FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0822, 1581 aa
1>>>pF1KA0822 1581 - 1581 aa - 1581 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4094+/-0.00127; mu= 17.8635+/- 0.075
mean_var=80.7162+/-16.188, 0's: 0 Z-trim(101.2): 69 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.142756
statistics sampled from 6359 (6420) to 6359 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.529), E-opt: 0.2 (0.197), width: 16
Scan time: 4.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11680.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17 (1581) 10404 2153.8 0
CCDS74139.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17 (1621) 6504 1350.5 0
CCDS74138.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17 (1616) 6450 1339.4 0
CCDS11681.1 ABCA9 gene_id:10350|Hs108|chr17 (1624) 2721 571.4 8e-162
CCDS11683.1 ABCA6 gene_id:23460|Hs108|chr17 (1617) 2261 476.7 2.6e-133
CCDS11684.1 ABCA10 gene_id:10349|Hs108|chr17 (1543) 2080 439.4 4.2e-122
CCDS11685.1 ABCA5 gene_id:23461|Hs108|chr17 (1642) 1498 319.5 5.4e-86
CCDS47584.1 ABCA13 gene_id:154664|Hs108|chr7 (5058) 738 163.2 2e-38
CCDS12055.1 ABCA7 gene_id:10347|Hs108|chr19 (2146) 715 158.3 2.4e-37
CCDS10466.1 ABCA3 gene_id:21|Hs108|chr16 (1704) 515 117.1 4.9e-25
CCDS33373.1 ABCA12 gene_id:26154|Hs108|chr2 (2277) 370 87.3 6.3e-16
CCDS33372.1 ABCA12 gene_id:26154|Hs108|chr2 (2595) 370 87.3 7.1e-16
CCDS6762.1 ABCA1 gene_id:19|Hs108|chr9 (2261) 311 75.1 2.8e-12
CCDS747.1 ABCA4 gene_id:24|Hs108|chr1 (2273) 306 74.1 5.8e-12
CCDS43909.1 ABCA2 gene_id:20|Hs108|chr9 (2436) 301 73.1 1.3e-11
>>CCDS11680.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17 (1581 aa)
initn: 10404 init1: 10404 opt: 10404 Z-score: 11570.5 bits: 2153.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10404; 100.0% identity (100.0% similar) in 1581 aa overlap (1-1581:1-1581)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 PEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 QAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 VVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 TIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEIFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEIFLL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 DEPTAGLDPFSRHQVWNLLKERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DEPTAGLDPFSRHQVWNLLKERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 FLKKKWGIGYHLSLQLNEICVEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FLKKKWGIGYHLSLQLNEICVEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 LYKDLDSYPDLGIENYGVSMTTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LYKDLDSYPDLGIENYGVSMTTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 MEQVLSSLNKMRKTIGGVALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MEQVLSSLNKMRKTIGGVALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 YTMVKIYQNSYTWELSPHLYFLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YTMVKIYQNSYTWELSPHLYFLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 VDAFGTRNGTDDPSYNGAITVCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VDAFGTRNGTDDPSYNGAITVCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 VHIRTERSTFLENGQDNPIGFLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VHIRTERSTFLENGQDNPIGFLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 SPSAYWFGQALVDVSLYFLVFVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPSAYWFGQALVDVSLYFLVFVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 YVISFIFRKGRKNSGIWSFCFYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YVISFIFRKGRKNSGIWSFCFYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 SSHLLFSSLFSEERMDVQPFLVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSHLLFSSLFSEERMDVQPFLVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 SSDVCQNPEEPEGEDEDVQMERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSDVCQNPEEPEGEDEDVQMERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 KNKIATRNVSFCVRKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KNKIATRNVSFCVRKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEF
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 LGYCPQENALWPNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LGYCPQENALWPNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 GIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAE
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 AEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAA
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 RQERYSSLMVYKLPVEDVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RQERYSSLMVYKLPVEDVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQEL
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580
pF1KA0 GDFEEDFDPSVKWKLLPQEEP
:::::::::::::::::::::
CCDS11 GDFEEDFDPSVKWKLLPQEEP
1570 1580
>>CCDS74139.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17 (1621 aa)
initn: 6504 init1: 6504 opt: 6504 Z-score: 7229.4 bits: 1350.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10266; 97.5% identity (97.5% similar) in 1613 aa overlap (9-1581:9-1621)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 PEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 QAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 VVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KA0 TIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEI---
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEIQRV
550 560 570 580 590 600
600 610 620
pF1KA0 -------------------------------------FLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLLK
:::::::::::::::::::::::
CCDS74 LLELEMKNIQDVLAQNLSGGQKRKLTFGIAILGDPQIFLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLLK
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 ERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEIC
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 VEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVSM
730 740 750 760 770 780
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 TTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGVAL
790 800 810 820 830 840
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 WRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 WRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLY
850 860 870 880 890 900
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 FLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGAIT
910 920 930 940 950 960
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 VCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIG
970 980 990 1000 1010 1020
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 FLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFLV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA0 FVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWSFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWSFC
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA0 FYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSSLFSEERMDVQPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSSLFSEERMDVQPF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA0 LVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSDVCQNPEEPEGEDEDVQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSDVCQNPEEPEGEDEDVQM
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KA0 ERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSFCVRKGEVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSFCVRKGEVLG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KA0 LLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEFLGYCPQENALWPNLTVRQHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEFLGYCPQENALWPNLTVRQHL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KA0 EVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVL
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KA0 LDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIG
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KA0 SIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQP
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1530 1540 1550 1560 1570 1580
pF1KA0 LAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEE
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 P
:
CCDS74 P
>>CCDS74138.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17 (1616 aa)
initn: 6456 init1: 3975 opt: 6450 Z-score: 7169.3 bits: 1339.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10212; 97.2% identity (97.2% similar) in 1613 aa overlap (9-1581:9-1616)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 PEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 QAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 VVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KA0 TIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEI---
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEIQRV
550 560 570 580 590 600
600 610 620
pF1KA0 -------------------------------------FLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLLK
:::::::::::::::::::::::
CCDS74 LLELEMKNIQDVLAQNLSGGQKRKLTFGIAILGDPQIFLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLLK
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 ERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEIC
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 VEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVSM
730 740 750 760 770 780
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 TTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGVAL
790 800 810 820 830 840
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 WRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 WRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLY
850 860 870 880 890 900
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 FLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGAIT
910 920 930 940 950 960
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 VCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIG
970 980 990 1000 1010 1020
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 FLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFLV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA0 FVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWSFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWSFC
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA0 FYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSSLFSEERMDVQPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSSLFSEERMDVQPF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA0 LVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSDVCQNPEEPEGEDEDVQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS74 LVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFF-----SSDVCQNPEEPEGEDEDVQM
1210 1220 1230 1240 1250
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KA0 ERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSFCVRKGEVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSFCVRKGEVLG
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KA0 LLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEFLGYCPQENALWPNLTVRQHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEFLGYCPQENALWPNLTVRQHL
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KA0 EVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVL
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KA0 LDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIG
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KA0 SIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQP
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1530 1540 1550 1560 1570 1580
pF1KA0 LAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEE
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KA0 P
:
CCDS74 P
>>CCDS11681.1 ABCA9 gene_id:10350|Hs108|chr17 (1624 aa)
initn: 5251 init1: 2514 opt: 2721 Z-score: 3018.7 bits: 571.4 E(32554): 8e-162
Smith-Waterman score: 7440; 69.5% identity (86.6% similar) in 1615 aa overlap (1-1571:1-1614)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIY-PHSHQVNDFSSL
: ::..:: :::::::::: ::::::::..:.::: :.::.: ::.. . :::.: ..
CCDS11 MSKRRMSVGQQTWALLCKNCLKKWRMKRQTLLEWLFSFLLVLFLYLFFSNLHQVHDTPQM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 LTMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTAN
.:::::::.::.. . ....: ..:::.:::::::.::: :. ..: :::.:. :. :
CCDS11 SSMDLGRVDSFNDTNYVIAFAPESKTTQEIMNKVASAPFLKGRTIMGWPDEKSMDELDLN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 YPEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVA
: . ::: ::.:.:::::: :: .: :::.::.::: .:: . :: : ::..::::
CCDS11 YSIDAVRVIFTDTFSYHLKFSWGHRIPMMKEHRDHSAHCQAVNEKMKCEGSEFWEKGFVA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 LQAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYY
.:::::::::::.:::::::.:::::: .::. :..:.:: ::...: ::::::.::::
CCDS11 FQAAINAAIIEIATNHSVMEQLMSVTGVHMKILPFVAQGGVATDFFIFFCIISFSTFIYY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 ASVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGF
.:::::.::. . .::::::::.:::::::::.:::::.::: ..::...:.:...:.::
CCDS11 VSVNVTQERQYITSLMTMMGLRESAFWLSWGLMYAGFILIMATLMALIVKSAQIVVLTGF
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 MVVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEW
..::.:::::::::..::::::.:.:: :::::::::: :::: ::: .:: .::: :::
CCDS11 VMVFTLFLLYGLSLITLAFLMSVLIKKPFLTGLVVFLLIVFWGILGFPALYTRLPAFLEW
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 ILSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYF
: ::::::: .:::::.:::::.:::: :.. ::.:: :::.::: :::.:..::
CCDS11 TLCLLSPFAFTVGMAQLIHLDYDVNSNAHLDSSQNPYLIIATLFMLVFDTLLYLVLTLYF
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 EKILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEA
.:::: ::::: ::::::: :: : ...::.::.: :.::. .: :: . ::: ::::
CCDS11 DKILPAEYGHRCSPLFFLKSCFWFQHGRANHVVLENETDSDPTPNDCFEPVSPEFCGKEA
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 IRIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGS
:::.:. ::: :: ...:::: .:::::::::::.::::::::.:::::::::::::.::
CCDS11 IRIKNLKKEYAGKCERVEALKGVVFDIYEGQITALLGHSGAGKTTLLNILSGLSVPTSGS
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 VTIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEI--
::.::. ::.:::.::.::.:: :::::::: ::::.::::::::::::::.::.::.
CCDS11 VTVYNHTLSRMADIENISKFTGFCPQSNVQFGFLTVKENLRLFAKIKGILPHEVEKEVQR
550 560 570 580 590 600
600 610
pF1KA0 --------------------------------------FLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLL
.:::::::::::.:::..::::
CCDS11 VVQELEMENIQDILAQNLSGGQNRKLTFGIAILGDPQVLLLDEPTAGLDPLSRHRIWNLL
610 620 630 640 650 660
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 KERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEI
:: :.::::::::::.::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS11 KEGKSDRVILFSTQFIDEADILADRKVFISNGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLHLNER
670 680 690 700 710 720
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 CVEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVS
: :.::::::::: ::::.:.:: ::.: :::::::::::::.::: . :::.::::
CCDS11 CDPESITSLVKQHISDAKLTAQSEEKLVYILPLERTNKFPELYRDLDRCSNQGIEDYGVS
730 740 750 760 770 780
740 750 760 770 780 790
pF1KA0 MTTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGVA
.::::::::::::::::.::::.: :..:.. : : :::.::::::... ::::.:::
CCDS11 ITTLNEVFLKLEGKSTIDESDIGIWGQLQTDGAKDIGSLVELEQVLSSFHETRKTISGVA
790 800 810 820 830 840
800 810 820 830 840 850
pF1KA0 LWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHL
:::::.::::.::.::::.:::.: ..::.. .: : :.:. . . ::.:: :::::.
CCDS11 LWRQQVCAIAKVRFLKLKKERKSLWTILLLFGISFIPQLLEHLFYESYQKSYPWELSPNT
850 860 870 880 890 900
860 870 880 890 900 910
pF1KA0 YFLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGAI
:::.:::::.::::.::.:::::..::.:..:...::::.::::::::::::::::::::
CCDS11 YFLSPGQQPQDPLTHLLVINKTGSTIDNFLHSLRRQNIAIEVDAFGTRNGTDDPSYNGAI
910 920 930 940 950 960
920 930 940 950 960 970
pF1KA0 TVCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPI
: .::.. ::.:::.:::::::::.:..::::::. . : ::.:.::::.:. .:
CCDS11 IVSGDEKDHRFSIACNTKRLNCFPVLLDVISNGLLGIFNSSEHIQTDRSTFFEEHMDYEY
970 980 990 1000 1010 1020
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA0 GFLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFL
:. . .::. ...: :::::::: :::..:.:::::::: ::::::::::::::::::
CCDS11 GYRSNTFFWIPMAASFTPYIAMSSIGDYKKKAHSQLRISGLYPSAYWFGQALVDVSLYFL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA0 VFVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHI-IQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWS
..... .:.:: . :.... : .. ::: :..:: ::.:.:::::::::.:::::::::
CCDS11 ILLLMQIMDYIFSPEEIIFIIQNLLIQILCSIGYVSSLVFLTYVISFIFRNGRKNSGIWS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KA0 FCFYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSSL--FSEERMD
: : .:..::... .. . :. :.:::: :.:: ::. :.. .:. .. . .
CCDS11 FFFLIVVIFSIVATDLNEYGFLGLFFGTMLIPPFTLIGSLFIFSEISPDSMDYLGASESE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KA0 VQPFLVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSDVCQNPEEPEGEDE
. .:..:::.:::.:::: ::::: . :: ::::: :::::::. . ::::::::.:
CCDS11 IV-YLALLIPYLHFLIFLFILRCLEMNCRKKLMRKDPVFRISPRSNAIFPNPEEPEGEEE
1210 1220 1230 1240 1250
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KA0 DVQMERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSFCVRKG
:.::::.::.::. .::: :::::::::::::::.:.::::::.:::::::::::.::
CCDS11 DIQMERMRTVNAMAVRDFDETPVIIASCLRKEYAGKKKNCFSKRKKKIATRNVSFCVKKG
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KA0 EVLGLLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEFLGYCPQENALWPNLTV
::.::::::::::::.::.::::::::::::.:::::::. : :::::::::::::::::
CCDS11 EVIGLLGHNGAGKSTTIKMITGDTKPTAGQVILKGSGGGEPLGFLGYCPQENALWPNLTV
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KA0 RQHLEVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNP
:::::::::::::::::: .::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS11 RQHLEVYAAVKGLRKGDAMIAITRLVDALKLQDQLKAPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNP
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KA0 SVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRL
::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQVIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRL
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1460 1470 1480 1490 1500 1510
pF1KA0 RCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVE
::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::.:::.:::::::::::
CCDS11 RCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKLKNLAQMEPLHAEILRLFPQAAQQERFSSLMVYKLPVE
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1520 1530 1540 1550 1560 1570
pF1KA0 DVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLL
::.::.::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS11 DVRPLSQAFFKLEIVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDLEEDFDPSVKWKLL
1560 1570 1580 1590 1600 1610
1580
pF1KA0 PQEEP
CCDS11 LQEEP
1620
>>CCDS11683.1 ABCA6 gene_id:23460|Hs108|chr17 (1617 aa)
initn: 4821 init1: 1808 opt: 2261 Z-score: 2506.7 bits: 476.7 E(32554): 2.6e-133
Smith-Waterman score: 5943; 57.7% identity (79.4% similar) in 1625 aa overlap (1-1576:1-1611)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
: .. :: ::: ::::::::::::::::::.:: :.:: ::. .. : . .: ..
CCDS11 MNMKQKSVYQQTKALLCKNFLKKWRMKRESLLEWGLSILLGLCIALFSSSMRNVQFPGMA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KA0 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKE-FTAN
..::::: :: : . :::::..: :::::::.: .:.: : :.: :.. . : . :
CCDS11 PQNLGRVDKFNSSSLMVVYTPISNLTQQIMNKTALAPLLKGTSVIGAPNKTHMDEILLEN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 YPEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVA
: . . :..:.::.: :. :.. : :: : .:::.. . : .. .:..::::
CCDS11 LPYAM-GIIFNETFSYKLIFFQGYNSPLWKE--DFSAHCWDGYGEFSCTLTKYWNRGFVA
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 LQAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYY
::.:::.::::::::: :::::::::. .:: :: .. . ...... .. :: ..:.
CCDS11 LQTAINTAIIEITTNHPVMEELMSVTAITMKTLPFITKNLLHNEMFILFFLLHFSPLVYF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 ASVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGF
:.:::.:::. : :: ::::.::::::::::.:::::::...:....: ::.:...::
CCDS11 ISLNVTKERKKSKNLMKMMGLQDSAFWLSWGLIYAGFIFIISIFVTIIITFTQIIVMTGF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 MVVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEW
::.: ::.:::::::::.::::.:.::. ::.:::::::.:::::::: .:..::.::::
CCDS11 MVIFILFFLYGLSLVALVFLMSVLLKKAVLTNLVVFLLTLFWGCLGFTVFYEQLPSSLEW
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 ILSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYF
::.. ::::: :: :...:::.::. :: :: : ..:: :: .: .:: ::.::
CCDS11 ILNICSPFAFTTGMIQIIKLDYNLNGVIFPDPSGDSYTMIATFSMLLLDGLIYLLLALYF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 EKILPNEYGHRR--PPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGK
.:::: :: .: :::::.:: : :.:. ..: :.::. : :: . ::::::
CCDS11 DKILP--YGDERHYSPLFFLNSSSCFQHQRTNAKVIEKEIDAEHPSDDYFEPVAPEFQGK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 EAIRIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTK
:::::::: :::::: :.:::: :.::::::::::::::::::::.:::::.::::::.
CCDS11 EAIRIRNVKKEYKGKSGKVEALKGLLFDIYEGQITAILGHSGAGKSSLLNILNGLSVPTE
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 GSVTIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGI----LPQEV
:::::::..:::: :::.. :.:::::: :::::.:::.::: :::::::: . :::
CCDS11 GSVTIYNKNLSEMQDLEEIRKITGVCPQFNVQFDILTVKENLSLFAKIKGIHLKEVEQEV
540 550 560 570 580 590
600 610
pF1KA0 ------------------------------------DKEIFLLDEPTAGLDPFSRHQVWN
: .:.::::::.::::::: :::.
CCDS11 QRILLELDMQNIQDNLAKHLSEGQKRKLTFGITILGDPQILLLDEPTTGLDPFSRDQVWS
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 LLKERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLN
::.::..:.::::::: ::::::::::::..:.:.:::::::.:::..::.::::::. :
CCDS11 LLRERRADHVILFSTQSMDEADILADRKVIMSNGRLKCAGSSMFLKRRWGLGYHLSLHRN
660 670 680 690 700 710
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 EICVEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYG
::: :.:::.. .:::::::..... ::.::::::::: ::.:..:::. : :. .:
CCDS11 EICNPEQITSFITHHIPDAKLKTENKEKLVYTLPLERTNTFPDLFSDLDKCSDQGVTGYD
720 730 740 750 760 770
740 750 760 770 780 790
pF1KA0 VSMTTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGG
.::.::::::.::::.::: :.:. :.: :.: : ::: . ::...:. ...
CCDS11 ISMSTLNEVFMKLEGQSTI-EQDFE-----QVEMIRDSESLNEMELAHSSFSEMQTAVSD
780 790 800 810 820
800 810 820 830 840 850
pF1KA0 VALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSP
..:::.:. :.::.:.::::.. :.::.:::.. .. ::.:: : . ... ::..
CCDS11 MGLWRMQVFAMARLRFLKLKRQTKVLLTLLLVFGIAIFPLIVENIMYAMLNEKIDWEFKN
830 840 850 860 870 880
860 870 880 890 900 910
pF1KA0 HLYFLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNG
.::::.::: :..: :.:::::.: ..:.:::.:..:::: :::: : .::::: ::::
CCDS11 ELYFLSPGQLPQEPRTSLLIINNTESNIEDFIKSLKHQNILLEVDDFENRNGTDGLSYNG
890 900 910 920 930 940
920 930 940 950 960 970
pF1KA0 AITVCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDN
:: : ..:.: ::..::.:::.:::.::.:.::::: : . . ::: : : : .
CCDS11 AIIVSGKQKDYRFSVVCNTKRLHCFPILMNIISNGLLQMFNHTQHIRIESSPFPLSHIGL
950 960 970 980 990 1000
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA0 PIGFLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLY
:. .: ... : :::.:.::.:::. :.::: :::: :::: ::::::::..
CCDS11 WTGLPDGSFFLFLVLCSISPYITMGSISDYKKNAKSQLWISGLYTSAYWCGQALVDVSFF
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA0 FLVFVFIYLMSYISNFEDMLLT--IIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSG
.:.....::. :: :.. .:.: :. . : . ::. ::.:. :.::::::: :::::
CCDS11 ILILLLMYLIFYIENMQYLLITSQIVFALVI-VTPGYAASLVFFIYMISFIFRKRRKNSG
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KA0 IWSFCFYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGC-LFLSSH-LLFSSLFSEE
.::: :. .... . .. :. .: . :.: :..: :: . : :
CCDS11 LWSFYFFFASTIMFSITLINHFDLSILITTMVLVPSYTLLGFKTFLEVRDQEHYREFPEA
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KA0 RMDVQP--FLVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSDVCQNPEEP
.... ::: .::... ..:.:.:::.: : ::: ::::: :::::.: :. :::::
CCDS11 NFELSATDFLVCFIPYFQTLLFVFVLRCMELKCGKKRMRKDPVFRISPQSRDAKPNPEEP
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KA0 EGEDEDVQMERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSF
::::.: ::.:::.::... .:::::::::::.:::::..:.::::::.:::.::.::
CCDS11 IDEDEDIQTERIRTATALTTSILDEKPVIIASCLHKEYAGQKKSCFSKRKKKIAARNISF
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KA0 CVRKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEFLGYCPQENALW
::..::.::::: ::::::.::..:.: ::::::.: ::: .. .: ::::::::.::
CCDS11 CVQEGEILGLLGPNGAGKSSSIRMISGITKPTAGEVELKGCSS--VLGHLGYCPQENVLW
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KA0 PNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLS
: ::.:.:::::::::::::.::..::.:::.:.::..::. ::. :. :: ::::::::
CCDS11 PMLTLREHLEVYAAVKGLRKADARLAIARLVSAFKLHEQLNVPVQKLTAGITRKLCFVLS
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KA0 ILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIM
.::: :.::::::::.:: :::::::::.:. .:::::.::::: .:::::.:::::::
CCDS11 LLGNSPVLLLDEPSTGIDPTGQQQMWQAIQAVVKNTERGVLLTTHNLAEAEALCDRVAIM
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1460 1470 1480 1490 1500 1510
pF1KA0 VSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSSLMVY
:::::::::::::::.:.::::.::.:::. .:: .:.:::.:::::: :::::::..:
CCDS11 VSGRLRCIGSIQHLKNKLGKDYILELKVKETSQVTLVHTEILKLFPQAAGQERYSSLLTY
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1520 1530 1540 1550 1560 1570
pF1KA0 KLPVEDVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSV
:::: :: ::.:.: ::: ::..:.:::::::: :::.::::::::::.:.:.:..: ..
CCDS11 KLPVADVYPLSQTFHKLEAVKHNFNLEEYSLSQCTLEKVFLELSKEQEVGNFDEEIDTTM
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1580
pF1KA0 KWKLLPQEEP
.::::
CCDS11 RWKLLPHSDEP
1610
>>CCDS11684.1 ABCA10 gene_id:10349|Hs108|chr17 (1543 aa)
initn: 4132 init1: 2077 opt: 2080 Z-score: 2305.6 bits: 439.4 E(32554): 4.2e-122
Smith-Waterman score: 5913; 59.9% identity (81.5% similar) in 1525 aa overlap (90-1562:1-1524)
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 LTMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIK-EFTA
:::.: . :. :. :.: ::::.. :.
CCDS11 MNKMALASFMKGRTVIGTPDEETMDIELPK
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 NYPEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFV
.: .:.: : :..:.::.::: :. .:. :::...: ::. . ...: .. .: .:::
CCDS11 KY-HEMVGVIFSDTFSYRLKFNWGYRIPVIKEHSEYTEHCWAMHGEIFCYLAKYWLKGFV
40 50 60 70 80
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 ALQAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIY
:.::::::::::.:::::::::: :: : :::. ::... .... . :.:..:::::::
CCDS11 AFQAAINAAIIEVTTNHSVMEELTSVIGINMKIPPFISKGEIMNEWFHFTCLVSFSSFIY
90 100 110 120 130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 YASVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSG
.::.::.::: ..: :::.::::.::::::::: : :::::..:.:::: : ... .:
CCDS11 FASLNVARERGKFKKLMTVMGLRESAFWLSWGLTYICFIFIMSIFMALVITSIPIVFHTG
150 160 170 180 190 200
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 FMVVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLE
:::.:.:. ::::::.:::::::.:..: .:.::. ::.:::::::::: :::.:: ::
CCDS11 FMVIFTLYSLYGLSLIALAFLMSVLIRKPMLAGLAGFLFTVFWGCLGFTVLYRQLPLSLG
210 220 230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 WILSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIY
:.::::::::: ::::. ::: :.. :: :: : ..:: :.::::: .:: ...:
CCDS11 WVLSLLSPFAFTAGMAQITHLDNYLSGVIFPDPSGDSYKMIATFFILAFDTLFYLIFTLY
270 280 290 300 310 320
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 FEKILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKE
::..::.. :: :::::::::::. :.: : .:.:.. . : :::: . :::.:::
CCDS11 FERVLPDKDGHGDSPLFFLKSSFWSKHQNTHHEIFENEINPEHSSDDSFEPVSPEFHGKE
330 340 350 360 370 380
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 AIRIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKG
::::::: :::.:: :.:::. . ::::::::::::::.:::::::::::::::: :.:
CCDS11 AIRIRNVIKEYNGKTGKVEALQGIFFDIYEGQITAILGHNGAGKSTLLNILSGLSVSTEG
390 400 410 420 430 440
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 SVTIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEI-
:.::::..:::..:.:.. : : ::: : ::::::::::::.::::::: :.::..:.
CCDS11 SATIYNTQLSEITDMEEIRKNIGFCPQFNFQFDFLTVRENLRVFAKIKGIQPKEVEQEVK
450 460 470 480 490 500
600 610
pF1KA0 ---------------------------------------FLLDEPTAGLDPFSRHQVWNL
.:::::::::::::::.::.:
CCDS11 RIIMELDMQSIQDIIAKKLSGGQKRKLTLGIAILGDPQVLLLDEPTAGLDPFSRHRVWSL
510 520 530 540 550 560
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 LKERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNE
:::.:.::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::::::::::. ::
CCDS11 LKEHKVDRLILFSTQFMDEADILADRKVFLSNGKLKCAGSSLFLKRKWGIGYHLSLHRNE
570 580 590 600 610 620
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 ICVEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGV
.: :.::::.:::::::::...:: ::.:.::::.:::::.::.:::. : ::.::.:
CCDS11 MCDTEKITSLIKQHIPDAKLTTESEEKLVYSLPLEKTNKFPDLYSDLDKCSDQGIRNYAV
630 640 650 660 670 680
740 750 760 770 780 790
pF1KA0 SMTTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGV
:.:.::::::.:::::.:.: :. : . . . . .: :::::: :: . ::.....
CCDS11 SVTSLNEVFLNLEGKSAIDEPDFDIGKQEKIHVTRNTGDESEMEQVLCSLPETRKAVSSA
690 700 710 720 730 740
800 810 820 830 840 850
pF1KA0 ALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPH
::::.:: :.: .:.:::..::.::: :::.: .: :...: : :. .... ::.::
CCDS11 ALWRRQIYAVATLRFLKLRRERRALLCLLLVLGIAFIPIILEKIMYKVTRETHCWEFSPS
750 760 770 780 790 800
860 870 880 890 900 910
pF1KA0 LYFLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGA
.:::. : :. :::.:::.:.::..:.:...:.. :.:.::.: : .:::.::::::::
CCDS11 MYFLSLEQIPKTPLTSLLIVNNTGSNIEDLVHSLKCQDIVLEIDDFRNRNGSDDPSYNGA
810 820 830 840 850 860
920 930 940 950 960 970
pF1KA0 ITVCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNP
: : ..:.: ::.:::.:.:::::::: ::::.:.:. . . :. : ..: ..
CCDS11 IIVSGDQKDYRFSVACNTKKLNCFPVLMGIVSNALMGIFNFTELIQMESTSFSRDDIVLD
870 880 890 900 910 920
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA0 IGFLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYF
.::. .: :..:. :.:.::::.:::. ..::: :::: ::::: ::::::. :::
CCDS11 LGFIDGSIFLLLITNCVSPFIGMSSISDYKKNVQSQLWISGLWPSAYWCGQALVDIPLYF
930 940 950 960 970 980
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA0 LVFVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWS
:.. :.:. :. . .: . .. . : .: . ::::.:::.:::::: :::.:.::
CCDS11 LILFSIHLIYYFIFLGFQLSWELMFVLVVCIIGCAVSLIFLTYVLSFIFRKWRKNNGFWS
990 1000 1010 1020 1030 1040
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KA0 FCFYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLF-SSLFS-EERMD
: :... . . .. . .:. .. ..:: :..: ..: .: : .: : ..:..
CCDS11 FGFFIILICVSTIMVSTQYEKLNLILCMIFIPSFTLLGYVMLLIQLDFMRNLDSLDNRIN
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KA0 -VQP--FLVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSDVCQNPEEPEG
:. .:. :::.:. .::::..:::: :.:.. : ::: ::::::: .. ::::::
CCDS11 EVNKTILLTTLIPYLQSVIFLFVIRCLEMKYGNEIMNKDPVFRISPRSRETHPNPEEPEE
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KA0 EDEDVQMERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSFCV
:::::: :::..::::.. :..:.::: ::::.::: .:.::: ::.::: :::::::
CCDS11 EDEDVQAERVQAANALTAPNLEEEPVITASCLHKEYYETKKSCFSTRKKKIAIRNVSFCV
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 RKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGG------DALEFLGYCPQE
.::::::::::::::::::::.::: :::::: :.:.:: .. ..:.::::::::
CCDS11 KKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKMITGCTKPTAGVVVLQGSRASVRQQHDNSLKFLGYCPQE
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 NALWPNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLC
:.:::.::...:::.::::::: : :: ..:.:::.:::::.:::.::::::::::::::
CCDS11 NSLWPKLTMKEHLELYAAVKGLGKEDAALSISRLVEALKLQEQLKAPVKTLSEGIKRKLC
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 FVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDR
::::::::::::::::: ::::::::::::: ..:: .: :::.:::::::.::::::::
CCDS11 FVLSILGNPSVVLLDEPFTGMDPEGQQQMWQILQATVKNKERGTLLTTHYMSEAEAVCDR
1350 1360 1370 1380 1390 1400
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 VAIMVSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSS
.:.:::: :::::::::::.:::.:::::.:.:. .::: ::.:::.:::::: ::::::
CCDS11 MAMMVSGTLRCIGSIQHLKNKFGRDYLLEIKMKEPTQVEALHTEILKLFPQAAWQERYSS
1410 1420 1430 1440 1450 1460
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 LMVYKLPVEDVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDF
::.::::::::.::..:::::: .::.:.::::::::.::::::::: ::::::.
CCDS11 LMAYKLPVEDVHPLSRAFFKLEAMKQTFNLEEYSLSQATLEQVFLELCKEQELGNVDDKI
1470 1480 1490 1500 1510 1520
1570 1580
pF1KA0 DPSVKWKLLPQEEP
CCDS11 DTTVEWKLLPQEDP
1530 1540
>>CCDS11685.1 ABCA5 gene_id:23461|Hs108|chr17 (1642 aa)
initn: 2929 init1: 740 opt: 1498 Z-score: 1657.3 bits: 319.5 E(32554): 5.4e-86
Smith-Waterman score: 3972; 40.6% identity (71.1% similar) in 1629 aa overlap (23-1580:25-1638)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSS
: : :. :..: : :..:. : . : . .
CCDS11 MSTAIREVGVWRQTRTLLLKNYLIKCRTKKSSVQEILFPLFFLFWLILISMMHPNKKYEE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 LLTMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEF--
. ...:. .: :. : . . :::::: :..::.:: :: : .:. . . ::.
CCDS11 VPNIELNPMDKFTLSNLILGYTPVTNITSSIMQKV-STDHLP--DVIITEEYTNEKEMLT
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 -TANYPEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKE
. . : ..: :.: ...::.:.:. .:... . : : : .. ::.. .:.
CCDS11 SSLSKPSNFVGVVFKDSMSYELRFFPDM-IPVSSIYMDSRAGCSKS-----CEAAQYWSS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 GFVALQAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSS
::..:::.:.::::.. :: :. .:: :. . : . . . . :. .:.::
CCDS11 GFTVLQASIDAAIIQLKTNVSLWKELESTKAVIMGETAVVEIDTFPRGVILIYLVIAFSP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 FIYYASVNVTRER-KRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFI
: :. ..... :. :..: .. .:::.:.:::::: :::...::.:.:..:.. .. ..
CCDS11 FGYFLAIHIVAEKEKKIKEFLKIMGLHDTAFWLSWVLLYTSLIFLMSLLMAVIATASLLF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 ILSGFMVVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTS-LYRHL
:. .:.: ::.::::: : .:.... : ::: .:.: :..:: .: .:. : . .
CCDS11 PQSSSIVIFLLFFLYGLSSVFFALMLTPLFKKSKHVGIVEFFVTVAFGFIGLMIILIESF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 PASLEWILSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNA-FPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLY
: :: :..: . .:..:.::..::. :.: .: : . . : .. : .::.... .:
CCDS11 PKSLVWLFSPFCHCTFVIGIAQVMHLE-DFNEGASFSNLTAGPYPLIITIIMLTLNSIFY
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 LALAIYFEKILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPP
. ::.:.....:.:.: :: :.::: :.::..... . : ..... :: . .: .
CCDS11 VLLAVYLDQVIPGEFGLRRSSLYFLKPSYWSKSKRNYEELSEGNVNGNISFSEIIEPVSS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 EFQGKEAIRIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGL
:: ::::::: .. : :. : ...:::..: ::::::::::.:::::.:::::.::: ::
CCDS11 EFVGKEAIRISGIQKTYRKKGENVEALRNLSFDIYEGQITALLGHSGTGKSTLMNILCGL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580
pF1KA0 SVPTKGSVTIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGI----
:. : ..::....::. .. . :. :.::: ...:: :::.::: ..:.::::
CCDS11 CPPSDGFASIYGHRVSEIDEMFEARKMIGICPQLDIHFDVLTVEENLSILASIKGIPANN
540 550 560 570 580 590
590 600 610
pF1KA0 LPQEVDK------------------------------------EIFLLDEPTAGLDPFSR
. :::.: .:.::::::::.:: ::
CCDS11 IIQEVQKVLLDLDMQTIKDNQAKKLSGGQKRKLSLGIAVLGNPKILLLDEPTAGMDPCSR
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 HQVWNLLKERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHL
: :::::: ::..:: .:::.::::::::::::. .::: :::.:::.:::.::::::.:
CCDS11 HIVWNLLKYRKANRVTVFSTHFMDEADILADRKAVISQGMLKCVGSSMFLKSKWGIGYRL
660 670 680 690 700 710
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 SLQLNEICVEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLG
:. ... :. :...:::::::: : : ... .:.:.::.. .:: :.. :::. .::
CCDS11 SMYIDKYCATESLSSLVKQHIPGATLLQQNDQQLVYSLPFKDMDKFSGLFSALDSHSNLG
720 730 740 750 760 770
740 750 760 770 780 790
pF1KA0 IENYGVSMTTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMR
. .::::::::..:::::: .. :...: ... . :. :.. . :::: : :.. .
CCDS11 VISYGVSMTTLEDVFLKLEVEAEIDQADYSVFTQQPLEEEMDSKSFDEMEQSLLILSETK
780 790 800 810 820 830
800 810 820 830 840 850
pF1KA0 KT-IGGVALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSY
. .. ..::.::. .::. ... ::.: :.. ..::.:. : . . . . ..:.
CCDS11 AALVSTMSLWKQQMYTIAKFHFFTLKRESKSVRSVLLLLLIFFTVQIFMFLVHHSFKNAV
840 850 860 870 880 890
860 870 880 890 900 910
pF1KA0 T-WELSPHLYFLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGT
. .: : :::: ::..:: :.::. :.. ..:.:.:. ::: : .. . .
CCDS11 VPIKLVPDLYFLKPGDKPHKYKTSLLLQNSADSDISDLISFFTSQNIM--VTMINDSDYV
900 910 920 930 940
920 930 940 950 960 970
pF1KA0 DDPSYNGAITVCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTF
. ...:..: .::.: :. . :. . .:.:..:.:: : .. . :. . :
CCDS11 SVAPHSAALNVMHSEKDYVFAAVFNSTMVYSLPILVNIISNYYLYHLNVTETIQIWSTPF
950 960 970 980 990 1000
980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 LENGQDNPIGFLAYIMFWL--VLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFG
... : . . :.. : ..... :::.:: . ...: .: .::..::: :::::.:
CCDS11 FQEITDIVFKIELYFQAALLGIIVTAMPPYFAMENAENHKIKAYTQLKLSGLLPSAYWIG
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 QALVDVSLYFLVFVFIYLMSYIS-NFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIF
::.::. :.:...... : : .. .. .. :. . . : .:: :.:..::. :: :
CCDS11 QAVVDIPLFFIILILM-LGSLLAFHYGLYFYTVKFLAVVFCLIGYVPSVILFTYIASFTF
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 RKGRKNSGIWSFCFYVVTVFSVAGFAFSIF-----ESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSS
.: ... .::: . :... .: ...: . . . : ..:: ..:::. :
CCDS11 KKILNTKEFWSFIYSVAALACIAITEITFFMGYTIATILHYAFCIIIPIYPLLGCLI--S
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 HLLFSSLFSEERMDV-QPF----LVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRI
. .: .. .:. .:. .. . :.:. ....: :. : :.: .:.:::::::
CCDS11 FIKISWKNVRKNVDTYNPWDRLSVAVISPYLQCVLWIFLLQYYEKKYGGRSIRKDPFFRN
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 SPRSSDVCQNPEEP--EGEDEDVQMERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKG
.: . :: : : :::::. ::... . .. .::: :..: :.::: :.
CCDS11 LSTKSKNRKLPEPPDNEDEDEDVKAERLKVKELMGCQCCEEKPSIMVSNLHKEYDDKKDF
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA0 CFSKRKNKIATRNVSFCVRKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLL-----K
.:.. .:.::. .::::.:::.::::: ::::::: :....:: .::.:::.: .
CCDS11 LLSRKVKKVATKYISFCVKKGEILGLLGPNGAGKSTIINILVGDIEPTSGQVFLGDYSSE
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA0 GSGGGDALEFLGYCPQENALWPNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQ
: :.:. .::::: : :::. :...:.:.:.::::. .: . .:.:.. :: :...
CCDS11 TSEDDDSLKCMGYCPQINPLWPDTTLQEHFEIYGAVKGMSASDMKEVISRITHALDLKEH
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA0 LKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERG
:.. :: : ::::::::.::.::::...:::::::::::...:.::.:::..:.: .:.
CCDS11 LQKTVKKLPAGIKRKLCFALSMLGNPQITLLDEPSTGMDPKAKQHMWRAIRTAFKNRKRA
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1440 1450 1460 1470 1480
pF1KA0 ALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQ---VEP
:.:::::: :::::::::::::::.:::::..::::::::: :.::.:.:. . :.
CCDS11 AILTTHYMEEAEAVCDRVAIMVSGQLRCIGTVQHLKSKFGKGYFLEIKLKDWIENLEVDR
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KA0 LHAEILRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTL
:. :: .::.:.::: .::...::.: :::: :.:.:::::..:..: .::::.::.::
CCDS11 LQREIQYIFPNASRQESFSSILAYKIPKEDVQSLSQSFFKLEEAKHAFAIEEYSFSQATL
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1550 1560 1570 1580
pF1KA0 EQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEEP
::::.::.:::: : :. : ::.
CCDS11 EQVFVELTKEQEEEDNSCGTLNSTLWWERTQEDRVVF
1610 1620 1630 1640
>>CCDS47584.1 ABCA13 gene_id:154664|Hs108|chr7 (5058 aa)
initn: 1052 init1: 274 opt: 738 Z-score: 803.4 bits: 163.2 E(32554): 2e-38
Smith-Waterman score: 1519; 27.9% identity (56.9% similar) in 1576 aa overlap (177-1570:3524-5047)
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 AKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVALQAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTG
:. :: :. ::: . :.. ..: .. .
CCDS47 YSVRTDVVKNPSWKFHPQNLPADGFKYNYVFAPLQDMIERAIILVQTGQEALEPAAQTQA
3500 3510 3520 3530 3540 3550
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 KNMKMHS---FIGQSGVITDL-YLFSCIISFSSFIYYASVNVTRERKRMKALMTMMGLRD
. :. :... : . : .... ..: .:.. : ... ... : :::..
CCDS47 APYPCHTSDLFLNNVGFFFPLIMMLTWMVSVASMVRKL---VYEQEIQIEEYMRMMGVHP
3560 3570 3580 3590 3600 3610
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 SAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFMVVFSLFLLYGLSLVALAFLMSI
.:.: : . . : . ::.:.... .. :. ..:: ..: .:.:.: :..:.:
CCDS47 VIHFLAWFLENMAVLTISSATLAIVLKTSGIFAHSNTFIVFLFLLDFGMSVVMLSYLLSA
3620 3630 3640 3650 3660 3670
330 340 350 360 370
pF1KA0 LVKKSFLTGL---VVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWILSLLSPFAFMLGMAQLLHL
. ... ..: .:.... : . . :. .: . .: ::: :: :. . :
CCDS47 FFSQANTAALCTSLVYMIS-FLPYIVLLVLHNQLSFVNQTFLCLLSTTAFGQGVFFITFL
3680 3690 3700 3710 3720
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 DYDLN----SNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFEKILPNEYGHRRPPLF
. . . .: . .:. . . .:. ::. ::. . :. ...:. .: :.: :
CCDS47 EGQETGIQWNNMYQALEQGGMTFGWVCWMILFDSSLYFLCGWYLSNLIPGTFGLRKPWYF
3730 3740 3750 3760 3770 3780
440 450 460 470 480
pF1KA0 FLKSSFWSQT----QKTDHVALEDEMDADPSFHD---SFEQAPPEFQGKE-AIRIRNVTK
. .:.:... .: .. . . . .: . :... :..:. .. . .:::
CCDS47 PFTASYWKSVGFLVEKRQYFLSSSLFFFNENFDNKGSSLQNREGELEGSAPGVTLVSVTK
3790 3800 3810 3820 3830 3840
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 EYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSVTIYNNKL
::.:. ...:: . .:. ::::.:: .::::.:....:.:: ::.:.. : ...:
CCDS47 EYEGHK---AVVQDLSLTFYRDQITALLGTNGAGKTTIISMLTGLHPPTSGTIIINGKNL
3850 3860 3870 3880 3890 3900
550 560 570 580 590
pF1KA0 SEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEI----------
. .:: . :::::... .: :::::.: :::.::. :: . ::.
CCDS47 Q--TDLSRVRMELGVCPQQDILLDNLTVREHLLLFASIKA--PQWTKKELHQQVNQTLQD
3910 3920 3930 3940 3950 3960
600 610 620
pF1KA0 ---------------------------FL-------LDEPTAGLDPFSRHQVWNLLKERK
:. :::::.:.:: :::..:..: . .
CCDS47 VDLTQHQHKQTRALSGGLKRKLSLGIAFMGMSRTVVLDEPTSGVDPCSRHSLWDILLKYR
3970 3980 3990 4000 4010 4020
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 TDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEICVEE
:.:.:.:. .:::. :.:: . :..:.:.: : . ::. .: : .:.: . .:
CCDS47 EGRTIIFTTHHLDEAEALSDRVAVLQHGRLRCCGPPFCLKEAYGQGLRLTLTRQPSVLEA
4030 4040 4050 4060 4070 4080
690 700 710 720 730
pF1KA0 N-------ITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNK--FPELYKDLD-SYPDLGI
. .:::.: .::.: :. .: ..: ::.: . :.: . :.. :: . .: .
CCDS47 HDLKDMACVTSLIKIYIPQAFLKDSSGSELTYTIPKD-TDKACLKGLFQALDENLHQLHL
4090 4100 4110 4120 4130 4140
740 750 760 770 780 790
pF1KA0 ENYGVSMTTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRK
.::.: :::.:::: : :. ..: ::. : . .. : .: .:: .
CCDS47 TGYGISDTTLEEVFLMLLQDSN-KKSHIALGTESELQNHRPTGHL---SGYCGSLARP-A
4150 4160 4170 4180 4190
800 810 820 830 840
pF1KA0 TIGGVALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLI------LMAGFC---PLLVEYTMV
:. :: : : :. :: :: . . :. :: ::. : :. :: .:: .
CCDS47 TVQGVQLLRAQVAAILARRLRRTLRAGKSTLADLLLPVLFVALAMGLFMVRPLATEYPPL
4200 4210 4220 4230 4240 4250
850
pF1KA0 KI----YQ---------------------------------------NSYTWELSP--HL
.. :: :: :. .: :
CCDS47 RLTPGHYQRAETYFFSSGGDNLDLTRVLLRKFRDQDLPCADLNPRQKNSSCWRTDPFSHP
4260 4270 4280 4290 4300 4310
860 870 880 890 900
pF1KA0 YFL-------APGQQPHDP-LTQLL---IINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRN
: :... : ::. : ..: .: ...... . .. : .:: .
CCDS47 EFQDSCGCLKCPNRSASAPYLTNHLGHTLLNLSGFNMEEYLLA-PSEKPRLGGWSFGLKI
4320 4330 4340 4350 4360 4370
910 920 930 940 950
pF1KA0 GTDDPSYNGAIT-------VCCNEKNYSFSLACNAKRLNCF------PVLMDIVSNGLLG
.. . :: :. : :.:.. :: ..:: . : .: . :.
CCDS47 PSEAGGANGNISKPPTLAKVWYNQKGFH-SLPSYLNHLNNLILWQHLPPTVDWRQYGITL
4380 4390 4400 4410 4420 4430
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 MVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIGFLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQL
. .: ... .::. .. .. : .. . .:..: :. : . : :.
CCDS47 YSHPYGGALLNEDKILESIRQCGVA-LCIVLGFSILSAS----IGSSVVRDRVIGAKRLQ
4440 4450 4460 4470 4480
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA0 RISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFLVFVFIYLMSYIS------NFED------MLLTIIHI
.::::. ::: . : :. :..:: : . . .. .:. .::...
CCDS47 HISGLGYRMYWFTNFLYDM-LFYLVSVCLCVAVIVAFQLTAFTFRKNLAATALLLSLFGY
4490 4500 4510 4520 4530 4540
1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 IQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWSFCFYVVTVF-------SVAGFAFSI
.: : .: :: . ..:: . . . :...: ...:.. : : .:
CCDS47 ATLPWM--YLMSRIFSSSDVAFI--SYVSLNFIFGLCTMLITIMPRLLAIISKAKNLQNI
4550 4560 4570 4580 4590 4600
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 FESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSSLFSEERMD--VQPFLVFLIPFLHFIIFL
.. . ..::.. : . : . . .: . .: :.:: . :: .:.
CCDS47 YDV-LKWVFTIFPQFCLGQGLVELCYNQIKYDLTHNFGIDSYVSPF---EMNFLGWIFVQ
4610 4620 4630 4640 4650 4660
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA0 FTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSDVCQNPEEPEGEDEDVQMERVRTANALNSTNF
.. . . . .. : ..: ::. .. :. . ..: ::. :. :. .. ::
CCDS47 LASQGTVLLLLRVLLHWD-LLRW-PRGHSTLQGTVKS-SKDTDVEKEEKRVFEG--RTNG
4670 4680 4690 4700 4710
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA0 DEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSFCVRKGEVLGLLGHNGAGKSTSIK
: ... : :.: .: : .: ::....:. . ::: .:::: :::::::..:
CCDS47 D---ILVLYNLSKHY--RR--FF---QNIIAVQDISLGIPKGECFGLLGVNGAGKSTTFK
4720 4730 4740 4750 4760
1300 1310 1320 1330 1340
pF1KA0 VITGDTKPTAGQVLLKG--------SGGGDALEFLGYCPQENALWPNLTVRQHLEVYAAV
...:... :.:..... :..: : ..:::::..:: :: .:: : ..
CCDS47 MLNGEVSLTSGHAIIRTPMGDAVDLSSAGTAGVLIGYCPQQDALDELLTGWEHLYYYCSL
4770 4780 4790 4800 4810 4820
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KA0 KGL-RKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPS
.:. :. ::: :. :.:. . .:: : : : :::: .:...:.:...::::::
CCDS47 RGIPRQCIPEVA-GDLIRRLHLEAHADKPVATYSGGTKRKLSTALALVGKPDILLLDEPS
4830 4840 4850 4860 4870 4880
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KA0 TGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHL
.:::: ... .::.: :. .:.::.: : : ::.: :.::::.: ..:.:: ::.
CCDS47 SGMDPCSKRYLWQTIMKEVREGC-AAVLTSHSMEECEALCTRLAIMVNGSFKCLGSPQHI
4890 4900 4910 4920 4930 4940
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KA0 KSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRL-FPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQPLAQA
:..:: : ... . . :. . .. :.: :: . .. .:. :..: . ::.
CCDS47 KNRFGDGYTVKVWLCKEANQHCTVSDHLKLYFPGIQFKGQHLNLLEYHVP-KRWGCLADL
4950 4960 4970 4980 4990 5000
1530 1540 1550 1560 1570 1580
pF1KA0 FFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEEP
: .:. : .....::..:.::::::.....::. .. .:::
CCDS47 FKVIENNKTFLNIKHYSINQTTLEQVFINFASEQQQ-TLQSTLDPSTDSHHTHHLPI
5010 5020 5030 5040 5050
>>CCDS12055.1 ABCA7 gene_id:10347|Hs108|chr19 (2146 aa)
initn: 1157 init1: 259 opt: 715 Z-score: 783.9 bits: 158.3 E(32554): 2.4e-37
Smith-Waterman score: 1335; 27.5% identity (51.9% similar) in 1604 aa overlap (244-1571:569-2118)
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 FIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYASVNVTRERK-RMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLL
:.::.. :.. : ::: ...::.: :
CCDS12 DDVFLRVLSRSLPLFLTLAWIYSVTLTVKAVVREKETRLRDTMRAMGLSRAVLWLGWFLS
540 550 560 570 580 590
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 YAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFMVVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLT--
: ... : .:.::.. ... : ::: .. .... :. .::.: . ... :.
CCDS12 CLGPFLLSAALLVLVLKLGDILPYSHPGVVFLFLAAFAVATVTQSFLLSAFFSRANLAAA
600 610 620 630 640 650
340 350 360 370 380
pF1KA0 --GLVVFLLTV-FWGCLGFTSLYRHLPASLEWILSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNS--
::. : : . . :... . .:::. . ::::: :: .: .: :. . ..
CCDS12 CGGLAYFSLYLPYVLCVAWRD---RLPAGGRVAASLLSPVAFGFGCESLALLEEQGEGAQ
660 670 680 690 700 710
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 --NAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFEKILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWS
:. .:. .. .. .: .:. :: . :.: . :..:: .: : .. :.:
CCDS12 WHNVGTRPTADVFSLAQVSGLLLLDAALYGLATWYLEAVCPGQYGIPEPWNFPFRRSYWC
720 730 740 750 760 770
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 QTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAIRIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLV
. : ::. :.::: . . .. .:.. :.. :.:. ::. :
CCDS12 GPRPPKSPA-PCPTPLDPKV--LVEEAPPGL--SPGVSVRSLEKRFPGSPQP--ALRGLS
780 790 800 810 820
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 FDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSVTIYNNKL-SEMADLENLSKLTGV
.:.:.:.:::.:::.::::.: :.::::: :. ::. : .. . : :: .. ::
CCDS12 LDFYQGHITAFLGHNGAGKTTTLSILSGLFPPSGGSAFILGHDVRSSMAAIR---PHLGV
830 840 850 860 870 880
570 580 590
pF1KA0 CPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKG----ILPQEVDK-----------------------
::: :: ::.::: :.. .....:: .. : :.
CCDS12 CPQYNVLFDMLTVDEHVWFYGRLKGLSAAVVGPEQDRLLQDVGLVSKQSVQTRHLSGGMQ
890 900 910 920 930 940
600 610 620 630 640
pF1KA0 -------------EIFLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLLKERKTDRVILFSTQFMDEADILA
.. .:::::::.:: ::. .:.:: . . :....::. .:::..:.
CCDS12 RKLSVAIAFVGGSQVVILDEPTAGVDPASRRGIWELLLKYREGRTLILSTHHLDEAELLG
950 960 970 980 990 1000
650 660 670 680
pF1KA0 DRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEICVEEN------------------
:: . .. :.: : :: :::... : ::.:.: .. . :
CCDS12 DRVAVVAGGRLCCCGSPLFLRRHLGSGYYLTLVKARLPLTTNEKADTDMEGSVDTRQEKK
1010 1020 1030 1040 1050 1060
690 700 710 720
pF1KA0 ------------ITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLE--RTNKFPELYKDLDSY-P
. .::.. .: :.: . .:. .:: . ..: :...::.
CCDS12 NGSQGSRVGTPQLLALVQHWVPGARLVEELPHELVLVLPYTGAHDGSFATLFRELDTRLA
1070 1080 1090 1100 1110 1120
730 740 750 760 770
pF1KA0 DLGIENYGVSMTTLNEVFLKL--EGKSTINESD----------IAILGEVQAEKADDTER
.: . .::.: :.:.:.:::. : . . : :: : . : :
CCDS12 ELRLTGYGISDTSLEEIFLKVVEECAADTDMEDGSCGQHLCTGIAGLDVTLRLKMPPQET
1130 1140 1150 1160 1170 1180
780 790 800 810 820
pF1KA0 LVEMEQVLSSLNKMRKTIG--------GVALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLI
.: . .: . . : : :: :::. :. :.: .. :..:.: . .
CCDS12 ALENGEPAGSAPETDQGSGPDAVGRVQGWALTRQQLQALLLKRFLLARRSRRGLFAQI-V
1190 1200 1210 1220 1230 1240
830 840 850 860
pF1KA0 LMAGFCPL-LVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLY-----FL---APG---------------
: : : : :: .: . . . .::: .: :. :::
CCDS12 LPALFVGLALVFSLIVPPFGHYPALRLSPTMYGAQVSFFSEDAPGDPGRARLLEALLQEA
1250 1260 1270 1280 1290 1300
870
pF1KA0 --QQP---HD----------------------------PLTQ--------LL--------
..: :. : : ::
CCDS12 GLEEPPVQHSSHRFSAPEVPAEVAKVLASGNWTPESPSPACQCSRPGARRLLPDCPAAAG
1310 1320 1330 1340 1350 1360
880 890 900 910
pF1KA0 --------------IINKTGASIDDFI---------QSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDP
. : :: ...::. :... .. . :: : : ::
CCDS12 GPPPPQAVTGSGEVVQNLTGRNLSDFLVKTYPRLVRQGLKTKKWVNEVRYGGFSLGGRDP
1370 1380 1390 1400 1410 1420
920 930 940
pF1KA0 SY---------------------NGAIT-VCCNEKNYSFSLAC--------NAKRLNCFP
. .::. : : .. :: : : . .
CCDS12 GLPSGQELGRSVEELWALLSPLPGGALDRVLKNLTAWAHSLDAQDSLKIWFNNKGWHSMV
1430 1440 1450 1460 1470 1480
950 960 970 980 990
pF1KA0 VLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDN----PIGFLAYIMFWL-VLTSSC---
.... .::..: : : .: : : .. : . . ::.: :
CCDS12 AFVNRASNAILRAHLPPGPARHAHSITTLNHPLNLTKEQLSEGALMASSVDVLVSICVVF
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 -----PPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFL---VFVFIYLM
: ... :.. .::. ..::::. ::.:. : :. :.. . :.:.:
CCDS12 AMSFVPASFTLVLIEERVTRAKHLQLMGGLSPTLYWLGNFLWDMCNYLVPACIVVLIFLA
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA0 ----SYIS--NFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWSFC-
.:.. :. .:: .. :..:. . : ::.: . . :
CCDS12 FQQRAYVAPANLPALLLLLLL---------YGWSITPLMYPASFFFSVPSTAYVVLT-CI
1610 1620 1630 1640 1650
1110 1120 1130 1140 1150
pF1KA0 -FYVVTVFSVAGFAFSIFES----DIPFIF--TFLIPPATMIG--CLFLSSHLLFSSLFS
... :.: :.. .: . .. :. .::: : .: . . . ... :
CCDS12 NLFIGINGSMATFVLELFSDQKLQEVSRILKQVFLIFPHFCLGRGLIDMVRNQAMADAF-
1660 1670 1680 1690 1700 1710
1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 EERM-DVQ---PFLVFLIP--FLHFIIF--LFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSD
::. : : :. .. .: ..: :: : : . .... .: : : ..
CCDS12 -ERLGDRQFQSPLRWEVVGKNLLAMVIQGPLFLLFTLLLQH-RSQLLPQPRVRSLPLLGE
1720 1730 1740 1750 1760 1770
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 VCQNPEEPEGEDEDVQMERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNK
::::: :: :.... .:. : :.. : : : :.:
CCDS12 ----------EDEDVARERERVVQG--ATQGD---VLVLRNLTKVYRGQRMP--------
1780 1790 1800
1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA0 IATRNVSFCVRKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSG----GGDALE
:. . . . :: .:::: :::::.......:::: . :...: : . . :
CCDS12 -AVDRLCLGIPPGECFGLLGVNGAGKTSTFRMVTGDTLASRGEAVLAGHSVAREPSAAHL
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA0 FLGYCPQENALWPNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGD-AEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTL
.::::: .:.. :: :.:::. : ..:. ... :..: . :. : :. :. :
CCDS12 SMGYCPQSDAIFELLTGREHLELLARLRGVPEAQVAQTAGSGLAR-LGLSWYADRPAGTY
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA0 SEGIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYM
: : :::: .:...:.:.::.::::.::::: ... .:... :. :. :...::.: :
CCDS12 SGGNKRKLATALALVGDPAVVFLDEPTTGMDPSARRFLWNSLLAVVREG-RSVMLTSHSM
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA0 AEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQ
: ::.:.:.::::.::.::.:: ::::..:. . : ..: :. .: : . ::
CCDS12 EECEALCSRLAIMVNGRFRCLGSPQHLKGRFAAGHTLTLRVPA-ARSQPAAAFVAAEFPG
1990 2000 2010 2020 2030 2040
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KA0 AARQERYSSLMVYKLPVEDVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQ
: .: ... . ..:: ::..: .: .:..:.::. ::.::: .::.:
CCDS12 AELREAHGGRLRFQLPPGGRCALARVFGELAVHGAEHGVEDFSVSQTMLEEVFLYFSKDQ
2050 2060 2070 2080 2090 2100
1560 1570 1580
pF1KA0 -ELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEEP
. : ::. . .:
CCDS12 GKDEDTEEQKEAGVGVDPAPGLQHPKRVSQFLDDPSTAETVL
2110 2120 2130 2140
>>CCDS10466.1 ABCA3 gene_id:21|Hs108|chr16 (1704 aa)
initn: 1258 init1: 441 opt: 515 Z-score: 562.9 bits: 117.1 E(32554): 4.9e-25
Smith-Waterman score: 1720; 28.6% identity (59.1% similar) in 1536 aa overlap (172-1558:206-1696)
150 160 170 180 190
pF1KA0 GHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVALQAAINAAIIEITTNHSVME--
. .:::.:.: :.. ::.: .. .. .
CCDS10 TEGWHTTSLFPLFPNPGPREPTSPDGGEPGYIREGFLAVQHAVDRAIMEYHADAATRQLF
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 ELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA---SVNVTRER-KRMKALM
. ..:: : . . ::.. ... : . .. . :: : : . :..:. .:.: :
CCDS10 QRLTVTIKRFPYPPFIADPFLVAIQYQLPLLL-LLSFTYTALTIARAVVQEKERRLKEYM
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 TMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLAL---VIRSTQFIILS--GFMVVFSLFLLYG
:::: . : .: ::. :..: : :..: : . . .:: .:....: ..
CCDS10 RMMGLSSWLHWSAWFLLFFLFLLIAASFMTLLFCVKVKPNVAVLSRSDPSLVLAFLLCFA
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360
pF1KA0 LSLVALAFLMSILVKKSFLT----GLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWILSLLSP
.: ....:..: . .:. .. :.. :. . . . . : . : . :::
CCDS10 ISTISFSFMVSTFFSKANMAAAFGGFLYFFTYIPY--FFVAPRYNWMTLSQKLCSCLLSN
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410
pF1KA0 FAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNF-------MLAFDTCLYLALAIYF
:. .: :::. .. .. .. . : . : .: :: .:. :: .. :.
CCDS10 VAMAMG-AQLIG-KFEAKGMGIQWRDLLSPVNVDDDFCFGQVLGMLLLDSVLYGLVTWYM
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 EKILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADP--SFHDSFEQAPPEFQGK
: ..:...: .: ::. :.: : :: ..: :.:: .... . .: :: .
CCDS10 EAVFPGQFGVPQPWYFFIMPSYWC--GKPRAVAGKEEEDSDPEKALRNEYFEAEPE-DLV
480 490 500 510 520
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 EAIRIRNVTKEYK-GKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPT
.:.:....: .. :. :. :..:: ...::::::..:::.::::.: :..:.:: ::
CCDS10 AGIKIKHLSKVFRVGNKDRA-AVRDLNLNLYEGQITVLLGHNGAGKTTTLSMLTGLFPPT
530 540 550 560 570 580
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 KGSVTIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGI----LPQE
.: . : . ..:. :. .. : :.::: .. :: ::: :.: ..:..::. :.:
CCDS10 SGRAYISGYEISQ--DMVQIRKSLGLCPQHDILFDNLTVAEHLYFYAQLKGLSRQKCPEE
590 600 610 620 630 640
600 610
pF1KA0 V----------DK--------------------------EIFLLDEPTAGLDPFSRHQVW
: :: ....:::::.:.: .::. .:
CCDS10 VKQMLHIIGLEDKWNSRSRFLSGGMRRKLSIGIALIAGSKVLILDEPTSGMDAISRRAIW
650 660 670 680 690 700
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 NLLKERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQL
.::...:.::.:...:.::::::.:.:: .....:.:.: :::::::.:.: :::..:
CCDS10 DLLQRQKSDRTIVLTTHFMDEADLLGDRIAIMAKGELQCCGSSLFLKQKYGAGYHMTLVK
710 720 730 740 750 760
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 NEICVEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDS-YPDLGIEN
. : :.:..::..:.:.: : ... ..: . :: : :..: :. :.. .::: .
CCDS10 EPHCNPEDISQLVHHHVPNATLESSAGAELSFILPRESTHRFEGLFAKLEKKQKELGIAS
770 780 790 800 810 820
740 750 760 770 780
pF1KA0 YGVSMTTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILG----EVQAEK-----ADDTERLVEMEQV--
.:.:.::..::::.. :: . . :: . . : :. : :.. :.
CCDS10 FGASITTMEEVFLRV-GKLVDSSMDIQAIQLPALQYQHERRASDWAVDSNLCGAMDPSDG
830 840 850 860 870 880
790 800 810 820 830
pF1KA0 LSSLNKMRKTI----GGVALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLI--------LMA
...: . ..: :.:: ::. :. . .: : . : .:. :.:
CCDS10 IGALIEEERTAVKLNTGLALHCQQFWAMFLKKAAYSWREWKMVAAQVLVPLTCVTLALLA
890 900 910 920 930 940
840 850 860 870 880
pF1KA0 -GFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLYFLAPG-QQPHDPLTQLL--IINKTGASIDDF
.. : . :... . : . : : .:: .: . :.. : .. : .
CCDS10 INYSSELFDDPMLRLTLGEYGRTVVP---FSVPGTSQLGQQLSEHLKDALQAEGQEPREV
950 960 970 980 990 1000
890 900 910 920 930
pF1KA0 IQSVEHQNI---ALEVDAFGTR----NGTDDPSYNGAITVCCNEKNY---SFSLACNAK-
. ..:. : ..: .:. : . : . .... :.. : . .:: .
CCDS10 LGDLEEFLIFRASVEGGGFNERCLVAASFRDVGERTVVNALFNNQAYHSPATALAVVDNL
1010 1020 1030 1040 1050 1060
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 --RLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIGFLAYIMFWLVLTSSC
.: : : .::: . .: ... .. : :. . :.. ..: ... .:
CCDS10 LFKLLCGPHASIVVSN----FPQPRSALQAAKDQFNEGRKGFDIAL--NLLFAMAFLAST
1070 1080 1090 1100 1110
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 PPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFLVFVFIYLMSYISNFED
.:.: . .:. .::. ...:.. : :. . ::. .. :. . . :.
CCDS10 FSILAVS---ERAVQAKHVQFVSGVHVASFWLSALLWDL-ISFLIPSLLLLVVF-KAFDV
1120 1130 1140 1150 1160
1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA0 MLLTII-HIIQ-IPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKN----------SGIWSFCFYV
.: :. . . . :....: . :...:.: . ::: .: .
CCDS10 RAFTRDGHMADTLLLLLLYGWAIIPLMYLMNFFFLGAATAYTRLTIFNILSGIATF--LM
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1110 1120 1130 1140 1150
pF1KA0 VTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSS----LFSE------E
::.. . : .. : . . .::. : .: : . . . :: .
CCDS10 VTIMRIP--AVKLEELSKTLDHVFLVLPNHCLGMAVSSFYENYETRRYCTSSEVAAHYCK
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1160 1170 1180 1190
pF1KA0 RMDVQ---PFLVFLIPFL-HFII--------FLFTLRCLEWKFGKKSMRKD--PFFRISP
....: : .. : . .:. .:. : .: .. .. .: . :
CCDS10 KYNIQYQENFYAWSAPGVGRFVASMAASGCAYLILLFLIETNLLQR-LRGILCALRRRRT
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 RSSDVCQNPEEPEGEDEDVQMERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSK
. . : : ::.:: ::.: : . .. . :.:: :: . . .
CCDS10 LTELYTRMPVLP--EDQDVADERTRIL-APSPDSLLHTPLII-----KELS----KVYEQ
1350 1360 1370 1380 1390
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA0 RKNKIATRNVSFCVRKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKG----SGGG
: .:. .:. :.::: .:::: :::::.:..:..::. . :.:.... : : :
CCDS10 RVPLLAVDRLSLAVQKGECFGLLGFNGAGKTTTFKMLTGEESLTSGDAFVGGHRISSDVG
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA0 DALEFLGYCPQENALWPNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPV
. . .::::: .:: ..: :. : .:: ..:. . . . . .: :. . .. :
CCDS10 KVRQRIGYCPQFDALLDHMTGREMLVMYARLRGIPERHIGACVENTLRGLLLEPHANKLV
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA0 KTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTT
.: : : :::: ....:.:.:..:::::::::: ... .:... : :.. .. ..:.
CCDS10 RTYSGGNKRKLSTGIALIGEPAVIFLDEPSTGMDPVARRLLWDTV-ARARESGKAIIITS
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA0 HYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLH---AEI
: : : ::.: :.::::.:...:.:: ::::::::. : :. ::.. .: : :. : .
CCDS10 HSMEECEALCTRLAIMVQGQFKCLGSPQHLKSKFGSGYSLRAKVQSEGQQEALEEFKAFV
1580 1590 1600 1610 1620 1630
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KA0 LRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFL
:: .. ........ :.:: .:.. :..: :::.:... ...::.:: .::::::
CCDS10 DLTFPGSVLEDEHQGMVHYHLPGRDLS-WAKVFGILEKAKEKYGVDDYSVSQISLEQVFL
1640 1650 1660 1670 1680 1690
1560 1570 1580
pF1KA0 ELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEEP
... :
CCDS10 SFAHLQPPTAEEGR
1700
1581 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 01:16:12 2016 done: Sat Nov 5 01:16:13 2016
Total Scan time: 4.360 Total Display time: 0.970
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]