Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0751
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0751, 1188 aa
1>>>pF1KA0751 1188 - 1188 aa - 1188 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3573+/-0.00105; mu= 4.1186+/- 0.063
mean_var=220.5186+/-46.169, 0's: 0 Z-trim(111.3): 83 B-trim: 203 in 1/50
Lambda= 0.086368
statistics sampled from 12185 (12263) to 12185 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.377), width: 16
Scan time: 5.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS64948.1 RIMS2 gene_id:9699|Hs108|chr8 (1188) 7951 1004.6 0
CCDS55269.1 RIMS2 gene_id:9699|Hs108|chr8 (1349) 4118 527.0 1.1e-148
CCDS55029.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6 ( 817) 3493 449.0 2.1e-125
CCDS43761.1 RIMS2 gene_id:9699|Hs108|chr8 (1163) 3069 396.3 2.3e-109
CCDS55030.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6 (1012) 2158 282.7 3e-75
CCDS47449.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6 (1692) 2125 278.8 7.8e-74
CCDS55031.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6 ( 826) 2117 277.6 8.8e-74
CCDS55032.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6 ( 760) 1973 259.6 2.1e-68
CCDS64949.1 RIMS2 gene_id:9699|Hs108|chr8 ( 285) 1546 206.1 9.7e-53
CCDS55033.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6 ( 219) 1232 166.9 4.7e-41
CCDS30687.1 RIMS3 gene_id:9783|Hs108|chr1 ( 308) 1145 156.2 1.1e-37
CCDS13338.1 RIMS4 gene_id:140730|Hs108|chr20 ( 269) 1084 148.6 2e-35
CCDS56191.1 RIMS4 gene_id:140730|Hs108|chr20 ( 270) 1082 148.3 2.4e-35
>>CCDS64948.1 RIMS2 gene_id:9699|Hs108|chr8 (1188 aa)
initn: 7951 init1: 7951 opt: 7951 Z-score: 5364.5 bits: 1004.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7951; 100.0% identity (100.0% similar) in 1188 aa overlap (1-1188:1-1188)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MQFETLRQVCNSVLSHFHGVFSSPPNILQNELFGQTLNNARKRSPSVSRDQNRRYDQREE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MQFETLRQVCNSVLSHFHGVFSSPPNILQNELFGQTLNNARKRSPSVSRDQNRRYDQREE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 REEYSQYATSDTAMPRSPSDYADRRSQHEPQFYEDSDHLSYRDSNRRSHRHSKEYIVDDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 REEYSQYATSDTAMPRSPSDYADRRSQHEPQFYEDSDHLSYRDSNRRSHRHSKEYIVDDE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 DVESRDEYERQRREEEYQSRYRSDPNLARYPVKPQPYEEQMRIHAEVSRARHERRHSDVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 DVESRDEYERQRREEEYQSRYRSDPNLARYPVKPQPYEEQMRIHAEVSRARHERRHSDVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LANADLEDSRISMLRMDRPSRQRSISERRAAMENQRSYSMERTREAQGPSSYAQRTTNHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LANADLEDSRISMLRMDRPSRQRSISERRAAMENQRSYSMERTREAQGPSSYAQRTTNHS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 PPTPRRSPLPIDRPDLRRTDSLRKQHHLDPSSAVRKTKREKMETMLRNDSLSSDQSESVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PPTPRRSPLPIDRPDLRRTDSLRKQHHLDPSSAVRKTKREKMETMLRNDSLSSDQSESVR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 PPPPKPHKSKKGGKMRQISLSSSEEELASTPEYTSCDDVEIESESVSEKGDSQKGKRKTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PPPPKPHKSKKGGKMRQISLSSSEEELASTPEYTSCDDVEIESESVSEKGDSQKGKRKTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EQAVLSDSNTRSERQKEMMYFGGHSLEEDLEWSEPQIKDSGVDTCSSTTLNEEHSHSDKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EQAVLSDSNTRSERQKEMMYFGGHSLEEDLEWSEPQIKDSGVDTCSSTTLNEEHSHSDKH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 PVTWQPSKDGDRLIGRILLNKRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCAFITKVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PVTWQPSKDGDRLIGRILLNKRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCAFITKVKK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 GSLADTVGHLRPGDEVLEWNGRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIPRIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GSLADTVGHLRPGDEVLEWNGRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIPRIP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 DSTHAQLESSSSSFESQKMDRPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSIKLWFDKVGHQLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 DSTHAQLESSSSSFESQKMDRPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSIKLWFDKVGHQLI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 VTILGAKDLPSREDGRPRNPYVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFIYSPVHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 VTILGAKDLPSREDGRPRNPYVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFIYSPVHR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 REFRERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSSLPLPHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 REFRERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSSLPLPHP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 SPYMPRRQLHGESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSDYRHDGRDLQSSTLSVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SPYMPRRQLHGESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSDYRHDGRDLQSSTLSVPE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 QVMSSNHCSPSGSPHRVDVIGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQGLRGTRTMTGHYNTISRMDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 QVMSSNHCSPSGSPHRVDVIGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQGLRGTRTMTGHYNTISRMDR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 HRVMDDHYSPDRDRDCEAADRQPYHRSRSTEQRPLLERTTTRSRSTERPDTNLMRSMPSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 HRVMDDHYSPDRDRDCEAADRQPYHRSRSTEQRPLLERTTTRSRSTERPDTNLMRSMPSL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 MTGRSAPPSPALSRSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQLPQLPPKGTLDRKAGGKKLRST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MTGRSAPPSPALSRSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQLPQLPPKGTLDRKAGGKKLRST
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 VQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNLIFPGVRLASDSQFSDFLDGLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 VQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNLIFPGVRLASDSQFSDFLDGLG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 PAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGLVVKPGSKTLPAPYVKVYLLDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGLVVKPGSKTLPAPYVKVYLLDN
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 GVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQIIVWGDYGRMDHKSFMGVAQILLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQIIVWGDYGRMDHKSFMGVAQILLD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180
pF1KA0 ELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLESSTGPSYSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLESSTGPSYSRS
1150 1160 1170 1180
>>CCDS55269.1 RIMS2 gene_id:9699|Hs108|chr8 (1349 aa)
initn: 6108 init1: 4044 opt: 4118 Z-score: 2782.5 bits: 527.0 E(32554): 1.1e-148
Smith-Waterman score: 7095; 93.1% identity (93.6% similar) in 1164 aa overlap (41-1188:233-1349)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 NSVLSHFHGVFSSPPNILQNELFGQTLNNARKRSPSVSRDQNRRYDQREEREEYSQYATS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KSRSHGLTRQHSIKNGSGVKHHIASDIASDRKRSPSVSRDQNRRYDQREEREEYSQYATS
210 220 230 240 250 260
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 DTAMPRSPSDYADRRSQHEPQFYEDSDHLSYRDSNRRSHRHSKEYIVDDEDVESRDEYER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DTAMPRSPSDYADRRSQHEPQFYEDSDHLSYRDSNRRSHRHSKEYIVDDEDVESRDEYER
270 280 290 300 310 320
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 QRREEEYQSRYRSDPNLARYPVKPQPYEEQMRIHAEVSRARHERRHSDVSLANADLEDSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QRREEEYQSRYRSDPNLARYPVKPQPYEEQMRIHAEVSRARHERRHSDVSLANADLEDSR
330 340 350 360 370 380
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 ISMLRMDRPSRQRSISERRAAMENQRSYSMERTREAQGPSSYAQRTTNHSPPTPRRSPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ISMLRMDRPSRQRSISERRAAMENQRSYSMERTREAQGPSSYAQRTTNHSPPTPRRSPLP
390 400 410 420 430 440
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 IDRPDLRRTDSLRKQHHLDPSSAVRKTKREKMETMLRNDSLSSDQSESVRPPPPKPHKSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IDRPDLRRTDSLRKQHHLDPSSAVRKTKREKMETMLRNDSLSSDQSESVRPPPPKPHKSK
450 460 470 480 490 500
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 KGGKMRQISLSSSEEELASTPEYTSCDDVEIESESVSEKGDSQKGKRKTSEQAVLSDSNT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KGGKMRQISLSSSEEELASTPEYTSCDDVEIESESVSEKGDM------------------
510 520 530 540
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 RSERQKEMMYFGGHSLEEDLEWSEPQIKDSGVDTCSSTTLNEEHSHSDKHPVTWQPSKDG
: .: . .. . : : . :::::::::::
CCDS55 ------------------DYNWLD-----------HTSWHSSEASPMSLHPVTWQPSKDG
550 560 570
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 DRLIGRILLNKRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCAFITKVKKGSLADTVGHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DRLIGRILLNKRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCAFITKVKKGSLADTVGHL
580 590 600 610 620 630
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 RPGDEVLEWNGRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIPRIPDSTHAQLESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RPGDEVLEWNGRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIPRIPDSTHAQLESS
640 650 660 670 680 690
560 570 580 590
pF1KA0 SSSFESQKMDRPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLS----------------IKLWFDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS55 SSSFESQKMDRPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSSQSLSRRTTPFVPRVQIKLWFDK
700 710 720 730 740 750
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 VGHQLIVTILGAKDLPSREDGRPRNPYVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VGHQLIVTILGAKDLPSREDGRPRNPYVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFI
760 770 780 790 800 810
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 YSPVHRREFRERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YSPVHRREFRERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSS
820 830 840 850 860 870
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 LPLPHPSPYMPRRQLHGESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSDYRHDGRDLQSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LPLPHPSPYMPRRQLHGESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSDYRHDGRDLQSS
880 890 900 910 920 930
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 TLSVPEQVMSSNHCSPSGSPHRVDVIGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQGLRGTRTMTGHYNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TLSVPEQVMSSNHCSPSGSPHRVDVIGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQGLRGTRTMTGHYNT
940 950 960 970 980 990
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 ISRMDRHRVMDDHYSPDRDRDCEAADRQPYHRSRSTEQRPLLERTTTRSRSTERPDTNLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ISRMDRHRVMDDHYSPDRDRDCEAADRQPYHRSRSTEQRPLLERTTTRSRSTERPDTNLM
1000 1010 1020 1030 1040 1050
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 RSMPSLMTGRSAPPSPALSRSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQLPQLPPKGTLDRKAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RSMPSLMTGRSAPPSPALSRSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQLPQLPPKGTLDRKAGG
1060 1070 1080 1090 1100 1110
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 KKLRSTVQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNLIFPGVRLASDSQFSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KKLRSTVQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNLIFPGVRLASDSQFSD
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 FLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGLVVKPGSKTLPAPYVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGLVVKPGSKTLPAPYVK
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 VYLLDNGVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQIIVWGDYGRMDHKSFMGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VYLLDNGVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQIIVWGDYGRMDHKSFMGV
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA0 AQILLDELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLESSTGPSYSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AQILLDELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLESSTGPSYSRS
1300 1310 1320 1330 1340
>>CCDS55029.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6 (817 aa)
initn: 3064 init1: 1766 opt: 3493 Z-score: 2364.8 bits: 449.0 E(32554): 2.1e-125
Smith-Waterman score: 3519; 68.7% identity (84.0% similar) in 788 aa overlap (411-1188:48-817)
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 FGGHSLEEDLEWSEPQIKDSGVDTCSSTTLNEEHSHSDKHPVTWQPSKDGDRLIGRILLN
..: : ..:::::::::.:::::::..::
CCDS55 SVDSEEGTIEARRAVAGDLDYYWLDPATWHSRETSPISSHPVTWQPSKEGDRLIGRVILN
20 30 40 50 60 70
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 KRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCAFITKVKKGSLADTVGHLRPGDEVLEWN
:: ..:.::::.:::::::::::. ::: :::::::::::::.::::: ::::::::
CCDS55 KRT---TMPKDSGALLGLKVVGGKMTDLGRLGAFITKVKKGSLADVVGHLRAGDEVLEWN
80 90 100 110 120 130
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 GRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIPRIPDSTHAQLESSSSSFESQKMD
:. : ::: ::::::::::: :::::..::::::::::::.:.: :::::::::::::.
CCDS55 GKPLPGATNEEVYNIILESKSEPQVEIIVSRPIGDIPRIPESSHPPLESSSSSFESQKME
140 150 160 170 180 190
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 RPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSIKLWFDKVGHQLIVTILGAKDLPSREDGRPRNP
:::::: :: ::: :.:.:: : ::::.:::.:::::::::..: : :::.: :::::::
CCDS55 RPSISVISPTSPGALKDAPQVLPGQLSVKLWYDKVGHQLIVNVLQATDLPARVDGRPRNP
200 210 220 230 240 250
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 YVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFIYSPVHRREFRERMLEITLWDQARVRE
:::.:::::::::.::::::::: :::::::::.:: ::::.:::::::::.::: ::.:
CCDS55 YVKMYFLPDRSDKSKRRTKTVKKILEPKWNQTFVYSHVHRRDFRERMLEITVWDQPRVQE
260 270 280 290 300 310
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 EESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSSLPLPHPSPYMPRRQLHGESPTRRLQR
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::.::::..:::: ...:::
CCDS55 EESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDESSLPLPQPSPFMPRRHIHGESSSKKLQR
320 330 340 350 360 370
750 760 770 780 790
pF1KA0 SKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSD--YRHDGRDLQSSTLSVPEQVMSSNHCSPSGSPHRVD
:.:::::..:::. ::::::: :: ..:. .:.::.:::: ...: : : :::: .
CCDS55 SQRISDSDISDYEVDDGIGVVPPVGYRSSARESKSTTLTVPEQQRTTHHRSRSVSPHRGN
380 390 400 410 420 430
800 810 820 830 840 850
pF1KA0 VIGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQGLRGTRTMTGHYN-TISRMD-RHRVMDDHYSPDRDRDC
:. :: :.:: .: . . : .:. : :.. . : .: : : .:..: ..: .
CCDS55 DQGKPRSRLPNVPLQRSLDEIHPTRRSRSPTRHHDASRSPVDHRTRDVDSQYLSEQDSEL
440 450 460 470 480 490
860 870 880 890 900 910
pF1KA0 EAADRQPYHRS-----RSTEQRPLLERTTTRSRSTERPDTNLMRSMPSLMTGRSAPPSPA
: :: ..: .:.:.:. . : . ::::.: ::
CCDS55 LMLPRAKRGRSAECLHTTSELQPFLDRARSASTNCLRPDTSLH--------------SPE
500 510 520 530 540
920 930 940 950 960 970
pF1KA0 LSRSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQLPQLPPK-GTLDRKAGGKKLRSTVQRSTETGLA
: : . . .:. :..: ..::::::::.: . :......: :::.::.:::::::.:
CCDS55 RERMHRQRSPTQSPPADTSFSSRRGRQLPQVPVRSGSIEQESGHKKLKSTIQRSTETGMA
550 560 570 580 590 600
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA0 VEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNLIFPGVRLASDSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTL
.:::. :.:: ::::::::.::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::
CCDS55 AEMRK-MVRQPSRESTDGSINSYSSEGNLIFPGVRLGADSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTL
610 620 630 640 650
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA0 ATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGLVVKPGSKTLPAPYVKVYLLDNGVCIAKKKTK
:::::::::.:: :::::::::.::::.:. :::::. ::::::::::.::.:::::::.
CCDS55 ATPAMGDIQIGMEDKKGQLEVEVIRARSLTQKPGSKSTPAPYVKVYLLENGACIAKKKTR
660 670 680 690 700 710
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KA0 VARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQIIVWGDYGRMDHKSFMGVAQILLDELELSNMVIG
.:::::.::::: : :.:::::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::.::::
CCDS55 IARKTLDPLYQQSLVFDESPQGKVLQVIVWGDYGRMDHKCFMGVAQILLEELDLSSMVIG
720 730 740 750 760 770
1160 1170 1180
pF1KA0 WFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLESSTGPSYSRS
:.:::::::::::::.::::::::::::::::: ::
CCDS55 WYKLFPPSSLVDPTLTPLTRRASQSSLESSTGPPCIRS
780 790 800 810
>>CCDS43761.1 RIMS2 gene_id:9699|Hs108|chr8 (1163 aa)
initn: 5299 init1: 2965 opt: 3069 Z-score: 2077.0 bits: 396.3 E(32554): 2.3e-109
Smith-Waterman score: 7353; 92.9% identity (93.4% similar) in 1210 aa overlap (1-1188:1-1163)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MQFETLRQVCNSVLSHFHGVFSSPPNILQNELFGQTLNNARKRSPSVSRDQNRRYDQREE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MQFETLRQVCNSVLSHFHGVFSSPPNILQNELFGQTLNNARKRSPSVSRDQNRRYDQREE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 REEYSQYATSDTAMPRSPSDYADRRSQHEPQFYEDSDHLSYRDSNRRSHRHSKEYIVDDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 REEYSQYATSDTAMPRSPSDYADRRSQHEPQFYEDSDHLSYRDSNRRSHRHSKEYIVDDE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 DVESRDEYERQRREEEYQSRYRSDPNLARYPVKPQPYEEQMRIHAEVSRARHERRHSDVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DVESRDEYERQRREEEYQSRYRSDPNLARYPVKPQPYEEQMRIHAEVSRARHERRHSDVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LANADLEDSRISMLRMDRPSRQRSISERRAAMENQRSYSMERTREAQGPSSYAQRTTNHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LANADLEDSRISMLRMDRPSRQRSISERRAAMENQRSYSMERTREAQGPSSYAQRTTNHS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 PPTPRRSPLPIDRPDLRRTDSLRKQHHLDPSSAVRKTKREKMETMLRNDSLSSDQSESVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PPTPRRSPLPIDRPDLRRTDSLRKQHHLDPSSAVRKTKREKMETMLRNDSLSSDQSESVR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 PPPPKPHKSKKGGKMRQISLSSSEEELASTPEYTSCDDVEIESESVSEKGDSQKGKRKTS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PPPPKPHKSKKGGKMRQISLSSSEEELASTPEYTSCDDVEIESESVSEKGDM--------
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EQAVLSDSNTRSERQKEMMYFGGHSLEEDLEWSEPQIKDSGVDTCSSTTLNEEHSHSDKH
: .: . .. . : : . :
CCDS43 ----------------------------DYNWLD-----------HTSWHSSEASPMSLH
360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 PVTWQPSKDGDRLIGRILLNKRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCAFITKVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PVTWQPSKDGDRLIGRILLNKRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCAFITKVKK
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 GSLADTVGHLRPGDEVLEWNGRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIPRIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GSLADTVGHLRPGDEVLEWNGRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIPRIP
440 450 460 470 480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 DSTHAQLESSSSSFESQKMDRPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSIKLWFDKVGHQLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DSTHAQLESSSSSFESQKMDRPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSIKLWFDKVGHQLI
500 510 520 530 540 550
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 VTILGAKDLPSREDGRPRNPYVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFIYSPVHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VTILGAKDLPSREDGRPRNPYVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFIYSPVHR
560 570 580 590 600 610
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 REFRERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSSLPLPHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 REFRERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSSLPLPHP
620 630 640 650 660 670
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 SPYMPRRQLHGESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSDYRHDGRDLQSSTLSVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SPYMPRRQLHGESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSDYRHDGRDLQSSTLSVPE
680 690 700 710 720 730
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 QVMSSNHCSPSGSPHRVDVIGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQGLRGTRTMTGHYNTISRMDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QVMSSNHCSPSGSPHRVDVIGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQGLRGTRTMTGHYNTISRMDR
740 750 760 770 780 790
850 860 870
pF1KA0 HRVMDDHYSPDRD----------------------RDCEAADRQPYHRSRSTEQRPLLER
::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HRVMDDHYSPDRDSHFLTLPRSRYSQTIDHHHRDGRDCEAADRQPYHRSRSTEQRPLLER
800 810 820 830 840 850
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 TTTRSRSTERPDTNLMRSMPSLMTGRSAPPSPALSRSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TTTRSRSTERPDTNLMRSMPSLMTGRSAPPSPALSRSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQ
860 870 880 890 900 910
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 LPQLPPKGTLDRKAGGKKLRSTVQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LPQLPPKGTLDRKAGGKKLRSTVQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGN
920 930 940 950 960 970
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 LIFPGVRLASDSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LIFPGVRLASDSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARG
980 990 1000 1010 1020 1030
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 LVVKPGSKTLPAPYVKVYLLDNGVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LVVKPGSKTLPAPYVKVYLLDNGVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQII
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 VWGDYGRMDHKSFMGVAQILLDELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VWGDYGRMDHKSFMGVAQILLDELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLE
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1180
pF1KA0 SSTGPSYSRS
::::::::::
CCDS43 SSTGPSYSRS
1160
>>CCDS55030.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6 (1012 aa)
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Smith-Waterman score: 2279; 51.3% identity (64.4% similar) in 811 aa overlap (411-1030:48-854)
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 FGGHSLEEDLEWSEPQIKDSGVDTCSSTTLNEEHSHSDKHPVTWQPSKDGDRLIGRILLN
..: : ..:::::::::.:::::::..::
CCDS55 SVDSEEGTIEARRAVAGDLDYYWLDPATWHSRETSPISSHPVTWQPSKEGDRLIGRVILN
20 30 40 50 60 70
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 KRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCAFITKVKKGSLADTVGHLRPGDEVLEWN
:: ..:.::::.:::::::::::. ::: :::::::::::::.::::: ::::::::
CCDS55 KRT---TMPKDSGALLGLKVVGGKMTDLGRLGAFITKVKKGSLADVVGHLRAGDEVLEWN
80 90 100 110 120 130
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 GRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIPRIPDSTHAQLESSSSSFESQKMD
:. : ::: ::::::::::: :::::..::::::::::::.:.: :::::::::::::.
CCDS55 GKPLPGATNEEVYNIILESKSEPQVEIIVSRPIGDIPRIPESSHPPLESSSSSFESQKME
140 150 160 170 180 190
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 RPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSIKLWFDKVGHQLIVTILGAKDLPSREDGRPRNP
:::::: :: ::: :.:.:: : ::::.:::.:::::::::..: : :::.: :::::::
CCDS55 RPSISVISPTSPGALKDAPQVLPGQLSVKLWYDKVGHQLIVNVLQATDLPARVDGRPRNP
200 210 220 230 240 250
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 YVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFIYSPVHRREFRERMLEITLWDQARVRE
:::.:::::::::.::::::::: :::::::::.:: ::::.:::::::::.::: ::.:
CCDS55 YVKMYFLPDRSDKSKRRTKTVKKILEPKWNQTFVYSHVHRRDFRERMLEITVWDQPRVQE
260 270 280 290 300 310
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 EESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSSLPLPHPSPYMPRRQLHGESPTRRLQR
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::.::::..:::: ...:::
CCDS55 EESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDESSLPLPQPSPFMPRRHIHGESSSKKLQR
320 330 340 350 360 370
750 760 770 780 790
pF1KA0 SKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSD-YRHDGRDLQSSTLSVPEQVMSSNHCSPSGSPHRVDV
:.:::::..:::. ::::::: :: ..:. .:.::.:::: ...: : : :::: .
CCDS55 SQRISDSDISDYEVDDGIGVVPPGYRSSARESKSTTLTVPEQQRTTHHRSRSVSPHRGND
380 390 400 410 420 430
800 810 820 830 840 850
pF1KA0 IGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQGLRGTRTMTGHYN-TISRMD-RHRVMDDHYSPDRDRDCE
:. :: :.:: .: . . : .:. : :.. . : .: : : .:..: ..: .
CCDS55 QGKPRSRLPNVPLQRSLDEIHPTRRSRSPTRHHDASRSPVDHRTRDVDSQYLSEQDSELL
440 450 460 470 480 490
860 870 880 890 900
pF1KA0 AADRQPYHRS-----RSTEQRPLLERTTTRSRSTERPDTNLM---RSMPSLMTGRSAPPS
: :: ..: .:.:.:. . : . ::::.: : : . ::. .
CCDS55 MLPRAKRGRSAECLHTTSELQPFLDRARSASTNCLRPDTSLHSPERERHSRKSERSSIQK
500 510 520 530 540 550
910 920 930 940
pF1KA0 PALS-------RSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQLPQLP-------------------
. . : : . . .:. :..: ..::::::::.:
CCDS55 QTRKGTASDAERMHRQRSPTQSPPADTSFSSRRGRQLPQVPVRSGSIEQASLVVEERTRQ
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 ------------------------------------------------------------
CCDS55 MKMKVHRFKQTTGSGSSQELDREQYSKYNIHKDQYRSCDNVSAKSSDSDVSDVSAISRTS
620 630 640 650 660 670
950
pF1KA0 -----------------PKG--------------------------------TLDRK---
:.: ::...
CCDS55 SASRLSSTSFMSEQSERPRGRISSFTPKMQGRRMGTSGRSIMKSTSVSGEMYTLEHNDGS
680 690 700 710 720 730
960
pF1KA0 ----------AGGKK--------------------------------LRSTVQRSTETGL
::::: :.::.:::::::.
CCDS55 QSDTAVGTVGAGGKKRRSSLSAKVVAIVSRRSRSTSQLSQTESGHKKLKSTIQRSTETGM
740 750 760 770 780 790
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 AVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNLIFPGVRLASDSQFSDFLDGLGPAQLVGRQT
:.:::. :.:: ::::::::.::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::
CCDS55 AAEMRK-MVRQPSRESTDGSINSYSSEGNLIFPGVRLGADSQFSDFLDGLGPAQLVGRQT
800 810 820 830 840 850
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 LATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGLVVKPGSKTLPAPYVKVYLLDNGVCIAKKKT
:
CCDS55 LATPAMGDIQIGMEDKKGQLEVEVIRARSLTQKPGSKSTPAPYVKVYLLENGACIAKKKT
860 870 880 890 900 910
>--
initn: 893 init1: 893 opt: 893 Z-score: 612.6 bits: 125.1 E(32554): 8.4e-28
Smith-Waterman score: 893; 83.5% identity (94.3% similar) in 158 aa overlap (1031-1188:855-1012)
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA0 FPGVRLASDSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGLV
:::::::::.:: :::::::::.::::.:.
CCDS55 FPGVRLGADSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQIGMEDKKGQLEVEVIRARSLT
830 840 850 860 870 880
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA0 VKPGSKTLPAPYVKVYLLDNGVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQIIVW
:::::. ::::::::::.::.:::::::..:::::.::::: : :.:::::::::.:::
CCDS55 QKPGSKSTPAPYVKVYLLENGACIAKKKTRIARKTLDPLYQQSLVFDESPQGKVLQVIVW
890 900 910 920 930 940
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA0 GDYGRMDHKSFMGVAQILLDELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLESS
::::::::: :::::::::.::.::.:::::.:::::::::::::.::::::::::::::
CCDS55 GDYGRMDHKCFMGVAQILLEELDLSSMVIGWYKLFPPSSLVDPTLTPLTRRASQSSLESS
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 TGPSYSRS
::: ::
CCDS55 TGPPCIRS
1010
>>CCDS47449.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6 (1692 aa)
initn: 4158 init1: 1766 opt: 2125 Z-score: 1439.0 bits: 278.8 E(32554): 7.8e-74
Smith-Waterman score: 2962; 54.9% identity (72.2% similar) in 909 aa overlap (22-918:236-1079)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MQFETLRQVCNSVLSHFHGVFSSPPNILQN-ELFGQTLNNARKRSPSVSRD
:.::. .. : :.:. .:.. : ::.
CCDS47 REKKARLQERSRSQTPLSTAAASSQDAAPPSAPPDRSKGAEPSQQALGPEQKQASSRSRS
210 220 230 240 250 260
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 QNRRYDQREEREEYSQYATSDTAMPRSPSDYADRRSQHEPQFYEDSDHLSYRDSNRRSHR
. : .:.. :. .. :. . .: :. .. :.: : .
CCDS47 EPPR--ERKKTPGLSEQ-NGKGALKSERKRVPKTSAQPVEGAVEERERKERRESRRLEKG
270 280 290 300 310 320
120 130 140 150 160
pF1KA0 HSKEYIVDDEDVESRDE-----YERQRREEEYQSRYRSDPNLARYPVKPQPYEEQMRIHA
.:..: . :.::: :.::.::.::.::::::::::::::: : :.:::.::
CCDS47 RSQDY---PDTPEKRDEGKAADEEKQRKEEDYQTRYRSDPNLARYPVKPPPEEQQMRMHA
330 340 350 360 370
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 EVSRARHERRHSDVSLANADLEDSRISMLRMDRPSRQRSISERRAAMENQRSYSMERTRE
.:::::::::::::.: .. . : . ... . : . .. :.:: ::: :
CCDS47 RVSRARHERRHSDVALPRTEAG----AALPEGKAGKRAPAAARASPPDSPRAYSAERTAE
380 390 400 410 420 430
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 AQGPSSYAQRTTNHSPPTPRRSPLPIDRPDLRRTDSLRKQHHLDPSSAV--RKTKREKME
...:. :.. ::::::.::..:.: . :.:. . :::: .::::::: ::.::::.:
CCDS47 TRAPG--AKQLTNHSPPAPRHGPVPAEAPELKAQEPLRKQSRLDPSSAVLMRKAKREKVE
440 450 460 470 480 490
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 TMLRNDSLSSDQSESVRPPPPKPHKSKKGGKMRQISLSSSEEELASTPEYTSCDDVEIES
:::::::::::::::::: :::::.::.::: ::.:.:::::: .::::::::.:::.::
CCDS47 TMLRNDSLSSDQSESVRPSPPKPHRSKRGGKKRQMSVSSSEEEGVSTPEYTSCEDVELES
500 510 520 530 540 550
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 ESVSEKGDSQKGKRKTSEQAVLSDSNTRSERQKEMMYFGGHSLEEDLEWSEPQIKDSGVD
:::::::: : : .:
CCDS47 ESVSEKGDL------------------------------------DYYWLDP--------
560
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 TCSSTTLNEEHSHSDKHPVTWQPSKDGDRLIGRILLNKRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGG
.: ..: : ..:::::::::.:::::::..:::: ..:.::::.::::::::
CCDS47 ---ATWHSRETSPISSHPVTWQPSKEGDRLIGRVILNKRT---TMPKDSGALLGLKVVGG
570 580 590 600 610 620
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 KMTESGRLCAFITKVKKGSLADTVGHLRPGDEVLEWNGRLLQGATFEEVYNIILESKPEP
:::. ::: :::::::::::::.::::: :::::::::. : ::: ::::::::::: ::
CCDS47 KMTDLGRLGAFITKVKKGSLADVVGHLRAGDEVLEWNGKPLPGATNEEVYNIILESKSEP
630 640 650 660 670 680
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 QVELVVSRPIGDIPRIPDSTHAQLESSSSSFESQKMDRPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLS
:::..::::::::::::.:.: :::::::::::::.:::::: :: ::: :.:.:: :
CCDS47 QVEIIVSRPIGDIPRIPESSHPPLESSSSSFESQKMERPSISVISPTSPGALKDAPQVLP
690 700 710 720 730 740
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 GQLSIKLWFDKVGHQLIVTILGAKDLPSREDGRPRNPYVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKK
::::.:::.:::::::::..: : :::.: ::::::::::.:::::::::.:::::::::
CCDS47 GQLSVKLWYDKVGHQLIVNVLQATDLPARVDGRPRNPYVKMYFLPDRSDKSKRRTKTVKK
750 760 770 780 790 800
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 TLEPKWNQTFIYSPVHRREFRERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIELETALLDDEPH
:::::::::.:: ::::.:::::::::.::: ::.::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ILEPKWNQTFVYSHVHRRDFRERMLEITVWDQPRVQEEESEFLGEILIELETALLDDEPH
810 820 830 840 850 860
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 WYKLQTHDVSSLPLPHPSPYMPRRQLHGESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSD
:::::::: ::::::.:::.::::..:::: ...::::.:::::..:::. :::::::
CCDS47 WYKLQTHDESSLPLPQPSPFMPRRHIHGESSSKKLQRSQRISDSDISDYEVDDGIGVVPP
870 880 890 900 910 920
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 --YRHDGRDLQSSTLSVPEQVMSSNHCSPSGSPHRVDVIGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQG
:: ..:. .:.::.:::: ...: : : :::: . :. :: :.:: .: . .
CCDS47 VGYRSSARESKSTTLTVPEQQRTTHHRSRSVSPHRGNDQGKPRSRLPNVPLQRSLDEIHP
930 940 950 960 970 980
830 840 850 860 870
pF1KA0 LRGTRTMTGHYN-TISRMD-RHRVMDDHYSPDRDRDCEAADRQPYHRSRSTEQRPLLERT
: .:. : :.. . : .: : : .:..: ..: . : .:.::.: :
CCDS47 TRRSRSPTRHHDASRSPVDHRTRDVDSQYLSEQDSELLMLPRA--KRGRSAECLHTT-RH
990 1000 1010 1020 1030 1040
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 TTRSRSTERPDTNLMRSMPSLMTGRSAPPSPALSRSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQL
.: .: : :..: : :. . ..: :
CCDS47 LVRHYKTLPPKMPLLQSSSHWNIYSSILPAHTKTKSVTRQDISLHHECFNSTVLRFTDEI
1050 1060 1070 1080 1090 1100
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 PQLPPKGTLDRKAGGKKLRSTVQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNL
CCDS47 LVSELQPFLDRARSASTNCLRPDTSLHSPERERGRWSPSLDRRRPPSPRIQIQHASPEND
1110 1120 1130 1140 1150 1160
>--
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690 700 710 720 730 740
pF1KA0 FLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSSLPLPHPSPYMPRRQLHGE-SPTRRLQRSKR
. . : :: :.. ..: : .. :.
CCDS47 LRPDTSLHSPERERGRWSPSLDRRRPPSPRIQIQHASPENDRHSRKSERSSIQKQTRKGT
1120 1130 1140 1150 1160 1170
750 760 770 780 790
pF1KA0 ISDSEVSDYDCDDGIG----VVSDY-----RHDGRDLQSSTLSVPEQVMSSNHCSPSGSP
::.: : . : ..: .: .:. .:: : . . : .: :.::
CCDS47 ASDAERVLPTCLSRRGHAAPRATDQPVIRGKHPARS-RSSEHSSIRTLCSMHHLVPGGSA
1180 1190 1200 1210 1220 1230
800 810 820
pF1KA0 HRVDVIGRT-RSWSPSVPPP------------------QSRNVEQGL----RGTRTM---
.. : :. ::. :: .: ..::. . :: :
CCDS47 PPSPLLTRMHRQRSPTQSPPADTSFSSRRGRQLPQVPVRSGSIEQASLVVEERTRQMKMK
1240 1250 1260 1270 1280 1290
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pF1KA0 ---------TGHYNTISR--MDRHRVMDDHY-SPD----RDRDCEAADRQPYHRSRSTEQ
.: . ..: .... . :.: : : .. : ...: . :. :. .
CCDS47 VHRFKQTTGSGSSQELDREQYSKYNIHKDQYRSCDNVSAKSSDSDVSDVSAISRTSSASR
1300 1310 1320 1330 1340 1350
880 890 900 910
pF1KA0 RPLLERTTTRSRSTERPDTNLMRSMPSLM------TGRSAPPSPALS------------R
: :. :...::: . :... .::: : ..: .
CCDS47 ---LSSTSFMSEQSERPRGRISSFTPKMQGRRMGTSGRSIMKSTSVSGEMYTLEHNDGSQ
1360 1370 1380 1390 1400 1410
920 930 940 950 960
pF1KA0 SHPRTGSV-------QTSPSSTPVA--GRRGRQLPQLPPKGTLDRKAGGKKLRSTVQRST
: .:.: ..: :. :: .::.:. :: . ..: :::.::.::::
CCDS47 SDTAVGTVGAGGKKRRSSLSAKVVAIVSRRSRSTSQLS-----QTESGHKKLKSTIQRST
1420 1430 1440 1450 1460 1470
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 ETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNLIFPGVRLASDSQFSDFLDGLGPAQLV
:::.:.:::. :.:: ::::::::.::::::::::::::::..:::::::::::::::::
CCDS47 ETGMAAEMRK-MVRQPSRESTDGSINSYSSEGNLIFPGVRLGADSQFSDFLDGLGPAQLV
1480 1490 1500 1510 1520
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 GRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGLVVKPGSKTLPAPYVKVYLLDNGVCIA
::::::::::::::.:: :::::::::.::::.:. :::::. ::::::::::.::.:::
CCDS47 GRQTLATPAMGDIQIGMEDKKGQLEVEVIRARSLTQKPGSKSTPAPYVKVYLLENGACIA
1530 1540 1550 1560 1570 1580
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 KKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQIIVWGDYGRMDHKSFMGVAQILLDELELS
::::..:::::.::::: : :.:::::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::
CCDS47 KKKTRIARKTLDPLYQQSLVFDESPQGKVLQVIVWGDYGRMDHKCFMGVAQILLEELDLS
1590 1600 1610 1620 1630 1640
1150 1160 1170 1180
pF1KA0 NMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLESSTGPSYSRS
.:::::.:::::::::::::.::::::::::::::::: ::
CCDS47 SMVIGWYKLFPPSSLVDPTLTPLTRRASQSSLESSTGPPCIRS
1650 1660 1670 1680 1690
>>CCDS55031.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6 (826 aa)
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390 400 410 420 430 440
pF1KA0 FGGHSLEEDLEWSEPQIKDSGVDTCSSTTLNEEHSHSDKHPVTWQPSKDGDRLIGRILLN
..: : ..:::::::::.:::::::..::
CCDS55 AGFLQFLLLHTLHSGTGDLDYYWLDPATWHSRETSPISSHPVTWQPSKEGDRLIGRVILN
10 20 30 40 50 60
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 KRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCAFITKVKKGSLADTVGHLRPGDEVLEWN
:: ..:.::::.:::::::::::. ::: :::::::::::::.::::: ::::::::
CCDS55 KRT---TMPKDSGALLGLKVVGGKMTDLGRLGAFITKVKKGSLADVVGHLRAGDEVLEWN
70 80 90 100 110
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 GRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIPRIPDSTHAQLESSSSSFESQKMD
:. : ::: ::::::::::: :::::..::::::::::::.:.: :::::::::::::.
CCDS55 GKPLPGATNEEVYNIILESKSEPQVEIIVSRPIGDIPRIPESSHPPLESSSSSFESQKME
120 130 140 150 160 170
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pF1KA0 RPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSIKLWFDKVGHQLIVTILGAKDLPSREDGRPRNP
:::::: :: ::: :.:.:: : ::::.:::.:::::::::..: : :::.: :::::::
CCDS55 RPSISVISPTSPGALKDAPQVLPGQLSVKLWYDKVGHQLIVNVLQATDLPARVDGRPRNP
180 190 200 210 220 230
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 YVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFIYSPVHRREFRERMLEITLWDQARVRE
:::.:::::::::.::::::::: :::::::::.:: ::::.:::::::::.::: ::.:
CCDS55 YVKMYFLPDRSDKSKRRTKTVKKILEPKWNQTFVYSHVHRRDFRERMLEITVWDQPRVQE
240 250 260 270 280 290
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pF1KA0 EESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSSLPLPHPSPYMPRRQLHGESPTRRLQR
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::.::::..:::: ...:::
CCDS55 EESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDESSLPLPQPSPFMPRRHIHGESSSKKLQR
300 310 320 330 340 350
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pF1KA0 SKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSD--YRHDGRDLQSSTLSVPEQVMSSNHCSPSGSPHRVD
:.:::::..:::. ::::::: :: ..:. .:.::.:::: ...: : : :::: .
CCDS55 SQRISDSDISDYEVDDGIGVVPPVGYRSSARESKSTTLTVPEQQRTTHHRSRSVSPHRGN
360 370 380 390 400 410
800 810 820 830 840 850
pF1KA0 VIGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQGLRGTRTMTGHYN-TISRMD-RHRVMDDHYSPDRDRDC
:. :: :.:: .: . . : .:. : :.. . : .: : : .:..: ..: .
CCDS55 DQGKPRSRLPNVPLQRSLDEIHPTRRSRSPTRHHDASRSPVDHRTRDVDSQYLSEQDSEL
420 430 440 450 460 470
860 870 880 890 900
pF1KA0 EAADRQPYHRS-----RSTEQRPLLERTTTRSRSTERPDTNLM---RSMPSLMTGRSAPP
: :: ..: .:.:.:. . : . ::::.: : : . ::.
CCDS55 LMLPRAKRGRSAECLHTTSELQPFLDRARSASTNCLRPDTSLHSPERERHSRKSERSSIQ
480 490 500 510 520 530
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pF1KA0 SPALS-------RSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQLPQLPPK-GTLDRKAGGKKLRST
. . . : : . . .:. :..: ..::::::::.: . :......: :::.::
CCDS55 KQTRKGTASDAERMHRQRSPTQSPPADTSFSSRRGRQLPQVPVRSGSIEQESGHKKLKST
540 550 560 570 580 590
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 VQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNLIFPGVRLASDSQFSDFLDGLG
.:::::::.:.:::. :.:: ::::::::.::::::::::::::::..::::::::::::
CCDS55 IQRSTETGMAAEMRK-MVRQPSRESTDGSINSYSSEGNLIFPGVRLGADSQFSDFLDGLG
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1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 PAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGLVVKPGSKTLPAPYVKVYLLDN
:::::::::::::::::::.:: :::::::::.::::.:. :::::. ::::::::::.:
CCDS55 PAQLVGRQTLATPAMGDIQIGMEDKKGQLEVEVIRARSLTQKPGSKSTPAPYVKVYLLEN
660 670 680 690 700 710
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 GVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQIIVWGDYGRMDHKSFMGVAQILLD
:.:::::::..:::::.::::: : :.:::::::::.:::::::::::: :::::::::.
CCDS55 GACIAKKKTRIARKTLDPLYQQSLVFDESPQGKVLQVIVWGDYGRMDHKCFMGVAQILLE
720 730 740 750 760 770
1150 1160 1170 1180
pF1KA0 ELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLESSTGPSYSRS
::.::.:::::.:::::::::::::.::::::::::::::::: ::
CCDS55 ELDLSSMVIGWYKLFPPSSLVDPTLTPLTRRASQSSLESSTGPPCIRS
780 790 800 810 820
>>CCDS55032.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6 (760 aa)
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pF1KA0 DKHPVTWQPSKDGDRLIGRILLNKRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCAFITK
.:.::::.:::::::::::. ::: :::::
CCDS55 MPKDSGALLGLKVVGGKMTDLGRLGAFITK
10 20 30
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 VKKGSLADTVGHLRPGDEVLEWNGRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIP
::::::::.::::: :::::::::. : ::: ::::::::::: :::::..:::::::::
CCDS55 VKKGSLADVVGHLRAGDEVLEWNGKPLPGATNEEVYNIILESKSEPQVEIIVSRPIGDIP
40 50 60 70 80 90
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pF1KA0 RIPDSTHAQLESSSSSFESQKMDRPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSIKLWFDKVGH
:::.:.: :::::::::::::.:::::: :: ::: :.:.:: : ::::.:::.:::::
CCDS55 RIPESSHPPLESSSSSFESQKMERPSISVISPTSPGALKDAPQVLPGQLSVKLWYDKVGH
100 110 120 130 140 150
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pF1KA0 QLIVTILGAKDLPSREDGRPRNPYVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFIYSP
::::..: : :::.: ::::::::::.:::::::::.::::::::: :::::::::.::
CCDS55 QLIVNVLQATDLPARVDGRPRNPYVKMYFLPDRSDKSKRRTKTVKKILEPKWNQTFVYSH
160 170 180 190 200 210
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pF1KA0 VHRREFRERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVSSLPL
::::.:::::::::.::: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS55 VHRRDFRERMLEITVWDQPRVQEEESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDESSLPL
220 230 240 250 260 270
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 PHPSPYMPRRQLHGESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSD--YRHDGRDLQSST
:.:::.::::..:::: ...::::.:::::..:::. ::::::: :: ..:. .:.:
CCDS55 PQPSPFMPRRHIHGESSSKKLQRSQRISDSDISDYEVDDGIGVVPPVGYRSSARESKSTT
280 290 300 310 320 330
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pF1KA0 LSVPEQVMSSNHCSPSGSPHRVDVIGRTRSWSPSVPPPQSRNVEQGLRGTRTMTGHYN-T
:.:::: ...: : : :::: . :. :: :.:: .: . . : .:. : :.. .
CCDS55 LTVPEQQRTTHHRSRSVSPHRGNDQGKPRSRLPNVPLQRSLDEIHPTRRSRSPTRHHDAS
340 350 360 370 380 390
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pF1KA0 ISRMD-RHRVMDDHYSPDRDRDCEAADRQPYHRS-----RSTEQRPLLERTTTRSRSTER
: .: : : .:..: ..: . : :: ..: .:.:.:. . : . :
CCDS55 RSPVDHRTRDVDSQYLSEQDSELLMLPRAKRGRSAECLHTTSELQPFLDRARSASTNCLR
400 410 420 430 440 450
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pF1KA0 PDTNLM---RSMPSLMTGRSAPPSPALS-------RSHPRTGSVQTSPSSTPVAGRRGRQ
:::.: : : . ::. . . . : : . . .:. :..: ..:::::
CCDS55 PDTSLHSPERERHSRKSERSSIQKQTRKGTASDAERMHRQRSPTQSPPADTSFSSRRGRQ
460 470 480 490 500 510
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pF1KA0 LPQLPPK-GTLDRKAGGKKLRSTVQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEG
:::.: . :......: :::.::.:::::::.:.:::. :.:: ::::::::.:::::::
CCDS55 LPQVPVRSGSIEQESGHKKLKSTIQRSTETGMAAEMRK-MVRQPSRESTDGSINSYSSEG
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pF1KA0 NLIFPGVRLASDSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRAR
:::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::::::::.::::
CCDS55 NLIFPGVRLGADSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQIGMEDKKGQLEVEVIRAR
570 580 590 600 610 620
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pF1KA0 GLVVKPGSKTLPAPYVKVYLLDNGVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQI
.:. :::::. ::::::::::.::.:::::::..:::::.::::: : :.:::::::::.
CCDS55 SLTQKPGSKSTPAPYVKVYLLENGACIAKKKTRIARKTLDPLYQQSLVFDESPQGKVLQV
630 640 650 660 670 680
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pF1KA0 IVWGDYGRMDHKSFMGVAQILLDELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSL
:::::::::::: :::::::::.::.::.:::::.:::::::::::::.:::::::::::
CCDS55 IVWGDYGRMDHKCFMGVAQILLEELDLSSMVIGWYKLFPPSSLVDPTLTPLTRRASQSSL
690 700 710 720 730 740
1180
pF1KA0 ESSTGPSYSRS
:::::: ::
CCDS55 ESSTGPPCIRS
750 760
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pF1KA0 TRSRSTERPDTNLMRSMPSLMTGRSAPPSPALSRSHPRTGSVQT-SPSSTPVAGRRGRQL
: .:: :. : .. : : .:: .
CCDS64 MGRQGLGGASAAGRSMQRSQSRSSLSASFEALAGY----F
10 20 30
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pF1KA0 PQLPPKGTLDRKAGGKKLRSTVQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNL
: . . .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PCMNSLEEEEGEAGGKKLRSTVQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNL
40 50 60 70 80 90
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 IFPGVRLASDSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 IFPGVRLASDSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGL
100 110 120 130 140 150
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pF1KA0 VVKPGSKTLPAPYVKVYLLDNGVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQIIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 VVKPGSKTLPAPYVKVYLLDNGVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQIIV
160 170 180 190 200 210
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 WGDYGRMDHKSFMGVAQILLDELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 WGDYGRMDHKSFMGVAQILLDELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLES
220 230 240 250 260 270
1180
pF1KA0 STGPSYSRS
:::::::::
CCDS64 STGPSYSRS
280
>>CCDS55033.1 RIMS1 gene_id:22999|Hs108|chr6 (219 aa)
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940 950 960 970 980 990
pF1KA0 LPQLPPKGTLDRKAGGKKLRSTVQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGN
.:.:::. :.:: ::::::::.::::::::
CCDS55 MAAEMRK-MVRQPSRESTDGSINSYSSEGN
10 20
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 LIFPGVRLASDSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARG
::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::::::::.::::.
CCDS55 LIFPGVRLGADSQFSDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQIGMEDKKGQLEVEVIRARS
30 40 50 60 70 80
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 LVVKPGSKTLPAPYVKVYLLDNGVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGKVLQII
:. :::::. ::::::::::.::.:::::::..:::::.::::: : :.:::::::::.:
CCDS55 LTQKPGSKSTPAPYVKVYLLENGACIAKKKTRIARKTLDPLYQQSLVFDESPQGKVLQVI
90 100 110 120 130 140
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 VWGDYGRMDHKSFMGVAQILLDELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLE
::::::::::: :::::::::.::.::.:::::.:::::::::::::.::::::::::::
CCDS55 VWGDYGRMDHKCFMGVAQILLEELDLSSMVIGWYKLFPPSSLVDPTLTPLTRRASQSSLE
150 160 170 180 190 200
1180
pF1KA0 SSTGPSYSRS
::::: ::
CCDS55 SSTGPPCIRS
210
1188 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 10:15:55 2016 done: Thu Nov 3 10:15:56 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]