FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0726, 956 aa 1>>>pF1KA0726 956 - 956 aa - 956 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4762+/-0.000921; mu= 20.5041+/- 0.055 mean_var=75.0725+/-15.087, 0's: 0 Z-trim(107.2): 117 B-trim: 527 in 3/46 Lambda= 0.148025 statistics sampled from 9311 (9446) to 9311 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16 Scan time: 4.470 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8575.1 CLSTN3 gene_id:9746|Hs108|chr12 ( 956) 6503 1398.8 0 CCDS105.1 CLSTN1 gene_id:22883|Hs108|chr1 ( 971) 3216 696.8 5.2e-200 CCDS30580.1 CLSTN1 gene_id:22883|Hs108|chr1 ( 981) 2983 647.1 5e-185 CCDS3112.1 CLSTN2 gene_id:64084|Hs108|chr3 ( 955) 1717 376.7 1.2e-103 >>CCDS8575.1 CLSTN3 gene_id:9746|Hs108|chr12 (956 aa) initn: 6503 init1: 6503 opt: 6503 Z-score: 7498.0 bits: 1398.8 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6503; 100.0% identity (100.0% similar) in 956 aa overlap (1-956:1-956) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MTLLLLPLLLASLLASCSCNKANKHKPWIEAEYQGIVMENDNTVLLNPPLFALDKDAPLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 MTLLLLPLLLASLLASCSCNKANKHKPWIEAEYQGIVMENDNTVLLNPPLFALDKDAPLR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 YAGEICGFRLHGSGVPFEAVILDKATGEGLIRAKEPVDCEAQKEHTFTIQAYDCGEGPDG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 YAGEICGFRLHGSGVPFEAVILDKATGEGLIRAKEPVDCEAQKEHTFTIQAYDCGEGPDG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KA0 ANTKKSHKATVHVRVNDVNEFAPVFVERLYRAAVTEGKLYDRILRVEAIDGDCSPQYSQI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 ANTKKSHKATVHVRVNDVNEFAPVFVERLYRAAVTEGKLYDRILRVEAIDGDCSPQYSQI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KA0 CYYEILTPNTPFLIDNDGNIENTEKLQYSGERLYKFTVTAYDCGKKRAADDAEVEIQVKP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 CYYEILTPNTPFLIDNDGNIENTEKLQYSGERLYKFTVTAYDCGKKRAADDAEVEIQVKP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KA0 TCKPSWQGWNKRIEYAPGAGSLALFPGIRLETCDEPLWNIQATIELQTSHVAKGCDRDNY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 TCKPSWQGWNKRIEYAPGAGSLALFPGIRLETCDEPLWNIQATIELQTSHVAKGCDRDNY 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KA0 SERALRKLCGAATGEVDLLPMPGPNANWTAGLSVHYSQDSSLIYWFNGTQAVQVPLGGPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 SERALRKLCGAATGEVDLLPMPGPNANWTAGLSVHYSQDSSLIYWFNGTQAVQVPLGGPS 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KA0 GLGSGPQDSLSDHFTLSFWMKHGVTPNKGKKEEETIVCNTVQNEDGFSHYSLTVHGCRIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 GLGSGPQDSLSDHFTLSFWMKHGVTPNKGKKEEETIVCNTVQNEDGFSHYSLTVHGCRIA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KA0 FLYWPLLESARPVKFLWKLEQVCDDEWHHYALNLEFPTVTLYTDGISFDPALIHDNGLIH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 FLYWPLLESARPVKFLWKLEQVCDDEWHHYALNLEFPTVTLYTDGISFDPALIHDNGLIH 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KA0 PPRREPALMIGACWTEEKNKEKEKGDNSTDTTQGDPLSIHHYFHGYLAGFSVRSGRLESR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 PPRREPALMIGACWTEEKNKEKEKGDNSTDTTQGDPLSIHHYFHGYLAGFSVRSGRLESR 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KA0 EVIECLYACREGLDYRDFESLGKGMKVHVNPSQSLLTLEGDDVETFNHALQHVAYMNTLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 EVIECLYACREGLDYRDFESLGKGMKVHVNPSQSLLTLEGDDVETFNHALQHVAYMNTLR 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KA0 FATPGVRPLRLTTAVKCFSEESCVSIPEVEGYVVVLQPDAPQILLSGTAHFARPAVDFEG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 FATPGVRPLRLTTAVKCFSEESCVSIPEVEGYVVVLQPDAPQILLSGTAHFARPAVDFEG 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KA0 TNGVPLFPDLQITCSISHQVEAKKDESWQGTVTDTRMSDEIVHNLDGCEISLVGDDLDPE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 TNGVPLFPDLQITCSISHQVEAKKDESWQGTVTDTRMSDEIVHNLDGCEISLVGDDLDPE 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KA0 RESLLLDTTSLQQRGLELTNTSAYLTIAGVESITVYEEILRQARYRLRHGAALYTRKFRL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 RESLLLDTTSLQQRGLELTNTSAYLTIAGVESITVYEEILRQARYRLRHGAALYTRKFRL 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KA0 SCSEMNGRYSSNEFIVEVNVLHSMNRVAHPSHVLSSQQFLHRGHQPPPEMAGHSLASSHR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 SCSEMNGRYSSNEFIVEVNVLHSMNRVAHPSHVLSSQQFLHRGHQPPPEMAGHSLASSHR 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KA0 NSMIPSAATLIIVVCVGFLVLMVVLGLVRIHSLHRRVSGAGGPPGASSDPKDPDLFWDDS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 NSMIPSAATLIIVVCVGFLVLMVVLGLVRIHSLHRRVSGAGGPPGASSDPKDPDLFWDDS 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 pF1KA0 ALTIIVNPMESYQNRQSCVTGAVGGQQEDEDSSDSEVADSPSSDERRIIETPPHRY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 ALTIIVNPMESYQNRQSCVTGAVGGQQEDEDSSDSEVADSPSSDERRIIETPPHRY 910 920 930 940 950 >>CCDS105.1 CLSTN1 gene_id:22883|Hs108|chr1 (971 aa) initn: 3447 init1: 1679 opt: 3216 Z-score: 3704.2 bits: 696.8 E(32554): 5.2e-200 Smith-Waterman score: 3448; 52.4% identity (80.8% similar) in 944 aa overlap (8-945:15-939) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MTLLLLPLLLASLLASCSC--NKANKHKPWIEAEYQGIVMENDNTVLLNPPLF ::::.:: . . ..::::::.: :.::: ::::::::.:::. CCDS10 MLRRPAPALAPAARLLLAGLLCGGGVWAARVNKHKPWLEPTYHGIVTENDNTVLLDPPLI 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 ALDKDAPLRYAGEICGFRLHGSGVPFEAVILDKATGEGLIRAKEPVDCEAQKEHTFTIQA :::::::::.:::::::..::..:::.::..::.::::.::.:: .::: ::...::::: CCDS10 ALDKDAPLRFAGEICGFKIHGQNVPFDAVVVDKSTGEGVIRSKEKLDCELQKDYSFTIQA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 YDCGEGPDGANTKKSHKATVHVRVNDVNEFAPVFVERLYRAAVTEGKLYDRILRVEAIDG ::::.::::.:.:::::::::..::::::.:::: :. :.:.: ::: :: ::::::.:. CCDS10 YDCGKGPDGTNVKKSHKATVHIQVNDVNEYAPVFKEKSYKATVIEGKQYDSILRVEAVDA 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 DCSPQYSQICYYEILTPNTPFLIDNDGNIENTEKLQYSGERLYKFTVTAYDCGKKRAADD :::::.:::: :::.::..:: .:.:: :.:::::.:. :. ::.::::::::::::..: CCDS10 DCSPQFSQICSYEIITPDVPFTVDKDGYIKNTEKLNYGKEHQYKLTVTAYDCGKKRATED 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 AEVEIQVKPTCKPSWQGWNKRIEYAPGAGSLALFPGIRLETCDEPLWNIQATIELQTSHV . :.:..:::: :.:::::.:::: ::.:.::.::.:.:::::::. ..:::.::.:::. CCDS10 VLVKISIKPTCTPGWQGWNNRIEYEPGTGALAVFPNIHLETCDEPVASVQATVELETSHI 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 AKGCDRDNYSERALRKLCGAATGEVDLLPMPGPNANWTAGLSVHYSQDSSLIYWFNGTQA .::::::.:::..:..:::::.: ..::: :. . ::: :: . ..::. .. :::::: CCDS10 GKGCDRDTYSEKSLHRLCGAAAGTAELLPSPSGSLNWTMGLPTDNGHDSDQVFEFNGTQA 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 VQVPLGGPSGLGSGPQDSLSDHFTLSFWMKHGVTPNKGKKEEETIVCNTVQNEDGFSHYS :..: : : .:.. ::.: ::.:: : :.:.: ::.:.. ... . ::: CCDS10 VRIPDGVVS---VSPKEP----FTISVWMRHG--PF-GRKKE-TILCSSDKTDMNRHHYS 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KA0 LTVHGCRIAFLYW--PLLESA-RPVKFLWKLEQVCDDEWHHYALNLEFPTVTLYTDGISF : :::::. ::. : :. ::..: :::.::::.:::::.::.:::.::::.:: : CCDS10 LYVHGCRLIFLFRQDPSEEKKYRPAEFHWKLNQVCDEEWHHYVLNVEFPSVTLYVDGTSH 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 DPALIHDNGLIHPPRREPALMIGACWTEEKNKEKE-KGDNSTDTTQGDPLSIHHYFHGYL .: . .. .:: . : :..:::: : .. :.. . . : .. : : . ..:.: : CCDS10 EPFSVTEDYPLHPSKIETQLVVGACWQEFSGVENDNETEPVTVASAGGDLHMTQFFRGNL 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KA0 AGFSVRSGRLESREVIECLYACREGLDYRDFESLGKGMKVHVNPSQSLLTLEGDDVETFN ::...:::.: ...::.:::.:.:::: . .:. :.:......::: .:::::.:. .. CCDS10 AGLTLRSGKLADKKVIDCLYTCKEGLDLQVLEDSGRGVQIQAHPSQLVLTLEGEDLGELD 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KA0 HALQHVAYMNTLRFATPGVRPLRLTTAVKCFSEESCVSIPEVEGYVVVLQPDAPQILLSG .:.::..:.:. .: :::.: :..:...:::.: .:.:.: :.:::.::::. :.: ::: CCDS10 KAMQHISYLNSRQFPTPGIRRLKITSTIKCFNEATCISVPPVDGYVMVLQPEEPKISLSG 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KA0 TAHFARPAVDFEGTNGVPLFPDLQITCSISHQVEAKKDESWQGTVTDTRMSDEIVHNLDG . :::: : .::...:: :::.:.: .:...:: . : . . :: .. .:.::::.:: CCDS10 VHHFARAASEFESSEGVFLFPELRIISTITREVEPEGDGAEDPTVQESLVSEEIVHDLDT 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KA0 CEISLVGDDLDPERESLLLDTTSLQQRGLELTNTSAYLTIAGVESITVYEEILRQARYRL ::... :..:. :.::: .: . :::.:.:.... .:..::.... :::.:. ::: CCDS10 CEVTVEGEELNHEQESLEVDMARLQQKGIEVSSSELGMTFTGVDTMASYEEVLHLLRYRN 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 pF1KA0 RHGAALYTRKFRLSCSEMNGRYSSNEFIVEVNVLHSMNRVAHPSHVLSSQQFLHRGHQPP :. .: :::.: :::.:::: :::: :::::.:. : . : .:. .. ::.: :. CCDS10 WHARSLLDRKFKLICSELNGRYISNEFKVEVNVIHTANPMEHANHMAAQPQFVHPEHRSF 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 pF1KA0 PEMAGHSLASSHRNSMIPSAATLIIVVCVGFLVLMVVLGLVRIHSLHRRVSGAGGPPGAS ...::.::. : ...::.::..:::::.:::.:..::. ::.. :::. . CCDS10 VDLSGHNLANPHPFAVVPSTATVVIVVCVSFLVFMIILGVFRIRAAHRRTMRD------Q 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 pF1KA0 SDPKDPDLFWDDSALTIIVNPMESYQNRQSCVTGAVGGQQEDEDSSDSEVADSPSSDERR . :. .. :::::::: :::::.:....: . ..:.:.: :.: :. .: : CCDS10 DTGKENEMDWDDSALTITVNPMETYEDQHS--SEEEEEEEEEEESEDGEEEDDITSAESE 890 900 910 920 930 940 950 pF1KA0 IIETPPHRY CCDS10 SSEEEEGEQGDPQNATRQQQLEWDDSTLSY 950 960 970 >>CCDS30580.1 CLSTN1 gene_id:22883|Hs108|chr1 (981 aa) initn: 3219 init1: 1451 opt: 2983 Z-score: 3435.3 bits: 647.1 E(32554): 5e-185 Smith-Waterman score: 3418; 51.9% identity (80.0% similar) in 954 aa overlap (8-945:15-949) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MTLLLLPLLLASLLASCSC--NKANKHKPWIEAEYQGIVMENDNTVLLNPPLF ::::.:: . . ..::::::.: :.::: ::::::::.:::. CCDS30 MLRRPAPALAPAARLLLAGLLCGGGVWAARVNKHKPWLEPTYHGIVTENDNTVLLDPPLI 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KA0 ALDKDAPLRYA----------GEICGFRLHGSGVPFEAVILDKATGEGLIRAKEPVDCEA :::::::::.: ::::::..::..:::.::..::.::::.::.:: .::: CCDS30 ALDKDAPLRFAESFEVTVTKEGEICGFKIHGQNVPFDAVVVDKSTGEGVIRSKEKLDCEL 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KA0 QKEHTFTIQAYDCGEGPDGANTKKSHKATVHVRVNDVNEFAPVFVERLYRAAVTEGKLYD ::...:::::::::.::::.:.:::::::::..::::::.:::: :. :.:.: ::: :: CCDS30 QKDYSFTIQAYDCGKGPDGTNVKKSHKATVHIQVNDVNEYAPVFKEKSYKATVIEGKQYD 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KA0 RILRVEAIDGDCSPQYSQICYYEILTPNTPFLIDNDGNIENTEKLQYSGERLYKFTVTAY ::::::.:.:::::.:::: :::.::..:: .:.:: :.:::::.:. :. ::.::::: CCDS30 SILRVEAVDADCSPQFSQICSYEIITPDVPFTVDKDGYIKNTEKLNYGKEHQYKLTVTAY 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KA0 DCGKKRAADDAEVEIQVKPTCKPSWQGWNKRIEYAPGAGSLALFPGIRLETCDEPLWNIQ :::::::..:. :.:..:::: :.:::::.:::: ::.:.::.::.:.:::::::. ..: CCDS30 DCGKKRATEDVLVKISIKPTCTPGWQGWNNRIEYEPGTGALAVFPNIHLETCDEPVASVQ 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KA0 ATIELQTSHVAKGCDRDNYSERALRKLCGAATGEVDLLPMPGPNANWTAGLSVHYSQDSS ::.::.:::..::::::.:::..:..:::::.: ..::: :. . ::: :: . ..::. CCDS30 ATVELETSHIGKGCDRDTYSEKSLHRLCGAAAGTAELLPSPSGSLNWTMGLPTDNGHDSD 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KA0 LIYWFNGTQAVQVPLGGPSGLGSGPQDSLSDHFTLSFWMKHGVTPNKGKKEEETIVCNTV .. :::::::..: : : .:.. ::.: ::.:: : :.:.: ::.:.. CCDS30 QVFEFNGTQAVRIPDGVVS---VSPKEP----FTISVWMRHG--PF-GRKKE-TILCSSD 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KA0 QNEDGFSHYSLTVHGCRIAFLYW--PLLESA-RPVKFLWKLEQVCDDEWHHYALNLEFPT ... . :::: :::::. ::. : :. ::..: :::.::::.:::::.::.:::. CCDS30 KTDMNRHHYSLYVHGCRLIFLFRQDPSEEKKYRPAEFHWKLNQVCDEEWHHYVLNVEFPS 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 pF1KA0 VTLYTDGISFDPALIHDNGLIHPPRREPALMIGACWTEEKNKEKE-KGDNSTDTTQGDPL ::::.:: : .: . .. .:: . : :..:::: : .. :.. . . : .. : : CCDS30 VTLYVDGTSHEPFSVTEDYPLHPSKIETQLVVGACWQEFSGVENDNETEPVTVASAGGDL 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KA0 SIHHYFHGYLAGFSVRSGRLESREVIECLYACREGLDYRDFESLGKGMKVHVNPSQSLLT . ..:.: :::...:::.: ...::.:::.:.:::: . .:. :.:......::: .:: CCDS30 HMTQFFRGNLAGLTLRSGKLADKKVIDCLYTCKEGLDLQVLEDSGRGVQIQAHPSQLVLT 530 540 550 560 570 580 580 590 600 610 620 630 pF1KA0 LEGDDVETFNHALQHVAYMNTLRFATPGVRPLRLTTAVKCFSEESCVSIPEVEGYVVVLQ :::.:. ...:.::..:.:. .: :::.: :..:...:::.: .:.:.: :.:::.::: CCDS30 LEGEDLGELDKAMQHISYLNSRQFPTPGIRRLKITSTIKCFNEATCISVPPVDGYVMVLQ 590 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 690 pF1KA0 PDAPQILLSGTAHFARPAVDFEGTNGVPLFPDLQITCSISHQVEAKKDESWQGTVTDTRM :. :.: :::. :::: : .::...:: :::.:.: .:...:: . : . . :: .. . 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