Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0756
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0756, 1169 aa
1>>>pF1KA0756 1169 - 1169 aa - 1169 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2287+/-0.00129; mu= 13.5778+/- 0.076
mean_var=219.4181+/-45.778, 0's: 0 Z-trim(107.6): 205 B-trim: 4 in 1/50
Lambda= 0.086584
statistics sampled from 9464 (9698) to 9464 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.643), E-opt: 0.2 (0.298), width: 16
Scan time: 5.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30982.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1169) 7972 1010.7 0
CCDS53462.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1174) 7952 1008.2 0
CCDS5751.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1183) 4185 537.7 6.3e-152
CCDS74887.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1171) 2947 383.0 2.2e-105
CCDS53461.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 ( 619) 2554 333.6 9e-91
CCDS53460.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1240) 2549 333.3 2.2e-90
CCDS2556.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1224) 2453 321.3 8.7e-87
CCDS75652.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1211) 2278 299.5 3.3e-80
CCDS47686.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1304) 2278 299.5 3.4e-80
CCDS48192.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1248) 1988 263.3 2.7e-69
CCDS14734.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1253) 1988 263.3 2.7e-69
CCDS14733.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1257) 1988 263.3 2.7e-69
CCDS58812.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1208) 1863 247.6 1.3e-64
CCDS55153.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1192) 1423 192.7 4.6e-48
CCDS34590.1 SDK1 gene_id:221935|Hs108|chr7 (2213) 962 135.4 1.5e-30
CCDS43041.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3 (1026) 943 132.6 4.7e-30
CCDS45769.1 SDK2 gene_id:54549|Hs108|chr17 (2172) 856 122.1 1.4e-26
CCDS8738.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12 (1007) 833 118.9 6.4e-26
CCDS8737.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12 (1018) 833 118.9 6.4e-26
CCDS2557.1 CNTN6 gene_id:27255|Hs108|chr3 (1028) 825 117.9 1.3e-25
CCDS53697.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 (1026) 753 108.9 6.5e-23
CCDS53696.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 (1100) 753 108.9 6.8e-23
CCDS33790.1 CNTN3 gene_id:5067|Hs108|chr3 (1028) 737 106.9 2.6e-22
CCDS1449.1 CNTN2 gene_id:6900|Hs108|chr1 (1040) 713 103.9 2.1e-21
CCDS58168.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 ( 911) 667 98.1 1e-19
CCDS53957.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1408) 584 87.9 1.8e-16
CCDS58378.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1450) 584 88.0 1.8e-16
CCDS10247.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1461) 584 88.0 1.8e-16
CCDS2558.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3 ( 698) 574 86.3 2.8e-16
CCDS42040.1 PRTG gene_id:283659|Hs108|chr15 (1150) 568 85.8 6.4e-16
CCDS8384.1 DSCAML1 gene_id:57453|Hs108|chr11 (2113) 548 83.7 5.3e-15
CCDS30956.1 HMCN1 gene_id:83872|Hs108|chr1 (5635) 539 83.1 2.1e-14
CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1496) 496 77.0 3.8e-13
CCDS74265.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1505) 479 74.9 1.7e-12
CCDS42910.1 NCAM2 gene_id:4685|Hs108|chr21 ( 837) 461 72.3 5.5e-12
CCDS55289.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 451 71.4 1.9e-11
CCDS44254.1 IGSF9 gene_id:57549|Hs108|chr1 (1179) 449 71.0 1.9e-11
CCDS42929.1 DSCAM gene_id:1826|Hs108|chr21 (2012) 450 71.4 2.5e-11
CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1502) 444 70.5 3.5e-11
>>CCDS30982.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1169 aa)
initn: 7972 init1: 7972 opt: 7972 Z-score: 5397.6 bits: 1010.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7972; 100.0% identity (100.0% similar) in 1169 aa overlap (1-1169:1-1169)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MARQPPPPWVHAAFLLCLLSLGGAIEIPMDLTQPPTITKQSAKDHIVDPRDNILIECEAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MARQPPPPWVHAAFLLCLLSLGGAIEIPMDLTQPPTITKQSAKDHIVDPRDNILIECEAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GNPAPSFHWTRNSRFFNIAKDPRVSMRRRSGTLVIDFRSGGRPEEYEGEYQCFARNKFGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GNPAPSFHWTRNSRFFNIAKDPRVSMRRRSGTLVIDFRSGGRPEEYEGEYQCFARNKFGT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 ALSNRIRLQVSKSPLWPKENLDPVVVQEGAPLTLQCNPPPGLPSPVIFWMSSSMEPITQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ALSNRIRLQVSKSPLWPKENLDPVVVQEGAPLTLQCNPPPGLPSPVIFWMSSSMEPITQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 KRVSQGHNGDLYFSNVMLQDMQTDYSCNARFHFTHTIQQKNPFTLKVLTNHPYNDSSLRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KRVSQGHNGDLYFSNVMLQDMQTDYSCNARFHFTHTIQQKNPFTLKVLTNHPYNDSSLRN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 HPDMYSARGVAERTPSFMYPQGTASSQMVLRGMDLLLECIASGVPTPDIAWYKKGGDLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HPDMYSARGVAERTPSFMYPQGTASSQMVLRGMDLLLECIASGVPTPDIAWYKKGGDLPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 DKAKFENFNKALRITNVSEEDSGEYFCLASNKMGSIRHTISVRVKAAPYWLDEPKNLILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DKAKFENFNKALRITNVSEEDSGEYFCLASNKMGSIRHTISVRVKAAPYWLDEPKNLILA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 PGEDGRLVCRANGNPKPTVQWMVNGEPLQSAPPNPNREVAGDTIIFRDTQISSRAVYQCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PGEDGRLVCRANGNPKPTVQWMVNGEPLQSAPPNPNREVAGDTIIFRDTQISSRAVYQCN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 TSNEHGYLLANAFVSVLDVPPRMLSPRNQLIRVILYNRTRLDCPFFGSPIPTLRWFKNGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TSNEHGYLLANAFVSVLDVPPRMLSPRNQLIRVILYNRTRLDCPFFGSPIPTLRWFKNGQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 GSNLDGGNYHVYENGSLEIKMIRKEDQGIYTCVATNILGKAENQVRLEVKDPTRIYRMPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GSNLDGGNYHVYENGSLEIKMIRKEDQGIYTCVATNILGKAENQVRLEVKDPTRIYRMPE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 DQVARRGTTVQLECRVKHDPSLKLTVSWLKDDEPLYIGNRMKKEDDSLTIFGVAERDQGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DQVARRGTTVQLECRVKHDPSLKLTVSWLKDDEPLYIGNRMKKEDDSLTIFGVAERDQGS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 YTCVASTELDQDLAKAYLTVLGRPDRPRDLELTDLAERSVRLTWIPGDANNSPITDYVVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YTCVASTELDQDLAKAYLTVLGRPDRPRDLELTDLAERSVRLTWIPGDANNSPITDYVVQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 FEEDQFQPGVWHDHSKYPGSVNSAVLRLSPYVNYQFRVIAINEVGSSHPSLPSERYRTSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FEEDQFQPGVWHDHSKYPGSVNSAVLRLSPYVNYQFRVIAINEVGSSHPSLPSERYRTSG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 APPESNPGDVKGEGTRKNNMEITWTPMNATSAFGPNLRYIVKWRRRETREAWNNVTVWGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 APPESNPGDVKGEGTRKNNMEITWTPMNATSAFGPNLRYIVKWRRRETREAWNNVTVWGS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 RYVVGQTPVYVPYEIRVQAENDFGKGPEPESVIGYSGEDYPRAAPTEVKVRVMNSTAISL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RYVVGQTPVYVPYEIRVQAENDFGKGPEPESVIGYSGEDYPRAAPTEVKVRVMNSTAISL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 QWNRVYSDTVQGQLREYRAYYWRESSLLKNLWVSQKRQQASFPGDRLRGVVSRLFPYSNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QWNRVYSDTVQGQLREYRAYYWRESSLLKNLWVSQKRQQASFPGDRLRGVVSRLFPYSNY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 KLEMVVVNGRGDGPRSETKEFTTPEGVPSAPRRFRVRQPNLETINLEWDHPEHPNGIMIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KLEMVVVNGRGDGPRSETKEFTTPEGVPSAPRRFRVRQPNLETINLEWDHPEHPNGIMIG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 YTLKYVAFNGTKVGKQIVENFSPNQTKFTVQRTDPVSRYRFTLSARTQVGSGEAVTEESP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YTLKYVAFNGTKVGKQIVENFSPNQTKFTVQRTDPVSRYRFTLSARTQVGSGEAVTEESP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 APPNEAYTNNQADIATQGWFIGLMCAIALLVLILLIVCFIKRSRGGKYPVREKKDVPLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 APPNEAYTNNQADIATQGWFIGLMCAIALLVLILLIVCFIKRSRGGKYPVREKKDVPLGP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 EDPKEEDGSFDYSDEDNKPLQGSQTSLDGTIKQQESDDSLVDYGEGGEGQFNEDGSFIGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EDPKEEDGSFDYSDEDNKPLQGSQTSLDGTIKQQESDDSLVDYGEGGEGQFNEDGSFIGQ
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160
pF1KA0 YTVKKDKEETEGNESSEATSPVNAIYSLA
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YTVKKDKEETEGNESSEATSPVNAIYSLA
1150 1160
>>CCDS53462.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1174 aa)
initn: 7024 init1: 7024 opt: 7952 Z-score: 5384.1 bits: 1008.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7952; 99.6% identity (99.6% similar) in 1174 aa overlap (1-1169:1-1174)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MARQPPPPWVHAAFLLCLLSLGGAIEIPMDLTQPPTITKQSAKDHIVDPRDNILIECEAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MARQPPPPWVHAAFLLCLLSLGGAIEIPMDLTQPPTITKQSAKDHIVDPRDNILIECEAK
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70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GNPAPSFHWTRNSRFFNIAKDPRVSMRRRSGTLVIDFRSGGRPEEYEGEYQCFARNKFGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GNPAPSFHWTRNSRFFNIAKDPRVSMRRRSGTLVIDFRSGGRPEEYEGEYQCFARNKFGT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 ALSNRIRLQVSKSPLWPKENLDPVVVQEGAPLTLQCNPPPGLPSPVIFWMSSSMEPITQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ALSNRIRLQVSKSPLWPKENLDPVVVQEGAPLTLQCNPPPGLPSPVIFWMSSSMEPITQD
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190 200 210 220 230 240
pF1KA0 KRVSQGHNGDLYFSNVMLQDMQTDYSCNARFHFTHTIQQKNPFTLKVLTNHPYNDSSLRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KRVSQGHNGDLYFSNVMLQDMQTDYSCNARFHFTHTIQQKNPFTLKVLTNHPYNDSSLRN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 HPDMYSARGVAERTPSFMYPQGTASSQMVLRGMDLLLECIASGVPTPDIAWYKKGGDLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 HPDMYSARGVAERTPSFMYPQGTASSQMVLRGMDLLLECIASGVPTPDIAWYKKGGDLPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 DKAKFENFNKALRITNVSEEDSGEYFCLASNKMGSIRHTISVRVKAAPYWLDEPKNLILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DKAKFENFNKALRITNVSEEDSGEYFCLASNKMGSIRHTISVRVKAAPYWLDEPKNLILA
310 320 330 340 350 360
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pF1KA0 PGEDGRLVCRANGNPKPTVQWMVNGEPLQSAPPNPNREVAGDTIIFRDTQISSRAVYQCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PGEDGRLVCRANGNPKPTVQWMVNGEPLQSAPPNPNREVAGDTIIFRDTQISSRAVYQCN
370 380 390 400 410 420
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pF1KA0 TSNEHGYLLANAFVSVLDVPPRMLSPRNQLIRVILYNRTRLDCPFFGSPIPTLRWFKNGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TSNEHGYLLANAFVSVLDVPPRMLSPRNQLIRVILYNRTRLDCPFFGSPIPTLRWFKNGQ
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pF1KA0 GSNLDGGNYHVYENGSLEIKMIRKEDQGIYTCVATNILGKAENQVRLEVKDPTRIYRMPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GSNLDGGNYHVYENGSLEIKMIRKEDQGIYTCVATNILGKAENQVRLEVKDPTRIYRMPE
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pF1KA0 DQVARRGTTVQLECRVKHDPSLKLTVSWLKDDEPLYIGNRMKKEDDSLTIFGVAERDQGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DQVARRGTTVQLECRVKHDPSLKLTVSWLKDDEPLYIGNRMKKEDDSLTIFGVAERDQGS
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610 620 630 640 650 660
pF1KA0 YTCVASTELDQDLAKAYLTVLGRPDRPRDLELTDLAERSVRLTWIPGDANNSPITDYVVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YTCVASTELDQDLAKAYLTVLGRPDRPRDLELTDLAERSVRLTWIPGDANNSPITDYVVQ
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pF1KA0 FEEDQFQPGVWHDHSKYPGSVNSAVLRLSPYVNYQFRVIAINEVGSSHPSLPSERYRTSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FEEDQFQPGVWHDHSKYPGSVNSAVLRLSPYVNYQFRVIAINEVGSSHPSLPSERYRTSG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 APPESNPGDVKGEGTRKNNMEITWTPMNATSAFGPNLRYIVKWRRRETREAWNNVTVWGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 APPESNPGDVKGEGTRKNNMEITWTPMNATSAFGPNLRYIVKWRRRETREAWNNVTVWGS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 RYVVGQTPVYVPYEIRVQAENDFGKGPEPESVIGYSGEDYPRAAPTEVKVRVMNSTAISL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RYVVGQTPVYVPYEIRVQAENDFGKGPEPESVIGYSGEDYPRAAPTEVKVRVMNSTAISL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 QWNRVYSDTVQGQLREYRAYYWRESSLLKNLWVSQKRQQASFPGDRLRGVVSRLFPYSNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QWNRVYSDTVQGQLREYRAYYWRESSLLKNLWVSQKRQQASFPGDRLRGVVSRLFPYSNY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 KLEMVVVNGRGDGPRSETKEFTTPEGVPSAPRRFRVRQPNLETINLEWDHPEHPNGIMIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KLEMVVVNGRGDGPRSETKEFTTPEGVPSAPRRFRVRQPNLETINLEWDHPEHPNGIMIG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 YTLKYVAFNGTKVGKQIVENFSPNQTKFTVQRTDPVSRYRFTLSARTQVGSGEAVTEESP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YTLKYVAFNGTKVGKQIVENFSPNQTKFTVQRTDPVSRYRFTLSARTQVGSGEAVTEESP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 APPNEA-----YTNNQADIATQGWFIGLMCAIALLVLILLIVCFIKRSRGGKYPVREKKD
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 APPNEATPTAAYTNNQADIATQGWFIGLMCAIALLVLILLIVCFIKRSRGGKYPVREKKD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 VPLGPEDPKEEDGSFDYSDEDNKPLQGSQTSLDGTIKQQESDDSLVDYGEGGEGQFNEDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VPLGPEDPKEEDGSFDYSDEDNKPLQGSQTSLDGTIKQQESDDSLVDYGEGGEGQFNEDG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160
pF1KA0 SFIGQYTVKKDKEETEGNESSEATSPVNAIYSLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SFIGQYTVKKDKEETEGNESSEATSPVNAIYSLA
1150 1160 1170
>>CCDS5751.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1183 aa)
initn: 3200 init1: 1964 opt: 4185 Z-score: 2841.0 bits: 537.7 E(32554): 6.3e-152
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10 20 30 40 50
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CCDS57 MQLKIMPKKKRLSAGRVPLILFLCQMISALEVPLDLVQPPTITQQSPKDYIIDPRENIVI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 ECEAKGNPAPSFHWTRNSRFFNIAKDPRVSMRRRSGTLVIDFRSGGRPEEYEGEYQCFAR
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CCDS57 QCEAKGKPPPSFSWTRNGTHFDIDKDPLVTMKPGTGTLIINIMSEGKAETYEGVYQCTAR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 NKFGTALSNRIRLQVSKSPLWPKENLDPVVVQEGAPLTLQCNPPPGLPSPVIFWMSSSME
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CCDS57 NERGAAVSNNIVVRPSRSPLWTKEKLEPITLQSGQSLVLPCRPPIGLPPPIIFWMDNSFQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
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CCDS57 RLPQSERVSQGLNGDLYFSNVLPEDTREDYICYARFNHTQTIQQKQPISVKVISVDELND
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 SSLRNHPD--MYSARGVAERTPSFMYPQGTASSQMVLRGMDLLLECIASGVPTPDIAWYK
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CCDS57 TIAANLSDTEFYGAKSSRERPPTFLTPEGNASNKEELRGNVLSLECIAEGLPTPIIYWAK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 KGGDLPSDKAKFENFNKALRITNVSEEDSGEYFCLASNKMGSIRHTISVRVKAAPYWLDE
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CCDS57 EDGMLPKNRTVYKNFEKTLQIIHVSEADSGNYQCIAKNALGAIHHTISVRVKAAPYWITA
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360 370 380 390 400 410
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CCDS57 PQNLVLSPGEDGTLICRANGNPKPRISWLTNGVPIEIAPDDPSRKIDGDTIIFSNVQERS
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::::::.:::.:::::::::.:: :::.:.: : : .:: . ::: :::::.::.
CCDS57 SAVYQCNASNEYGYLLANAFVNVLAEPPRILTPANTLYQVIANRPALLDCAFFGSPLPTI
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CCDS57 EWFKGAKGSALHEDIYVLHENGTLEIPVAQKDSTGTYTCVARNKLGMAKNEVHLEIKDPT
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pF1KA0 RIYRMPEDQVARRGTTVQLECRVKHDPSLKLTVSWLKDDEPLYIGNRMKKEDDSLTIFGV
: ..:: :..::. :..::.:::: .:.::: ::::.. : .:. . : :.. :
CCDS57 WIVKQPEYAVVQRGSMVSFECKVKHDHTLSLTVLWLKDNRELPSDERFTVDKDHLVVADV
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pF1KA0 AERDQGSYTCVASTELDQDLAKAYLTVLGRPDRPRDLELTDLAERSVRLTWIPGDANNSP
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CCDS57 SDDDSGTYTCVANTTLDSVSASAVLSVVDVPNPPFDLELTDQLDKSVQLSWTPGDDNNSP
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pF1KA0 ITDYVVQFEEDQFQPGVWHDHSKYPGSVNSAVLRLSPYVNYQFRVIAINEVGSSHPSLPS
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CCDS57 ITKFIIEYEDAMHKPGLWHHQTEVSGTQTTAQLKLSPYVNYSFRVMAVNSIGKSLPSEAS
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pF1KA0 ERYRTSGAPPESNPGDVKGEGTRKNNMEITWTPMNATSAFGPNLRYIVKWRRRETREAWN
:.: :... :..:: :.: :.. .:. ::: :.:. . ::.:.: :.::... . :.
CCDS57 EQYLTKASEPDKNPTAVEGLGSEPDNLVITWKPLNGFESNGPGLQYKVSWRQKDGDDEWT
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 NVTVWG-SRYVVGQTPVYVPYEIRVQAENDFGKGPEPESVIGYSGEDYPRAAPTEVKVRV
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CCDS57 SVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDMGFAPEPAVVMGHSGEDLPMVAPGNVRVNV
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pF1KA0 MNSTAISLQWNRVYSDTVQGQLREYRAYYWRESSLLKNLWVSQKRQQASFPGDRLRGVVS
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CCDS57 VNSTLAEVHWDPVPLKSIRGHLQGYRIYYWKTQSSSKRNRRHIEKKILTFQGSKTHGMLP
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 RLFPYSNYKLEMVVVNGRGDGPRSETKEFTTPEGVPSAPRRFRVRQPNLETINLEWDHPE
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CCDS57 GLEPFSHYTLNVRVVNGKGEGPASPDRVFNTPEGVPSAPSSLKIVNPTLDSLTLEWDPPS
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960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 HPNGIMIGYTLKYVAFNGT-KVGKQIVENFSPNQTKFTVQRTDPVSRYRFTLSARTQVGS
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CCDS57 HPNGILTEYTLKYQPINSTHELGPLVDLKIPANKTRWTLKNLNFSTRYKFYFYAQTSAGS
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 GEAVTEESPAPPNEAYTNNQADIATQGWFIGLMCAIALLVLILLIVCFIKRSRGGKYPVR
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CCDS57 GSQITEEAVTTVDEAMASRQVDIATQGWFIGLMCAVALLILILLIVCFIRRNKGGKYPVK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA0 EKKDVPLGPE-DP-KEEDGSF-DYSD-EDNKPLQ-GSQTSLDGTIKQQESDDSLVDYGEG
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CCDS57 EKEDAHADPEIQPMKEDDGTFGEYSDAEDHKPLKKGSRTPSDRTVKKEDSDDSLVDYGEG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1130 1140 1150 1160
pF1KA0 GEGQFNEDGSFIGQYTVKKDKEETEGNESSEATSPVNAIYSLA
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CCDS57 VNGQFNEDGSFIGQYSGKKEKEPAEGNESSEAPSPVNAMNSFV
1150 1160 1170 1180
>>CCDS74887.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1171 aa)
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10 20 30 40 50
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... ::... ::::: .. : ::: ::: : ... : :. . :::::
CCDS74 MEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQS-KVQVAFPFDEYFQIECEA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 KGNPAPSFHWTRNSRFFNIAKDPRVSMRRRSGTLVIDFRSGGRPEEYEGEYQCFARNKFG
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CCDS74 KGNPEPTFSWTKDGNPFYFT-DHRIIPSNNSGTFRIP--NEGHISHFQGKYRCFASNKLG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 TALSNRIRLQVSKSPLWPKENLDPVVVQEGAPLTLQCNPPPGLPSPVIFWMSSSMEPITQ
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CCDS74 IAMSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 DKRVSQGHNGDLYFSNVMLQDMQTDYSCNARFHFTHTIQQKNPFTLKVLTNHPYNDSSLR
:.:: ....:::::.:: .: ..:: : : : .:: :: :. : : . . ::::
CCDS74 DERVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSLKHANDSS--
180 190 200 210 220 230
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pF1KA0 NHPDMYS-ARGVAERTPSFMYP---QGTASSQMVLRGMDLLLECIASGVPTPDIAWYKKG
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CCDS74 SSTEIGSKANSIKQRKPKLLLPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 GDLPSDKAKFENFNKALRITNVSEEDSGEYFCLASNKMGSIRHTISVRVKAAPYWLDEPK
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CCDS74 GDLPKGRETKENYGKTLKIENVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQ
300 310 320 330 340 350
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pF1KA0 NLILAPGEDGRLVCRANGNPKPTVQWMVNGEPLQSAPPNPNREVAGDTII-----FRDTQ
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CCDS74 SAVYSTGSNGILLCEAEGEPQPTIKWRVNGSPVDNHP------FAGDVVFPREISFTNLQ
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CCDS74 PNHTAVYQCEASNVHGTILANANIDVVDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPE
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pF1KA0 PTLRWFKNGQGSNLDGGNYHVYENGSLEIKMIRKEDQGIYTCVATNILGKAENQVRLEVK
.. : : . . :.: ::.::::.:.:. .:: : :.: . : .::. . :...
CCDS74 AVVSWQKVEEVKPLEGRRYHIYENGTLQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIR
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. :.. :.. . ..:.:. : : :: : .:: :: : . :.. :. .
CCDS74 NATKLRVSPKNPRIPKLHMLELHCESKCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIID
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.::: .:. .::: : : : : ::. . .::: :: :..:.:.. .:::::::
CCDS74 GANLTISNVTLEDQGIYCCSAHTALDSAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTW
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pF1KA0 IPGDANNSPITDYVVQFEEDQFQPGVWHDHSKYPGSVNSAVLRLSPYVNYQFRVIAINEV
: .:: :..:.:.:: .. .:: :.. .. :. ....: :.:.: :::::::.:::
CCDS74 EAGADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGRWEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEV
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pF1KA0 GSSHPSLPSERYRTSGAPPESNPGDVKGEGTRKNNMEITWTPMNATSAFGPNLRYIVKWR
: :.:: ::....: : :. :: ... .... ..: : : :... ::.:.: : :.
CCDS74 GRSQPSQPSDHHETPPAAPDRNPQNIRVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWK
710 720 730 740 750 760
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pF1KA0 RRETREAWNNVTVWGSRYVVGQTPVYVPYEIRVQAENDFGKGPEPESVIGYSGEDYPRAA
. . :.. :: . : ::.::...::: :..:.::.:.:: ::::::: .:
CCDS74 PQGAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVYAPYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTA
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pF1KA0 PTEVKVRVMNSTAISLQWNRVYSDTVQGQLREYRAYYWRESSLLKNLWVSQKRQQASFPG
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CCDS74 PVIHGVDVINSTLVKVTWSTVPKDRVHGRLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSG
830 840 850 860 870 880
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pF1KA0 DRLRGVVSRLFPYSNYKLEMVVVNGRGDGPRSETKEFTTPEGVPSAPRRFRVRQPNLETI
.: :.: : .:...: ... :..: ::.:: : :::::: : ..: . . .:
CCDS74 QRNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSKGAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTA
890 900 910 920 930 940
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pF1KA0 NLEWDHPEHPNGIMIGYTLKYVAFNGT-KVGK-QIVENFSPNQTKFTVQRTDPVSRYRFT
.: : :.. :: . :: :.: .: : ..:. . .. .:.. .. .. . ...:.:
CCDS74 TLSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIINDTYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFY
950 960 970 980 990 1000
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA0 LSARTQVGSGEAVTEESPAPPNEAYTNNQADIATQGWFIGLMCAIALLVLILLIVCFIKR
: : :. : :. .:::: . . :.. ::.:::::::::::::::.:.:: :::.::
CCDS74 LRACTSQGCGKPITEESSTLGEGKYAGLYDDISTQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKR
1010 1020 1030 1040 1050 1060
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pF1KA0 SRGGKYPVREKKDVPLGPEDPKEEDGSF-DYSDEDNKPLQGSQTSLDGTIKQQESDDSLV
.::::: :.::.:. :: . .: .: .::: :.:::.:: ::. .. :: ::::
CCDS74 NRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETFGEYSDSDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLV
1070 1080 1090 1100 1110 1120
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pF1KA0 DYGEGGEGQFNEDGSFIGQYTVKKDKEETEGNESSEATSPVNAIYSLA
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CCDS74 EYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGSVESNGSSTATFPLRA
1130 1140 1150 1160 1170
>>CCDS53461.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (619 aa)
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10 20 30 40 50
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:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MARQPPPPWVHAAFLLCLLSLGGAIEIPMDPSIQNELTQPPTITKQSAKDHIVDPRDNIL
10 20 30 40 50 60
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pF1KA0 IECEAKGNPAPSFHWTRNSRFFNIAKDPRVSMRRRSGTLVIDFRSGGRPEEYEGEYQCFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IECEAKGNPAPSFHWTRNSRFFNIAKDPRVSMRRRSGTLVIDFRSGGRPEEYEGEYQCFA
70 80 90 100 110 120
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pF1KA0 RNKFGTALSNRIRLQVSKSPLWPKENLDPVVVQEGAPLTLQCNPPPGLPSPVIFWMSSSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RNKFGTALSNRIRLQVSKSPLWPKENLDPVVVQEGAPLTLQCNPPPGLPSPVIFWMSSSM
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 EPITQDKRVSQGHNGDLYFSNVMLQDMQTDYSCNARFHFTHTIQQKNPFTLKVLTNHPYN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS53 EPITQDKRVSQGHNGDLYFSNVMLQDMQTDYSCNARFHFTHTIQQKNPFTLKVLTT----
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 DSSLRNHPDMYSARGVAERTPSFMYPQGTASSQMVLRGMDLLLECIASGVPTPDIAWYKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 -------------RGVAERTPSFMYPQGTASSQMVLRGMDLLLECIASGVPTPDIAWYKK
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 GGDLPSDKAKFENFNKALRITNVSEEDSGEYFCLASNKMGSIRHTISVRVKAAPYWLDEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GGDLPSDKAKFENFNKALRITNVSEEDSGEYFCLASNKMGSIRHTISVRVKAAPYWLDEP
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 KNLILAPGEDGRLVCRANGNPKPTVQWMVNGEPLQSAPPNPNREVAGDTIIFRDTQISSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KNLILAPGEDGRLVCRANGNPKPTVQWMVNGEPLQSAPPNPNREVAGDTIIFRDTQISSR
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 AVYQCNTSNEHGYLLANAFVSVLDVPPRMLSPRNQLIRVILYNRTRLDCPFFGSPIPTLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AVYQCNTSNEHGYLLANAFVSVLDVPPRMLSPRNQLIRVILYNRTRLDCPFFGSPIPTLR
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 WFKNGQGSNLDGGNYHVYENGSLEIKMIRKEDQGIYTCVATNILGKAENQVRLEVKDPTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 WFKNGQGSNLDGGNYHVYENGSLEIKMIRKEDQGIYTCVATNILGKAENQVRLEVKDPTR
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 IYRMPEDQVARRGTTVQLECRVKHDPSLKLTVSWLKDDEPLYIGNRMKKEDDSLTIFGVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IYRMPEDQVARRGTTVQLECRVKHDPSLKLTVSWLKDDEPLYIGNRMKKEDDSLTIFGVA
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pF1KA0 ERDQGSYTCVASTELDQDLAKAYLTVLGR-PDRPRDLELTDLAERSVRLTWIPGDANNSP
:::::::::::::::::::::::::::: : :
CCDS53 ERDQGSYTCVASTELDQDLAKAYLTVLGNCPCSPWH
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pF1KA0 ITDYVVQFEEDQFQPGVWHDHSKYPGSVNSAVLRLSPYVNYQFRVIAINEVGSSHPSLPS
>>CCDS53460.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1240 aa)
initn: 5052 init1: 2534 opt: 2549 Z-score: 1736.3 bits: 333.3 E(32554): 2.2e-90
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10 20 30 40 50
pF1KA0 MARQPPPPWVHAAFLLCLLSLGGAIEIPMD------LTQPPTITKQSAKDHIVDPRDNIL
:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MARQPPPPWVHAAFLLCLLSLGGAIEIPMDPSIQNELTQPPTITKQSAKDHIVDPRDNIL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 IECEAKGNPAPSFHWTRNSRFFNIAKDPRVSMRRRSGTLVIDFRSGGRPEEYEGEYQCFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IECEAKGNPAPSFHWTRNSRFFNIAKDPRVSMRRRSGTLVIDFRSGGRPEEYEGEYQCFA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 RNKFGTALSNRIRLQVSKSPLWPKENLDPVVVQEGAPLTLQCNPPPGLPSPVIFWMSSSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RNKFGTALSNRIRLQVSKSPLWPKENLDPVVVQEGAPLTLQCNPPPGLPSPVIFWMSSSM
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 EPITQDKRVSQGHNGDLYFSNVMLQDMQTDYSCNARFHFTHTIQQKNPFTLKVLTNHPYN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS53 EPITQDKRVSQGHNGDLYFSNVMLQDMQTDYSCNARFHFTHTIQQKNPFTLKVLTT----
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 DSSLRNHPDMYSARGVAERTPSFMYPQGTASSQMVLRGMDLLLECIASGVPTPDIAWYKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 -------------RGVAERTPSFMYPQGTASSQMVLRGMDLLLECIASGVPTPDIAWYKK
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GGDLPSDKAKFENFNKALRITNVSEEDSGEYFCLASNKMGSIRHTISVRVKAAPYWLDEP
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 KNLILAPGEDGRLVCRANGNPKPTVQWMVNGEPLQSAPPNPNREVAGDTIIFRDTQISSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KNLILAPGEDGRLVCRANGNPKPTVQWMVNGEPLQSAPPNPNREVAGDTIIFRDTQISSR
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420 430 440 450 460 470
pF1KA0 AVYQCNTSNEHGYLLANAFVSVLDVPPRMLSPRNQLIRVILYNRTRLDCPFFGSPIPTLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AVYQCNTSNEHGYLLANAFVSVLDVPPRMLSPRNQLIRVILYNRTRLDCPFFGSPIPTLR
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 WFKNGQGSNLDGGNYHVYENGSLEIKMIRKEDQGIYTCVATNILGKAENQVRLEVKDPTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 WFKNGQGSNLDGGNYHVYENGSLEIKMIRKEDQGIYTCVATNILGKAENQVRLEVKDPTR
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540 550 560 570 580 590
pF1KA0 IYRMPEDQVARRGTTVQLECRVKHDPSLKLTVSWLKDDEPLYIGNRMKKEDDSLTIFGVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IYRMPEDQVARRGTTVQLECRVKHDPSLKLTVSWLKDDEPLYIGNRMKKEDDSLTIFGVA
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630
pF1KA0 ERDQGSYTCVASTELDQDLAKAYLTVL---------------GRPDRPRDLELTDLAERS
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS53 ERDQGSYTCVASTELDQDLAKAYLTVLADQATPTNRLAALPKGRPDRPRDLELTDLAERS
590 600 610 620 630 640
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pF1KA0 VRLTWIPGDANNSPITDYVVQFEEDQFQPGVWHDHSKYPGSVNSAVLRLSPYVNYQFRVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VRLTWIPGDANNSPITDYVVQFEEDQFQPGVWHDHSKYPGSVNSAVLRLSPYVNYQFRVI
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700 710 720 730 740 750
pF1KA0 AINEVGSSHPSLPSERYRTSGAPPESNPGDVKGEGTRKNNMEITWTPMNATSAFGPNLRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AINEVGSSHPSLPSERYRTSGAPPESNPGDVKGEGTRKNNMEITWTPMNATSAFGPNLRY
710 720 730 740 750 760
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 IVKWRRRETREAWNNVTVWGSRYVVGQTPVYVPYEIRVQAENDFGKGPEPESVIGYSGED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IVKWRRRETREAWNNVTVWGSRYVVGQTPVYVPYEIRVQAENDFGKGPEPESVIGYSGED
770 780 790 800 810 820
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 YPRAAPTEVKVRVMNSTAISLQWNRVYSDTVQGQLREYRAYYWRESSLLKNLWVSQKRQQ
CCDS53 ------------------------------------------------------------
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 ASFPGDRLRGVVSRLFPYSNYKLEMVVVNGRGDGPRSETKEFTTPEGVPSAPRRFRVRQP
.::::::::::::
CCDS53 -----------------------------------------------LPSAPRRFRVRQP
830
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 NLETINLEWDHPEHPNGIMIGYTLKYVAFNGTKVGKQIVENFSPNQTKFTVQRTDPVSRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NLETINLEWDHPEHPNGIMIGYTLKYVAFNGTKVGKQIVENFSPNQTKFTVQRTDPVSRY
840 850 860 870 880 890
1000 1010 1020
pF1KA0 RFTLSARTQVGSGEAVTEESPAPPNEA---------------------------------
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RFTLSARTQVGSGEAVTEESPAPPNEATPTAAPPTLPPTTVGATGAVSSTDATAIAATTE
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 ------------------------------------------------------------
CCDS53 ATTVPIIPTVAPTTIATTTTVATTTTTTAAATTTTESPPTTTSGTKIHESAPDEQSIWNV
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 ------------------------------------------------------------
CCDS53 TVLPNSKWANITWKHNFGPGTDFVVEYIDSNHTKKTVPVKAQAQPIQLTDLYPGMTYTLR
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1030 1040 1050 1060
pF1KA0 ---------------------YTNNQADIATQGWFIGLMCAIALLVLILLIVCFIKRSRG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VYSRDNEGISSTVITFMTSTAYTNNQADIATQGWFIGLMCAIALLVLILLIVCFIKRSRG
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA0 GKYPVREKKDVPLGPEDPKEEDGSFDYSDEDNKPLQGSQTSLDGTIKQQESDDSLVDYGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GKYPVREKKDVPLGPEDPKEEDGSFDYSDEDNKPLQGSQTSLDGTIKQQESDDSLVDYGE
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1130 1140 1150 1160
pF1KA0 GGEGQFNEDGSFIGQYTVKKDKEETEGNESSEATSPVNAIYSLA
CCDS53 GGEGQFNEDGSFIGQYTVKKDKEETEGNESSEATSPVNAIYSLA
1200 1210 1220 1230 1240
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10 20 30 40 50
pF1KA0 MARQPPPPWVHAAFLLCLLSLGGAIEIPMDLTQPPTITKQSAKDHIVDPRDNIL-IECEA
... ::... ::::: .. : ::: ::: : ... : :. . :::::
CCDS25 MEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQS-KVQVAFPFDEYFQIECEA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 KGNPAPSFHWTRNSRFFNIAKDPRVSMRRRSGTLVIDFRSGGRPEEYEGEYQCFARNKFG
:::: :.: ::... : .. : :. :::. : . :. ...:.:.::: ::.:
CCDS25 KGNPEPTFSWTKDGNPFYFT-DHRIIPSNNSGTFRIP--NEGHISHFQGKYRCFASNKLG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 TALSNRIRLQVSKSPLWPKENLDPVVVQEGAPLTLQCNPPPGLPSPVIFWMSSSMEPITQ
:.:..:.. : . : .:::..::. :.:: :..: :::: ::: :.::. .: : :
CCDS25 IAMSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQ
120 130 140 150 160 170
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pF1KA0 DKRVSQGHNGDLYFSNVMLQDMQTDYSCNARFHFTHTIQQKNPFTLKVLTNHPYNDSSLR
:.:: ....:::::.:: .: ..:: : : : .:: :: :. : : . . ::::
CCDS25 DERVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSLKHANDSS--
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 NHPDMYS-ARGVAERTPSFMYP---QGTASSQMVLRGMDLLLECIASGVPTPDIAWYKKG
. .. : : .. .: :... : .:. :: .:.: :::::.: :.:::.. : : :
CCDS25 SSTEIGSKANSIKQRKPKLLLPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIG
240 250 260 270 280 290
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pF1KA0 GDLPSDKAKFENFNKALRITNVSEEDSGEYFCLASNKMGSIRHTISVRVKAAPYWLDEPK
::::. . ::..:.:.: ::: .:.:.: : ::: .:. : . : :. : : .:.
CCDS25 GDLPKGRETKENYGKTLKIENVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQ
300 310 320 330 340 350
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pF1KA0 NLILAPGEDGRLVCRANGNPKPTVQWMVNGEPLQSAPPNPNREVAGDTII-----FRDTQ
. . . : .: :.:.:.:.:.::..: ::: :... : :::... : . :
CCDS25 SAVYSTGSNGILLCEAEGEPQPTIKWRVNGSPVDNHP------FAGDVVFPREISFTNLQ
360 370 380 390 400
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pF1KA0 ISSRAVYQCNTSNEHGYLLANAFVSVLDVPPRMLSPRNQLIRVILYNRTRLDCPFFGSPI
. :::::..:: :: .:::: ..:.:: : . . .. ... . : : ::.::
CCDS25 PNHTAVYQCEASNVHGTILANANIDVVDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPE
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 PTLRWFKNGQGSNLDGGNYHVYENGSLEIKMIRKEDQGIYTCVATNILGKAENQVRLEVK
.. : : . . :.: ::.::::.:.:. .:: : :.: . : .::. . :...
CCDS25 AVVSWQKVEEVKPLEGRRYHIYENGTLQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIR
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
pF1KA0 DPTRIYRMPEDQVARRGTTVQLECRVKHDPSLK--LTVSWLKDDEPLYIGN----RMKKE
. :.. :.. . ..:.:. : : :: : .:: :: : . :.. :. .
CCDS25 NATKLRVSPKNPRIPKLHMLELHCESKCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIID
530 540 550 560 570 580
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pF1KA0 DDSLTIFGVAERDQGSYTCVASTELDQDLAKAYLTVLGRPDRPRDLELTDLAERSVRLTW
.::: .:. .::: : : : : ::. . .::: :: :..:.:.. .:::::::
CCDS25 GANLTISNVTLEDQGIYCCSAHTALDSAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTW
590 600 610 620 630 640
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pF1KA0 IPGDANNSPITDYVVQFEEDQFQPGVWHDHSKYPGSVNSAVLRLSPYVNYQFRVIAINEV
: .:: :..:.:.:: .. .:: :.. .. :. ....: :.:.: :::::::.:::
CCDS25 EAGADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGRWEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEV
650 660 670 680 690 700
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pF1KA0 GSSHPSLPSERYRTSGAPPESNPGDVKGEGTRKNNMEITWTPMNATSAFGPNLRYIVKWR
: :.:: ::....: : :. :: ... .... ..: : : :... ::.:.: : :.
CCDS25 GRSQPSQPSDHHETPPAAPDRNPQNIRVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWK
710 720 730 740 750 760
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pF1KA0 RRETREAWNNVTVWGSRYVVGQTPVYVPYEIRVQAENDFGKGPEPESVIGYSGEDYPRAA
. . :.. :: . : ::.::...::: :..:.::.:.:: ::::::: .:
CCDS25 PQGAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVYAPYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTA
770 780 790 800 810 820
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 PTEVKVRVMNSTAISLQWNRVYSDTVQGQLREYRAYYWRESSLLKNLWVSQKRQQASFPG
:. : :.::: ... :. : .: :.:.:. :. .:. .::: . .. . : :
CCDS25 PVIHGVDVINSTLVKVTWSTVPKDRVHGRLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSG
830 840 850 860 870 880
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 DRLRGVVSRLFPYSNYKLEMVVVNGRGDGPRSETKEFTTPEGVPSAPRRFRVRQPNLETI
.: :.: : .:...: ... :..: ::.:: : :::::: : ..: . . .:
CCDS25 QRNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSKGAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTA
890 900 910 920 930 940
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pF1KA0 NLEWDHPEHPNGIMIGYTLKYVAFNGT-KVGK-QIVENFSPNQTKFTVQRTDPVSRYRFT
.: : :.. :: . :: :.: .: : ..:. . .. .:.. .. .. . ...:.:
CCDS25 TLSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIINDTYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFY
950 960 970 980 990 1000
1010 1020 1030
pF1KA0 LSARTQVGSGEAVTEESPA--------------------PPNEAY-----------TNNQ
: : :. : :. .:::: . : :.. :.:
CCDS25 LRACTSQGCGKPITEESSTLGEGSKGIGKISGVNLTQKTHPIEVFEPGAEHIVRLMTKNW
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1040 1050 1060
pF1KA0 AD----------------------IATQGWFIGLMCAIALLVLILLIVCFIKRSRGGKYP
.: :.:::::::::::::::.:.:: :::.::.:::::
CCDS25 GDNDSIFQDVIETRGREYAGLYDDISTQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYS
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA0 VREKKDVPLGPEDPKEEDGSF-DYSDEDNKPLQGSQTSLDGTIKQQESDDSLVDYGEGGE
:.::.:. :: . .: .: .::: :.:::.:: ::. .. :: ::::.:::: .
CCDS25 VKEKEDLHPDPEIQSVKDETFGEYSDSDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDH
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1130 1140 1150 1160
pF1KA0 GQFNEDGSFIGQYTVKKDKEETEGNESSEATSPVNAIYSLA
: :.::::::: :. .:
CCDS25 GLFSEDGSFIGAYAGSKEKGSVESNGSSTATFPLRA
1190 1200 1210 1220
>>CCDS75652.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1211 aa)
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10 20 30 40
pF1KA0 MARQPPPPWVHAAFLLCLLSLGGAIEIPMD------LTQPPTITKQSAKDHIVDP
..: : .. .:.:.:.: :.::::::.:: ::.:.::
CCDS75 MQLKIMPKKKRLSAGRVPLILFLCQMISALEVPLDPKLLEDLVQPPTITQQSPKDYIIDP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 RDNILIECEAKGNPAPSFHWTRNSRFFNIAKDPRVSMRRRSGTLVIDFRSGGRPEEYEGE
:.::.:.:::::.: ::: ::::. :.: ::: :.:. .:::.:.. : :. : :::
CCDS75 RENIVIQCEAKGKPPPSFSWTRNGTHFDIDKDPLVTMKPGTGTLIINIMSEGKAETYEGV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 YQCFARNKFGTALSNRIRLQVSKSPLWPKENLDPVVVQEGAPLTLQCNPPPGLPSPVIFW
::: :::. :.:.:: : .. :.:::: ::.:.:...: : :.: : :: ::: :.:::
CCDS75 YQCTARNERGAAVSNNIVVRPSRSPLWTKEKLEPITLQSGQSLVLPCRPPIGLPPPIIFW
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 MSSSMEPITQDKRVSQGHNGDLYFSNVMLQDMQTDYSCNARFHFTHTIQQKNPFTLKVLT
:..:.. . :..::::: :::::::::. .: . :: : :::. :.:::::.:...::..
CCDS75 MDNSFQRLPQSERVSQGLNGDLYFSNVLPEDTREDYICYARFNHTQTIQQKQPISVKVIS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 NHPYNDSSLRNHPD--MYSARGVAERTPSFMYPQGTASSQMVLRGMDLLLECIASGVPTP
::. : : .:.:.. :: :.:. :.:.::.. ::: : ::::: :.:::
CCDS75 VDELNDTIAANLSDTEFYGAKSSRERPPTFLTPEGNASNKEELRGNVLSLECIAEGLPTP
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 DIAWYKKGGDLPSDKAKFENFNKALRITNVSEEDSGEYFCLASNKMGSIRHTISVRVKAA
: : :. : ::.... ..::.:.:.: .::: :::.: :.:.: .:.:.::::::::::
CCDS75 IIYWAKEDGMLPKNRTVYKNFEKTLQIIHVSEADSGNYQCIAKNALGAIHHTISVRVKAA
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 PYWLDEPKNLILAPGEDGRLVCRANGNPKPTVQWMVNGEPLQSAPPNPNREVAGDTIIFR
:::. :.::.:.::::: :.::::::::: ..:..:: :.. :: .:.:.. ::::::
CCDS75 PYWITAPQNLVLSPGEDGTLICRANGNPKPRISWLTNGVPIEIAPDDPSRKIDGDTIIFS
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 DTQISSRAVYQCNTSNEHGYLLANAFVSVLDVPPRMLSPRNQLIRVILYNRTRLDCPFFG
..: : ::::::.:::.:::::::::.:: :::.:.: : : .:: . ::: :::
CCDS75 NVQERSSAVYQCNASNEYGYLLANAFVNVLAEPPRILTPANTLYQVIANRPALLDCAFFG
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 SPIPTLRWFKNGQGSNLDGGNYHVYENGSLEIKMIRKEDQGIYTCVATNILGKAENQVRL
::.::..:::...:: : : ..:::.::: . .:.. : ::::: : :: :.:.:.:
CCDS75 SPLPTIEWFKGAKGSALHEDIYVLHENGTLEIPVAQKDSTGTYTCVARNKLGMAKNEVHL
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 EVKDPTRIYRMPEDQVARRGTTVQLECRVKHDPSLKLTVSWLKDDEPLYIGNRMKKEDDS
:.:::: : ..:: :..::. :..::.:::: .:.::: ::::.. : .:. . :
CCDS75 EIKDPTWIVKQPEYAVVQRGSMVSFECKVKHDHTLSLTVLWLKDNRELPSDERFTVDKDH
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630
pF1KA0 LTIFGVAERDQGSYTCVASTELDQDLAKAYLTVLGR----------PDRPRDLELTDLAE
:.. :.. :.:.:::::.: ::. :.: :.:.. :. : :::::: .
CCDS75 LVVADVSDDDSGTYTCVANTTLDSVSASAVLSVVAPTPTPAPVYDVPNPPFDLELTDQLD
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 RSVRLTWIPGDANNSPITDYVVQFEEDQFQPGVWHDHSKYPGSVNSAVLRLSPYVNYQFR
.::.:.: ::: :::::: .....:. . .::.:: ... :. ..: :.:::::::.::
CCDS75 KSVQLSWTPGDDNNSPITKFIIEYEDAMHKPGLWHHQTEVSGTQTTAQLKLSPYVNYSFR
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 VIAINEVGSSHPSLPSERYRTSGAPPESNPGDVKGEGTRKNNMEITWTPMNATSAFGPNL
:.:.: .:.: :: ::.: :... :..:: :.: :.. .:. ::: :.:. . ::.:
CCDS75 VMAVNSIGKSLPSEASEQYLTKASEPDKNPTAVEGLGSEPDNLVITWKPLNGFESNGPGL
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 RYIVKWRRRETREAWNNVTVWG-SRYVVGQTPVYVPYEIRVQAENDFGKGPEPESVIGYS
.: :.::... . :..:.: . :.:.:. ::..::: :.::: ::.: .::: :.:.:
CCDS75 QYKVSWRQKDGDDEWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDMGFAPEPAVVMGHS
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
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::: : .:: .:.: :.::: ..:. : ...:.:. :: :::. .: : .
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880 890 900 910 920 930
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940 950 960 970 980 990
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.:.:....:::: : :::::. ::::: .:.: ..: . .. :.:..:.. .
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1000 1010 1020 1030 1040
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1050 1060 1070 1080 1090
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CCDS75 LKKGSRTPSDRTVKKEDSDDSLVDYGEGVNGQFNEDGSFIGQYSGKKEKEPAEGNESSEA
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1160
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CCDS75 PSPVNAMNSFV
1210
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CCDS47 EIKDPTWIVKQPEYAVVQRGSMVSFECKVKHDHTLSLTVLWLKDNRELPSDERFTVDKDH
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CCDS47 VMAVNSIGKSLPSEASEQYLTKASEPDKNPTAVEGLGSEPDNLVITWKPLNGFESNGPGL
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CCDS47 VNPTLDSLTLEWDPPSHPNGILTEYTLKYQPINSTHELGPLVDLKIPANKTRWTLKNLNF
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1000 1010 1020
pF1KA0 VSRYRFTLSARTQVGSGEAVTEESPA--------PPN---------------------EA
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CCDS47 STRYKFYFYAQTSAGSGSQITEEAVTTVDEAGILPPDVGAGKVQAVNPRISNLTAAAAET
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pF1KA0 YTN---------------------------------------------------------
:.:
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1030 1040 1050 1060 1070
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CCDS47 DSGFVSSEDVFETGPAMASRQVDIATQGWFIGLMCAVALLILILLIVCFIRRNKGGKYPV
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CCDS47 KEKEDAHADPEIQPMKEDDGTFGEYSDAEDHKPLKKGSRTPSDRTVKKEDSDDSLVDYGE
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CCDS48 GKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCFASNKL
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CCDS48 GTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSKILHIK
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CCDS48 QDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKATNSMID---
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: : ...: ...: ..:.:. :.::::: : ::: : : . .: .
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CCDS48 YGPGETARLDCQVQGRPQPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTMVTQ
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CCDS48 WFIGFVSAIILLLLVLLILCFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMKDETFGEYSDNEE
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: . ::
CCDS48 KAF-GSSQPSLNGDIKPLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEKEAAGGNDSS
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1169 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]