FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0822, 1581 aa
1>>>pF1KA0822 1581 - 1581 aa - 1581 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0118+/-0.000548; mu= 20.3669+/- 0.034
mean_var=91.8119+/-18.666, 0's: 0 Z-trim(107.8): 233 B-trim: 184 in 1/51
Lambda= 0.133852
statistics sampled from 15613 (15864) to 15613 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.502), E-opt: 0.2 (0.186), width: 16
Scan time: 12.150
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_009099 (OMIM: 612505) ATP-binding cassette sub- (1581) 10404 2021.1 0
XP_005256997 (OMIM: 612505) PREDICTED: ATP-binding (1560) 6504 1268.0 0
NP_001275914 (OMIM: 612505) ATP-binding cassette s (1621) 6504 1268.0 0
XP_005256995 (OMIM: 612505) PREDICTED: ATP-binding (1621) 6504 1268.0 0
NP_001275915 (OMIM: 612505) ATP-binding cassette s (1616) 6450 1257.6 0
XP_016879504 (OMIM: 612507) PREDICTED: ATP-binding (1476) 4817 942.2 0
XP_011522494 (OMIM: 612505) PREDICTED: ATP-binding (1063) 3914 767.7 0
XP_011522493 (OMIM: 612505) PREDICTED: ATP-binding (1164) 3914 767.8 0
XP_011522876 (OMIM: 612504) PREDICTED: ATP-binding (1300) 3805 746.7 2.8e-214
XP_016879897 (OMIM: 612504) PREDICTED: ATP-binding ( 932) 3524 692.4 4.7e-198
NP_525022 (OMIM: 612507) ATP-binding cassette sub- (1624) 2721 537.5 3.5e-151
XP_016879502 (OMIM: 612507) PREDICTED: ATP-binding (1626) 2721 537.5 3.5e-151
XP_016879503 (OMIM: 612507) PREDICTED: ATP-binding (1626) 2721 537.5 3.5e-151
XP_016879501 (OMIM: 612507) PREDICTED: ATP-binding (1626) 2721 537.5 3.5e-151
XP_016879500 (OMIM: 612507) PREDICTED: ATP-binding (1632) 2721 537.5 3.5e-151
NP_525023 (OMIM: 612504) ATP-binding cassette sub- (1617) 2261 448.7 1.9e-124
XP_016879893 (OMIM: 612504) PREDICTED: ATP-binding (1617) 2261 448.7 1.9e-124
XP_016879894 (OMIM: 612504) PREDICTED: ATP-binding (1617) 2261 448.7 1.9e-124
NP_525021 (OMIM: 612508) ATP-binding cassette sub- (1543) 2080 413.7 6.1e-114
XP_016879896 (OMIM: 612504) PREDICTED: ATP-binding (1422) 1641 328.9 1.9e-88
XP_016879895 (OMIM: 612504) PREDICTED: ATP-binding (1422) 1641 328.9 1.9e-88
NP_758424 (OMIM: 612503) ATP-binding cassette sub- (1642) 1498 301.3 4.4e-80
NP_061142 (OMIM: 612503) ATP-binding cassette sub- (1642) 1498 301.3 4.4e-80
XP_011513438 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4861) 738 154.9 1.6e-35
XP_011513435 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (5013) 738 154.9 1.6e-35
XP_011513434 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (5028) 738 154.9 1.6e-35
NP_689914 (OMIM: 607807) ATP-binding cassette sub- (5058) 738 154.9 1.6e-35
XP_011513432 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (5059) 738 154.9 1.6e-35
XP_006722681 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1365) 715 150.1 1.2e-34
XP_011525938 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1365) 715 150.1 1.2e-34
XP_011525934 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1994) 715 150.2 1.7e-34
XP_016881631 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (2061) 715 150.2 1.7e-34
XP_011525931 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (2137) 715 150.2 1.8e-34
XP_011525930 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (2146) 715 150.2 1.8e-34
NP_061985 (OMIM: 605414,608907) ATP-binding casset (2146) 715 150.2 1.8e-34
XP_011513433 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (5028) 699 147.3 3e-33
XP_011525933 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1997) 679 143.2 2.1e-32
XP_011525932 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (2103) 679 143.2 2.2e-32
XP_006722679 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (2128) 679 143.2 2.2e-32
XP_011513436 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4950) 604 129.0 9.9e-28
NP_001080 (OMIM: 601615,610921) ATP-binding casset (1704) 515 111.5 6.3e-23
XP_011513446 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4024) 375 84.7 1.7e-14
XP_011513445 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4030) 375 84.7 1.7e-14
NP_056472 (OMIM: 242500,601277,607800) ATP-binding (2277) 370 83.6 2.1e-14
NP_775099 (OMIM: 242500,601277,607800) ATP-binding (2595) 370 83.6 2.4e-14
XP_011509253 (OMIM: 242500,601277,607800) PREDICTE (2598) 370 83.6 2.4e-14
XP_011513444 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4298) 354 80.7 3e-13
XP_011513443 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4329) 354 80.7 3e-13
XP_016867257 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4396) 354 80.7 3.1e-13
XP_016867256 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4433) 354 80.7 3.1e-13
>>NP_009099 (OMIM: 612505) ATP-binding cassette sub-fami (1581 aa)
initn: 10404 init1: 10404 opt: 10404 Z-score: 10853.7 bits: 2021.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10404; 100.0% identity (100.0% similar) in 1581 aa overlap (1-1581:1-1581)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 PEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 PEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 QAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 QAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 SVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 VVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 VVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 TIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEIFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 TIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEIFLL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 DEPTAGLDPFSRHQVWNLLKERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 DEPTAGLDPFSRHQVWNLLKERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 FLKKKWGIGYHLSLQLNEICVEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 FLKKKWGIGYHLSLQLNEICVEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 LYKDLDSYPDLGIENYGVSMTTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 LYKDLDSYPDLGIENYGVSMTTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 MEQVLSSLNKMRKTIGGVALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 MEQVLSSLNKMRKTIGGVALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 YTMVKIYQNSYTWELSPHLYFLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 YTMVKIYQNSYTWELSPHLYFLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 VDAFGTRNGTDDPSYNGAITVCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 VDAFGTRNGTDDPSYNGAITVCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 VHIRTERSTFLENGQDNPIGFLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 VHIRTERSTFLENGQDNPIGFLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGL
970 980 990 1000 1010 1020
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pF1KA0 SPSAYWFGQALVDVSLYFLVFVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 SPSAYWFGQALVDVSLYFLVFVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 YVISFIFRKGRKNSGIWSFCFYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 YVISFIFRKGRKNSGIWSFCFYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 SSHLLFSSLFSEERMDVQPFLVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 SSHLLFSSLFSEERMDVQPFLVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 SSDVCQNPEEPEGEDEDVQMERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 SSDVCQNPEEPEGEDEDVQMERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 KNKIATRNVSFCVRKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 KNKIATRNVSFCVRKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEF
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 LGYCPQENALWPNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 LGYCPQENALWPNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 GIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 GIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAE
1390 1400 1410 1420 1430 1440
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pF1KA0 AEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 AEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAA
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 RQERYSSLMVYKLPVEDVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 RQERYSSLMVYKLPVEDVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQEL
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580
pF1KA0 GDFEEDFDPSVKWKLLPQEEP
:::::::::::::::::::::
NP_009 GDFEEDFDPSVKWKLLPQEEP
1570 1580
>>XP_005256997 (OMIM: 612505) PREDICTED: ATP-binding cas (1560 aa)
initn: 6504 init1: 6504 opt: 6504 Z-score: 6783.6 bits: 1268.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9891; 97.4% identity (97.4% similar) in 1560 aa overlap (62-1581:1-1560)
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 MEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLLTMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMN
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMN
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 KVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANYPEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANYPEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEH
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 KDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVALQAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVALQAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKM
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 HSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYASVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYASVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGL
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 LYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFMVVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFMVVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTG
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 LVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWILSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWILSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHP
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 SDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFEKILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFEKILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHV
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 ALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAIRIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAIRIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQI
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520 530 540 550 560 570
pF1KA0 TAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSVTIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSVTIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFD
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580 590
pF1KA0 FLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEI----------------------------------
::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEIQRVLLELEMKNIQDVLAQNLSGGQKRKLTFGIAI
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pF1KA0 ------FLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLLKERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LGDPQIFLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLLKERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEICVEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLP
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pF1KA0 LERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVSMTTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVSMTTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGVALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILM
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pF1KA0 AGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLYFLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLYFLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGAITVCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIGFLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFLVFVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA0 KSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEEP
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Smith-Waterman score: 10266; 97.5% identity (97.5% similar) in 1613 aa overlap (9-1581:9-1621)
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
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pF1KA0 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEIC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVSM
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pF1KA0 TTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGVAL
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pF1KA0 WRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLY
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870 880 890 900 910 920
pF1KA0 FLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGAIT
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930 940 950 960 970 980
pF1KA0 VCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIG
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pF1KA0 FLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFLV
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1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA0 FVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWSFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWSFC
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pF1KA0 FYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSSLFSEERMDVQPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSSLFSEERMDVQPF
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1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA0 LVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSDVCQNPEEPEGEDEDVQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSDVCQNPEEPEGEDEDVQM
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KA0 ERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSFCVRKGEVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSFCVRKGEVLG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KA0 LLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEFLGYCPQENALWPNLTVRQHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEFLGYCPQENALWPNLTVRQHL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KA0 EVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVL
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KA0 LDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIG
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KA0 SIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQP
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1530 1540 1550 1560 1570 1580
pF1KA0 LAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEE
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pF1KA0 P
:
NP_001 P
>>XP_005256995 (OMIM: 612505) PREDICTED: ATP-binding cas (1621 aa)
initn: 6504 init1: 6504 opt: 6504 Z-score: 6783.3 bits: 1268.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10266; 97.5% identity (97.5% similar) in 1613 aa overlap (9-1581:9-1621)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANY
70 80 90 100 110 120
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pF1KA0 PEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 QAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 VVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWI
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pF1KA0 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
370 380 390 400 410 420
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pF1KA0 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
430 440 450 460 470 480
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pF1KA0 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
490 500 510 520 530 540
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pF1KA0 TIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEI---
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEIQRV
550 560 570 580 590 600
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pF1KA0 -------------------------------------FLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLLK
:::::::::::::::::::::::
XP_005 LLELEMKNIQDVLAQNLSGGQKRKLTFGIAILGDPQIFLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLLK
610 620 630 640 650 660
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pF1KA0 ERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEIC
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pF1KA0 VEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVSM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGVAL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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870 880 890 900 910 920
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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1050 1060 1070 1080 1090 1100
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVL
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XP_005 LDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIG
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1470 1480 1490 1500 1510 1520
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XP_005 SIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQP
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XP_005 LAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEE
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pF1KA0 P
:
XP_005 P
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Smith-Waterman score: 10212; 97.2% identity (97.2% similar) in 1613 aa overlap (9-1581:9-1616)
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NP_001 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_001 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
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NP_001 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
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NP_001 ERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEIC
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NP_001 VEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVSM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGVAL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGAIT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWSFC
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pF1KA0 FYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSSLFSEERMDVQPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSSLFSEERMDVQPF
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pF1KA0 LVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSDVCQNPEEPEGEDEDVQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_001 LVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFF-----SSDVCQNPEEPEGEDEDVQM
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pF1KA0 ERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSFCVRKGEVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSFCVRKGEVLG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEFLGYCPQENALWPNLTVRQHL
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pF1KA0 EVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVL
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pF1KA0 LDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIG
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1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KA0 SIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQP
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pF1KA0 LAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEE
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pF1KA0 P
:
NP_001 P
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pF1KA0 RVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVALQAAIN
::: .:: . :: : ::..::::.:::::
XP_016 MCSSSKAHCQAVNEKMKCEGSEFWEKGFVAFQAAIN
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pF1KA0 AAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYASVNVT
::::::.:::::::.:::::: .::. :..:.:: ::...: ::::::.::::.:::::
XP_016 AAIIEIATNHSVMEQLMSVTGVHMKILPFVAQGGVATDFFIFFCIISFSTFIYYVSVNVT
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pF1KA0 RERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFMVVFSL
.::. . .::::::::.:::::::::.:::::.::: ..::...:.:...:.::..::.:
XP_016 QERQYITSLMTMMGLRESAFWLSWGLMYAGFILIMATLMALIVKSAQIVVLTGFVMVFTL
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pF1KA0 FLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWILSLLS
::::::::..::::::.:.:: :::::::::: :::: ::: .:: .::: ::: : :::
XP_016 FLLYGLSLITLAFLMSVLIKKPFLTGLVVFLLIVFWGILGFPALYTRLPAFLEWTLCLLS
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pF1KA0 PFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFEKILPN
:::: .:::::.:::::.:::: :.. ::.:: :::.::: :::.:..::.::::
XP_016 PFAFTVGMAQLIHLDYDVNSNAHLDSSQNPYLIIATLFMLVFDTLLYLVLTLYFDKILPA
220 230 240 250 260 270
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pF1KA0 EYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAIRIRNV
::::: ::::::: :: : ...::.::.: :.::. .: :: . ::: :::::::.:.
XP_016 EYGHRCSPLFFLKSCFWFQHGRANHVVLENETDSDPTPNDCFEPVSPEFCGKEAIRIKNL
280 290 300 310 320 330
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pF1KA0 TKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSVTIYNN
::: :: ...:::: .:::::::::::.::::::::.:::::::::::::.::::.::.
XP_016 KKEYAGKCERVEALKGVVFDIYEGQITALLGHSGAGKTTLLNILSGLSVPTSGSVTVYNH
340 350 360 370 380 390
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pF1KA0 KLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEI--------
::.:::.::.::.:: :::::::: ::::.::::::::::::::.::.::.
XP_016 TLSRMADIENISKFTGFCPQSNVQFGFLTVKENLRLFAKIKGILPHEVEKEVQRVVQELE
400 410 420 430 440 450
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pF1KA0 --------------------------------FLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLLKERKTD
.:::::::::::.:::..:::::: :.:
XP_016 MENIQDILAQNLSGGQNRKLTFGIAILGDPQVLLLDEPTAGLDPLSRHRIWNLLKEGKSD
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pF1KA0 RVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEICVEENI
:::::::::.::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::.::: : :.:
XP_016 RVILFSTQFIDEADILADRKVFISNGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLHLNERCDPESI
520 530 540 550 560 570
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pF1KA0 TSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVSMTTLNE
:::::::: ::::.:.:: ::.: :::::::::::::.::: . :::.::::.:::::
XP_016 TSLVKQHISDAKLTAQSEEKLVYILPLERTNKFPELYRDLDRCSNQGIEDYGVSITTLNE
580 590 600 610 620 630
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pF1KA0 VFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGVALWRQQI
:::::::::::.::::.: :..:.. : : :::.::::::... ::::.::::::::.
XP_016 VFLKLEGKSTIDESDIGIWGQLQTDGAKDIGSLVELEQVLSSFHETRKTISGVALWRQQV
640 650 660 670 680 690
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 CAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLYFLAPG
::::.::.::::.:::.: ..::.. .: : :.:. . . ::.:: :::::. :::.::
XP_016 CAIAKVRFLKLKKERKSLWTILLLFGISFIPQLLEHLFYESYQKSYPWELSPNTYFLSPG
700 710 720 730 740 750
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 QQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGAITVCCNE
:::.::::.::.:::::..::.:..:...::::.:::::::::::::::::::: : .:
XP_016 QQPQDPLTHLLVINKTGSTIDNFLHSLRRQNIAIEVDAFGTRNGTDDPSYNGAIIVSGDE
760 770 780 790 800 810
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 KNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIGFLAYI
:.. ::.:::.:::::::::.:..::::::. . : ::.:.::::.:. .: :. .
XP_016 KDHRFSIACNTKRLNCFPVLLDVISNGLLGIFNSSEHIQTDRSTFFEEHMDYEYGYRSNT
820 830 840 850 860 870
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 MFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFLVFVFIY
.::. ...: :::::::: :::..:.:::::::: ::::::::::::::::::.....
XP_016 FFWIPMAASFTPYIAMSSIGDYKKKAHSQLRISGLYPSAYWFGQALVDVSLYFLILLLMQ
880 890 900 910 920 930
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA0 LMSYISNFEDMLLTIIHI-IQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWSFCFYVV
.:.:: . :.... : .. ::: :..:: ::.:.:::::::::.:::::::::: : .:
XP_016 IMDYIFSPEEIIFIIQNLLIQILCSIGYVSSLVFLTYVISFIFRNGRKNSGIWSFFFLIV
940 950 960 970 980 990
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pF1KA0 TVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSSL--FSEERMDVQPFLV
..::... .. . :. :.:::: :.:: ::. :.. .:. .. . .. .:.
XP_016 VIFSIVATDLNEYGFLGLFFGTMLIPPFTLIGSLFIFSEISPDSMDYLGASESEIV-YLA
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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pF1KA0 FLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSDVCQNPEEPEGEDEDVQMER
.:::.:::.:::: ::::: . :: ::::: :::::::. . ::::::::.::.::::
XP_016 LLIPYLHFLIFLFILRCLEMNCRKKLMRKDPVFRISPRSNAIFPNPEEPEGEEEDIQMER
1060 1070 1080 1090 1100 1110
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pF1KA0 VRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSFCVRKGEVLGLL
.::.::. .::: :::::::::::::::.:.::::::.:::::::::::.::::.:::
XP_016 MRTVNAMAVRDFDETPVIIASCLRKEYAGKKKNCFSKRKKKIATRNVSFCVKKGEVIGLL
1120 1130 1140 1150 1160 1170
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pF1KA0 GHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEFLGYCPQENALWPNLTVRQHLEV
:::::::::.::.::::::::::::.:::::::. : :::::::::::::::::::::::
XP_016 GHNGAGKSTTIKMITGDTKPTAGQVILKGSGGGEPLGFLGYCPQENALWPNLTVRQHLEV
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pF1KA0 YAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVLLD
:::::::::::: .::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YAAVKGLRKGDAMIAITRLVDALKLQDQLKAPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVLLD
1240 1250 1260 1270 1280 1290
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pF1KA0 EPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSI
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EPSTGMDPEGQQQMWQVIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSI
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pF1KA0 QHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQPLA
::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::.:::.:::::::::::::.::.
XP_016 QHLKSKFGKDYLLEMKLKNLAQMEPLHAEILRLFPQAAQQERFSSLMVYKLPVEDVRPLS
1360 1370 1380 1390 1400 1410
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pF1KA0 QAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEEP
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
XP_016 QAFFKLEIVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDLEEDFDPSSLDCESMFCLLC
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XP_016 L
>>XP_011522494 (OMIM: 612505) PREDICTED: ATP-binding cas (1063 aa)
initn: 4247 init1: 3914 opt: 3914 Z-score: 4082.9 bits: 767.7 E(85289): 0
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVAL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEIQRV
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:::::::::::::::::::::::
XP_011 LLELEMKNIQDVLAQNLSGGQKRKLTFGIAILGDPQIFLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLLK
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630 640 650 660 670 680
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEIC
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690 700 710 720 730 740
pF1KA0 VEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVSM
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750 760 770 780 790 800
pF1KA0 TTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGVAL
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810 820 830 840 850 860
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLY
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870 880 890 900 910 920
pF1KA0 FLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGAIT
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930 940 950 960 970 980
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIG
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::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKTLINPNESIMCLQIT
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>>XP_011522493 (OMIM: 612505) PREDICTED: ATP-binding cas (1164 aa)
initn: 7264 init1: 3914 opt: 3914 Z-score: 4082.4 bits: 767.8 E(85289): 0
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
10 20 30 40 50 60
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pF1KA0 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANY
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVAL
130 140 150 160 170 180
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pF1KA0 QAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA
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pF1KA0 SVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFM
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWI
310 320 330 340 350 360
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pF1KA0 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
370 380 390 400 410 420
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pF1KA0 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
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pF1KA0 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KA0 TIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEI---
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEIQRV
550 560 570 580 590 600
600 610 620
pF1KA0 -------------------------------------FLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLLK
:::::::::::::::::::::::
XP_011 LLELEMKNIQDVLAQNLSGGQKRKLTFGIAILGDPQIFLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLLK
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pF1KA0 ERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEIC
670 680 690 700 710 720
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pF1KA0 VEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVSM
730 740 750 760 770 780
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pF1KA0 TTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGVAL
790 800 810 820 830 840
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 WRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLY
850 860 870 880 890 900
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 FLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGAIT
910 920 930 940 950 960
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 VCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIG
970 980 990 1000 1010 1020
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 FLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFLV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA0 FVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWSFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWSFC
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1110 1120 1130 1140 1150
pF1KA0 FYVVTVFSVAGFA-FSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSSLFSEERMDVQP
::::..: : . . :..:..
XP_011 FYVVSIFLVDVYCIYLIYNSELIL
1150 1160
>>XP_011522876 (OMIM: 612504) PREDICTED: ATP-binding cas (1300 aa)
initn: 4168 init1: 1281 opt: 3805 Z-score: 3967.9 bits: 746.7 E(85289): 2.8e-214
Smith-Waterman score: 4864; 58.9% identity (80.0% similar) in 1311 aa overlap (320-1581:1-1300)
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pF1KA0 STQFIILSGFMVVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSL
::.:.::. ::.:::::::.:::::::: .
XP_011 MSVLLKKAVLTNLVVFLLTLFWGCLGFTVF
10 20 30
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 YRHLPASLEWILSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDT
:..::.::::::.. ::::: :: :...:::.::. :: :: : ..:: :: .:
XP_011 YEQLPSSLEWILNICSPFAFTTGMIQIIKLDYNLNGVIFPDPSGDSYTMIATFSMLLLDG
40 50 60 70 80 90
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 CLYLALAIYFEKILPNEYGHRR--PPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSF
.:: ::.::.:::: :: .: :::::.:: : :.:. ..: :.::. : :
XP_011 LIYLLLALYFDKILP--YGDERHYSPLFFLNSSSCFQHQRTNAKVIEKEIDAEHPSDDYF
100 110 120 130 140
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pF1KA0 EQAPPEFQGKEAIRIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLN
: . :::::::::::::: :::::: :.:::: :.::::::::::::::::::::.:::
XP_011 EPVAPEFQGKEAIRIRNVKKEYKGKSGKVEALKGLLFDIYEGQITAILGHSGAGKSSLLN
150 160 170 180 190 200
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pF1KA0 ILSGLSVPTKGSVTIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKG
::.::::::.:::::::..:::: :::.. :.:::::: :::::.:::.::: :::::::
XP_011 ILNGLSVPTEGSVTIYNKNLSEMQDLEEIRKITGVCPQFNVQFDILTVKENLSLFAKIKG
210 220 230 240 250 260
590 600
pF1KA0 I----LPQEV------------------------------------DKEIFLLDEPTAGL
: . ::: : .:.::::::.::
XP_011 IHLKEVEQEVQRILLELDMQNIQDNLAKHLSEGQKRKLTFGITILGDPQILLLDEPTTGL
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...:. ... ..:::.:. :.::.:.::::.. :.::.:::.. .. ::.:: : .
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]