FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0816, 1902 aa
1>>>pF1KA0816 1902 - 1902 aa - 1902 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8964+/-0.000613; mu= 11.8215+/- 0.037
mean_var=223.5860+/-47.808, 0's: 0 Z-trim(112.4): 422 B-trim: 60 in 1/49
Lambda= 0.085773
statistics sampled from 20721 (21258) to 20721 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.584), E-opt: 0.2 (0.249), width: 16
Scan time: 14.040
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002325 (OMIM: 212780,604270,614305,616304) low- (1905) 13476 1683.4 0
XP_016873223 (OMIM: 212780,604270,614305,616304) P (1809) 12741 1592.4 0
XP_011518405 (OMIM: 212780,604270,614305,616304) P (1637) 11330 1417.7 0
XP_011518406 (OMIM: 212780,604270,614305,616304) P (1160) 7857 987.8 0
XP_006719141 (OMIM: 603507,610947,616724) PREDICTE (1613) 3022 389.7 1.3e-106
NP_002327 (OMIM: 603507,610947,616724) low-density (1613) 3022 389.7 1.3e-106
XP_011543333 (OMIM: 133780,144750,166710,259770,60 (1600) 2952 381.0 5.3e-104
NP_002326 (OMIM: 133780,144750,166710,259770,60181 (1615) 2952 381.0 5.3e-104
XP_011543332 (OMIM: 133780,144750,166710,259770,60 (1624) 2952 381.0 5.3e-104
XP_005274051 (OMIM: 133780,144750,166710,259770,60 (1653) 2952 381.0 5.4e-104
XP_011543331 (OMIM: 133780,144750,166710,259770,60 (1662) 2952 381.0 5.4e-104
XP_011518973 (OMIM: 603507,610947,616724) PREDICTE (1462) 2673 346.4 1.2e-93
XP_016874793 (OMIM: 603507,610947,616724) PREDICTE (1345) 2237 292.4 2e-77
NP_002323 (OMIM: 107770) prolow-density lipoprotei (4544) 2142 281.2 1.6e-73
XP_016874792 (OMIM: 107770) PREDICTED: prolow-dens (4561) 2142 281.3 1.6e-73
NP_001309155 (OMIM: 192977,224050) very low-densit ( 804) 2070 271.5 2.4e-71
NP_001309154 (OMIM: 192977,224050) very low-densit ( 832) 2070 271.5 2.4e-71
NP_001182728 (OMIM: 143890,606945) low-density lip ( 819) 1859 245.4 1.7e-63
NP_001278831 (OMIM: 133780,144750,166710,259770,60 (1034) 1686 224.1 5.7e-57
XP_016873224 (OMIM: 133780,144750,166710,259770,60 (1072) 1686 224.1 5.8e-57
XP_011509486 (OMIM: 222448,600073) PREDICTED: low- (3892) 1496 201.2 1.7e-49
XP_011509485 (OMIM: 222448,600073) PREDICTED: low- (4612) 1496 201.3 1.9e-49
NP_004516 (OMIM: 222448,600073) low-density lipopr (4655) 1496 201.3 1.9e-49
XP_016859830 (OMIM: 608766) PREDICTED: low-density (4469) 1493 200.9 2.4e-49
NP_061027 (OMIM: 608766) low-density lipoprotein r (4599) 1493 200.9 2.4e-49
NP_001182732 (OMIM: 143890,606945) low-density lip ( 682) 1456 195.5 1.6e-48
NP_001182729 (OMIM: 143890,606945) low-density lip ( 692) 1396 188.1 2.7e-46
XP_016859831 (OMIM: 608766) PREDICTED: low-density (2883) 1124 155.1 9.8e-36
XP_016863342 (OMIM: 131530,611718) PREDICTED: pro- ( 934) 1063 147.0 8.5e-34
XP_016863340 (OMIM: 131530,611718) PREDICTED: pro- (1060) 1063 147.1 9.3e-34
XP_016863339 (OMIM: 131530,611718) PREDICTED: pro- (1141) 1063 147.1 9.8e-34
XP_016863338 (OMIM: 131530,611718) PREDICTED: pro- (1142) 1063 147.1 9.8e-34
NP_001171601 (OMIM: 131530,611718) pro-epidermal g (1166) 1063 147.1 9.9e-34
XP_011530009 (OMIM: 131530,611718) PREDICTED: pro- (1178) 1063 147.1 1e-33
XP_016863336 (OMIM: 131530,611718) PREDICTED: pro- (1182) 1063 147.1 1e-33
NP_001954 (OMIM: 131530,611718) pro-epidermal grow (1207) 1063 147.1 1e-33
XP_016863335 (OMIM: 131530,611718) PREDICTED: pro- (1215) 1063 147.1 1e-33
XP_005262853 (OMIM: 131530,611718) PREDICTED: pro- (1215) 1063 147.1 1e-33
XP_016863334 (OMIM: 131530,611718) PREDICTED: pro- (1223) 1063 147.1 1e-33
XP_016863341 (OMIM: 131530,611718) PREDICTED: pro- (1010) 1035 143.6 9.9e-33
NP_001171602 (OMIM: 131530,611718) pro-epidermal g (1165) 1035 143.6 1.1e-32
XP_016863337 (OMIM: 131530,611718) PREDICTED: pro- (1181) 1035 143.6 1.1e-32
NP_001018066 (OMIM: 192977,224050) very low-densit ( 845) 979 136.6 1.1e-30
NP_003374 (OMIM: 192977,224050) very low-density l ( 873) 979 136.6 1.1e-30
XP_011540396 (OMIM: 602600,608446) PREDICTED: low- ( 934) 975 136.1 1.6e-30
XP_016857754 (OMIM: 602600,608446) PREDICTED: low- ( 921) 957 133.9 7.5e-30
XP_016873225 (OMIM: 133780,144750,166710,259770,60 ( 833) 952 133.2 1.1e-29
NP_059992 (OMIM: 602600,608446) low-density lipopr ( 700) 880 124.2 4.6e-27
XP_016857755 (OMIM: 602600,608446) PREDICTED: low- ( 842) 880 124.3 5.2e-27
XP_006710945 (OMIM: 602600,608446) PREDICTED: low- ( 901) 880 124.3 5.5e-27
>>NP_002325 (OMIM: 212780,604270,614305,616304) low-dens (1905 aa)
initn: 13478 init1: 10587 opt: 13476 Z-score: 9025.4 bits: 1683.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 13476; 99.6% identity (99.8% similar) in 1905 aa overlap (1-1902:1-1905)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MRRQWGALLLGALLCAHGLASSPECACGRSHFTCAVSALGECTCIPAQWQCDGDNDCGDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MRRQWGALLLGALLCAHGLASSPECACGRSHFTCAVSALGECTCIPAQWQCDGDNDCGDH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 SDEDGCILPTCSPLDFHCDNGKCIRRSWVCDGDNDCEDDSDEQDCPPRECEEDEFPCQNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SDEDGCILPTCSPLDFHCDNGKCIRRSWVCDGDNDCEDDSDEQDCPPRECEEDEFPCQNG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 YCIRSLWHCDGDNDCGDNSDEQCDMRKCSDKEFRCSDGSCIAEHWYCDGDTDCKDGSDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 YCIRSLWHCDGDNDCGDNSDEQCDMRKCSDKEFRCSDGSCIAEHWYCDGDTDCKDGSDEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 NCPSAVPAPPCNLEEFQCAYGRCILDIYHCDGDDDCGDWSDESDCSSHQPCRSGEFMCDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NCPSAVPAPPCNLEEFQCAYGRCILDIYHCDGDDDCGDWSDESDCSSHQPCRSGEFMCDS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GLCINAGWRCDGDADCDDQSDERNCTTSMCTAEQFRCHSGRCVRLSWRCDGEDDCADNSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GLCINAGWRCDGDADCDDQSDERNCTTSMCTAEQFRCHSGRCVRLSWRCDGEDDCADNSD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 EENCENTGSPQCALDQFLCWNGRCIGQRKLCNGVNDCGDNSDESPQQNCRPRTGEENCNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EENCENTGSPQCALDQFLCWNGRCIGQRKLCNGVNDCGDNSDESPQQNCRPRTGEENCNV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 NNGGCAQKCQMVRGAVQCTCHTGYRLTEDGHTCQDVNECAEEGYCSQGCTNSEGAFQCWC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NNGGCAQKCQMVRGAVQCTCHTGYRLTEDGHTCQDVNECAEEGYCSQGCTNSEGAFQCWC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 ETGYELRPDRRSCKALGPEPVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENAIALDFHHRRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ETGYELRPDRRSCKALGPEPVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENAIALDFHHRRE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 LVFWSDVTLDRILRANLNGSNVEEVVSTGLESPGGLAVDWVHDKLYWTDSGTSRIEVANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LVFWSDVTLDRILRANLNGSNVEEVVSTGLESPGGLAVDWVHDKLYWTDSGTSRIEVANL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 DGAHRKVLLWQNLEKPRAIALHPMEGTIYWTDWGNTPRIEASSMDGSGRRIIADTHLFWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DGAHRKVLLWQNLEKPRAIALHPMEGTIYWTDWGNTPRIEASSMDGSGRRIIADTHLFWP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 NGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVISQGLPHPFAITVFEDSLYWTDWHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVISQGLPHPFAITVFEDSLYWTDWHT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 KSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGKNRCGDNNGGCTHLCLPSGQNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGKNRCGDNNGGCTHLCLPSGQNY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 TCACPTGFRKISSHACAQSLDKFLLFARRMDIRRISFDTEDLSDDVIPLADVRSAVALDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TCACPTGFRKISSHACAQSLDKFLLFARRMDIRRISFDTEDLSDDVIPLADVRSAVALDW
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 DSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEVVVDTSLESPAGLAIDWVTNKLYWTDAGTDRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEVVVDTSLESPAGLAIDWVTNKLYWTDAGTDRI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 EVANTDGSMRTVLIWENLDRPRDIVVEPMGGYMYWTDWGASPKIERAGMDASGRQVIISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EVANTDGSMRTVLIWENLDRPRDIVVEPMGGYMYWTDWGASPKIERAGMDASGRQVIISS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 NLTWPNGLAIDYGSQRLYWADAGMKTIEFAGLDGSKRKVLIGSQLPHPFGLTLYGERIYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NLTWPNGLAIDYGSQRLYWADAGMKTIEFAGLDGSKRKVLIGSQLPHPFGLTLYGERIYW
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 TDWQTKSIQSADRLTGLDRETLQENLENLMDIHVFHRRRPPVSTPCAMENGGCSHLCLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TDWQTKSIQSADRLTGLDRETLQENLENLMDIHVFHRRRPPVSTPCAMENGGCSHLCLRS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 PNPSGFSCTCPTGINLLSDGKTCSPGMNSFLIFARRIDIRMVSLDIPYFADVVVPINITM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PNPSGFSCTCPTGINLLSDGKTCSPGMNSFLIFARRIDIRMVSLDIPYFADVVVPINITM
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 KNTIAVGVDPQEGKVYWSDSTLHRISRANLDGSQHEDIITTGLQTTDGLAVDAIGRKVYW
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KNTIAIGVDPQEGKVYWSDSTLHRISRANLDGSQHEDIITTGLQTTDGLAVDAIGRKVYW
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 TDTGTNRIEVGNLDGSMRKVLVWQNLDSPRAIVLYHEMGFMYWTDWGENAKLERSGMDGS
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NP_002 TDTGTNRIEVGNLDGSMRKVLVWQNLDSPRAIVLYHEMGFMYWTDWGENAKLERSGMDGS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 DRAVLINNNLGWPNGLTVDKASSQLLWADAHTERIEAADLNGANRHTLVSPVQHPYGLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DRAVLINNNLGWPNGLTVDKASSQLLWADAHTERIEAADLNGANRHTLVSPVQHPYGLTL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 LDSYIYWTDWQTRSIHRADKGTGSNVILVRSNLPGLMDMQAVDRAQPLGFNKCGSRNGGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LDSYIYWTDWQTRSIHRADKGTGSNVILVRSNLPGLMDMQAVDRAQPLGFNKCGSRNGGC
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 SHLCLPRPSGFSCACPTGIQLKGDGKTCDPSPETYLLFSSRGSIRRISLDTSDHTDVHVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SHLCLPRPSGFSCACPTGIQLKGDGKTCDPSPETYLLFSSRGSIRRISLDTSDHTDVHVP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 VPELNNVISLDYDSVDGKVYYTDVFLDVIRRADLNGSNMETVIGRGLKTTDGLAVDWVAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VPELNNVISLDYDSVDGKVYYTDVFLDVIRRADLNGSNMETVIGRGLKTTDGLAVDWVAR
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA0 NLYWTDTGRNTIEASRLDGSCRKVLINNSLDD---IAAFPRKGYLFWTDWGHIAKIERAN
:::::::::::::::::::::::::::::::. ::.::::::::::::::::::::::
NP_002 NLYWTDTGRNTIEASRLDGSCRKVLINNSLDEPRAIAVFPRKGYLFWTDWGHIAKIERAN
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KA0 LDGSERKVLINTDLGWPNGLTLDYDTRRIYWVDAHLDRIESADLNGKLRQVLVGHVSHPF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
NP_002 LDGSERKVLINTDLGWPNGLTLDYDTRRIYWVDAHLDRIESADLNGKLRQVLVSHVSHPF
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KA0 ALTQQDRWIYWTDWQTKSIQRVDKYSGRNKETVLANVEGLMDIIVVSPQRQTGTNACGVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ALTQQDRWIYWTDWQTKSIQRVDKYSGRNKETVLANVEGLMDIIVVSPQRQTGTNACGVN
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA0 NGGCTHLCFARASDFVCACPDEPDSQPCSLVPGLVPPAPRATGMSEKSPVLPNTPPTTLY
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NGGCTHLCFARASDFVCACPDEPDSRPCSLVPGLVPPAPRATGMSEKSPVLPNTPPTTLY
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KA0 SSTTRTRTSLEEVEGRCSERDARLGLCARSNDAVPAAPGEGLHISYAIGGLLSILLILVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SSTTRTRTSLEEVEGRCSERDARLGLCARSNDAVPAAPGEGLHISYAIGGLLSILLILVV
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KA0 IAALMLYRHKKSKFTDPGMGNLTYSNPSYRTSTQEVKIEAIPKPAMYNQLCYKKEGGPDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IAALMLYRHKKSKFTDPGMGNLTYSNPSYRTSTQEVKIEAIPKPAMYNQLCYKKEGGPDH
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1800 1810 1820 1830 1840 1850
pF1KA0 NYTKEKIKIVEGICLLSGDDAEWDDLKQLRSSRGGLLRDHVCMKTDTVSIQASSGSLDDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NYTKEKIKIVEGICLLSGDDAEWDDLKQLRSSRGGLLRDHVCMKTDTVSIQASSGSLDDT
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1860 1870 1880 1890 1900
pF1KA0 ETEQLLQEEQSECSSVHTAATPERRGSLPDTGWKHERKLSSESQV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ETEQLLQEEQSECSSVHTAATPERRGSLPDTGWKHERKLSSESQV
1870 1880 1890 1900
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RIEVANTDGSMRTVLIWENLDRPRDIVVEPMGGYMYWTDWGASPKIERAGMDASGRQVII
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSNLTWPNGLAIDYGSQRLYWADAGMKTIEFAGLDGSKRKVLIGSQLPHPFGLTLYGERI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YWTDWQTKSIQSADRLTGLDRETLQENLENLMDIHVFHRRRPPVSTPCAMENGGCSHLCL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSPNPSGFSCTCPTGINLLSDGKTCSPGMNSFLIFARRIDIRMVSLDIPYFADVVVPINI
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:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TMKNTIAIGVDPQEGKVYWSDSTLHRISRANLDGSQHEDIITTGLQTTDGLAVDAIGRKV
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pF1KA0 YWTDTGTNRIEVGNLDGSMRKVLVWQNLDSPRAIVLYHEMGFMYWTDWGENAKLERSGMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YWTDTGTNRIEVGNLDGSMRKVLVWQNLDSPRAIVLYHEMGFMYWTDWGENAKLERSGMD
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pF1KA0 GSDRAVLINNNLGWPNGLTVDKASSQLLWADAHTERIEAADLNGANRHTLVSPVQHPYGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSDRAVLINNNLGWPNGLTVDKASSQLLWADAHTERIEAADLNGANRHTLVSPVQHPYGL
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pF1KA0 TLLDSYIYWTDWQTRSIHRADKGTGSNVILVRSNLPGLMDMQAVDRAQPLGFNKCGSRNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TLLDSYIYWTDWQTRSIHRADKGTGSNVILVRSNLPGLMDMQAVDRAQPLGFNKCGSRNG
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pF1KA0 GCSHLCLPRPSGFSCACPTGIQLKGDGKTCDPSPETYLLFSSRGSIRRISLDTSDHTDVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GCSHLCLPRPSGFSCACPTGIQLKGDGKTCDPSPETYLLFSSRGSIRRISLDTSDHTDVH
1060 1070 1080 1090 1100 1110
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pF1KA0 VPVPELNNVISLDYDSVDGKVYYTDVFLDVIRRADLNGSNMETVIGRGLKTTDGLAVDWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VPVPELNNVISLDYDSVDGKVYYTDVFLDVIRRADLNGSNMETVIGRGLKTTDGLAVDWV
1120 1130 1140 1150 1160 1170
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:::::::::::::::::::::::::::::::::. ::.::::::::::::::::::::
XP_011 ARNLYWTDTGRNTIEASRLDGSCRKVLINNSLDEPRAIAVFPRKGYLFWTDWGHIAKIER
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
XP_011 ANLDGSERKVLINTDLGWPNGLTLDYDTRRIYWVDAHLDRIESADLNGKLRQVLVSHVSH
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pF1KA0 PFALTQQDRWIYWTDWQTKSIQRVDKYSGRNKETVLANVEGLMDIIVVSPQRQTGTNACG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PFALTQQDRWIYWTDWQTKSIQRVDKYSGRNKETVLANVEGLMDIIVVSPQRQTGTNACG
1300 1310 1320 1330 1340 1350
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:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VNNGGCTHLCFARASDFVCACPDEPDSRPCSLVPGLVPPAPRATGMSEKSPVLPNTPPTT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LYSSTTRTRTSLEEVEGRCSERDARLGLCARSNDAVPAAPGEGLHISYAIGGLLSILLIL
1420 1430 1440 1450 1460 1470
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