FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0853, 1668 aa 1>>>pF1KA0853 1668 - 1668 aa - 1668 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0340+/-0.0005; mu= -10.0503+/- 0.032 mean_var=583.5835+/-116.373, 0's: 0 Z-trim(122.2): 586 B-trim: 0 in 0/62 Lambda= 0.053091 statistics sampled from 39280 (39949) to 39280 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.735), E-opt: 0.2 (0.468), width: 16 Scan time: 17.670 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001317495 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domai (1668) 11134 869.5 0 NP_001317496 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domai (1668) 11134 869.5 0 NP_001317494 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domai (1668) 11134 869.5 0 XP_016875968 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1669) 11122 868.6 0 XP_016875966 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1669) 11122 868.6 0 XP_016875967 (OMIM: 616453) PREDICTED: 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