FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0911, 981 aa 1>>>pF1KA0911 981 - 981 aa - 981 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6841+/-0.00132; mu= 5.5850+/- 0.079 mean_var=216.4367+/-43.787, 0's: 0 Z-trim(108.3): 89 B-trim: 359 in 1/49 Lambda= 0.087178 statistics sampled from 10053 (10130) to 10053 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.311), width: 16 Scan time: 4.660 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS30580.1 CLSTN1 gene_id:22883|Hs108|chr1 ( 981) 6610 845.5 0 CCDS105.1 CLSTN1 gene_id:22883|Hs108|chr1 ( 971) 6068 777.3 0 CCDS8575.1 CLSTN3 gene_id:9746|Hs108|chr12 ( 956) 2983 389.3 1.9e-107 CCDS3112.1 CLSTN2 gene_id:64084|Hs108|chr3 ( 955) 2033 269.9 1.8e-71 >>CCDS30580.1 CLSTN1 gene_id:22883|Hs108|chr1 (981 aa) initn: 6610 init1: 6610 opt: 6610 Z-score: 4507.6 bits: 845.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6610; 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CCDS85 MTLLLLPLLLASLLASCSC--NKANKHKPWIEAEYQGIVMENDNTVLLNPPLF 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 ALDKDAPLRFAESFEVTVTKEGEICGFKIHGQNVPFDAVVVDKSTGEGVIRSKEKLDCEL :::::::::.: ::::::..::..:::.::..::.::::.::.:: .::: CCDS85 ALDKDAPLRYA----------GEICGFRLHGSGVPFEAVILDKATGEGLIRAKEPVDCEA 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KA0 QKDYSFTIQAYDCGKGPDGTNVKKSHKATVHIQVNDVNEYAPVFKEKSYKATVIEGKQYD ::...:::::::::.::::.:.:::::::::..::::::.:::: :. :.:.: ::: :: CCDS85 QKEHTFTIQAYDCGEGPDGANTKKSHKATVHVRVNDVNEFAPVFVERLYRAAVTEGKLYD 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KA0 SILRVEAVDADCSPQFSQICSYEIITPDVPFTVDKDGYIKNTEKLNYGKEHQYKLTVTAY ::::::.:.:::::.:::: :::.::..:: .:.:: :.:::::.:. :. ::.::::: CCDS85 RILRVEAIDGDCSPQYSQICYYEILTPNTPFLIDNDGNIENTEKLQYSGERLYKFTVTAY 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KA0 DCGKKRATEDVLVKISIKPTCTPGWQGWNNRIEYEPGTGALAVFPNIHLETCDEPVASVQ :::::::..:. :.:..:::: :.:::::.:::: ::.:.::.::.:.:::::::. ..: CCDS85 DCGKKRAADDAEVEIQVKPTCKPSWQGWNKRIEYAPGAGSLALFPGIRLETCDEPLWNIQ 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KA0 ATVELETSHIGKGCDRDTYSEKSLHRLCGAAAGTAELLPSPSGSLNWTMGLPTDNGHDSD ::.::.:::..::::::.:::..:..:::::.: ..::: :. . ::: :: . ..::. CCDS85 ATIELQTSHVAKGCDRDNYSERALRKLCGAATGEVDLLPMPGPNANWTAGLSVHYSQDSS 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 pF1KA0 QVFEFNGTQAVRIPDGVVS---VSPKEP----FTISVWMRHG--PF-GRKKE-TILCSSD .. :::::::..: : : .:.. ::.: ::.:: : :.:.: ::.:.. CCDS85 LIYWFNGTQAVQVPLGGPSGLGSGPQDSLSDHFTLSFWMKHGVTPNKGKKEEETIVCNTV 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 KTDMNRHHYSLYVHGCRLIFLFRQDPSEEKKYRPAEFHWKLNQVCDEEWHHYVLNVEFPS ... . :::: :::::. ::. : :. ::..: :::.::::.:::::.::.:::. CCDS85 QNEDGFSHYSLTVHGCRIAFLYW--PLLESA-RPVKFLWKLEQVCDDEWHHYALNLEFPT 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 VTLYVDGTSHEPFSVTEDYPLHPSKIETQLVVGACWQEFSGVENDNETEPVTVASAGGDL ::::.:: : .: . .. .:: . : :..:::: : .. :.. . . : .. : : CCDS85 VTLYTDGISFDPALIHDNGLIHPPRREPALMIGACWTEEKNKEKE-KGDNSTDTTQGDPL 460 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 580 pF1KA0 HMTQFFRGNLAGLTLRSGKLADKKVIDCLYTCKEGLDLQVLEDSGRGVQIQAHPSQLVLT . ..:.: :::...:::.: ...::.:::.:.:::: . .:. :.:......::: .:: CCDS85 SIHHYFHGYLAGFSVRSGRLESREVIECLYACREGLDYRDFESLGKGMKVHVNPSQSLLT 520 530 540 550 560 570 590 600 610 620 630 640 pF1KA0 LEGEDLGELDKAMQHISYLNSRQFPTPGIRRLKITSTIKCFNEATCISVPPVDGYVMVLQ :::.:. ...:.::..:.:. .: :::.: :..:...:::.: .:.:.: :.:::.::: CCDS85 LEGDDVETFNHALQHVAYMNTLRFATPGVRPLRLTTAVKCFSEESCVSIPEVEGYVVVLQ 580 590 600 610 620 630 650 660 670 680 690 700 pF1KA0 PEEPKISLSGVHHFARAASEFESSEGVFLFPELRIISTITREVEPEGDGAEDPTVQESLV :. :.: :::. :::: : .::...:: :::.:.: .:...:: . : . . :: .. . CCDS85 PDAPQILLSGTAHFARPAVDFEGTNGVPLFPDLQITCSISHQVEAKKDESWQGTVTDTRM 640 650 660 670 680 690 710 720 730 740 750 760 pF1KA0 SEEIVHDLDTCEVTVEGEELNHEQESLEVDMARLQQKGIEVSSSELGMTFTGVDTMASYE :.::::.:: ::... :..:. :.::: .: . :::.:.:.... .:..::.... :: CCDS85 SDEIVHNLDGCEISLVGDDLDPERESLLLDTTSLQQRGLELTNTSAYLTIAGVESITVYE 700 710 720 730 740 750 770 780 790 800 810 820 pF1KA0 EVLHLLRYRNWHARSLLDRKFKLICSELNGRYISNEFKVEVNVIHTANPMEHANHMAAQP :.:. ::: :. .: :::.: :::.:::: :::: :::::.:. : . : .:. .. CCDS85 EILRQARYRLRHGAALYTRKFRLSCSEMNGRYSSNEFIVEVNVLHSMNRVAHPSHVLSSQ 760 770 780 790 800 810 830 840 850 860 870 880 pF1KA0 QFVHPEHRSFVDLSGHNLANPHPFAVVPSTATVVIVVCVSFLVFMIILGVFRIRAAHRRT ::.: :. ...::.::. : ...::.::..:::::.:::.:..::. ::.. :::. 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