Result of FASTA (omim) for pF1KA0911
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0911, 981 aa
  1>>>pF1KA0911 981 - 981 aa - 981 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2271+/-0.000518; mu= 2.3189+/- 0.032
 mean_var=259.3357+/-52.909, 0's: 0 Z-trim(115.6): 118  B-trim: 100 in 1/54
 Lambda= 0.079642
 statistics sampled from 26017 (26135) to 26017 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.306), width:  16
 Scan time: 14.750

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001009566 (OMIM: 611321) calsyntenin-1 isoform  ( 981) 6610 774.3       0
NP_055759 (OMIM: 611321) calsyntenin-1 isoform 2 p ( 971) 6068 712.1 3.6e-204
NP_001289812 (OMIM: 611321) calsyntenin-1 isoform  ( 962) 3492 416.1 4.5e-115
NP_055533 (OMIM: 611324) calsyntenin-3 precursor [ ( 956) 2983 357.6 1.8e-97
XP_006719226 (OMIM: 611324) PREDICTED: calsyntenin ( 968) 2983 357.6 1.8e-97
XP_016862511 (OMIM: 611323) PREDICTED: calsyntenin ( 930) 2033 248.4 1.3e-64
NP_071414 (OMIM: 611323) calsyntenin-2 precursor [ ( 955) 2033 248.4 1.3e-64


>>NP_001009566 (OMIM: 611321) calsyntenin-1 isoform 1 pr  (981 aa)
 initn: 6610 init1: 6610 opt: 6610  Z-score: 4122.9  bits: 774.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6610; 100.0% identity (100.0% similar) in 981 aa overlap (1-981:1-981)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MLRRPAPALAPAARLLLAGLLCGGGVWAARVNKHKPWLEPTYHGIVTENDNTVLLDPPLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLRRPAPALAPAARLLLAGLLCGGGVWAARVNKHKPWLEPTYHGIVTENDNTVLLDPPLI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 ALDKDAPLRFAESFEVTVTKEGEICGFKIHGQNVPFDAVVVDKSTGEGVIRSKEKLDCEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALDKDAPLRFAESFEVTVTKEGEICGFKIHGQNVPFDAVVVDKSTGEGVIRSKEKLDCEL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 QKDYSFTIQAYDCGKGPDGTNVKKSHKATVHIQVNDVNEYAPVFKEKSYKATVIEGKQYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QKDYSFTIQAYDCGKGPDGTNVKKSHKATVHIQVNDVNEYAPVFKEKSYKATVIEGKQYD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 SILRVEAVDADCSPQFSQICSYEIITPDVPFTVDKDGYIKNTEKLNYGKEHQYKLTVTAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SILRVEAVDADCSPQFSQICSYEIITPDVPFTVDKDGYIKNTEKLNYGKEHQYKLTVTAY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 DCGKKRATEDVLVKISIKPTCTPGWQGWNNRIEYEPGTGALAVFPNIHLETCDEPVASVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DCGKKRATEDVLVKISIKPTCTPGWQGWNNRIEYEPGTGALAVFPNIHLETCDEPVASVQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 ATVELETSHIGKGCDRDTYSEKSLHRLCGAAAGTAELLPSPSGSLNWTMGLPTDNGHDSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATVELETSHIGKGCDRDTYSEKSLHRLCGAAAGTAELLPSPSGSLNWTMGLPTDNGHDSD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 QVFEFNGTQAVRIPDGVVSVSPKEPFTISVWMRHGPFGRKKETILCSSDKTDMNRHHYSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVFEFNGTQAVRIPDGVVSVSPKEPFTISVWMRHGPFGRKKETILCSSDKTDMNRHHYSL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 YVHGCRLIFLFRQDPSEEKKYRPAEFHWKLNQVCDEEWHHYVLNVEFPSVTLYVDGTSHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YVHGCRLIFLFRQDPSEEKKYRPAEFHWKLNQVCDEEWHHYVLNVEFPSVTLYVDGTSHE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 PFSVTEDYPLHPSKIETQLVVGACWQEFSGVENDNETEPVTVASAGGDLHMTQFFRGNLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PFSVTEDYPLHPSKIETQLVVGACWQEFSGVENDNETEPVTVASAGGDLHMTQFFRGNLA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 GLTLRSGKLADKKVIDCLYTCKEGLDLQVLEDSGRGVQIQAHPSQLVLTLEGEDLGELDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLTLRSGKLADKKVIDCLYTCKEGLDLQVLEDSGRGVQIQAHPSQLVLTLEGEDLGELDK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 AMQHISYLNSRQFPTPGIRRLKITSTIKCFNEATCISVPPVDGYVMVLQPEEPKISLSGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AMQHISYLNSRQFPTPGIRRLKITSTIKCFNEATCISVPPVDGYVMVLQPEEPKISLSGV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 HHFARAASEFESSEGVFLFPELRIISTITREVEPEGDGAEDPTVQESLVSEEIVHDLDTC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HHFARAASEFESSEGVFLFPELRIISTITREVEPEGDGAEDPTVQESLVSEEIVHDLDTC
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 EVTVEGEELNHEQESLEVDMARLQQKGIEVSSSELGMTFTGVDTMASYEEVLHLLRYRNW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVTVEGEELNHEQESLEVDMARLQQKGIEVSSSELGMTFTGVDTMASYEEVLHLLRYRNW
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 HARSLLDRKFKLICSELNGRYISNEFKVEVNVIHTANPMEHANHMAAQPQFVHPEHRSFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HARSLLDRKFKLICSELNGRYISNEFKVEVNVIHTANPMEHANHMAAQPQFVHPEHRSFV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 DLSGHNLANPHPFAVVPSTATVVIVVCVSFLVFMIILGVFRIRAAHRRTMRDQDTGKENE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLSGHNLANPHPFAVVPSTATVVIVVCVSFLVFMIILGVFRIRAAHRRTMRDQDTGKENE
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 MDWDDSALTITVNPMETYEDQHSSEEEEEEEEEEESEDGEEEDDITSAESESSEEEEGEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDWDDSALTITVNPMETYEDQHSSEEEEEEEEEEESEDGEEEDDITSAESESSEEEEGEQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980 
pF1KA0 GDPQNATRQQQLEWDDSTLSY
       :::::::::::::::::::::
NP_001 GDPQNATRQQQLEWDDSTLSY
              970       980 

>>NP_055759 (OMIM: 611321) calsyntenin-1 isoform 2 precu  (971 aa)
 initn: 6539 init1: 6064 opt: 6068  Z-score: 3786.4  bits: 712.1 E(85289): 3.6e-204
Smith-Waterman score: 6523; 99.0% identity (99.0% similar) in 981 aa overlap (1-981:1-971)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MLRRPAPALAPAARLLLAGLLCGGGVWAARVNKHKPWLEPTYHGIVTENDNTVLLDPPLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MLRRPAPALAPAARLLLAGLLCGGGVWAARVNKHKPWLEPTYHGIVTENDNTVLLDPPLI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 ALDKDAPLRFAESFEVTVTKEGEICGFKIHGQNVPFDAVVVDKSTGEGVIRSKEKLDCEL
       :::::::::::          :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ALDKDAPLRFA----------GEICGFKIHGQNVPFDAVVVDKSTGEGVIRSKEKLDCEL
               70                  80        90       100       110

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 QKDYSFTIQAYDCGKGPDGTNVKKSHKATVHIQVNDVNEYAPVFKEKSYKATVIEGKQYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QKDYSFTIQAYDCGKGPDGTNVKKSHKATVHIQVNDVNEYAPVFKEKSYKATVIEGKQYD
              120       130       140       150       160       170

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 SILRVEAVDADCSPQFSQICSYEIITPDVPFTVDKDGYIKNTEKLNYGKEHQYKLTVTAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SILRVEAVDADCSPQFSQICSYEIITPDVPFTVDKDGYIKNTEKLNYGKEHQYKLTVTAY
              180       190       200       210       220       230

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 DCGKKRATEDVLVKISIKPTCTPGWQGWNNRIEYEPGTGALAVFPNIHLETCDEPVASVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DCGKKRATEDVLVKISIKPTCTPGWQGWNNRIEYEPGTGALAVFPNIHLETCDEPVASVQ
              240       250       260       270       280       290

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 ATVELETSHIGKGCDRDTYSEKSLHRLCGAAAGTAELLPSPSGSLNWTMGLPTDNGHDSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ATVELETSHIGKGCDRDTYSEKSLHRLCGAAAGTAELLPSPSGSLNWTMGLPTDNGHDSD
              300       310       320       330       340       350

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 QVFEFNGTQAVRIPDGVVSVSPKEPFTISVWMRHGPFGRKKETILCSSDKTDMNRHHYSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QVFEFNGTQAVRIPDGVVSVSPKEPFTISVWMRHGPFGRKKETILCSSDKTDMNRHHYSL
              360       370       380       390       400       410

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 YVHGCRLIFLFRQDPSEEKKYRPAEFHWKLNQVCDEEWHHYVLNVEFPSVTLYVDGTSHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YVHGCRLIFLFRQDPSEEKKYRPAEFHWKLNQVCDEEWHHYVLNVEFPSVTLYVDGTSHE
              420       430       440       450       460       470

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 PFSVTEDYPLHPSKIETQLVVGACWQEFSGVENDNETEPVTVASAGGDLHMTQFFRGNLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PFSVTEDYPLHPSKIETQLVVGACWQEFSGVENDNETEPVTVASAGGDLHMTQFFRGNLA
              480       490       500       510       520       530

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 GLTLRSGKLADKKVIDCLYTCKEGLDLQVLEDSGRGVQIQAHPSQLVLTLEGEDLGELDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GLTLRSGKLADKKVIDCLYTCKEGLDLQVLEDSGRGVQIQAHPSQLVLTLEGEDLGELDK
              540       550       560       570       580       590

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 AMQHISYLNSRQFPTPGIRRLKITSTIKCFNEATCISVPPVDGYVMVLQPEEPKISLSGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AMQHISYLNSRQFPTPGIRRLKITSTIKCFNEATCISVPPVDGYVMVLQPEEPKISLSGV
              600       610       620       630       640       650

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 HHFARAASEFESSEGVFLFPELRIISTITREVEPEGDGAEDPTVQESLVSEEIVHDLDTC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HHFARAASEFESSEGVFLFPELRIISTITREVEPEGDGAEDPTVQESLVSEEIVHDLDTC
              660       670       680       690       700       710

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 EVTVEGEELNHEQESLEVDMARLQQKGIEVSSSELGMTFTGVDTMASYEEVLHLLRYRNW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EVTVEGEELNHEQESLEVDMARLQQKGIEVSSSELGMTFTGVDTMASYEEVLHLLRYRNW
              720       730       740       750       760       770

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 HARSLLDRKFKLICSELNGRYISNEFKVEVNVIHTANPMEHANHMAAQPQFVHPEHRSFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HARSLLDRKFKLICSELNGRYISNEFKVEVNVIHTANPMEHANHMAAQPQFVHPEHRSFV
              780       790       800       810       820       830

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 DLSGHNLANPHPFAVVPSTATVVIVVCVSFLVFMIILGVFRIRAAHRRTMRDQDTGKENE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DLSGHNLANPHPFAVVPSTATVVIVVCVSFLVFMIILGVFRIRAAHRRTMRDQDTGKENE
              840       850       860       870       880       890

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 MDWDDSALTITVNPMETYEDQHSSEEEEEEEEEEESEDGEEEDDITSAESESSEEEEGEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MDWDDSALTITVNPMETYEDQHSSEEEEEEEEEEESEDGEEEDDITSAESESSEEEEGEQ
              900       910       920       930       940       950

              970       980 
pF1KA0 GDPQNATRQQQLEWDDSTLSY
       :::::::::::::::::::::
NP_055 GDPQNATRQQQLEWDDSTLSY
              960       970 

>>NP_001289812 (OMIM: 611321) calsyntenin-1 isoform 3 pr  (962 aa)
 initn: 6479 init1: 3492 opt: 3492  Z-score: 2186.8  bits: 416.1 E(85289): 4.5e-115
Smith-Waterman score: 6445; 98.1% identity (98.1% similar) in 981 aa overlap (1-981:1-962)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MLRRPAPALAPAARLLLAGLLCGGGVWAARVNKHKPWLEPTYHGIVTENDNTVLLDPPLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLRRPAPALAPAARLLLAGLLCGGGVWAARVNKHKPWLEPTYHGIVTENDNTVLLDPPLI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 ALDKDAPLRFAESFEVTVTKEGEICGFKIHGQNVPFDAVVVDKSTGEGVIRSKEKLDCEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALDKDAPLRFAESFEVTVTKEGEICGFKIHGQNVPFDAVVVDKSTGEGVIRSKEKLDCEL
               70        80        90       100       110       120

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pF1KA0 QKDYSFTIQAYDCGKGPDGTNVKKSHKATVHIQVNDVNEYAPVFKEKSYKATVIEGKQYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QKDYSFTIQAYDCGKGPDGTNVKKSHKATVHIQVNDVNEYAPVFKEKSYKATVIEGKQYD
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pF1KA0 SILRVEAVDADCSPQFSQICSYEIITPDVPFTVDKDGYIKNTEKLNYGKEHQYKLTVTAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SILRVEAVDADCSPQFSQICSYEIITPDVPFTVDKDGYIKNTEKLNYGKEHQYKLTVTAY
              190       200       210       220       230       240

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pF1KA0 DCGKKRATEDVLVKISIKPTCTPGWQGWNNRIEYEPGTGALAVFPNIHLETCDEPVASVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DCGKKRATEDVLVKISIKPTCTPGWQGWNNRIEYEPGTGALAVFPNIHLETCDEPVASVQ
              250       260       270       280       290       300

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pF1KA0 ATVELETSHIGKGCDRDTYSEKSLHRLCGAAAGTAELLPSPSGSLNWTMGLPTDNGHDSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATVELETSHIGKGCDRDTYSEKSLHRLCGAAAGTAELLPSPSGSLNWTMGLPTDNGHDSD
              310       320       330       340       350       360

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pF1KA0 QVFEFNGTQAVRIPDGVVSVSPKEPFTISVWMRHGPFGRKKETILCSSDKTDMNRHHYSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVFEFNGTQAVRIPDGVVSVSPKEPFTISVWMRHGPFGRKKETILCSSDKTDMNRHHYSL
              370       380       390       400       410       420

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pF1KA0 YVHGCRLIFLFRQDPSEEKKYRPAEFHWKLNQVCDEEWHHYVLNVEFPSVTLYVDGTSHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YVHGCRLIFLFRQDPSEEKKYRPAEFHWKLNQVCDEEWHHYVLNVEFPSVTLYVDGTSHE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 PFSVTEDYPLHPSKIETQLVVGACWQEFSGVENDNETEPVTVASAGGDLHMTQFFRGNLA
       ::::::::::::::::::::::::::                   :::::::::::::::
NP_001 PFSVTEDYPLHPSKIETQLVVGACWQ-------------------GGDLHMTQFFRGNLA
              490       500                          510       520 

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 GLTLRSGKLADKKVIDCLYTCKEGLDLQVLEDSGRGVQIQAHPSQLVLTLEGEDLGELDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLTLRSGKLADKKVIDCLYTCKEGLDLQVLEDSGRGVQIQAHPSQLVLTLEGEDLGELDK
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pF1KA0 AMQHISYLNSRQFPTPGIRRLKITSTIKCFNEATCISVPPVDGYVMVLQPEEPKISLSGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AMQHISYLNSRQFPTPGIRRLKITSTIKCFNEATCISVPPVDGYVMVLQPEEPKISLSGV
             590       600       610       620       630       640 

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 HHFARAASEFESSEGVFLFPELRIISTITREVEPEGDGAEDPTVQESLVSEEIVHDLDTC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HHFARAASEFESSEGVFLFPELRIISTITREVEPEGDGAEDPTVQESLVSEEIVHDLDTC
             650       660       670       680       690       700 

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pF1KA0 EVTVEGEELNHEQESLEVDMARLQQKGIEVSSSELGMTFTGVDTMASYEEVLHLLRYRNW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVTVEGEELNHEQESLEVDMARLQQKGIEVSSSELGMTFTGVDTMASYEEVLHLLRYRNW
             710       720       730       740       750       760 

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 HARSLLDRKFKLICSELNGRYISNEFKVEVNVIHTANPMEHANHMAAQPQFVHPEHRSFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HARSLLDRKFKLICSELNGRYISNEFKVEVNVIHTANPMEHANHMAAQPQFVHPEHRSFV
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              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 DLSGHNLANPHPFAVVPSTATVVIVVCVSFLVFMIILGVFRIRAAHRRTMRDQDTGKENE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLSGHNLANPHPFAVVPSTATVVIVVCVSFLVFMIILGVFRIRAAHRRTMRDQDTGKENE
             830       840       850       860       870       880 

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 MDWDDSALTITVNPMETYEDQHSSEEEEEEEEEEESEDGEEEDDITSAESESSEEEEGEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDWDDSALTITVNPMETYEDQHSSEEEEEEEEEEESEDGEEEDDITSAESESSEEEEGEQ
             890       900       910       920       930       940 

              970       980 
pF1KA0 GDPQNATRQQQLEWDDSTLSY
       :::::::::::::::::::::
NP_001 GDPQNATRQQQLEWDDSTLSY
             950       960  

>>NP_055533 (OMIM: 611324) calsyntenin-3 precursor [Homo  (956 aa)
 initn: 3219 init1: 1451 opt: 2983  Z-score: 1870.8  bits: 357.6 E(85289): 1.8e-97
Smith-Waterman score: 3418; 51.9% identity (80.0% similar) in 954 aa overlap (15-949:8-945)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MLRRPAPALAPAARLLLAGLLCGGGVWAARVNKHKPWLEPTYHGIVTENDNTVLLDPPLI
                     ::::.:: . .    ..::::::.:  :.::: ::::::::.:::.
NP_055        MTLLLLPLLLASLLASCSC--NKANKHKPWIEAEYQGIVMENDNTVLLNPPLF
                      10          20        30        40        50 

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 ALDKDAPLRFAESFEVTVTKEGEICGFKIHGQNVPFDAVVVDKSTGEGVIRSKEKLDCEL
       :::::::::.:          ::::::..::..:::.::..::.::::.::.:: .::: 
NP_055 ALDKDAPLRYA----------GEICGFRLHGSGVPFEAVILDKATGEGLIRAKEPVDCEA
              60                  70        80        90       100 

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 QKDYSFTIQAYDCGKGPDGTNVKKSHKATVHIQVNDVNEYAPVFKEKSYKATVIEGKQYD
       ::...:::::::::.::::.:.:::::::::..::::::.:::: :. :.:.: ::: ::
NP_055 QKEHTFTIQAYDCGEGPDGANTKKSHKATVHVRVNDVNEFAPVFVERLYRAAVTEGKLYD
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              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 SILRVEAVDADCSPQFSQICSYEIITPDVPFTVDKDGYIKNTEKLNYGKEHQYKLTVTAY
        ::::::.:.:::::.:::: :::.::..:: .:.:: :.:::::.:. :. ::.:::::
NP_055 RILRVEAIDGDCSPQYSQICYYEILTPNTPFLIDNDGNIENTEKLQYSGERLYKFTVTAY
             170       180       190       200       210       220 

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 DCGKKRATEDVLVKISIKPTCTPGWQGWNNRIEYEPGTGALAVFPNIHLETCDEPVASVQ
       :::::::..:. :.:..:::: :.:::::.:::: ::.:.::.::.:.:::::::. ..:
NP_055 DCGKKRAADDAEVEIQVKPTCKPSWQGWNKRIEYAPGAGSLALFPGIRLETCDEPLWNIQ
             230       240       250       260       270       280 

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 ATVELETSHIGKGCDRDTYSEKSLHRLCGAAAGTAELLPSPSGSLNWTMGLPTDNGHDSD
       ::.::.:::..::::::.:::..:..:::::.: ..::: :. . ::: :: .  ..::.
NP_055 ATIELQTSHVAKGCDRDNYSERALRKLCGAATGEVDLLPMPGPNANWTAGLSVHYSQDSS
             290       300       310       320       330       340 

              370          380           390          400          
pF1KA0 QVFEFNGTQAVRIPDGVVS---VSPKEP----FTISVWMRHG--PF-GRKKE-TILCSSD
        .. :::::::..: :  :    .:..     ::.: ::.::  :  :.:.: ::.:.. 
NP_055 LIYWFNGTQAVQVPLGGPSGLGSGPQDSLSDHFTLSFWMKHGVTPNKGKKEEETIVCNTV
             350       360       370       380       390       400 

     410       420       430       440       450       460         
pF1KA0 KTDMNRHHYSLYVHGCRLIFLFRQDPSEEKKYRPAEFHWKLNQVCDEEWHHYVLNVEFPS
       ... .  :::: :::::. ::.   :  :.  ::..: :::.::::.:::::.::.:::.
NP_055 QNEDGFSHYSLTVHGCRIAFLYW--PLLESA-RPVKFLWKLEQVCDDEWHHYALNLEFPT
             410       420         430        440       450        

     470       480       490       500       510       520         
pF1KA0 VTLYVDGTSHEPFSVTEDYPLHPSKIETQLVVGACWQEFSGVENDNETEPVTVASAGGDL
       ::::.:: : .:  . ..  .:: . :  :..:::: : .. :.. . .  : .. :  :
NP_055 VTLYTDGISFDPALIHDNGLIHPPRREPALMIGACWTEEKNKEKE-KGDNSTDTTQGDPL
      460       470       480       490       500        510       

     530       540       550       560       570       580         
pF1KA0 HMTQFFRGNLAGLTLRSGKLADKKVIDCLYTCKEGLDLQVLEDSGRGVQIQAHPSQLVLT
        . ..:.: :::...:::.: ...::.:::.:.:::: . .:. :.:......::: .::
NP_055 SIHHYFHGYLAGFSVRSGRLESREVIECLYACREGLDYRDFESLGKGMKVHVNPSQSLLT
       520       530       540       550       560       570       

     590       600       610       620       630       640         
pF1KA0 LEGEDLGELDKAMQHISYLNSRQFPTPGIRRLKITSTIKCFNEATCISVPPVDGYVMVLQ
       :::.:.  ...:.::..:.:. .: :::.: :..:...:::.: .:.:.: :.:::.:::
NP_055 LEGDDVETFNHALQHVAYMNTLRFATPGVRPLRLTTAVKCFSEESCVSIPEVEGYVVVLQ
       580       590       600       610       620       630       

     650       660       670       680       690       700         
pF1KA0 PEEPKISLSGVHHFARAASEFESSEGVFLFPELRIISTITREVEPEGDGAEDPTVQESLV
       :. :.: :::. :::: : .::...:: :::.:.:  .:...:: . : . . :: .. .
NP_055 PDAPQILLSGTAHFARPAVDFEGTNGVPLFPDLQITCSISHQVEAKKDESWQGTVTDTRM
       640       650       660       670       680       690       

     710       720       730       740       750       760         
pF1KA0 SEEIVHDLDTCEVTVEGEELNHEQESLEVDMARLQQKGIEVSSSELGMTFTGVDTMASYE
       :.::::.:: ::... :..:. :.::: .: . :::.:.:....   .:..::.... ::
NP_055 SDEIVHNLDGCEISLVGDDLDPERESLLLDTTSLQQRGLELTNTSAYLTIAGVESITVYE
       700       710       720       730       740       750       

     770       780       790       800       810       820         
pF1KA0 EVLHLLRYRNWHARSLLDRKFKLICSELNGRYISNEFKVEVNVIHTANPMEHANHMAAQP
       :.:.  :::  :. .:  :::.: :::.:::: :::: :::::.:. : . : .:. .. 
NP_055 EILRQARYRLRHGAALYTRKFRLSCSEMNGRYSSNEFIVEVNVLHSMNRVAHPSHVLSSQ
       760       770       780       790       800       810       

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pF1KA0 QFVHPEHRSFVDLSGHNLANPHPFAVVPSTATVVIVVCVSFLVFMIILGVFRIRAAHRRT
       ::.:  :.   ...::.::. :  ...::.::..:::::.:::.:..::. ::.. :::.
NP_055 QFLHRGHQPPPEMAGHSLASSHRNSMIPSAATLIIVVCVGFLVLMVVLGLVRIHSLHRRV
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pF1KA0 MRD------QDTGKENEMDWDDSALTITVNPMETYEDQHS--SEEEEEEEEEEESEDGEE
                ..  :. .. :::::::: :::::.:....:  .     ..:.:.: :.: 
NP_055 SGAGGPPGASSDPKDPDLFWDDSALTIIVNPMESYQNRQSCVTGAVGGQQEDEDSSDSEV
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pF1KA0 EDDITSAESESSEEEEGEQGDPQNATRQQQLEWDDSTLSY
        :. .: :                                
NP_055 ADSPSSDERRIIETPPHRY                     
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       :...:::::::::.::::.:.:::::::::..::::::.:::: :. :.:.: ::: :: 
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pF1KA0 TVELETSHIGKGCDRDTYSEKSLHRLCGAAAGTAELLPSPSGSLNWTMGLPTDNGHDSDQ
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pF1KA0 TLYVDGTSHEPFSVTEDYPLHPSKIETQLVVGACWQEFSGVENDNETEPVTVASAGGDLH
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XP_006 DEIVHNLDGCEISLVGDDLDPERESLLLDTTSLQQRGLELTNTSAYLTIAGVESITVYEE
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pF1KA0 VLHLLRYRNWHARSLLDRKFKLICSELNGRYISNEFKVEVNVIHTANPMEHANHMAAQPQ
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pF1KA0 DDITSAESESSEEEEGEQGDPQNATRQQQLEWDDSTLSY
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XP_006 DSPSSDERRIIETPPHRY                     
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        ..::.:..:::::::.:::::::..::::..:  .::::::.. ::: :: .:.   :.
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XP_016 MIFKFDGRQGAKVPDGIVPKNLTDQFTITMWMKHGPSPGVRAEKETILCNSDKTEMNRHH
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pF1KA0 YSLYVHGCRLIFLFRQDPSEEKKYRPAEFHWKLNQVCDEEWHHYVLNVEFPSVTLYVDGT
       :.::::.:::.::.:.: ..   .:::::::::.:.::.:::.::.::::: ::::.::.
XP_016 YALYVHNCRLVFLLRKDFDQADTFRPAEFHWKLDQICDKEWHYYVINVEFPVVTLYMDGA
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pF1KA0 SHEPFSVTEDYPLHPSKIETQLVVGACWQEFSGVENDNETEPVTVASAGGDLHMTQFFRG
       ..::. ::.:.:.:::.:  ::.::::::   : :    :.:          ...:::.:
XP_016 TYEPYLVTNDWPIHPSHIAMQLTVGACWQ---GGE---VTKP----------QFAQFFHG
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XP_016 SLASLTIRPGKMESQKVISCLQACKEGLDINSLESLGQGIKYHFNPSQSILVMEGDDIGN
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pF1KA0 LDKAMQHISYLNSRQFPTPGIRRLKITSTIKCFNEATCISVPPVDGYVMVLQPEEPKISL
       ...:.:..::.::::::: :.::::..: ..::.: .:::.: ::.::::::  ::.:.:
XP_016 INRALQKVSYINSRQFPTAGVRRLKVSSKVQCFGEDVCISIPEVDAYVMVLQAIEPRITL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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