNTVVVTSPDQPRTKVR
150 160 170 180 190 200
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 IKPSSKALGTSLEKIQQLFQKLKLLSLSQSFSSTAPSDTDLGESLGANVATTDSDE----
.. :. ..: . . : : : .:..: : . .. ..::.. .: :..
XP_011 VRFELKSPVKTIEDFLRRFTPSCLTSGCSSIGSLAANKSS--HKLGSSFPSTPSSDGMLL
210 220 230 240 250 260
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 RDDASVCSGGDSTDDGGYRSSMWDQGDILESGSGTSLEEALEAPATDLARPEFCYEAESP
: . . . .. ..:: : :.: : : : : . :. ::::::
XP_011 RLEERLGQPTSAIASNGYSS----QADNWAS------ELAQEQESER----ELRYEAESP
270 280 290 300
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 DEAALVHAAHAYSFTLVSRTPEQVTVRLPQGTCLTFSLLCTLGFDSVRKRMSVVVRHPLT
::::::.::.::. .:: : .::.:.::. ::: :: ::::::::::::::.:::::
XP_011 DEAALVYAARAYNCVLVERLHDQVSVELPHLGRLTFELLHTLGFDSVRKRMSVVIRHPLT
310 320 330 340 350 360
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 GEIVVYTKGADSVIMDLLEDPACVPDINMEKKLRKIRARTQKHLDLYARDGLRTLCIAKK
:: :::::::::.::::. : : ... .:::..::..:..:: .:::::::::.
XP_011 DEINVYTKGADSVVMDLLQ-PCSSVDARGRHQ-KKIRSKTQNYLNVYAAEGLRTLCIAKR
370 380 390 400 410 420
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 VVSEEDFRRWASFRREAEASLDNRDELLMETAQHLENQLTLLGATGIEDRLQEGVPDTIA
:.:.:.. : . . :::.::.: .:::...: .::..: ::::::::::::.:::.::.
XP_011 VLSKEEYACWLQSHLEAESSLENSEELLFQSAIRLETNLHLLGATGIEDRLQDGVPETIS
430 440 450 460 470 480
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 TLREAGIQLWVLTGDKQETAVNIAHSCRLLNQTDTVYTINTENQETCESILNCALEELKQ
::.::.:.:::::::::::::::..:.::.. . : :.:. .::.: ..:. : . :
XP_011 KLRQAGLQIWVLTGDKQETAVNIAYACKLLDHDEEVITLNATSQEACAALLDQCLCYV-Q
490 500 510 520 530 540
970 980 990 1000 1010
pF1KA0 FRELQKPDRKLFG---FRLPSKTPSITSEAVVPEAGLVIDGKTLNAIFQGKLEKKFLELT
: ::. .: : .:. : : :: : . .:::::..: .. .:: ::: :.
XP_011 SRGLQRAPEKTKGKVSMRFSSLCPPSTSTASGRRPSLVIDGRSLAYALEKNLEDKFLFLA
550 560 570 580 590 600
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 QYCRSVLCCRSTPLQKSMIVKLVRDKLRVMTLSIGDGANDVSMIQAADIGIGISGQEGMQ
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XP_011 KQCRSVLCCRSTPLQKSMVVKLVRSKLKAMTLAIGDGANDVSMIQVADVGVGISGQEGMQ
610 620 630 640 650 660
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 AVMSSDFAITRFKHLKKLLLVHGHWCYSRLARMVVYYLYKNVCYVNLLFWYQFFCGFSSS
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XP_011 AVMASDFAVPKFRYLERLLILHGHWCYSRLANMVLYFFYKNTMFVGLLFWFQFFCGFSAS
670 680 690 700 710 720
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 TMIDYWQMIFFNLFFTSLPPLVFGVLDKDISAETLLALPELYKSGQNSECYNLSTFWISM
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XP_011 TMIDQWYLIFFNLLFSSLPPLVTGVLDRDVPANVLLTNPQLYKSGQNMEEYRPRTFWFNM
730 740 750 760 770 780
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 VDAFYQSLICFFIPYLAYKGSDIDVFTFGTPINTISLTTILLHQAMEMKTWTIFHGVVLL
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XP_011 ADAAFQSLVCFSIPYLAYYDSNVDLFTWGTPIVTIALLTFLLHLGIETKTWTWLNWITCG
790 800 810 820 830 840
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA0 GSFLMYFLVSLLYNATCVICNSPTNPYWVMEGQLSNPTFYLVCFLTPVVALLPRYFFLSL
: :..: :.:.:::.:. : :.::::.:.. :..:.:::.:..:::.::::: :: ::
XP_011 FSVLLFFTVALIYNASCATCYPPSNPYWTMQALLGDPVFYLTCLMTPVAALLPRLFFRSL
850 860 870 880 890 900
1320 1330 1340 1350 1360
pF1KA0 QGTCGKSLISKAQKIDK-----------------LPPDKRNLEIQSWRSRQRPAPVPEVA
:: . .. :... . :: :. . : .: :. . .:. . .
XP_011 QGRVFPTQLQLARQLTRKSPRRCSAPKETFAQGRLPKDS-GTEHSSGRTVKTSVPLSQPS
910 920 930 940 950 960
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KA0 RPTHHPVSSITGQDFSASTPKSSNPPKRKHVEESVLHEQRCGTECMRDDSCSGDSSAQLS
:..:: :. .. ... : : :.:
XP_011 WHTQQPVCSLEASGEPSTVDMSM--PVREHTLLEGLSAPAPMSSAPGEAVLRSPGGCPEE
970 980 990 1000 1010 1020
>>XP_011520131 (OMIM: 605855) PREDICTED: probable phosph (1194 aa)
initn: 2479 init1: 1749 opt: 2463 Z-score: 2544.9 bits: 483.2 E(85289): 5.2e-135
Smith-Waterman score: 3304; 50.0% identity (74.0% similar) in 1109 aa overlap (313-1392:1-1077)
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 VGIVIYAGHETKAMLNNSGPRYKRSKIERRMNIDIFFCIGILILMCLIGAVGHSIWNGTF
:: :...:. .:. : :..::::..: .
XP_011 MNCDVLWCVLLLVCMSLFSAVGHGLWIWRY
10 20 30
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 EEHPP-FDVPDANGSFLPSALGGFYMFLTMIILLQVLIPISLYVSIELVKLGQVFFLSND
.:. : :: ..:: : . .. : ::::::.::::::::::::::.:: ::.:...:
XP_011 QEKKSLFYVPKSDGSSLSPVTAAVYSFLTMIIVLQVLIPISLYVSIEIVKACQVYFINQD
40 50 60 70 80 90
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 LDLYDEETDLSIQCRALNIAEDLGQIQYIFSDKTGTLTENKMVFRRCTIMGSEYSHQENA
..::::::: ..:::::::.::::::::::::::::::::::::::::. : ::::. ::
XP_011 MQLYDEETDSQLQCRALNITEDLGQIQYIFSDKTGTLTENKMVFRRCTVSGVEYSHDANA
100 110 120 130 140 150
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 KRLETPKELDSDGEEWTQYQCLSFSARWAQDPATMRSQKGAQPLRRSQSARVPIQGHYR-
.:: .: ::. :: . . : : : ... :..... ..:.::.. .: :
XP_011 QRLARYQEADSEEEEVVP-RGGSVSQR-----GSIGSHQSVRVVHRTQSTK----SHRRT
160 170 180 190 200
530 540 550 560 570
pF1KA0 -QRSMGHRESS-QPPVAFSSSIEKDVTPDKNLLTKVRDAALWLETLSDSRPAKASLSTT-
.:. ..: : . .:::: .:::.::: .:: :: . : . .. : ::
XP_011 GSRAEAKRASMLSKHTAFSSPMEKDITPDPKLLEKVSECDKSLAVARHQEHLLAHLSPEL
210 220 230 240 250 260
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 SSIADFFLALTICNSVMVSTTTEPRQRVTIKPSSKALGTSLEKIQQLFQKLKLLSLSQSF
:.. :::.::::::.:.:.. .:: .: .. :. ..: . . : : : .:.
XP_011 SDVFDFFIALTICNTVVVTSPDQPRTKVRVRFELKSPVKTIEDFLRRFTPSCLTSGCSSI
270 280 290 300 310 320
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 SSTAPSDTDLGESLGANVATTDSDE----RDDASVCSGGDSTDDGGYRSSMWDQGDILES
.: : . .. ..::.. .: :.. : . . . .. ..:: : :.: :
XP_011 GSLAANKSS--HKLGSSFPSTPSSDGMLLRLEERLGQPTSAIASNGYSS----QADNWAS
330 340 350 360 370
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 GSGTSLEEALEAPATDLARPEFCYEAESPDEAALVHAAHAYSFTLVSRTPEQVTVRLPQG
: : : . :. ::::::::::::.::.::. .:: : .::.:.::.
XP_011 ------ELAQEQESER----ELRYEAESPDEAALVYAARAYNCVLVERLHDQVSVELPHL
380 390 400 410 420
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 TCLTFSLLCTLGFDSVRKRMSVVVRHPLTGEIVVYTKGADSVIMDLLEDPACVPDINMEK
::: :: ::::::::::::::.::::: :: :::::::::.::::. : : ..
XP_011 GRLTFELLHTLGFDSVRKRMSVVIRHPLTDEINVYTKGADSVVMDLLQ-PCSSVDARGRH
430 440 450 460 470 480
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 KLRKIRARTQKHLDLYARDGLRTLCIAKKVVSEEDFRRWASFRREAEASLDNRDELLMET
. .:::..::..:..:: .:::::::::.:.:.:.. : . . :::.::.: .:::...
XP_011 Q-KKIRSKTQNYLNVYAAEGLRTLCIAKRVLSKEEYACWLQSHLEAESSLENSEELLFQS
490 500 510 520 530 540
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 AQHLENQLTLLGATGIEDRLQEGVPDTIATLREAGIQLWVLTGDKQETAVNIAHSCRLLN
: .::..: ::::::::::::.:::.::. ::.::.:.:::::::::::::::..:.::.
XP_011 AIRLETNLHLLGATGIEDRLQDGVPETISKLRQAGLQIWVLTGDKQETAVNIAYACKLLD
550 560 570 580 590 600
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 QTDTVYTINTENQETCESILNCALEELKQFRELQKPDRKLFG---FRLPSKTPSITSEAV
. . : :.:. .::.: ..:. : . : : ::. .: : .:. : : :: :
XP_011 HDEEVITLNATSQEACAALLDQCLCYV-QSRGLQRAPEKTKGKVSMRFSSLCPPSTSTAS
610 620 630 640 650 660
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 VPEAGLVIDGKTLNAIFQGKLEKKFLELTQYCRSVLCCRSTPLQKSMIVKLVRDKLRVMT
. .:::::..: .. .:: ::: :.. ::::::::::::::::.:::::.::..::
XP_011 GRRPSLVIDGRSLAYALEKNLEDKFLFLAKQCRSVLCCRSTPLQKSMVVKLVRSKLKAMT
670 680 690 700 710 720
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 LSIGDGANDVSMIQAADIGIGISGQEGMQAVMSSDFAITRFKHLKKLLLVHGHWCYSRLA
:.::::::::::::.::.:.::::::::::::.::::. .:..:..::..::::::::::
XP_011 LAIGDGANDVSMIQVADVGVGISGQEGMQAVMASDFAVPKFRYLERLLILHGHWCYSRLA
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1120 1130 1140 1150 1160 1170
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::.:..:::. .:.::::.:::::::.::::: : .:::::.:.:::::: ::::.:.
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:..::. :.::::::: : : :::..:.:: .:::.:: :::::: :..:.::.:::
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pF1KA0 -------LPPDKRNLEIQSWRSRQRPAPVPEVARPTHHPVSSITGQDFSASTPKSSNPPK
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...:..::::::: ..:::::::.::::::::::::::::::::::::::::. : ::::
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: :.. :::.::::::.:.:.. .:: .: .. :. ..: . . : : :
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... .:::..::..:..:: .:::::::::.:.:.:.. : . . :::.::.: .::
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pF1KA0 -------LPPDKRNLEIQSWRSRQRPAPVPEVARPTHHPVSSITGQDFSASTPKSSNPPK
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XP_011 ETFAQGRLPKDS-GTEHSSGRTVKTSVPLSQPSWHTQQPVCSLEASGEPSTVDMSM--PV
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XP_011 REHTLLEGLSAPAPMSSAPGEAVLRSPGGCPEESKVRAASTGRVTPLSSLFSLPTFSLLN
1380 1390 1400 1410 1420 1430
>>XP_011520372 (OMIM: 609123) PREDICTED: probable phosph (739 aa)
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XP_011 ETITIE-ELGTLVTYQLLAFLDFNNTRKRMSVIVRNP-EGQIKLYSKGADTILFEKLH--
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XP_011 NIGYACNMLTDDMNDVFVIAGNNAVEVREELRKAKQNLFGQNRNFSN-GHVVCEKKQQLE
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XP_011 LDSIVEETITGDYALIINGHSLAHALESDVKNDLLELACMCKTVICCRVTPLQKAQVVEL
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