Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0815
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0815, 1229 aa
1>>>pF1KA0815 1229 - 1229 aa - 1229 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5334+/-0.00147; mu= 19.7508+/- 0.088
mean_var=293.7718+/-53.793, 0's: 0 Z-trim(110.2): 270 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.074829
statistics sampled from 11130 (11420) to 11130 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.667), E-opt: 0.2 (0.351), width: 16
Scan time: 5.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41237.1 MEGF6 gene_id:1953|Hs108|chr1 (1541) 7722 849.5 0
CCDS10213.2 MEGF11 gene_id:84465|Hs108|chr15 (1044) 2348 269.1 4.2e-71
CCDS4142.1 MEGF10 gene_id:84466|Hs108|chr5 (1140) 2331 267.3 1.6e-70
CCDS30892.1 PEAR1 gene_id:375033|Hs108|chr1 (1037) 2154 248.1 8.4e-65
CCDS78055.1 MEGF10 gene_id:84466|Hs108|chr5 ( 567) 1288 154.2 8.7e-37
CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9 (2555) 1077 132.5 1.3e-29
CCDS32232.1 FBN1 gene_id:2200|Hs108|chr15 (2871) 1062 131.0 4.2e-29
CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19 (2321) 975 121.4 2.6e-26
CCDS12196.1 FBN3 gene_id:84467|Hs108|chr19 (2809) 948 118.7 2.1e-25
CCDS34222.1 FBN2 gene_id:2201|Hs108|chr5 (2912) 932 117.0 7.2e-25
CCDS55265.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 937) 894 112.0 7.1e-24
CCDS55264.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 956) 894 112.0 7.1e-24
CCDS83309.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 915) 830 105.1 8.4e-22
CCDS74370.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1557) 804 102.7 7.6e-21
CCDS74368.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1587) 804 102.7 7.7e-21
CCDS74369.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1624) 804 102.7 7.8e-21
CCDS45564.1 SCARF1 gene_id:8578|Hs108|chr17 ( 569) 778 99.1 3.3e-20
CCDS11007.1 SCARF1 gene_id:8578|Hs108|chr17 ( 830) 778 99.4 3.9e-20
CCDS46666.1 SCARF2 gene_id:91179|Hs108|chr22 ( 866) 773 98.9 5.8e-20
CCDS13779.2 SCARF2 gene_id:91179|Hs108|chr22 ( 871) 773 98.9 5.8e-20
CCDS14048.1 SCUBE1 gene_id:80274|Hs108|chr22 ( 988) 770 98.7 7.8e-20
CCDS9831.1 LTBP2 gene_id:4053|Hs108|chr14 (1821) 730 94.8 2.1e-18
CCDS5138.1 LAMA2 gene_id:3908|Hs108|chr6 (3122) 712 93.3 1e-17
CCDS6811.1 TNC gene_id:3371|Hs108|chr9 (2201) 667 88.2 2.6e-16
CCDS44647.1 LTBP3 gene_id:4054|Hs108|chr11 (1303) 648 85.7 8.2e-16
CCDS8103.1 LTBP3 gene_id:4054|Hs108|chr11 (1256) 620 82.7 6.5e-15
CCDS53599.1 SCUBE2 gene_id:57758|Hs108|chr11 ( 807) 598 80.0 2.7e-14
CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs108|chr3 (1798) 588 79.5 8.5e-14
CCDS46762.1 FBLN2 gene_id:2199|Hs108|chr3 (1184) 571 77.3 2.5e-13
CCDS46761.1 FBLN2 gene_id:2199|Hs108|chr3 (1231) 571 77.4 2.5e-13
CCDS14069.1 FBLN1 gene_id:2192|Hs108|chr22 ( 683) 551 74.8 8.5e-13
CCDS14067.1 FBLN1 gene_id:2192|Hs108|chr22 ( 703) 547 74.4 1.2e-12
CCDS4800.1 SCUBE3 gene_id:222663|Hs108|chr6 ( 993) 542 74.1 2e-12
CCDS81553.1 SCUBE2 gene_id:57758|Hs108|chr11 ( 999) 542 74.1 2e-12
CCDS43028.1 FBLN1 gene_id:2192|Hs108|chr22 ( 566) 538 73.2 2e-12
CCDS9499.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 494) 537 73.0 2.1e-12
CCDS14068.1 FBLN1 gene_id:2192|Hs108|chr22 ( 601) 538 73.3 2.1e-12
CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20 (1218) 542 74.2 2.2e-12
CCDS54345.1 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1342) 540 74.1 2.7e-12
CCDS33178.2 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1395) 540 74.1 2.7e-12
CCDS1857.1 EFEMP1 gene_id:2202|Hs108|chr2 ( 493) 532 72.5 3e-12
CCDS33177.2 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1721) 540 74.3 3e-12
CCDS30551.1 AGRN gene_id:375790|Hs108|chr1 (2045) 540 74.4 3.3e-12
CCDS73594.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 445) 517 70.8 8.8e-12
CCDS8116.1 EFEMP2 gene_id:30008|Hs108|chr11 ( 443) 513 70.3 1.2e-11
CCDS54784.1 NPNT gene_id:255743|Hs108|chr4 ( 582) 510 70.2 1.7e-11
CCDS7797.2 SCUBE2 gene_id:57758|Hs108|chr11 ( 971) 512 70.8 1.9e-11
CCDS33502.1 LAMA5 gene_id:3911|Hs108|chr20 (3695) 517 72.3 2.5e-11
CCDS34732.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs108|chr7 (1761) 511 71.2 2.7e-11
CCDS482.1 TIE1 gene_id:7075|Hs108|chr1 (1138) 507 70.4 2.9e-11
>>CCDS41237.1 MEGF6 gene_id:1953|Hs108|chr1 (1541 aa)
initn: 9206 init1: 7264 opt: 7722 Z-score: 4524.0 bits: 849.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8335; 87.9% identity (88.3% similar) in 1225 aa overlap (38-1131:146-1366)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 GLAALWCLGLLGGLARVAGTHYRYLWRGCYPCHLGQAGYPVSAGDQ-RPDVDECRTHNGG
::: : : . . :::::::::::
CCDS41 QQPDEEGCLSAECSASLCFHGGRCVPGSAQPCHCP----PGFQGPRCQYDVDECRTHNGG
120 130 140 150 160 170
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 CQHRCVNTPGSYLCECKPGFRLHTDSRTCLAINSCALGNGGCQHHCVQLTITRHRCQCRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CQHRCVNTPGSYLCECKPGFRLHTDSRTCLAINSCALGNGGCQHHCVQLTITRHRCQCRP
180 190 200 210 220 230
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 GFQLQEDGRHCVRRSPCANRNGSCMHRCQVVRGLARCECHVGYQLAADGKACEDVDECAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GFQLQEDGRHCVRRSPCANRNGSCMHRCQVVRGLARCECHVGYQLAADGKACEDVDECAA
240 250 260 270 280 290
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 GLAQCAHGCLNTQGSFKCVCHAGYELGADGRQCYRIEMEIVNSCEANNGGCSHGCSHTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GLAQCAHGCLNTQGSFKCVCHAGYELGADGRQCYRIEMEIVNSCEANNGGCSHGCSHTSA
300 310 320 330 340 350
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GPLCTCPRGYELDTDQRTCIDVDDCADSPCCQQVCTNNPGGYECGCYAGYRLSADGCGCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GPLCTCPRGYELDTDQRTCIDVDDCADSPCCQQVCTNNPGGYECGCYAGYRLSADGCGCE
360 370 380 390 400 410
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 DVDECASSRGGCEHHCTNLAGSFQCSCEAGYRLHEDRRGCSPLEEPMVDLDGELPFVRPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DVDECASSRGGCEHHCTNLAGSFQCSCEAGYRLHEDRRGCSPLEEPMVDLDGELPFVRPL
420 430 440 450 460 470
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 PHIAVLQDELPQLFQDDDVGADEEEAELRGEHTLTEKFVCLDDSFGHDCSLTCDDCRNGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PHIAVLQDELPQLFQDDDVGADEEEAELRGEHTLTEKFVCLDDSFGHDCSLTCDDCRNGG
480 490 500 510 520 530
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 TCLLGLDGCDCPEGWTGLICNETCPPDTFGKNCSFSCSCQNGGTCDSVTGACRCPPGVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TCLLGLDGCDCPEGWTGLICNETCPPDTFGKNCSFSCSCQNGGTCDSVTGACRCPPGVSG
540 550 560 570 580 590
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 TNCEDGCPKGYYGKHCRKKCNCANRGRCHRLYGACLCDPGLYGRFCHLTCPPWAFGPGCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TNCEDGCPKGYYGKHCRKKCNCANRGRCHRLYGACLCDPGLYGRFCHLTCPPWAFGPGCS
600 610 620 630 640 650
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EECQCVQPHTQSCDKRDGSCSCKAGFRGERCQAECELGYFGPGCWQACTCPVGVACDSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EECQCVQPHTQSCDKRDGSCSCKAGFRGERCQAECELGYFGPGCWQACTCPVGVACDSVS
660 670 680 690 700 710
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 GECGKRCPAGFQGEDCGQECPVGTFGVNCSSSCSCGGAPCHGVTGQCRCPPGRTGEDCEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GECGKRCPAGFQGEDCGQECPVGTFGVNCSSSCSCGGAPCHGVTGQCRCPPGRTGEDCEA
720 730 740 750 760 770
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 DCPEGRWGLGCQEICPACQHAARCDPETGACLCLPGFVGSRCQDVCPAGWYGPSCQTRCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DCPEGRWGLGCQEICPACQHAARCDPETGACLCLPGFVGSRCQDVCPAGWYGPSCQTRCS
780 790 800 810 820 830
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 CANDGHCHPATGHCSCAPGWTGFSCQRACDTGHWGPDCSHPCNCSAGHGSCDAISGLCLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CANDGHCHPATGHCSCAPGWTGFSCQRACDTGHWGPDCSHPCNCSAGHGSCDAISGLCLC
840 850 860 870 880 890
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 EAGYVGPRCEQQCPQGHFGPGCEQLCQCQHGAACDHVSGACTCPAGWRGTFCEHACPAGF
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EAGYVGPRCEQQCPQGHFGPGCEQRCQCQHGAACDHVSGACTCPAGWRGTFCEHACPAGF
900 910 920 930 940 950
850 860 870 880
pF1KA0 FGLDCRSACNCTAGAACDAVNGSCLCPAGRRGPRCAE-----------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FGLDCRSACNCTAGAACDAVNGSCLCPAGRRGPRCAETCPAHTYGHNCSQACACFNGASC
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 ------------------------------------------------------------
CCDS41 DPVHGQCHCAPGWMGPSCLQACPAGLYGDNCRHSCLCQNGGTCDPVSGHCACPEGWAGLA
1020 1030 1040 1050 1060 1070
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 ---KCLPRDVRAGCRHSGGCLNGGLCDPHTGRCLCPAGWTGDKCQSPCLRGWFGEACAQR
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CEKECLPRDVRAGCRHSGGCLNGGLCDPHTGRCLCPAGWTGDKCQSPCLRGWFGEACAQR
1080 1090 1100 1110 1120 1130
950 960 970
pF1KA0 CSCPPAAACHHVTGACRCPPGFTGSGCEQGCPPG--------------------------
:::::.:::::::::::::::::::::::.::::
CCDS41 CSCPPGAACHHVTGACRCPPGFTGSGCEQACPPGSFGEDCAQMCQCPGENPACHPATGTC
1140 1150 1160 1170 1180 1190
980 990 1000 1010
pF1KA0 ------------------RYGPGCEQLCGCLNGGSCDAATGACRCPTGFLGTDCNLTCPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SCAAGYHGPSCQQRCPPGRYGPGCEQLCGCLNGGSCDAATGACRCPTGFLGTDCNLTCPQ
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 GRFGPNCTHVCGCGQGAACDPVTGTCLCPPGRAGVRCERGCPQNRFGVGCEHTCSCRNGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GRFGPNCTHVCGCGQGAACDPVTGTCLCPPGRAGVRCERGCPQNRFGVGCEHTCSCRNGG
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 LCHASNGSCSCGLGWTGRHCELACPPGRYGAACHLECSCHNNSTCEPATGTCRCGPGFYG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LCHASNGSCSCGLGWTGRHCELACPPGRYGAACHLECSCHNNSTCEPATGTCRCGPGFYG
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 QACEHRRSGATCNLDCRRGQFGPSCTLHCDCGGGADCDPVSGQCHCVDGYMGPTCREGGP
CCDS41 QACEHPCPPGFHGAGCQGLCWCQHGAPCDPISGRCLCPAGFHGHFCERGCEPGSFGEGCH
1380 1390 1400 1410 1420 1430
>--
initn: 1507 init1: 663 opt: 969 Z-score: 584.0 bits: 120.5 E(32554): 3.3e-26
Smith-Waterman score: 969; 67.4% identity (78.3% similar) in 184 aa overlap (1046-1229:1367-1541)
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 QGRFGPNCTHVCGCGQGAACDPVTGTCLCPPGRAGVRCERGCPQNRFGVGCEHTCSCRNG
:: : ::. :: . :.::. : :..:
CCDS41 PGRYGAACHLECSCHNNSTCEPATGTCRCGPGFYGQACEHPCPPGFHGAGCQGLCWCQHG
1340 1350 1360 1370 1380 1390
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 GLCHASNGSCSCGLGWTGRHCELACPPGRYGAACHLECSCHNNSTCEPATGTCRCGPGFY
. : .: : : :. :. :: .: :: .: .:: .:.: ... :.:.:: : : ::
CCDS41 APCDPISGRCLCPAGFHGHFCERGCEPGSFGEGCHQRCDCDGGAPCDPVTGLCLCPPG--
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 GQACEHRRSGATCNLDCRRGQFGPSCTLHCDCGGGADCDPVSGQCHCVDGYMGPTCREGG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 -------RSGATCNLDCRRGQFGPSCTLHCDCGGGADCDPVSGQCHCVDGYMGPTCREGG
1460 1470 1480 1490 1500
1200 1210 1220
pF1KA0 PLRLPENPSLAQGSAGTLPASSRPTSRSGGPARH
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PLRLPENPSLAQGSAGTLPASSRPTSRSGGPARH
1510 1520 1530 1540
>>CCDS10213.2 MEGF11 gene_id:84465|Hs108|chr15 (1044 aa)
initn: 1996 init1: 1040 opt: 2348 Z-score: 1390.1 bits: 269.1 E(32554): 4.2e-71
Smith-Waterman score: 2650; 40.8% identity (60.5% similar) in 812 aa overlap (341-1141:23-824)
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 CASSRGGCEHHCTNLAGSFQCSCEAGYRLHEDRRGCSPLEEPMVDLDGELPFVRPLPHIA
:: :: : : . . ...:. .:
CCDS10 MVLSLTGLIAFSFLQATLALNPEDPNVCSHWESYAVTV--QESYAHPFDQIY
10 20 30 40 50
380 390 400 410 420
pF1KA0 VLQ-DELPQLFQDDDVGADEEEAELRGEHTLTEKFV-CLDDSF--GHDCSLTC-DDCRNG
. .. . :. . . : :: .:. .. : . : : : ..: .:
CCDS10 YTRCTDILNWFKCTRHRISYKTAYRRGLRTMYRRRSQCCPGYYESGDFCIPLCTEECVHG
60 70 80 90 100 110
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 GTCLLGLDGCDCPEGWTGLICNETCPPDTFGKNCSFSCSCQNGGTCDSVTGACRCPPGVS
:. . : : : :: : :. : : .: .:: :.::::. :. .:::: : :
CCDS10 -RCV-SPDTCHCEPGWGGPDCSSGCDSDHWGPHCSNRCQCQNGALCNPITGACVCAAGFR
120 130 140 150 160
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 GTNCEDGCPKGYYGKHCRKKCNCANRGRCHRLYGACLCDPGLYGRFCHLTCPPWAFGPGC
: ::. : : .:: :. :.: . . : : ::: :: : .:. ::: . : :
CCDS10 GWRCEELCAPGTHGKGCQLPCQCRHGASCDPRAGECLCAPGYTGVYCEELCPPGSHGAHC
170 180 190 200 210 220
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SEECQCVQPHTQSCDKRDGSCSCKAGFRGERCQAECELGYFGPGCWQACTCPVGVACDSV
.: : . : : . : :.: :. : : : : :: .: : : : : :: :
CCDS10 ELRCPCQNGGT--CHHITGECACPPGWTGAVCAQPCPPGTFGQNCSQDCPCHHGGQCDHV
230 240 250 260 270 280
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 SGECGKRCPAGFQGEDCGQECPVGTFGVNCSSSCSC-GGAPCHGVTGQCRCPPGRTGEDC
.:.: .: ::..:. : .::: :.:: .::. :.: .:. : .:: :.: :: : :
CCDS10 TGQC--HCTAGYMGDRCQEECPFGSFGFQCSQHCDCHNGGQCSPTTGACECEPGYKGPRC
290 300 310 320 330 340
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 -EADCPEGRWGLGCQEICPACQ--HAARCDPETGACLCLPGFVGSRCQDVCPAGWYGPSC
: :::: : :: :: :. .. : : :::: : ::. : .:.. ::.:.:: .:
CCDS10 QERLCPEGLHGPGCTLPCP-CDADNTISCHPVTGACTCQPGWSGHHCNESCPVGYYGDGC
350 360 370 380 390 400
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 QTRCSCANDGHCHPATGHCSCAPGWTGFSCQRACDTGHWGPDCSHPCNCSAGHGSCDAIS
: :.: : . :: :: :.::::. : : .: .: .::.:: :.:. : :.:. ..
CCDS10 QLPCTCQNGADCHSITGGCTCAPGFMGEVCAVSCAAGTYGPNCSSICSCNNG-GTCSPVD
410 420 430 440 450 460
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 GLCLCEAGYVGPRCEQQCPQGHFGPGCEQLCQCQHGAACDHVSGACTCPAGWRGTFCEHA
: : :. :. : : ::.: .: .:.. : : .::::. ..:.:.: :: : ::
CCDS10 GSCTCKEGWQGLDCTLPCPSGTWGLNCNESCTCANGAACSPIDGSCSCTPGWLGDTCELP
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pF1KA0 CPAGFFGLDCRSACNCTAGAACDAVNGSCLCPAGRRGPRCAEKCLPRDVRAGCRHSGGCL
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CCDS10 CPDGTFGLNCSEHCDCSHADGCDPVTGHCCCLAGWTGIRCDSTCPPGRWGPNCSVSCSCE
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pF1KA0 NGGLCDPHTGRCLCPAGWTGDKCQSPCLRGWFGEACAQRCS-CPPAA-ACHHVTGACRCP
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CCDS10 NGGSCSPEDGSCECAPGFRGPLCQRICPPGFYGHGCAQPCPLCVHSSRPCHHISGICECL
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pF1KA0 PGFTGSGCEQGCPPGRYGPGCEQLCGCLNGGSCDAATGACRCPTGFLGTDCNLTCPQGRF
:::.:. :.: : : .: : :::.: :.:.:. :.:.: :..: ::. .:: : .
CCDS10 PGFSGALCNQVCAGGYFGQDCAQLCSCANNGTCSPIDGSCQCFPGWIGKDCSQACPPGFW
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pF1KA0 GPNCTHVCGCGQGAACDPVTGTCLCPPGRAGVRCERGCPQNRFGVGCEHTCSCRNGGLCH
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CCDS10 GPACFHACSCHNGASCSAEDGACHCTPGWTGLFCTQRCPAAFFGKDCGRVCQCQNGASCD
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pF1KA0 ASNGSCSCGLGWTGRHCELACPPGRYGAACHLECSCHNNSTCEPATGTCRCGPGFYGQAC
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CCDS10 HISGKCTCRTGFTGQHCEQRCAPGTFGYGCQQLCECMNNSTCDHVTGTCYCSPGFKGIRC
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..
CCDS10 DQAALMMEELNPYTKISPALGAERHSVGAVTGIMLLLFLIVVLLGLFAWHRRRQKEKGRD
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. .. . :. .. . : .::.:. .: : . :. : : : :
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CCDS41 WRCEDRCEQGTYGNDCHQRCQCQNGATCDHVTGECRCPPGYTGAFCEDLCPPGKHGPQCE
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CCDS41 QRCPC--QNGGVCHHVTGECSCPSGWMGTVCGQPCPEGRFGKNCSQECQCHNGGTCDAAT
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CCDS41 GQC--HCSPGYTGERCQDECPVGTYGVLCAETCQCVNGGKCYHVSGACLCEAGFAGERCE
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CCDS41 QICSCQNGADCDSVTGKCTCAPGFKGIDCSTPCPLGTYGINCSSRCGCK-NDAVCSPVDG
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CCDS41 SCTCKAGWHGVDCSIRCPSGTWGFGCNLTCQCLNGGACNTLDGTCTCAPGWRGEKCELPC
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CCDS41 QDGTYGLNCAERCDCSHADGCHPTTGHCRCLPGWSGVHCDSVCAEGRWGPNCSLPCYCKN
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CCDS41 GFTGALCNEVCPSGRFGKNCAGICTCTNNGTCNPIDRSCQCYPGWIGSDCSQPCPPAHWG
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CCDS41 PNCIHTCNCHNGAFCSAYDGECKCTPGWTGLYCTQRCPLGFYGKDCALICQCQNGADCDH
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CCDS41 ISGQCTCRTGFMGRHCEQKCPSGTYGYGCRQICDCLNNSTCDHITGTCYCSPGWKGARCD
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.
CCDS41 QAGVIIVGNLNSLSRTSTALPADSYQIGAIAGIIILVLVVLFLLALFIIYRHKQKGKESS
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. ::.: .: .:. : : .:. .: ..: :.: :: : :...:: : :.
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CCDS30 CLCLHGGVCQATSGLCQCAPGYTGPHCASLCPPDTYGVNCSARCSCENAIACSPIDGECV
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: :: .:. :: : .: .: :.: :.: :::: : ::. :. :. :: :
CCDS30 CKEGWQRGNCSVPCPPGTWGFSCNASCQCAHEAVCSPQTGACTCTPGWHGAHCQLPCPKG
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..: :: . : : .. .:: . : :.: .:..:. :.:.::.: .: ::...: : .:..
CCDS30 QFGEGCASRCDCDHSDGCDPVHGRCQCQAGWMGARCHLSCPEGLWGVNCSNTCTCKNGGT
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pF1KA0 CDPVTGTCLCPPGRAGVRCERGCPQNRFGVGCEHTCSCRNGGLCHASNGSCSCGLGWTGR
: : .:.:.: :: : :.:.: .:.: : :.: : ..:: :::.: : ::::
CCDS30 CLPENGNCVCAPGFRGPSCQRSCQPGRYGKRCV-PCKCANHSFCHPSNGTCYCLAGWTGP
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CCDS30 DCSQPCPPGHWGENCAQTCQCHHGGTCHPQDGSCICPLGWTGHHCLE---------GCPL
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pF1KA0 GQFGPSCTLHCDCGGGADCDPVSGQCHCVDGYMGPTCREG--GPLR-LPENPSLAQGSAG
: :: .:. :.:: : : : .: : : :. : :: : :. .: .: .: .: :
CCDS30 GTFGANCSQPCQCGPGEKCHPETGACVCPPGHSGAPCRIGIQEPFTVMPTTP-VAYNSLG
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pF1KA0 TLPASSRPTSRSGGPARH
..
CCDS30 AVIGIAVLGSLVVALVALFIGYRHWQKGKEHHHLAVAYSSGRLDGSEYVMPDVPPSYSHY
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CCDS78 TDILNWFKCTRHRVSYRTAYRHGEKTMYRRKSQCCPGFYESGEMCVPHCAD---------
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CCDS78 ---KCVHG-RCIAPNT--CQCEPGWGGTNCSSACDGDHWGPHCTSRCQCKNGALCNPITG
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CCDS78 ACHCAAGFRGWRCEDRCEQGTYGNDCHQRCQCQNG-ATCDHVTGECRCPPGYTGAFCEDL
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CCDS78 CPPGKHGPQCEQRCPCQNGGVCHHVTGECSCPSGWMGTVCGQPCPEGRFGKNCSQECQCH
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CCDS78 NGGTCDAATGQCHCSPGYTGERCQDECPVGTYGVLCAETCQCVNGGKCYHVSGACLCEAG
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CCDS78 FAGERCEARLCPEGLYGIKCDKRCPCHLENTHSCHPMSGECACKPGWSGLYCNETCSPGF
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CCDS78 SPVDGSCTCKAGWHGVDCSIRCPSGTWGFGCNLTCQCLNGGACNTLDGTCTCAPGWRGEK
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CCDS78 CELPCQDGTYGLNCAERCDCSHADGCHPTTGHCRCLPGWSGLF
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CCDS43 NTHGGYNCVCVNGWTGEDCSENIDDCASAACFHGATCHDRVASFYCECPHGRTGLLCHLN
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CCDS43 D-ACIS-NPCNEGSN-CDTNPVN---GKAICTCPSGYT----GPACSQDVDECSLGANPC
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pF1KA0 MH--RCQVVRGLARCECHVGYQLAADGKACE-DVDECAAGLAQCAHGCLNTQGSFKCVCH
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CCDS43 EHAGKCINTLGSFECQCLQGYT----GPRCEIDVNECVSNPCQNDATCLDQIGEFQCICM
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CCDS43 PGYE----GVHCE------VNTDECASSPCLHNGRCLDKINEFQCECPTGF---TGHLCQ
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CCDS43 YDVDECASTPCKNGAKCLDGPNTYTCVCTEGYT----GTHCEVDIDECDPD--PCHYGSC
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CCDS43 KDGVATFTCLCRPGYTGHH----C---ETNINECSSQ-----PCRHGGTCQDR-------
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pF1KA0 DDVGADEEEAELRGEHTLTEKFVCLDDSFGHDCSLTCDDCR----NGGTCLLGLDG--CD
..: : :: . : .: .. ::: ..:::: .:: :
CCDS43 -------DNAYL---------CFCLKGTTGPNCEINLDDCASSPCDSGTCLDKIDGYECA
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: :.:: .:: . .:. . :.:::::.. :..: .:. ::.:
CCDS43 CEPGYTGSMCNINID------ECA-GNPCHNGGTCED---------GINGFTCR--CPEG
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CCDS32 CSNTEGGYLCGCPPGYFRIGQGHCVSGMGMGRGNPEPPVSGEMDDNSLSPEACYECKING
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:. : . . : . : ::: : : . : : ::: .:..: : .
CCDS12 GYTGPLCENPAVPCAPSPCR--NGGT---CRQSGDLTYDCACLPGF----EGQNCEVNVD
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. . . . . :. . . : . .. : : : : : :.: :.
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: :: :.: . :: : : .: : ::.: : .:. . . ::.
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: :. . :.:.::. : .:.. : : . : .: . .: :
CCDS12 FGVCRDGINRYDCVCQPGFTGPLCNVEINECASSPCGEGGSCVDGENGFRCLCPPGSLPP
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: .. : .. :: : . : :: :: :. :: : :. . ::.:
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. : : . .: : :: :. : .: : :: :: :.:. ::. :
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.::.: : ::. : : : :. : : : : . : .: .:. ::::. .
CCDS12 SCPQGWQGPRCQQDVDECAGPAPCGPH-GICTNLAGSFS--C--TCHGGYTGPSCDQDIN
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:. : : : :. ..: ::: ::..: : : : .: :.:: : :.:
CCDS12 DCDPNPCLNGGSCQDGVGSFSCSCLPGFAGPRCARDVD------ECLSNPC----GPGTC
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CCDS12 TDHVASFTCTCPPGYGGFHCEQDLPDCSPSSCFNGGTCVDGVNSFSCLCRPGYTGAHCQH
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. : .: : : : .: : .:.. :. : :. : ...
CCDS12 EADPCLSRPCLHGGVCSAAHPGFRCTCLESFTGPQCQTLVDWCSRQPCQNGGRCVQTGAY
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:::: : : : . :: :.. : : : : :: : . . :.:: : ::..:
CCDS12 CLCPPGWSGRLCDIRSLPCREAAAQIGVRLEQLCQAGGQCVDEDSSHYCVCPEGRTGSHC
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.. ::: :: : ...:. :. :.: ::..:..::. :
CCDS12 EQEVDPCL--------AQ--PCQHGGTCRGYMGGYMCECLPGYNGDNCEDDVDECASQP-
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CCDS12 ------CQHGGSCIDLVARYLCSCPPGTLGVLCEINEDDCGPGPPLDSGPRCLH-----N
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CCDS12 GTCVDLVGGFRCTCPPGYTGLRCEADINECRSGA-C-HAAHTRD---CLQDPGGGFRCLC
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CCDS12 -PGASNASCAAAPCLHGGSCRPAPLAPFFRCACAQGWTGPRCEAPAAAPEVSEEPRCPRA
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CCDS12 GTATLNQTIDICRHFTNLCLNGRCLPTPSSYRCECN-VGYTQDVRGECIDVDECTS--SP
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CCDS12 CARPFPGTVTKSECCCANPDHGFGEPCQLCPAKDSAEFQALCSSGLGITTDGR---DINE
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CCDS12 SYSCSCPPGFHFWQDTEICKDVDECLSSPCVSGVCRNLAGSYTCKCGPGSRLDPSGTFCL
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CCDS12 DSTKGTCWLK-IQESRCEVNLQGASLRSECCATLGAAWGS----PCERCEIDPACARGF-
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CCDS12 -----ARMTGVTCDDV-------NECESFPGVCPNG-RCVNTAGSFRCECPEGLMLDASG
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pF1KA0 TNCEDGCPKGYYGKHCRKKCNCANRGRCHRLYGACLCDPG-LYGRFCHLTCP-PWA--FG
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CCDS12 RLCVDVRLEPCFLRWDEDECGVTLPGK-YRM-DVCCCSIGAVWGVECE-ACPDPESLEFA
910 920 930 940 950 960
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pF1KA0 PGC-------SEECQCVQPHTQS---CDKRDGSCS---CKAGFRGERCQAECELGYFGPG
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CCDS12 SLCPRGLGFASRDFLSGRPFYKDVNECKVFPGLCTHGTCRNTVGSFHC--ACAGGFALDA
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. :: . : ::. : :..:. : : : : . :: . :.
CCDS12 QERNCT-DID-ECRISPDLCGQGTCVNTPGSFECE-CFPGYESGFMLMK-NCMDVDECAR
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CCDS12 DPLLCRGGTCTNTDGSYKCQCPPGHELTAKGTACE-DIDECSLSDG---LCPHGQ----C
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.. . ::: :. .: .: :. :: : . : ::: :... . :
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CCDS12 RCECEMGFDPTEDHRACQDVDECAQGNLC--AFGSCENLPGMFRCICNGGYELDRGGGNC
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: . :.. . : ..:.:. :: : . : :::: : .: ...
CCDS12 TDINECADPVNC--INGVCINTPGSYLCSCPQDFELNPSGVGCVDTRAGNCFLETHDRGD
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pF1KA0 NG-SCSC--GLGWTGRHCELACPPGR-YGAACHLECSCHNNSTCEPATGTCRCGPGFYGQ
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CCDS12 SGISCSAEIGVGVTRASC--CCSLGRAWGNPCEL---CPMANTTEYRT-LCPGGEGFQ--
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pF1KA0 ACEHRRSGATCNLD-CRRGQFGPSCTLHCDCGGGADCDPVSG--QCHCVDGYMGPTCREG
.: . ..: : : :. : :: :: . : ::.: ::
CCDS12 --PNRITVILEDIDEC---QELPGL-----CQGG-DCVNTFGSFQCECPPGYHLSEHTRI
1560 1570 1580 1590 1600
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pF1KA0 GPLRLPENPSLAQGSAGTLPASSRPTSRSGGPARH
CCDS12 CEDIDECSTHSGICGPGTCYNTLGNYTCVCPAEYLQVNGGNNCMDMRKSVCFRHYNGTCQ
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CCDS12 SPGGACVGRNECREIPNVCSHGDCMDTEGSYMC-LCHRGFQASA-DQTLCMDIDECDRQP
1800 1810 1820 1830 1840 1850
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pF1KA0 GGCQHRCVNTPGSYLCECKPGFRLHTDSRTCLAINSCALGNGG-CQH-HCVQLTITRHRC
: . : : ::: : : ::: . : . :. .. :. : :. ::.. . . : :
CCDS12 CG-NGTCKNIIGSYNCLCFPGFVV-THNGDCVDFDECTTLVGQVCRFGHCLNTAGSFH-C
1860 1870 1880 1890 1900 1910
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pF1KA0 QCRPGFQLQEDGRHCVRRSPCANRNGSCMH-RCQVVRGLARCECHVGYQLAADGKACEDV
:. ::.: ::..:: . : . :.:. :: ..: :: : :.:. .: : :.
CCDS12 LCQDGFELTADGKNCVDTNECLSLAGTCLPGTCQNLEGSFRCICPPGFQVQSDH--CIDI
1920 1930 1940 1950 1960 1970
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pF1KA0 DECAAGLAQCAHG-CLNTQGSFKCVCHAGYELGADGRQCY---------RIEM-------
:::. : : : :. :::.:.: :. :. .:..:. :.:
CCDS12 DECSEEPNLCLFGTCTNSPGSFQCLCPPGFVLSDNGHRCFDTRQSFCFTRFEAGKCSVPK
1980 1990 2000 2010 2020 2030
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pF1KA0 ----------------------------------------------------EIVNSCEA
: :: :
CCDS12 AFNTTKTRCCCSKRPGEGWGDPCELCPQEGSAAFQELCPFGHGAVPGPDDSREDVNECAE
2040 2050 2060 2070 2080 2090
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pF1KA0 NNGGCSHG-CSHTSAGPLCTCPRGYELDTDQRTCIDVDDCA-DSPCCQQVCTNNPGGYEC
: : :..: : .:... : :: :: :: .:.:.:.:. :: : .::: ::.::
CCDS12 NPGVCTNGVCVNTDGSFRCECPFGYSLDFTGINCVDTDECSVGHPCGQGTCTNVIGGFEC
2100 2110 2120 2130 2140 2150
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.: :.. . :::.:::. . : .: : ::. :.: ::: :.:: : ..
CCDS12 ACADGFE-PGLMMTCEDIDECSLNPLLCAFRCHNTEGSYLCTCPAGYTLREDGAMCRDVD
2160 2170 2180 2190 2200
360 370 380 390 400
pF1KA0 EPMVDLDGELPFVRPLPHIAVLQDELPQLFQDDDVGADEEEAELRGEHTLTEKFV-CLDD
: ::. :: . .. .. . . : . : . : ::
CCDS12 ECA---DGQ-------------QDCHARGMECKNLIGTFACVCPPGMRPLPGSGEGCTDD
2210 2220 2230 2240 2250
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.... ..:: : : : : . : :: :: . : : : . . . .:: :
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. : .: :. . : . :. : : . : .:: : .: : : . ::
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: : : .. :: .:: :. :.:. :: .:. : ::...
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:. :: . : : . : ::. :: :. : ..: :. : : :
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:: :: : .: .: . :.. .:.. .: : : : : : :
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