Result of FASTA (omim) for
pF1KA0806
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0806, 1065 aa
1>>>pF1KA0806 1065 - 1065 aa - 1065 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2120+/-0.000687; mu= 8.8937+/- 0.042
mean_var=343.7176+/-74.545, 0's: 0 Z-trim(112.9): 925 B-trim: 90 in 2/50
Lambda= 0.069179
statistics sampled from 20958 (22010) to 20958 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.258), width: 16
Scan time: 14.590
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055628 (OMIM: 608869,615112) leucine-rich repea (1065) 7102 725.1 5.1e-208
NP_001299615 (OMIM: 608869,615112) leucine-rich re ( 962) 6399 654.9 6.3e-187
NP_700356 (OMIM: 608870) leucine-rich repeats and (1119) 3833 398.9 8.6e-110
XP_011536195 (OMIM: 608870) PREDICTED: leucine-ric (1041) 3749 390.5 2.7e-107
XP_016858441 (OMIM: 608869,615112) PREDICTED: leuc ( 553) 3741 389.3 3.3e-107
NP_001129523 (OMIM: 608870) leucine-rich repeats a (1059) 3746 390.2 3.4e-107
XP_005271426 (OMIM: 608869,615112) PREDICTED: leuc ( 958) 3257 341.3 1.6e-92
NP_056356 (OMIM: 608868) leucine-rich repeats and (1093) 2776 293.4 4.8e-78
XP_016861623 (OMIM: 608868) PREDICTED: leucine-ric (1068) 2632 279.0 1e-73
XP_016874279 (OMIM: 608870) PREDICTED: leucine-ric ( 623) 2274 242.9 4.2e-63
XP_011531880 (OMIM: 608868) PREDICTED: leucine-ric (1045) 2153 231.2 2.5e-59
XP_011531881 (OMIM: 608868) PREDICTED: leucine-ric ( 833) 2141 229.8 4.9e-59
XP_016861625 (OMIM: 608868) PREDICTED: leucine-ric ( 833) 2141 229.8 4.9e-59
XP_016861624 (OMIM: 608868) PREDICTED: leucine-ric ( 867) 2137 229.5 6.7e-59
XP_011515758 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin (1439) 502 66.6 1.2e-09
XP_011515759 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin (1439) 499 66.3 1.4e-09
XP_016873564 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 476 63.5 4.5e-09
XP_011518546 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 476 63.5 4.5e-09
XP_016873566 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 476 63.5 4.5e-09
XP_011518541 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 476 63.5 4.5e-09
XP_011518540 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 476 63.5 4.5e-09
XP_016873561 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 476 63.5 4.5e-09
XP_011518542 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 476 63.5 4.5e-09
NP_001245348 (OMIM: 608817) leucine-rich repeat-co ( 640) 476 63.5 4.5e-09
XP_011518543 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 476 63.5 4.5e-09
XP_016873560 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 476 63.5 4.5e-09
XP_011518544 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 476 63.5 4.5e-09
NP_065980 (OMIM: 608817) leucine-rich repeat-conta ( 640) 476 63.5 4.5e-09
XP_011518545 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 476 63.5 4.5e-09
XP_016873563 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 476 63.5 4.5e-09
XP_016873565 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 476 63.5 4.5e-09
XP_016873562 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 476 63.5 4.5e-09
XP_016873559 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 476 63.5 4.5e-09
XP_016873567 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 476 63.5 4.5e-09
XP_016873568 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 476 63.5 4.5e-09
XP_005264764 (OMIM: 269400,605158) PREDICTED: pero (1455) 469 63.3 1.2e-08
XP_016867994 (OMIM: 610486) PREDICTED: leucine-ric ( 653) 453 61.2 2.2e-08
XP_011514763 (OMIM: 610486) PREDICTED: leucine-ric ( 653) 453 61.2 2.2e-08
NP_071426 (OMIM: 610486) leucine-rich repeat-conta ( 653) 453 61.2 2.2e-08
XP_011515760 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin (1328) 454 61.7 3.1e-08
XP_016868530 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin (1328) 454 61.7 3.1e-08
XP_016873611 (OMIM: 607313,608630) PREDICTED: roun (1364) 443 60.7 6.8e-08
NP_071765 (OMIM: 607313,608630) roundabout homolog (1386) 443 60.7 6.8e-08
XP_016862473 (OMIM: 602430) PREDICTED: roundabout (1596) 432 59.7 1.6e-07
XP_016862472 (OMIM: 602430) PREDICTED: roundabout (1612) 432 59.7 1.6e-07
NP_002932 (OMIM: 602430) roundabout homolog 1 isof (1651) 432 59.7 1.6e-07
NP_001258 (OMIM: 602178) chondroadherin precursor ( 359) 405 56.0 4.4e-07
XP_016862474 (OMIM: 602430) PREDICTED: roundabout (1535) 416 58.0 4.7e-07
NP_001139317 (OMIM: 602430) roundabout homolog 1 i (1551) 416 58.1 4.7e-07
XP_011532282 (OMIM: 602430) PREDICTED: roundabout (1590) 416 58.1 4.8e-07
>>NP_055628 (OMIM: 608869,615112) leucine-rich repeats a (1065 aa)
initn: 7102 init1: 7102 opt: 7102 Z-score: 3855.6 bits: 725.1 E(85289): 5.1e-208
Smith-Waterman score: 7102; 100.0% identity (100.0% similar) in 1065 aa overlap (1-1065:1-1065)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAPAPLGVPEEQLLGCRSRVLSRLLFIAQTALLLLPAAGAGLCPAPCSCRIPLLDCSRRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MAPAPLGVPEEQLLGCRSRVLSRLLFIAQTALLLLPAAGAGLCPAPCSCRIPLLDCSRRK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LPAPSWRALSGLLPPDTAILDFSHNRLSNWNISLESQTLQEVKMNYNELTEIPYFGEPTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LPAPSWRALSGLLPPDTAILDFSHNRLSNWNISLESQTLQEVKMNYNELTEIPYFGEPTS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 NITLLSLVHNIIPEINAQALQFYPALESLDLSSNIISEIKTSSFPRMQLKYLNLSNNRIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NITLLSLVHNIIPEINAQALQFYPALESLDLSSNIISEIKTSSFPRMQLKYLNLSNNRIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 TLEAGCFDNLSSSLLVVKLNRNRMSMIPPKIFKLPHLQFLELKRNRIKIVEGLTFQGLDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TLEAGCFDNLSSSLLVVKLNRNRMSMIPPKIFKLPHLQFLELKRNRIKIVEGLTFQGLDS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LRSLKMQRNGISKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWLYGLRMLQQLYVSQNAIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LRSLKMQRNGISKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWLYGLRMLQQLYVSQNAIE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 RISPDAWEFCQRLSELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRVTHIADGVFRFLSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RISPDAWEFCQRLSELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRVTHIADGVFRFLSN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LQTLDLRNNEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFIGLESLEHLDLNNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LQTLDLRNNEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFIGLESLEHLDLNNN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 AIMSIQENAFSQTHLKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQHSVNVSCAHPEWLAGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AIMSIQENAFSQTHLKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQHSVNVSCAHPEWLAGQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SILNVDLKDFVCDDFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTCTAVSSSDSPMSTVWRKDSEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SILNVDLKDFVCDDFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTCTAVSSSDSPMSTVWRKDSEIL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 YDVDTENFVRYWQQAGEALEYTSILHLFNVNFTDEGKYQCIVTNHFGSNYSQKAKLTVNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YDVDTENFVRYWQQAGEALEYTSILHLFNVNFTDEGKYQCIVTNHFGSNYSQKAKLTVNE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 MPSFLKTPMDLTIRTGAMARLECAAEGHPAPQISWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDDVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MPSFLKTPMDLTIRTGAMARLECAAEGHPAPQISWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDDVF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 FIANVKIEDMGIYSCMAQNTAGGLSANASLTVLETPSFIRPLEDKTVTRGETAVLQCIAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FIANVKIEDMGIYSCMAQNTAGGLSANASLTVLETPSFIRPLEDKTVTRGETAVLQCIAG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 GSPAPRLNWTKDDGPLLVTERHFFAAANQLLIIVDAGLEDAGKYTCIMSNTLGTERGHIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GSPAPRLNWTKDDGPLLVTERHFFAAANQLLIIVDAGLEDAGKYTCIMSNTLGTERGHIY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 LNVISSPNCDSSQSSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGTSLIWVIVIYHMRRKNEDYSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LNVISSPNCDSSQSSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGTSLIWVIVIYHMRRKNEDYSI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 TNTEELNLPADIPSYLSSQGTLSEPQEGYSNSEAGSHQQLMPPANGYIHKGTDGGTGTRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TNTEELNLPADIPSYLSSQGTLSEPQEGYSNSEAGSHQQLMPPANGYIHKGTDGGTGTRV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 ICSDCYDNANIYSRTREYCPYTYIAEEDVLDQTLSSLMVQMPKETYLVHPPQDTTALESL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ICSDCYDNANIYSRTREYCPYTYIAEEDVLDQTLSSLMVQMPKETYLVHPPQDTTALESL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 IPSANREPSAFPTNHERISEKKLPSTQMSGETLQRPVWNINRELGLPHPPFSQQPVHESP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IPSANREPSAFPTNHERISEKKLPSTQMSGETLQRPVWNINRELGLPHPPFSQQPVHESP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060
pF1KA0 QLHQNEGLAGREPDCSASSMSCHRLQDHAFDFSRTRNIQDGSEGT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QLHQNEGLAGREPDCSASSMSCHRLQDHAFDFSRTRNIQDGSEGT
1030 1040 1050 1060
>>NP_001299615 (OMIM: 608869,615112) leucine-rich repeat (962 aa)
initn: 6399 init1: 6399 opt: 6399 Z-score: 3476.9 bits: 654.9 E(85289): 6.3e-187
Smith-Waterman score: 6399; 100.0% identity (100.0% similar) in 962 aa overlap (104-1065:1-962)
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 PPDTAILDFSHNRLSNWNISLESQTLQEVKMNYNELTEIPYFGEPTSNITLLSLVHNIIP
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MNYNELTEIPYFGEPTSNITLLSLVHNIIP
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 EINAQALQFYPALESLDLSSNIISEIKTSSFPRMQLKYLNLSNNRITTLEAGCFDNLSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EINAQALQFYPALESLDLSSNIISEIKTSSFPRMQLKYLNLSNNRITTLEAGCFDNLSSS
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 LLVVKLNRNRMSMIPPKIFKLPHLQFLELKRNRIKIVEGLTFQGLDSLRSLKMQRNGISK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLVVKLNRNRMSMIPPKIFKLPHLQFLELKRNRIKIVEGLTFQGLDSLRSLKMQRNGISK
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 LKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWLYGLRMLQQLYVSQNAIERISPDAWEFCQRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWLYGLRMLQQLYVSQNAIERISPDAWEFCQRL
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 SELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRVTHIADGVFRFLSNLQTLDLRNNEISW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRVTHIADGVFRFLSNLQTLDLRNNEISW
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 AIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFIGLESLEHLDLNNNAIMSIQENAFSQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFIGLESLEHLDLNNNAIMSIQENAFSQT
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 HLKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQHSVNVSCAHPEWLAGQSILNVDLKDFVCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HLKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQHSVNVSCAHPEWLAGQSILNVDLKDFVCD
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 DFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTCTAVSSSDSPMSTVWRKDSEILYDVDTENFVRYWQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTCTAVSSSDSPMSTVWRKDSEILYDVDTENFVRYWQ
400 410 420 430 440 450
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 QAGEALEYTSILHLFNVNFTDEGKYQCIVTNHFGSNYSQKAKLTVNEMPSFLKTPMDLTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QAGEALEYTSILHLFNVNFTDEGKYQCIVTNHFGSNYSQKAKLTVNEMPSFLKTPMDLTI
460 470 480 490 500 510
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 RTGAMARLECAAEGHPAPQISWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDDVFFIANVKIEDMGIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RTGAMARLECAAEGHPAPQISWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDDVFFIANVKIEDMGIY
520 530 540 550 560 570
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 SCMAQNTAGGLSANASLTVLETPSFIRPLEDKTVTRGETAVLQCIAGGSPAPRLNWTKDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SCMAQNTAGGLSANASLTVLETPSFIRPLEDKTVTRGETAVLQCIAGGSPAPRLNWTKDD
580 590 600 610 620 630
740 750 760 770 780 790
pF1KA0 GPLLVTERHFFAAANQLLIIVDAGLEDAGKYTCIMSNTLGTERGHIYLNVISSPNCDSSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPLLVTERHFFAAANQLLIIVDAGLEDAGKYTCIMSNTLGTERGHIYLNVISSPNCDSSQ
640 650 660 670 680 690
800 810 820 830 840 850
pF1KA0 SSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGTSLIWVIVIYHMRRKNEDYSITNTEELNLPADIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGTSLIWVIVIYHMRRKNEDYSITNTEELNLPADIP
700 710 720 730 740 750
860 870 880 890 900 910
pF1KA0 SYLSSQGTLSEPQEGYSNSEAGSHQQLMPPANGYIHKGTDGGTGTRVICSDCYDNANIYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SYLSSQGTLSEPQEGYSNSEAGSHQQLMPPANGYIHKGTDGGTGTRVICSDCYDNANIYS
760 770 780 790 800 810
920 930 940 950 960 970
pF1KA0 RTREYCPYTYIAEEDVLDQTLSSLMVQMPKETYLVHPPQDTTALESLIPSANREPSAFPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RTREYCPYTYIAEEDVLDQTLSSLMVQMPKETYLVHPPQDTTALESLIPSANREPSAFPT
820 830 840 850 860 870
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA0 NHERISEKKLPSTQMSGETLQRPVWNINRELGLPHPPFSQQPVHESPQLHQNEGLAGREP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NHERISEKKLPSTQMSGETLQRPVWNINRELGLPHPPFSQQPVHESPQLHQNEGLAGREP
880 890 900 910 920 930
1040 1050 1060
pF1KA0 DCSASSMSCHRLQDHAFDFSRTRNIQDGSEGT
::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DCSASSMSCHRLQDHAFDFSRTRNIQDGSEGT
940 950 960
>>NP_700356 (OMIM: 608870) leucine-rich repeats and immu (1119 aa)
initn: 3241 init1: 1847 opt: 3833 Z-score: 2092.1 bits: 398.9 E(85289): 8.6e-110
Smith-Waterman score: 3833; 61.8% identity (82.9% similar) in 946 aa overlap (43-975:47-975)
20 30 40 50 60
pF1KA0 LLGCRSRVLSRLLFIAQTALLLLPAAGAGLCPAPCSCRIPLLDCSRRKL-----PAPSWR
::. : : ::::::..: : :::
NP_700 LCAVLGRAGRSDSGGRGELGQPSGVAAERPCPTTCRCLGDLLDCSRKRLARLPEPLPSW-
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ALSGLLPPDTAILDFSHNRLSNWNISLES--QTLQEVKMNYNELTEIPYFGEPTSNITLL
.: ::.:::::: . : : :.:.:::.: ::: :: .: ..:::::
NP_700 ---------VARLDLSHNRLSFIKASSMSHLQSLREVKLNNNELETIPNLGPVSANITLL
80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 SLVHNIIPEINAQALQFYPALESLDLSSNIISEIKTSSFPRMQLKYLNLSNNRITTLEAG
::. : : :: . :. . .::.:::::: :::..:. :: .::::: :..::.:..: :
NP_700 SLAGNRIVEILPEHLKEFQSLETLDLSSNNISELQTA-FPALQLKYLYLNSNRVTSMEPG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 CFDNLSSSLLVVKLNRNRMSMIPPKIFKLPHLQFLELKRNRIKIVEGLTFQGLDSLRSLK
::::...:::.::::::.: ::::.::::.:: :::.::.:: :.::::::: .:.:::
NP_700 YFDNLANTLLVLKLNRNRISAIPPKMFKLPQLQHLELNRNKIKNVDGLTFQGLGALKSLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 MQRNGISKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWLYGLRMLQQLYVSQNAIERISPD
:::::..:: ::::.::.::: :.:.:::::...::::::: :::.:..:::::.:::::
NP_700 MQRNGVTKLMDGAFWGLSNMEILQLDHNNLTEITKGWLYGLLMLQELHLSQNAINRISPD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 AWEFCQRLSELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRVTHIADGVFRFLSNLQTLD
::::::.::::::..:.:.:::.:.:.:::::. :..:.:::..::: .:: ::.:.:::
NP_700 AWEFCQKLSELDLTFNHLSRLDDSSFLGLSLLNTLHIGNNRVSYIADCAFRGLSSLKTLD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LRNNEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFIGLESLEHLDLNNNAIMSI
:.::::::.::: . ::.:: .: .::::::.:.::::::: ::..::::::..:::::.
NP_700 LKNNEISWTIEDMNGAFSGLDKLRRLILQGNRIRSITKKAFTGLDALEHLDLSDNAIMSL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 QENAFSQTH-LKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQHSVNVSCAHPEWLAGQSILN
: ::::: . :..: ::::::::::.:::: ::...:::: ::.:::::. : :.::.
NP_700 QGNAFSQMKKLQQLHLNTSSLLCDCQLKWLPQWVAENNFQSFVNASCAHPQLLKGRSIFA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 VDLKDFVCDDFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTCTAVSSSDSPMSTVWRKDSEILYDVD
:. :::::: :::: ..::: :..: :... :.:.:::::::. .:.::.:.:.:..
NP_700 VSPDGFVCDDFPKPQITVQPETQSAIKGSNLSFICSAASSSDSPMTFAWKKDNELLHDAE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 TENFVRYWQQAGEALEYTSILHLFNVNFTDEGKYQCIVTNHFGSNYSQKAKLTVNEMPSF
::... :.::..:::.::.: .:.:..::::::...:::::.:: ::::::: .:::
NP_700 MENYAHLRAQGGEVMEYTTILRLREVEFASEGKYQCVISNHFGSSYSVKAKLTVNMLPSF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LKTPMDLTIRTGAMARLECAAEGHPAPQISWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDDVFFIAN
:::::::::.:::::::::: :::::::.::::::::::::::::::::::::::::..
NP_700 TKTPMDLTIRAGAMARLECAAVGHPAPQIAWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDDVFFIVD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 VKIEDMGIYSCMAQNTAGGLSANASLTVLETPSFIRPLEDKTVTRGETAVLQCIAGGSPA
:::::.:.::: :::.::..::::.:::::::::.::: :.:::.::::::::::::::
NP_700 VKIEDIGVYSCTAQNSAGSISANATLTVLETPSFLRPLLDRTVTKGETAVLQCIAGGSPP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 PRLNWTKDDGPLLVTERHFFAAANQLLIIVDAGLEDAGKYTCIMSNTLGTERGHIYLNVI
:.:::::::.::.:::::::::.::::::::. . ::::::: ::::::::::.. :.::
NP_700 PKLNWTKDDSPLVVTERHFFAAGNQLLIIVDSDVSDAGKYTCEMSNTLGTERGNVRLSVI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 SSPNCDSSQ-SSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGTSLIWVIVIYHMRRKNEDYSITNT
.:.::: : .. . .::::.:::.:::.::::::::::.::..::: ::.::: :::::
NP_700 PTPTCDSPQMTAPSLDDDGWATVGVVIIAVVCCVVGTSLVWVVIIYHTRRRNEDCSITNT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 EELNLPADIPSYLSSQGTLSEPQEGYSNSEAGSHQQLMPPANGYIHKGTDGGTGTRVICS
.: ::::::::::::::::.. :.:: .::.:::.:.. ... . ..:: :
NP_700 DETNLPADIPSYLSSQGTLADRQDGYVSSESGSHHQFVTSSGAGFFLPQHDSSGT---CH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950
pF1KA0 -DCYDNANIYSRTREY-CPYTYIAEEDVLDQTLSSLMVQMPKETYLV--HPPQDTTALES
: ..:.. . : . ::. . : .... . : ::: . : :. ..
NP_700 IDNSSEADVEAATDLFLCPFLGSTGPMYLK---GNVYGSDPFETYHTGCSPDPRTVLMDH
910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 LIPSANREPSAFPTNHERISEKKLPSTQMSGETLQRPVWNINRELGLPHPPFSQQPVHES
:: .. .: .:
NP_700 YEPSYIKKKECYPCSHPSEESCERSFSNISWPSHVRKLLNTSYSHNEGPGMKNLCLNKSS
960 970 980 990 1000 1010
>>XP_011536195 (OMIM: 608870) PREDICTED: leucine-rich re (1041 aa)
initn: 3113 init1: 1847 opt: 3749 Z-score: 2047.1 bits: 390.5 E(85289): 2.7e-107
Smith-Waterman score: 3749; 62.8% identity (84.5% similar) in 904 aa overlap (80-975:1-897)
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 RIPLLDCSRRKLPAPSWRALSGLLPPDTAILDFSHNRLSNWNISLES--QTLQEVKMNYN
.:.:::::: . : : :.:.:::.: :
XP_011 MDLSHNRLSFIKASSMSHLQSLREVKLNNN
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 ELTEIPYFGEPTSNITLLSLVHNIIPEINAQALQFYPALESLDLSSNIISEIKTSSFPRM
:: :: .: ..:::::::. : : :: . :. . .::.:::::: :::..:. :: .
XP_011 ELETIPNLGPVSANITLLSLAGNRIVEILPEHLKEFQSLETLDLSSNNISELQTA-FPAL
40 50 60 70 80
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 QLKYLNLSNNRITTLEAGCFDNLSSSLLVVKLNRNRMSMIPPKIFKLPHLQFLELKRNRI
::::: :..::.:..: : ::::...:::.::::::.: ::::.::::.:: :::.::.:
XP_011 QLKYLYLNSNRVTSMEPGYFDNLANTLLVLKLNRNRISAIPPKMFKLPQLQHLELNRNKI
90 100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 KIVEGLTFQGLDSLRSLKMQRNGISKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWLYGLR
: :.::::::: .:.::::::::..:: ::::.::.::: :.:.:::::...:::::::
XP_011 KNVDGLTFQGLGALKSLKMQRNGVTKLMDGAFWGLSNMEILQLDHNNLTEITKGWLYGLL
150 160 170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 MLQQLYVSQNAIERISPDAWEFCQRLSELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRV
:::.:..:::::.:::::::::::.::::::..:.:.:::.:.:.:::::. :..:.:::
XP_011 MLQELHLSQNAINRISPDAWEFCQKLSELDLTFNHLSRLDDSSFLGLSLLNTLHIGNNRV
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 THIADGVFRFLSNLQTLDLRNNEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFI
..::: .:: ::.:.::::.::::::.::: . ::.:: .: .::::::.:.:::::::
XP_011 SYIADCAFRGLSSLKTLDLKNNEISWTIEDMNGAFSGLDKLRRLILQGNRIRSITKKAFT
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 GLESLEHLDLNNNAIMSIQENAFSQTH-LKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQHS
::..::::::..:::::.: ::::: . :..: ::::::::::.:::: ::...::::
XP_011 GLDALEHLDLSDNAIMSLQGNAFSQMKKLQQLHLNTSSLLCDCQLKWLPQWVAENNFQSF
330 340 350 360 370 380
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 VNVSCAHPEWLAGQSILNVDLKDFVCDDFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTCTAVSSSD
::.:::::. : :.::. :. :::::: :::: ..::: :..: :... :.:.::::
XP_011 VNASCAHPQLLKGRSIFAVSPDGFVCDDFPKPQITVQPETQSAIKGSNLSFICSAASSSD
390 400 410 420 430 440
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 SPMSTVWRKDSEILYDVDTENFVRYWQQAGEALEYTSILHLFNVNFTDEGKYQCIVTNHF
:::. .:.::.:.:.:.. ::... :.::..:::.::.: .:.:..::::::...:::
XP_011 SPMTFAWKKDNELLHDAEMENYAHLRAQGGEVMEYTTILRLREVEFASEGKYQCVISNHF
450 460 470 480 490 500
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 GSNYSQKAKLTVNEMPSFLKTPMDLTIRTGAMARLECAAEGHPAPQISWQKDGGTDFPAA
::.:: ::::::: .::: :::::::::.:::::::::: :::::::.::::::::::::
XP_011 GSSYSVKAKLTVNMLPSFTKTPMDLTIRAGAMARLECAAVGHPAPQIAWQKDGGTDFPAA
510 520 530 540 550 560
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 RERRMHVMPEDDVFFIANVKIEDMGIYSCMAQNTAGGLSANASLTVLETPSFIRPLEDKT
::::::::::::::::..:::::.:.::: :::.::..::::.:::::::::.::: :.:
XP_011 RERRMHVMPEDDVFFIVDVKIEDIGVYSCTAQNSAGSISANATLTVLETPSFLRPLLDRT
570 580 590 600 610 620
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 VTRGETAVLQCIAGGSPAPRLNWTKDDGPLLVTERHFFAAANQLLIIVDAGLEDAGKYTC
::.:::::::::::::: :.:::::::.::.:::::::::.::::::::. . :::::::
XP_011 VTKGETAVLQCIAGGSPPPKLNWTKDDSPLVVTERHFFAAGNQLLIIVDSDVSDAGKYTC
630 640 650 660 670 680
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 IMSNTLGTERGHIYLNVISSPNCDSSQ-SSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGTSLIWV
::::::::::.. :.:: .:.::: : .. . .::::.:::.:::.::::::::::.::
XP_011 EMSNTLGTERGNVRLSVIPTPTCDSPQMTAPSLDDDGWATVGVVIIAVVCCVVGTSLVWV
690 700 710 720 730 740
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 IVIYHMRRKNEDYSITNTEELNLPADIPSYLSSQGTLSEPQEGYSNSEAGSHQQLMPPAN
..::: ::.::: :::::.: ::::::::::::::::.. :.:: .::.:::.:.. ..
XP_011 VIIYHTRRRNEDCSITNTDETNLPADIPSYLSSQGTLADRQDGYVSSESGSHHQFVTSSG
750 760 770 780 790 800
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 GYIHKGTDGGTGTRVICS-DCYDNANIYSRTREY-CPYTYIAEEDVLDQTLSSLMVQMPK
. . ..:: : : ..:.. . : . ::. . : .... . :
XP_011 AGFFLPQHDSSGT---CHIDNSSEADVEAATDLFLCPFLGSTGPMYLK---GNVYGSDPF
810 820 830 840 850 860
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 ETYLV--HPPQDTTALESLIPSANREPSAFPTNHERISEKKLPSTQMSGETLQRPVWNIN
::: . : :. .. :: .. .: .:
XP_011 ETYHTGCSPDPRTVLMDHYEPSYIKKKECYPCSHPSEESCERSFSNISWPSHVRKLLNTS
870 880 890 900 910 920
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA0 RELGLPHPPFSQQPVHESPQLHQNEGLAGREPDCSASSMSCHRLQDHAFDFSRTRNIQDG
XP_011 YSHNEGPGMKNLCLNKSSLDFSANPEPASVASSNSFMGTFGKALRRPHLDAYSSFGQPSD
930 940 950 960 970 980
>>XP_016858441 (OMIM: 608869,615112) PREDICTED: leucine- (553 aa)
initn: 3741 init1: 3741 opt: 3741 Z-score: 2045.6 bits: 389.3 E(85289): 3.3e-107
Smith-Waterman score: 3741; 100.0% identity (100.0% similar) in 553 aa overlap (513-1065:1-553)
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 LNVDLKDFVCDDFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTCTAVSSSDSPMSTVWRKDSEILYD
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MNVTLTCTAVSSSDSPMSTVWRKDSEILYD
10 20 30
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 VDTENFVRYWQQAGEALEYTSILHLFNVNFTDEGKYQCIVTNHFGSNYSQKAKLTVNEMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VDTENFVRYWQQAGEALEYTSILHLFNVNFTDEGKYQCIVTNHFGSNYSQKAKLTVNEMP
40 50 60 70 80 90
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 SFLKTPMDLTIRTGAMARLECAAEGHPAPQISWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDDVFFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SFLKTPMDLTIRTGAMARLECAAEGHPAPQISWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDDVFFI
100 110 120 130 140 150
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 ANVKIEDMGIYSCMAQNTAGGLSANASLTVLETPSFIRPLEDKTVTRGETAVLQCIAGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ANVKIEDMGIYSCMAQNTAGGLSANASLTVLETPSFIRPLEDKTVTRGETAVLQCIAGGS
160 170 180 190 200 210
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 PAPRLNWTKDDGPLLVTERHFFAAANQLLIIVDAGLEDAGKYTCIMSNTLGTERGHIYLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PAPRLNWTKDDGPLLVTERHFFAAANQLLIIVDAGLEDAGKYTCIMSNTLGTERGHIYLN
220 230 240 250 260 270
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 VISSPNCDSSQSSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGTSLIWVIVIYHMRRKNEDYSITN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VISSPNCDSSQSSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGTSLIWVIVIYHMRRKNEDYSITN
280 290 300 310 320 330
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 TEELNLPADIPSYLSSQGTLSEPQEGYSNSEAGSHQQLMPPANGYIHKGTDGGTGTRVIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TEELNLPADIPSYLSSQGTLSEPQEGYSNSEAGSHQQLMPPANGYIHKGTDGGTGTRVIC
340 350 360 370 380 390
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 SDCYDNANIYSRTREYCPYTYIAEEDVLDQTLSSLMVQMPKETYLVHPPQDTTALESLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SDCYDNANIYSRTREYCPYTYIAEEDVLDQTLSSLMVQMPKETYLVHPPQDTTALESLIP
400 410 420 430 440 450
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 SANREPSAFPTNHERISEKKLPSTQMSGETLQRPVWNINRELGLPHPPFSQQPVHESPQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SANREPSAFPTNHERISEKKLPSTQMSGETLQRPVWNINRELGLPHPPFSQQPVHESPQL
460 470 480 490 500 510
1030 1040 1050 1060
pF1KA0 HQNEGLAGREPDCSASSMSCHRLQDHAFDFSRTRNIQDGSEGT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HQNEGLAGREPDCSASSMSCHRLQDHAFDFSRTRNIQDGSEGT
520 530 540 550
>>NP_001129523 (OMIM: 608870) leucine-rich repeats and i (1059 aa)
initn: 3113 init1: 1847 opt: 3746 Z-score: 2045.5 bits: 390.2 E(85289): 3.4e-107
Smith-Waterman score: 3746; 62.9% identity (84.5% similar) in 903 aa overlap (81-975:20-915)
60 70 80 90 100
pF1KA0 IPLLDCSRRKLPAPSWRALSGLLPPDTAILDFSHNRLSNWNISLES--QTLQEVKMNYNE
:.:::::: . : : :.:.:::.: ::
NP_001 MVDVLLLFSLCLLFHISRPDLSHNRLSFIKASSMSHLQSLREVKLNNNE
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 LTEIPYFGEPTSNITLLSLVHNIIPEINAQALQFYPALESLDLSSNIISEIKTSSFPRMQ
: :: .: ..:::::::. : : :: . :. . .::.:::::: :::..:. :: .:
NP_001 LETIPNLGPVSANITLLSLAGNRIVEILPEHLKEFQSLETLDLSSNNISELQTA-FPALQ
50 60 70 80 90 100
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 LKYLNLSNNRITTLEAGCFDNLSSSLLVVKLNRNRMSMIPPKIFKLPHLQFLELKRNRIK
:::: :..::.:..: : ::::...:::.::::::.: ::::.::::.:: :::.::.::
NP_001 LKYLYLNSNRVTSMEPGYFDNLANTLLVLKLNRNRISAIPPKMFKLPQLQHLELNRNKIK
110 120 130 140 150 160
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 IVEGLTFQGLDSLRSLKMQRNGISKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWLYGLRM
:.::::::: .:.::::::::..:: ::::.::.::: :.:.:::::...::::::: :
NP_001 NVDGLTFQGLGALKSLKMQRNGVTKLMDGAFWGLSNMEILQLDHNNLTEITKGWLYGLLM
170 180 190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 LQQLYVSQNAIERISPDAWEFCQRLSELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRVT
::.:..:::::.:::::::::::.::::::..:.:.:::.:.:.:::::. :..:.:::.
NP_001 LQELHLSQNAINRISPDAWEFCQKLSELDLTFNHLSRLDDSSFLGLSLLNTLHIGNNRVS
230 240 250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 HIADGVFRFLSNLQTLDLRNNEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFIG
.::: .:: ::.:.::::.::::::.::: . ::.:: .: .::::::.:.::::::: :
NP_001 YIADCAFRGLSSLKTLDLKNNEISWTIEDMNGAFSGLDKLRRLILQGNRIRSITKKAFTG
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 LESLEHLDLNNNAIMSIQENAFSQTH-LKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQHSV
:..::::::..:::::.: ::::: . :..: ::::::::::.:::: ::...:::: :
NP_001 LDALEHLDLSDNAIMSLQGNAFSQMKKLQQLHLNTSSLLCDCQLKWLPQWVAENNFQSFV
350 360 370 380 390 400
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 NVSCAHPEWLAGQSILNVDLKDFVCDDFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTCTAVSSSDS
:.:::::. : :.::. :. :::::: :::: ..::: :..: :... :.:.:::::
NP_001 NASCAHPQLLKGRSIFAVSPDGFVCDDFPKPQITVQPETQSAIKGSNLSFICSAASSSDS
410 420 430 440 450 460
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 PMSTVWRKDSEILYDVDTENFVRYWQQAGEALEYTSILHLFNVNFTDEGKYQCIVTNHFG
::. .:.::.:.:.:.. ::... :.::..:::.::.: .:.:..::::::...::::
NP_001 PMTFAWKKDNELLHDAEMENYAHLRAQGGEVMEYTTILRLREVEFASEGKYQCVISNHFG
470 480 490 500 510 520
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 SNYSQKAKLTVNEMPSFLKTPMDLTIRTGAMARLECAAEGHPAPQISWQKDGGTDFPAAR
:.:: ::::::: .::: :::::::::.:::::::::: :::::::.:::::::::::::
NP_001 SSYSVKAKLTVNMLPSFTKTPMDLTIRAGAMARLECAAVGHPAPQIAWQKDGGTDFPAAR
530 540 550 560 570 580
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 ERRMHVMPEDDVFFIANVKIEDMGIYSCMAQNTAGGLSANASLTVLETPSFIRPLEDKTV
:::::::::::::::..:::::.:.::: :::.::..::::.:::::::::.::: :.::
NP_001 ERRMHVMPEDDVFFIVDVKIEDIGVYSCTAQNSAGSISANATLTVLETPSFLRPLLDRTV
590 600 610 620 630 640
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 TRGETAVLQCIAGGSPAPRLNWTKDDGPLLVTERHFFAAANQLLIIVDAGLEDAGKYTCI
:.:::::::::::::: :.:::::::.::.:::::::::.::::::::. . :::::::
NP_001 TKGETAVLQCIAGGSPPPKLNWTKDDSPLVVTERHFFAAGNQLLIIVDSDVSDAGKYTCE
650 660 670 680 690 700
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 MSNTLGTERGHIYLNVISSPNCDSSQ-SSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGTSLIWVI
::::::::::.. :.:: .:.::: : .. . .::::.:::.:::.::::::::::.::.
NP_001 MSNTLGTERGNVRLSVIPTPTCDSPQMTAPSLDDDGWATVGVVIIAVVCCVVGTSLVWVV
710 720 730 740 750 760
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 VIYHMRRKNEDYSITNTEELNLPADIPSYLSSQGTLSEPQEGYSNSEAGSHQQLMPPANG
.::: ::.::: :::::.: ::::::::::::::::.. :.:: .::.:::.:.. ...
NP_001 IIYHTRRRNEDCSITNTDETNLPADIPSYLSSQGTLADRQDGYVSSESGSHHQFVTSSGA
770 780 790 800 810 820
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 YIHKGTDGGTGTRVICS-DCYDNANIYSRTREY-CPYTYIAEEDVLDQTLSSLMVQMPKE
. ..:: : : ..:.. . : . ::. . : .... . : :
NP_001 GFFLPQHDSSGT---CHIDNSSEADVEAATDLFLCPFLGSTGPMYLK---GNVYGSDPFE
830 840 850 860 870 880
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pF1KA0 TYLV--HPPQDTTALESLIPSANREPSAFPTNHERISEKKLPSTQMSGETLQRPVWNINR
:: . : :. .. :: .. .: .:
NP_001 TYHTGCSPDPRTVLMDHYEPSYIKKKECYPCSHPSEESCERSFSNISWPSHVRKLLNTSY
890 900 910 920 930 940
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA0 ELGLPHPPFSQQPVHESPQLHQNEGLAGREPDCSASSMSCHRLQDHAFDFSRTRNIQDGS
NP_001 SHNEGPGMKNLCLNKSSLDFSANPEPASVASSNSFMGTFGKALRRPHLDAYSSFGQPSDC
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MAPAPLGVPEEQLLGCRSRVLSRLLFIAQTALLLLPAAGAGLCPAPCSCRIPLLDCSRRK
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LPAPSWRALSGLLPPDTAILDFSHNRLSNWNISLESQTLQEVKMNYNELTEIPYFGEPTS
70 80 90 100 110 120
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pF1KA0 NITLLSLVHNIIPEINAQALQFYPALESLDLSSNIISEIKTSSFPRMQLKYLNLSNNRIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NITLLSLVHNIIPEINAQALQFYPALESLDLSSNIISEIKTSSFPRMQLKYLNLSNNRIT
130 140 150 160 170 180
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pF1KA0 TLEAGCFDNLSSSLLVVKLNRNRMSMIPPKIFKLPHLQFLELKRNRIKIVEGLTFQGLDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TLEAGCFDNLSSSLLVVKLNRNRMSMIPPKIFKLPHLQFLELKRNRIKIVEGLTFQGLDS
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pF1KA0 LRSLKMQRNGISKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWLYGLRMLQQLYVSQNAIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LRSLKMQRNGISKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWLYGLRMLQQLYVSQNAIE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RISPDAWEFCQRLSELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRVTHIADGVFRFLSN
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pF1KA0 LQTLDLRNNEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFIGLESLEHLDLNNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LQTLDLRNNEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFIGLESLEHLDLNNN
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pF1KA0 AIMSIQENAFSQTHLKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQHSVNVSCAHPEWLAGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AIMSIQENAFSQTHLKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQHSVNVSCAHPEWLAGQ
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::::::::::::
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:
XP_005 -----------------------------------------------------------E
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MPSFLKTPMDLTIRTGAMARLECAAEGHPAPQISWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDDVF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FIANVKIEDMGIYSCMAQNTAGGLSANASLTVLETPSFIRPLEDKTVTRGETAVLQCIAG
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pF1KA0 GSPAPRLNWTKDDGPLLVTERHFFAAANQLLIIVDAGLEDAGKYTCIMSNTLGTERGHIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GSPAPRLNWTKDDGPLLVTERHFFAAANQLLIIVDAGLEDAGKYTCIMSNTLGTERGHIY
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pF1KA0 LNVISSPNCDSSQSSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGTSLIWVIVIYHMRRKNEDYSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LNVISSPNCDSSQSSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGTSLIWVIVIYHMRRKNEDYSI
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pF1KA0 TNTEELNLPADIPSYLSSQGTLSEPQEGYSNSEAGSHQQLMPPANGYIHKGTDGGTGTRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TNTEELNLPADIPSYLSSQGTLSEPQEGYSNSEAGSHQQLMPPANGYIHKGTDGGTGTRV
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pF1KA0 ICSDCYDNANIYSRTREYCPYTYIAEEDVLDQTLSSLMVQMPKETYLVHPPQDTTALESL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ICSDCYDNANIYSRTREYCPYTYIAEEDVLDQTLSSLMVQMPKETYLVHPPQDTTALESL
800 810 820 830 840 850
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pF1KA0 IPSANREPSAFPTNHERISEKKLPSTQMSGETLQRPVWNINRELGLPHPPFSQQPVHESP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IPSANREPSAFPTNHERISEKKLPSTQMSGETLQRPVWNINRELGLPHPPFSQQPVHESP
860 870 880 890 900 910
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pF1KA0 QLHQNEGLAGREPDCSASSMSCHRLQDHAFDFSRTRNIQDGSEGT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QLHQNEGLAGREPDCSASSMSCHRLQDHAFDFSRTRNIQDGSEGT
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>>NP_056356 (OMIM: 608868) leucine-rich repeats and immu (1093 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KA0 MAPAPLGVPEEQLLGCRSRVLSRLLFIAQTALLLLPA-AGAGL---CPAPCSCRIPLLDC
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10 20 30 40 50
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pF1KA0 SRRKLPAPSWRALSGLLPPDTAILDFSHNRLSNWN-ISLES-QTLQEVKMNYNELTEIPY
. : : : : : :: : :..:.:.::. . ..:. .:::: .: :::: .:
NP_056 GGRGLAA-----LPGDLPSWTRSLNLSYNKLSEIDPAGFEDLPNLQEVYLNNNELTAVPS
60 70 80 90 100
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pF1KA0 FGEPTSNITLLSLVHNIIPEINAQALQFYPALESLDLSSNIISEIKTSSFPRMQ-LKYLN
.: .:... : : :: : .... :. : .:: :::: : :.:.... ::. .: ::
NP_056 LGAASSHVVSLFLQHNKIRSVEGSQLKAYLSLEVLDLSLNNITEVRNTCFPHGPPIKELN
110 120 130 140 150 160
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pF1KA0 LSNNRITTLEAGCFDNLSSSLLVVKLNRNRMSMIPPKIFKLPHLQFLELKRNRIKIVEGL
:..::: ::: : ::.:: :::...:..::....: . ::::.: :.:.::::...:::
NP_056 LAGNRIGTLELGAFDGLSRSLLTLRLSKNRITQLPVRAFKLPRLTQLDLNRNRIRLIEGL
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pF1KA0 TFQGLDSLRSLKMQRNGISKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWLYGLRMLQQLY
:::::.::. ::.:::.:::: ::::.::..:. :.::.:.:..::.: :::: :.::.
NP_056 TFQGLNSLEVLKLQRNNISKLTDGAFWGLSKMHVLHLEYNSLVEVNSGSLYGLTALHQLH
230 240 250 260 270 280
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pF1KA0 VSQNAIERISPDAWEFCQRLSELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRVTHIADG
.:.:.: :: .: :::.: :: ::.:.:::::: ... :: : : :. : ..:::.:
NP_056 LSNNSIARIHRKGWSFCQKLHELVLSFNNLTRLDEESLAELSSLSVLRLSHNSISHIAEG
290 300 310 320 330 340
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pF1KA0 VFRFLSNLQTLDLRNNEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFIGLESLE
.:. : .:..::: .:::: .:::.: ::.:: ::.:: : ::.:::..:.:: :::.::
NP_056 AFKGLRSLRVLDLDHNEISGTIEDTSGAFSGLDSLSKLTLFGNKIKSVAKRAFSGLEGLE
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420 430 440 450 460 470
pF1KA0 HLDLNNNAIMSIQENAFSQT-HLKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQHSVNVSCA
::.:..::: :.: .:: . .:::: ....:.::::.:::: ::. .: :...::
NP_056 HLNLGGNAIRSVQFDAFVKMKNLKELHISSDSFLCDCQLKWLPPWLIGRMLQAFVTATCA
410 420 430 440 450 460
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pF1KA0 HPEWLAGQSILNVDLKDFVCDDFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTCTAVSSSDSPMSTV
::: : ::::..: ..::::::::::: :.::: .:. : .. .::.:.:::.:::. .
NP_056 HPESLKGQSIFSVPPESFVCDDFLKPQIITQPETTMAMVGKDIRFTCSAASSSSSPMTFA
470 480 490 500 510 520
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pF1KA0 WRKDSEILYDVDTENFVRYWQQAGEALEYTSILHLFNVNFTDEGKYQCIVTNHFGSNYSQ
:.::.:.: ..: ::::. : ::..:::.:::: .:.: ::.:::..::::::.::.
NP_056 WKKDNEVLTNADMENFVHVHAQDGEVMEYTTILHLRQVTFGHEGRYQCVITNHFGSTYSH
530 540 550 560 570 580
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pF1KA0 KAKLTVNEMPSFLKTPMDLTIRTGAMARLECAAEGHPAPQISWQKDGGTDFPAARERRMH
::.:::: .::: ::: :.:::: .:::::::: ::: :::.::::::::::::::::::
NP_056 KARLTVNVLPSFTKTPHDITIRTTTMARLECAATGHPNPQIAWQKDGGTDFPAARERRMH
590 600 610 620 630 640
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pF1KA0 VMPEDDVFFIANVKIEDMGIYSCMAQNTAGGLSANASLTVLETPSFIRPLEDKTVTRGET
:::.::::::..:::.: :.::: :::.::..::::.::::::::.. ::::..:. :::
NP_056 VMPDDDVFFITDVKIDDAGVYSCTAQNSAGSISANATLTVLETPSLVVPLEDRVVSVGET
650 660 670 680 690 700
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pF1KA0 AVLQCIAGGSPAPRLNWTKDDGPLLVTERHFFAAANQLLIIVDAGLEDAGKYTCIMSNTL
..::: : :.: ::..: : : :: .:::: .. ::::.. .. ::::.::: :::::
NP_056 VALQCKATGNPPPRITWFKGDRPLSLTERHHLTPDNQLLVVQNVVAEDAGRYTCEMSNTL
710 720 730 740 750 760
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pF1KA0 GTERGHIYLNVISSPNCDSSQSSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGTSLIWVIVIYHMR
::::.: :.:. . .: . :: ::::: :.:: .: :::.:: .::. :
NP_056 GTERAHSQLSVLPAAGC---------RKDG-TTVGIFTIAVVSSIVLTSLVWVCIIYQTR
770 780 790 800 810
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pF1KA0 RKNEDYSITNTEELNLPADIPSYLSSQGTLSEPQEGYSNSEAGSHQQLMPPANGY-----
.:.:.::.:::.: .: :.:::::::::::. :: .:.: . . .::
NP_056 KKSEEYSVTNTDETVVPPDVPSYLSSQGTLSDRQETVVRTEGGPQANGHIESNGVCPRDA
820 830 840 850 860 870
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pF1KA0 -----------------------IHK----------GTDGGT----GTRVICSDCYDNAN
:: :: : : ::.:::: ...
NP_056 SHFPEPDTHSVACRQPKLCAGSAYHKEPWKAMEKAEGTPGPHKMEHGGRVVCSDCNTEVD
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920 930 940 950 960 970
pF1KA0 IYSRTREYCPYTYIAEEDVLDQTLSSLMVQMPKETYLVHPPQDTTALESLIPSANREPSA
::: . . : ...... .. .. : . : :. . . . . :
NP_056 CYSRGQAFHPQP-VSRDSAQPSAPNG---PEPGGSDQEHSPHHQCSRTAAGSCPECQGSL
940 950 960 970 980 990
980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 FPTNHERI--SEKKLPSTQMSGETLQRPVWNINRELGLPHPPFSQ-QPVHE----SPQLH
.:.::.:. . :: : ....:. :.. : : :: .. ::. ::.
NP_056 YPSNHDRMLTAVKKKPMASLDGK--GDSSWTLAR---LYHPDSTELQPASSLTSGSPERA
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1030 1040 1050 1060
pF1KA0 QNEGL---AGREPD-CSASSMSCHRLQDHAFDFSRTRNIQDGSEGT
. . : :. : :.:: :
NP_056 EAQYLLVSNGHLPKACDASPESTPLTGQLPGKQRVPLLLAPKS
1060 1070 1080 1090
>>XP_016861623 (OMIM: 608868) PREDICTED: leucine-rich re (1068 aa)
initn: 2593 init1: 1588 opt: 2632 Z-score: 1444.5 bits: 279.0 E(85289): 1e-73
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10 20 30 40 50
pF1KA0 MAPAPLGVPEEQLLGCRSRVLSRLLFIAQTALLLLPA-AGAGL---CPAPCSCRIPLLDC
::.. : : :. :.:: : : :.: :::
XP_016 MARPVRGGLGAPRRSPCLLLLWLLLLRLEPVTAAAGPRAPCAAACTCAGDSLDC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 SRRKLPAPSWRALSGLLPPDTAILDFSHNRLSNWNISLESQTLQEVKMNYNELTEIPYFG
. : : : :: : : .:. :: ...::.:.:: :
XP_016 GGRGLAA---------LPGD----------LPSWTRSL--------NLSYNKLSEIDPAG
60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 -EPTSNITLLSLVHNIIPEINAQALQFYPALESLDLSSNIISEIKTSSFPRMQ-LKYLNL
: : : . :: : .... :. : .:: :::: : :.:.... ::. .: :::
XP_016 FEDLPN--LQEVQHNKIRSVEGSQLKAYLSLEVLDLSLNNITEVRNTCFPHGPPIKELNL
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 SNNRITTLEAGCFDNLSSSLLVVKLNRNRMSMIPPKIFKLPHLQFLELKRNRIKIVEGLT
..::: ::: : ::.:: :::...:..::....: . ::::.: :.:.::::...::::
XP_016 AGNRIGTLELGAFDGLSRSLLTLRLSKNRITQLPVRAFKLPRLTQLDLNRNRIRLIEGLT
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 FQGLDSLRSLKMQRNGISKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWLYGLRMLQQLYV
::::.::. ::.:::.:::: ::::.::..:. :.::.:.:..::.: :::: :.::..
XP_016 FQGLNSLEVLKLQRNNISKLTDGAFWGLSKMHVLHLEYNSLVEVNSGSLYGLTALHQLHL
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 SQNAIERISPDAWEFCQRLSELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRVTHIADGV
:.:.: :: .: :::.: :: ::.:.:::::: ... :: : : :. : ..:::.:.
XP_016 SNNSIARIHRKGWSFCQKLHELVLSFNNLTRLDEESLAELSSLSVLRLSHNSISHIAEGA
270 280 290 300 310 320
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pF1KA0 FRFLSNLQTLDLRNNEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFIGLESLEH
:. : .:..::: .:::: .:::.: ::.:: ::.:: : ::.:::..:.:: :::.:::
XP_016 FKGLRSLRVLDLDHNEISGTIEDTSGAFSGLDSLSKLTLFGNKIKSVAKRAFSGLEGLEH
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 LDLNNNAIMSIQENAFSQT-HLKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQHSVNVSCAH
:.:..::: :.: .:: . .:::: ....:.::::.:::: ::. .: :...:::
XP_016 LNLGGNAIRSVQFDAFVKMKNLKELHISSDSFLCDCQLKWLPPWLIGRMLQAFVTATCAH
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 PEWLAGQSILNVDLKDFVCDDFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTCTAVSSSDSPMSTVW
:: : ::::..: ..::::::::::: :.::: .:. : .. .::.:.:::.:::. .:
XP_016 PESLKGQSIFSVPPESFVCDDFLKPQIITQPETTMAMVGKDIRFTCSAASSSSSPMTFAW
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 RKDSEILYDVDTENFVRYWQQAGEALEYTSILHLFNVNFTDEGKYQCIVTNHFGSNYSQK
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