Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0772
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0772, 468 aa
1>>>pF1KA0772 468 - 468 aa - 468 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1520+/-0.000872; mu= 14.1145+/- 0.052
mean_var=85.4126+/-16.932, 0's: 0 Z-trim(108.1): 38 B-trim: 85 in 1/50
Lambda= 0.138776
statistics sampled from 9928 (9965) to 9928 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16
Scan time: 3.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13494.1 OSBPL2 gene_id:9885|Hs108|chr20 ( 468) 3236 657.8 7e-189
CCDS13495.1 OSBPL2 gene_id:9885|Hs108|chr20 ( 480) 3159 642.4 3.1e-184
CCDS11885.1 OSBPL1A gene_id:114876|Hs108|chr18 ( 437) 2226 455.5 4.9e-128
CCDS56056.1 OSBPL1A gene_id:114876|Hs108|chr18 ( 568) 2227 455.8 5.4e-128
CCDS11884.1 OSBPL1A gene_id:114876|Hs108|chr18 ( 950) 2227 455.9 8.3e-128
CCDS63323.1 OSBPL2 gene_id:9885|Hs108|chr20 ( 370) 1972 404.6 8.7e-113
CCDS47564.1 OSBPL3 gene_id:26031|Hs108|chr7 ( 820) 786 167.4 5.2e-41
CCDS5392.1 OSBPL3 gene_id:26031|Hs108|chr7 ( 851) 786 167.4 5.3e-41
CCDS5391.1 OSBPL3 gene_id:26031|Hs108|chr7 ( 856) 786 167.4 5.4e-41
CCDS5390.1 OSBPL3 gene_id:26031|Hs108|chr7 ( 887) 786 167.4 5.5e-41
CCDS56151.1 OSBPL6 gene_id:114880|Hs108|chr2 ( 898) 775 165.2 2.6e-40
CCDS56152.1 OSBPL6 gene_id:114880|Hs108|chr2 ( 903) 775 165.2 2.6e-40
CCDS2277.1 OSBPL6 gene_id:114880|Hs108|chr2 ( 934) 775 165.2 2.7e-40
CCDS2278.1 OSBPL6 gene_id:114880|Hs108|chr2 ( 938) 775 165.2 2.7e-40
CCDS56150.1 OSBPL6 gene_id:114880|Hs108|chr2 ( 959) 775 165.2 2.7e-40
CCDS11515.1 OSBPL7 gene_id:114881|Hs108|chr17 ( 842) 769 164.0 5.6e-40
CCDS7974.1 OSBP gene_id:5007|Hs108|chr11 ( 807) 735 157.2 6.1e-38
CCDS63451.1 OSBP2 gene_id:23762|Hs108|chr22 ( 460) 709 151.8 1.4e-36
CCDS63450.1 OSBP2 gene_id:23762|Hs108|chr22 ( 549) 709 151.9 1.6e-36
CCDS63446.1 OSBP2 gene_id:23762|Hs108|chr22 ( 750) 709 151.9 2.1e-36
CCDS63449.1 OSBP2 gene_id:23762|Hs108|chr22 ( 659) 707 151.5 2.5e-36
CCDS63448.1 OSBP2 gene_id:23762|Hs108|chr22 ( 915) 709 152.0 2.5e-36
CCDS43002.1 OSBP2 gene_id:23762|Hs108|chr22 ( 916) 707 151.6 3.3e-36
CCDS41814.1 OSBPL8 gene_id:114882|Hs108|chr12 ( 847) 455 101.1 4.7e-21
CCDS31862.1 OSBPL8 gene_id:114882|Hs108|chr12 ( 889) 455 101.1 4.9e-21
CCDS31343.1 OSBPL5 gene_id:114879|Hs108|chr11 ( 811) 421 94.3 5.1e-19
CCDS31344.1 OSBPL5 gene_id:114879|Hs108|chr11 ( 879) 421 94.3 5.5e-19
>>CCDS13494.1 OSBPL2 gene_id:9885|Hs108|chr20 (468 aa)
initn: 3236 init1: 3236 opt: 3236 Z-score: 3504.5 bits: 657.8 E(32554): 7e-189
Smith-Waterman score: 3236; 100.0% identity (100.0% similar) in 468 aa overlap (1-468:1-468)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MNGEEEFFDAVTEANQKVTGMIDLDTSKNNRIGKTGERPSQENGIQKHRTSLPAPMFSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MNGEEEFFDAVTEANQKVTGMIDLDTSKNNRIGKTGERPSQENGIQKHRTSLPAPMFSRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 DFSVWTILKKCVGLELSKITMPIAFNEPLSFLQRITEYMEHVYLIHRASCQPQPLERMQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DFSVWTILKKCVGLELSKITMPIAFNEPLSFLQRITEYMEHVYLIHRASCQPQPLERMQS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 VAAFAVSAVASQWERTGKPFNPLLGETYELIREDLGFRFISEQVSHHPPISAFHSEGLNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VAAFAVSAVASQWERTGKPFNPLLGETYELIREDLGFRFISEQVSHHPPISAFHSEGLNH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 DFLFHGSIYPKLKFWGKSVEAEPRGTITLELLKHNEAYTWTNPTCCVHNVIIGKLWIEQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DFLFHGSIYPKLKFWGKSVEAEPRGTITLELLKHNEAYTWTNPTCCVHNVIIGKLWIEQY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GTVEILNHRTGHKCVLHFKPCGLFGKELHKVEGHIQDKNKKKLFMIYGKWTECLWGIDPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GTVEILNHRTGHKCVLHFKPCGLFGKELHKVEGHIQDKNKKKLFMIYGKWTECLWGIDPV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 SYESFKKQERRGDHLRKAKLDEDSGKADSDVADDVPVAQETVQVIPGSKLLWRINTRPPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SYESFKKQERRGDHLRKAKLDEDSGKADSDVADDVPVAQETVQVIPGSKLLWRINTRPPN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 SAQMYNFTSFTVSLNELETGMEKTLPPTDCRLRPDIRGMENGNMDLASQEKERLEEKQRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SAQMYNFTSFTVSLNELETGMEKTLPPTDCRLRPDIRGMENGNMDLASQEKERLEEKQRE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KA0 ARRERAKEEAEWQTRWFYPGNNPYTGTPDWLYAGDYFERNFSDCPDIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ARRERAKEEAEWQTRWFYPGNNPYTGTPDWLYAGDYFERNFSDCPDIY
430 440 450 460
>>CCDS13495.1 OSBPL2 gene_id:9885|Hs108|chr20 (480 aa)
initn: 3159 init1: 3159 opt: 3159 Z-score: 3421.0 bits: 642.4 E(32554): 3.1e-184
Smith-Waterman score: 3202; 97.5% identity (97.5% similar) in 480 aa overlap (1-468:1-480)
10 20 30 40
pF1KA0 MNGEEEFFDAVT------------EANQKVTGMIDLDTSKNNRIGKTGERPSQENGIQKH
:::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MNGEEEFFDAVTGFDSDNSSGEFSEANQKVTGMIDLDTSKNNRIGKTGERPSQENGIQKH
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 RTSLPAPMFSRSDFSVWTILKKCVGLELSKITMPIAFNEPLSFLQRITEYMEHVYLIHRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RTSLPAPMFSRSDFSVWTILKKCVGLELSKITMPIAFNEPLSFLQRITEYMEHVYLIHRA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 SCQPQPLERMQSVAAFAVSAVASQWERTGKPFNPLLGETYELIREDLGFRFISEQVSHHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SCQPQPLERMQSVAAFAVSAVASQWERTGKPFNPLLGETYELIREDLGFRFISEQVSHHP
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 PISAFHSEGLNHDFLFHGSIYPKLKFWGKSVEAEPRGTITLELLKHNEAYTWTNPTCCVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PISAFHSEGLNHDFLFHGSIYPKLKFWGKSVEAEPRGTITLELLKHNEAYTWTNPTCCVH
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 NVIIGKLWIEQYGTVEILNHRTGHKCVLHFKPCGLFGKELHKVEGHIQDKNKKKLFMIYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NVIIGKLWIEQYGTVEILNHRTGHKCVLHFKPCGLFGKELHKVEGHIQDKNKKKLFMIYG
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 KWTECLWGIDPVSYESFKKQERRGDHLRKAKLDEDSGKADSDVADDVPVAQETVQVIPGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KWTECLWGIDPVSYESFKKQERRGDHLRKAKLDEDSGKADSDVADDVPVAQETVQVIPGS
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 KLLWRINTRPPNSAQMYNFTSFTVSLNELETGMEKTLPPTDCRLRPDIRGMENGNMDLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KLLWRINTRPPNSAQMYNFTSFTVSLNELETGMEKTLPPTDCRLRPDIRGMENGNMDLAS
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 QEKERLEEKQREARRERAKEEAEWQTRWFYPGNNPYTGTPDWLYAGDYFERNFSDCPDIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QEKERLEEKQREARRERAKEEAEWQTRWFYPGNNPYTGTPDWLYAGDYFERNFSDCPDIY
430 440 450 460 470 480
>>CCDS11885.1 OSBPL1A gene_id:114876|Hs108|chr18 (437 aa)
initn: 2219 init1: 1615 opt: 2226 Z-score: 2412.1 bits: 455.5 E(32554): 4.9e-128
Smith-Waterman score: 2226; 71.4% identity (91.1% similar) in 427 aa overlap (43-468:15-437)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 EANQKVTGMIDLDTSKNNRIGKTGERPSQENGIQKHRTSLPAPMFSRSDFSVWTILKKCV
:::.:::::::.:::::.:::.:.::.::.
CCDS11 MSEEKDCGGGDALSNGIKKHRTSLPSPMFSRNDFSIWSILRKCI
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 GLELSKITMPIAFNEPLSFLQRITEYMEHVYLIHRASCQPQPLERMQSVAAFAVSAVASQ
:.::::::::. ::::::::::.::::::.::::.:: .:.:::: ::::::::::::
CCDS11 GMELSKITMPVIFNEPLSFLQRLTEYMEHTYLIHKASSLSDPVERMQCVAAFAVSAVASQ
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 WERTGKPFNPLLGETYELIREDLGFRFISEQVSHHPPISAFHSEGLNHDFLFHGSIYPKL
::::::::::::::::::.:.:::::.:::::::::::::::.::::.::.:::::::::
CCDS11 WERTGKPFNPLLGETYELVRDDLGFRLISEQVSHHPPISAFHAEGLNNDFIFHGSIYPKL
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 KFWGKSVEAEPRGTITLELLKHNEAYTWTNPTCCVHNVIIGKLWIEQYGTVEILNHRTGH
:::::::::::.::::::::.::::::::::::::::.:.:::::::::.:::.::.::
CCDS11 KFWGKSVEAEPKGTITLELLEHNEAYTWTNPTCCVHNIIVGKLWIEQYGNVEIINHKTGD
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 KCVLHFKPCGLFGKELHKVEGHIQDKNKKKLFMIYGKWTECLWGIDPVSYESFKKQERRG
::::.::::::::::::::::.::::.:::: .::::::::...::......::.....
CCDS11 KCVLNFKPCGLFGKELHKVEGYIQDKSKKKLCALYGKWTECLYSVDPATFDAYKKNDKKN
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 DHLRKAKLDEDSGKADSDVADDVPVAQ-ETVQVIPGSKLLWRINTRPPNSAQMYNFTSFT
. .: ... . :. :..:: . :.: .:::: ::::: ::::::::::::::.
CCDS11 TEEKK----NSKQMSTSEELDEMPVPDSESVFIIPGSVLLWRIAPRPPNSAQMYNFTSFA
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 VSLNELETGMEKTLPPTDCRLRPDIRGMENGNMDLASQEKERLEEKQREARRERAKEEAE
. :::.. ::...: ::::::::::.::::..: ::.::.::::::: ::..:.: : .
CCDS11 MVLNEVDKDMESVIPKTDCRLRPDIRAMENGEIDQASEEKKRLEEKQRAARKNRSKSEED
350 360 370 380 390 400
440 450 460
pF1KA0 WQTRWFYPGNNPYTGTPDWLYAGDYFERNFSDCPDIY
:.::::. : :::.:. ::.:.:.:..::. . ::::
CCDS11 WKTRWFHQGPNPYNGAQDWIYSGSYWDRNYFNLPDIY
410 420 430
>>CCDS56056.1 OSBPL1A gene_id:114876|Hs108|chr18 (568 aa)
initn: 2219 init1: 1615 opt: 2227 Z-score: 2411.4 bits: 455.8 E(32554): 5.4e-128
Smith-Waterman score: 2242; 65.4% identity (87.1% similar) in 482 aa overlap (4-468:91-568)
10 20
pF1KA0 MNGEEEFFDAVTEA-NQKVTGMIDLDTSKN---
:.::.::.... ... . .. :...
CCDS56 LSEALETLATEHHELEQSLVKGSPPASILSEDEFYDALSDSESERSLSRLEAVTARSFEE
70 80 90 100 110 120
30 40 50 60 70
pF1KA0 --NRIGKTGERPSQE----------NGIQKHRTSLPAPMFSRSDFSVWTILKKCVGLELS
...:. .: :.: :::.:::::::.:::::.:::.:.::.::.:.:::
CCDS56 EGEHLGSRKHRMSEEKDCGGGDALSNGIKKHRTSLPSPMFSRNDFSIWSILRKCIGMELS
130 140 150 160 170 180
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 KITMPIAFNEPLSFLQRITEYMEHVYLIHRASCQPQPLERMQSVAAFAVSAVASQWERTG
:::::. ::::::::::.::::::.::::.:: .:.:::: :::::::::::::::::
CCDS56 KITMPVIFNEPLSFLQRLTEYMEHTYLIHKASSLSDPVERMQCVAAFAVSAVASQWERTG
190 200 210 220 230 240
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 KPFNPLLGETYELIREDLGFRFISEQVSHHPPISAFHSEGLNHDFLFHGSIYPKLKFWGK
:::::::::::::.:.:::::.:::::::::::::::.::::.::.::::::::::::::
CCDS56 KPFNPLLGETYELVRDDLGFRLISEQVSHHPPISAFHAEGLNNDFIFHGSIYPKLKFWGK
250 260 270 280 290 300
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 SVEAEPRGTITLELLKHNEAYTWTNPTCCVHNVIIGKLWIEQYGTVEILNHRTGHKCVLH
::::::.::::::::.::::::::::::::::.:.:::::::::.:::.::.:: ::::.
CCDS56 SVEAEPKGTITLELLEHNEAYTWTNPTCCVHNIIVGKLWIEQYGNVEIINHKTGDKCVLN
310 320 330 340 350 360
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 FKPCGLFGKELHKVEGHIQDKNKKKLFMIYGKWTECLWGIDPVSYESFKKQERRGDHLRK
::::::::::::::::.::::.:::: .::::::::...::......::..... . .:
CCDS56 FKPCGLFGKELHKVEGYIQDKSKKKLCALYGKWTECLYSVDPATFDAYKKNDKKNTEEKK
370 380 390 400 410 420
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 AKLDEDSGKADSDVADDVPVAQ-ETVQVIPGSKLLWRINTRPPNSAQMYNFTSFTVSLNE
... . :. :..:: . :.: .:::: ::::: ::::::::::::::.. :::
CCDS56 ----NSKQMSTSEELDEMPVPDSESVFIIPGSVLLWRIAPRPPNSAQMYNFTSFAMVLNE
430 440 450 460 470
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 LETGMEKTLPPTDCRLRPDIRGMENGNMDLASQEKERLEEKQREARRERAKEEAEWQTRW
.. ::...: ::::::::::.::::..: ::.::.::::::: ::..:.: : .:.:::
CCDS56 VDKDMESVIPKTDCRLRPDIRAMENGEIDQASEEKKRLEEKQRAARKNRSKSEEDWKTRW
480 490 500 510 520 530
440 450 460
pF1KA0 FYPGNNPYTGTPDWLYAGDYFERNFSDCPDIY
:. : :::.:. ::.:.:.:..::. . ::::
CCDS56 FHQGPNPYNGAQDWIYSGSYWDRNYFNLPDIY
540 550 560
>>CCDS11884.1 OSBPL1A gene_id:114876|Hs108|chr18 (950 aa)
initn: 2219 init1: 1615 opt: 2227 Z-score: 2408.0 bits: 455.9 E(32554): 8.3e-128
Smith-Waterman score: 2242; 65.4% identity (87.1% similar) in 482 aa overlap (4-468:473-950)
10 20
pF1KA0 MNGEEEFFDAVTEA-NQKVTGMIDLDTSKN---
:.::.::.... ... . .. :...
CCDS11 LSEALETLATEHHELEQSLVKGSPPASILSEDEFYDALSDSESERSLSRLEAVTARSFEE
450 460 470 480 490 500
30 40 50 60 70
pF1KA0 --NRIGKTGERPSQE----------NGIQKHRTSLPAPMFSRSDFSVWTILKKCVGLELS
...:. .: :.: :::.:::::::.:::::.:::.:.::.::.:.:::
CCDS11 EGEHLGSRKHRMSEEKDCGGGDALSNGIKKHRTSLPSPMFSRNDFSIWSILRKCIGMELS
510 520 530 540 550 560
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 KITMPIAFNEPLSFLQRITEYMEHVYLIHRASCQPQPLERMQSVAAFAVSAVASQWERTG
:::::. ::::::::::.::::::.::::.:: .:.:::: :::::::::::::::::
CCDS11 KITMPVIFNEPLSFLQRLTEYMEHTYLIHKASSLSDPVERMQCVAAFAVSAVASQWERTG
570 580 590 600 610 620
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 KPFNPLLGETYELIREDLGFRFISEQVSHHPPISAFHSEGLNHDFLFHGSIYPKLKFWGK
:::::::::::::.:.:::::.:::::::::::::::.::::.::.::::::::::::::
CCDS11 KPFNPLLGETYELVRDDLGFRLISEQVSHHPPISAFHAEGLNNDFIFHGSIYPKLKFWGK
630 640 650 660 670 680
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 SVEAEPRGTITLELLKHNEAYTWTNPTCCVHNVIIGKLWIEQYGTVEILNHRTGHKCVLH
::::::.::::::::.::::::::::::::::.:.:::::::::.:::.::.:: ::::.
CCDS11 SVEAEPKGTITLELLEHNEAYTWTNPTCCVHNIIVGKLWIEQYGNVEIINHKTGDKCVLN
690 700 710 720 730 740
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 FKPCGLFGKELHKVEGHIQDKNKKKLFMIYGKWTECLWGIDPVSYESFKKQERRGDHLRK
::::::::::::::::.::::.:::: .::::::::...::......::..... . .:
CCDS11 FKPCGLFGKELHKVEGYIQDKSKKKLCALYGKWTECLYSVDPATFDAYKKNDKKNTEEKK
750 760 770 780 790 800
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 AKLDEDSGKADSDVADDVPVAQ-ETVQVIPGSKLLWRINTRPPNSAQMYNFTSFTVSLNE
... . :. :..:: . :.: .:::: ::::: ::::::::::::::.. :::
CCDS11 ----NSKQMSTSEELDEMPVPDSESVFIIPGSVLLWRIAPRPPNSAQMYNFTSFAMVLNE
810 820 830 840 850
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 LETGMEKTLPPTDCRLRPDIRGMENGNMDLASQEKERLEEKQREARRERAKEEAEWQTRW
.. ::...: ::::::::::.::::..: ::.::.::::::: ::..:.: : .:.:::
CCDS11 VDKDMESVIPKTDCRLRPDIRAMENGEIDQASEEKKRLEEKQRAARKNRSKSEEDWKTRW
860 870 880 890 900 910
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CCDS11 FHQGPNPYNGAQDWIYSGSYWDRNYFNLPDIY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QPQPLERMQSVAAFAVSAVASQWERTGKPFNPLLGETYELIREDLGFRFISEQVSHHPPI
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CCDS63 SAFHSEGLNHDFLFHGSIYPKLKFWGKSVEAEPRGTITLELLKHNEAYTWTNPTCCVHNV
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CCDS63 IIGKLWIEQYGTVEILNHRTGHKCVLHFKPCGLFGKELHKVEGHIQDKNKKKLFMIYGKW
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CCDS63 LWRINTRPPNSAQIWPARRRSGWRRSREKHGGSGPRRRQSGRRGGSTQAITPTLGPPTGC
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CCDS47 SPLERMVYVAAFAISAYASSYYRAGSKPFNPVLGETYECIREDKGFQFFSEQVSHHPPIS
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CCDS47 ACHAESRN--FVFWQDVRWKNKFWGKSMEIVPIGTTHVTLPVFGDHFEWNKVTSCIHNIL
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: .. : ..: :
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CCDS47 VWRANPMPKGYEQYYSFTQFALELNEMDPSSKSLLPPTDTRFRPDQRFLEEGNLEEAEIQ
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pF1KA0 KERLEEKQREARRERAKEEAEWQTRWFYPGNNPYTGTPDWLYAGDYFERNFSDCPDIY
:.:.:. ::: :: ....: : :.: ... .:. : :.:
CCDS47 KQRIEQLQRERRRVLEENHVEHQPRFFRKSDDD-----SWVSNGTYLELRKDLGFSKLDH
770 780 790 800 810
CCDS47 PVLW
820
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10 20 30 40 50
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CCDS53 SPSSSENEISDDDSYVSDISDNLSLDNLSNDLDNERQT-LGPVLD--SGREAKSRRRTCL
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60 70 80 90 100 110
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CCDS53 PAPCPSSSNISLWNILRNNIGKDLSKVAMPVELNEPLNTLQRLCEELEYSELLDKAAQIP
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120 130 140 150 160 170
pF1KA0 QPLERMQSVAAFAVSAVASQWERTG-KPFNPLLGETYELIREDLGFRFISEQVSHHPPIS
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CCDS53 SPLERMVYVAAFAISAYASSYYRAGSKPFNPVLGETYECIREDKGFQFFSEQVSHHPPIS
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180 190 200 210 220 230
pF1KA0 AFHSEGLNHDFLFHGSIYPKLKFWGKSVEAEPRGTITLELLKHNEAYTWTNPTCCVHNVI
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CCDS53 ACHAESRN--FVFWQDVRWKNKFWGKSMEIVPIGTTHVTLPVFGDHFEWNKVTSCIHNIL
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240 250 260 270 280 290
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CCDS53 SGQRWIEHYGEIVIKNLHDDSCYCKVNFIKAKYWSTNAHEIEGTVFDRSGKAVHRLFGKW
660 670 680 690 700 710
300 310 320 330 340 350
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: .. : ..: :
CCDS53 HESIY----------------------------CGGGSS------------------SAC
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CCDS53 VWRANPMPKGYEQYYSFTQFALELNEMDPSSKSLLPPTDTRFRPDQRFLEEGNLEEAEIQ
740 750 760 770 780 790
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CCDS53 KQRIEQLQRERRRVLEENHVEHQPRFFRKSDDD-----SWVSNGTYLELRKDLGFSKLDH
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CCDS53 PVLW
850
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10 20 30 40 50
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CCDS53 SPSSSENEISDDDSYVSDISDNLSLDNLSNDLDNERQT-LGPVLD--SGREAKSRRRTCL
430 440 450 460 470 480
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pF1KA0 PAPMFSRSDFSVWTILKKCVGLELSKITMPIAFNEPLSFLQRITEYMEHVYLIHRASCQP
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CCDS53 PAPCPSSSNISLWNILRNNIGKDLSKVAMPVELNEPLNTLQRLCEELEYSELLDKAAQIP
490 500 510 520 530 540
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 QPLERMQSVAAFAVSAVASQWERTG-KPFNPLLGETYELIREDLGFRFISEQVSHHPPIS
.::::: :::::.:: ::.. :.: :::::.:::::: :::: ::.:.:::::::::::
CCDS53 SPLERMVYVAAFAISAYASSYYRAGSKPFNPVLGETYECIREDKGFQFFSEQVSHHPPIS
550 560 570 580 590 600
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 AFHSEGLNHDFLFHGSIYPKLKFWGKSVEAEPRGTITLELLKHNEAYTWTNPTCCVHNVI
: :.:. : :.: .. : ::::::.: : :: . : .. . :.. : :.::..
CCDS53 ACHAESRN--FVFWQDVRWKNKFWGKSMEIVPIGTTHVTLPVFGDHFEWNKVTSCIHNIL
610 620 630 640 650 660
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pF1KA0 IGKLWIEQYGTVEILN-HRTGHKCVLHFKPCGLFGKELHKVEGHIQDKNKKKLFMIYGKW
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CCDS53 SGQRWIEHYGEIVIKNLHDDSCYCKVNFIKAKYWSTNAHEIEGTVFDRSGKAVHRLFGKW
670 680 690 700 710 720
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CCDS53 HESIY----------------------------CGGGSS------------------SAC
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CCDS53 VWRANPMPKGYEQYYSFTQFALELNEMDPSSKSLLPPTDTRFRPDQRFLEEGNLEEAEIQ
740 750 760 770 780 790
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pF1KA0 KERLEEKQREARRERAKEEAEWQTRWFYPGNNPYTGTPDWLYAGDYFERNFSDCPDIY
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CCDS53 KQRIEQLQRERRRVLEENHVEHQPRFFRKSDDD-----SWVSNGTYLELRKDLGFSKLDH
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CCDS53 PVLW
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pF1KA0 MNGEEEFFDAVTEANQKVTGMIDLDTSKNNRIGKTGERPSQENGIQKHRTSL
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CCDS53 SPSSSENEISDDDSYVSDISDNLSLDNLSNDLDNERQT-LGPVLD--SGREAKSRRRTCL
460 470 480 490 500 510
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 PAPMFSRSDFSVWTILKKCVGLELSKITMPIAFNEPLSFLQRITEYMEHVYLIHRASCQP
::: : :..:.:.::.. .: .:::..::. .::::. :::. : .:. :. .:. :
CCDS53 PAPCPSSSNISLWNILRNNIGKDLSKVAMPVELNEPLNTLQRLCEELEYSELLDKAAQIP
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120 130 140 150 160 170
pF1KA0 QPLERMQSVAAFAVSAVASQWERTG-KPFNPLLGETYELIREDLGFRFISEQVSHHPPIS
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CCDS53 SPLERMVYVAAFAISAYASSYYRAGSKPFNPVLGETYECIREDKGFQFFSEQVSHHPPIS
580 590 600 610 620 630
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 AFHSEGLNHDFLFHGSIYPKLKFWGKSVEAEPRGTITLELLKHNEAYTWTNPTCCVHNVI
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CCDS53 ACHAESRN--FVFWQDVRWKNKFWGKSMEIVPIGTTHVTLPVFGDHFEWNKVTSCIHNIL
640 650 660 670 680 690
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 IGKLWIEQYGTVEILN-HRTGHKCVLHFKPCGLFGKELHKVEGHIQDKNKKKLFMIYGKW
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CCDS53 SGQRWIEHYGEIVIKNLHDDSCYCKVNFIKAKYWSTNAHEIEGTVFDRSGKAVHRLFGKW
700 710 720 730 740 750
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 TECLWGIDPVSYESFKKQERRGDHLRKAKLDEDSGKADSDVADDVPVAQETVQVIPGSKL
: .. : ..: :
CCDS53 HESIY----------------------------CGGGSS------------------SAC
760
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 LWRINTRPPNSAQMYNFTSFTVSLNELETGMEKTLPPTDCRLRPDIRGMENGNMDLASQE
.:: : : . :.:.::.:.. :::.. . .. ::::: :.::: : .:.::.. : .
CCDS53 VWRANPMPKGYEQYYSFTQFALELNEMDPSSKSLLPPTDTRFRPDQRFLEEGNLEEAEIQ
770 780 790 800 810 820
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pF1KA0 KERLEEKQREARRERAKEEAEWQTRWFYPGNNPYTGTPDWLYAGDYFERNFSDCPDIY
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CCDS53 KQRIEQLQRERRRVLEENHVEHQPRFFRKSDDD-----SWVSNGTYLELRKDLGFSKLDH
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CCDS53 PVLW
468 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]