FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0743, 1061 aa
1>>>pF1KA0743 1061 - 1061 aa - 1061 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9117+/-0.000535; mu= 12.8864+/- 0.033
mean_var=106.5535+/-20.445, 0's: 0 Z-trim(109.0): 244 B-trim: 6 in 1/54
Lambda= 0.124248
statistics sampled from 16862 (17136) to 16862 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.532), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16
Scan time: 13.470
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004787 (OMIM: 600567) neurexin 3 isoform 1 [Hom (1061) 7080 1281.4 0
XP_011535675 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1446) 7080 1281.5 0
XP_016877296 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1449) 7064 1278.6 0
XP_016877291 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1541) 6444 1167.5 0
XP_016877289 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1553) 6444 1167.5 0
XP_016877288 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1654) 6444 1167.5 0
XP_011535669 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1657) 6444 1167.5 0
XP_016860816 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1466) 5646 1024.4 0
XP_006712200 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1481) 5646 1024.4 0
XP_011535679 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1323) 5634 1022.3 0
XP_016877294 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1464) 5634 1022.3 0
XP_016877292 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1468) 5634 1022.3 0
XP_011535674 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1476) 5634 1022.3 0
XP_011535673 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1479) 5634 1022.3 0
NP_001317124 (OMIM: 600567) neurexin 3 isoform 5 [ (1571) 5634 1022.3 0
XP_011535672 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1575) 5634 1022.3 0
XP_011535671 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1583) 5634 1022.3 0
XP_011535670 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1586) 5634 1022.3 0
XP_016877286 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1667) 5634 1022.3 0
XP_016877284 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1675) 5634 1022.3 0
XP_016877283 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1675) 5634 1022.3 0
XP_011535668 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1679) 5634 1022.3 0
XP_006720385 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1683) 5634 1022.3 0
XP_016877281 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1683) 5634 1022.3 0
XP_005268275 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1684) 5634 1022.3 0
XP_016877279 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1687) 5634 1022.3 0
XP_011535666 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1687) 5634 1022.3 0
XP_016877280 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1687) 5634 1022.3 0
XP_011535665 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1687) 5634 1022.3 0
XP_011535667 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 (1687) 5634 1022.3 0
XP_016860815 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1471) 5579 1012.4 0
NP_004792 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin-1 (1477) 5579 1012.4 0
XP_011531479 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1484) 5579 1012.4 0
NP_001317025 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1437) 5543 1006.0 0
NP_001317017 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1447) 5543 1006.0 0
NP_001317012 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1452) 5543 1006.0 0
XP_016860814 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1472) 5543 1006.0 0
NP_001317016 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1440) 5476 994.0 0
NP_001317024 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1460) 5476 994.0 0
XP_016860813 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1475) 5476 994.0 0
XP_016874067 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2- (1488) 5394 979.3 0
XP_016874057 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2- (1682) 4899 890.6 0
XP_016874056 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2- (1685) 4883 887.7 0
XP_011531482 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1450) 4626 841.6 0
XP_011531477 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1495) 4626 841.6 0
NP_001317011 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1496) 4626 841.6 0
NP_001317006 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1499) 4626 841.6 0
NP_001317023 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1500) 4626 841.6 0
NP_001317015 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1504) 4626 841.6 0
NP_001317022 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1506) 4626 841.6 0
>>NP_004787 (OMIM: 600567) neurexin 3 isoform 1 [Homo sa (1061 aa)
initn: 7080 init1: 7080 opt: 7080 Z-score: 6862.2 bits: 1281.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7080; 99.9% identity (100.0% similar) in 1061 aa overlap (1-1061:1-1061)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKWNTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKWNTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 RKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDMGSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDMGSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 GTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLGGLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLGGLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMSAKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMSAKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 YWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMHTEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMHTEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPETLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPETLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 DDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 IDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 IDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 DGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 KVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 DALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYI
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 FGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFSTTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFSTTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 GVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 TQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 QTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRSTASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRSTASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 TANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060
pF1KA0 DETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
1030 1040 1050 1060
>>XP_011535675 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 isof (1446 aa)
initn: 7080 init1: 7080 opt: 7080 Z-score: 6860.1 bits: 1281.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7080; 99.9% identity (100.0% similar) in 1061 aa overlap (1-1061:386-1446)
10 20 30
pF1KA0 MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RQHSGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
360 370 380 390 400 410
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
420 430 440 450 460 470
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
480 490 500 510 520 530
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
540 550 560 570 580 590
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
600 610 620 630 640 650
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
660 670 680 690 700 710
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
720 730 740 750 760 770
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRY
780 790 800 810 820 830
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 ISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLS
840 850 860 870 880 890
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
900 910 920 930 940 950
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
960 970 980 990 1000 1010
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 NLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQGV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
XP_011 NLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGV
1020 1030 1040 1050 1060 1070
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
1080 1090 1100 1110 1120 1130
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
1140 1150 1160 1170 1180 1190
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
1200 1210 1220 1230 1240 1250
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
1260 1270 1280 1290 1300 1310
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVV
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 GIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKSGHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKSGHK
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1060
pF1KA0 KQKNKDREYYV
:::::::::::
XP_011 KQKNKDREYYV
1440
>--
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pF1KA0 LKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILF-NSGDGND
: : : :::::. :..:. ..: :
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pF1KA0 FIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVT
:. . :: : .. :.. . ... .: . .::..:: ....:: : : .: . .
XP_011 FLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETAVLSN--KQVNDSSWHFLMVSRDRLRT-VLMLDGEGQS
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.. . .:. .::...:. . . : : . ::.: . .. .. : :..
XP_011 GELQPQRPYMDVVSDLFLGGVPTDIRPSALTLDGVQAMPGFKGLILDLKYGNSEPRLLG-
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: .. ::: : : : : :.:. ::::: :.:.:. :. :::
XP_011 ----SRGVQMDAEGP---CGERPCENGGICFLLDGHPTCDCSTTGYGGKLCSEDVSQDPG
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.... :.: : . .. : .. ::.....:.: ..:....
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.. .:...: ...: ...:.:.:. . .. ::. .: :. :::
XP_011 GKS---ADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAIVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSG
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XP_016 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA0 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
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::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTGRSANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTG
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pF1KA0 MVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKS
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pF1KA0 GHKKQKNKDREYYV
::::::::::::::
XP_016 GHKKQKNKDREYYV
1440
>--
initn: 263 init1: 117 opt: 253 Z-score: 246.4 bits: 57.7 E(85289): 5.5e-07
Smith-Waterman score: 358; 25.3% identity (56.2% similar) in 324 aa overlap (516-813:45-354)
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 LKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILF-NSGDGND
: : : :::::. :..:. ..: :
XP_016 SILLGSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRWDASTRSDLSFQFKTNVSTGLLLYLDDGGVCD
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pF1KA0 FIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVT
:. . :: : .. :.. . ... .: . .::..:: ....:: : : .: . .
XP_016 FLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETAVLSN--KQVNDSSWHFLMVSRDRLRT-VLMLDGEGQS
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.. . .:. .::...:. . . : : . ::.: . .. .. : :..
XP_016 GELQPQRPYMDVVSDLFLGGVPTDIRPSALTLDGVQAMPGFKGLILDLKYGNSEPRLLG-
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: .. ::: : : : : :.:. ::::: :.:.:. :. :::
XP_016 ----SRGVQMDAEGP---CGERPCENGGICFLLDGHPTCDCSTTGYGGKLCSEDVSQDPG
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.... :.: : . .. : .. ::.....:.: ..:....
XP_016 LSHLMMSEQGRSKAREENVATFRGSEYLCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTWQRNGLILHT
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.. .:...: ...: ...:.:.:. . .. ::. .: :. :::
XP_016 GKS---ADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAIVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSG
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XP_016 IGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEV
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Smith-Waterman score: 6444; 99.9% identity (100.0% similar) in 961 aa overlap (1-961:374-1334)
10 20 30
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
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XP_016 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
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pF1KA0 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
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pF1KA0 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA0 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA0 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
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XP_016 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
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pF1KA0 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
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pF1KA0 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
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pF1KA0 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
1250 1260 1270 1280 1290 1300
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pF1KA0 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVV
:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTDKSLSTSIFEGGYKAHAPKWESKDFRPNK
1310 1320 1330 1340 1350 1360
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pF1KA0 GIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKSGHK
XP_016 VSETSRTTTTSLSPELIRFTASSSSGMVPKLPAGKMNNRDLKPQPDIVLLPLPTAYELDS
1370 1380 1390 1400 1410 1420
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initn: 707 init1: 641 opt: 653 Z-score: 633.5 bits: 129.4 E(85289): 1.5e-28
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pF1KA0 VLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNR
: :::. ::. . ... :. .
XP_016 TSIFEGGYKAHAPKWESKDFRPNKVSETSRTTTTSLSPELIRFTASSSSGMVPKLPAGKM
1340 1350 1360 1370 1380 1390
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pF1KA0 STASIQPTSD----DLVSSAECSSDD-EDFVECEP-----STANPTEPGIRRVPGASEVI
.. ...: : : .. : .: .. . : :::::::::::::::::::
XP_016 NNRDLKPQPDIVLLPLPTAYELDSTKLKSPLITSPMFRNVPTANPTEPGIRRVPGASEVI
1400 1410 1420 1430 1440 1450
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pF1KA0 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMK
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1040 1050 1060
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XP_016 EKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
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>--
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: : : :::::. :..:. ..: :
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:. . :: : .. :.. . ... :.. .::..:: ....:: : : .: . .
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.. . .:. .::...:. . . : : . ::.: . .. .. : :..
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: .. ::: : : : : :.:. ::::: :.:.:. :. :::
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.... ... . : : :. ::.....:.: ..:.... ..
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.:...: ...: ...:.:.:. . .. ::. .: :. ::: ..:..::
XP_016 ---ADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAIVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQVTISVD
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XP_016 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
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.. ...: : : .. : .: .. . : :::::::::::::::::::
XP_016 NNRDLKPQPDIVLLPLPTAYELDSTKLKSPLITSPMFRNVPTANPTEPGIRRVPGASEVI
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pF1KA0 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMK
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XP_016 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMK
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XP_016 EKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
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:. . :: : .. :.. . ... .: . .::..:: ....:: : : .: . .
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.. . .:. .::...:. . . : : . ::.: . .. .. : :..
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: .. ::: : : : : :.:. ::::: :.:.:. :. :::
XP_016 ----SRGVQMDAEGP---CGERPCENGGICFLLDGHPTCDCSTTGYGGKLCSEDVSQDPG
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.... :.: : . .. : .. ::.....:.: ..:....
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.. .:...: ...: ...:.:.:. . .. ::. .: :. :::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
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pF1KA0 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
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XP_016 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA0 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA0 ISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLS
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pF1KA0 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
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pF1KA0 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
XP_016 NLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGV
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pF1KA0 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
1080 1090 1100 1110 1120 1130
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pF1KA0 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
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XP_016 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
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pF1KA0 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
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XP_016 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
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pF1KA0 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
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pF1KA0 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVV
:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTGGELVIPLLVEDPLATPPIATRAPSITLP
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pF1KA0 GIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKSGHK
XP_016 PTFRPLLTIIETTKDSLSMTSEAGLPCLSDQGSDGCDDDGLVISGYGSGETFDSNLPPTD
1380 1390 1400 1410 1420 1430
>--
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Smith-Waterman score: 653; 66.3% identity (77.3% similar) in 172 aa overlap (900-1061:1483-1654)
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 VLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNR
: :::. ::. . ... :. .
XP_016 TSIFEGGYKAHAPKWESKDFRPNKVSETSRTTTTSLSPELIRFTASSSSGMVPKLPAGKM
1460 1470 1480 1490 1500 1510
930 940 950 960 970
pF1KA0 STASIQPTSD----DLVSSAECSSDD-EDFVECEP-----STANPTEPGIRRVPGASEVI
.. ...: : : .. : .: .. . : :::::::::::::::::::
XP_016 NNRDLKPQPDIVLLPLPTAYELDSTKLKSPLITSPMFRNVPTANPTEPGIRRVPGASEVI
1520 1530 1540 1550 1560 1570
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pF1KA0 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMK
1580 1590 1600 1610 1620 1630
1040 1050 1060
pF1KA0 EKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
::::::::::::::::::::::
XP_016 EKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
1640 1650
>--
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Smith-Waterman score: 358; 25.3% identity (56.2% similar) in 324 aa overlap (516-813:45-354)
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 LKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILF-NSGDGND
: : : :::::. :..:. ..: :
XP_016 SILLGSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRWDASTRSDLSFQFKTNVSTGLLLYLDDGGVCD
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pF1KA0 FIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVT
:. . :: : .. :.. . ... .: . .::..:: ....:: : : .: . .
XP_016 FLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETAVLSN--KQVNDSSWHFLMVSRDRLRT-VLMLDGEGQS
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pF1KA0 QVINGAKN-LDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKL--VASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIND
.. . .:. .::...:. . . : : . ::.: . .. .. : :..
XP_016 GELQPQRPYMDVVSDLFLGGVPTDIRPSALTLDGVQAMPGFKGLILDLKYGNSEPRLLG-
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: .. ::: : : : : :.:. ::::: :.:.:. :. :::
XP_016 ----SRGVQMDAEGP---CGERPCENGGICFLLDGHPTCDCSTTGYGGKLCSEDVSQDPG
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pF1KA0 ATYIF----GKSG----------GLILYTWPANDRP-STRSDRLAVGFSTTVKDGILVRI
.... :.: : . .. : .. ::.....:.: ..:....
XP_016 LSHLMMSEQGRSKAREENVATFRGSEYLCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTWQRNGLILHT
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pF1KA0 DSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGT--VDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATL
.. .:...: ...: ...:.:.:. . .. ::. .: :. :::
XP_016 GKS---ADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAIVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSG
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pF1KA0 QVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNP
XP_016 IGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEV
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Smith-Waterman score: 6444; 99.9% identity (100.0% similar) in 961 aa overlap (1-961:386-1346)
10 20 30
pF1KA0 MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA0 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLS
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pF1KA0 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
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pF1KA0 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
XP_011 NLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGV
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pF1KA0 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
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pF1KA0 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
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pF1KA0 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKV
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pF1KA0 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS
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pF1KA0 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVV
:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTGRSGGELVIPLLVEDPLATPPIATRAPSI
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pF1KA0 GIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKSGHK
XP_011 TLPPTFRPLLTIIETTKDSLSMTSEAGLPCLSDQGSDGCDDDGLVISGYGSGETFDSNLP
1380 1390 1400 1410 1420 1430
>--
initn: 691 init1: 641 opt: 653 Z-score: 633.0 bits: 129.5 E(85289): 1.6e-28
Smith-Waterman score: 653; 66.3% identity (77.3% similar) in 172 aa overlap (900-1061:1486-1657)
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 VLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNR
: :::. ::. . ... :. .
XP_011 TSIFEGGYKAHAPKWESKDFRPNKVSETSRTTTTSLSPELIRFTASSSSGMVPKLPAGKM
1460 1470 1480 1490 1500 1510
930 940 950 960 970
pF1KA0 STASIQPTSD----DLVSSAECSSDD-EDFVECEP-----STANPTEPGIRRVPGASEVI
.. ...: : : .. : .: .. . : :::::::::::::::::::
XP_011 NNRDLKPQPDIVLLPLPTAYELDSTKLKSPLITSPMFRNVPTANPTEPGIRRVPGASEVI
1520 1530 1540 1550 1560 1570
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA0 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMK
1580 1590 1600 1610 1620 1630
1040 1050 1060
pF1KA0 EKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
::::::::::::::::::::::
XP_011 EKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
1640 1650
>--
initn: 263 init1: 117 opt: 253 Z-score: 245.5 bits: 57.8 E(85289): 6.2e-07
Smith-Waterman score: 358; 25.3% identity (56.2% similar) in 324 aa overlap (516-813:45-354)
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 LKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILF-NSGDGND
: : : :::::. :..:. ..: :
XP_011 SILLGSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRWDASTRSDLSFQFKTNVSTGLLLYLDDGGVCD
20 30 40 50 60 70
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pF1KA0 FIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVT
:. . :: : .. :.. . ... .: . .::..:: ....:: : : .: . .
XP_011 FLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETAVLSN--KQVNDSSWHFLMVSRDRLRT-VLMLDGEGQS
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pF1KA0 QVINGAKN-LDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKL--VASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIND
.. . .:. .::...:. . . : : . ::.: . .. .. : :..
XP_011 GELQPQRPYMDVVSDLFLGGVPTDIRPSALTLDGVQAMPGFKGLILDLKYGNSEPRLLG-
140 150 160 170 180 190
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pF1KA0 ALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCN-----DPG
: .. ::: : : : : :.:. ::::: :.:.:. :. :::
XP_011 ----SRGVQMDAEGP---CGERPCENGGICFLLDGHPTCDCSTTGYGGKLCSEDVSQDPG
200 210 220 230 240
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pF1KA0 ATYIF----GKSG----------GLILYTWPANDRP-STRSDRLAVGFSTTVKDGILVRI
.... :.: : . .. : .. ::.....:.: ..:....
XP_011 LSHLMMSEQGRSKAREENVATFRGSEYLCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTWQRNGLILHT
250 260 270 280 290 300
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.. .:...: ...: ...:.:.:. . .. ::. .: :. :::
XP_011 GKS---ADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAIVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSG
310 320 330 340 350 360
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pF1KA0 QVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNP
XP_011 IGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEV
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>>XP_016860816 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTED: n (1466 aa)
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Smith-Waterman score: 5646; 76.8% identity (92.3% similar) in 1068 aa overlap (1-1061:399-1466)
10 20 30
pF1KA0 MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DVKVTRNLRQVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
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40 50 60 70 80 90
pF1KA0 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
:::::::::::.::::::::. .: ::::.: :.::::::::::::.:::::..::::::
XP_016 CLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLDPITFETPESFISLPKW
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:.:. ::::::::::::::::::.::::...:::. . ::::::.:.:::.:::::::
XP_016 NAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDFFAIEMLDGHLYLLLDM
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pF1KA0 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
::::::.:: ::.:::::::::.::::::::::::. :::.:: ::::::::. ..:::
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pF1KA0 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
:::::.:::..:::.:::.::::::::::::::::.::.:::.::.:..:::: :::. .
XP_016 GLPENKAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMAEVQSTAGVKPSCSKET
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pF1KA0 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
:: : : :::::..:.:::::..:::.:::: ::.:::::..:::::::.::: .:.:::
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pF1KA0 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
:::::::.:: ::::::.:.::::::::::::::::.::::: :::::::::::::::::
XP_016 TEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTVNLDCIRINCNSSKGPE
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pF1KA0 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVA-EGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKR
::.:: .::::::::::::::::::::::::. : : :.:::::::::::::::.::.:
XP_016 TLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHNIETGIITERR
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pF1KA0 YISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYL
:.: :::.:::::::: :::. :::::::::::::::.::::.::::::::::::::::.
XP_016 YLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNIIADPVTFKTKSSYV
850 860 870 880 890 900
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pF1KA0 SLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIK
.:::::::::::::::::::: ::.::.:::::::::.:::::::.::::::::: :.::
XP_016 ALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVFDLGNGANLIK
910 920 930 940 950 960
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pF1KA0 GNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMY
:.:..::::::::::.:.::.:: :..:.:::..::. ::.:::::.:::..:.:. :
XP_016 GSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDLYIGGVAKETY
970 980 990 1000 1010 1020
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pF1KA0 SNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQG
..::::: ...:::::::::::::::::::.::: .:::.:::::::::::::::.:::
XP_016 KSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGCEGPSTTCQEDSCSNQG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KA0 VCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGF
::.:::.::.:::::::.:: :::::.::::.:.:: : : :: :::::::.::::.::
XP_016 VCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTRADRLAIGF
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KA0 STTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVR
::. :...:::.::. ::::.:.:::.:::::: ::.:: ::.:.: . .:::::::::
XP_016 STVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEESNAIINDGKYHVVR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 FTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLK
:::.:::::::::.::: :.::.::::::::.:: : ::::..:. ::::::::::.:::
XP_016 FTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLK
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pF1KA0 VLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQT-TSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKN
::::::::. :: : :.::::::::: . : .: :.: ::::..::::::.::.:.:..
XP_016 VLNMAAENDANIAIVGNVRLVGEVPSSMTTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
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pF1KA0 R--STASIQPTSDD-LVSSAECSSDDEDFVECEPSTANPTEPGIRR-VPGASEVIRESSS
. . :. :.:: ::.:::: :::::. ::::.::::. : :. ::..::::::::
XP_016 KPPTKEPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSSANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KA0 TTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::...:::: :
XP_016 TTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPS
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1050 1060
pF1KA0 S-KSGHKKQKNKDREYYV
: ::..:..::::.::::
XP_016 SAKSSNKNKKNKDKEYYV
1450 1460
>--
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pF1KA0 NIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDG-NDFIAVELVK
::.:: : :..:. . .: ::. . :..
XP_016 ELGSGLEFPGAEGQWTRFPKWNACCESEMSFQLKTRSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTR
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: .. :.. . : .. .: :.::. ::.: : :. :: . .:..: : .: .
XP_016 GGRLQLSFSIFCAEPATLL--ADTPVNDGAWHSVRIRRQFRNTTLFIDQVEAKWV-EVKS
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... . . :...:: . . :: : :. :.: . .: .:. ..
XP_016 KRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREPFKGWIRDVRVNSSQVLPVD----
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::..: : :.. :. :.. : : ::: . .:::: :.. :..:
XP_016 -SGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDDQAVCDCSRTGFRGKDCSQ
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: : .... ::: : : . .. : .. ::.....:.: .
XP_016 EDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTLQR
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.:.... .. .:...: ...: ...:.:.:. . .. ::. .: :. ::
XP_016 NGLMLHTGKS---ADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVKVTR
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: ..:..::
XP_016 NLRQVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVV
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10 20 30
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:::::::::::.::::::::. .: ::::.: :.::::::::::::.:::::..::::::
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:.:. ::::::::::::::::::.::::...:::. . ::::::.:.:::.:::::::
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::::::.:: ::.:::::::::.::::::::::::. :::.:: ::::::::. ..:::
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:: : : :::::..:.:::::..:::.:::: ::.:::::..:::::::.::: .:.:::
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:::::::.:: ::::::.:.::::::::::::::::.::::: :::::::::::::::::
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pF1KA0 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVA-EGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKR
::.:: .::::::::::::::::::::::::. : : :.:::::::::::::::.::.:
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:.: :::.:::::::: :::. :::::::::::::::.::::.::::::::::::::::.
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..::::: ...:::::::::::::::::::.::: .:::.:::::::::::::::.:::
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::.:::.::.:::::::.:: :::::.::::.:.:: : : :: :::::::.::::.::
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::. :...:::.::. ::::.:.:::.:::::: ::.:: ::.:.: . .:::::::::
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XP_006 FTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLK
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pF1KA0 VLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQT-TSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKN
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XP_006 VLNMAAENDANIAIVGNVRLVGEVPSSMTTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRG
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pF1KA0 R--STASIQPTSDD-LVSSAECSSDDEDFVECEPSTANPTEPGIRR-VPGASEVIRESSS
. . :. :.:: ::.:::: :::::. ::::.::::. : :. ::..::::::::
XP_006 KPPTKEPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSSANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSS
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pF1KA0 TTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::...:::: :
XP_006 TTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPS
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1050 1060
pF1KA0 S-KSGHKKQKNKDREYYV
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XP_006 SAKSSNKNKKNKDKEYYV
1470 1480
>--
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pF1KA0 NIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDG-NDFIAVELVK
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XP_006 -SGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDDQAVCDCSRTGFRGKDCSQ
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pF1KA0 ---NDPGATYIF----GKSGGLILYT----------WPANDRP-STRSDRLAVGFSTTVK
: : .... ::: : : . .. : .. ::.....:.: .
XP_006 EDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTLQR
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.:.... .. .:...: ...: ...:.:.:. . .. ::. .: :. ::
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:
XP_006 NLRQHSGIGHAMVNKLHCSVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPG
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>>XP_011535679 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 isof (1323 aa)
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XP_011 MVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKWNTKRMGSIS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDMGSGTIKVKA
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pF1KA0 TQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLGGLPENRAGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLGGLPENRAGL
190 200 210 220 230 240
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pF1KA0 ILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMSAKQCDSYPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMSAKQCDSYPC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMHTEAEDVSFR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPETLYAGQKLN
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pF1KA0 DNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYISVVPSSFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYISVVPSSFI
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460 470 480 490 500 510
pF1KA0 GHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTS
490 500 510 520 530 540
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pF1KA0 MHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDN
550 560 570 580 590 600
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pF1KA0 QWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKLVASR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKLVASR
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::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFT
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pF1KA0 CDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFSTTVKDGILV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFSTTVKDGILV
730 740 750 760 770 780
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pF1KA0 RIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATL
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pF1KA0 QVDNWPVNEHYPTG------------------------------RQLTIFNTQAQIAIGG
:::::::::::::: ::::::::::::::::
XP_011 QVDNWPVNEHYPTGNTDNERFQMVKQKIPFKYNRPVEEWLQEKGRQLTIFNTQAQIAIGG
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850 860 870 880 890 900
pF1KA0 KDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEM
910 920 930 940 950 960
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