Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0890
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0890, 1194 aa
1>>>pF1KA0890 1194 - 1194 aa - 1194 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5698+/-0.000906; mu= 16.6981+/- 0.055
mean_var=94.1413+/-18.911, 0's: 0 Z-trim(108.6): 28 B-trim: 130 in 1/50
Lambda= 0.132186
statistics sampled from 10263 (10287) to 10263 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.667), E-opt: 0.2 (0.316), width: 16
Scan time: 5.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2759.1 DHX30 gene_id:22907|Hs108|chr3 (1194) 7918 1520.9 0
CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (1008) 985 198.7 6.1e-50
CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5 (1430) 919 186.2 5e-46
CCDS34158.1 DHX29 gene_id:54505|Hs108|chr5 (1369) 861 175.1 1e-42
CCDS11617.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 ( 779) 812 165.6 4.1e-40
CCDS41444.1 DHX9 gene_id:1660|Hs108|chr1 (1270) 732 150.5 2.5e-35
CCDS54657.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 ( 994) 695 143.4 2.7e-33
CCDS54463.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 ( 672) 692 142.7 2.8e-33
CCDS13310.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 ( 703) 677 139.9 2.1e-32
CCDS1800.1 DHX57 gene_id:90957|Hs108|chr2 (1386) 657 136.2 5.4e-31
CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19 (1143) 612 127.6 1.7e-28
CCDS54150.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 ( 702) 594 124.1 1.2e-27
CCDS77040.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1181) 558 117.3 2.3e-25
CCDS11464.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1220) 558 117.3 2.3e-25
CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6 (1041) 507 107.5 1.7e-22
CCDS11072.1 DHX33 gene_id:56919|Hs108|chr17 ( 707) 502 106.5 2.4e-22
CCDS10907.1 DHX38 gene_id:9785|Hs108|chr16 (1227) 496 105.5 8.5e-22
CCDS33966.1 DHX15 gene_id:1665|Hs108|chr4 ( 795) 456 97.8 1.2e-19
CCDS9987.2 TDRD9 gene_id:122402|Hs108|chr14 (1382) 408 88.7 1.1e-16
CCDS7652.1 DHX32 gene_id:55760|Hs108|chr10 ( 743) 357 78.9 5.2e-14
CCDS9261.1 DHX37 gene_id:57647|Hs108|chr12 (1157) 349 77.4 2.2e-13
CCDS1949.2 DQX1 gene_id:165545|Hs108|chr2 ( 717) 313 70.5 1.7e-11
>>CCDS2759.1 DHX30 gene_id:22907|Hs108|chr3 (1194 aa)
initn: 7918 init1: 7918 opt: 7918 Z-score: 8154.5 bits: 1520.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7918; 100.0% identity (100.0% similar) in 1194 aa overlap (1-1194:1-1194)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MFSLDSFRKDRAQHRQRQCKLPPPRLPPMCVNPTPGGTISRASRDLLKEFPQPKNLLNSV
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CCDS27 MFSLDSFRKDRAQHRQRQCKLPPPRLPPMCVNPTPGGTISRASRDLLKEFPQPKNLLNSV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 IGRALGISHAKDKLVYVHTNGPKKKKVTLHIKWPKSVEVEGYGSKKIDAERQAAAAACQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 IGRALGISHAKDKLVYVHTNGPKKKKVTLHIKWPKSVEVEGYGSKKIDAERQAAAAACQL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 FKGWGLLGPRNELFDAAKYRVLADRFGSPADSWWRPEPTMPPTSWRQLNPESIRPGGPGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 FKGWGLLGPRNELFDAAKYRVLADRFGSPADSWWRPEPTMPPTSWRQLNPESIRPGGPGG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LSRSLGREEEEDEEEELEEGTIDVTDFLSMTQQDSHAPLRDSRGSSFEMTDDDSAIRALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LSRSLGREEEEDEEEELEEGTIDVTDFLSMTQQDSHAPLRDSRGSSFEMTDDDSAIRALT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 QFPLPKNLLAKVIQIATSSSTAKNLMQFHTVGTKTKLSTLTLLWPCPMTFVAKGRRKAEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 QFPLPKNLLAKVIQIATSSSTAKNLMQFHTVGTKTKLSTLTLLWPCPMTFVAKGRRKAEA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ENKAAALACKKLKSLGLVDRNNEPLTHAMYNLASLRELGETQRRPCTIQVPEPILRKIET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ENKAAALACKKLKSLGLVDRNNEPLTHAMYNLASLRELGETQRRPCTIQVPEPILRKIET
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 FLNHYPVESSWIAPELRLQSDDILPLGKDSGPLSDPITGKPYVPLLEAEEVRLSQSLLEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 FLNHYPVESSWIAPELRLQSDDILPLGKDSGPLSDPITGKPYVPLLEAEEVRLSQSLLEL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 WRRRGPVWQEAPQLPVDPHRDTILNAIEQHPVVVISGDTGCGKTTRIPQLLLERYVTEGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 WRRRGPVWQEAPQLPVDPHRDTILNAIEQHPVVVISGDTGCGKTTRIPQLLLERYVTEGR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 GARCNVIITQPRRISAVSVAQRVSHELGPSLRRNVGFQVRLESKPPSRGGALLFCTVGIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 GARCNVIITQPRRISAVSVAQRVSHELGPSLRRNVGFQVRLESKPPSRGGALLFCTVGIL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 LRKLQSNPSLEGVSHVIVDEVHERDVNTDFLLILLKGLQRLNPALRLVLMSATGDNERFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LRKLQSNPSLEGVSHVIVDEVHERDVNTDFLLILLKGLQRLNPALRLVLMSATGDNERFS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 RYFGGCPVIKVPGFMYPVKEHYLEDILAKLGKHQYLHRHRHHESEDECALDLDLVTDLVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 RYFGGCPVIKVPGFMYPVKEHYLEDILAKLGKHQYLHRHRHHESEDECALDLDLVTDLVL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 HIDARGEPGGILCFLPGWQEIKGVQQRLQEALGMHESKYLILPVHSNIPMMDQKAIFQQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 HIDARGEPGGILCFLPGWQEIKGVQQRLQEALGMHESKYLILPVHSNIPMMDQKAIFQQP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 PVGVRKIVLATNIAETSITINDIVHVVDSGLHKEERYDLKTKVSCLETVWVSRANVIQRR
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CCDS27 PVGVRKIVLATNIAETSITINDIVHVVDSGLHKEERYDLKTKVSCLETVWVSRANVIQRR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 GRAGRCQSGFAYHLFPRSRLEKMVPFQVPEILRTPLENLVLQAKIHMPEKTAVEFLSKAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 GRAGRCQSGFAYHLFPRSRLEKMVPFQVPEILRTPLENLVLQAKIHMPEKTAVEFLSKAV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 DSPNIKAVDEAVILLQEIGVLDQREYLTTLGQRLAHISTDPRLAKAIVLAAIFRCLHPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 DSPNIKAVDEAVILLQEIGVLDQREYLTTLGQRLAHISTDPRLAKAIVLAAIFRCLHPLL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 VVVSCLTRDPFSSSLQNRAEVDKVKALLSHDSGSDHLAFVRAVAGWEEVLRWQDRSSREN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 VVVSCLTRDPFSSSLQNRAEVDKVKALLSHDSGSDHLAFVRAVAGWEEVLRWQDRSSREN
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 YLEENLLYAPSLRFIHGLIKQFSENIYEAFLVGKPSDCTLASAQCNEYSEEEELVKGVLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 YLEENLLYAPSLRFIHGLIKQFSENIYEAFLVGKPSDCTLASAQCNEYSEEEELVKGVLM
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 AGLYPNLIQVRQGKVTRQGKFKPNSVTYRTKSGNILLHKSTINREATRLRSRWLTYFMAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 AGLYPNLIQVRQGKVTRQGKFKPNSVTYRTKSGNILLHKSTINREATRLRSRWLTYFMAV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 KSNGSVFVRDSSQVHPLAVLLLTDGDVHIRDDGRRATISLSDSDLLRLEGDSRTVRLLKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 KSNGSVFVRDSSQVHPLAVLLLTDGDVHIRDDGRRATISLSDSDLLRLEGDSRTVRLLKE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 LRRALGRMVERSLRSELAALPPSVQEEHGQLLALLAELLRGPCGSFDVRKTADD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LRRALGRMVERSLRSELAALPPSVQEEHGQLLALLAELLRGPCGSFDVRKTADD
1150 1160 1170 1180 1190
>>CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (1008 aa)
initn: 1434 init1: 593 opt: 985 Z-score: 1010.1 bits: 198.7 E(32554): 6.1e-50
Smith-Waterman score: 1679; 36.5% identity (67.3% similar) in 799 aa overlap (413-1155:180-963)
390 400 410 420 430
pF1KA0 ILPLGKDSGPLSDPITGKPYVPLLEAEEVRLSQSLLE-LWRRRGPV-----WQEAPQLPV
:.:.::: : .... . . .::
CCDS31 QEKKMFRIRNRSYIDRDSEYLLQENEPDGTLDQKLLEDLQKKKNDLRYIEMQHFREKLPS
150 160 170 180 190 200
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 DPHRDTILNAIEQHPVVVISGDTGCGKTTRIPQLLLERYVTEGRGARCNVIITQPRRISA
. ..: :..: :.::::.:::::::.. :..:. :. .:.:. : .. ::::::::
CCDS31 YGMQKELVNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYIERGKGSACRIVCTQPRRISA
210 220 230 240 250 260
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 VSVAQRVSHELGPSLRR--NVGFQVRLESKPPSRGGALLFCTVGILLRKLQSNPSLEGVS
.:::.::. : . : ..:.:.::.:. : . :..:.::.::.:. :::.: : .::
CCDS31 ISVAERVAAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRKQGSILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVS
270 280 290 300 310 320
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 HVIVDEVHERDVNTDFLLILLKGLQRLNPALRLVLMSATGDNERFSRYFGGCPVIKVPGF
:...::.:::....: :. ..: : . :...::::: . :.::.:::.::.:..:::
CCDS31 HIVLDEIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGF
330 340 350 360 370 380
620 630 640 650
pF1KA0 MYPVKEHYLEDILAKLG--KHQYLHRHR--------H---HESEDECAL-----------
.:: :. :::.. :. .: :: . : .:.:.. :.
CCDS31 TFPVVEYLLEDVIEKIRYVPEQKEHRSQFKRGFMQGHVNRQEKEEKEAIYKERWPDYVRE
390 400 410 420 430 440
660 670 680
pF1KA0 ---------------------DLDLVTDLVLHIDARGEPGGILCFLPGWQEIKGVQQRLQ
::.:.. :. .: . : :.:: :::::..:. ... :.
CCDS31 LRRRYSASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEEEDGAILVFLPGWDNISTLHDLLM
450 460 470 480 490 500
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 EALGMHESKYLILPVHSNIPMMDQKAIFQQPPVGVRKIVLATNIAETSITINDIVHVVDS
. .. .:.::.:.:: .: ..: .:.. : ::::::.:::::::::::.:.:.:.:.
CCDS31 SQVMFKSDKFLIIPLHSLMPTVNQTQVFKRTPPGVRKIVIATNIAETSITIDDVVYVIDG
510 520 530 540 550 560
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 GLHKEERYDLKTKVSCLETVWVSRANVIQRRGRAGRCQSGFAYHLFPRSRLEKMVPFQVP
: :: ..: ....: . . :::.::. ::.::::: : : :::. : . .:.:
CCDS31 GKIKETHFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGHCYHLYNGLRASLLDDYQLP
570 580 590 600 610 620
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 EILRTPLENLVLQAKIHMPEKTAVEFLSKAVDSPNIKAVDEAVILLQEIGVLDQREYLTT
::::::::.: :: :: . . :::. .: :. .:: .. :.:...::..: ::
CCDS31 EILRTPLEELCLQIKI-LRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLSIRHLMELNALDKQEELTP
630 640 650 660 670 680
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 LGQRLAHISTDPRLAKAIVLAAIFRCLHPLLVVVSCLT-RDPFSSSLQNRAEVDKVKALL
:: .::.. ..:...: :...:.: :: :.:.... :. .::: : .. .: . :
CCDS31 LGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDPFVIPLGKEKIADARRKEL
690 700 710 720 730 740
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 SHDSGSDHLAFVRAVAGWEEVLRWQDRSSRENYLEENLLYAPSLRFIHGLIKQFSENIYE
..:. ::::. : : ::::. : : .. : : .: . .:...:.. ::.:..
CCDS31 AKDTRSDHLTVVNAFEGWEEARRRGFRYEKD-YCWEYFLSSNTLQMLHNMKGQFAEHLLG
750 760 770 780 790 800
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 AFLVGK--PSDCTLASAQCNEYSEEEELVKGVLMAGLYPNLIQVRQGKVTRQGKFKPNSV
: .:.. :.: . : :..:...:.:. :::::.. ..: . :: .
CCDS31 AGFVSSRNPKD-----PESNINSDNEKIIKAVICAGLYPKVAKIRLN----LGKKRKMVK
810 820 830 840 850
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA0 TYRTKSGNILLHKSTINREATRLRSRWLTYFMAVKSNGSVFVRDSSQVHPLAVLLLTDGD
.: .: . .: ...: : : .. :: : . .... :... : ..: : ::. ::
CCDS31 VYTKTDGLVAVHPKSVNVEQTDFHYNWLIYHLKMRTS-SIYLYDCTEVSPYC-LLFFGGD
860 870 880 890 900 910
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA0 VHIRDDGRRATISLSDSDLLRLEGDSRTVRLLKELRRALGRMVERSLRSELAALPPSVQE
. :. :. . ::.... . ... .: ..:.::::. : .......:
CCDS31 ISIQKDNDQETIAVDE--WIVFQSPARIAHLVKELRKELDILLQEKIESPHPVDWNDTKS
920 930 940 950 960 970
1170 1180 1190
pF1KA0 EHGQLLALLAELLRGPCGSFDVRKTADD
CCDS31 RDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS
980 990 1000
>>CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5 (1430 aa)
initn: 1198 init1: 480 opt: 919 Z-score: 939.7 bits: 186.2 E(32554): 5e-46
Smith-Waterman score: 1106; 27.9% identity (53.0% similar) in 1044 aa overlap (313-1130:83-1084)
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 LWPCPMTFVAKGRRKAEAENKAAALACKKLKSLGLVDRNNEPLTHAMYNLASLRELGETQ
.:::::.... .. : .. .. .::
CCDS41 LERFRYGDQREMEFPSSLTSTERAFIHRLSQSLGLVSKSKGKGANR-YLTVKKKDGSETA
60 70 80 90 100 110
350 360 370 380 390
pF1KA0 RRPCTIQVPEPILRKIETFLNHYPV---ESSWIAPELR------LQSDDILPLGKDSGPL
. : .. . . ........:: : . . :. . ..... ..: :: :
CCDS41 HAMMTCNLTHNTKHAVRSLIQRFPVTNKERTELLPKTERGNVFAVEAEN-REMSKTSGRL
120 130 140 150 160 170
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 SDPITGKPYVPLLEAEEVRLSQSLLELWRRRGPVWQEAPQLPVDPHRDTILNAIEQHPVV
.. : : .: :. ..: .. .:. ::... .. :.. :... ::
CCDS41 NN---GIPQIP------VKRGESEFDSFRQSLPVFEK---------QEEIVKIIKENKVV
180 190 200 210
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 VISGDTGCGKTTRIPQLLLERYVTEGRGARCNVIITQPRRISAVSVAQRVSHELGPSLRR
.: :.:: ::::.:::.::. . : : .. :::::..:..::.::. : . .
CCDS41 LIVGETGSGKTTQIPQFLLDDCFKN--GIPCRIFCTQPRRLAAIAVAERVAAERRERIGQ
220 230 240 250 260 270
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 NVGFQVRLESKPPSRGGALLFCTVGILLRKLQSNPS-LEGVSHVIVDEVHERDVNTDFLL
..:.:.::::. . : ::: :.::: :... : : :.::::::::::: .::::
CCDS41 TIGYQIRLESRVSPKT-LLTFCTNGVLLRTLMAGDSTLSTVTHVIVDEVHERDRFSDFLL
280 290 300 310 320
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 ILLKGLQRLNPALRLVLMSATGDNERFSRYFGGCPVIKVPGFMYPVKEHYLEDILAKLG-
:. : . .:.:.:.: ::. : . : ::::.:::: . : . ::: .::::: :
CCDS41 TKLRDLLQKHPTLKLILSSAALDVNLFIRYFGSCPVIYIQGRPFEVKEMFLEDILRTTGY
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 -----------KHQ----------------------------------------------
:.:
CCDS41 TNKEMLKYKKEKQQEEKQQTTLTEWYSAQENSFKPESQRQRTVLNVTDEYDLLDDGGDAV
390 400 410 420 430 440
640
pF1KA0 ---------------------------YLHR--------------------HRH------
.::. .::
CCDS41 FSQLTEKDVNCLEPWLIKEMDACLSDIWLHKDIDAFAQVFHLILTENVSVDYRHSETSAT
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 ------------------------------------------------------------
CCDS41 ALMVAAGRGFASQVEQLISMGANVHSKASNGWMALDWAKHFGQTEIVDLLESYSATLEFG
510 520 530 540 550 560
650 660 670
pF1KA0 --------------------------HESEDECALDLDLVTDLVLHIDARGEPGGILCFL
:.: :. .::::. :. .: . :..: ::
CCDS41 NLDESSLVQTNGSDLSAEDRELLKAYHHSFDDEKVDLDLIMHLLYNICHSCDAGAVLIFL
570 580 590 600 610 620
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 PGWQEIKGVQQRL---QEALGMHESKYLILPVHSNIPMMDQKAIFQQPPVGVRKIVLATN
::..:: :...:. .. .. .: .. .:::. ::: ....::.:::::.:.::
CCDS41 PGYDEIVGLRDRILFDDKRFADSTHRYQVFMLHSNMQTSDQKKVLKNPPAGVRKIILSTN
630 640 650 660 670 680
740 750 760 770 780 790
pF1KA0 IAETSITINDIVHVVDSGLHKEERYDLKTKVSCLETVWVSRANVIQRRGRAGRCQSGFAY
:::::::.::.: :.::: ::. .: . :. :. ::.:.:..:::.::::::. :. .
CCDS41 IAETSITVNDVVFVIDSGKVKEKSFDALNFVTMLKMVWISKASAIQRKGRAGRCRPGICF
690 700 710 720 730 740
800 810 820 830 840 850
pF1KA0 HLFPRSRLEKMVPFQVPEILRTPLENLVLQAKIHMPEKTAV-EFLSKAVDSPNIKAVDEA
.:: : :...:. ::.::.:: ::..: :..:. : . . .:: :: . : : .:
CCDS41 RLFSRLRFQNMLEFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPVNCPIADFLMKAPEPPPALIVRNA
750 760 770 780 790 800
860 870 880 890 900 910
pF1KA0 VILLQEIGVLDQREYLTTLGQRLAHISTDPRLAKAIVLAAIFRCLHPLLVVVSCLT-RDP
: .:. : ..: : :: :: .:: . ..:.:.: .. :....:: :.:... :. :::
CCDS41 VQMLKTIDAMDTWEDLTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDP
810 820 830 840 850 860
920 930 940 950 960
pF1KA0 F---SSSLQNRAEVDKVKALLSHDSGSDHLAFVRAVAGWEEVLR--WQDRSSRENYLEEN
: ... :.:: . . .. . :::.:..:: .:... :. . . :.:
CCDS41 FVLPTQASQKRAAM-LCRKRFTAGAFSDHMALLRAFQAWQKARSDGWE-----RAFCEKN
870 880 890 900 910 920
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pF1KA0 LLYAPSLRFIHGLIKQFSENIYEAFLVGKPSDCTLASAQCNEYSEEEELVKGVLMAGLYP
.: ....: :. :. .. . .: . . ... : ::. .::..:.::.::
CCDS41 FLSQATMEIIIGMRTQLLGQLRASGFVRARGGGDIRDVNTN--SENWAVVKAALVAGMYP
930 940 950 960 970 980
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 NLIQVRQ------GKVTRQGKFKPNSVTYRTKSGNILLHKSTINREATRLR---SRWLTY
::..: . : .. .:.: :: . . .: : .:. .. . :: :
CCDS41 NLVHVDRENLVLTGPKEKKVRFHPASVLSQPQYKKI----PPANGQAAAIKALPTDWLIY
990 1000 1010 1020 1030
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 FMAVKSNGSVFVRDSSQVHPLAVLLLTDGDVHIRDDGRRATISLSDSDLLRLEGDSRTVR
.... . .: : : :...:.. .: :. .:.. . .:..:
CCDS41 DEMTRAHRIANIRCCSAVTPVTILVFCG-------PARLASNALQEPSSFRVDGIPNDSS
1040 1050 1060 1070 1080 1090
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pF1KA0 LLKELRRALGRMVERSLRSELAALPPSVQEEHGQLLALLAELLRGPCGSFDVRKTADD
CCDS41 DSEMEDKTTANLAALKLDEWLHFTLEPEAASLLLQLRQKWHSLFLRRMRAPSKPWSQVDE
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pF1KA0 EAPQLPVDPHRDTILNAIEQHPVVVISGDTGCGKTTRIPQLLLERYV-TEGRGARCNVII
: :::: :::.:......: :::..:.:: ::.:..:..::: . .: ....::..
CCDS34 ERQQLPVFKHRDSIVETLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLEDLLLNEWEASKCNIVC
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::::::::::.:.:: ::: :. : .. :.:.:.::. .. ::.::.:.::::
CCDS34 TQPRRISAVSLANRVCDELGCENGPGGRNSLCGYQIRMESRA-CESTRLLYCTTGVLLRK
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:: . : .::::::::::::.:..:::::.:: . . :.:.::::: :.:.:: ::
CCDS34 LQEDGLLSNVSHVIVDEVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYF
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pF1KA0 GGCPVIKVPGFMYPVKEHYLEDILAKLG--------------------------------
::.... : :::. .::::. . :
CCDS34 THCPILRISGRSYPVEVFHLEDIIEETGFVLEKDSEYCQKFLEEEEEVTINVTSKAGGIK
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:.: :. : .... :. . :. .:::. .:. ..: :.
CCDS34 KYQEYIPVQTGAHADLNPFYQKYSSRTQHAILYMNPHKINLDLILELLAYLDKSPQFRNI
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pF1KA0 PGGILCFLPGWQEIKGVQQRLQEALGMHESKYLILPVHSNIPMMDQKAIFQQPPVGVRKI
:..: :::: .:. . . :.. .. .: .. .:: . .:: : : :: :::::
CCDS34 EGAVLIFLPGLAHIQQLYDLLSNDRRFYSERYKVIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKI
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pF1KA0 VLATNIAETSITINDIVHVVDSGLHKEERYDLKTKVSCLETVWVSRANVIQRRGRAGRCQ
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CCDS34 VLATNIAETGITIPDVVFVIDTGRTKENKYHESSQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVR
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pF1KA0 SGFAYHLFPRSRLEKMVPFQVPEILRTPLENL---VLQAKIHMPEKTAVEFLSKAVDSPN
.:: .... : :.: .. ..::::::.:::.: ... .. :: .:::::.: :.
CCDS34 DGFCFRMYTRERFEGFMDYSVPEILRVPLEELCLHIMKCNLGSPE----DFLSKALDPPQ
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pF1KA0 IKAVDEAVILLQEIGVLDQRE-YLTTLGQRLAHISTDPRLAKAIVLAAIFRCLHPLLVVV
......:. ::..::. . : :: :::.:: . .. ...: ....::: :: :. ...
CCDS34 LQVISNAMNLLRKIGACELNEPKLTPLGQHLAALPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLA
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pF1KA0 SCLT-RDPFSSSLQNRAEVDKVKALLSHDSGSDHLAFVRAVAGWEEVLRWQDRSSRENYL
. .: ..::.. . . :.: .:. :. . ::::.. : ::... . :. .:
CCDS34 AVMTEKSPFTTPIGRKDEADLAKSALAM-ADSDHLTIYNAYLGWKKARQEGGYRSEITYC
1110 1120 1130 1140 1150 1160
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pF1KA0 EENLLYAPSLRFIHGLIKQFSENIYEAFLVGKPSDCTLASAQCNEYSE-----EEELVKG
..:.: :: .. .:: .. .: .: :. : .: . :. :. : :.:.
CCDS34 RRNFLNRTSLLTLED-VKQELIKLVKA--AGFSSSTTSTSWEGNRASQTLSFQEIALLKA
1170 1180 1190 1200 1210
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pF1KA0 VLMAGLYPNLIQVRQGK-VTRQGKFKPNSVTYRTKSGNILLHKSTINREATRLRSR-WLT
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CCDS34 VLVAGLYDNVGKIIYTKSVDVTEKL---ACIVETAQGKAQVHPSSVNRD---LQTHGWLL
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pF1KA0 YFMAVKSNGSVFVRDSSQVHPLAVLLLTDGDVHIRDDGRRATISLSDSDLLRLEGDSRTV
: .. . :..:... . :. :::. ::.... : :: . . ... . .
CCDS34 YQEKIRY-ARVYLRETTLITPFPVLLF-GGDIEVQHRERL----LSIDGWIYFQAPVKIA
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pF1KA0 RLLKELRRALGRMVERSLRSELAALPPSVQEEHGQLLALLAELLRGPCGSFDVRKTADD
..:.:: ... ::..: :... :. ..: ...::..
CCDS34 VIFKQLRV----LIDSVLRKKLEN--PKMSLENDKILQIITELIKTENN
1330 1340 1350 1360
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CCDS11 IQKQRKKIIQAVRDNSFLIVTGNTGSGKTTQLPKYLYE----AGFSQHGMIGVTQPRKVA
60 70 80 90 100 110
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CCDS11 AISVAQRVAEEMKCTLGSKVGYQVRFDDCS-SKETAIKYMTDGCLLKHILGDPNLTKFSV
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.:.::.::: ..::.:. ::: : :. .: :..:.:::: . ..: .::.::..
CCDS11 IILDEAHERTLTTDILFGLLKKLFQEKSPNRKEHLKVVVMSATMELAKLSAFFGNCPIFD
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.:: .:::.:.. . : : : : : . .. .. ... : :
CCDS11 IPGRLYPVREKFCNLI----GP-----RDR------ENTAYIQAIVKVTMDIHLNEMAGD
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:: :: : :: :. . .: : .. . :::: .... .:. :: :
CCDS11 ILVFLTGQFEIEKSCELLFQMAESVDYDYDVQDTTLDGLLILPCYGSMTTDQQRRIFLPP
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: :.:: :..:::. ::.::. : .:::.:. :. .. . .. ::.: .:.....::
CCDS11 PPGIRKCVISTNISATSLTIDGIRYVVDGGFVKQLNHNPRLGLDILEVVPISKSEALQRS
340 350 360 370 380 390
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::::: .:: .... .. .. .: .: ::: :: : ..:: : . . ...:
CCDS11 GRAGRTSSGKCFRIYSKDFWNQCMPDHVIPEIKRTSLTSVVLTLKC-LAIHDVIRF--PY
400 410 420 430 440 450
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.: :: . . ::. : . ..:. ..: :: .... :.:. :.. :: . : :
CCDS11 LDPPNERLILEALKQLYQCDAIDRSGHVTRLGLSMVEFPLPPHLTCAVIKAASLDCEDLL
460 470 480 490 500 510
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pF1KA0 LVVVSCLTRD-----PFSSSLQNRAEVDKVKALLSHDSGSDHLAFVRAVAGWEEVLRWQD
: ... :. . : . :..:: .. . : .. .: . .: . .. .:. ..
CCDS11 LPIAAMLSVENVFIRPVDPEYQKEAE-QRHRELAAKAGGFNDFATLAVI--FEQC---KS
520 530 540 550 560
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pF1KA0 RSSRENYLEENLLYAPSLRFIHGLIKQFSENIYEAFLVGKPSDCTLASAQCNEYSEEEEL
.. .. ... .. : . :. : : . . . :: . . . ..:.
CCDS11 SGAPASWCQKHWIHWRCLFSAFRVEAQLRELIRK---LKQQSDFPKETFE----GPKHEV
570 580 590 600 610
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pF1KA0 VKGVLMAGLYPNLIQVRQGKV--TRQGK-----FKPNSVTYR--TKSGNILLHKSTINRE
.. : :: . :. . :.. : .:. ..:.:. .. :: :..:. .
CCDS11 LRRCLCAGYFKNVARRSVGRTFCTMDGRGSPVHIHPSSALHEQETKLEWIIFHEVLV---
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pF1KA0 ATRLRSRWLTYFMAVKSNGSVFVRDS-SQVHPLAVLLLTD-GDVHIRDDGRRATISLSDS
.:.. .: . .. . .::: ..: . . :.. . ..:.:.:: . .
CCDS11 TTKVYARIVC---PIRYE---WVRDLLPKLHEFNAHDLSSVARREVREDARRRWTNKENV
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CCDS11 KQLK-DGISKDV--LKKMQRRNDDKSISDARARFLERKQQRTQDHSDTRKETG
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pF1KA0 ITGKPYVPLLEAEEVRLSQSLLELWRRRGPVWQEAPQLPVDPHRDTILNAIEQHPVVVIS
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CCDS41 PLAFATPEQISMDLKNELMYQLEQDHDLQAILQERELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIR
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pF1KA0 GDTGCGKTTRIPQLLLERYVTEGRGARCNVIITQPRRISAVSVAQRVSHELGPSLRRNVG
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CCDS41 GATGCGKTTQVPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCG
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CCDS41 YSVRFESILPRPHASIMFCTVGVLLRKLEAG--IRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLR
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CCDS41 DVVQAYPEVRIVLMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPP
530 540 550 560 570 580
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pF1KA0 -GKHQYLHRHRHHESED-ECAL----------------------DLDLVTDLVLHIDARG
:.. . :..: .: : ..:. :. .:.. .
CCDS41 KDKKKKDKDDDGGEDDDANCNLICGDEYGPETRLSMSQLNEKETPFELIEALLKYIETLN
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CCDS41 VPGAVLVFLPGWNLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTK
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..:.::::::::::::.:.:.:: .: . . ..... :::.:..:. ::.:::::
CCDS41 VILSTNIAETSITINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRV
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. :: .:: :.:.:.. ..::..::::....:. :. . .::.::.. : .
CCDS41 RPGFCFHLCSRARFERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKL-LRLGGIGQFLAKAIEPPPLD
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pF1KA0 AVDEAVILLQEIGVLDQREYLTTLGQRLAHISTDPRLAKAIVLAAIFRCLHPLLVVV--S
:: :: :.:. .:: . :: ::. ::.. .::..: .... :: . ... .
CCDS41 AVIEAEHTLRELDALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAAT
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pF1KA0 CLTRDPFSSSLQNRAEVDKVKALLSHDSGSDHLAFVRAVAGWEEVLRWQDRSSRENYLEE
:. .:: ... .. .. .. . :::.:.. . .:... : . .. . :.
CCDS41 CFP-EPF---INEGKRLGYIHRNFAGNRFSDHVALLSVFQAWDDA-RMGGEEAEIRFCEH
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. : .::. :..: . .. : : :: :... : ... ..: ..: :.
CCDS41 KRLNMATLRMTWEAKVQLKEILINS---GFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGV
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:::. .. . .: .:. : :.:::..: . . : ....
CCDS41 YPNVCYHKEKRKILTTEGR-------------NALIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFG
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pF1KA0 MAVKSNGSVFVRDSSQVHPLAVLLLTDGDVHIRDDGRRATISLSDSDLLRLEGDSRTVRL
... .. .. . : :: .::... :. .::. : : : : ..:. . ...
CCDS41 EKIRTR-AISAKGMTLVTPLQLLLFASKKVQ--SDGQ---IVLVD-DWIKLQISHEAAAC
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. :: :. .:
CCDS41 ITGLRAAMEALVVEVTKQPAIISQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGSTRYGDGP
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390 400 410 420 430
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:.:.::: : .... . . .::
CCDS54 QEKKMFRIRNRSYIDRDSEYLLQENEPDGTLDQKLLEDLQKKKNDLRYIEMQHFREKLPS
150 160 170 180 190 200
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 DPHRDTILNAIEQHPVVVISGDTGCGKTTRIPQLLLERYVTEGRGARCNVIITQPRRISA
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CCDS54 YGMQKELVNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYIERGKGSACRIVCTQPRRISA
210 220 230 240 250 260
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 VSVAQRVSHELGPSLRR--NVGFQVRLESKPPSRGGALLFCTVGILLRKLQSNPSLEGVS
.:::.::. : . : ..:.:.::.:. : . :..:.::.::.:. :::.: : .::
CCDS54 ISVAERVAAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRKQGSILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVS
270 280 290 300 310 320
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 HVIVDEVHERDVNTDFLLILLKGLQRLNPALRLVLMSATGDNERFSRYFGGCPVIKVPGF
:...::.:::....: :. ..: : . :...::::: . :.::.:::.::.:..:::
CCDS54 HIVLDEIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGF
330 340 350 360 370 380
620 630 640 650
pF1KA0 MYPVKEHYLEDILAKLG--KHQYLHRHR--------H---HESEDECAL-----------
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CCDS54 TFPVVEYLLEDVIEKIRYVPEQKEHRSQFKRGFMQGHVNRQEKEEKEAIYKERWPDYVRE
390 400 410 420 430 440
660 670 680
pF1KA0 ---------------------DLDLVTDLVLHIDARGEPGGILCFLPGWQEIKGVQQRLQ
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CCDS54 LRRRYSASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEEEDGAILVFLPGWDNISTLHDLLM
450 460 470 480 490 500
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pF1KA0 EALGMHESKYLILPVHSNIPMMDQKAIFQQPPVGVRKIVLATNIAETSITINDIVHVVDS
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CCDS54 SQV-MFKS-------------VNQTQVFKRTPPGVRKIVIATNIAETSITIDDVVYVIDG
510 520 530 540 550
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 GLHKEERYDLKTKVSCLETVWVSRANVIQRRGRAGRCQSGFAYHLFPRSRLEKMVPFQVP
: :: ..: ....: . . :::.::. ::.::::: : : :::. : . .:.:
CCDS54 GKIKETHFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGHCYHLYNGLRASLLDDYQLP
560 570 580 590 600 610
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 EILRTPLENLVLQAKIHMPEKTAVEFLSKAVDSPNIKAVDEAVILLQEIGVLDQREYLTT
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CCDS54 EILRTPLEELCLQIKI-LRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLSIRHLMELNALDKQEELTP
620 630 640 650 660 670
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 LGQRLAHISTDPRLAKAIVLAAIFRCLHPLLVVVSCLT-RDPFSSSLQNRAEVDKVKALL
:: .::.. ..:...: :...:.: :: :.:.... :. .::: : .. .: . :
CCDS54 LGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDPFVIPLGKEKIADARRKEL
680 690 700 710 720 730
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 SHDSGSDHLAFVRAVAGWEEVLRWQDRSSRENYLEENLLYAPSLRFIHGLIKQFSENIYE
..:. ::::. : : ::::. : : .. : : .: . .:...:.. ::.:..
CCDS54 AKDTRSDHLTVVNAFEGWEEARRRGFRYEKD-YCWEYFLSSNTLQMLHNMKGQFAEHLLG
740 750 760 770 780 790
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 AFLVGK--PSDCTLASAQCNEYSEEEELVKGVLMAGLYPNLIQVRQGKVTRQGKFKPNSV
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CCDS54 AGFVSSRNPKD-----PESNINSDNEKIIKAVICAGLYPKVAKIRLN----LGKKRKMVK
800 810 820 830 840
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA0 TYRTKSGNILLHKSTINREATRLRSRWLTYFMAVKSNGSVFVRDSSQVHPLAVLLLTDGD
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CCDS54 VYTKTDGLVAVHPKSVNVEQTDFHYNWLIYHLKMRTS-SIYLYDCTEVSPYC-LLFFGGD
850 860 870 880 890 900
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA0 VHIRDDGRRATISLSDSDLLRLEGDSRTVRLLKELRRALGRMVERSLRSELAALPPSVQE
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CCDS54 ISIQKDNDQETIAVDE--WIVFQSPARIAHLVKELRKELDILLQEKIESPHPVDWNDTKS
910 920 930 940 950 960
1170 1180 1190
pF1KA0 EHGQLLALLAELLRGPCGSFDVRKTADD
CCDS54 RDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS
970 980 990
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CCDS54 MAAPVGPVKFWRPGTEGPGVSISEERQSL--AENS
10 20 30
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 HPVVVISGDTGCGKTTRIPQLLLERYVTE-GRGARCNVI-ITQPRRISAVSVAQRVSHEL
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CCDS54 GTTVVYNPYAALSIEQQRQKLPVFKYLAEAGWTAEGRVVGVTQPRRVAAVTVAGRVAEER
40 50 60 70 80 90
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 GPSLRRNVGFQVRLESKPPSRGGALLFCTVGILLRKLQSNPSLEGVSHVIVDEVHERDVN
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CCDS54 GAVLGHEVGYCIRFDDCTDQLATRIKFLTDGMLVREMMVDPLLTKYSVIMLDEAHERTLY
100 110 120 130 140 150
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CCDS54 TDIAIGLLKKIQKKRGDLRLIVASATLDADKFRDFFNQNETSDPARDTCVILTVEGRTFP
160 170 180 190 200 210
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 VKEHYLEDILAKLGKHQYLHRHRHHESEDECALDLDLVTDLVLHIDARGEPGGILCFLPG
: ::.. . : . :..: . : .: :: :
CCDS54 VDIFYLQSPVPDYIKSTVETVVKIHQTEGD---------------------GDVLAFLTG
220 230 240 250
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 WQEIKGV------QQRLQEALGMHESKYL-ILPVHSNIPMMDQKAIFQQPPVGVRKIVLA
.:.. : : : ::. ..: .::.....: ..: .:.. .:::...:
CCDS54 QEEVETVVSMLIEQARALARTGMK--RHLRVLPMYAGLPSFEQMKVFERVSRSVRKVIVA
260 270 280 290 300 310
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pF1KA0 TNIAETSITINDIVHVVDSGLHKEERYDLKTKVSCLETVWVSRANVIQRRGRAGRCQSGF
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CCDS54 TNVAETSITISGIVYVIDCGFVKLRAYNPRTAIECLVVVPVSQASANQRAGRGGRSRSGK
320 330 340 350 360 370
800 810 820 830 840
pF1KA0 AYHLFPRSRLEKMVPFQVPEILRTPLENLVLQAK-IHMPEKTAVEFLSKAVDSPNIKAVD
:.:. . ..:. :::. :. : ..:: : . . . .:.: : ...
CCDS54 CYRLYTEEAFDKLPQSTVPEMQRSNLAPVILQLKALGIDNVLRFHFMSP----PPAQSMV
380 390 400 410 420
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 EAVILLQEIGVLDQREYLTT-LGQRLAHISTDPRLAKAIVLAAIFRCLHPLLVVVSCLT-
.:. :: .: ::. :: ::.:.:.. .: .:: .. .. : : . .: ... .
CCDS54 QALELLYALGGLDKDCRLTEPLGMRIAEFPLNPMFAKMLLESGNFGCSQEILSIAAMMQI
430 440 450 460 470 480
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 RDPFSSSLQNRAEVDKVKALLSHDSGSDHLAFVRAVAGWEEVLRWQDRSSR---ENYLE-
.. : ...... .:. .. . : :::... .: .. ....:. :..:.
CCDS54 QNIFVVPPNQKSHAIRVHRKFAVEEG-DHLTMLNI---YEAFIK-HNKDSKWCQEHFLNY
490 500 510 520 530 540
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pF1KA0 ENLLYAPSLRF-IHGLIKQFSENIYEAFLVGKPSDCTLASAQCNEYSEEEELVKGVLM-A
..:. : ..: .. :. .:. . . : : : .: .: .:.: . :
CCDS54 KGLVRAATVREQLKKLLVKFQ--VPRKSSEGDP-DLVL---RC--------IVSGFFANA
550 560 570 580
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 GLYPNLIQVRQGKVTRQGKFKPNSVTYRTKSGNILLHKSTIN------REATRLRSRWLT
. . . : . .. ...: :: : : .... .:. :..: ..: ::
CCDS54 ARFHSTGAYRTIRDDHELHIHPASVLYAEKPPRWVIYNEVIQTSKYYMRDVTAIESAWLL
590 600 610 620 630 640
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 YFMAVKSNGSVFVRDSSQVHPLAVLLLTDGDVHIRDDGRRATISLSDSDLLRLEGDSRTV
CCDS54 ELAPHFYQQGTHLSLKAKRAKVQDP
650 660 670
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. :. .::: :. :: ::.. .:::
CCDS13 GPGVSISEERQSLAENSGTTVVYNPYAALSIEQQRQKLPVFKLRNHILYLIENYQTVVIV
20 30 40 50 60 70
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pF1KA0 GDTGCGKTTRIPQLLLER-YVTEGRGARCNVIITQPRRISAVSVAQRVSHELGPSLRRNV
:.:::::.:.::: : : ...::: : .:::::..::.:: ::..: : : ..:
CCDS13 GETGCGKSTQIPQYLAEAGWTAEGR----VVGVTQPRRVAAVTVAGRVAEERGAVLGHEV
80 90 100 110 120 130
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pF1KA0 GFQVRLESKPPSRGGALLFCTVGILLRKLQSNPSLEGVSHVIVDEVHERDVNTDFLLILL
:. .:... . . . : : :.:.:... .: : : ...::.::: . ::. . ::
CCDS13 GYCIRFDDCTDQLATRIKFLTDGMLVREMMVDPLLTKYSVIMLDEAHERTLYTDIAIGLL
140 150 160 170 180 190
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: .:. :::.. ::: : ..: .:. : .. : : .:: ::..
CCDS13 KKIQKKRGDLRLIVASATLDADKFRDFFNQNETSDPARDTCVILTVEGRTFPVDIFYLQS
200 210 220 230 240 250
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 ILAKLGKHQYLHRHRHHESEDECALDLDLVTDLVLHIDARGEPGGILCFLPGWQEIKGV-
. : . :..: . : .: :: : .:.. :
CCDS13 PVPDYIKSTVETVVKIHQTEGD---------------------GDVLAFLTGQEEVETVV
260 270 280 290
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pF1KA0 -----QQRLQEALGMHESKYL-ILPVHSNIPMMDQKAIFQQPPVGVRKIVLATNIAETSI
: : :: ...: .::.....: ..: .:.. .:::...:::.:::::
CCDS13 SMLIEQARALARTGM--KRHLRVLPMYAGLPSFEQMKVFERVSRSVRKVIVATNVAETSI
300 310 320 330 340
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pF1KA0 TINDIVHVVDSGLHKEERYDLKTKVSCLETVWVSRANVIQRRGRAGRCQSGFAYHLFPRS
::. ::.:.: :. : . :. .: . :: .: ::.:.. :: ::.:: .:: :.:. .
CCDS13 TISGIVYVIDCGFVKLRAYNPRTAIECLVVVPVSQASANQRAGRGGRSRSGKCYRLYTEE
350 360 370 380 390 400
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..:. :::. :. : ..:: : . . . .:.: : ... .:. ::
CCDS13 AFDKLPQSTVPEMQRSNLAPVILQLKALGIDNVLRFHFMS----PPPAQSMVQALELLYA
410 420 430 440 450 460
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.: ::. :: ::.:.:.. .: .:: .. .. : : . .: ... . .. :
CCDS13 LGGLDKDCRLTEPLGMRIAEFPLNPMFAKMLLESGNFGCSQEILSIAAMMQIQNIFVVPP
470 480 490 500 510 520
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...... .:. .. . : :::... .: .. ....:. :..:. ..:. : .
CCDS13 NQKSHAIRVHRKFAVEEG-DHLTMLNI---YEAFIK-HNKDSKWCQEHFLNYKGLVRAAT
530 540 550 560 570 580
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.: .. :. .: .. . : : : .: .: .:.: . :. . .
CCDS13 VREQLKKLLVKF--QVPRKSSEGDP-DLVL---RC--------IVSGFFANAARFHSTGA
590 600 610 620
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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: . .. ...: :: : : .... .:. :..: ..: ::
CCDS13 YRTIRDDHELHIHPASVLYAEKPPRWVIYNEVIQTSKYYMRDVTAIESAWLLELAPHFYQ
630 640 650 660 670 680
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 GSVFVRDSSQVHPLAVLLLTDGDVHIRDDGRRATISLSDSDLLRLEGDSRTVRLLKELRR
CCDS13 QGTHLSLKAKRAKVQDP
690 700
>>CCDS1800.1 DHX57 gene_id:90957|Hs108|chr2 (1386 aa)
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CCDS18 DASFLYELEIRFSKDHKYPYQAPLVAFYSTNENLPLACRLHISEFLYDKALTFAETSEPV
350 360 370 380 390 400
330 340 350 360 370
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.... .: .. : .:... : . .: : .:.. : : ..:...
CCDS18 VYSLITLLEEESEIVKLLTNTHHKYSDPPVNFLPVPSRTRINNPACHKTVIPNNSFVSNQ
410 420 430 440 450 460
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::.. :.. .:.:: . .. :: : ..::. .. ..
CCDS18 IPEVEKASES-EESDEDDGPAPVIVENESYVNLKKKISKRYDWQAKSVHAENGKICKQFR
470 480 490 500 510 520
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. . :. . :: .::. .:.:::: ...: :::::: :::::::.:::..:. .
CCDS18 MKQASRQFQSILQERQSLPAWEERETILNLLRKHQVVVISGMTGCGKTTQIPQFILDDSL
530 540 550 560 570 580
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pF1KA0 TEGRGARCNVIITQPRRISAVSVAQRVSHELGPSLRRNVGFQVRLESKPPSRGGALLFCT
. :.: ::::::::.:::.::..: . . .::.:.:::: : . ::.::
CCDS18 NGPPEKVANIICTQPRRISAISVAERVAKERAERVGLTVGYQIRLESVKSS-ATRLLYCT
590 600 610 620 630 640
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.:.:::.:... .:.::::.:::::::: ..::::..:: . :.:...::::: .
CCDS18 TGVLLRRLEGDTALQGVSHIIVDEVHERTEESDFLLLVLKDIVSQRPGLQVILMSATLNA
650 660 670 680 690 700
600 610 620 630 640
pF1KA0 ERFSRYFGGCPVIKVPGFMYPVKEHYLEDILA----------------KLGKHQYLHRHR
: :: ::..:::: .:: .:: . .::: .: : ... :. .:
CCDS18 ELFSDYFNSCPVITIPGRTFPVDQFFLEDAIAVTRYVLQDGSPYMRSMKQISKEKLKARR
710 720 730 740 750 760
650 660
pF1KA0 HHESEDECALDL---------DLVTDLV--LHID-----AR-------------------
.. . .: :: : : : : ..: ::
CCDS18 NRTAFEEVEEDLRLSLHLQDQDSVKDAVPDQQLDFKQLLARYKGVSKSVIKTMSIMDFEK
770 780 790 800 810 820
670 680 690 700
pF1KA0 ---------------GE----PGGILCFLPGWQEIKGVQQRLQ-EAL--GMHESKYLILP
:. ::.:: :::: ::: . ..:: ..: . . .. .: :
CCDS18 VNLELIEALLEWIVDGKHSYPPGAILVFLPGLAEIKMLYEQLQSNSLFNNRRSNRCVIHP
830 840 850 860 870 880
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 VHSNIPMMDQKAIFQQPPVGVRKIVLATNIAETSITINDIVHVVDSGLHKEERYDLKTKV
.::.. .:.:.: .::.:: ::...::::::::::.:.:.:.::: ::.::: . .
CCDS18 LHSSLSSEEQQAVFVKPPAGVTKIIISTNIAETSITIDDVVYVIDSGKMKEKRYDASKGM
890 900 910 920 930 940
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CCDS18 ESLEDTFVSQANALQRKGRAGRVASGVCFHLFTSHHYNHQLLKQQLPEIQRVPLEQLCLR
950 960 970 980 990 1000
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:: .: .. .:. .. :. .. . : :...:.: : :: :: .:: . .:
CCDS18 IKILEMFSAHNLQSVFSRLIEPPHTDSLRASKIRLRDLGALTPDERLTPLGYHLASLPVD
1010 1020 1030 1040 1050 1060
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pF1KA0 PRLAKAIVLAAIFRCLHPLLVVVSCLT-RDPFSSSLQNRAEVDKVKALLSHDSGSDHLAF
:..: .....::::: : :.... :. ..:: : ... :... : .. ..::.::.
CCDS18 VRIGKLMLFGSIFRCLDPALTIAASLAFKSPFVSPWDKKEEANQKKLEFAF-ANSDYLAL
1070 1080 1090 1100 1110 1120
940 950 960 970 980 990
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