Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0726
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0726, 956 aa
1>>>pF1KA0726 956 - 956 aa - 956 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4762+/-0.000921; mu= 20.5041+/- 0.055
mean_var=75.0725+/-15.087, 0's: 0 Z-trim(107.2): 117 B-trim: 527 in 3/46
Lambda= 0.148025
statistics sampled from 9311 (9446) to 9311 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16
Scan time: 4.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8575.1 CLSTN3 gene_id:9746|Hs108|chr12 ( 956) 6503 1398.8 0
CCDS105.1 CLSTN1 gene_id:22883|Hs108|chr1 ( 971) 3216 696.8 5.2e-200
CCDS30580.1 CLSTN1 gene_id:22883|Hs108|chr1 ( 981) 2983 647.1 5e-185
CCDS3112.1 CLSTN2 gene_id:64084|Hs108|chr3 ( 955) 1717 376.7 1.2e-103
>>CCDS8575.1 CLSTN3 gene_id:9746|Hs108|chr12 (956 aa)
initn: 6503 init1: 6503 opt: 6503 Z-score: 7498.0 bits: 1398.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6503; 100.0% identity (100.0% similar) in 956 aa overlap (1-956:1-956)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTLLLLPLLLASLLASCSCNKANKHKPWIEAEYQGIVMENDNTVLLNPPLFALDKDAPLR
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CCDS85 MTLLLLPLLLASLLASCSCNKANKHKPWIEAEYQGIVMENDNTVLLNPPLFALDKDAPLR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 YAGEICGFRLHGSGVPFEAVILDKATGEGLIRAKEPVDCEAQKEHTFTIQAYDCGEGPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 YAGEICGFRLHGSGVPFEAVILDKATGEGLIRAKEPVDCEAQKEHTFTIQAYDCGEGPDG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 ANTKKSHKATVHVRVNDVNEFAPVFVERLYRAAVTEGKLYDRILRVEAIDGDCSPQYSQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 ANTKKSHKATVHVRVNDVNEFAPVFVERLYRAAVTEGKLYDRILRVEAIDGDCSPQYSQI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 CYYEILTPNTPFLIDNDGNIENTEKLQYSGERLYKFTVTAYDCGKKRAADDAEVEIQVKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 CYYEILTPNTPFLIDNDGNIENTEKLQYSGERLYKFTVTAYDCGKKRAADDAEVEIQVKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TCKPSWQGWNKRIEYAPGAGSLALFPGIRLETCDEPLWNIQATIELQTSHVAKGCDRDNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 TCKPSWQGWNKRIEYAPGAGSLALFPGIRLETCDEPLWNIQATIELQTSHVAKGCDRDNY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 SERALRKLCGAATGEVDLLPMPGPNANWTAGLSVHYSQDSSLIYWFNGTQAVQVPLGGPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 SERALRKLCGAATGEVDLLPMPGPNANWTAGLSVHYSQDSSLIYWFNGTQAVQVPLGGPS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 GLGSGPQDSLSDHFTLSFWMKHGVTPNKGKKEEETIVCNTVQNEDGFSHYSLTVHGCRIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 GLGSGPQDSLSDHFTLSFWMKHGVTPNKGKKEEETIVCNTVQNEDGFSHYSLTVHGCRIA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 FLYWPLLESARPVKFLWKLEQVCDDEWHHYALNLEFPTVTLYTDGISFDPALIHDNGLIH
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CCDS85 FLYWPLLESARPVKFLWKLEQVCDDEWHHYALNLEFPTVTLYTDGISFDPALIHDNGLIH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 PPRREPALMIGACWTEEKNKEKEKGDNSTDTTQGDPLSIHHYFHGYLAGFSVRSGRLESR
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CCDS85 PPRREPALMIGACWTEEKNKEKEKGDNSTDTTQGDPLSIHHYFHGYLAGFSVRSGRLESR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EVIECLYACREGLDYRDFESLGKGMKVHVNPSQSLLTLEGDDVETFNHALQHVAYMNTLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 EVIECLYACREGLDYRDFESLGKGMKVHVNPSQSLLTLEGDDVETFNHALQHVAYMNTLR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 FATPGVRPLRLTTAVKCFSEESCVSIPEVEGYVVVLQPDAPQILLSGTAHFARPAVDFEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 FATPGVRPLRLTTAVKCFSEESCVSIPEVEGYVVVLQPDAPQILLSGTAHFARPAVDFEG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 TNGVPLFPDLQITCSISHQVEAKKDESWQGTVTDTRMSDEIVHNLDGCEISLVGDDLDPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 TNGVPLFPDLQITCSISHQVEAKKDESWQGTVTDTRMSDEIVHNLDGCEISLVGDDLDPE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 RESLLLDTTSLQQRGLELTNTSAYLTIAGVESITVYEEILRQARYRLRHGAALYTRKFRL
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CCDS85 RESLLLDTTSLQQRGLELTNTSAYLTIAGVESITVYEEILRQARYRLRHGAALYTRKFRL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 SCSEMNGRYSSNEFIVEVNVLHSMNRVAHPSHVLSSQQFLHRGHQPPPEMAGHSLASSHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 SCSEMNGRYSSNEFIVEVNVLHSMNRVAHPSHVLSSQQFLHRGHQPPPEMAGHSLASSHR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 NSMIPSAATLIIVVCVGFLVLMVVLGLVRIHSLHRRVSGAGGPPGASSDPKDPDLFWDDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 NSMIPSAATLIIVVCVGFLVLMVVLGLVRIHSLHRRVSGAGGPPGASSDPKDPDLFWDDS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950
pF1KA0 ALTIIVNPMESYQNRQSCVTGAVGGQQEDEDSSDSEVADSPSSDERRIIETPPHRY
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CCDS85 ALTIIVNPMESYQNRQSCVTGAVGGQQEDEDSSDSEVADSPSSDERRIIETPPHRY
910 920 930 940 950
>>CCDS105.1 CLSTN1 gene_id:22883|Hs108|chr1 (971 aa)
initn: 3447 init1: 1679 opt: 3216 Z-score: 3704.2 bits: 696.8 E(32554): 5.2e-200
Smith-Waterman score: 3448; 52.4% identity (80.8% similar) in 944 aa overlap (8-945:15-939)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MTLLLLPLLLASLLASCSC--NKANKHKPWIEAEYQGIVMENDNTVLLNPPLF
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CCDS10 MLRRPAPALAPAARLLLAGLLCGGGVWAARVNKHKPWLEPTYHGIVTENDNTVLLDPPLI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 ALDKDAPLRYAGEICGFRLHGSGVPFEAVILDKATGEGLIRAKEPVDCEAQKEHTFTIQA
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CCDS10 ALDKDAPLRFAGEICGFKIHGQNVPFDAVVVDKSTGEGVIRSKEKLDCELQKDYSFTIQA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 YDCGEGPDGANTKKSHKATVHVRVNDVNEFAPVFVERLYRAAVTEGKLYDRILRVEAIDG
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CCDS10 YDCGKGPDGTNVKKSHKATVHIQVNDVNEYAPVFKEKSYKATVIEGKQYDSILRVEAVDA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 DCSPQYSQICYYEILTPNTPFLIDNDGNIENTEKLQYSGERLYKFTVTAYDCGKKRAADD
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CCDS10 DCSPQFSQICSYEIITPDVPFTVDKDGYIKNTEKLNYGKEHQYKLTVTAYDCGKKRATED
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 AEVEIQVKPTCKPSWQGWNKRIEYAPGAGSLALFPGIRLETCDEPLWNIQATIELQTSHV
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CCDS10 VLVKISIKPTCTPGWQGWNNRIEYEPGTGALAVFPNIHLETCDEPVASVQATVELETSHI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 AKGCDRDNYSERALRKLCGAATGEVDLLPMPGPNANWTAGLSVHYSQDSSLIYWFNGTQA
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CCDS10 GKGCDRDTYSEKSLHRLCGAAAGTAELLPSPSGSLNWTMGLPTDNGHDSDQVFEFNGTQA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 VQVPLGGPSGLGSGPQDSLSDHFTLSFWMKHGVTPNKGKKEEETIVCNTVQNEDGFSHYS
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CCDS10 VRIPDGVVS---VSPKEP----FTISVWMRHG--PF-GRKKE-TILCSSDKTDMNRHHYS
370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KA0 LTVHGCRIAFLYW--PLLESA-RPVKFLWKLEQVCDDEWHHYALNLEFPTVTLYTDGISF
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CCDS10 LYVHGCRLIFLFRQDPSEEKKYRPAEFHWKLNQVCDEEWHHYVLNVEFPSVTLYVDGTSH
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 DPALIHDNGLIHPPRREPALMIGACWTEEKNKEKE-KGDNSTDTTQGDPLSIHHYFHGYL
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CCDS10 EPFSVTEDYPLHPSKIETQLVVGACWQEFSGVENDNETEPVTVASAGGDLHMTQFFRGNL
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 AGFSVRSGRLESREVIECLYACREGLDYRDFESLGKGMKVHVNPSQSLLTLEGDDVETFN
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CCDS10 AGLTLRSGKLADKKVIDCLYTCKEGLDLQVLEDSGRGVQIQAHPSQLVLTLEGEDLGELD
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 HALQHVAYMNTLRFATPGVRPLRLTTAVKCFSEESCVSIPEVEGYVVVLQPDAPQILLSG
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CCDS10 KAMQHISYLNSRQFPTPGIRRLKITSTIKCFNEATCISVPPVDGYVMVLQPEEPKISLSG
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 TAHFARPAVDFEGTNGVPLFPDLQITCSISHQVEAKKDESWQGTVTDTRMSDEIVHNLDG
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CCDS10 VHHFARAASEFESSEGVFLFPELRIISTITREVEPEGDGAEDPTVQESLVSEEIVHDLDT
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 CEISLVGDDLDPERESLLLDTTSLQQRGLELTNTSAYLTIAGVESITVYEEILRQARYRL
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CCDS10 CEVTVEGEELNHEQESLEVDMARLQQKGIEVSSSELGMTFTGVDTMASYEEVLHLLRYRN
710 720 730 740 750 760
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 RHGAALYTRKFRLSCSEMNGRYSSNEFIVEVNVLHSMNRVAHPSHVLSSQQFLHRGHQPP
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CCDS10 WHARSLLDRKFKLICSELNGRYISNEFKVEVNVIHTANPMEHANHMAAQPQFVHPEHRSF
770 780 790 800 810 820
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 PEMAGHSLASSHRNSMIPSAATLIIVVCVGFLVLMVVLGLVRIHSLHRRVSGAGGPPGAS
...::.::. : ...::.::..:::::.:::.:..::. ::.. :::. .
CCDS10 VDLSGHNLANPHPFAVVPSTATVVIVVCVSFLVFMIILGVFRIRAAHRRTMRD------Q
830 840 850 860 870 880
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 SDPKDPDLFWDDSALTIIVNPMESYQNRQSCVTGAVGGQQEDEDSSDSEVADSPSSDERR
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CCDS10 DTGKENEMDWDDSALTITVNPMETYEDQHS--SEEEEEEEEEEESEDGEEEDDITSAESE
890 900 910 920 930 940
950
pF1KA0 IIETPPHRY
CCDS10 SSEEEEGEQGDPQNATRQQQLEWDDSTLSY
950 960 970
>>CCDS30580.1 CLSTN1 gene_id:22883|Hs108|chr1 (981 aa)
initn: 3219 init1: 1451 opt: 2983 Z-score: 3435.3 bits: 647.1 E(32554): 5e-185
Smith-Waterman score: 3418; 51.9% identity (80.0% similar) in 954 aa overlap (8-945:15-949)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MTLLLLPLLLASLLASCSC--NKANKHKPWIEAEYQGIVMENDNTVLLNPPLF
::::.:: . . ..::::::.: :.::: ::::::::.:::.
CCDS30 MLRRPAPALAPAARLLLAGLLCGGGVWAARVNKHKPWLEPTYHGIVTENDNTVLLDPPLI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KA0 ALDKDAPLRYA----------GEICGFRLHGSGVPFEAVILDKATGEGLIRAKEPVDCEA
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CCDS30 ALDKDAPLRFAESFEVTVTKEGEICGFKIHGQNVPFDAVVVDKSTGEGVIRSKEKLDCEL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 QKEHTFTIQAYDCGEGPDGANTKKSHKATVHVRVNDVNEFAPVFVERLYRAAVTEGKLYD
::...:::::::::.::::.:.:::::::::..::::::.:::: :. :.:.: ::: ::
CCDS30 QKDYSFTIQAYDCGKGPDGTNVKKSHKATVHIQVNDVNEYAPVFKEKSYKATVIEGKQYD
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 RILRVEAIDGDCSPQYSQICYYEILTPNTPFLIDNDGNIENTEKLQYSGERLYKFTVTAY
::::::.:.:::::.:::: :::.::..:: .:.:: :.:::::.:. :. ::.:::::
CCDS30 SILRVEAVDADCSPQFSQICSYEIITPDVPFTVDKDGYIKNTEKLNYGKEHQYKLTVTAY
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 DCGKKRAADDAEVEIQVKPTCKPSWQGWNKRIEYAPGAGSLALFPGIRLETCDEPLWNIQ
:::::::..:. :.:..:::: :.:::::.:::: ::.:.::.::.:.:::::::. ..:
CCDS30 DCGKKRATEDVLVKISIKPTCTPGWQGWNNRIEYEPGTGALAVFPNIHLETCDEPVASVQ
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 ATIELQTSHVAKGCDRDNYSERALRKLCGAATGEVDLLPMPGPNANWTAGLSVHYSQDSS
::.::.:::..::::::.:::..:..:::::.: ..::: :. . ::: :: . ..::.
CCDS30 ATVELETSHIGKGCDRDTYSEKSLHRLCGAAAGTAELLPSPSGSLNWTMGLPTDNGHDSD
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 LIYWFNGTQAVQVPLGGPSGLGSGPQDSLSDHFTLSFWMKHGVTPNKGKKEEETIVCNTV
.. :::::::..: : : .:.. ::.: ::.:: : :.:.: ::.:..
CCDS30 QVFEFNGTQAVRIPDGVVS---VSPKEP----FTISVWMRHG--PF-GRKKE-TILCSSD
370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KA0 QNEDGFSHYSLTVHGCRIAFLYW--PLLESA-RPVKFLWKLEQVCDDEWHHYALNLEFPT
... . :::: :::::. ::. : :. ::..: :::.::::.:::::.::.:::.
CCDS30 KTDMNRHHYSLYVHGCRLIFLFRQDPSEEKKYRPAEFHWKLNQVCDEEWHHYVLNVEFPS
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 VTLYTDGISFDPALIHDNGLIHPPRREPALMIGACWTEEKNKEKE-KGDNSTDTTQGDPL
::::.:: : .: . .. .:: . : :..:::: : .. :.. . . : .. : :
CCDS30 VTLYVDGTSHEPFSVTEDYPLHPSKIETQLVVGACWQEFSGVENDNETEPVTVASAGGDL
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 SIHHYFHGYLAGFSVRSGRLESREVIECLYACREGLDYRDFESLGKGMKVHVNPSQSLLT
. ..:.: :::...:::.: ...::.:::.:.:::: . .:. :.:......::: .::
CCDS30 HMTQFFRGNLAGLTLRSGKLADKKVIDCLYTCKEGLDLQVLEDSGRGVQIQAHPSQLVLT
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 LEGDDVETFNHALQHVAYMNTLRFATPGVRPLRLTTAVKCFSEESCVSIPEVEGYVVVLQ
:::.:. ...:.::..:.:. .: :::.: :..:...:::.: .:.:.: :.:::.:::
CCDS30 LEGEDLGELDKAMQHISYLNSRQFPTPGIRRLKITSTIKCFNEATCISVPPVDGYVMVLQ
590 600 610 620 630 640
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 PDAPQILLSGTAHFARPAVDFEGTNGVPLFPDLQITCSISHQVEAKKDESWQGTVTDTRM
:. :.: :::. :::: : .::...:: :::.:.: .:...:: . : . . :: .. .
CCDS30 PEEPKISLSGVHHFARAASEFESSEGVFLFPELRIISTITREVEPEGDGAEDPTVQESLV
650 660 670 680 690 700
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 SDEIVHNLDGCEISLVGDDLDPERESLLLDTTSLQQRGLELTNTSAYLTIAGVESITVYE
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CCDS30 SEEIVHDLDTCEVTVEGEELNHEQESLEVDMARLQQKGIEVSSSELGMTFTGVDTMASYE
710 720 730 740 750 760
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 EILRQARYRLRHGAALYTRKFRLSCSEMNGRYSSNEFIVEVNVLHSMNRVAHPSHVLSSQ
:.:. ::: :. .: :::.: :::.:::: :::: :::::.:. : . : .:. ..
CCDS30 EVLHLLRYRNWHARSLLDRKFKLICSELNGRYISNEFKVEVNVIHTANPMEHANHMAAQP
770 780 790 800 810 820
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 QFLHRGHQPPPEMAGHSLASSHRNSMIPSAATLIIVVCVGFLVLMVVLGLVRIHSLHRRV
::.: :. ...::.::. : ...::.::..:::::.:::.:..::. ::.. :::.
CCDS30 QFVHPEHRSFVDLSGHNLANPHPFAVVPSTATVVIVVCVSFLVFMIILGVFRIRAAHRRT
830 840 850 860 870 880
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 SGAGGPPGASSDPKDPDLFWDDSALTIIVNPMESYQNRQSCVTGAVGGQQEDEDSSDSEV
.. :. .. :::::::: :::::.:....: . ..:.:.: :.:
CCDS30 MRD------QDTGKENEMDWDDSALTITVNPMETYEDQHS--SEEEEEEEEEEESEDGEE
890 900 910 920 930 940
940 950
pF1KA0 ADSPSSDERRIIETPPHRY
:. .: :
CCDS30 EDDITSAESESSEEEEGEQGDPQNATRQQQLEWDDSTLSY
950 960 970 980
>>CCDS3112.1 CLSTN2 gene_id:64084|Hs108|chr3 (955 aa)
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