Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0816
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0816, 1902 aa
1>>>pF1KA0816 1902 - 1902 aa - 1902 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2349+/-0.00143; mu= 15.7103+/- 0.085
mean_var=172.3252+/-34.222, 0's: 0 Z-trim(105.5): 173 B-trim: 21 in 1/49
Lambda= 0.097701
statistics sampled from 8252 (8437) to 8252 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16
Scan time: 5.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31478.1 LRP4 gene_id:4038|Hs108|chr11 (1905) 13476 1914.1 0
CCDS8647.1 LRP6 gene_id:4040|Hs108|chr12 (1613) 3022 440.5 2.4e-122
CCDS8181.1 LRP5 gene_id:4041|Hs108|chr11 (1615) 2952 430.7 2.3e-119
CCDS8932.1 LRP1 gene_id:4035|Hs108|chr12 (4544) 2142 316.9 1.1e-84
CCDS56085.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 ( 819) 1859 276.3 3.3e-73
CCDS2232.1 LRP2 gene_id:4036|Hs108|chr2 (4655) 1496 225.9 2.9e-57
CCDS2182.1 LRP1B gene_id:53353|Hs108|chr2 (4599) 1493 225.5 3.8e-57
CCDS56083.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 ( 682) 1456 219.4 3.7e-56
CCDS56084.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 ( 692) 1396 211.0 1.3e-53
CCDS54794.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4 (1166) 1063 164.3 2.5e-39
CCDS3689.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4 (1207) 1063 164.3 2.6e-39
CCDS54795.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4 (1165) 1035 160.3 3.9e-38
CCDS34979.1 VLDLR gene_id:7436|Hs108|chr9 ( 845) 979 152.3 7.4e-36
CCDS6446.1 VLDLR gene_id:7436|Hs108|chr9 ( 873) 979 152.3 7.6e-36
CCDS579.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1 ( 700) 880 138.3 1e-31
CCDS580.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1 ( 793) 871 137.1 2.7e-31
CCDS30720.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1 ( 904) 871 137.1 3e-31
CCDS578.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1 ( 963) 871 137.1 3.1e-31
CCDS8436.1 SORL1 gene_id:6653|Hs108|chr11 (2214) 832 132.0 2.5e-29
CCDS1608.1 NID1 gene_id:4811|Hs108|chr1 (1247) 693 112.2 1.3e-23
CCDS58651.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 ( 858) 653 106.4 5.1e-22
CCDS12254.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 ( 860) 653 106.4 5.1e-22
CCDS33626.1 LRP5L gene_id:91355|Hs108|chr22 ( 252) 644 104.6 5.2e-22
CCDS9706.1 NID2 gene_id:22795|Hs108|chr14 (1375) 652 106.4 7.9e-22
CCDS8487.1 ST14 gene_id:6768|Hs108|chr11 ( 855) 521 87.8 2e-16
CCDS30625.1 HSPG2 gene_id:3339|Hs108|chr1 (4391) 494 84.6 9e-15
CCDS34222.1 FBN2 gene_id:2201|Hs108|chr5 (2912) 456 79.1 2.8e-13
CCDS46761.1 FBLN2 gene_id:2199|Hs108|chr3 (1231) 445 77.2 4.4e-13
CCDS54344.1 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1353) 436 76.0 1.1e-12
CCDS31462.1 LDLRAD3 gene_id:143458|Hs108|chr11 ( 345) 405 71.0 8.9e-12
CCDS46762.1 FBLN2 gene_id:2199|Hs108|chr3 (1184) 409 72.1 1.4e-11
>>CCDS31478.1 LRP4 gene_id:4038|Hs108|chr11 (1905 aa)
initn: 13478 init1: 10587 opt: 13476 Z-score: 10272.6 bits: 1914.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 13476; 99.6% identity (99.8% similar) in 1905 aa overlap (1-1902:1-1905)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MRRQWGALLLGALLCAHGLASSPECACGRSHFTCAVSALGECTCIPAQWQCDGDNDCGDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MRRQWGALLLGALLCAHGLASSPECACGRSHFTCAVSALGECTCIPAQWQCDGDNDCGDH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 SDEDGCILPTCSPLDFHCDNGKCIRRSWVCDGDNDCEDDSDEQDCPPRECEEDEFPCQNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SDEDGCILPTCSPLDFHCDNGKCIRRSWVCDGDNDCEDDSDEQDCPPRECEEDEFPCQNG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 YCIRSLWHCDGDNDCGDNSDEQCDMRKCSDKEFRCSDGSCIAEHWYCDGDTDCKDGSDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YCIRSLWHCDGDNDCGDNSDEQCDMRKCSDKEFRCSDGSCIAEHWYCDGDTDCKDGSDEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 NCPSAVPAPPCNLEEFQCAYGRCILDIYHCDGDDDCGDWSDESDCSSHQPCRSGEFMCDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NCPSAVPAPPCNLEEFQCAYGRCILDIYHCDGDDDCGDWSDESDCSSHQPCRSGEFMCDS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GLCINAGWRCDGDADCDDQSDERNCTTSMCTAEQFRCHSGRCVRLSWRCDGEDDCADNSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GLCINAGWRCDGDADCDDQSDERNCTTSMCTAEQFRCHSGRCVRLSWRCDGEDDCADNSD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 EENCENTGSPQCALDQFLCWNGRCIGQRKLCNGVNDCGDNSDESPQQNCRPRTGEENCNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EENCENTGSPQCALDQFLCWNGRCIGQRKLCNGVNDCGDNSDESPQQNCRPRTGEENCNV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 NNGGCAQKCQMVRGAVQCTCHTGYRLTEDGHTCQDVNECAEEGYCSQGCTNSEGAFQCWC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NNGGCAQKCQMVRGAVQCTCHTGYRLTEDGHTCQDVNECAEEGYCSQGCTNSEGAFQCWC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 ETGYELRPDRRSCKALGPEPVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENAIALDFHHRRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ETGYELRPDRRSCKALGPEPVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENAIALDFHHRRE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 LVFWSDVTLDRILRANLNGSNVEEVVSTGLESPGGLAVDWVHDKLYWTDSGTSRIEVANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LVFWSDVTLDRILRANLNGSNVEEVVSTGLESPGGLAVDWVHDKLYWTDSGTSRIEVANL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 DGAHRKVLLWQNLEKPRAIALHPMEGTIYWTDWGNTPRIEASSMDGSGRRIIADTHLFWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DGAHRKVLLWQNLEKPRAIALHPMEGTIYWTDWGNTPRIEASSMDGSGRRIIADTHLFWP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 NGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVISQGLPHPFAITVFEDSLYWTDWHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVISQGLPHPFAITVFEDSLYWTDWHT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 KSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGKNRCGDNNGGCTHLCLPSGQNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGKNRCGDNNGGCTHLCLPSGQNY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 TCACPTGFRKISSHACAQSLDKFLLFARRMDIRRISFDTEDLSDDVIPLADVRSAVALDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TCACPTGFRKISSHACAQSLDKFLLFARRMDIRRISFDTEDLSDDVIPLADVRSAVALDW
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 DSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEVVVDTSLESPAGLAIDWVTNKLYWTDAGTDRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEVVVDTSLESPAGLAIDWVTNKLYWTDAGTDRI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 EVANTDGSMRTVLIWENLDRPRDIVVEPMGGYMYWTDWGASPKIERAGMDASGRQVIISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EVANTDGSMRTVLIWENLDRPRDIVVEPMGGYMYWTDWGASPKIERAGMDASGRQVIISS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 NLTWPNGLAIDYGSQRLYWADAGMKTIEFAGLDGSKRKVLIGSQLPHPFGLTLYGERIYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NLTWPNGLAIDYGSQRLYWADAGMKTIEFAGLDGSKRKVLIGSQLPHPFGLTLYGERIYW
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 TDWQTKSIQSADRLTGLDRETLQENLENLMDIHVFHRRRPPVSTPCAMENGGCSHLCLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TDWQTKSIQSADRLTGLDRETLQENLENLMDIHVFHRRRPPVSTPCAMENGGCSHLCLRS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 PNPSGFSCTCPTGINLLSDGKTCSPGMNSFLIFARRIDIRMVSLDIPYFADVVVPINITM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PNPSGFSCTCPTGINLLSDGKTCSPGMNSFLIFARRIDIRMVSLDIPYFADVVVPINITM
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 KNTIAVGVDPQEGKVYWSDSTLHRISRANLDGSQHEDIITTGLQTTDGLAVDAIGRKVYW
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KNTIAIGVDPQEGKVYWSDSTLHRISRANLDGSQHEDIITTGLQTTDGLAVDAIGRKVYW
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 TDTGTNRIEVGNLDGSMRKVLVWQNLDSPRAIVLYHEMGFMYWTDWGENAKLERSGMDGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TDTGTNRIEVGNLDGSMRKVLVWQNLDSPRAIVLYHEMGFMYWTDWGENAKLERSGMDGS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 DRAVLINNNLGWPNGLTVDKASSQLLWADAHTERIEAADLNGANRHTLVSPVQHPYGLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRAVLINNNLGWPNGLTVDKASSQLLWADAHTERIEAADLNGANRHTLVSPVQHPYGLTL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 LDSYIYWTDWQTRSIHRADKGTGSNVILVRSNLPGLMDMQAVDRAQPLGFNKCGSRNGGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LDSYIYWTDWQTRSIHRADKGTGSNVILVRSNLPGLMDMQAVDRAQPLGFNKCGSRNGGC
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 SHLCLPRPSGFSCACPTGIQLKGDGKTCDPSPETYLLFSSRGSIRRISLDTSDHTDVHVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHLCLPRPSGFSCACPTGIQLKGDGKTCDPSPETYLLFSSRGSIRRISLDTSDHTDVHVP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 VPELNNVISLDYDSVDGKVYYTDVFLDVIRRADLNGSNMETVIGRGLKTTDGLAVDWVAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VPELNNVISLDYDSVDGKVYYTDVFLDVIRRADLNGSNMETVIGRGLKTTDGLAVDWVAR
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA0 NLYWTDTGRNTIEASRLDGSCRKVLINNSLDD---IAAFPRKGYLFWTDWGHIAKIERAN
:::::::::::::::::::::::::::::::. ::.::::::::::::::::::::::
CCDS31 NLYWTDTGRNTIEASRLDGSCRKVLINNSLDEPRAIAVFPRKGYLFWTDWGHIAKIERAN
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KA0 LDGSERKVLINTDLGWPNGLTLDYDTRRIYWVDAHLDRIESADLNGKLRQVLVGHVSHPF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS31 LDGSERKVLINTDLGWPNGLTLDYDTRRIYWVDAHLDRIESADLNGKLRQVLVSHVSHPF
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KA0 ALTQQDRWIYWTDWQTKSIQRVDKYSGRNKETVLANVEGLMDIIVVSPQRQTGTNACGVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ALTQQDRWIYWTDWQTKSIQRVDKYSGRNKETVLANVEGLMDIIVVSPQRQTGTNACGVN
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA0 NGGCTHLCFARASDFVCACPDEPDSQPCSLVPGLVPPAPRATGMSEKSPVLPNTPPTTLY
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NGGCTHLCFARASDFVCACPDEPDSRPCSLVPGLVPPAPRATGMSEKSPVLPNTPPTTLY
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KA0 SSTTRTRTSLEEVEGRCSERDARLGLCARSNDAVPAAPGEGLHISYAIGGLLSILLILVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SSTTRTRTSLEEVEGRCSERDARLGLCARSNDAVPAAPGEGLHISYAIGGLLSILLILVV
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KA0 IAALMLYRHKKSKFTDPGMGNLTYSNPSYRTSTQEVKIEAIPKPAMYNQLCYKKEGGPDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IAALMLYRHKKSKFTDPGMGNLTYSNPSYRTSTQEVKIEAIPKPAMYNQLCYKKEGGPDH
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1800 1810 1820 1830 1840 1850
pF1KA0 NYTKEKIKIVEGICLLSGDDAEWDDLKQLRSSRGGLLRDHVCMKTDTVSIQASSGSLDDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NYTKEKIKIVEGICLLSGDDAEWDDLKQLRSSRGGLLRDHVCMKTDTVSIQASSGSLDDT
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1860 1870 1880 1890 1900
pF1KA0 ETEQLLQEEQSECSSVHTAATPERRGSLPDTGWKHERKLSSESQV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ETEQLLQEEQSECSSVHTAATPERRGSLPDTGWKHERKLSSESQV
1870 1880 1890 1900
>>CCDS8647.1 LRP6 gene_id:4040|Hs108|chr12 (1613 aa)
initn: 2274 init1: 1692 opt: 3022 Z-score: 2309.9 bits: 440.5 E(32554): 2.4e-122
Smith-Waterman score: 3709; 45.1% identity (74.6% similar) in 1210 aa overlap (433-1620:14-1213)
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 GYCSQGCTNSEGAFQCWCETGYELRPDRRSCKALGPEPVLLFANRIDIRQV--LPHRSEY
: : :.::.::: :.: : . .
CCDS86 MGAVLRSLLACSFCVLLRAAPLLLYANRRDLRLVDATNGKENA
10 20 30 40
470 480 490 500 510
pF1KA0 TLLLNNLENAIALDFHHRRELVFWSDVTLDRILRANLNGS-NVEEVVSTGLESPGGLAVD
:.....::.: :.:: . :..::::. . : :...: . .:..:: .:: :: ::: :
CCDS86 TIVVGGLEDAAAVDFVFSHGLIYWSDVSEEAIKRTEFNKTESVQNVVVSGLLSPDGLACD
50 60 70 80 90 100
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 WVHDKLYWTDSGTSRIEVANLDGAHRKVLLWQNLEKPRAIALHPMEGTIYWTDWGNTPRI
:. .::::::: :.::::.::::. ::::.::.:..:::::: : : .::::::..:.:
CCDS86 WLGEKLYWTDSETNRIEVSNLDGSLRKVLFWQELDQPRAIALDPSSGFMYWTDWGEVPKI
110 120 130 140 150 160
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 EASSMDGSGRRIIADTHLFWPNGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVISQG
: ..::::.: :: .....::::::.:: ...::.::: . :...::::..:.::.. .
CCDS86 ERAGMDGSSRFIIINSEIYWPNGLTLDYEEQKLYWADAKLNFIHKSNLDGTNRQAVVKGS
170 180 190 200 210 220
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 LPHPFAITVFEDSLYWTDWHTKSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGK
::::::.:.::: :::::: :.:: . ::.::.. . :.. . :::::.. :::: .
CCDS86 LPHPFALTLFEDILYWTDWSTHSILACNKYTGEGLREIHSDIFSPMDIHAFSQQRQPNAT
230 240 250 260 270 280
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 NRCGDNNGGCTHLCL--PSGQNYTCACPTGFRKI-SSHACAQSLDKFLLFARRMDIRRIS
: :: .::::.:::: : : :::::: . . ....: .. ..::.::: :.::::
CCDS86 NPCGIDNGGCSHLCLMSPVKPFYQCACPTGVKLLENGKTCKDGATELLLLARRTDLRRIS
290 300 310 320 330 340
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 FDTEDLSDDVIPLADVRSAVALDWDSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEVVVDTSLE
.:: :..: :. : :.: :.:.:.: . ..:::: . .: :. ::.:.. :: ...
CCDS86 LDTPDFTDIVLQLEDIRHAIAIDYDPVEGYIYWTDDEVRAIRRSFIDGSGSQFVVTAQIA
350 360 370 380 390 400
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 SPAGLAIDWVTNKLYWTDAGTDRIEVANTDGSMRTVLIWENLDRPRDIVVEPMGGYMYWT
: :.:.:::. .:::::.:::::::. .:.:: .:: :.:..:: ::..:: ::::::
CCDS86 HPDGIAVDWVARNLYWTDTGTDRIEVTRLNGTMRKILISEDLEEPRAIVLDPMVGYMYWT
410 420 430 440 450 460
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 DWGASPKIERAGMDASGRQVIISSNLTWPNGLAIDYGSQRLYWADAGMKTIEFAGLDGSK
::: ::::::..:.: : :.....: ::::::.:: ..::.:: :: . ::.
CCDS86 DWGEIPKIERAALDGSDRVVLVNTSLGWPNGLALDYDEGKIYWGDAKTDKIEVMNTDGTG
470 480 490 500 510 520
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 RKVLIGSQLPHPFGLTLYGERIYWTDWQTKSIQSADRLTGLDRETLQENLENLMDIHVFH
:.::. ...:: ::.:: :. .:::::: .::. . . .. .::.. ..: .:: ... .
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: ::: .::. .:..:.. .:.. :. : ....::.: .:. :::: ..::
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: .. ::. .:.::: .:...::.:::::::::..:::. :.::::..::::::..:
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:.... : ::..... . ::.::: ..:::::::. :::.::.: .:.: .....:
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.::. . .. :.:.:.: :: :::::: : .:: :.::. .:..:..::. .: :
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: ... :.:::...:. . . ::::: :::.::.::. . :. : .:.::
CCDS86 EQDRPRAVVVNPEKGYMYFTNLQERSPKIERAALDGTEREVLFFSGLSKPIALALDSRLG
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...:.:. : ::::.::.: : :: ... .: .:: . :.:: : : . :...: ..
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::. .: : : . : :: .:. .. . :. .:::
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CCDS86 LVLLQDELSCGEPPTCSPQQFTCFTGEIDCIPVAWRCDGFTECEDHSDELNCPVCSESQF
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>--
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::. ::::: .: : .:. :: .: ::: ..::: ::: .:: : :..
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CCDS86 SDKSDELDCYPTEEPAPQATNTVGSVIGVIVTIFVSGTVYFICQRMLCPRMKGDGETMTN
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CCDS81 GDKRTRIQGRVAHLTGIHAVEEVSLE-EFSAHPCARDNGGCSHICIAKGDGTPRCSCPVH
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CCDS81 LVLLQNLLTCGEPPTCSPDQFACATGEIDCIPGAWRCDGFPECDDQSDEEGCPVCSAAQF
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pF1KA0 MRRQWGALLLGALLCAHGLASSP--ECACGRSHFTCAVSA
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CCDS89 KPSYCNSRRCKKTFRQCSNGRCVSNMLWCNGADDCGDGSDEIPCNKTACGVGEFRCR---
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CCDS89 VCDGANDCGDYSDERDCPGVKRPR-CPLNYFACPSGRCIPMSWTCDKEDDCEHGEDETHC
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CCDS89 N-KFCSEAQFECQNHRCISKQWLCDGSDDCGDGSDEAAHCEGKT----CGPSSFSCPGTH
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CCDS89 VCVPERWLCDGDKDCADGADESIAAGCLYNSTCDDREFMCQNRQCIPKHFVCDHDRDCAD
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CCDS89 GSDESPECEYPTCGPSEFRCANGRCLSSRQWECDGENDCHDQSDEAPKNPHCTSQEHKCN
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: .:::: .:::... :::: .::::.::: ..:. .: . . .::.: :. .
CCDS89 ASSQFLCSSGRCVAEALLCNGQDDCGDSSDE---RGCHI---NECLSRKLSGCSQDCEDL
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. . .: :. :.:: .::.:: ::.::. ::: : :..:...: : :: : : .
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::::. :: :.:::: .:.. :.:::: ..:.::.:::: .:.....:.::: .
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CCDS89 VSSGLREPRALVVDVQNGYLYWTDWGDHSLIGRIGMDGSSRSVIVDTKITWPNGLTLDYV
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CCDS89 TERIYWADAREDYIEFASLDGSNRHVVLSQDIPHIFALTLFEDYVYWTDWETKSINRAHK
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CCDS21 VSYKCKCWPGFQLKDDGKTCVDIDECSSGFPCSQQCINTYGTYKCLCTDGYEIQPDNPNG
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CCDS21 CKSLSDEEPFLILADHHEIRKISTDGSNYTLLKQGLNNVIAIDFDYREEFIYWIDSSRPN
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CCDS21 GSRINRMCLNGSDIKVVHNTAV--PNALAVDWIGKNLYWSDTEKRIIEVSKLNGLYPTIL
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CCDS21 RHLYGITVFEDYLYATNSDNYNIVRINRFNGTDIHSL-IKIENAWGIRIYQKRTQPTVRS
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CCDS21 GIVRGMDLNTKIADEYMIPIENLVNPRALDFHAETNYIYFADTTSFLIGRQKIDGTERET
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CCDS56 QLDRAHGVSSYDTVISRDIQAPDGLAVDWIHSNIYWTDSVLGTVSVADTKGVKRKTLFRE
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CCDS56 LYWVDSKLHSISSIDVNGGNRKTILEDEKRLAHPFSLAVFEDKVFWTDIINEAIFSANRL
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CCDS56 TGSDVNLLAENLLSPEDMVLFHNLTQPRGVNWCERTTLSNGGCQYLCLPAPQINPHSPKF
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CCDS54 SSFVPLGELKVVHPLAQPKAEDDTWEPEQKLCKLRKGNCSSTVCGQDLQSHLCMCAEGYA
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CCDS54 LSRDRKYCEDVN--ECAF-----WNHGCTLGCKNTPGSYYCTCPVGFVLLPDGKRCHQLV
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CCDS54 SCPRNVSECSHDCVLTSEGPLCFCPEGSVLERDGKTCSGCSS-PDNGGCSQLCVPLSPVS
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CCDS54 WECDCFPGYDLQLDEKSCAASGPQPFLLFANSQDIRHMHFDGTDYGTLLSQQMGMVYALD
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CCDS54 HDPVENKIYFAHTALKWIERANMDGSQRERLIEEGVDVPEGLAVDWIGRRFYWTDRGKSL
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