Result of FASTA (omim) for
pF1KA0931
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0931, 1256 aa
1>>>pF1KA0931 1256 - 1256 aa - 1256 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4123+/-0.000466; mu= 12.2432+/- 0.029
mean_var=146.5195+/-31.957, 0's: 0 Z-trim(113.4): 246 B-trim: 1248 in 1/52
Lambda= 0.105956
statistics sampled from 22350 (22671) to 22350 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.611), E-opt: 0.2 (0.266), width: 16
Scan time: 15.020
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001275932 (OMIM: 611066) PH domain leucine-rich (1256) 8297 1281.7 0
NP_055835 (OMIM: 611066) PH domain leucine-rich re (1323) 4572 712.3 5.4e-204
XP_011524188 (OMIM: 609396) PREDICTED: PH domain l (1109) 2002 319.4 8.6e-86
NP_919431 (OMIM: 609396) PH domain leucine-rich re (1717) 2002 319.5 1.2e-85
NP_001311265 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 582) 466 84.4 2.5e-15
XP_016872192 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582) 466 84.4 2.5e-15
XP_016872191 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582) 466 84.4 2.5e-15
NP_001311266 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 582) 466 84.4 2.5e-15
XP_016872193 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582) 466 84.4 2.5e-15
NP_031399 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich repea ( 582) 466 84.4 2.5e-15
NP_001255968 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 536) 434 79.5 6.9e-14
XP_016857384 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1255) 401 74.7 4.5e-12
XP_016857383 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1438) 401 74.7 5e-12
XP_016857382 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1472) 401 74.7 5.1e-12
XP_016857381 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1490) 401 74.7 5.1e-12
NP_001317564 (OMIM: 614453) leucine-rich repeat-co (1495) 401 74.7 5.1e-12
XP_016857379 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1528) 401 74.7 5.2e-12
XP_016857378 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1537) 401 74.7 5.2e-12
NP_065845 (OMIM: 614453) leucine-rich repeat-conta (1537) 401 74.7 5.2e-12
XP_016857377 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1541) 401 74.7 5.2e-12
XP_016857376 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1547) 401 74.7 5.3e-12
XP_016857374 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1594) 401 74.7 5.4e-12
XP_016857375 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1594) 401 74.7 5.4e-12
NP_056171 (OMIM: 607733) protein scribble homolog (1630) 374 70.6 9.6e-11
NP_874365 (OMIM: 607733) protein scribble homolog (1655) 374 70.6 9.7e-11
XP_011513029 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 465) 345 65.8 7.7e-10
NP_060684 (OMIM: 608195) leucine-rich repeat-conta ( 524) 343 65.5 1e-09
XP_011513028 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 524) 343 65.5 1e-09
XP_016866486 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 331) 318 61.6 1e-08
XP_006714723 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1246) 295 58.5 3.3e-07
XP_016865126 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1298) 295 58.5 3.5e-07
NP_001006600 (OMIM: 606944) erbin isoform 7 [Homo (1302) 295 58.5 3.5e-07
NP_001240627 (OMIM: 606944) erbin isoform 4 [Homo (1346) 295 58.5 3.6e-07
NP_001240630 (OMIM: 606944) erbin isoform 9 [Homo (1367) 295 58.5 3.6e-07
NP_061165 (OMIM: 606944) erbin isoform 2 [Homo sap (1371) 295 58.5 3.6e-07
NP_001240626 (OMIM: 606944) erbin isoform 1 [Homo (1412) 295 58.5 3.7e-07
XP_016865125 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1415) 295 58.5 3.7e-07
NP_001240628 (OMIM: 606944) erbin isoform 8 [Homo (1419) 295 58.5 3.7e-07
XP_005248612 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1456) 295 58.5 3.8e-07
XP_005248611 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1460) 295 58.5 3.8e-07
XP_016865124 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1460) 295 58.5 3.8e-07
XP_011542154 (OMIM: 605352) PREDICTED: malignant f (1003) 282 56.4 1.1e-06
NP_004216 (OMIM: 605352) malignant fibrous histioc (1052) 282 56.4 1.2e-06
NP_640338 (OMIM: 611931) protein phosphatase 1L is ( 360) 263 53.2 3.7e-06
XP_005252609 (OMIM: 179555) PREDICTED: ras suppres ( 277) 251 51.3 1.1e-05
NP_036557 (OMIM: 179555) ras suppressor protein 1 ( 277) 249 51.0 1.3e-05
NP_001017403 (OMIM: 606653) leucine-rich repeat-co ( 967) 258 52.7 1.4e-05
NP_067649 (OMIM: 606653) leucine-rich repeat-conta ( 915) 257 52.6 1.5e-05
XP_016857485 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 876) 255 52.2 1.8e-05
XP_011508141 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 900) 255 52.3 1.8e-05
>>NP_001275932 (OMIM: 611066) PH domain leucine-rich rep (1256 aa)
initn: 8297 init1: 8297 opt: 8297 Z-score: 6861.0 bits: 1281.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8297; 100.0% identity (100.0% similar) in 1256 aa overlap (1-1256:1-1256)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MKRNGSRNCLNRRSRFGSRERDWLREDVKRGCVYLYGADTTTATTTTTTSSSSSSSSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MKRNGSRNCLNRRSRFGSRERDWLREDVKRGCVYLYGADTTTATTTTTTSSSSSSSSSSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 DLHLVLCTVETPASEICAGEGRESLYLQLHGDLVRRLEPTERPLQIVYDYLSRLGFDDPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLHLVLCTVETPASEICAGEGRESLYLQLHGDLVRRLEPTERPLQIVYDYLSRLGFDDPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 RIQEEATNPDLGCMIRFYGEKPCHMDRLDRILLSGIYNVRKGKTQLHKWAERLVVLCGTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RIQEEATNPDLGCMIRFYGEKPCHMDRLDRILLSGIYNVRKGKTQLHKWAERLVVLCGTC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LIVSSVKDCQTGKMHILPLVGGKIEEVKRRQYSLAFSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LIVSSVKDCQTGKMHILPLVGGKIEEVKRRQYSLAFSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 RQASKVVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDITYLNLRHNFMQLERPGGLDTLYKFSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RQASKVVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDITYLNLRHNFMQLERPGGLDTLYKFSQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 PEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 DLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRLTDLDLSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRLTDLDLSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SLRTLYASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLRTLYASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 PVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIPLEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNKLNKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIPLEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNKLNKL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 EQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 ILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTTDSTVTSTFWSHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTTDSTVTSTFWSHG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 LAEMAGQRNKLCVSALAMDSFAEGVGAVYGMFDGDRNEELPRLLQCTMADVLLEEVQQST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAEMAGQRNKLCVSALAMDSFAEGVGAVYGMFDGDRNEELPRLLQCTMADVLLEEVQQST
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 NDTVFMANTFLVSHRKLGMAGQKLGSSALLCYIRPDTADPASSFSLTVANVGTCQAVLCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDTVFMANTFLVSHRKLGMAGQKLGSSALLCYIRPDTADPASSFSLTVANVGTCQAVLCR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 GGKPVPLSKVFSLEQDPEEAQRVKDQKAIITEDNKVNGVTCCTRMLGCTYLYPWILPKPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGKPVPLSKVFSLEQDPEEAQRVKDQKAIITEDNKVNGVTCCTRMLGCTYLYPWILPKPH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 ISSTPLTIQDELLILGNKALWEHLSYTEAVNAVRHVQDPLAAAKKLCTLAQSYGCQDNVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISSTPLTIQDELLILGNKALWEHLSYTEAVNAVRHVQDPLAAAKKLCTLAQSYGCQDNVG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 AMVVYLNIGEEGCTCEMNGLTLPGPVGFASTTTIKDAPKPATPSSSSGIASEFSSEMSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AMVVYLNIGEEGCTCEMNGLTLPGPVGFASTTTIKDAPKPATPSSSSGIASEFSSEMSTS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 EVSSEVGSTASDEHNAGGLDTALLPRPERRCSLHPTPTSGLFQRQPSSATFSSNQSDNGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVSSEVGSTASDEHNAGGLDTALLPRPERRCSLHPTPTSGLFQRQPSSATFSSNQSDNGL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 DSDDDQPVEGVITNGSKVEVEVDIHCCRGRDLENSPPLIESSPTLCSEEHARGSCFGIRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DSDDDQPVEGVITNGSKVEVEVDIHCCRGRDLENSPPLIESSPTLCSEEHARGSCFGIRR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 QNSVNSGMLLPMSKDRMELQKSPSTSCLYGKKLSNGSIVPLEDSLNLIEVATEVPKRKTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QNSVNSGMLLPMSKDRMELQKSPSTSCLYGKKLSNGSIVPLEDSLNLIEVATEVPKRKTG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 YFAAPTQMEPEDQFVVPHDLEEEVKEQMKQHQDSRLEPEPHEEDRTEPPEEFDTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YFAAPTQMEPEDQFVVPHDLEEEVKEQMKQHQDSRLEPEPHEEDRTEPPEEFDTAL
1210 1220 1230 1240 1250
>>NP_055835 (OMIM: 611066) PH domain leucine-rich repeat (1323 aa)
initn: 4387 init1: 4387 opt: 4572 Z-score: 3783.3 bits: 712.3 E(85289): 5.4e-204
Smith-Waterman score: 7901; 94.8% identity (94.8% similar) in 1288 aa overlap (36-1256:36-1323)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 SRNCLNRRSRFGSRERDWLREDVKRGCVYLYGADTTTATTTTTTSSSSSSSSSSSDLHLV
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SRNCLNRRSRFGSRERDWLREDVKRGCVYLYGADTTTATTTTTTSSSSSSSSSSSDLHLV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LCTVETPASEICAGEGRESLYLQLHGDLVRRLEPTERPLQIVYDYLSRLGFDDPVRIQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LCTVETPASEICAGEGRESLYLQLHGDLVRRLEPTERPLQIVYDYLSRLGFDDPVRIQEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 ATNPDLGCMIRFYGEKPCHMDRLDRILLSGIYNVRKGKTQLHKWAERLVVLCGTCLIVSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ATNPDLGCMIRFYGEKPCHMDRLDRILLSGIYNVRKGKTQLHKWAERLVVLCGTCLIVSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 VKDCQTGKMHILPLVGGKIEEVKRRQYSLAFSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VKDCQTGKMHILPLVGGKIEEVKRRQYSLAFSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDITYLNLRHNFMQLERPGGLDTLYKFSQLKGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDITYLNLRHNFMQLERPGGLDTLYKFSQLKGLN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 NLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 HLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRLTDLDLSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGFSLRTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRLTDLDLSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGFSLRTL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 YASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRIL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KA0 SSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIPLEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALN----------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIPLEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNLRYLNASANS
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 ---------------------------------------------------------KLN
:::
NP_055 LESLPSACTGEESLSMLQLLYLTNNLLTDQCIPVLVGHLHLRILHLANNQLQTFPASKLN
610 620 630 640 650 660
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 KLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDL
670 680 690 700 710 720
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 TEILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTTDSTVTSTFWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TEILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTTDSTVTSTFWS
730 740 750 760 770 780
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 HGLAEMAGQRNKLCVSALAMDSFAEGVGAVYGMFDGDRNEELPRLLQCTMADVLLEEVQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HGLAEMAGQRNKLCVSALAMDSFAEGVGAVYGMFDGDRNEELPRLLQCTMADVLLEEVQQ
790 800 810 820 830 840
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 STNDTVFMANTFLVSHRKLGMAGQKLGSSALLCYIRPDTADPASSFSLTVANVGTCQAVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 STNDTVFMANTFLVSHRKLGMAGQKLGSSALLCYIRPDTADPASSFSLTVANVGTCQAVL
850 860 870 880 890 900
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 CRGGKPVPLSKVFSLEQDPEEAQRVKDQKAIITEDNKVNGVTCCTRMLGCTYLYPWILPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 CRGGKPVPLSKVFSLEQDPEEAQRVKDQKAIITEDNKVNGVTCCTRMLGCTYLYPWILPK
910 920 930 940 950 960
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 PHISSTPLTIQDELLILGNKALWEHLSYTEAVNAVRHVQDPLAAAKKLCTLAQSYGCQDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PHISSTPLTIQDELLILGNKALWEHLSYTEAVNAVRHVQDPLAAAKKLCTLAQSYGCQDN
970 980 990 1000 1010 1020
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 VGAMVVYLNIGEEGCTCEMNGLTLPGPVGFASTTTIKDAPKPATPSSSSGIASEFSSEMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VGAMVVYLNIGEEGCTCEMNGLTLPGPVGFASTTTIKDAPKPATPSSSSGIASEFSSEMS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 TSEVSSEVGSTASDEHNAGGLDTALLPRPERRCSLHPTPTSGLFQRQPSSATFSSNQSDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TSEVSSEVGSTASDEHNAGGLDTALLPRPERRCSLHPTPTSGLFQRQPSSATFSSNQSDN
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 GLDSDDDQPVEGVITNGSKVEVEVDIHCCRGRDLENSPPLIESSPTLCSEEHARGSCFGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GLDSDDDQPVEGVITNGSKVEVEVDIHCCRGRDLENSPPLIESSPTLCSEEHARGSCFGI
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 RRQNSVNSGMLLPMSKDRMELQKSPSTSCLYGKKLSNGSIVPLEDSLNLIEVATEVPKRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RRQNSVNSGMLLPMSKDRMELQKSPSTSCLYGKKLSNGSIVPLEDSLNLIEVATEVPKRK
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 TGYFAAPTQMEPEDQFVVPHDLEEEVKEQMKQHQDSRLEPEPHEEDRTEPPEEFDTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TGYFAAPTQMEPEDQFVVPHDLEEEVKEQMKQHQDSRLEPEPHEEDRTEPPEEFDTAL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
>--
initn: 252 init1: 252 opt: 252 Z-score: 214.4 bits: 51.9 E(85289): 3.3e-05
Smith-Waterman score: 252; 100.0% identity (100.0% similar) in 35 aa overlap (1-35:1-35)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MKRNGSRNCLNRRSRFGSRERDWLREDVKRGCVYLYGADTTTATTTTTTSSSSSSSSSSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MKRNGSRNCLNRRSRFGSRERDWLREDVKRGCVYLYGADTTTATTTTTTSSSSSSSSSSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 DLHLVLCTVETPASEICAGEGRESLYLQLHGDLVRRLEPTERPLQIVYDYLSRLGFDDPV
NP_055 DLHLVLCTVETPASEICAGEGRESLYLQLHGDLVRRLEPTERPLQIVYDYLSRLGFDDPV
70 80 90 100 110 120
>>XP_011524188 (OMIM: 609396) PREDICTED: PH domain leuci (1109 aa)
initn: 2240 init1: 1096 opt: 2002 Z-score: 1661.2 bits: 319.4 E(85289): 8.6e-86
Smith-Waterman score: 2071; 50.4% identity (73.7% similar) in 639 aa overlap (84-649:470-1108)
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 SSSSSSSDLHLVLCTVETPASEICAGEGRESLYLQLHGDLVRRLEPTERPLQIVYDYLSR
.::.::::. .:::: :.:::: ::: .
XP_011 AAAVAPGGLQSTPGRSGVTAEKAPPPPPPPTLYVQLHGETTRRLEAEEKPLQIQNDYLFQ
440 450 460 470 480 490
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LGFDDPVRIQEEATNPDLGCMIRFYGEKPCHMDRLDRILLSGIYNVRKGKTQL--HKWAE
::: . :.:::. . ..::.::::. :: .:: :::.::::::: :: ..:..
XP_011 LGFGELWRVQEEGMDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGMYNVRKGKMQLPVNRWTR
500 510 520 530 540 550
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 RLVVLCGTCLIVSSVKDCQTGKMHILPLVGGKIEEVKRRQYSLAFSSAGAQAQTYHVSFE
: :.::::::::::::: :::::.:::.:::.::::..:. :::::.: :.:::.. :.
XP_011 RQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCLAFSSSGPQSQTYYICFD
560 570 580 590 600 610
240 250 260 270 280
pF1KA0 TLAEYQRWQRQASKVVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDITYLNLRHNFMQ----LE
:..:: :: ::.:::.:::::.::::: :::..: .::::::.:.:::..::.. :
XP_011 TFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDLTHLNLKQNFLRQNPSLP
620 630 640 650 660 670
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 RPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNL
::. : .:..::.::::.:.:: ::. .: : ::.:::.:::.....:. .: . ::
XP_011 AARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVSCNALRSVPAAVGVMHNL
680 690 700 710 720 730
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 QTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLN
::. :::::: .:: :: :..::: ::.:::.:..:::: :::: .:.. :.:::.:.:
XP_011 QTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKLTAVDKLCMSGNCVETLR
740 750 760 770 780 790
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 LGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRLTDLDLSSLCSLEQLHC
: .: .: ::::::::.: .. .. .... .:.:..:::::.: ::: . ..: :::
XP_011 LQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNKLGDLDAMIFNNIEVLHC
800 810 820 830 840 850
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 GRNQLRELTLSGFSLRTLYASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKI
:::: : . :. :..::::::.:. ..:::::. :...:.::: :: ::.:.::..:.
XP_011 ERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVSRNRLENVPEWVCESRKL
860 870 880 890 900 910
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 EVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIPLEVLDLQHNALTRLPD
::::...: . :.:.:.. . :::::. :::.. :: .:. .::::.::: : .::
XP_011 EVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERTSVEVLDVQHNQLLELPP
920 930 940 950 960 970
590
pF1KA0 TLFSKA-----LN-----------------------------------------------
.:. :: ::
XP_011 NLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNNSLTDKCVPLLTGHPHLK
980 990 1000 1010 1020 1030
600 610 620 630 640
pF1KA0 ---------------KLNKLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFP
:. :::.:::..:::::::.::::: ::.:.::..:::: : .::
XP_011 ILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCRRMHTVIAHSNCIEVFP
1040 1050 1060 1070 1080 1090
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 EILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKI
:..:::.:.
XP_011 EVMQLPEIKD
1100
>>NP_919431 (OMIM: 609396) PH domain leucine-rich repeat (1717 aa)
initn: 2843 init1: 1096 opt: 2002 Z-score: 1658.5 bits: 319.5 E(85289): 1.2e-85
Smith-Waterman score: 4029; 51.8% identity (75.5% similar) in 1233 aa overlap (84-1230:470-1680)
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 SSSSSSSDLHLVLCTVETPASEICAGEGRESLYLQLHGDLVRRLEPTERPLQIVYDYLSR
.::.::::. .:::: :.:::: ::: .
NP_919 AAAVAPGGLQSTPGRSGVTAEKAPPPPPPPTLYVQLHGETTRRLEAEEKPLQIQNDYLFQ
440 450 460 470 480 490
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LGFDDPVRIQEEATNPDLGCMIRFYGEKPCHMDRLDRILLSGIYNVRKGKTQL--HKWAE
::: . :.:::. . ..::.::::. :: .:: :::.::::::: :: ..:..
NP_919 LGFGELWRVQEEGMDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGMYNVRKGKMQLPVNRWTR
500 510 520 530 540 550
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 RLVVLCGTCLIVSSVKDCQTGKMHILPLVGGKIEEVKRRQYSLAFSSAGAQAQTYHVSFE
: :.::::::::::::: :::::.:::.:::.::::..:. :::::.: :.:::.. :.
NP_919 RQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCLAFSSSGPQSQTYYICFD
560 570 580 590 600 610
240 250 260 270 280
pF1KA0 TLAEYQRWQRQASKVVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDITYLNLRHNFMQ----LE
:..:: :: ::.:::.:::::.::::: :::..: .::::::.:.:::..::.. :
NP_919 TFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDLTHLNLKQNFLRQNPSLP
620 630 640 650 660 670
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 RPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNL
::. : .:..::.::::.:.:: ::. .: : ::.:::.:::.....:. .: . ::
NP_919 AARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVSCNALRSVPAAVGVMHNL
680 690 700 710 720 730
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 QTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLN
::. :::::: .:: :: :..::: ::.:::.:..:::: :::: .:.. :.:::.:.:
NP_919 QTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKLTAVDKLCMSGNCVETLR
740 750 760 770 780 790
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 LGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRLTDLDLSSLCSLEQLHC
: .: .: ::::::::.: .. .. .... .:.:..:::::.: ::: . ..: :::
NP_919 LQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNKLGDLDAMIFNNIEVLHC
800 810 820 830 840 850
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 GRNQLRELTLSGFSLRTLYASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKI
:::: : . :. :..::::::.:. ..:::::. :...:.::: :: ::.:.::..:.
NP_919 ERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVSRNRLENVPEWVCESRKL
860 870 880 890 900 910
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 EVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIPLEVLDLQHNALTRLPD
::::...: . :.:.:.. . :::::. :::.. :: .:. .::::.::: : .::
NP_919 EVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERTSVEVLDVQHNQLLELPP
920 930 940 950 960 970
590
pF1KA0 TLFSKA-----LN-----------------------------------------------
.:. :: ::
NP_919 NLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNNSLTDKCVPLLTGHPHLK
980 990 1000 1010 1020 1030
600 610 620 630 640
pF1KA0 ---------------KLNKLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFP
:. :::.:::..:::::::.::::: ::.:.::..:::: : .::
NP_919 ILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCRRMHTVIAHSNCIEVFP
1040 1050 1060 1070 1080 1090
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 EILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKI
:..:::.:. ::::::.:.:. .:: :: ::.:::::: :::.::::.....: .::
NP_919 EVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLVLDHKTLELLNNIRCFKI
1100 1110 1120 1130 1140 1150
710 720 730 740 750
pF1KA0 DQKPLPTT-DSTVTSTFWSHGLAEMAGQRNKLCVSALAMDSFAEGVGAVYGMFDGDRNEE
:: :.: :.. . . :::: .: .: .:::::.::....: .. :.::.:::::: :
NP_919 DQ---PSTGDASGAPAVWSHGYTEASGVKNKLCVAALSVNNFCDNREALYGVFDGDRNVE
1160 1170 1180 1190 1200 1210
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 LPRLLQCTMADVLLEEVQQSTNDTVFMANTFLVSHRKLGMAGQKLGSSALLCYIRPDTAD
.: ::::::.:.: ::.:.. :. .:.:::.: .:::: ::::::..:.::.:. : .:
NP_919 VPYLLQCTMSDILAEELQKTKNEEEYMVNTFIVMQRKLGTAGQKLGGAAVLCHIKHDPVD
1220 1230 1240 1250 1260 1270
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 PASSFSLTVANVGTCQAVLCRGGKPVPLSKVFSLEQDPEEAQRVKDQKAIITEDNKVNGV
:..::.:: :::: ::.::::.:::.:::. . . . :: .:.:..:::::::.:::::
NP_919 PGGSFTLTSANVGKCQTVLCRNGKPLPLSRSYIMSCE-EELKRIKQHKAIITEDGKVNGV
1280 1290 1300 1310 1320 1330
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 TCCTRMLGCTYLYPWILPKPHISSTPLTIQDELLILGNKALWEHLSYTEAVNAVRHVQDP
: ::.:: :.:.: ..:.::..:. :: :::..:::.:.::. :: :::.:::.: :
NP_919 TESTRILGYTFLHPSVVPRPHVQSVLLTPQDEFFILGSKGLWDSLSVEEAVEAVRNVPDA
1340 1350 1360 1370 1380 1390
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 LAAAKKLCTLAQSYGCQDNVGAMVVYLNIGEEG-CTCEMN-GLTLPGPVG--FASTTT--
::::::::::::::::.:...:.:: :.. :.. : ::.. : ..: : : ...
NP_919 LAAAKKLCTLAQSYGCHDSISAVVVQLSVTEDSFCCCELSAGGAVPPPSPGIFPPSVNMV
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 IKDAPKPA--TPSSSSGIASEFSSEMSTSEVSSEVGSTASDEHNAGGLDTALLPRP-ERR
::: :. . .::::::.:::.:::.::::.::::::::::: :.:. : :.:
NP_919 IKDRPSDGLGVPSSSSGMASEISSELSTSEMSSEVGSTASDEPPPGALSENSPAYPSEQR
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 CSLHPTPTSGLFQRQPSSATFSSNQSDNGLDSDDDQPVEGVITNGSKVEVEVDIHCCRGR
: ::: :. :::: ::::::: :::::::::..:.:::.::::.::::::::: :..
NP_919 CMLHPICLSNSFQRQLSSATFSSAFSDNGLDSDDEEPIEGVFTNGSRVEVEVDIHCSRAK
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA0 DLENSPPLIESSPTLCSEEHARGSCFGIRRQNSVNSGMLLPMSKDRMELQKSPSTSCL--
. :.. :.. :. :.: :... ..:. : .. . : .
NP_919 EKEKQQHLLQV-PAEASDE-----------------GIVISANEDEPGLPRKADFSAVGT
1580 1590 1600 1610
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA0 YGKKLSNGSIVPLEDSLNLIEVATEVPKRKTG-YFAAPTQMEPEDQFVVPHDLEEEVKEQ
:.. .:::..: : : :.:::::..: :: : :::::.: .:.:::..: .:::::::
NP_919 IGRRRANGSVAPQERSHNVIEVATDAPLRKPGGYFAAPAQPDPDDQFIIPPELEEEVKEI
1620 1630 1640 1650 1660 1670
1230 1240 1250
pF1KA0 MKQHQDSRLEPEPHEEDRTEPPEEFDTAL
::.
NP_919 MKHHQEQQQQQQPPPPPQLQPQLPRHYQLDQLPDYYDTPL
1680 1690 1700 1710
>>NP_001311265 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich repeat (582 aa)
initn: 272 init1: 229 opt: 466 Z-score: 396.2 bits: 84.4 E(85289): 2.5e-15
Smith-Waterman score: 466; 27.1% identity (57.9% similar) in 484 aa overlap (180-648:97-560)
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 RILLSGIYNVRKGKTQLHKWAERLVVLCGTCLIVSSVK-DCQTGKMHILPLVGGKIEEVK
: .:.. : . ..:::: .. ..
NP_001 SVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMRLDLSKRSIHILPSSIKELTQLT
70 80 90 100 110 120
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 R-RQYSLAFSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASKVVS--QRISTVDLSCYSLEEVP
. :: ..: :.. :.. ::: . . .. ... .:: .:.:.:
NP_001 ELYLYSNKLQSLPAEVGCL-VNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLREIP
130 140 150 160 170 180
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 EHLFYSQDITYLNLRHNFMQ-LERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTL
.. ...: : :: : . .:. . ..:.:. :.. .::. .: . :. .:
NP_001 SVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVEKD-----IKNLSKLSMLSIRENKIKQLPAEIGELCNL
190 200 210 220 230 240
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 TELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIP
:... : .. ::..::: .. .: :. : : ::. .:::..:: ::. .: .: ::
NP_001 ITLDVAHNQLEHLPKEIGNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIP
250 260 270 280 290 300
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 EVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHV
. : . :... . .: . .: ..:. . ... . : : .. . . . . : .
NP_001 RSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSL
310 320 330 340 350 360
450 460 470 480 490
pF1KA0 DLRDNRLTDLDL---SSLCSLEQLHCGRNQLRELTL---SGFSLRTLYASSNRLTAV--N
... ::.. . . : : .:. ::: : : . :. : ..:.:: . .
NP_001 NMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPED
370 380 390 400 410 420
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 VYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLG
: . :: ... :: :::. .: . .:.. ::. : : .: .: .:.::.:
NP_001 VSGLVSLEVLI-LSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLT
430 440 450 460 470
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 HNHVQNLPTLVEHIP-LEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNKLNKLEQLEELNLSGN-KLK
.:.. .:: . :. : : : .: ::.::. ... ::.:::: :. : .:.
NP_001 NNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPE--------EIGTLENLEELYLNDNPNLH
480 490 500 510 520 530
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 TIPTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDL
..: .: :..: . .. .: .: :::
NP_001 SLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLP-----PQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV
540 550 560 570 580
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 DLTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTTDSTVTSTFWSHGLAEMAGQRNKLCVS
>>XP_016872192 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leucine- (582 aa)
initn: 272 init1: 229 opt: 466 Z-score: 396.2 bits: 84.4 E(85289): 2.5e-15
Smith-Waterman score: 466; 27.1% identity (57.9% similar) in 484 aa overlap (180-648:97-560)
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 RILLSGIYNVRKGKTQLHKWAERLVVLCGTCLIVSSVK-DCQTGKMHILPLVGGKIEEVK
: .:.. : . ..:::: .. ..
XP_016 SVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMRLDLSKRSIHILPSSIKELTQLT
70 80 90 100 110 120
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 R-RQYSLAFSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASKVVS--QRISTVDLSCYSLEEVP
. :: ..: :.. :.. ::: . . .. ... .:: .:.:.:
XP_016 ELYLYSNKLQSLPAEVGCL-VNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLREIP
130 140 150 160 170 180
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 EHLFYSQDITYLNLRHNFMQ-LERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTL
.. ...: : :: : . .:. . ..:.:. :.. .::. .: . :. .:
XP_016 SVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVEKD-----IKNLSKLSMLSIRENKIKQLPAEIGELCNL
190 200 210 220 230 240
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 TELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIP
:... : .. ::..::: .. .: :. : : ::. .:::..:: ::. .: .: ::
XP_016 ITLDVAHNQLEHLPKEIGNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIP
250 260 270 280 290 300
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 EVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHV
. : . :... . .: . .: ..:. . ... . : : .. . . . . : .
XP_016 RSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSL
310 320 330 340 350 360
450 460 470 480 490
pF1KA0 DLRDNRLTDLDL---SSLCSLEQLHCGRNQLRELTL---SGFSLRTLYASSNRLTAV--N
... ::.. . . : : .:. ::: : : . :. : ..:.:: . .
XP_016 NMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPED
370 380 390 400 410 420
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 VYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLG
: . :: ... :: :::. .: . .:.. ::. : : .: .: .:.::.:
XP_016 VSGLVSLEVLI-LSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLT
430 440 450 460 470
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 HNHVQNLPTLVEHIP-LEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNKLNKLEQLEELNLSGN-KLK
.:.. .:: . :. : : : .: ::.::. ... ::.:::: :. : .:.
XP_016 NNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPE--------EIGTLENLEELYLNDNPNLH
480 490 500 510 520 530
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 TIPTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDL
..: .: :..: . .. .: .: :::
XP_016 SLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLP-----PQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV
540 550 560 570 580
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 DLTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTTDSTVTSTFWSHGLAEMAGQRNKLCVS
>>XP_016872191 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leucine- (582 aa)
initn: 272 init1: 229 opt: 466 Z-score: 396.2 bits: 84.4 E(85289): 2.5e-15
Smith-Waterman score: 466; 27.1% identity (57.9% similar) in 484 aa overlap (180-648:97-560)
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 RILLSGIYNVRKGKTQLHKWAERLVVLCGTCLIVSSVK-DCQTGKMHILPLVGGKIEEVK
: .:.. : . ..:::: .. ..
XP_016 SVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMRLDLSKRSIHILPSSIKELTQLT
70 80 90 100 110 120
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 R-RQYSLAFSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASKVVS--QRISTVDLSCYSLEEVP
. :: ..: :.. :.. ::: . . .. ... .:: .:.:.:
XP_016 ELYLYSNKLQSLPAEVGCL-VNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLREIP
130 140 150 160 170 180
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 EHLFYSQDITYLNLRHNFMQ-LERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTL
.. ...: : :: : . .:. . ..:.:. :.. .::. .: . :. .:
XP_016 SVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVEKD-----IKNLSKLSMLSIRENKIKQLPAEIGELCNL
190 200 210 220 230 240
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 TELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIP
:... : .. ::..::: .. .: :. : : ::. .:::..:: ::. .: .: ::
XP_016 ITLDVAHNQLEHLPKEIGNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIP
250 260 270 280 290 300
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 EVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHV
. : . :... . .: . .: ..:. . ... . : : .. . . . . : .
XP_016 RSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSL
310 320 330 340 350 360
450 460 470 480 490
pF1KA0 DLRDNRLTDLDL---SSLCSLEQLHCGRNQLRELTL---SGFSLRTLYASSNRLTAV--N
... ::.. . . : : .:. ::: : : . :. : ..:.:: . .
XP_016 NMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPED
370 380 390 400 410 420
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 VYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLG
: . :: ... :: :::. .: . .:.. ::. : : .: .: .:.::.:
XP_016 VSGLVSLEVLI-LSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLT
430 440 450 460 470
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 HNHVQNLPTLVEHIP-LEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNKLNKLEQLEELNLSGN-KLK
.:.. .:: . :. : : : .: ::.::. ... ::.:::: :. : .:.
XP_016 NNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPE--------EIGTLENLEELYLNDNPNLH
480 490 500 510 520 530
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 TIPTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDL
..: .: :..: . .. .: .: :::
XP_016 SLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLP-----PQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV
540 550 560 570 580
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 DLTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTTDSTVTSTFWSHGLAEMAGQRNKLCVS
>>NP_001311266 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich repeat (582 aa)
initn: 272 init1: 229 opt: 466 Z-score: 396.2 bits: 84.4 E(85289): 2.5e-15
Smith-Waterman score: 466; 27.1% identity (57.9% similar) in 484 aa overlap (180-648:97-560)
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 RILLSGIYNVRKGKTQLHKWAERLVVLCGTCLIVSSVK-DCQTGKMHILPLVGGKIEEVK
: .:.. : . ..:::: .. ..
NP_001 SVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMRLDLSKRSIHILPSSIKELTQLT
70 80 90 100 110 120
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 R-RQYSLAFSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASKVVS--QRISTVDLSCYSLEEVP
. :: ..: :.. :.. ::: . . .. ... .:: .:.:.:
NP_001 ELYLYSNKLQSLPAEVGCL-VNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLREIP
130 140 150 160 170 180
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 EHLFYSQDITYLNLRHNFMQ-LERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTL
.. ...: : :: : . .:. . ..:.:. :.. .::. .: . :. .:
NP_001 SVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVEKD-----IKNLSKLSMLSIRENKIKQLPAEIGELCNL
190 200 210 220 230 240
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 TELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIP
:... : .. ::..::: .. .: :. : : ::. .:::..:: ::. .: .: ::
NP_001 ITLDVAHNQLEHLPKEIGNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIP
250 260 270 280 290 300
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 EVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHV
. : . :... . .: . .: ..:. . ... . : : .. . . . . : .
NP_001 RSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSL
310 320 330 340 350 360
450 460 470 480 490
pF1KA0 DLRDNRLTDLDL---SSLCSLEQLHCGRNQLRELTL---SGFSLRTLYASSNRLTAV--N
... ::.. . . : : .:. ::: : : . :. : ..:.:: . .
NP_001 NMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPED
370 380 390 400 410 420
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 VYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLG
: . :: ... :: :::. .: . .:.. ::. : : .: .: .:.::.:
NP_001 VSGLVSLEVLI-LSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLT
430 440 450 460 470
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 HNHVQNLPTLVEHIP-LEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNKLNKLEQLEELNLSGN-KLK
.:.. .:: . :. : : : .: ::.::. ... ::.:::: :. : .:.
NP_001 NNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPE--------EIGTLENLEELYLNDNPNLH
480 490 500 510 520 530
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 TIPTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDL
..: .: :..: . .. .: .: :::
NP_001 SLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLP-----PQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV
540 550 560 570 580
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 DLTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTTDSTVTSTFWSHGLAEMAGQRNKLCVS
>>XP_016872193 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leucine- (582 aa)
initn: 272 init1: 229 opt: 466 Z-score: 396.2 bits: 84.4 E(85289): 2.5e-15
Smith-Waterman score: 466; 27.1% identity (57.9% similar) in 484 aa overlap (180-648:97-560)
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 RILLSGIYNVRKGKTQLHKWAERLVVLCGTCLIVSSVK-DCQTGKMHILPLVGGKIEEVK
: .:.. : . ..:::: .. ..
XP_016 SVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMRLDLSKRSIHILPSSIKELTQLT
70 80 90 100 110 120
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 R-RQYSLAFSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASKVVS--QRISTVDLSCYSLEEVP
. :: ..: :.. :.. ::: . . .. ... .:: .:.:.:
XP_016 ELYLYSNKLQSLPAEVGCL-VNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLREIP
130 140 150 160 170 180
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 EHLFYSQDITYLNLRHNFMQ-LERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTL
.. ...: : :: : . .:. . ..:.:. :.. .::. .: . :. .:
XP_016 SVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVEKD-----IKNLSKLSMLSIRENKIKQLPAEIGELCNL
190 200 210 220 230 240
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 TELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIP
:... : .. ::..::: .. .: :. : : ::. .:::..:: ::. .: .: ::
XP_016 ITLDVAHNQLEHLPKEIGNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIP
250 260 270 280 290 300
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 EVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHV
. : . :... . .: . .: ..:. . ... . : : .. . . . . : .
XP_016 RSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSL
310 320 330 340 350 360
450 460 470 480 490
pF1KA0 DLRDNRLTDLDL---SSLCSLEQLHCGRNQLRELTL---SGFSLRTLYASSNRLTAV--N
... ::.. . . : : .:. ::: : : . :. : ..:.:: . .
XP_016 NMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPED
370 380 390 400 410 420
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 VYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLG
: . :: ... :: :::. .: . .:.. ::. : : .: .: .:.::.:
XP_016 VSGLVSLEVLI-LSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLT
430 440 450 460 470
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 HNHVQNLPTLVEHIP-LEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNKLNKLEQLEELNLSGN-KLK
.:.. .:: . :. : : : .: ::.::. ... ::.:::: :. : .:.
XP_016 NNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPE--------EIGTLENLEELYLNDNPNLH
480 490 500 510 520 530
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 TIPTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDL
..: .: :..: . .. .: .: :::
XP_016 SLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLP-----PQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV
540 550 560 570 580
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 DLTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTTDSTVTSTFWSHGLAEMAGQRNKLCVS
>>NP_031399 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich repeat pr (582 aa)
initn: 272 init1: 229 opt: 466 Z-score: 396.2 bits: 84.4 E(85289): 2.5e-15
Smith-Waterman score: 466; 27.1% identity (57.9% similar) in 484 aa overlap (180-648:97-560)
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 RILLSGIYNVRKGKTQLHKWAERLVVLCGTCLIVSSVK-DCQTGKMHILPLVGGKIEEVK
: .:.. : . ..:::: .. ..
NP_031 SVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMRLDLSKRSIHILPSSIKELTQLT
70 80 90 100 110 120
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 R-RQYSLAFSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASKVVS--QRISTVDLSCYSLEEVP
. :: ..: :.. :.. ::: . . .. ... .:: .:.:.:
NP_031 ELYLYSNKLQSLPAEVGCL-VNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLREIP
130 140 150 160 170 180
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 EHLFYSQDITYLNLRHNFMQ-LERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTL
.. ...: : :: : . .:. . ..:.:. :.. .::. .: . :. .:
NP_031 SVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVEKD-----IKNLSKLSMLSIRENKIKQLPAEIGELCNL
190 200 210 220 230 240
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 TELNLSCNGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIP
:... : .. ::..::: .. .: :. : : ::. .:::..:: ::. .: .: ::
NP_031 ITLDVAHNQLEHLPKEIGNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIP
250 260 270 280 290 300
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 EVYEKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHV
. : . :... . .: . .: ..:. . ... . : : .. . . . . : .
NP_031 RSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSL
310 320 330 340 350 360
450 460 470 480 490
pF1KA0 DLRDNRLTDLDL---SSLCSLEQLHCGRNQLRELTL---SGFSLRTLYASSNRLTAV--N
... ::.. . . : : .:. ::: : : . :. : ..:.:: . .
NP_031 NMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPED
370 380 390 400 410 420
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 VYPVPSLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLG
: . :: ... :: :::. .: . .:.. ::. : : .: .: .:.::.:
NP_031 VSGLVSLEVLI-LSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLT
430 440 450 460 470
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 HNHVQNLPTLVEHIP-LEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNKLNKLEQLEELNLSGN-KLK
.:.. .:: . :. : : : .: ::.::. ... ::.:::: :. : .:.
NP_031 NNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPE--------EIGTLENLEELYLNDNPNLH
480 490 500 510 520 530
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 TIPTTIANCKRLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDL
..: .: :..: . .. .: .: :::
NP_031 SLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLP-----PQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV
540 550 560 570 580
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 DLTGNTNLVLEHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTTDSTVTSTFWSHGLAEMAGQRNKLCVS
1256 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 01:08:35 2016 done: Fri Nov 4 01:08:37 2016
Total Scan time: 15.020 Total Display time: 0.260
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]