FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0727, 1006 aa 1>>>pF1KA0727 1006 - 1006 aa - 1006 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2578+/-0.000586; mu= 22.4753+/- 0.036 mean_var=73.9246+/-14.899, 0's: 0 Z-trim(105.3): 212 B-trim: 310 in 1/52 Lambda= 0.149169 statistics sampled from 13320 (13537) to 13320 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.478), E-opt: 0.2 (0.159), width: 16 Scan time: 11.310 The best scores are: opt bits E(85289) NP_056009 (OMIM: 606539) unconventional myosin-Id (1006) 6635 1438.7 0 NP_001290208 (OMIM: 606539) unconventional myosin- ( 961) 6286 1363.5 0 XP_016880174 (OMIM: 606539) PREDICTED: unconventio ( 955) 6281 1362.5 0 XP_016867993 (OMIM: 600642) PREDICTED: unconventio ( 780) 3007 657.8 6.3e-188 XP_016867992 (OMIM: 600642) PREDICTED: unconventio ( 903) 3007 657.9 7.1e-188 NP_149043 (OMIM: 600642) unconventional myosin-Ig (1018) 3007 657.9 7.8e-188 NP_001290209 (OMIM: 606539) unconventional myosin- ( 436) 2813 615.9 1.5e-175 NP_036355 (OMIM: 606537) unconventional myosin-Ib (1078) 2367 520.2 2.4e-146 NP_001317166 (OMIM: 606537) unconventional myosin- (1107) 2366 520.0 2.8e-146 NP_001317167 (OMIM: 606537) unconventional myosin- (1107) 2366 520.0 2.8e-146 NP_001155291 (OMIM: 606537) unconventional myosin- (1136) 2366 520.0 2.9e-146 NP_001123630 (OMIM: 606537) unconventional myosin- (1136) 2366 520.0 2.9e-146 XP_005246629 (OMIM: 606537) PREDICTED: unconventio (1136) 2366 520.0 2.9e-146 NP_203693 (OMIM: 606538) unconventional myosin-Ic (1028) 2264 498.0 1.1e-139 NP_001074419 (OMIM: 606538) unconventional myosin- (1044) 2264 498.0 1.1e-139 NP_001074248 (OMIM: 606538) unconventional myosin- (1063) 2264 498.0 1.1e-139 XP_011536675 (OMIM: 601478,607841) PREDICTED: unco ( 866) 2210 486.3 2.9e-136 NP_001242970 (OMIM: 601478,607841) unconventional (1043) 2210 486.4 3.4e-136 NP_005370 (OMIM: 601478,607841) unconventional myo (1043) 2210 486.4 3.4e-136 NP_001094891 (OMIM: 614636) unconventional myosin- (1022) 2146 472.6 4.7e-132 XP_016874696 (OMIM: 614636) PREDICTED: unconventio (1027) 2146 472.6 4.7e-132 XP_016859647 (OMIM: 606537) PREDICTED: unconventio (1015) 1983 437.5 1.7e-121 XP_011536525 (OMIM: 614636) PREDICTED: unconventio (1044) 1976 436.0 4.9e-121 XP_011520083 (OMIM: 610022) PREDICTED: unconventio (1714) 1544 343.2 7e-93 NP_061198 (OMIM: 610022) unconventional myosin-Vc (1742) 1538 341.9 1.7e-92 NP_000248 (OMIM: 160500,160760,181430,192600,25516 (1935) 1523 338.7 1.8e-91 XP_016876829 (OMIM: 160500,160760,181430,192600,25 (1935) 1523 338.7 1.8e-91 NP_002463 (OMIM: 158300,160741,608837) myosin-8 [H (1937) 1490 331.6 2.4e-89 XP_011522172 (OMIM: 160720,178110,193700,601680) P (1940) 1484 330.3 6e-89 NP_002461 (OMIM: 160720,178110,193700,601680) myos (1940) 1484 330.3 6e-89 XP_011522173 (OMIM: 160720,178110,193700,601680) P (1940) 1484 330.3 6e-89 NP_002462 (OMIM: 160710,192600,613251,613252,61408 (1939) 1483 330.1 6.9e-89 NP_001093582 (OMIM: 160740,605637) myosin-2 [Homo (1941) 1463 325.8 1.4e-87 NP_060004 (OMIM: 160740,605637) myosin-2 [Homo sap (1941) 1463 325.8 1.4e-87 XP_016880164 (OMIM: 160730) PREDICTED: myosin-1 is (1939) 1449 322.8 1.1e-86 NP_005954 (OMIM: 160730) myosin-1 [Homo sapiens] (1939) 1449 322.8 1.1e-86 XP_016880165 (OMIM: 160742) PREDICTED: myosin-4 is (1939) 1444 321.7 2.3e-86 NP_060003 (OMIM: 160742) myosin-4 [Homo sapiens] (1939) 1444 321.7 2.3e-86 XP_016880204 (OMIM: 600316,602666) PREDICTED: unco (3531) 1443 321.7 4.3e-86 NP_079005 (OMIM: 600652,608568,614369) myosin-14 i (1995) 1432 319.2 1.4e-85 XP_011525623 (OMIM: 600652,608568,614369) PREDICTE (2035) 1432 319.2 1.5e-85 NP_003793 (OMIM: 603487) myosin-13 [Homo sapiens] (1938) 1429 318.5 2.2e-85 NP_055796 (OMIM: 609929) myosin-15 precursor [Homo (1946) 1416 315.7 1.5e-84 XP_011510861 (OMIM: 609929) PREDICTED: myosin-15 i (1946) 1416 315.7 1.5e-84 XP_011526327 (OMIM: 601480) PREDICTED: unconventio (1115) 1381 308.0 1.8e-82 NP_057323 (OMIM: 600316,602666) unconventional myo (3530) 1352 302.1 3.4e-80 NP_004989 (OMIM: 601479,614131) unconventional myo (1108) 1340 299.2 8.2e-80 XP_011520804 (OMIM: 132900,160745) PREDICTED: myos (1929) 1315 294.0 5.3e-78 NP_074035 (OMIM: 132900,160745) myosin-11 isoform (1938) 1315 294.0 5.3e-78 NP_002465 (OMIM: 132900,160745) myosin-11 isoform (1972) 1315 294.0 5.4e-78 >>NP_056009 (OMIM: 606539) unconventional myosin-Id isof (1006 aa) initn: 6635 init1: 6635 opt: 6635 Z-score: 7712.9 bits: 1438.7 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6635; 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NP_001 LIL 960 >>XP_016880174 (OMIM: 606539) PREDICTED: unconventional (955 aa) initn: 6281 init1: 6281 opt: 6281 Z-score: 7301.5 bits: 1362.5 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6281; 100.0% identity (100.0% similar) in 954 aa overlap (1-954:1-954) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MAEQESLEFGKADFVLMDTVSMPEFMANLRLRFEKGRIYTFIGEVVVSVNPYKLLNIYGR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 MAEQESLEFGKADFVLMDTVSMPEFMANLRLRFEKGRIYTFIGEVVVSVNPYKLLNIYGR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 DTIEQYKGRELYERPPHLFAIADAAYKAMKRRSKDTCIVISGESGAGKTEASKYIMQYIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 DTIEQYKGRELYERPPHLFAIADAAYKAMKRRSKDTCIVISGESGAGKTEASKYIMQYIA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KA0 AITNPSQRAEVERVKNMLLKSNCVLEAFGNAKTNRNDNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 AITNPSQRAEVERVKNMLLKSNCVLEAFGNAKTNRNDNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGH 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KA0 INNYLLEKSRVIVQQPGERSFHSFYQLLQGGSEQMLRSLHLQKSLSSYNYIHVGAQLKSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 INNYLLEKSRVIVQQPGERSFHSFYQLLQGGSEQMLRSLHLQKSLSSYNYIHVGAQLKSS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KA0 INDAAEFRVVADAMKVIGFKPEEIQTVYKILAAILHLGNLKFVVDGDTPLIENGKVVSII :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 INDAAEFRVVADAMKVIGFKPEEIQTVYKILAAILHLGNLKFVVDGDTPLIENGKVVSII 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KA0 AELLSTKTDMVEKALLYRTVATGRDIIDKQHTEQEASYGRDAFAKAIYERLFCWIVTRIN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 AELLSTKTDMVEKALLYRTVATGRDIIDKQHTEQEASYGRDAFAKAIYERLFCWIVTRIN 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KA0 DIIEVKNYDTTIHGKNTVIGVLDIYGFEIFDNNSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLVLKQEQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 DIIEVKNYDTTIHGKNTVIGVLDIYGFEIFDNNSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLVLKQEQ 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KA0 EEYQREGIPWKHIDYFNNQIIVDLVEQQHKGIIAILDDACMNVGKVTDEMFLEALNSKLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 EEYQREGIPWKHIDYFNNQIIVDLVEQQHKGIIAILDDACMNVGKVTDEMFLEALNSKLG 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KA0 KHAHFSSRKLCASDKILEFDRDFRIRHYAGDVVYSVIGFIDKNKDTLFQDFKRLMYNSSN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 KHAHFSSRKLCASDKILEFDRDFRIRHYAGDVVYSVIGFIDKNKDTLFQDFKRLMYNSSN 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KA0 PVLKNMWPEGKLSITEVTKRPLTAATLFKNSMIALVDNLASKEPYYVRCIKPNDKKSPQI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 PVLKNMWPEGKLSITEVTKRPLTAATLFKNSMIALVDNLASKEPYYVRCIKPNDKKSPQI 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KA0 FDDERCRHQVEYLGLLENVRVRRAGFAFRQTYEKFLHRYKMISEFTWPNHDLPSDKEAVK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 FDDERCRHQVEYLGLLENVRVRRAGFAFRQTYEKFLHRYKMISEFTWPNHDLPSDKEAVK 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KA0 KLIERCGFQDDVAYGKTKIFIRTPRTLFTLEELRAQMLIRIVLFLQKVWRGTLARMRYKR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 KLIERCGFQDDVAYGKTKIFIRTPRTLFTLEELRAQMLIRIVLFLQKVWRGTLARMRYKR 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KA0 TKAALTIIRYYRRYKVKSYIHEVARRFHGVKTMRDYGKHVKWPSPPKVLRRFEEALQTIF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 TKAALTIIRYYRRYKVKSYIHEVARRFHGVKTMRDYGKHVKWPSPPKVLRRFEEALQTIF 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KA0 NRWRASQLIKSIPASDLPQVRAKVAAVEMLKGQRADLGLQRAWEGNYLASKPDTPQTSGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 NRWRASQLIKSIPASDLPQVRAKVAAVEMLKGQRADLGLQRAWEGNYLASKPDTPQTSGT 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KA0 FVPVANELKRKDKYMNVLFSCHVRKVNRFSKVEDRAIFVTDRHLYKMDPTKQYKVMKTIP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 FVPVANELKRKDKYMNVLFSCHVRKVNRFSKVEDRAIFVTDRHLYKMDPTKQYKVMKTIP 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KA0 LYNLTGLSVSNGKDQLVVFHTKDNKDLIVCLFSKQPTHESRIGELVGVLVNHFKSEKRHL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 LYNLTGLSVSNGKDQLVVFHTKDNKDLIVCLFSKQPTHESRIGELVGVLVNHFKR 910 920 930 940 950 970 980 990 1000 pF1KA0 QVNVTNPVQCSLHGKKCTVSVETRLNQPQPDFTKNRSGFILSVPGN >>XP_016867993 (OMIM: 600642) PREDICTED: unconventional (780 aa) initn: 2996 init1: 2778 opt: 3007 Z-score: 3494.8 bits: 657.8 E(85289): 6.3e-188 Smith-Waterman score: 3007; 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XP_016 RTLVTLEQSRARLIPIIVLLLQKAWRGTLARWRCRRLRAIYTIMRWFRRHKVRAHLAELQ 460 470 480 490 500 510 750 760 770 780 790 800 pF1KA0 RRFHGVKTMRDYGKHVKWPSPPKVLRRFEEALQTIFNRWRASQLIKSIPASDLPQVRAKV :::.... ::. . :: :: ::. :... ...: :::: ::.:.:: ::.::..::: XP_016 RRFQAARQPPLYGRDLVWPLPPAVLQPFQDTCHALFCRWRARQLVKNIPPSDMPQIKAKV 520 530 540 550 560 570 810 820 830 840 850 860 pF1KA0 AAVEMLKGQRADLGLQRAWEGNYLASKPDTPQTSGTFVPVANELKRKDKYMNVLFSCHVR ::. :.: : : : .::: .::.: :.: .:. :. . :. :: . :::: ::: XP_016 AAMGALQGLRQDWGCRRAWARDYLSSATDNPTASSLFAQRLKTLQDKDGFGAVLFSSHVR 580 590 600 610 620 630 870 880 890 900 910 920 pF1KA0 KVNRFSKVEDRAIFVTDRHLYKMDPTKQYKVMKTIPLYNLTGLSVSNGKDQLVVFHTKDN ::::: :...::...::.::::.:: .::.::...:: .:::::..: :::::.:.. . XP_016 KVNRFHKIRNRALLLTDQHLYKLDPDRQYRVMRAVPLEAVTGLSVTSGGDQLVVLHARGQ 640 650 660 670 680 690 930 940 950 960 970 980 pF1KA0 KDLIVCLFSKQPTHESRIGELVGVLVNHFKSEKRHLQVNVTNPVQCSLHGKKCTVSVETR ::.::: ..: ..:.:::::::. : ..: : :.: :.. . : .: . .::: : XP_016 DDLVVCLHRSRPPLDNRVGELVGVLAAHCQGEGRTLEVRVSDCIPLSHRGVRRLISVEPR 700 710 720 730 740 750 990 1000 pF1KA0 LNQPQPDFTKNRSGFILSVPGN .::.::: :..: : : XP_016 PEQPEPDFRCARGSFTLLWPSR 760 770 780 >>XP_016867992 (OMIM: 600642) PREDICTED: unconventional (903 aa) initn: 3450 init1: 2778 opt: 3007 Z-score: 3493.9 bits: 657.9 E(85289): 7.1e-188 Smith-Waterman score: 3605; 58.6% identity (81.9% similar) in 901 aa overlap (116-1004:1-901) 90 100 110 120 130 140 pF1KA0 YKAMKRRSKDTCIVISGESGAGKTEASKYIMQYIAAITNPSQRAEVERVKNMLLKSNCVL ::::::.:::::::::::::..::::.::: XP_016 MQYIAAVTNPSQRAEVERVKDVLLKSTCVL 10 20 30 150 160 170 180 190 200 pF1KA0 EAFGNAKTNRNDNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGHINNYLLEKSRVIVQQPGERSFHSFY ::::::.:::: ::::::::::::::::::::::::..::::::::. :. :::.::.:: XP_016 EAFGNARTNRNHNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGHIHSYLLEKSRVLKQHVGERNFHAFY 40 50 60 70 80 90 210 220 230 240 250 260 pF1KA0 QLLQGGSEQMLRSLHLQKSLSSYNYIHVGAQLKSSINDAAE-----FRVVADAMKVIGFK :::.:. ...:. :::... . ::. : :: :. ....: . ..:..::.::::. XP_016 QLLRGSEDKQLHELHLERNPAVYNFTHQGAGLNMTVHSALDSDEQSHQAVTEAMRVIGFS 100 110 120 130 140 150 270 280 290 300 310 pF1KA0 PEEIQTVYKILAAILHLGNLKFVVDGDTPLIENG------KVVSIIAELLSTKTDMVEKA :::...:..::::::::::..:: . : ..: .:. .::: .: :.: .. XP_016 PEEVESVHRILAAILHLGNIEFVETEEGGLQKEGLAVAEEALVDHVAELTATPRDLVLRS 160 170 180 190 200 210 320 330 340 350 360 370 pF1KA0 LLYRTVATG-RDIIDKQHTEQEASYGRDAFAKAIYERLFCWIVTRINDIIEVKNYDTTIH :: ::::.: :..:.: :: ::::.::: :::.:.::: :.:.:::...: .. : XP_016 LLARTVASGGRELIEKGHTAAEASYARDACAKAVYQRLFEWVVNRINSVMEPRGRDPRRD 220 230 240 250 260 270 380 390 400 410 420 430 pF1KA0 GKNTVIGVLDIYGFEIFDNNSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLVLKQEQEEYQREGIPWKHI ::.::::::::::::.: ::::::::::::::::::::::.::::::::.:::: :. . XP_016 GKDTVIGVLDIYGFEVFPVNSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLILKQEQEEYEREGITWQSV 280 290 300 310 320 330 440 450 460 470 480 490 pF1KA0 DYFNNQIIVDLVEQQHKGIIAILDDACMNVGKVTDEMFLEALNSKLGKHAHFSSRKLCAS .:::: ::::::. :.::.:.::.:: ..: .::..::..:. . .: :..::.:: . XP_016 EYFNNATIVDLVERPHRGILAVLDEACSSAGTITDRIFLQTLDMHHRHHLHYTSRQLCPT 340 350 360 370 380 390 500 510 520 530 540 550 pF1KA0 DKILEFDRDFRIRHYAGDVVYSVIGFIDKNKDTLFQDFKRLMYNSSNPVLKNMWPEGKLS :: .:: :::::.::::::.::: ::::::.: ::::::::.:::..:.:. :::.:. . XP_016 DKTMEFGRDFRIKHYAGDVTYSVEGFIDKNRDFLFQDFKRLLYNSTDPTLRAMWPDGQQD 400 410 420 430 440 450 560 570 580 590 600 610 pF1KA0 ITEVTKRPLTAATLFKNSMIALVDNLASKEPYYVRCIKPNDKKSPQIFDDERCRHQVEYL :::::::::::.:::::::.:::.:::::::.::::::::. : .:...::::: :: XP_016 ITEVTKRPLTAGTLFKNSMVALVENLASKEPFYVRCIKPNEDKVAGKLDENHCRHQVAYL 460 470 480 490 500 510 620 630 640 650 660 670 pF1KA0 GLLENVRVRRAGFAFRQTYEKFLHRYKMISEFTWPNHDLPSDKEAVKKLIERCGFQDDVA :::::::::::::: :: : .:: :::: :.::::: : ::: ::. :.:. :.: ::: XP_016 GLLENVRVRRAGFASRQPYSRFLLRYKMTCEYTWPNHLLGSDKAAVSALLEQHGLQGDVA 520 530 540 550 560 570 680 690 700 710 720 730 pF1KA0 YGKTKIFIRTPRTLFTLEELRAQMLIRIVLFLQKVWRGTLARMRYKRTKAALTIIRYYRR .:..:.:::.:::: :::. ::... :::.:::.::::::: : .: .: ::.:..:: XP_016 FGHSKLFIRSPRTLVTLEQSRARLIPIIVLLLQKAWRGTLARWRCRRLRAIYTIMRWFRR 580 590 600 610 620 630 740 750 760 770 780 790 pF1KA0 YKVKSYIHEVARRFHGVKTMRDYGKHVKWPSPPKVLRRFEEALQTIFNRWRASQLIKSIP .::.... :. :::.... ::. . :: :: ::. :... ...: :::: ::.:.:: XP_016 HKVRAHLAELQRRFQAARQPPLYGRDLVWPLPPAVLQPFQDTCHALFCRWRARQLVKNIP 640 650 660 670 680 690 800 810 820 830 840 850 pF1KA0 ASDLPQVRAKVAAVEMLKGQRADLGLQRAWEGNYLASKPDTPQTSGTFVPVANELKRKDK ::.::..:::::. :.: : : : .::: .::.: :.: .:. :. . :. :: XP_016 PSDMPQIKAKVAAMGALQGLRQDWGCRRAWARDYLSSATDNPTASSLFAQRLKTLQDKDG 700 710 720 730 740 750 860 870 880 890 900 910 pF1KA0 YMNVLFSCHVRKVNRFSKVEDRAIFVTDRHLYKMDPTKQYKVMKTIPLYNLTGLSVSNGK . :::: :::::::: :...::...::.::::.:: .::.::...:: .:::::..: XP_016 FGAVLFSSHVRKVNRFHKIRNRALLLTDQHLYKLDPDRQYRVMRAVPLEAVTGLSVTSGG 760 770 780 790 800 810 920 930 940 950 960 970 pF1KA0 DQLVVFHTKDNKDLIVCLFSKQPTHESRIGELVGVLVNHFKSEKRHLQVNVTNPVQCSLH :::::.:.. . ::.::: ..: ..:.:::::::. : ..: : :.: :.. . : . XP_016 DQLVVLHARGQDDLVVCLHRSRPPLDNRVGELVGVLAAHCQGEGRTLEVRVSDCIPLSHR 820 830 840 850 860 870 980 990 1000 pF1KA0 GKKCTVSVETRLNQPQPDFTKNRSGFILSVPGN : . .::: : .::.::: :..: : : XP_016 GVRRLISVEPRPEQPEPDFRCARGSFTLLWPSR 880 890 900 >>NP_149043 (OMIM: 600642) unconventional myosin-Ig [Hom (1018 aa) initn: 4015 init1: 2778 opt: 3007 Z-score: 3493.2 bits: 657.9 E(85289): 7.8e-188 Smith-Waterman score: 4170; 60.1% identity (83.0% similar) in 1016 aa overlap (1-1004:1-1016) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MAEQESLEFGKADFVLMDTVSMPEFMANLRLRFEKGRIYTFIGEVVVSVNPYKLLNIYGR : ..:. :.:: ::::.: :.: .:: ::.::::::::::.::::.::::::. : .:: NP_149 MEDEEGPEYGKPDFVLLDQVTMEDFMRNLQLRFEKGRIYTYIGEVLVSVNPYQELPLYGP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 DTIEQYKGRELYERPPHLFAIADAAYKAMKRRSKDTCIVISGESGAGKTEASKYIMQYIA ..: .:.:::::::::::.:.:.:::::::.::.:::::::::::::::::::.:::::: NP_149 EAIARYQGRELYERPPHLYAVANAAYKAMKHRSRDTCIVISGESGAGKTEASKHIMQYIA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KA0 AITNPSQRAEVERVKNMLLKSNCVLEAFGNAKTNRNDNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGH :.:::::::::::::..::::.:::::::::.:::: ::::::::::::::::::::::: NP_149 AVTNPSQRAEVERVKDVLLKSTCVLEAFGNARTNRNHNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGH 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KA0 INNYLLEKSRVIVQQPGERSFHSFYQLLQGGSEQMLRSLHLQKSLSSYNYIHVGAQLKSS :..::::::::. :. :::.::.:::::.:. ...:. :::... . ::. : :: :. . NP_149 IHSYLLEKSRVLKQHVGERNFHAFYQLLRGSEDKQLHELHLERNPAVYNFTHQGAGLNMT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 INDAAE-----FRVVADAMKVIGFKPEEIQTVYKILAAILHLGNLKFVVDGDTPLIENG- ...: . ..:..::.::::.:::...:..::::::::::..:: . : ..: NP_149 VHSALDSDEQSHQAVTEAMRVIGFSPEEVESVHRILAAILHLGNIEFVETEEGGLQKEGL 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 pF1KA0 -----KVVSIIAELLSTKTDMVEKALLYRTVATG-RDIIDKQHTEQEASYGRDAFAKAIY .:. .::: .: :.: ..:: ::::.: :..:.: :: ::::.::: :::.: NP_149 AVAEEALVDHVAELTATPRDLVLRSLLARTVASGGRELIEKGHTAAEASYARDACAKAVY 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KA0 ERLFCWIVTRINDIIEVKNYDTTIHGKNTVIGVLDIYGFEIFDNNSFEQFCINYCNEKLQ .::: :.:.:::...: .. : ::.::::::::::::.: :::::::::::::::: NP_149 QRLFEWVVNRINSVMEPRGRDPRRDGKDTVIGVLDIYGFEVFPVNSFEQFCINYCNEKLQ 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 QLFIQLVLKQEQEEYQREGIPWKHIDYFNNQIIVDLVEQQHKGIIAILDDACMNVGKVTD ::::::.::::::::.:::: :. ..:::: ::::::. :.::.:.::.:: ..: .:: NP_149 QLFIQLILKQEQEEYEREGITWQSVEYFNNATIVDLVERPHRGILAVLDEACSSAGTITD 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 EMFLEALNSKLGKHAHFSSRKLCASDKILEFDRDFRIRHYAGDVVYSVIGFIDKNKDTLF ..::..:. . .: :..::.:: .:: .:: :::::.::::::.::: ::::::.: :: NP_149 RIFLQTLDMHHRHHLHYTSRQLCPTDKTMEFGRDFRIKHYAGDVTYSVEGFIDKNRDFLF 490 500 510 520 530 540 530 540 550 560 570 580 pF1KA0 QDFKRLMYNSSNPVLKNMWPEGKLSITEVTKRPLTAATLFKNSMIALVDNLASKEPYYVR ::::::.:::..:.:. :::.:. .:::::::::::.:::::::.:::.:::::::.::: NP_149 QDFKRLLYNSTDPTLRAMWPDGQQDITEVTKRPLTAGTLFKNSMVALVENLASKEPFYVR 550 560 570 580 590 600 590 600 610 620 630 640 pF1KA0 CIKPNDKKSPQIFDDERCRHQVEYLGLLENVRVRRAGFAFRQTYEKFLHRYKMISEFTWP :::::. : .:...::::: :::::::::::::::: :: : .:: :::: :.::: NP_149 CIKPNEDKVAGKLDENHCRHQVAYLGLLENVRVRRAGFASRQPYSRFLLRYKMTCEYTWP 610 620 630 640 650 660 650 660 670 680 690 700 pF1KA0 NHDLPSDKEAVKKLIERCGFQDDVAYGKTKIFIRTPRTLFTLEELRAQMLIRIVLFLQKV :: : ::: ::. :.:. :.: :::.:..:.:::.:::: :::. ::... :::.:::. NP_149 NHLLGSDKAAVSALLEQHGLQGDVAFGHSKLFIRSPRTLVTLEQSRARLIPIIVLLLQKA 670 680 690 700 710 720 710 720 730 740 750 760 pF1KA0 WRGTLARMRYKRTKAALTIIRYYRRYKVKSYIHEVARRFHGVKTMRDYGKHVKWPSPPKV ::::::: : .: .: ::.:..::.::.... :. :::.... ::. . :: :: : NP_149 WRGTLARWRCRRLRAIYTIMRWFRRHKVRAHLAELQRRFQAARQPPLYGRDLVWPLPPAV 730 740 750 760 770 780 770 780 790 800 810 820 pF1KA0 LRRFEEALQTIFNRWRASQLIKSIPASDLPQVRAKVAAVEMLKGQRADLGLQRAWEGNYL :. :... ...: :::: ::.:.:: ::.::..:::::. :.: : : : .::: .:: NP_149 LQPFQDTCHALFCRWRARQLVKNIPPSDMPQIKAKVAAMGALQGLRQDWGCRRAWARDYL 790 800 810 820 830 840 830 840 850 860 870 880 pF1KA0 ASKPDTPQTSGTFVPVANELKRKDKYMNVLFSCHVRKVNRFSKVEDRAIFVTDRHLYKMD .: :.: .:. :. . :. :: . :::: :::::::: :...::...::.::::.: NP_149 SSATDNPTASSLFAQRLKTLQDKDGFGAVLFSSHVRKVNRFHKIRNRALLLTDQHLYKLD 850 860 870 880 890 900 890 900 910 920 930 940 pF1KA0 PTKQYKVMKTIPLYNLTGLSVSNGKDQLVVFHTKDNKDLIVCLFSKQPTHESRIGELVGV : .::.::...:: .:::::..: :::::.:.. . ::.::: ..: ..:.:::::: NP_149 PDRQYRVMRAVPLEAVTGLSVTSGGDQLVVLHARGQDDLVVCLHRSRPPLDNRVGELVGV 910 920 930 940 950 960 950 960 970 980 990 1000 pF1KA0 LVNHFKSEKRHLQVNVTNPVQCSLHGKKCTVSVETRLNQPQPDFTKNRSGFILSVPGN :. : ..: : :.: :.. . : .: . .::: : .::.::: :..: : : NP_149 LAAHCQGEGRTLEVRVSDCIPLSHRGVRRLISVEPRPEQPEPDFRCARGSFTLLWPSR 970 980 990 1000 1010 >>NP_001290209 (OMIM: 606539) unconventional myosin-Id i (436 aa) initn: 2813 init1: 2813 opt: 2813 Z-score: 3272.8 bits: 615.9 E(85289): 1.5e-175 Smith-Waterman score: 2813; 99.8% identity (100.0% similar) in 433 aa overlap (1-433:1-433) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MAEQESLEFGKADFVLMDTVSMPEFMANLRLRFEKGRIYTFIGEVVVSVNPYKLLNIYGR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MAEQESLEFGKADFVLMDTVSMPEFMANLRLRFEKGRIYTFIGEVVVSVNPYKLLNIYGR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 DTIEQYKGRELYERPPHLFAIADAAYKAMKRRSKDTCIVISGESGAGKTEASKYIMQYIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 DTIEQYKGRELYERPPHLFAIADAAYKAMKRRSKDTCIVISGESGAGKTEASKYIMQYIA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KA0 AITNPSQRAEVERVKNMLLKSNCVLEAFGNAKTNRNDNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 AITNPSQRAEVERVKNMLLKSNCVLEAFGNAKTNRNDNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGH 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KA0 INNYLLEKSRVIVQQPGERSFHSFYQLLQGGSEQMLRSLHLQKSLSSYNYIHVGAQLKSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 INNYLLEKSRVIVQQPGERSFHSFYQLLQGGSEQMLRSLHLQKSLSSYNYIHVGAQLKSS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KA0 INDAAEFRVVADAMKVIGFKPEEIQTVYKILAAILHLGNLKFVVDGDTPLIENGKVVSII :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 INDAAEFRVVADAMKVIGFKPEEIQTVYKILAAILHLGNLKFVVDGDTPLIENGKVVSII 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KA0 AELLSTKTDMVEKALLYRTVATGRDIIDKQHTEQEASYGRDAFAKAIYERLFCWIVTRIN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 AELLSTKTDMVEKALLYRTVATGRDIIDKQHTEQEASYGRDAFAKAIYERLFCWIVTRIN 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KA0 DIIEVKNYDTTIHGKNTVIGVLDIYGFEIFDNNSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLVLKQEQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 DIIEVKNYDTTIHGKNTVIGVLDIYGFEIFDNNSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLVLKQEQ 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KA0 EEYQREGIPWKHIDYFNNQIIVDLVEQQHKGIIAILDDACMNVGKVTDEMFLEALNSKLG ::::::::::::. NP_001 EEYQREGIPWKHVGLL 430 >>NP_036355 (OMIM: 606537) unconventional myosin-Ib isof (1078 aa) initn: 1566 init1: 1071 opt: 2367 Z-score: 2748.5 bits: 520.2 E(85289): 2.4e-146 Smith-Waterman score: 2389; 41.6% identity (69.3% similar) in 1004 aa overlap (10-926:16-998) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MAEQESLEFGKADFVLMDTVSMPEFMANLRLRFEKGRIYTFIGEVVVSVNPYKL : .:.::.. .. :. ::. ::....:::.:: ::.:::::. NP_036 MAKMEVKTSLLDNMIGVGDMVLLEPLNEETFINNLKKRFDHSEIYTYIGSVVISVNPYRS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 LNIYGRDTIEQYKGRELYERPPHLFAIADAAYKAMKRRSKDTCIVISGESGAGKTEASKY : ::. . .:.:..:..:: ::.::..: ::.... ..:: ::.:.:::::::::::: NP_036 LPIYSPEKVEEYRNRNFYELSPHIFALSDEAYRSLRDQDKDQCILITGESGAGKTEASKL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 IMQYIAAITNPSQRAEVERVKNMLLKSNCVLEAFGNAKTNRNDNSSRFGKYMDINFDFKG .:.:.::. . . :::..::..::.:: :::::::::: ::::::::::::::.::::: NP_036 VMSYVAAVCGKG--AEVNQVKEQLLQSNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKYMDIEFDFKG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 DPIGGHINNYLLEKSRVIVQQPGERSFHSFYQLLQGGSEQMLRSLHLQKSLSSYNYIHVG ::.:: :.:::::::::. : :::.:: :::::.:.::..: .:.:....: :::. . NP_036 DPLGGVISNYLLEKSRVVKQPRGERNFHVFYQLLSGASEELLNKLKLERDFSRYNYLSLD 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KA0 AQLKSSINDAAEFRVVADAMKVIGFKPEEIQTVYKILAAILHLGNLKFV----VDG-DTP . ....:::.::.: .::...:: .: ..: ..::.:.:::..: :.: : NP_036 SAKVNGVDDAANFRTVRNAMQIVGFMDHEAESVLAVVAAVLKLGNIEFKPESRVNGLDES 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KA0 LIENGKVVSIIAELLSTKTDMVEKALLYRTVATGRDIIDKQHTEQEASYGRDAFAKAIYE :.. . .. : :: . ...:.:. .::: . .. .. . .: :.:::.:: .: NP_036 KIKDKNELKEICELTGIDQSVLERAFSFRTVEAKQEKVSTTLNVAQAYYARDALAKNLYS 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KA0 RLFCWIVTRINDIIEVKNYDTTIHGKNTVIGVLDIYGFEIFDNNSFEQFCINYCNEKLQQ ::: :.:.:::. :... : .. : :.:::::::::::..:::::: :::::::::: NP_036 RLFSWLVNRINESIKAQ---TKVRKK--VMGVLDIYGFEIFEDNSFEQFIINYCNEKLQQ 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 LFIQLVLKQEQEEYQREGIPWKHIDYFNNQIIVDLVEQQHKGIIAILDDACMNVGKVTDE .::.:.::.::::: :: : : ::::::: :: ::.:.. .::.:.::. :. : :::: NP_036 IFIELTLKEEQEEYIREDIEWTHIDYFNNAIICDLIENNTNGILAMLDEECLRPGTVTDE 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 MFLEALNSKLGKHAHFSSR-KLCA---SDKILEFDRDFRIRHYAGDVVYSVIGFIDKNKD ::: ::. . : :: :: . :. .: : . :::.:::: :.:.: ::.:::.: NP_036 TFLEKLNQVCATHQHFESRMSKCSRFLNDTSLPHSC-FRIQHYAGKVLYQVEGFVDKNND 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KA0 TLFQDFKRLMYNSSNPVLKNMWPEGKLSITEVTKRPLTAATLFKNSMIALVDNLASKEPY :..:... :...:. ..:...:::. . .. ::: ::.. :: :. .:. :: .:.: NP_036 LLYRDLSQAMWKASHALIKSLFPEGNPAKINL-KRPPTAGSQFKASVATLMKNLQTKNPN 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KA0 YVRCIKPNDKKSPQIFDDERCRHQVEYLGLLENVRVRRAGFAFRQTYEKFLHRYKMISEF :.:::::::::. .::.. ::..::::::::::::::.::::.:: :.::::. . NP_036 YIRCIKPNDKKAAHIFNEALVCHQIRYLGLLENVRVRRAGYAFRQAYEPCLERYKMLCKQ 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KA0 TWPNHDLPSDKEAVKKLIERCGFQ-DDVAYGKTKIFIRTPRTLFTLEELRAQMLIRIVLF :::. :. . .:. :... . .. ..:..:::::.::::: ::.:: : : .. . NP_036 TWPHWKGPA-RSGVEVLFNELEIPVEEYSFGRSKIFIRNPRTLFKLEDLRKQRLEDLATL 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 pF1KA0 LQKVWRGTLARM-----------------------RYKRTKA-ALTIIRYYRRYKVKSYI .::..:: : ::..::. ::.: : : .:... . NP_036 IQKIYRGWKCRTHFLLMKKSQIVIAAWYRRYAQQKRYQQTKSSALVIQSYIRGWKARKIL 720 730 740 750 760 770 750 760 pF1KA0 HE-------------VARRFHGVKTMRDY--------GKHV------------------- .: .: .::... :.: ::.. NP_036 RELKHQKRCKEAVTTIAAYWHGTQVRREYRKFFRANAGKKIYEFTLQRIVQKYFLEMKNK 780 790 800 810 820 830 770 780 790 800 810 pF1KA0 ---------KWPSPPKV-LRRFEEALQTIFNRWRASQLIKSIPASDLPQVRAKVAAVEML .::: : . : .. :. ::. :: .. .. .. . :. : :.. NP_036 MPSLSPIDKNWPSRPYLFLDSTHKELKRIFHLWRCKKYRDQFTDQQKLIYEEKLEASELF 840 850 860 870 880 890 820 830 840 850 860 pF1KA0 KGQRA--DLGLQRAWEGNYLASKPDTPQTSGTFVPVANELKRKDKYMNVLFSCHVRKVNR : ..: .. . ..: :: . . :. . . . ...: .... : :.:: NP_036 KDKKALYPSSVGQPFQGAYLEINKN-PK----YKKLKDAIEEK-----IIIAEVVNKINR 900 910 920 930 940 870 880 890 900 910 920 pF1KA0 FS-KVEDRAIFVTDRHLYKMDPTKQYKVMKTIPLYNLTGLSVSNGKDQLVVFHTKDNKDL . : .: ...:. .: : :. .. . .:: ..: .:.:. .: . . : :.... NP_036 ANGKSTSRIFLLTNNNLLLADQ-KSGQIKSEVPLVDVTKVSMSSQNDGFFAVHLKEGSEA 950 960 970 980 990 930 940 950 960 970 980 pF1KA0 IVCLFSKQPTHESRIGELVGVLVNHFKSEKRHLQVNVTNPVQCSLHGKKCTVSVETRLNQ NP_036 ASKGDFLFSSDHLIEMATKLYRTTLSQTKQKLNIEISDEFLVQFRQDKVCVKFIQGNQKN 1000 1010 1020 1030 1040 1050 >>NP_001317166 (OMIM: 606537) unconventional myosin-Ib i (1107 aa) initn: 1566 init1: 1071 opt: 2366 Z-score: 2747.2 bits: 520.0 E(85289): 2.8e-146 Smith-Waterman score: 2366; 47.9% identity (75.8% similar) in 789 aa overlap (10-787:16-794) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MAEQESLEFGKADFVLMDTVSMPEFMANLRLRFEKGRIYTFIGEVVVSVNPYKL : .:.::.. .. :. ::. ::....:::.:: ::.:::::. NP_001 MAKMEVKTSLLDNMIGVGDMVLLEPLNEETFINNLKKRFDHSEIYTYIGSVVISVNPYRS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 LNIYGRDTIEQYKGRELYERPPHLFAIADAAYKAMKRRSKDTCIVISGESGAGKTEASKY : ::. . .:.:..:..:: ::.::..: ::.... ..:: ::.:.:::::::::::: NP_001 LPIYSPEKVEEYRNRNFYELSPHIFALSDEAYRSLRDQDKDQCILITGESGAGKTEASKL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 IMQYIAAITNPSQRAEVERVKNMLLKSNCVLEAFGNAKTNRNDNSSRFGKYMDINFDFKG .:.:.::. . . :::..::..::.:: :::::::::: ::::::::::::::.::::: NP_001 VMSYVAAVCG--KGAEVNQVKEQLLQSNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKYMDIEFDFKG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 DPIGGHINNYLLEKSRVIVQQPGERSFHSFYQLLQGGSEQMLRSLHLQKSLSSYNYIHVG ::.:: :.:::::::::. : :::.:: :::::.:.::..: .:.:....: :::. . 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