Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0869
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0869, 1113 aa
1>>>pF1KA0869 1113 - 1113 aa - 1113 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7217+/-0.00103; mu= 7.5224+/- 0.062
mean_var=200.5856+/-40.141, 0's: 0 Z-trim(110.4): 62 B-trim: 139 in 1/53
Lambda= 0.090557
statistics sampled from 11541 (11589) to 11541 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.689), E-opt: 0.2 (0.356), width: 16
Scan time: 5.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4366.1 WWC1 gene_id:23286|Hs108|chr5 (1113) 7197 953.9 0
CCDS54945.1 WWC1 gene_id:23286|Hs108|chr5 (1119) 7175 951.0 0
CCDS34109.2 WWC2 gene_id:80014|Hs108|chr4 (1192) 2032 279.1 4.2e-74
CCDS14136.1 WWC3 gene_id:55841|Hs108|chrX (1092) 1362 191.5 8.8e-48
>>CCDS4366.1 WWC1 gene_id:23286|Hs108|chr5 (1113 aa)
initn: 7197 init1: 7197 opt: 7197 Z-score: 5091.2 bits: 953.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7197; 100.0% identity (100.0% similar) in 1113 aa overlap (1-1113:1-1113)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MPRPELPLPEGWEEARDFDGKVYYIDHTNRTTSWIDPRDRYTKPLTFADCISDELPLGWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MPRPELPLPEGWEEARDFDGKVYYIDHTNRTTSWIDPRDRYTKPLTFADCISDELPLGWE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 EAYDPQVGDYFIDHNTKTTQIEDPRVQWRREQEHMLKDYLVVAQEALSAQKEIYQVKQQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EAYDPQVGDYFIDHNTKTTQIEDPRVQWRREQEHMLKDYLVVAQEALSAQKEIYQVKQQR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LELAQQEYQQLHAVWEHKLGSQVSLVSGSSSSSKYDPEILKAEIATAKSRVNKLKREMVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LELAQQEYQQLHAVWEHKLGSQVSLVSGSSSSSKYDPEILKAEIATAKSRVNKLKREMVH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LQHELQFKERGFQTLKKIDKKMSDAQGSYKLDEAQAVLRETKAIKKAITCGEKEKQDLIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LQHELQFKERGFQTLKKIDKKMSDAQGSYKLDEAQAVLRETKAIKKAITCGEKEKQDLIK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SLAMLKDGFRTDRGSHSDLWSSSSSLESSSFPLPKQYLDVSSQTDISGSFGINSNNQLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLAMLKDGFRTDRGSHSDLWSSSSSLESSSFPLPKQYLDVSSQTDISGSFGINSNNQLAE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 KVRLRLRYEEAKRRIANLKIQLAKLDSEAWPGVLDSERDRLILINEKEELLKEMRFISPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KVRLRLRYEEAKRRIANLKIQLAKLDSEAWPGVLDSERDRLILINEKEELLKEMRFISPR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 KWTQGEVEQLEMARKRLEKDLQAARDTQSKALTERLKLNSKRNQLVRELEEATRQVATLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KWTQGEVEQLEMARKRLEKDLQAARDTQSKALTERLKLNSKRNQLVRELEEATRQVATLH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SQLKSLSSSMQSLSSGSSPGSLTSSRGSLVASSLDSSTSASFTDLYYDPFEQLDSELQSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SQLKSLSSSMQSLSSGSSPGSLTSSRGSLVASSLDSSTSASFTDLYYDPFEQLDSELQSK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 VEFLLLEGATGFRPSGCITTIHEDEVAKTQKAEGGGRLQALRSLSGTPKSMTSLSPRSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VEFLLLEGATGFRPSGCITTIHEDEVAKTQKAEGGGRLQALRSLSGTPKSMTSLSPRSSL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SSPSPPCSPLMADPLLAGDAFLNSLEFEDPELSATLCELSLGNSAQERYRLEEPGTEGKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSPSPPCSPLMADPLLAGDAFLNSLEFEDPELSATLCELSLGNSAQERYRLEEPGTEGKQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LGQAVNTAQGCGLKVACVSAAVSDESVAGDSGVYEASVQRLGASEAAAFDSDESEAVGAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LGQAVNTAQGCGLKVACVSAAVSDESVAGDSGVYEASVQRLGASEAAAFDSDESEAVGAT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 RIQIALKYDEKNKQFAILIIQLSNLSALLQQQDQKVNIRVAVLPCSESTTCLFRTRPLDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RIQIALKYDEKNKQFAILIIQLSNLSALLQQQDQKVNIRVAVLPCSESTTCLFRTRPLDA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 SDTLVFNEVFWVSMSYPALHQKTLRVDVCTTDRSHLEECLGGAQISLAEVCRSGERSTRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SDTLVFNEVFWVSMSYPALHQKTLRVDVCTTDRSHLEECLGGAQISLAEVCRSGERSTRW
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 YNLLSYKYLKKQSRELKPVGVMAPASGPASTDAVSALLEQTAVELEKRQEGRSSTQTLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YNLLSYKYLKKQSRELKPVGVMAPASGPASTDAVSALLEQTAVELEKRQEGRSSTQTLED
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 SWRYEETSENEAVAEEEEEEVEEEEGEEDVFTEKASPDMDGYPALKVDKETNTETPAPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SWRYEETSENEAVAEEEEEEVEEEEGEEDVFTEKASPDMDGYPALKVDKETNTETPAPSP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 TVVRPKDRRVGTPSQGPFLRGSTIIRSKTFSPGPQSQYVCRLNRSDSDSSTLSKKPPFVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TVVRPKDRRVGTPSQGPFLRGSTIIRSKTFSPGPQSQYVCRLNRSDSDSSTLSKKPPFVR
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 NSLERRSVRMKRPSSVKSLRSERLIRTSLDLELDLQATRTWHSQLTQEISVLKELKEQLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NSLERRSVRMKRPSSVKSLRSERLIRTSLDLELDLQATRTWHSQLTQEISVLKELKEQLE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 QAKSHGEKELPQWLREDERFRLLLRMLEKRQMDRAEHKGELQTDKMMRAAAKDVHRLRGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QAKSHGEKELPQWLREDERFRLLLRMLEKRQMDRAEHKGELQTDKMMRAAAKDVHRLRGQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110
pF1KA0 SCKEPPEVQSFREKMAFFTRPRMNIPALSADDV
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SCKEPPEVQSFREKMAFFTRPRMNIPALSADDV
1090 1100 1110
>>CCDS54945.1 WWC1 gene_id:23286|Hs108|chr5 (1119 aa)
initn: 6291 init1: 6291 opt: 7175 Z-score: 5075.6 bits: 951.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7175; 99.5% identity (99.5% similar) in 1119 aa overlap (1-1113:1-1119)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MPRPELPLPEGWEEARDFDGKVYYIDHTNRTTSWIDPRDRYTKPLTFADCISDELPLGWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MPRPELPLPEGWEEARDFDGKVYYIDHTNRTTSWIDPRDRYTKPLTFADCISDELPLGWE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 EAYDPQVGDYFIDHNTKTTQIEDPRVQWRREQEHMLKDYLVVAQEALSAQKEIYQVKQQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EAYDPQVGDYFIDHNTKTTQIEDPRVQWRREQEHMLKDYLVVAQEALSAQKEIYQVKQQR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LELAQQEYQQLHAVWEHKLGSQVSLVSGSSSSSKYDPEILKAEIATAKSRVNKLKREMVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LELAQQEYQQLHAVWEHKLGSQVSLVSGSSSSSKYDPEILKAEIATAKSRVNKLKREMVH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LQHELQFKERGFQTLKKIDKKMSDAQGSYKLDEAQAVLRETKAIKKAITCGEKEKQDLIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LQHELQFKERGFQTLKKIDKKMSDAQGSYKLDEAQAVLRETKAIKKAITCGEKEKQDLIK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SLAMLKDGFRTDRGSHSDLWSSSSSLESSSFPLPKQYLDVSSQTDISGSFGINSNNQLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLAMLKDGFRTDRGSHSDLWSSSSSLESSSFPLPKQYLDVSSQTDISGSFGINSNNQLAE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 KVRLRLRYEEAKRRIANLKIQLAKLDSEAWPGVLDSERDRLILINEKEELLKEMRFISPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KVRLRLRYEEAKRRIANLKIQLAKLDSEAWPGVLDSERDRLILINEKEELLKEMRFISPR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 KWTQGEVEQLEMARKRLEKDLQAARDTQSKALTERLKLNSKRNQLVRELEEATRQVATLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KWTQGEVEQLEMARKRLEKDLQAARDTQSKALTERLKLNSKRNQLVRELEEATRQVATLH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SQLKSLSSSMQSLSSGSSPGSLTSSRGSLVASSLDSSTSASFTDLYYDPFEQLDSELQSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SQLKSLSSSMQSLSSGSSPGSLTSSRGSLVASSLDSSTSASFTDLYYDPFEQLDSELQSK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 VEFLLLEGATGFRPSGCITTIHEDEVAKTQKAEGGGRLQALRSLSGTPKSMTSLSPRSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VEFLLLEGATGFRPSGCITTIHEDEVAKTQKAEGGGRLQALRSLSGTPKSMTSLSPRSSL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SSPSPPCSPLMADPLLAGDAFLNSLEFEDPELSATLCELSLGNSAQERYRLEEPGTEGKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SSPSPPCSPLMADPLLAGDAFLNSLEFEDPELSATLCELSLGNSAQERYRLEEPGTEGKQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LGQAVNTAQGCGLKVACVSAAVSDESVAGDSGVYEASVQRLGASEAAAFDSDESEAVGAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LGQAVNTAQGCGLKVACVSAAVSDESVAGDSGVYEASVQRLGASEAAAFDSDESEAVGAT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 RIQIALKYDEKNKQFAILIIQLSNLSALLQQQDQKVNIRVAVLPCSESTTCLFRTRPLDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RIQIALKYDEKNKQFAILIIQLSNLSALLQQQDQKVNIRVAVLPCSESTTCLFRTRPLDA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 SDTLVFNEVFWVSMSYPALHQKTLRVDVCTTDRSHLEECLGGAQISLAEVCRSGERSTRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SDTLVFNEVFWVSMSYPALHQKTLRVDVCTTDRSHLEECLGGAQISLAEVCRSGERSTRW
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 YNLLSYKYLKKQSRELKPVGVMAPASGPASTDAVSALLEQTAVELEKRQEGRSSTQTLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YNLLSYKYLKKQSRELKPVGVMAPASGPASTDAVSALLEQTAVELEKRQEGRSSTQTLED
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 SWRYEETSENEAVAEEEEEEVEEEEGEEDVFTEKASPDMDGYPALKVDKETNTETPAPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SWRYEETSENEAVAEEEEEEVEEEEGEEDVFTEKASPDMDGYPALKVDKETNTETPAPSP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 TVVRPKDRRVGTPSQGPFLRGSTIIRSKTFSPGPQSQYVCRLNRSDSDSSTLSKKPPFVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TVVRPKDRRVGTPSQGPFLRGSTIIRSKTFSPGPQSQYVCRLNRSDSDSSTLSKKPPFVR
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010
pF1KA0 NSLERRSVRMKRPS------SVKSLRSERLIRTSLDLELDLQATRTWHSQLTQEISVLKE
:::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NSLERRSVRMKRPSPPPQPSSVKSLRSERLIRTSLDLELDLQATRTWHSQLTQEISVLKE
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 LKEQLEQAKSHGEKELPQWLREDERFRLLLRMLEKRQMDRAEHKGELQTDKMMRAAAKDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LKEQLEQAKSHGEKELPQWLREDERFRLLLRMLEKRQMDRAEHKGELQTDKMMRAAAKDV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110
pF1KA0 HRLRGQSCKEPPEVQSFREKMAFFTRPRMNIPALSADDV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HRLRGQSCKEPPEVQSFREKMAFFTRPRMNIPALSADDV
1090 1100 1110
>>CCDS34109.2 WWC2 gene_id:80014|Hs108|chr4 (1192 aa)
initn: 3038 init1: 1899 opt: 2032 Z-score: 1443.9 bits: 279.1 E(32554): 4.2e-74
Smith-Waterman score: 3176; 49.2% identity (74.4% similar) in 1152 aa overlap (1-1068:1-1147)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MPR----PELPLPEGWEEARDFDGKVYYIDHTNRTTSWIDPRDRYTKPLTFADCISDELP
::: .::::.:::::::.::::.::::..: ::::::::: ::::.::::..::::
CCDS34 MPRRAGSGQLPLPRGWEEARDYDGKVFYIDHNTRRTSWIDPRDRLTKPLSFADCVGDELP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 LGWEEAYDPQVGDYFIDHNTKTTQIEDPRVQWRREQEHMLKDYLVVAQEALSAQKEIYQV
::: ..:::.: :.::: .::::::::: ::: :::.:::::: :::.:: .:::.:.:
CCDS34 WGWEAGFDPQIGVYYIDHINKTTQIEDPRKQWRGEQEKMLKDYLSVAQDALRTQKELYHV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 KQQRLELAQQEYQQLHAVWEHKLGSQVSLVSGSSSSSKYDPEILKAEIATAKSRVNKLKR
:.::: :: .:: .:. ....: .:..:: ::::::.::::.::::::.:.. ::.::::
CCDS34 KEQRLALALDEYVRLNDAYKEKSSSHTSLFSGSSSSTKYDPDILKAEISTTRLRVKKLKR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 EMVHLQHELQFKERGFQTLKKIDKKMSDAQGSYKLDEAQAVLRETKAIKKAITCGEKEKQ
:. ....:: .::.::.::..:::::: .:..:.:.::.:.: : :.:.:::. ::::::
CCDS34 ELSQMKQELLYKEQGFETLQQIDKKMSGGQSGYELSEAKAILTELKSIRKAISSGEKEKQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 DLIKSLAMLKDGFRTDRG---SHSDLWSSSSSLESSSFPLPKQYLDVSSQTDISGSFGIN
::..::: :.. :. :.. :. :: : .: . : .: ::..:::.:::..:.
CCDS34 DLMQSLAKLQERFHLDQNIGRSEPDLRCSPV---NSHLCLSRQTLDAGSQTSISGDIGVR
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 SNNQLAEKVRLRLRYEEAKRRIANLKIQLAKLDSEAWPGVLDSERDRLILINEKEELLKE
: ..::::::: :.:::::: .:::::.:.:::::::::.:: :...:.:::::::::::
CCDS34 SRSNLAEKVRLSLQYEEAKRSMANLKIELSKLDSEAWPGALDIEKEKLMLINEKEELLKE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 MRFISPRKWTQGEVEQLEMARKRLEKDLQAARDTQSKALTERLKLNSKRNQLVRELEEAT
..:..:.: :: :.:.:: :.:::..: ..: : :.::.:::.:. .:..:...:::.:
CCDS34 LQFVTPQKRTQDELERLEAERQRLEEELLSVRGTPSRALAERLRLEERRKELLQKLEETT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 RQVATLHSQLKSLSSSMQSLSSGSSPGSLTSSRGSLVASSLDSSTSASFTDLYYDP-FEQ
. .. :::::::::.: :.::::: :::.:::::: .:: : .: : :.:::. .:
CCDS34 KLTTYLHSQLKSLSASTLSMSSGSSLGSLASSRGSLNTSSRGSLNSLSSTELYYSSQSDQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KA0 LDSELQSKVEFLLLEGATGFRPSGCITTIHEDEVAKTQKAEGGGRLQALRS--------L
.: . : :..::: : .:. ::: ::::::.::.:. . : . : .. . :
CCDS34 IDVDYQYKLDFLLQE-KSGYIPSGPITTIHENEVVKSPSQPGQSGLCGVAAAATGHTPPL
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KA0 SGTPKSMTSLSPRSSLSSPSPPCSPLMAD---PLLAG-DAFLNSL--EFEDPELSATLCE
. .:::..::: :::::: ::: :::. . :. .. :: :... .::: :::. . .
CCDS34 AEAPKSVASLSSRSSLSSLSPPGSPLVLEGTFPMSSSHDASLHQFTADFEDCELSSHFAD
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610
pF1KA0 LSL-----------GNSAQ---ERYRLEE----PGTEG-----KQLGQAVNTAQGCGLKV
.:: :...: : :.: : :: :.: . . . : :.
CCDS34 ISLIENQILLDSDSGGASQSLSEDKDLNECAREPLYEGTADVEKSLPKR-RVIHLLGEKT
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 ACVSAAVSDESVAGDSGVYEASVQRLGASEAAAFDSDESEAVGATRIQIALKYDEKNKQF
.:::::::::::::::::::: :.. . : .... .. : ....::.:.:. :...:
CCDS34 TCVSAAVSDESVAGDSGVYEAFVKQPSEMEDVTYSEEDVAIVETAQVQIGLRYNAKSSSF
660 670 680 690 700 710
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 AILIIQLSNLSALLQQQDQKVNIRVAVLPCSESTTCLFRTRPLDASDTLVFNEVFWVSMS
..: :: :: :.: . .:: .:::::: : ...:::::. .....::.:: :..:
CCDS34 MVIIAQLRNLHAFLIPHTSKVYFRVAVLPSSTDVSCLFRTKVHPPTESILFNDVFRVAIS
720 730 740 750 760 770
740 750 760 770 780 790
pF1KA0 YPALHQKTLRVDVCTTDRSHLEECLGGAQISLAEVCRSGERSTRWYNLLSYKYLKKQSRE
::.:::::::.:.... . ::::.:.:::::.. :.: : ::::: : . .. :
CCDS34 QTALQQKTLRVDLCSVSKHRREECLAGTQISLADLPFSSEVFTLWYNLLPSKQMPCKKNE
780 790 800 810 820 830
800 810 820 830 840
pF1KA0 LKPVGVMAPASGPAST---DAVSALLEQTAVEL----------EKRQEGRSSTQTLEDSW
. .:. : . ... ::::::: .:..:: :... :. . . .:
CCDS34 ENEDSVFQPNQPLVDSIDLDAVSALLARTSAELLAVEQELAQEEEEESGQEEPRGPDGDW
840 850 860 870 880 890
850 860 870 880
pF1KA0 -RYEETSENEAVAEEEEEEVEEEEGE--EDVFTEKASPDM--DG-------------YPA
. . . .: :::.: : :.. ::. . . :.: :: :
CCDS34 LTMLREASDEIVAEKEAEVKLPEDSSCTEDLSSCTSVPEMNEDGNRKESNCAKDLRSQPP
900 910 920 930 940 950
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 LK----VDKETNTETPAPSPTVVRPKDRRVGTPSQGPFLRGSTIIRSKTFSPGPQSQYVC
. :::::::. : . .::::.: . : ::.:.:.:.::.::::: ..::.:
CCDS34 TRIPTLVDKETNTDEAANDNMAVRPKERSSLSSRQHPFVRSSVIVRSQTFSPGERNQYIC
960 970 980 990 1000 1010
950 960 970 980 990
pF1KA0 RLNRSDSDSSTLSKKPPFVRNSLERRSVRMKRPSSVKSLR---SERLIRTSLDLELDLQA
::::::::::::.:: ::::: ::::.:.:: . :: .: .::::::::::::
CCDS34 RLNRSDSDSSTLAKKSLFVRNSTERRSLRVKRTVCQSVLRRTTQECPVRTSLDLELDLQA
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 TRTWHSQLTQEISVLKELKEQLEQAKSHGEKELPQWLREDERFRLLLRMLEKR-QMDRAE
. : .:.:..:...:..:...::. :..:: .:: . :::::. ::.. ::. .... :
CCDS34 SLTRQSRLNDELQALRDLRQKLEELKAQGETDLPPGVLEDERFQRLLKQAEKQAEQSKEE
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 HKGELQTDKMMRAAAKDVHRLRGQSCKEPPEVQSFREKMAFFTRPRMNIPALSADDV
.: :...:.::
CCDS34 QKQGLNAEKLMRQVSKDVCRLREQSQKVPRQVQSFREKIAYFTRAKISIPSLPADDV
1140 1150 1160 1170 1180 1190
>>CCDS14136.1 WWC3 gene_id:55841|Hs108|chrX (1092 aa)
initn: 2200 init1: 725 opt: 1362 Z-score: 971.3 bits: 191.5 E(32554): 8.8e-48
Smith-Waterman score: 2310; 41.8% identity (67.8% similar) in 1098 aa overlap (72-1095:1-1074)
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 TKPLTFADCISDELPLGWEEAYDPQVGDYFIDHNTKTTQIEDPRVQWRREQEHMLKDYLV
.:: .: ::::::: :::::::.:::.::.
CCDS14 MDHINKLTQIEDPREQWRREQERMLKEYLI
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 VAQEALSAQKEIYQVKQQRLELAQQEYQQLHAVWEHKLGSQVSLVSGSSSSSKYDPEILK
::::::.:.:::::.::::.::::.:::::: . : : .: :: :...::::. .:
CCDS14 VAQEALNAKKEIYQIKQQRFELAQEEYQQLHKMCEDDSRSYASSFSGYSTNTKYDPHQIK
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 AEIATAKSRVNKLKREMVHLQHELQFKERGFQTLKKIDKKMSDAQGSYKLDEAQAVLRET
::::. ..:...::::......:::.::.: .::..::.:::... :::::::::.. :
CCDS14 AEIASRRDRLSRLKRELTQMKQELQYKEKGVETLQEIDRKMSSTHTSYKLDEAQAIMSEL
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 KAIKKAITCGEKEKQDLIKSLAMLKDGFRTDRGSHSDLWSSSSSLE-SSSFPLPKQYLDV
..::::: ::::..::..::: : :.:... . ..: . . .. .:.:. :.
CCDS14 RTIKKAICTGEKERRDLMHSLAKLTDSFKNSCSVTDSLVDFPHHVGVPGDAGVPQQFCDA
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 SSQTDISGSFGINSNNQLAEKVRLRLRYEEAKRRIANLKIQLAKLDSEAWPGVLDSERDR
.::::: : : ......:...::: .::::..:.::.. :::.::.:.::.. ...:::
CCDS14 GSQTDIIGEFVFDDKTRLVDRVRLNWQYEEARKRVANIQQQLARLDNESWPSTAEADRDR
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 LILINEKEELLKEMRFISPRKWTQGEVEQLEMARKRLEKDLQAARDTQSKALTERLKLNS
: ::.::: ::.:...: .. . :.: .:: :.:::..:. :: :.... :::. :.
CCDS14 LQLIKEKEALLQELQLIIAQRRSAGDVARLEEERERLEEELRRARATSAQGATERILLQE
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 KRNQLVRELEEATRQVATLHSQLKSLSSSMQSLSSGSSPGSLTSSRGSLVASSLDSSTSA
::: :. .:::::: .. :.:::::: .: ..::::: :::.:::::: ::: : .:.
CCDS14 KRNCLLMQLEEATRLTSYLQSQLKSLCASTLTVSSGSSRGSLASSRGSL-ASSRGSLSSV
340 350 360 370 380
470 480 490 500 510
pF1KA0 SFTDLYYDP-FEQLDSELQSKVEFLLLEGATGFRPSGCITTIHEDEVAKTQKAEGGGRLQ
::::.: : .:. :.: .. ..: :. : . .. .: : .. : . ..
CCDS14 SFTDIYGLPQYEKPDAEGSQLLRFDLI-------P---FDSLGRD--APFSEPPGPSGFH
390 400 410 420 430
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 ALRSLSGTPKSMTSLSPRSSLSSPSPPCSPLMADPLLAG--DAFLNSLE--FEDPELSAT
: ::.:..::: :::::: ::: ::: :.: . :. : .: : : :.:
CCDS14 KQRRSLDTPQSLASLSSRSSLSSLSPPSSPL-DTPFLPASRDSPLAQLADSCEGPGLGA-
440 450 460 470 480 490
580 590 600 610
pF1KA0 LCELSLGNSAQERYRLEE---------PGT-EGKQ----------LGQAV----NTAQGC
: .: ::. : :: :: . .: .: ..:.
CCDS14 LDRLRAHASAMGDEDLPGMAALQPHGVPGDGEGPHERGPPPASAPVGGTVTLREDSAKRL
500 510 520 530 540 550
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 GLKVACVSAAVSDESVAGDSGVYEASVQRLGASEAAAFDSDESEAVGATRIQIALKYDEK
.. .:: .:: :.:.::::.: ..: .: :. . :. : .:...: :
CCDS14 ERRARRISACLSDYSLASDSGVFEPLTKRNEDAEEPAYGDTASN--GDPQIHVGLLRDSG
560 570 580 590 600 610
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 NKQFAILIIQLSNLSALLQQQDQKVNIRVAVLPCSESTTCLFRTRPLDASDTLVFNEVFW
.. . . ..::.: ..: ..: ::.::: . : . .: . .. :. . :::::::
CCDS14 SECLLVHVLQLKNPAGLAVKEDCKVHIRVYLPPLDSGTPNTYCSKALEFQVPLVFNEVFR
620 630 640 650 660 670
740 750 760 770 780 790
pF1KA0 VSMSYPALHQKTLRVDVCTTDRSHLEECLGGAQISLAEVCRSGERSTRWYNLLSYKYLK-
. . :: :.:.. ::.. . :: :: :::.::. .: . ::... . .
CCDS14 IPVHSSALTLKSLQLYVCSVTPQLQEELLGIAQINLADYDSLSEMQLRWHSVQVFTSSEP
680 690 700 710 720 730
800 810 820 830
pF1KA0 KQSRELKPVGVMAPASGPA-------STDAVSALLEQT-----AVELEKRQEGRSSTQTL
...:: .: . : :: .::::..:: .: ::: : .: . :
CCDS14 SRTREAGCAG-ESSARDPAHTISISGKTDAVTVLLARTTAQLQAVERELAEERAKLEYTE
740 750 760 770 780 790
840 850 860 870 880
pF1KA0 EDSWRYEETSEN-EAVAEEEEEEVEEEEGEEDV------FTEKASPDMD---GYP-----
:. ..:. :. ::..:. . . : . . : .: :.:
CCDS14 EEVLEMERKEEQAEAISERSWQADSVDSGCSNCTQTSPPYPEPCCMGIDSILGHPFAAQA
800 810 820 830 840 850
890 900 910 920
pF1KA0 -----------ALKVDKETNTET----PAPSPTVVRPKDRRVGTPSQGPFLRGSTIIRSK
:::::::::: : : . ::. : :.: :.:..::.::.
CCDS14 GPYSPEKFQPSPLKVDKETNTEDLFLEEAASLVKERPSRRARGSP----FVRSGTIVRSQ
860 870 880 890 900
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 TFSPGPQSQYVCRLNRSDSDSSTLSKKPPFVRNSLERRSVRMKRPSSVKSLRSERLIRTS
::::: .::::::: ::::::::: .: :::::.::::..:.:. : .: .: . :::
CCDS14 TFSPGARSQYVCRLYRSDSDSSTLPRKSPFVRNTLERRTLRYKQ--SCRSSLAELMARTS
910 920 930 940 950 960
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 LDLELDLQATRTWHSQLTQEISVLKELKEQLEQAKSHGEKELPQWLREDERFRLLLRMLE
:::::::::.:: . ::..:. .:.::...::.:. .:. .:: :. .:::.: ::: :
CCDS14 LDLELDLQASRTRQRQLNEELCALRELRQRLEDAQLRGQTDLPPWVLRDERLRGLLREAE
970 980 990 1000 1010 1020
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA0 KR-QMDRAEHKGELQTDKMMRAAAKDVHRLRGQSCKEPPEVQSFREKMAFFTRPRMNIPA
.. .. . ... : ..::.. :.:....::::: ::: .::.::::.
CCDS14 RQTRQTKLDYRHEQAAEKMLKKASKEIYQLRGQSHKEPIQVQTFREKIAFFTRPRINIPP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1110
pF1KA0 LSADDV
CCDS14 LPADDV
1090
1113 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 09:17:20 2016 done: Sat Nov 5 09:17:21 2016
Total Scan time: 5.450 Total Display time: 0.230
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]