Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0864
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0864, 1038 aa
1>>>pF1KA0864 1038 - 1038 aa - 1038 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1664+/-0.00102; mu= -3.8456+/- 0.062
mean_var=326.0210+/-65.964, 0's: 0 Z-trim(114.3): 38 B-trim: 125 in 2/50
Lambda= 0.071032
statistics sampled from 14841 (14863) to 14841 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.756), E-opt: 0.2 (0.457), width: 16
Scan time: 4.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42268.1 MPRIP gene_id:23164|Hs108|chr17 (1038) 6847 716.1 9.4e-206
CCDS32578.1 MPRIP gene_id:23164|Hs108|chr17 (1025) 6717 702.8 9.6e-202
CCDS43016.1 TRIOBP gene_id:11078|Hs108|chr22 ( 652) 591 74.9 6.4e-13
CCDS43015.1 TRIOBP gene_id:11078|Hs108|chr22 (2365) 591 75.3 1.8e-12
CCDS33644.1 TRIOBP gene_id:11078|Hs108|chr22 ( 431) 567 72.3 2.5e-12
>>CCDS42268.1 MPRIP gene_id:23164|Hs108|chr17 (1038 aa)
initn: 6847 init1: 6847 opt: 6847 Z-score: 3807.4 bits: 716.1 E(32554): 9.4e-206
Smith-Waterman score: 6847; 100.0% identity (100.0% similar) in 1038 aa overlap (1-1038:1-1038)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSAAKENPCRKFQANIFNKSKCQNCFKPRESHLLNDEDLTQAKPIYGGWLLLAPDGTDFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSAAKENPCRKFQANIFNKSKCQNCFKPRESHLLNDEDLTQAKPIYGGWLLLAPDGTDFD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 NPVHRSRKWQRRFFILYEHGLLRYALDEMPTTLPQGTINMNQCTDVVDGEGRTGQKFSLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NPVHRSRKWQRRFFILYEHGLLRYALDEMPTTLPQGTINMNQCTDVVDGEGRTGQKFSLC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 ILTPEKEHFIRAETKEIVSGWLEMLMVYPRTNKQNQKKKRKVEPPTPQEPGPAKVAVTSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ILTPEKEHFIRAETKEIVSGWLEMLMVYPRTNKQNQKKKRKVEPPTPQEPGPAKVAVTSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 SSSSSSSSSIPSAEKVPTTKSTLWQEEMRTKDQPDGSSLSPAQSPSQSQPPAASSLREPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SSSSSSSSSIPSAEKVPTTKSTLWQEEMRTKDQPDGSSLSPAQSPSQSQPPAASSLREPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LESKEEESAMSSDRMDCGRKVRVESGYFSLEKTKQDLKAEEQQLPPPLSPPSPSTPNHRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LESKEEESAMSSDRMDCGRKVRVESGYFSLEKTKQDLKAEEQQLPPPLSPPSPSTPNHRR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 SQVIEKFEALDIEKAEHMETNAVGPSPSSDTRQGRSEKRAFPRKRDFTNEAPPAPLPDAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SQVIEKFEALDIEKAEHMETNAVGPSPSSDTRQGRSEKRAFPRKRDFTNEAPPAPLPDAS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 ASPLSPHRRAKSLDRRSTEPSVTPDLLNFKKGWLTKQYEDGQWKKHWFVLADQSLRYYRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ASPLSPHRRAKSLDRRSTEPSVTPDLLNFKKGWLTKQYEDGQWKKHWFVLADQSLRYYRD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SVAEEAADLDGEIDLSACYDVTEYPVQRNYGFQIHTKEGEFTLSAMTSGIRRNWIQTIMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SVAEEAADLDGEIDLSACYDVTEYPVQRNYGFQIHTKEGEFTLSAMTSGIRRNWIQTIMK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 HVHPTTAPDVTSSLPEEKNKSSCSFETCPRPTEKQEAELGEPDPEQKRSRARERRREGRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HVHPTTAPDVTSSLPEEKNKSSCSFETCPRPTEKQEAELGEPDPEQKRSRARERRREGRS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 KTFDWAEFRPIQQALAQERVGGVGPADTHEPLRPEAEPGELERERARRREERRKRFGMLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KTFDWAEFRPIQQALAQERVGGVGPADTHEPLRPEAEPGELERERARRREERRKRFGMLD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 ATDGPGTEDAALRMEVDRSPGLPMSDLKTHNVHVEIEQRWHQVETTPLREEKQVPIAPVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ATDGPGTEDAALRMEVDRSPGLPMSDLKTHNVHVEIEQRWHQVETTPLREEKQVPIAPVH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 LSSEDGGDRLSTHELTSLLEKELEQSQKEASDLLEQNRLLQDQLRVALGREQSAREGYVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEDGGDRLSTHELTSLLEKELEQSQKEASDLLEQNRLLQDQLRVALGREQSAREGYVL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 QATCERGFAAMEETHQKKIEDLQRQHQRELEKLREEKDRLLAEETAATISAIEAMKNAHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QATCERGFAAMEETHQKKIEDLQRQHQRELEKLREEKDRLLAEETAATISAIEAMKNAHR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 EEMERELEKSQRSQISSVNSDVEALRRQYLEELQSVQRELEVLSEQYSQKCLENAHLAQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EEMERELEKSQRSQISSVNSDVEALRRQYLEELQSVQRELEVLSEQYSQKCLENAHLAQA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 LEAERQALRQCQRENQELNAHNQELNNRLAAEITRLRTLLTGDGGGEATGSPLAQGKDAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LEAERQALRQCQRENQELNAHNQELNNRLAAEITRLRTLLTGDGGGEATGSPLAQGKDAY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 ELEVLLRVKESEIQYLKQEISSLKDELQTALRDKKYASDKYKDIYTELSIAKAKADCDIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ELEVLLRVKESEIQYLKQEISSLKDELQTALRDKKYASDKYKDIYTELSIAKAKADCDIS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 RLKEQLKAATEALGEKSPDSATVSGYDIMKSKSNPDFLKKDRSCVTRQLRNIRSKSLKEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RLKEQLKAATEALGEKSPDSATVSGYDIMKSKSNPDFLKKDRSCVTRQLRNIRSKSLKEG
970 980 990 1000 1010 1020
1030
pF1KA0 LTVQERLKLFESRDLKKD
::::::::::::::::::
CCDS42 LTVQERLKLFESRDLKKD
1030
>>CCDS32578.1 MPRIP gene_id:23164|Hs108|chr17 (1025 aa)
initn: 6831 init1: 6717 opt: 6717 Z-score: 3735.5 bits: 702.8 E(32554): 9.6e-202
Smith-Waterman score: 6717; 99.5% identity (99.8% similar) in 1022 aa overlap (1-1022:1-1022)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSAAKENPCRKFQANIFNKSKCQNCFKPRESHLLNDEDLTQAKPIYGGWLLLAPDGTDFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MSAAKENPCRKFQANIFNKSKCQNCFKPRESHLLNDEDLTQAKPIYGGWLLLAPDGTDFD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 NPVHRSRKWQRRFFILYEHGLLRYALDEMPTTLPQGTINMNQCTDVVDGEGRTGQKFSLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NPVHRSRKWQRRFFILYEHGLLRYALDEMPTTLPQGTINMNQCTDVVDGEGRTGQKFSLC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 ILTPEKEHFIRAETKEIVSGWLEMLMVYPRTNKQNQKKKRKVEPPTPQEPGPAKVAVTSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ILTPEKEHFIRAETKEIVSGWLEMLMVYPRTNKQNQKKKRKVEPPTPQEPGPAKVAVTSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 SSSSSSSSSIPSAEKVPTTKSTLWQEEMRTKDQPDGSSLSPAQSPSQSQPPAASSLREPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSSSSSSSSIPSAEKVPTTKSTLWQEEMRTKDQPDGSSLSPAQSPSQSQPPAASSLREPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LESKEEESAMSSDRMDCGRKVRVESGYFSLEKTKQDLKAEEQQLPPPLSPPSPSTPNHRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LESKEEESAMSSDRMDCGRKVRVESGYFSLEKTKQDLKAEEQQLPPPLSPPSPSTPNHRR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 SQVIEKFEALDIEKAEHMETNAVGPSPSSDTRQGRSEKRAFPRKRDFTNEAPPAPLPDAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SQVIEKFEALDIEKAEHMETNAVGPSPSSDTRQGRSEKRAFPRKRDFTNEAPPAPLPDAS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 ASPLSPHRRAKSLDRRSTEPSVTPDLLNFKKGWLTKQYEDGQWKKHWFVLADQSLRYYRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ASPLSPHRRAKSLDRRSTEPSVTPDLLNFKKGWLTKQYEDGQWKKHWFVLADQSLRYYRD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SVAEEAADLDGEIDLSACYDVTEYPVQRNYGFQIHTKEGEFTLSAMTSGIRRNWIQTIMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SVAEEAADLDGEIDLSACYDVTEYPVQRNYGFQIHTKEGEFTLSAMTSGIRRNWIQTIMK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 HVHPTTAPDVTSSLPEEKNKSSCSFETCPRPTEKQEAELGEPDPEQKRSRARERRREGRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HVHPTTAPDVTSSLPEEKNKSSCSFETCPRPTEKQEAELGEPDPEQKRSRARERRREGRS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 KTFDWAEFRPIQQALAQERVGGVGPADTHEPLRPEAEPGELERERARRREERRKRFGMLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KTFDWAEFRPIQQALAQERVGGVGPADTHEPLRPEAEPGELERERARRREERRKRFGMLD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 ATDGPGTEDAALRMEVDRSPGLPMSDLKTHNVHVEIEQRWHQVETTPLREEKQVPIAPVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ATDGPGTEDAALRMEVDRSPGLPMSDLKTHNVHVEIEQRWHQVETTPLREEKQVPIAPVH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 LSSEDGGDRLSTHELTSLLEKELEQSQKEASDLLEQNRLLQDQLRVALGREQSAREGYVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LSSEDGGDRLSTHELTSLLEKELEQSQKEASDLLEQNRLLQDQLRVALGREQSAREGYVL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 QATCERGFAAMEETHQKKIEDLQRQHQRELEKLREEKDRLLAEETAATISAIEAMKNAHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QATCERGFAAMEETHQKKIEDLQRQHQRELEKLREEKDRLLAEETAATISAIEAMKNAHR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 EEMERELEKSQRSQISSVNSDVEALRRQYLEELQSVQRELEVLSEQYSQKCLENAHLAQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EEMERELEKSQRSQISSVNSDVEALRRQYLEELQSVQRELEVLSEQYSQKCLENAHLAQA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 LEAERQALRQCQRENQELNAHNQELNNRLAAEITRLRTLLTGDGGGEATGSPLAQGKDAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LEAERQALRQCQRENQELNAHNQELNNRLAAEITRLRTLLTGDGGGEATGSPLAQGKDAY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 ELEVLLRVKESEIQYLKQEISSLKDELQTALRDKKYASDKYKDIYTELSIAKAKADCDIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ELEVLLRVKESEIQYLKQEISSLKDELQTALRDKKYASDKYKDIYTELSIAKAKADCDIS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 RLKEQLKAATEALGEKSPDSATVSGYDIMKSKSNPDFLKKDRSCVTRQLRNIRSKSLKEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :
CCDS32 RLKEQLKAATEALGEKSPDSATVSGYDIMKSKSNPDFLKKDRSCVTRQLRNIRSKSVIEQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030
pF1KA0 LTVQERLKLFESRDLKKD
..
CCDS32 VSWDT
>>CCDS43016.1 TRIOBP gene_id:11078|Hs108|chr22 (652 aa)
initn: 1520 init1: 498 opt: 591 Z-score: 345.5 bits: 74.9 E(32554): 6.4e-13
Smith-Waterman score: 1582; 43.4% identity (68.7% similar) in 668 aa overlap (324-976:6-643)
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 STPNHRRSQVIEKFEALDIEKAEHMETNAVGPSPSSDTRQGRSEKRAFPRKRDFTNEAPP
::. . ....:: : . . :
CCDS43 MGGWKGPGQRRGKEGPEARRRAAERGGGGGGGGVP
10 20 30
360 370 380 390 400
pF1KA0 APLPDASASPLSPHRRAKSLDRRSTEPSVTPDLLNFKKGWLTKQYEDG------------
:: : :. :. : ..:::::::::::.. : :
CCDS43 APRSPARE----PRPRSCLLLPPPWGAAMTPDLLNFKKGWMSILDEPGEPPSPSLTTTST
40 50 60 70 80 90
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 -QWKKHWFVLADQSLRYYRDSVAEEAADLDGEIDLSACYDVTEYPVQRNYGFQIHTKEGE
:::::::::.:.::.:::::.:::: .::::::: .: ::::: ::::::::::::..
CCDS43 SQWKKHWFVLTDSSLKYYRDSTAEEADELDGEIDLRSCTDVTEYAVQRNYGFQIHTKDAV
100 110 120 130 140 150
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 FTLSAMTSGIRRNWIQTIMKHVHPTTAPDVTSSLPEEKNKSSCSFETCPRPTEKQEAELG
.::::::::::::::... : :.::.:::::. .:... :. : : . : . :
CCDS43 YTLSAMTSGIRRNWIEALRKTVRPTSAPDVTKLSDSNKENALHSYSTQKGPLKAGEQRAG
160 170 180 190 200 210
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 EPDPEQKRSRARERRREGRSKTFDWAEFRPIQQALAQERVGGVGPADTHEPLRPEAEPGE
. ::. :. .:. ...:..:. :. :: :. . :: : . : :. :
CCDS43 S----EVISRGGPRKADGQRQALDYVELSPLTQASPQR---ARTPARTPDRL---AKQEE
220 230 240 250 260
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 LERERARRREERRKRFGMLDATDGPGTEDAALRMEVDRSPGLPMSDLKTHNVHVEIEQRW
:::. :.: ::::: : .:::. : : . :. : :... . . . :::..:
CCDS43 LERDLAQRSEERRKWF---EATDSRTPEVPAGEGP-RRGLGAPLTEDQQNRLSEEIEKKW
270 280 290 300 310
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 HQVETTPLREEKQVPIAPVHLSSEDGGDRLSTHELTSLLEKELEQSQKEASDLLEQNRLL
...: ::::.:.::.. . :.. : : . ::::.. . . :: ::
CCDS43 QELEKLPLRENKRVPLTAL-LNQSRGERRGPPSDGHEALEKEVQALRAQ----LEAWRLQ
320 330 340 350 360 370
710 720 730 740 750
pF1KA0 QDQLRVALGREQSAR--EGYVLQATCERGFAAMEETHQKKIEDLQRQHQRELEKLREEKD
. . :: ..... ::. : .:::..: :: .::. .:.:::.:.:::..:..::.
CCDS43 GEAPQSALRSQEDGHIPPGYISQEACERSLAEMESSHQQVMEELQRHHERELQRLQQEKE
380 390 400 410 420 430
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 RLLAEETAATISAIEAMKNAHREEMERELEKSQRSQISSVNSDVEALRRQYLEELQSVQR
::::::::: :::::::.:..::. ::: :.. :... ..::.:. ......:
CCDS43 WLLAEETAATASAIEAMKKAYQEELSRELSKTR-----SLQQGPDGLRKQHQSDVEALKR
440 450 460 470 480
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 ELEVLSEQYSQKCLENAHLAQALEAERQALRQCQRENQELNAHNQELNNRLAAEITRLRT
::.:::::::::::: . : . : ....::.::.:.::: :::::..::. :: .::
CCDS43 ELQVLSEQYSQKCLEIGALMRQAEEREHTLRRCQQEGQELLRHNQELHGRLSEEIDQLRG
490 500 510 520 530 540
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 LLTGDGGGEATGSPLAQGKDAYELEVLLRVKESEIQYLKQEISSLKDELQTALRDKKYAS
.....: :.. : .. ... ::::::::::.:.::::.:.. :.:::: .::...:
CCDS43 FIASQGMGNGCGR--SNERSSCELEVLLRVKENELQYLKKEVQCLRDELQMMQKDKRFTS
550 560 570 580 590 600
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 DKYKDIYTELSIAKAKADCDISRLKEQLKAATEALGEKSPDSATVSGYDIMKSKSNPDFL
::.:.:.::: :.... .: .:::.:. : :: ::
CCDS43 GKYQDVYVELSHIKTRSEREIEQLKEHLRLAMAALQEKESMRNSLAE
610 620 630 640 650
1000 1010 1020 1030
pF1KA0 KKDRSCVTRQLRNIRSKSLKEGLTVQERLKLFESRDLKKD
>>CCDS43015.1 TRIOBP gene_id:11078|Hs108|chr22 (2365 aa)
initn: 1643 init1: 498 opt: 591 Z-score: 337.5 bits: 75.3 E(32554): 1.8e-12
Smith-Waterman score: 1576; 39.0% identity (65.0% similar) in 795 aa overlap (207-976:1623-2356)
180 190 200 210 220
pF1KA0 VTSSSSSSSSSSSIPSAEKVPTTKSTLWQEEMRTKDQPDG-------SSLSPA---QSPS
:.....::.: .. ::: :::
CCDS43 LPRKDPAGHRDDLARALGPELGPPGTNDVPEQESHSQPEGWAEATPVNGHSPALQSQSPV
1600 1610 1620 1630 1640 1650
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 QSQPPAASSLREPGLESKEEESAMSSDRMDCGRKVRVESGYFSLEKTKQDLKAEEQQLPP
: :: .: . : .. . .. . .. ..: .. ..: . . : :. :
CCDS43 QLPSPACTSTQWPKIKVTRGPATATLAGLE-------QTGPLGSRSTAKGPSLPELQFQP
1660 1670 1680 1690 1700
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 PLSPPSPSTPNHRRSQVIEKFEALDIEKAEHMETNAVGPSPSSDTRQGRSEKRAFPRKRD
: : :.. .. . .. .: :.: : .... . . :
CCDS43 E--EPEESEPSRGQDPLTDQKQA-----------------DSADKRPAEGKAGSPLKGRL
1710 1720 1730 1740
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 FTNEAPPAPLPDASASPLSPHRRAKSLDRRSTEPSVTPDLLNFKKGWLTKQYEDG-----
:. :. : . ..: . .. : ::::::::::.. : :
CCDS43 VTSWRMPGDRP----TLFNPFLLSLGVLRWRR-----PDLLNFKKGWMSILDEPGEPPSP
1750 1760 1770 1780 1790
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: . : . ::. :. .:. ...:..:. :. :: :. . :: : . :
CCDS43 AGEQRAG----SEVISRGGPRKADGQRQALDYVELSPLTQASPQR---ARTPARTPDRL-
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:. ::::. :.: ::::: : .:::. : : . :. : :... . . .
CCDS43 --AKQEELERDLAQRSEERRKWF---EATDSRTPEVPAGEGP-RRGLGAPLTEDQQNRLS
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:::..:...: ::::.:.::.. . :.. : : . ::::.. . .
CCDS43 EEIEKKWQELEKLPLRENKRVPLTAL-LNQSRGERRGPPSDGHEALEKEVQALRAQ----
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pF1KA0 LEQNRLLQDQLRVALGREQSAR--EGYVLQATCERGFAAMEETHQKKIEDLQRQHQRELE
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CCDS43 LEAWRLQGEAPQSALRSQEDGHIPPGYISQEACERSLAEMESSHQQVMEELQRHHERELQ
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CCDS43 RLQQEKEWLLAEETAATASAIEAMKKAYQEELSRELSKTR-----SLQQGPDGLRKQHQS
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......:::.:::::::::::: . : . : ....::.::.:.::: :::::..::.
CCDS43 DVEALKRELQVLSEQYSQKCLEIGALMRQAEEREHTLRRCQQEGQELLRHNQELHGRLSE
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:: .:: .....: :.. : .. ... ::::::::::.:.::::.:.. :.::::
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