FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0819, 1918 aa 1>>>pF1KA0819 1918 - 1918 aa - 1918 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.8109+/-0.00122; mu= -22.0656+/- 0.074 mean_var=577.4798+/-115.856, 0's: 0 Z-trim(115.4): 66 B-trim: 0 in 0/56 Lambda= 0.053371 statistics sampled from 15883 (15933) to 15883 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.753), E-opt: 0.2 (0.489), width: 16 Scan time: 5.680 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS46659.1 MICAL3 gene_id:57553|Hs108|chr22 (2002) 6866 544.9 1.2e-153 CCDS46660.1 MICAL3 gene_id:57553|Hs108|chr22 ( 966) 6173 491.3 7.5e-138 CCDS46661.1 MICAL3 gene_id:57553|Hs108|chr22 (1073) 4917 394.6 1.1e-108 CCDS60726.1 MICAL2 gene_id:9645|Hs108|chr11 (1103) 3330 272.5 6.6e-72 CCDS7809.1 MICAL2 gene_id:9645|Hs108|chr11 (1124) 3330 272.5 6.7e-72 CCDS60727.1 MICAL2 gene_id:9645|Hs108|chr11 ( 934) 3325 272.0 7.5e-72 CCDS60728.1 MICAL2 gene_id:9645|Hs108|chr11 ( 976) 3325 272.0 7.8e-72 CCDS5076.1 MICAL1 gene_id:64780|Hs108|chr6 (1067) 2255 189.7 5.3e-47 CCDS69170.1 MICAL1 gene_id:64780|Hs108|chr6 (1086) 2255 189.7 5.4e-47 CCDS55047.1 MICAL1 gene_id:64780|Hs108|chr6 ( 981) 1291 115.4 1.1e-24 >>CCDS46659.1 MICAL3 gene_id:57553|Hs108|chr22 (2002 aa) initn: 12747 init1: 6713 opt: 6866 Z-score: 2871.9 bits: 544.9 E(32554): 1.2e-153 Smith-Waterman score: 12187; 95.6% identity (95.7% similar) in 1950 aa overlap (1-1866:1-1950) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MEERKHETMNPAHVLFDRFVQATTCKGTLKAFQELCDHLELKPKDYRSFYHKLKSKLNYW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 MEERKHETMNPAHVLFDRFVQATTCKGTLKAFQELCDHLELKPKDYRSFYHKLKSKLNYW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 KAKALWAKLDKRGSHKDYKKGKACTNTKCLIIGAGPCGLRTAIDLSLLGAKVVVIEKRDA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 KAKALWAKLDKRGSHKDYKKGKACTNTKCLIIGAGPCGLRTAIDLSLLGAKVVVIEKRDA 70 80 90 100 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CCDS46 RQAEALQEVPEETQAEHNLSSVLDTGAEEDVASRDWVSPWLPRMVSNSWAQMIHPPQPPT 910 920 930 940 950 960 960 970 980 990 1000 1010 pF1KA0 DLGGVPWKEAVRIHALLKGKSEEELEASKSFGPGNEEEEEEEEEYEEEEEEDYDEEEEES :: CCDS46 VLGSQM >>CCDS46661.1 MICAL3 gene_id:57553|Hs108|chr22 (1073 aa) initn: 4967 init1: 4917 opt: 4917 Z-score: 2065.0 bits: 394.6 E(32554): 1.1e-108 Smith-Waterman score: 5514; 87.5% identity (87.5% similar) in 994 aa overlap (1-870:1-994) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MEERKHETMNPAHVLFDRFVQATTCKGTLKAFQELCDHLELKPKDYRSFYHKLKSKLNYW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 MEERKHETMNPAHVLFDRFVQATTCKGTLKAFQELCDHLELKPKDYRSFYHKLKSKLNYW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 KAKALWAKLDKRGSHKDYKKGKACTNTKCLIIGAGPCGLRTAIDLSLLGAKVVVIEKRDA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 KAKALWAKLDKRGSHKDYKKGKACTNTKCLIIGAGPCGLRTAIDLSLLGAKVVVIEKRDA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KA0 FSRNNVLHLWPFTIHDLRGLGAKKFYGKFCAGAIDHISIRQLQLILLKVALILGIEIHVN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 FSRNNVLHLWPFTIHDLRGLGAKKFYGKFCAGAIDHISIRQLQLILLKVALILGIEIHVN 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KA0 VEFQGLIQPPEDQENERIGWRALVHPKTHPVSEYEFEVIIGGDGRRNTLEGFRRKEFRGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 VEFQGLIQPPEDQENERIGWRALVHPKTHPVSEYEFEVIIGGDGRRNTLEGFRRKEFRGK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KA0 LAIAITANFINRNTTAEAKVEEISGVAFIFNQKFFQELREATGIDLENIVYYKDDTHYFV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 LAIAITANFINRNTTAEAKVEEISGVAFIFNQKFFQELREATGIDLENIVYYKDDTHYFV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KA0 MTAKKQSLLDKGVILHDYADTELLLSRENVDQEALLSYAREAADFSTQQQLPSLDFAINH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 MTAKKQSLLDKGVILHDYADTELLLSRENVDQEALLSYAREAADFSTQQQLPSLDFAINH 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KA0 YGQPDVAMFDFTCMYASENAALVREQNGHQLLVALVGDSLLEPFWPMGTGIARGFLAAMD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 YGQPDVAMFDFTCMYASENAALVREQNGHQLLVALVGDSLLEPFWPMGTGIARGFLAAMD 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KA0 SAWMVRSWSLGTSPLEVLAERESIYRLLPQTTPENVSKNFSQYSIDPVTRYPNINVNFLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 SAWMVRSWSLGTSPLEVLAERESIYRLLPQTTPENVSKNFSQYSIDPVTRYPNINVNFLR 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KA0 PSQVRHLYDTGETKDIHLEMESLVNSRTTPKLTRNESVARSSKLLGWCQRQTDGYAGVNV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 PSQVRHLYDTGETKDIHLEMESLVNSRTTPKLTRNESVARSSKLLGWCQRQTDGYAGVNV 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KA0 TDLTMSWKSGLALCAIIHRYRPDLIDFDSLDEQNVEKNNQLAFDIAEKELGISPIMTGKE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 TDLTMSWKSGLALCAIIHRYRPDLIDFDSLDEQNVEKNNQLAFDIAEKELGISPIMTGKE 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KA0 MASVGEPDKLSMVMYLTQFYEMFKDSLPSSDTLDLNAEEKAVLIASTRSPISFLSKLGQT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 MASVGEPDKLSMVMYLTQFYEMFKDSLPSSDTLDLNAEEKAVLIASTRSPISFLSKLGQT 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KA0 ISRKRSPKDKKEKDLDGAGKRRKTSQSEEEEAPRGHRGERPTLVSTLTDRRMDVAVGNQN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 ISRKRSPKDKKEKDLDGAGKRRKTSQSEEEEAPRGHRGERPTLVSTLTDRRMDVAVGNQN 670 680 690 700 710 720 730 740 pF1KA0 KVKYMATQLLAKFEENAPAQSIGIRRQ--------------------------------- ::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 KVKYMATQLLAKFEENAPAQSIGIRRQQREKECSRTCPKKVITLSPPPTPPPCRAHGGQQ 730 740 750 760 770 780 pF1KA0 ------------------------------------------------------------ CCDS46 TYRDLDADNRGKQSPHHERPEPEPPRRFFVDQWELSLSLRSSARPASPSSDSLRQKYIKM 790 800 810 820 830 840 750 760 770 pF1KA0 -------------------------------GSMKKEFPQNLGGSDTCYFCQKRVYVMER ::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 YTGGVSSLAEQIANQLQRKEQPKALLDKKELGSMKKEFPQNLGGSDTCYFCQKRVYVMER 850 860 870 880 890 900 780 790 800 810 820 830 pF1KA0 LSAEGKFFHRSCFKCEYCATTLRLSAYAYDIEDGKFYCKPHYCYRLSGYAQRKRPAVAPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 LSAEGKFFHRSCFKCEYCATTLRLSAYAYDIEDGKFYCKPHYCYRLSGYAQRKRPAVAPL 910 920 930 940 950 960 840 850 860 870 880 890 pF1KA0 SGKEAKGPLQDGATTDANGRANAVASSTERTPGSGVNGLEEPSIAKRLRGTPERIELENY :::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 SGKEAKGPLQDGATTDANGRANAVASSTERTPGSLTSLFGWVARHSLGLCDKAKGMSQHL 970 980 990 1000 1010 1020 900 910 920 930 940 950 pF1KA0 RLSLRQAEALQEVPEETQAEHNLSSVLDTGAEEDVASSSSESEMEEEGEEEEEEPRLPPS CCDS46 QSNISSFGQQVAQNPLDSFFMCQLLAFGVPFLYGLSEVLVQIRGEFHWQAVAQ 1030 1040 1050 1060 1070 >>CCDS60726.1 MICAL2 gene_id:9645|Hs108|chr11 (1103 aa) initn: 3702 init1: 2632 opt: 3330 Z-score: 1404.4 bits: 272.5 E(32554): 6.6e-72 Smith-Waterman score: 3330; 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CCDS78 MASAQEPDKLSMVMYLSKFYELFRGTPLRPVDSWRKNYGENADL-SLAKSSISN-NYLNL 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KA0 TISRKRSPK-DKKEKDLDGAGKRRKTSQSEEEEAPRGHRGERPTLVSTLTDRRMDVAVGN :. :::.:. : . . : .::: . .: . . :. ... . . :: CCDS78 TFPRKRTPRVDGQTGENDMNKRRRKGFTNLDEPSNFSSRS-----LGSNQECGSSKEGGN 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KA0 QNKVKYMATQLLAKFEENA--PAQSIGIRRQGSMKKEFPQNLGGSDTCYFCQKRVYVMER ::::: ::.::::::::.. :. :: ... : . .: . : : CCDS78 QNKVKSMANQLLAKFEESTRNPSLMKQERRVSGIGKPVLCSSSGPPVHSCCPKPEEATPS 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KA0 LSAEGKFFHRSCFKCEYCATTLRLSAYAYDIEDGKFYCKPHYCYRLSGYAQRKRPAVAPL CCDS78 PSPPLKRQFPSVVVTGHVLRELKQVSAGSECLSRPWRARAKSDLQLGGTENFATLPSTRP 780 790 800 810 820 830 >>CCDS60727.1 MICAL2 gene_id:9645|Hs108|chr11 (934 aa) initn: 3704 init1: 2632 opt: 3325 Z-score: 1403.4 bits: 272.0 E(32554): 7.5e-72 Smith-Waterman score: 3659; 62.3% identity (77.8% similar) in 928 aa overlap (1-870:1-919) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MEERKHETMNPAHVLFDRFVQATTCKGTLKAFQELCDHLELKPKDYRSFYHKLKSKLNYW : : . : . : .:. ::::.::::::.::. : ::.: : :.:.:: :::::.. : CCDS60 MGENEDEKQAQAGQVFENFVQASTCKGTLQAFNILTRHLDLDPLDHRNFYSKLKSKVTTW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 KAKALWAKLDKRGSHKDYKKGKACTNTKCLIIGAGPCGLRTAIDLSLLGAKVVVIEKRDA :::::: :::::::::.::.::.::::::::.:.:::::::::.:. :::::::.::::. 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CCDS60 MASAQEPDKLSMVMYLSKFYELFRGTPLRPVDSWRKNYGENADL-SLAKSSISN-NYLNL 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KA0 TISRKRSPK-DKKEKDLDGAGKRRKTSQSEEEEAPRGHRGERPTLVSTLTDRRMDVAVGN :. :::.:. : . . : .::: . .: . . :. ... . . :: CCDS60 TFPRKRTPRVDGQTGENDMNKRRRKGFTNLDEPSNFSSRS-----LGSNQECGSSKEGGN 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 pF1KA0 QNKVKYMATQLLAKFEENA-------------------PAQSIGIRRQGSMKKEFPQNLG ::::: ::.::::::::.. :.. .. : ::.: :: ::: CCDS60 QNKVKSMANQLLAKFEESTRNPSLMKQEKKSPSGFHFHPSHLRTVHPQESMRKSFPLNLG 720 730 740 750 760 770 760 770 780 790 800 810 pF1KA0 GSDTCYFCQKRVYVMERLSAEGKFFHRSCFKCEYCATTLRLSAYAYDIEDGKFYCKPHYC ::::::::.:::::::::::::.:::: ::.: :::::::.::..: ..::::::::. CCDS60 GSDTCYFCKKRVYVMERLSAEGHFFHRECFRCSICATTLRLAAYTFDCDEGKFYCKPHFI 780 790 800 810 820 830 820 830 840 850 860 870 pF1KA0 YRLSGYAQRKRPA-VAPLSGKEAKGPLQDGATTDANGRANAVASSTERTPGSGVNGLEEP . .. :::: : . .:: :.. :. ... .... :: :. CCDS60 HCKTNSKQRKRRAELKQQREEEATWQEQEAPRRDTPTESSCAVAAIGTLEGSP-PGIST- 840 850 860 870 880 880 890 900 910 920 930 pF1KA0 SIAKRLRGTPERI--ELENYRLSLRQAEALQEVPEETQAEHNLSSVLDTGAEEDVASSSS :. ... : : :. .: :. .: :: .:. CCDS60 SFFRKVLGWPLRLPRDLCNWMQGLLQAAGLHIRDNAYNYCYMYELLSLGLPLLWAFSEVL 890 900 910 920 930 940 940 950 960 970 980 990 pF1KA0 ESEMEEEGEEEEEEPRLPPSDLGGVPWKEAVRIHALLKGKSEEELEASKSFGPGNEEEEE CCDS60 AAMYRESEGSLESICNWVLRCFPVKLR 950 960 970 >>CCDS5076.1 MICAL1 gene_id:64780|Hs108|chr6 (1067 aa) initn: 2889 init1: 1106 opt: 2255 Z-score: 957.3 bits: 189.7 E(32554): 5.3e-47 Smith-Waterman score: 2472; 44.4% identity (67.9% similar) in 966 aa overlap (8-958:6-889) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MEERKHETMNPAHVLFDRFVQATTCKGTLKAFQELCDHLELKPKDYRSFYHKLKSKLNYW . ::::. :. :.:: :. .:..::::: : :.: :::.:..:::: CCDS50 MASPTSTNPAHAHFESFLQAQLCQDVLSSFQELCGALGLEPGGGLPQYHKIKDQLNYW 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 KAKALWAKLDKRGSHKDYKKGKACTNTKCLIIGAGPCGLRTAIDLSLLGAKVVVIEKRDA .::.::.:::::... :..:.:::.::::..::::::::.:..:.::::.::..::: CCDS50 SAKSLWTKLDKRAGQPVYQQGRACTSTKCLVVGAGPCGLRVAVELALLGARVVLVEKRTK 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KA0 FSRNNVLHLWPFTIHDLRGLGAKKFYGKFCAGAIDHISIRQLQLILLKVALILGIEIHVN :::.::::::::::::::.::::::::.::.:..::::::::::.::::::.::.::: . CCDS50 FSRHNVLHLWPFTIHDLRALGAKKFYGRFCTGTLDHISIRQLQLLLLKVALLLGVEIHWG 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KA0 VEFQGLIQPPEDQENERIGWRALVHPKTHP-VSEYEFEVIIGGDGRRNTLEGFRRKEFRG : : :: ::: . . :::: ..:. ...:::.:.:.. : . . :::. .:.:: CCDS50 VTFTGL-QPPPRKGS---GWRAQLQPNPPAQLANYEFDVLISAAGGKFVPEGFKVREMRG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 KLAIAITANFINRNTTAEAKVEEISGVAFIFNQKFFQELREATGIDLENIVYYKDDTHYF ::::.:::::.: :. :..: :::::: :.::.::: : .::::::::::::::::::: CCDS50 KLAIGITANFVNGRTVEETQVPEISGVARIYNQSFFQSLLKATGIDLENIVYYKDDTHYF 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 VMTAKKQSLLDKGVILHDYADTELLLSRENVDQEALLSYAREAADFSTQQQLPSLDFAIN ::::::: :: ::. .:. ::. ::. :: ::: ..: ::::.:. .: .:.:: . CCDS50 VMTAKKQCLLRLGVLRQDWPDTNRLLGSANVVPEALQRFTRAAADFATHGKLGKLEFAQD 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 HYGQPDVAMFDFTCMYASENAALVREQNGHQLLVALVGDSLLEPFWPMGTGIARGFLAAM .:::::. :::: :. .:..: :.:..: .::..:::: :.:::::.:::.:::::::. CCDS50 AHGQPDVSAFDFTSMMRAESSARVQEKHGARLLLGLVGDCLVEPFWPLGTGVARGFLAAF 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KA0 DSAWMVRSWSLGTSPLEVLAERESIYRLLPQTTPENVSKNFSQYSIDPVTRYPNINVNFL :.::::. :. :. :::::::::.:.:: ::.:::. .: .::..::.:::::.:. . CCDS50 DAAWMVKRWAEGAESLEVLAERESLYQLLSQTSPENMHRNVAQYGLDPATRYPNLNLRAV 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KA0 RPSQVRHLYDTGETKDIHLEMESLVNSRTTPKLTRNESVARSSKLLGWCQRQTDGYAGVN :.::: :::. . .. . :..: . . :.. . .:: :::.:: :: ::. CCDS50 TPNQVRDLYDVLAKEPVQRN-----NDKTDTGMPATGSAGTQEELLRWCQEQTAGYPGVH 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KA0 VTDLTMSWKSGLALCAIIHRYRPDLIDFDSLDEQNVEKNNQLAFDIAEKELGISPIMTGK :.::. :: .::::::...: .: :.. . :. .. . . :. .::.::::.:..... CCDS50 VSDLSSSWADGLALCALVYRLQPGLLEPSELQGLGALEATAWALKVAENELGITPVVSAQ 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KA0 EMASVGEPDKLSMVMYLTQFYEMFKDSLPSSDTLDLNAEEKAVLIASTRSPISFLSKLGQ : :. : :... ::..:. ::. : .. . .: : . ::::: . CCDS50 --AVVAGSDPLGLIAYLSHFHSAFKSMAHSPGPVSQASP-------GTSSAVLFLSKLQR 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KA0 TISRKRSPKDKKEKDLDGAGKRRKTSQSEEEEAPRGHRGERPTLVSTLTDRRMDVAVGNQ :..:.:. ::. :..::. . . : :.: . : :: CCDS50 TLQRSRA----KENAEDAGGKKLRLEM--EAETPSTEVPPDPEPGVPLTP---------- 650 660 670 680 720 730 740 750 760 770 pF1KA0 NKVKYMATQLLAKFEENAPAQSIGIRRQGSMKKEFPQNLGGSDTCYFCQKRVYVMERLSA :.: :. :..: : .: ...::.::: . CCDS50 ------------------PSQH--------------QEAGAGDLCALCGEHLYVLERLCV 690 700 710 780 790 800 810 820 830 pF1KA0 EGKFFHRSCFKCEYCATTLRLSAYAYDIEDGKFYCKPHYCYRLSGYAQRKRPAVAPLSGK .:.:::::::.:. : .:: ..: ::.::: : : . : . : CCDS50 NGHFFHRSCFRCHTCEATLWPGGYEQHPGDGHFYCLQH-------LPQTDHKAEGSDRGP 720 730 740 750 760 840 850 860 870 880 890 pF1KA0 EAKGPLQDGATTDANGRANAVASSTERTPGSGVNGLEEPSIAKR--LR-GTPERIELENY :. : . : . :. .... : :.: . .:: : .: ..::: .: . CCDS50 ES--P--ELPTPSENSMPPGLSTPTASQEGAG--PVPDPSQPTRRQIRLSSPERQRLSS- 770 780 790 800 810 900 910 920 930 940 pF1KA0 RLSLRQAEALQEVPEETQ-----AEHNLSSVLDTGAEEDVASSSSESEMEEEGEE----- :.: .. :. . :.: : : . .: : : .. ::.: .: CCDS50 -LNLTPDPEMEPPPKPPRSCSALARHALESSF-VGWGLPVQSPQALVAMEKEEKESPFSS 820 830 840 850 860 870 950 960 970 980 990 1000 pF1KA0 EEEEPRLP-PSDLGGVPWKEAVRIHALLKGKSEEELEASKSFGPGNEEEEEEEEEYEEEE :::: .: ::. CCDS50 EEEEEDVPLDSDVEQALQTFAKTSGTMNNYPTWRRTLLRRAKEEEMKRFCKAQTIQRRLN 880 890 900 910 920 930 >>CCDS69170.1 MICAL1 gene_id:64780|Hs108|chr6 (1086 aa) initn: 2889 init1: 1106 opt: 2255 Z-score: 957.1 bits: 189.7 E(32554): 5.4e-47 Smith-Waterman score: 2472; 44.4% identity (67.9% similar) in 966 aa overlap (8-958:25-908) 10 20 30 40 pF1KA0 MEERKHETMNPAHVLFDRFVQATTCKGTLKAFQELCDHLELKP . ::::. :. :.:: :. .:..::::: : :.: CCDS69 MSCLSHSSLPSCCPPQEASMASPTSTNPAHAHFESFLQAQLCQDVLSSFQELCGALGLEP 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KA0 KDYRSFYHKLKSKLNYWKAKALWAKLDKRGSHKDYKKGKACTNTKCLIIGAGPCGLRTAI :::.:..::::.::.::.:::::... :..:.:::.::::..::::::::.:. CCDS69 GGGLPQYHKIKDQLNYWSAKSLWTKLDKRAGQPVYQQGRACTSTKCLVVGAGPCGLRVAV 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KA0 DLSLLGAKVVVIEKRDAFSRNNVLHLWPFTIHDLRGLGAKKFYGKFCAGAIDHISIRQLQ .:.::::.::..::: :::.::::::::::::::.::::::::.::.:..::::::::: CCDS69 ELALLGARVVLVEKRTKFSRHNVLHLWPFTIHDLRALGAKKFYGRFCTGTLDHISIRQLQ 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KA0 LILLKVALILGIEIHVNVEFQGLIQPPEDQENERIGWRALVHPKTHP-VSEYEFEVIIGG :.::::::.::.::: .: : :: ::: . . :::: ..:. ...:::.:.:.. CCDS69 LLLLKVALLLGVEIHWGVTFTGL-QPPPRKGS---GWRAQLQPNPPAQLANYEFDVLISA 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KA0 DGRRNTLEGFRRKEFRGKLAIAITANFINRNTTAEAKVEEISGVAFIFNQKFFQELREAT : . . :::. .:.::::::.:::::.: :. :..: :::::: :.::.::: : .:: CCDS69 AGGKFVPEGFKVREMRGKLAIGITANFVNGRTVEETQVPEISGVARIYNQSFFQSLLKAT 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KA0 GIDLENIVYYKDDTHYFVMTAKKQSLLDKGVILHDYADTELLLSRENVDQEALLSYAREA :::::::::::::::::::::::: :: ::. .:. ::. ::. :: ::: ..: : CCDS69 GIDLENIVYYKDDTHYFVMTAKKQCLLRLGVLRQDWPDTNRLLGSANVVPEALQRFTRAA 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KA0 ADFSTQQQLPSLDFAINHYGQPDVAMFDFTCMYASENAALVREQNGHQLLVALVGDSLLE :::.:. .: .:.:: . .:::::. :::: :. .:..: :.:..: .::..:::: :.: CCDS69 ADFATHGKLGKLEFAQDAHGQPDVSAFDFTSMMRAESSARVQEKHGARLLLGLVGDCLVE 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 PFWPMGTGIARGFLAAMDSAWMVRSWSLGTSPLEVLAERESIYRLLPQTTPENVSKNFSQ ::::.:::.:::::::.:.::::. :. :. :::::::::.:.:: ::.:::. .: .: CCDS69 PFWPLGTGVARGFLAAFDAAWMVKRWAEGAESLEVLAERESLYQLLSQTSPENMHRNVAQ 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 YSIDPVTRYPNINVNFLRPSQVRHLYDTGETKDIHLEMESLVNSRTTPKLTRNESVARSS :..::.:::::.:. . :.::: :::. . .. . :..: . . :.. . CCDS69 YGLDPATRYPNLNLRAVTPNQVRDLYDVLAKEPVQRN-----NDKTDTGMPATGSAGTQE 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KA0 KLLGWCQRQTDGYAGVNVTDLTMSWKSGLALCAIIHRYRPDLIDFDSLDEQNVEKNNQLA .:: :::.:: :: ::.:.::. :: .::::::...: .: :.. . :. .. . . : CCDS69 ELLRWCQEQTAGYPGVHVSDLSSSWADGLALCALVYRLQPGLLEPSELQGLGALEATAWA 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KA0 FDIAEKELGISPIMTGKEMASVGEPDKLSMVMYLTQFYEMFKDSLPSSDTLDLNAEEKAV . .::.::::.:..... : :. : :... ::..:. ::. : .. . CCDS69 LKVAENELGITPVVSAQ--AVVAGSDPLGLIAYLSHFHSAFKSMAHSPGPVSQASP---- 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KA0 LIASTRSPISFLSKLGQTISRKRSPKDKKEKDLDGAGKRRKTSQSEEEEAPRGHRGERPT .: : . ::::: .:..:.:. ::. :..::. . . : :.: . : CCDS69 ---GTSSAVLFLSKLQRTLQRSRA----KENAEDAGGKKLRLEM--EAETPSTEVPPDPE 650 660 670 680 690 710 720 730 740 750 760 pF1KA0 LVSTLTDRRMDVAVGNQNKVKYMATQLLAKFEENAPAQSIGIRRQGSMKKEFPQNLGGSD :: :.: :. :..: CCDS69 PGVPLTP----------------------------PSQH--------------QEAGAGD 700 710 770 780 790 800 810 820 pF1KA0 TCYFCQKRVYVMERLSAEGKFFHRSCFKCEYCATTLRLSAYAYDIEDGKFYCKPHYCYRL : .: ...::.::: ..:.:::::::.:. : .:: ..: ::.::: : CCDS69 LCALCGEHLYVLERLCVNGHFFHRSCFRCHTCEATLWPGGYEQHPGDGHFYCLQH----- 720 730 740 750 760 830 840 850 860 870 880 pF1KA0 SGYAQRKRPAVAPLSGKEAKGPLQDGATTDANGRANAVASSTERTPGSGVNGLEEPSIAK : . : . : :. : . : . :. .... : :.: . .:: CCDS69 --LPQTDHKAEGSDRGPES--P--ELPTPSENSMPPGLSTPTASQEGAG--PVPDPSQPT 770 780 790 800 810 820 890 900 910 920 930 pF1KA0 R--LR-GTPERIELENYRLSLRQAEALQEVPEETQ-----AEHNLSSVLDTGAEEDVASS : .: ..::: .: . :.: .. :. . :.: : : . .: : : CCDS69 RRQIRLSSPERQRLSS--LNLTPDPEMEPPPKPPRSCSALARHALESSF-VGWGLPVQSP 830 840 850 860 870 940 950 960 970 980 pF1KA0 SSESEMEEEGEE-----EEEEPRLP-PSDLGGVPWKEAVRIHALLKGKSEEELEASKSFG .. ::.: .: :::: .: ::. CCDS69 QALVAMEKEEKESPFSSEEEEEDVPLDSDVEQALQTFAKTSGTMNNYPTWRRTLLRRAKE 880 890 900 910 920 930 >>CCDS55047.1 MICAL1 gene_id:64780|Hs108|chr6 (981 aa) initn: 2208 init1: 858 opt: 1291 Z-score: 556.7 bits: 115.4 E(32554): 1.1e-24 Smith-Waterman score: 2030; 40.1% identity (61.0% similar) in 966 aa overlap (8-958:6-803) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MEERKHETMNPAHVLFDRFVQATTCKGTLKAFQELCDHLELKPKDYRSFYHKLKSKLNYW . ::::. :. :.:: :. .:..::::: : :.: :::.:..:::: CCDS55 MASPTSTNPAHAHFESFLQAQLCQDVLSSFQELCGALGLEPGGGLPQYHKIKDQLNYW 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 KAKALWAKLDKRGSHKDYKKGKACTNTKCLIIGAGPCGLRTAIDLSLLGAKVVVIEKRDA .::.::.:::::... :..:.:::.::::..::::::::.:..:.::::.::..::: CCDS55 SAKSLWTKLDKRAGQPVYQQGRACTSTKCLVVGAGPCGLRVAVELALLGARVVLVEKRTK 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KA0 FSRNNVLHLWPFTIHDLRGLGAKKFYGKFCAGAIDHISIRQLQLILLKVALILGIEIHVN :::.::::::::::::::.::::::::.::.:..::::::::::.::::::.::.::: . CCDS55 FSRHNVLHLWPFTIHDLRALGAKKFYGRFCTGTLDHISIRQLQLLLLKVALLLGVEIHWG 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KA0 VEFQGLIQPPEDQENERIGWRALVHPKTHP-VSEYEFEVIIGGDGRRNTLEGFRRKEFRG : : :: ::: . . :::: ..:. ...:::.:.:.. : . . :::. .:.:: CCDS55 VTFTGL-QPPPRKGS---GWRAQLQPNPPAQLANYEFDVLISAAGGKFVPEGFKVREMRG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 KLAIAITANFINRNTTAEAKVEEISGVAFIFNQKFFQELREATGIDLENIVYYKDDTHYF ::::.:::::.: :. :..: :::::: :.::.::: : .::::::::::::::::::: CCDS55 KLAIGITANFVNGRTVEETQVPEISGVARIYNQSFFQSLLKATGIDLENIVYYKDDTHYF 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 VMTAKKQSLLDKGVILHDYADTELLLSRENVDQEALLSYAREAADFSTQQQLPSLDFAIN ::::::: :: :: CCDS55 VMTAKKQCLLRLGV---------------------------------------------- 300 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 HYGQPDVAMFDFTCMYASENAALVREQNGHQLLVALVGDSLLEPFWPMGTGIARGFLAAM : .::::.:::.:::::::. CCDS55 ----------------------------------------LRQPFWPLGTGVARGFLAAF 310 320 420 430 440 450 460 470 pF1KA0 DSAWMVRSWSLGTSPLEVLAERESIYRLLPQTTPENVSKNFSQYSIDPVTRYPNINVNFL :.::::. :. :. :::::::::.:.:: ::.:::. .: .::..::.:::::.:. . CCDS55 DAAWMVKRWAEGAESLEVLAERESLYQLLSQTSPENMHRNVAQYGLDPATRYPNLNLRAV 330 340 350 360 370 380 480 490 500 510 520 530 pF1KA0 RPSQVRHLYDTGETKDIHLEMESLVNSRTTPKLTRNESVARSSKLLGWCQRQTDGYAGVN :.::: :::. . .. . :..: . . :.. . .:: :::.:: :: ::. CCDS55 TPNQVRDLYDVLAKEPVQRN-----NDKTDTGMPATGSAGTQEELLRWCQEQTAGYPGVH 390 400 410 420 430 440 540 550 560 570 580 590 pF1KA0 VTDLTMSWKSGLALCAIIHRYRPDLIDFDSLDEQNVEKNNQLAFDIAEKELGISPIMTGK :.::. :: .::::::...: .: :.. . :. .. . . :. .::.::::.:..... CCDS55 VSDLSSSWADGLALCALVYRLQPGLLEPSELQGLGALEATAWALKVAENELGITPVVSAQ 450 460 470 480 490 500 600 610 620 630 640 650 pF1KA0 EMASVGEPDKLSMVMYLTQFYEMFKDSLPSSDTLDLNAEEKAVLIASTRSPISFLSKLGQ : :. : :... ::..:. ::. : .. . .: : . ::::: . CCDS55 --AVVAGSDPLGLIAYLSHFHSAFKSMAHSPGPVSQASP-------GTSSAVLFLSKLQR 510 520 530 540 550 660 670 680 690 700 710 pF1KA0 TISRKRSPKDKKEKDLDGAGKRRKTSQSEEEEAPRGHRGERPTLVSTLTDRRMDVAVGNQ :..:.:. ::. :..::. . . : :.: . : :: CCDS55 TLQRSRA----KENAEDAGGKKLRLEM--EAETPSTEVPPDPEPGVPLTP---------- 560 570 580 590 720 730 740 750 760 770 pF1KA0 NKVKYMATQLLAKFEENAPAQSIGIRRQGSMKKEFPQNLGGSDTCYFCQKRVYVMERLSA :.: :. :..: : .: ...::.::: . CCDS55 ------------------PSQH--------------QEAGAGDLCALCGEHLYVLERLCV 600 610 620 780 790 800 810 820 830 pF1KA0 EGKFFHRSCFKCEYCATTLRLSAYAYDIEDGKFYCKPHYCYRLSGYAQRKRPAVAPLSGK .:.:::::::.:. : .:: ..: ::.::: : : . : . : CCDS55 NGHFFHRSCFRCHTCEATLWPGGYEQHPGDGHFYCLQH-------LPQTDHKAEGSDRGP 630 640 650 660 670 840 850 860 870 880 890 pF1KA0 EAKGPLQDGATTDANGRANAVASSTERTPGSGVNGLEEPSIAKR--LR-GTPERIELENY :. : . : . :. .... : :.: . .:: : .: ..::: .: . CCDS55 ES--P--ELPTPSENSMPPGLSTPTASQEGAG--PVPDPSQPTRRQIRLSSPERQRLSS- 680 690 700 710 720 730 900 910 920 930 940 pF1KA0 RLSLRQAEALQEVPEETQ-----AEHNLSSVLDTGAEEDVASSSSESEMEEEGEE----- :.: .. :. . :.: : : . .: : : .. ::.: .: CCDS55 -LNLTPDPEMEPPPKPPRSCSALARHALESSF-VGWGLPVQSPQALVAMEKEEKESPFSS 740 750 760 770 780 790 950 960 970 980 990 1000 pF1KA0 EEEEPRLP-PSDLGGVPWKEAVRIHALLKGKSEEELEASKSFGPGNEEEEEEEEEYEEEE :::: .: ::. CCDS55 EEEEEDVPLDSDVEQALQTFAKTSGTMNNYPTWRRTLLRRAKEEEMKRFCKAQTIQRRLN 800 810 820 830 840 850 1918 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 10:22:14 2016 done: Thu Nov 3 10:22:16 2016 Total Scan time: 5.680 Total Display time: 0.530 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]