FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0853, 1668 aa
1>>>pF1KA0853 1668 - 1668 aa - 1668 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0340+/-0.0005; mu= -10.0503+/- 0.032
mean_var=583.5835+/-116.373, 0's: 0 Z-trim(122.2): 586 B-trim: 0 in 0/62
Lambda= 0.053091
statistics sampled from 39280 (39949) to 39280 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.735), E-opt: 0.2 (0.468), width: 16
Scan time: 17.670
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001317495 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domai (1668) 11134 869.5 0
NP_001317496 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domai (1668) 11134 869.5 0
NP_001317494 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domai (1668) 11134 869.5 0
XP_016875968 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1669) 11122 868.6 0
XP_016875966 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1669) 11122 868.6 0
XP_016875967 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1669) 11122 868.6 0
XP_016875969 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1669) 11122 868.6 0
NP_001070256 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domai (1669) 11122 868.6 0
NP_001317493 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domai (1669) 11122 868.6 0
XP_005266367 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1669) 11122 868.6 0
NP_055885 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domain-c (1564) 10397 813.0 0
XP_005266369 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1564) 10397 813.0 0
XP_005266364 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1696) 7212 569.1 1.2e-160
XP_016875965 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1697) 7200 568.2 2.2e-160
XP_016875964 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1697) 7200 568.2 2.2e-160
XP_005266362 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1697) 7200 568.2 2.2e-160
XP_005266363 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1697) 7200 568.2 2.2e-160
XP_005266359 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1697) 7200 568.2 2.2e-160
XP_005266360 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1697) 7200 568.2 2.2e-160
XP_005266358 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1697) 7200 568.2 2.2e-160
XP_005266361 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1697) 7200 568.2 2.2e-160
XP_011535347 (OMIM: 612427) PREDICTED: RNA-binding ( 638) 629 64.4 3.6e-09
NP_067062 (OMIM: 612427) RNA-binding protein 25 [H ( 843) 630 64.6 4.1e-09
XP_011535346 (OMIM: 612427) PREDICTED: RNA-binding ( 843) 630 64.6 4.1e-09
NP_009044 (OMIM: 190370) trichohyalin [Homo sapien (1943) 585 61.6 8.1e-08
XP_016864545 (OMIM: 609268) PREDICTED: splicing re ( 359) 521 55.9 7.5e-07
NP_001310463 (OMIM: 609268) splicing regulatory gl ( 359) 521 55.9 7.5e-07
NP_001310456 (OMIM: 609268) splicing regulatory gl ( 508) 521 56.1 9.5e-07
NP_631907 (OMIM: 609268) splicing regulatory gluta ( 508) 521 56.1 9.5e-07
XP_011541473 (OMIM: 609268) PREDICTED: splicing re ( 508) 521 56.1 9.5e-07
NP_001070667 (OMIM: 609268) splicing regulatory gl ( 624) 521 56.2 1.1e-06
NP_003741 (OMIM: 602039) eukaryotic translation in (1382) 531 57.3 1.1e-06
NP_001310464 (OMIM: 609268) splicing regulatory gl ( 358) 513 55.3 1.1e-06
NP_001257421 (OMIM: 609268) splicing regulatory gl ( 507) 513 55.5 1.5e-06
NP_001310458 (OMIM: 609268) splicing regulatory gl ( 623) 513 55.6 1.7e-06
NP_001310462 (OMIM: 609268) splicing regulatory gl ( 538) 480 53.0 8.7e-06
NP_277021 (OMIM: 176873) cyclin-dependent kinase 1 ( 782) 452 51.0 5e-05
XP_005247023 (OMIM: 606093) PREDICTED: peptidyl-pr ( 754) 446 50.5 6.7e-05
XP_005247024 (OMIM: 606093) PREDICTED: peptidyl-pr ( 754) 446 50.5 6.7e-05
NP_004783 (OMIM: 606093) peptidyl-prolyl cis-trans ( 754) 446 50.5 6.7e-05
NP_277024 (OMIM: 176873) cyclin-dependent kinase 1 ( 748) 431 49.4 0.00015
NP_001278274 (OMIM: 176873) cyclin-dependent kinas ( 772) 431 49.4 0.00015
XP_011540795 (OMIM: 176873) PREDICTED: cyclin-depe ( 794) 426 49.0 0.0002
XP_011540797 (OMIM: 176873) PREDICTED: cyclin-depe ( 760) 422 48.7 0.00024
XP_016858415 (OMIM: 176873) PREDICTED: cyclin-depe ( 781) 415 48.1 0.00036
XP_016858414 (OMIM: 176873) PREDICTED: cyclin-depe ( 791) 411 47.8 0.00044
NP_001778 (OMIM: 176873) cyclin-dependent kinase 1 ( 795) 404 47.3 0.00065
NP_001309344 (OMIM: 616653) arginine/serine-rich p ( 787) 403 47.2 0.00068
NP_001309343 (OMIM: 616653) arginine/serine-rich p ( 787) 403 47.2 0.00068
XP_016866200 (OMIM: 616653) PREDICTED: arginine/se ( 796) 403 47.2 0.00068
>>NP_001317495 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domain-co (1668 aa)
initn: 11134 init1: 11134 opt: 11134 Z-score: 4629.0 bits: 869.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 11134; 99.9% identity (100.0% similar) in 1668 aa overlap (1-1668:1-1668)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSKIRRKVTVENTKTISDSTSRRPSVFERLGPSTGSTAETQCRNWLKTGNCLYGNTCRFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSKIRRKVTVENTKTISDSTSRRPSVFERLGPSTGSTAETQCRNWLKTGNCLYGNTCRFV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 HGPSPRGKGYSSNYRRSPERPTGDLRERMKNKRQDVDTEPQKRNTEESSSPVRKESSRGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HGPSPRGKGYSSNYRRSPERPTGDLRERMKNKRQDVDTEPQKRNTEESSSPVRKESSRGR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 HREKEDIKITKERTPESEEENVEWETNRDDSDNGDINYDYVHELSLEMKRQKIQRELMKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HREKEDIKITKERTPESEEENVEWETNRDDSDNGDINYDYVHELSLEMKRQKIQRELMKL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 EQENMEKREEIIIKKEVSPEVVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQENMEKREEIIIKKEVSPEVVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SSPLLDQQRNSKTNQSKKKGPRTPSPPPPIPEDIALGKKYKEKYKVKDRIEEKTRDGKDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSPLLDQQRNSKTNQSKKKGPRTPSPPPPIPEDIALGKKYKEKYKVKDRIEEKTRDGKDR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GRDFERQREKRDKPRSTSPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSPSPRRKRTPSPSYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GRDFERQREKRDKPRSTSPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSPSPRRKRTPSPSYQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 RTLTPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTSQSHDRRHERREDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RTLTPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTSQSHDRRHERREDT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 RGKRDREKDSREEREYEQDQSSSRDHRDDREPRDGRDRRDARDTRDRRELRDSRDMRDSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGKRDREKDSREEREYEQDQSSSRDHRDDREPRDGRDRRDARDTRDRRELRDSRDMRDSR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 EMRDYSRDTKESRDPRDSRSTRDAHDYRDREGRDTHRKEDTYPEESRSYGRNHLREESSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EMRDYSRDTKESRDPRDSRSTRDAHDYRDREGRDTHRKEDTYPEESRSYGRNHLREESSR
490 500 510 520 530 540
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pF1KA0 TEIRNESRNESRSEIRNDRMGRSRGRVPELPEKGSRGSRGSQIDSHSSNSNYHDSWETRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TEIRNESRNESRSEIRNDRMGRSRGRVPELPEKGSRGSRGSQIDSHSSNSNYHDSWETRS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 SYPERDRYPERDNRDQARDSSFERRHGERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SYPERDRYPERDNRDQARDSSFERRHGERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGRNDELERDERR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 EERRVDRVDDRRDERARERDRERERDRERERERERERDREREKERELERERARERERERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EERRVDRVDDRRDERARERDRERERDRERERERERERDREREKERELERERARERERERE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 KERDRERDRDRDHDRERERERERDREKEREREREERERERERERERERERERERERARER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KERDRERDRDRDHDRERERERERDREKEREREREERERERERERERERERERERERARER
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 DKERERQRDWEDKDKGRDDRREKREEIREDRNPRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DKERERQRDWEDKDKGRDDRREKREEIREDRNPRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 RREHSPDSDAYNSGDDKNEKHRLLSQVVRPQESRSLSPSHLTEDRQGRWKEEDRKPERKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RREHSPDSDAYNSGDDKNEKHRLLSQVVRPQESRSLSPSHLTEDRQGRWKEEDRKPERKE
850 860 870 880 890 900
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pF1KA0 SSRRYEEQELKEKVSSVDKQREQTEILESSRMRAQDIIGHHQSEDRETSDRAHDENKKKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSRRYEEQELKEKVSSVDKQREQTEILESSRMRAQDIIGHHQSEDRETSDRAHDENKKKA
910 920 930 940 950 960
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pF1KA0 KIQKKPIKKKKEDDVGIERGNIETTSEDGQVFSPKKGQKKKSIEKKRKKSKGDSDISDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KIQKKPIKKKKEDDVGIERGNIETTSEDGQVFSPKKGQKKKSIEKKRKKSKGDSDISDEE
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pF1KA0 AAQQSKKKRGPRTPPITTKEELVEMCNGKNGILEDSQKKEDTAFSDWSDEDVPDRTEVTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AAQQSKKKRGPRTPPITTKEELVEMCNGKNGILEDSQKKEDTAFSDWSDEDVPDRTEVTE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 AEHTATATTPGSTPSPLSSLLPPPPPVATATATTVPATLAATTAAAATSFSTSAITISTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEHTATATTPGSTPSPLSSLLPPPPPVATATATTVPATLAATTAAAATSFSTSAITISTS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 ATPTNTTNNTFANEDSHRKCHRTRVEKVETPHVTIEDAQHRKPMDQKRSSSLGSNRSNRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATPTNTTNNTFANEDSHRKCHRTRVEKVETPHVTIEDAQHRKPMDQKRSSSLGSNRSNRS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 HTSGRLRSPSNDSAHRSGDDQSGRKRVLHSGSRDREKTKSLEITGERKSRIDQLKRGEPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HTSGRLRSPSNDSAHRSGDDQSGRKRVLHSGSRDREKTKSLEITGERKSRIDQLKRGEPS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
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pF1KA0 RSTSSDRQDSRSHSSRRSSPESDRQVHSRSGSFDSRDRLQERDRYEHDRERERERRDTRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSTSSDRQDSRSHSSRRSSPESDRQVHSRSGSFDSRDRLQERDRYEHDRERERERRDTRQ
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pF1KA0 REWDRDADKDWPRNRDRDRLRERERERERDKRRDLDRERERLISDSVERDRDRDRDRTFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REWDRDADKDWPRNRDRDRLRERERERERDKRRDLDRERERLISDSVERDRDRDRDRTFE
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pF1KA0 SSQIESVKRCEAKLEGEHERDLESTSRDSLALDKERMDKDLGSVQGFEDTNKSERTESLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
NP_001 SSQIESVKRCEAKLEGEHERDLESTSRDSLALDKERMDKDLGSVQGFEETNKSERTESLE
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 GDDESKLDDAHSLGSGAGEGYEPISDDELDEILAGDAEKREDQQDEEKMPDPLDVIDVDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GDDESKLDDAHSLGSGAGEGYEPISDDELDEILAGDAEKREDQQDEEKMPDPLDVIDVDW
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1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 SGLMPKHPKEPREPGAALLKFTPGAVMLRVGISKKLAGSELFAKVKETCQRLLEKPKDAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGLMPKHPKEPREPGAALLKFTPGAVMLRVGISKKLAGSELFAKVKETCQRLLEKPKDAD
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 NLFEHELGALNMAALLRKEERASLLSNLGPCCKALCFRRDSAIRKQLVKNEKGTIKQAYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLFEHELGALNMAALLRKEERASLLSNLGPCCKALCFRRDSAIRKQLVKNEKGTIKQAYT
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660
pF1KA0 SAPMVDNELLRLSLRLFKRKTTCHAPGHEKTEDNKLSQSSIQQELCVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SAPMVDNELLRLSLRLFKRKTTCHAPGHEKTEDNKLSQSSIQQELCVS
1630 1640 1650 1660
>>NP_001317496 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domain-co (1668 aa)
initn: 11134 init1: 11134 opt: 11134 Z-score: 4629.0 bits: 869.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 11134; 99.9% identity (100.0% similar) in 1668 aa overlap (1-1668:1-1668)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSKIRRKVTVENTKTISDSTSRRPSVFERLGPSTGSTAETQCRNWLKTGNCLYGNTCRFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSKIRRKVTVENTKTISDSTSRRPSVFERLGPSTGSTAETQCRNWLKTGNCLYGNTCRFV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 HGPSPRGKGYSSNYRRSPERPTGDLRERMKNKRQDVDTEPQKRNTEESSSPVRKESSRGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HGPSPRGKGYSSNYRRSPERPTGDLRERMKNKRQDVDTEPQKRNTEESSSPVRKESSRGR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 HREKEDIKITKERTPESEEENVEWETNRDDSDNGDINYDYVHELSLEMKRQKIQRELMKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HREKEDIKITKERTPESEEENVEWETNRDDSDNGDINYDYVHELSLEMKRQKIQRELMKL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 EQENMEKREEIIIKKEVSPEVVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQENMEKREEIIIKKEVSPEVVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SSPLLDQQRNSKTNQSKKKGPRTPSPPPPIPEDIALGKKYKEKYKVKDRIEEKTRDGKDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSPLLDQQRNSKTNQSKKKGPRTPSPPPPIPEDIALGKKYKEKYKVKDRIEEKTRDGKDR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GRDFERQREKRDKPRSTSPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSPSPRRKRTPSPSYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GRDFERQREKRDKPRSTSPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSPSPRRKRTPSPSYQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 RTLTPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTSQSHDRRHERREDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RTLTPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGRHDHERTSQSHDRRHERREDT
370 380 390 400 410 420
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pF1KA0 RGKRDREKDSREEREYEQDQSSSRDHRDDREPRDGRDRRDARDTRDRRELRDSRDMRDSR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_001 RGKRDREKDSREEREYEQDQSSSRDHRDDREPRDGRDRRDARDTRDRRELRDSRDMRDSR
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pF1KA0 EMRDYSRDTKESRDPRDSRSTRDAHDYRDREGRDTHRKEDTYPEESRSYGRNHLREESSR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GDDESKLDDAHSLGSGAGEGYEPISDDELDEILAGDAEKREDQQDEEKMPDPLDVIDVDW
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NP_001 SGLMPKHPKEPREPGAALLKFTPGAVMLRVGISKKLAGSELFAKVKETCQRLLEKPKDAD
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NP_001 NLFEHELGALNMAALLRKEERASLLSNLGPCCKALCFRRDSAIRKQLVKNEKGTIKQAYT
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NP_001 SAPMVDNELLRLSLRLFKRKTTCHAPGHEKTEDNKLSQSSIQQELCVS
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>>XP_016875968 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger CCC (1669 aa)
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XP_016 HGPSPRGKGYSSNYRRSPERPTGDLRERMKNKRQDVDTEPQKRNTEESSSPVRKESSRGR
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XP_016 EQENMEKREEIIIKKEVSPEVVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAV
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XP_016 TSAPMVDNELLRLSLRLFKRKTTCHAPGHEKTEDNKLSQSSIQQELCVS
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XP_016 EQENMEKREEIIIKKEVSPEVVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WSGLMPKHPKEPREPGAALLKFTPGAVMLRVGISKKLAGSELFAKVKETCQRLLEKPKDA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DNLFEHELGALNMAALLRKEERASLLSNLGPCCKALCFRRDSAIRKQLVKNEKGTIKQAY
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XP_016 TSAPMVDNELLRLSLRLFKRKTTCHAPGHEKTEDNKLSQSSIQQELCVS
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NP_001 HGPSPRGKGYSSNYRRSPERPTGDLRERMKNKRQDVDTEPQKRNTEESSSPVRKESSRGR
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NP_001 EQENMEKREEIIIKKEVSPEVVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EERRVDRVDDRRDERARERDRERERDRERERERERERDREREKERELERERARERERERE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KERDRERDRDRDHDRERERERERDREKEREREREERERERERERERERERERERERARER
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_001 TSAPMVDNELLRLSLRLFKRKTTCHAPGHEKTEDNKLSQSSIQQELCVS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSRRYEEQELKEKVSSVDKQREQTEILESSRMRAQDIIGHHQSEDRETSDRAHDENKKKA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WSGLMPKHPKEPREPGAALLKFTPGAVMLRVGISKKLAGSELFAKVKETCQRLLEKPKDA
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pF1KA0 DNLFEHELGALNMAALLRKEERASLLSNLGPCCKALCFRRDSAIRKQLVKNEKGTIKQAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DNLFEHELGALNMAALLRKEERASLLSNLGPCCKALCFRRDSAIRKQLVKNEKGTIKQAY
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NP_001 TSAPMVDNELLRLSLRLFKRKTTCHAPGHEKTEDNKLSQSSIQQELCVS
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XP_005 EQENMEKREEIIIKKEVSPEVVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAV
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XP_005 SSPLLDQQRNSKTNQSKKKGPRTPSPPPPIPEDIALGKKYKEKYKVKDRIEEKTRDGKDR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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1668 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]