FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0835, 1121 aa 1>>>pF1KA0835 1121 - 1121 aa - 1121 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.3755+/-0.000507; mu= -9.9513+/- 0.032 mean_var=503.7368+/-99.545, 0's: 0 Z-trim(121.2): 131 B-trim: 0 in 0/61 Lambda= 0.057144 statistics sampled from 37299 (37464) to 37299 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.733), E-opt: 0.2 (0.439), width: 16 Scan time: 18.090 The best scores are: opt bits E(85289) NP_004526 (OMIM: 600379) myelin transcription fact (1121) 7463 631.2 1e-179 NP_001316774 (OMIM: 613084,616521) myelin transcri (1186) 2665 235.7 1.3e-60 NP_001289981 (OMIM: 613084,616521) myelin transcri (1186) 2665 235.7 1.3e-60 NP_001316773 (OMIM: 613084,616521) myelin transcri (1186) 2665 235.7 1.3e-60 XP_011508628 (OMIM: 613084,616521) PREDICTED: myel (1188) 2651 234.5 2.9e-60 NP_001316777 (OMIM: 613084,616521) myelin transcri (1184) 2645 234.0 4e-60 NP_001316776 (OMIM: 613084,616521) myelin transcri (1184) 2645 234.0 4e-60 NP_055840 (OMIM: 613084,616521) myelin transcripti (1184) 2645 234.0 4e-60 XP_016859100 (OMIM: 613084,616521) PREDICTED: myel (1186) 2631 232.9 9e-60 XP_016859101 (OMIM: 613084,616521) PREDICTED: myel (1186) 2631 232.9 9e-60 XP_016869563 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1018) 2487 220.9 3e-56 XP_016869562 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1018) 2487 220.9 3e-56 XP_016869561 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1018) 2487 220.9 3e-56 XP_016869568 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1012) 2484 220.7 3.6e-56 XP_016869564 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1012) 2484 220.7 3.6e-56 XP_011515943 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1012) 2484 220.7 3.6e-56 XP_016869566 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1012) 2484 220.7 3.6e-56 XP_016869565 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1012) 2484 220.7 3.6e-56 XP_016869567 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1012) 2484 220.7 3.6e-56 XP_016869569 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1012) 2484 220.7 3.6e-56 XP_011515935 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_011515938 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869537 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869536 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_011515936 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 NP_055497 (OMIM: 617155) suppression of tumorigeni (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_011515933 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869560 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869559 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_011515940 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869558 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_011515939 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869557 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_011515931 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869555 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869554 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869547 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869553 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869552 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869551 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869556 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869549 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869542 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869540 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869546 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869545 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869541 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869550 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_016869548 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 XP_011515937 (OMIM: 617155) PREDICTED: suppression (1047) 2484 220.7 3.7e-56 >>NP_004526 (OMIM: 600379) myelin transcription factor 1 (1121 aa) initn: 7463 init1: 7463 opt: 7463 Z-score: 3347.3 bits: 631.2 E(85289): 1e-179 Smith-Waterman score: 7463; 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NP_001 MQDTEKDDNNNDEYDNYDELVAKSLLNLGKIAEDAAYRAR--TESEMNSNTSNSLEDDSD 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 pF1KA0 GAASEEGEKGLFIQPEDAEEVVE-VTTER----------SQDLCPQSLEDAASEESSKQK . :.:. . :.. : : : . . :... .. :. :...:.. NP_001 -KNENLGRKSELSLDLDSDVVRETVDSLKLLAQGHGVVLSENMNDRNYADSMSQQDSRNM 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 pF1KA0 GILSHEEEDEEEEEEEEEEEEDEE---------EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE . . . .. :. :: ::: ... . .. : . .:.. ... . NP_001 NYVMLGKPMNNGLMEKMVEESDEEVCLSSLECLRNQCFDLARKLSETNPQERNPQQNMNI 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 pF1KA0 EEEAAPDVIFQEDTSHTSAQKAPEL-RGPESPSPKPEYSVIVEVRSDD---DKDEDTHSR .... :. : : . . .: : :. ::. . :.. ..: ..:.:: : NP_001 RQHVRPEEDFPGRTPDRNYSDMLNLMRLEEQLSPRSR--VFASCAKEDGCHERDDDTTSV 360 370 380 390 400 410 360 370 380 390 400 pF1KA0 KSTVTDESEMQDMMTRGNLGLLEQAIALKAEQVRTVCEPGCPPA----------EQSQLG .: :.:: ::.::: :::.::::..:..... : : .:: NP_001 NS---DRSEEVFDMTKGNLTLLEKAIALETERAKAMREKMAMEAGRRDNMRSYEDQSPRQ 420 430 440 450 460 470 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 LGEPGKAAKPLDT---VRKSYYSKDPSRAEKREIKCPTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGC : ::. :: .. :.: ::.:::::.::.: :::::::::::::::::::::::::: NP_001 L--PGEDRKPKSSDSHVKKPYYGKDPSRTEKKESKCPTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGC 480 490 500 510 520 530 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 PHKDRIPPEILAMHENVLKCPTPGCTGQGHVNSNRNTHRSLSGCPIAAAEKLAKSHEKQQ :::::.:::::::::.:::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::..::.: NP_001 PHKDRVPPEILAMHESVLKCPTPGCTGRGHVNSNRNSHRSLSGCPIAAAEKLAKAQEKHQ 540 550 560 570 580 590 530 540 550 560 570 580 pF1KA0 PQTGDPSKSSSNSDRILRPMCFVKQLEVPPYGSYRPNVAPATPRANLAKELEKFSKVTFD . : ::::. :::.:::::::::::.: :: :: :: .:::.::::::::.::..:. 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