FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0938, 1842 aa
1>>>pF1KA0938 1842 - 1842 aa - 1842 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0338+/-0.00119; mu= 2.5647+/- 0.072
mean_var=215.3884+/-43.526, 0's: 0 Z-trim(109.0): 78 B-trim: 131 in 1/51
Lambda= 0.087390
statistics sampled from 10502 (10557) to 10502 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.324), width: 16
Scan time: 5.290
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41815.1 NAV3 gene_id:89795|Hs108|chr12 (2363) 4786 617.8 1.5e-175
CCDS66432.1 NAV3 gene_id:89795|Hs108|chr12 (2385) 4786 617.8 1.5e-175
CCDS44552.1 NAV2 gene_id:89797|Hs108|chr11 (1493) 4665 602.4 4e-171
CCDS53612.1 NAV2 gene_id:89797|Hs108|chr11 (2365) 4294 555.7 7.2e-157
CCDS7850.1 NAV2 gene_id:89797|Hs108|chr11 (2429) 4294 555.7 7.4e-157
CCDS7851.2 NAV2 gene_id:89797|Hs108|chr11 (2432) 4280 554.0 2.5e-156
CCDS58126.1 NAV2 gene_id:89797|Hs108|chr11 (2488) 3860 501.0 2.2e-140
CCDS53456.1 NAV1 gene_id:89796|Hs108|chr1 (1483) 2518 331.7 1.2e-89
CCDS1414.2 NAV1 gene_id:89796|Hs108|chr1 (1877) 2322 307.1 4.1e-82
>>CCDS41815.1 NAV3 gene_id:89795|Hs108|chr12 (2363 aa)
initn: 9026 init1: 4723 opt: 4786 Z-score: 3265.0 bits: 617.8 E(32554): 1.5e-175
Smith-Waterman score: 10756; 91.8% identity (94.6% similar) in 1850 aa overlap (24-1842:516-2363)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MQRPAELSVFRSKEVRRKGACLQKQKSL--TNLSLTSDGERRPTVRISNWFGN
:..:: .. .. . : . :::. . :.
CCDS41 EEKDQVTEMAPKKTSKIASLIPKGSKTTAAKKESLIPSSSGIPKPGSKVPTVKQTISPGS
490 500 510 520 530 540
60 70 80 90 100
pF1KA0 AAKASQREANYAERRSLSKFLSRSVQSLYHTSSSAWNLLPA--GGSQSDSEDLEELSARR
.: ... : . . : :. ::. . ..:: : . .:. : : . :.
CCDS41 TA-SKESEKFRTTKGSPSQSLSKPITMEKASASSCPAPLEGREAGQASPSGSCTMTVAQS
550 560 570 580 590 600
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 GLEGESDEDSRSEDENVSSKPSS------ISRSWAEEEGESCLREGTAHLDEEVILTMLG
. .. .. . ... :.:.. : :. .:.:: . . .. :..
CCDS41 SGQSTGNGAVQLPQQQQHSHPNTATVAPFIYRAHSENEGTALPSADSCTSPTKMDLSYSK
610 620 630 640 650 660
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 DLEQALYTDLLGEDPETRRMRTVKNIADLRQNLEETMSSLRGTQISHSTLETTFDSTVTT
.: : .. :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TAKQCL-EEISGEDPETRRMRTVKNIADLRQNLEETMSSLRGTQISHSTLETTFDSTVTT
670 680 690 700 710 720
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 EVNGRTIPNLTSRPTPMTWRLGQACPRLQAGDAPSLGAGYPRSGTSRFIHTDPSRFMYTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EVNGRTIPNLTSRPTPMTWRLGQACPRLQAGDAPSLGAGYPRSGTSRFIHTDPSRFMYTT
730 740 750 760 770 780
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 PLRRAAVSRLGNMSQIDMSEKASSDLDMSSEVDVGGYMSDGDILGKSLRTDDINSGYMTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PLRRAAVSRLGNMSQIDMSEKASSDLDMSSEVDVGGYMSDGDILGKSLRTDDINSGYMTD
790 800 810 820 830 840
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 GGLNLYTRSLNRIPDTATSRDIIQRGVHDVTVDADSWDDSSSVSSGLSDTLDNISTDDLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GGLNLYTRSLNRIPDTATSRDIIQRGVHDVTVDADSWDDSSSVSSGLSDTLDNISTDDLN
850 860 870 880 890 900
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 TTSSVSSYSNITVPSRKNTQLRTDSEKRSTTDETWDSPEELKKPEEDFDSHGDAGGKWKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TTSSVSSYSNITVPSRKNTQLRTDSEKRSTTDETWDSPEELKKPEEDFDSHGDAGGKWKT
910 920 930 940 950 960
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 VSSGLPEDPEKAGQKASLSVSQTGSWRRGMSAQGGAPSRQKAGTSALKTPGKTDDAKASE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VSSGLPEDPEKAGQKASLSVSQTGSWRRGMSAQGGAPSRQKAGTSALKTPGKTDDAKASE
970 980 990 1000 1010 1020
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 KGKAPLKGSSLQRSPSDAGKSSGDEGKKPPSGIGRSTATSSFGFKKPSGVGSSAMITSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KGKAPLKGSSLQRSPSDAGKSSGDEGKKPPSGIGRSTATSSFGFKKPSGVGSSAMITSSG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 ATITSGSATLGKIPKSAAIGGKSNAGRKTSLDGSQNQDDVVLHVSSKTTLQYRSLPRPSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ATITSGSATLGKIPKSAAIGGKSNAGRKTSLDGSQNQDDVVLHVSSKTTLQYRSLPRPSK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 SSTSGIPGRGGHRSSTSSIDSNVSSKSAGATTSKLREPTKIGSGRSSPVTVNQTDKEKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SSTSGIPGRGGHRSSTSSIDSNVSSKSAGATTSKLREPTKIGSGRSSPVTVNQTDKEKEK
1150 1160 1170 1180 1190 1200
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 VAVSDSESVSLSGSPKSSPTSASACGAQGLRQPGSKYPDIASPTFRRLFGAKAGGKSASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VAVSDSESVSLSGSPKSSPTSASACGAQGLRQPGSKYPDIASPTFRRLFGAKAGGKSASA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 PNTEGVKSSSVMPSPSTTLARQGSLESPSSGTGSMGSAGGLSGSSSPLFNKPSDLTTDVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PNTEGVKSSSVMPSPSTTLARQGSLESPSSGTGSMGSAGGLSGSSSPLFNKPSDLTTDVI
1270 1280 1290 1300 1310 1320
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 SLSHSLASSPASVHSFTSGGLVWAANMSSSSAGSKDTPSYQSMTSLHTSSESIDLPLSHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SLSHSLASSPASVHSFTSGGLVWAANMSSSSAGSKDTPSYQSMTSLHTSSESIDLPLSHH
1330 1340 1350 1360 1370 1380
890 900 910 920
pF1KA0 GSLSGLTTGTHEVQSLLMRTGSVRSTLSE--------------RYTPSSRQANQEEGKEW
::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS41 GSLSGLTTGTHEVQSLLMRTGSVRSTLSESMQLDRNTLPKKGLRYTPSSRQANQEEGKEW
1390 1400 1410 1420 1430 1440
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 LRSHSTGGLQDTGNQSPLVSPSAMSSSAAGKYHFSNLVSPTNLSQFNLPGPSMMRSNSIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LRSHSTGGLQDTGNQSPLVSPSAMSSSAAGKYHFSNLVSPTNLSQFNLPGPSMMRSNSIP
1450 1460 1470 1480 1490 1500
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 AQDSSFDLYDDSQLCGSATSLEERPRAISHSGSFRDSMEEVHGSSLSLVSSTSSLYSTAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AQDSSFDLYDDSQLCGSATSLEERPRAISHSGSFRDSMEEVHGSSLSLVSSTSSLYSTAE
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA0 EKAHSEQIHKLRRELVASQEKVATLTSQLSANAHLVAAFEKSLGNMTGRLQSLTMTAEQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EKAHSEQIHKLRRELVASQEKVATLTSQLSANAHLVAAFEKSLGNMTGRLQSLTMTAEQK
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA0 ESELIELRETIEMLKAQNSAAQAAIQGALNGPDHPPKDLRIRRQHSSESVSSINSATSHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ESELIELRETIEMLKAQNSAAQAAIQGALNGPDHPPKDLRIRRQHSSESVSSINSATSHS
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA0 SIGSGNDADSKKKKKKNW-------LRSSFKQAFGKKKSTKPPSSHSDIEELTDSSLPAS
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SIGSGNDADSKKKKKKNWVNSRGSELRSSFKQAFGKKKSTKPPSSHSDIEELTDSSLPAS
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KA0 PKLPHNAGDCGSASMKPSQSASAICECTEAEAEIILQLKSELREKELKLTDIRLEALSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PKLPHNAGDCGSASMKPSQSASAICECTEAEAEIILQLKSELREKELKLTDIRLEALSSA
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KA0 HHLDQIREAMNRMQNEIEILKAENDRLKAETGNTAKPTRPPSESSSSTSSSSSRQSLGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HHLDQIREAMNRMQNEIEILKAENDRLKAETGNTAKPTRPPSESSSSTSSSSSRQSLGLS
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KA0 LNNLNITEAVSSDILLDDAGDATGHKDGRSVKIIVSISKGYGRAKDQKSQAYLIGSIGVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LNNLNITEAVSSDILLDDAGDATGHKDGRSVKIIVSISKGYGRAKDQKSQAYLIGSIGVS
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KA0 GKTKWDVLDGVIRRLFKEYVFRIDTSTSLGLSSDCIASYCIGDLIRSHNLEVPELLPCGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GKTKWDVLDGVIRRLFKEYVFRIDTSTSLGLSSDCIASYCIGDLIRSHNLEVPELLPCGY
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KA0 LVGDNNIITVNLKGVEENSLDSFVFDTLIPKPITQRYFNLLMEHHRIILSGPSGTGKTYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LVGDNNIITVNLKGVEENSLDSFVFDTLIPKPITQRYFNLLMEHHRIILSGPSGTGKTYL
1990 2000 2010 2020 2030 2040
1530 1540 1550 1560 1570 1580
pF1KA0 ANKLAEYVITKSGRKKTEDAIATFNVDHKSSKELQQYLANLAEQCSADNNGVELPVVIIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ANKLAEYVITKSGRKKTEDAIATFNVDHKSSKELQQYLANLAEQCSADNNGVELPVVIIL
2050 2060 2070 2080 2090 2100
1590 1600 1610 1620 1630 1640
pF1KA0 DNLHHVGSLSDIFNGFLNCKYNKCPYIIGTMNQGVSSSPNLELHHNFRWVLCANHTEPVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DNLHHVGSLSDIFNGFLNCKYNKCPYIIGTMNQGVSSSPNLELHHNFRWVLCANHTEPVK
2110 2120 2130 2140 2150 2160
1650 1660 1670 1680 1690 1700
pF1KA0 GFLGRYLRRKLIEIEIERNIRNNDLVKIIDWIPKTWHHLNSFLETHSSSDVTIGPRLFLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GFLGRYLRRKLIEIEIERNIRNNDLVKIIDWIPKTWHHLNSFLETHSSSDVTIGPRLFLP
2170 2180 2190 2200 2210 2220
1710 1720 1730 1740 1750 1760
pF1KA0 CPMDVEGSRVWFMDLWNYSLVPYILEAVREGLQMYGKRTPWEDPSKWVLDTYPWSSATLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CPMDVEGSRVWFMDLWNYSLVPYILEAVREGLQMYGKRTPWEDPSKWVLDTYPWSSATLP
2230 2240 2250 2260 2270 2280
1770 1780 1790 1800 1810 1820
pF1KA0 QESPALLQLRPEDVGYESCTSTKEATTSKHIPQTDTEGDPLMNMLMKLQEAANYSSTQSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QESPALLQLRPEDVGYESCTSTKEATTSKHIPQTDTEGDPLMNMLMKLQEAANYSSTQSC
2290 2300 2310 2320 2330 2340
1830 1840
pF1KA0 DSESTSHHEDILDSSLESTL
::::::::::::::::::::
CCDS41 DSESTSHHEDILDSSLESTL
2350 2360
>>CCDS66432.1 NAV3 gene_id:89795|Hs108|chr12 (2385 aa)
initn: 10384 init1: 4723 opt: 4786 Z-score: 3264.9 bits: 617.8 E(32554): 1.5e-175
Smith-Waterman score: 10640; 90.7% identity (93.4% similar) in 1861 aa overlap (24-1831:516-2374)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MQRPAELSVFRSKEVRRKGACLQKQKSL--TNLSLTSDGERRPTVRISNWFGN
:..:: .. .. . : . :::. . :.
CCDS66 EEKDQVTEMAPKKTSKIASLIPKGSKTTAAKKESLIPSSSGIPKPGSKVPTVKQTISPGS
490 500 510 520 530 540
60 70 80 90 100
pF1KA0 AAKASQREANYAERRSLSKFLSRSVQSLYHTSSSAWNLLPA--GGSQSDSEDLEELSARR
.: ... : . . : :. ::. . ..:: : . .:. : : . :.
CCDS66 TA-SKESEKFRTTKGSPSQSLSKPITMEKASASSCPAPLEGREAGQASPSGSCTMTVAQS
550 560 570 580 590 600
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 GLEGESDEDSRSEDENVSSKPSS------ISRSWAEEEGESCLREGTAHLDEEVILTMLG
. .. .. . ... :.:.. : :. .:.:: . . .. :..
CCDS66 SGQSTGNGAVQLPQQQQHSHPNTATVAPFIYRAHSENEGTALPSADSCTSPTKMDLSYSK
610 620 630 640 650 660
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 DLEQALYTDLLGEDPETRRMRTVKNIADLRQNLEETMSSLRGTQISHSTLETTFDSTVTT
.: : .. :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 TAKQCL-EEISGEDPETRRMRTVKNIADLRQNLEETMSSLRGTQISHSTLETTFDSTVTT
670 680 690 700 710 720
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 EVNGRTIPNLTSRPTPMTWRLGQACPRLQAGDAPSLGAGYPRSGTSRFIHTDPSRFMYTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EVNGRTIPNLTSRPTPMTWRLGQACPRLQAGDAPSLGAGYPRSGTSRFIHTDPSRFMYTT
730 740 750 760 770 780
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 PLRRAAVSRLGNMSQIDMSEKASSDLDMSSEVDVGGYMSDGDILGKSLRTDDINSGYMTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PLRRAAVSRLGNMSQIDMSEKASSDLDMSSEVDVGGYMSDGDILGKSLRTDDINSGYMTD
790 800 810 820 830 840
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 GGLNLYTRSLNRIPDTATSRDIIQRGVHDVTVDADSWDDSSSVSSGLSDTLDNISTDDLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GGLNLYTRSLNRIPDTATSRDIIQRGVHDVTVDADSWDDSSSVSSGLSDTLDNISTDDLN
850 860 870 880 890 900
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 TTSSVSSYSNITVPSRKNTQLRTDSEKRSTTDETWDSPEELKKPEEDFDSHGDAGGKWKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 TTSSVSSYSNITVPSRKNTQLRTDSEKRSTTDETWDSPEELKKPEEDFDSHGDAGGKWKT
910 920 930 940 950 960
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 VSSGLPEDPEKAGQKASLSVSQTGSWRRGMSAQGGAPSRQKAGTSALKTPGKTDDAKASE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VSSGLPEDPEKAGQKASLSVSQTGSWRRGMSAQGGAPSRQKAGTSALKTPGKTDDAKASE
970 980 990 1000 1010 1020
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 KGKAPLKGSSLQRSPSDAGKSSGDEGKKPPSGIGRSTATSSFGFKKPSGVGSSAMITSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KGKAPLKGSSLQRSPSDAGKSSGDEGKKPPSGIGRSTATSSFGFKKPSGVGSSAMITSSG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 ATITSGSATLGKIPKSAAIGGKSNAGRKTSLDGSQNQDDVVLHVSSKTTLQYRSLPRPSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ATITSGSATLGKIPKSAAIGGKSNAGRKTSLDGSQNQDDVVLHVSSKTTLQYRSLPRPSK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 SSTSGIPGRGGHRSSTSSIDSNVSSKSAGATTSKLREPTKIGSGRSSPVTVNQTDKEKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SSTSGIPGRGGHRSSTSSIDSNVSSKSAGATTSKLREPTKIGSGRSSPVTVNQTDKEKEK
1150 1160 1170 1180 1190 1200
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 VAVSDSESVSLSGSPKSSPTSASACGAQGLRQPGSKYPDIASPTFRRLFGAKAGGKSASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VAVSDSESVSLSGSPKSSPTSASACGAQGLRQPGSKYPDIASPTFRRLFGAKAGGKSASA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 PNTEGVKSSSVMPSPSTTLARQGSLESPSSGTGSMGSAGGLSGSSSPLFNKPSDLTTDVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PNTEGVKSSSVMPSPSTTLARQGSLESPSSGTGSMGSAGGLSGSSSPLFNKPSDLTTDVI
1270 1280 1290 1300 1310 1320
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 SLSHSLASSPASVHSFTSGGLVWAANMSSSSAGSKDTPSYQSMTSLHTSSESIDLPLSHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SLSHSLASSPASVHSFTSGGLVWAANMSSSSAGSKDTPSYQSMTSLHTSSESIDLPLSHH
1330 1340 1350 1360 1370 1380
890 900 910 920
pF1KA0 GSLSGLTTGTHEVQSLLMRTGSVRSTLSE--------------RYTPSSRQANQEEGKEW
::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS66 GSLSGLTTGTHEVQSLLMRTGSVRSTLSESMQLDRNTLPKKGLRYTPSSRQANQEEGKEW
1390 1400 1410 1420 1430 1440
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 LRSHSTGGLQDTGNQSPLVSPSAMSSSAAGKYHFSNLVSPTNLSQFNLPGPSMMRSNSIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LRSHSTGGLQDTGNQSPLVSPSAMSSSAAGKYHFSNLVSPTNLSQFNLPGPSMMRSNSIP
1450 1460 1470 1480 1490 1500
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 AQDSSFDLYDDSQLCGSATSLEERPRAISHSGSFRDSMEEVHGSSLSLVSSTSSLYSTAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AQDSSFDLYDDSQLCGSATSLEERPRAISHSGSFRDSMEEVHGSSLSLVSSTSSLYSTAE
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA0 EKAHSEQIHKLRRELVASQEKVATLTSQLSANAHLVAAFEKSLGNMTGRLQSLTMTAEQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EKAHSEQIHKLRRELVASQEKVATLTSQLSANAHLVAAFEKSLGNMTGRLQSLTMTAEQK
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA0 ESELIELRETIEMLKAQNSAAQAAIQGALNGPDHPPKDLRIRRQHSSESVSSINSATSHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ESELIELRETIEMLKAQNSAAQAAIQGALNGPDHPPKDLRIRRQHSSESVSSINSATSHS
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA0 SIGSGNDADSKKKKKKNW-------LRSSFKQAFGKKKSTKPPSSHSDIEELTDSSLPAS
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SIGSGNDADSKKKKKKNWVNSRGSELRSSFKQAFGKKKSTKPPSSHSDIEELTDSSLPAS
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1230 1240 1250 1260
pF1KA0 PKLPHNAGDCGSASMKPSQSASA----------------------ICECTEAEAEIILQL
::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS66 PKLPHNAGDCGSASMKPSQSASASPLVWPPKKRQNGPVIYKHRSRICECTEAEAEIILQL
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 KSELREKELKLTDIRLEALSSAHHLDQIREAMNRMQNEIEILKAENDRLKAETGNTAKPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KSELREKELKLTDIRLEALSSAHHLDQIREAMNRMQNEIEILKAENDRLKAETGNTAKPT
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 RPPSESSSSTSSSSSRQSLGLSLNNLNITEAVSSDILLDDAGDATGHKDGRSVKIIVSIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RPPSESSSSTSSSSSRQSLGLSLNNLNITEAVSSDILLDDAGDATGHKDGRSVKIIVSIS
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 KGYGRAKDQKSQAYLIGSIGVSGKTKWDVLDGVIRRLFKEYVFRIDTSTSLGLSSDCIAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KGYGRAKDQKSQAYLIGSIGVSGKTKWDVLDGVIRRLFKEYVFRIDTSTSLGLSSDCIAS
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 YCIGDLIRSHNLEVPELLPCGYLVGDNNIITVNLKGVEENSLDSFVFDTLIPKPITQRYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 YCIGDLIRSHNLEVPELLPCGYLVGDNNIITVNLKGVEENSLDSFVFDTLIPKPITQRYF
1990 2000 2010 2020 2030 2040
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 NLLMEHHRIILSGPSGTGKTYLANKLAEYVITKSGRKKTEDAIATFNVDHKSSKELQQYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NLLMEHHRIILSGPSGTGKTYLANKLAEYVITKSGRKKTEDAIATFNVDHKSSKELQQYL
2050 2060 2070 2080 2090 2100
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 ANLAEQCSADNNGVELPVVIILDNLHHVGSLSDIFNGFLNCKYNKCPYIIGTMNQGVSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ANLAEQCSADNNGVELPVVIILDNLHHVGSLSDIFNGFLNCKYNKCPYIIGTMNQGVSSS
2110 2120 2130 2140 2150 2160
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pF1KA0 PNLELHHNFRWVLCANHTEPVKGFLGRYLRRKLIEIEIERNIRNNDLVKIIDWIPKTWHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PNLELHHNFRWVLCANHTEPVKGFLGRYLRRKLIEIEIERNIRNNDLVKIIDWIPKTWHH
2170 2180 2190 2200 2210 2220
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pF1KA0 LNSFLETHSSSDVTIGPRLFLPCPMDVEGSRVWFMDLWNYSLVPYILEAVREGLQMYGKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LNSFLETHSSSDVTIGPRLFLPCPMDVEGSRVWFMDLWNYSLVPYILEAVREGLQMYGKR
2230 2240 2250 2260 2270 2280
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA0 TPWEDPSKWVLDTYPWSSATLPQESPALLQLRPEDVGYESCTSTKEATTSKHIPQTDTEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 TPWEDPSKWVLDTYPWSSATLPQESPALLQLRPEDVGYESCTSTKEATTSKHIPQTDTEG
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pF1KA0 DPLMNMLMKLQEAANYSSTQSCDSESTSHHEDILDSSLESTL
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 DPLMNMLMKLQEAANYSSTQSCDSESTSHHEDILDSSLESTL
2350 2360 2370 2380
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CCDS44 MLWPRNLTSWDDSSSVSSGISDTIDNLSTDDINTSSSI
10 20 30
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pF1KA0 SSYSNITVPSRKNTQLRTDSEKRSTTDET--WDSPEELKKPEEDFDS--HGDAGGKWKTV
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CCDS44 SSYANTPASSRKNLDVQTDAEKHSQVERNSLW-SGDDVKKSDGGSDSGIKMEPGSKWRRN
40 50 60 70 80 90
470 480 490 500 510
pF1KA0 SSGLPEDPEKA--GQKASLSVSQTGSWRRGMSAQGGA--P-SRQKAGTSALKTPG--KTD
: . .. .:. :.: . .::::::::::.:: : : .. .: ..:::::: :::
CCDS44 PSDVSDESDKSTSGKKNPV-ISQTGSWRRGMTAQVGITMPRTKPSAPAGALKTPGTGKTD
100 110 120 130 140 150
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 DAKASEKGKAPLKGSSLQRSPSDAGKSSGDEGKKP-PSGIGRSTATS-SFGFKKPSGVGS
:::.::::. :.:...:::::::.:::::.::: ::. ::.. :::::: :: ..
CCDS44 DAKVSEKGRLSPKASQVKRSPSDAGRSSGDESKKPLPSSSRTPTANANSFGFKKQSGSAA
160 170 180 190 200 210
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pF1KA0 S-AMITSSGATITSGSATLGKIPKSAAIGGKSNAGRKTSLDGSQNQDDVVLHVSSKTTLQ
. ::::.::.:.:: ::::::::::.:. ..: ::::.:.::.::::: : .::.:.::
CCDS44 GLAMITASGVTVTSRSATLGKIPKSSALVSRS-AGRKSSMDGAQNQDDGYLALSSRTNLQ
220 230 240 250 260 270
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pF1KA0 YRSLPRPSKSSTSGIPGRGGHRSSTSSIDSNVSSKSAGATTSKLREPTKIGSGRSSPVTV
::::::::::.. . : .:.::::::::::.:::::: . :::::.: . : : : :
CCDS44 YRSLPRPSKSNSRN--G-AGNRSSTSSIDSNISSKSAGLPVPKLREPSKTALGSSLPGLV
280 290 300 310 320 330
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::::::: ::.:::. .: : .:.. . . :: :::.::::.::::.:::::
CCDS44 NQTDKEKG--ISSDNESVASCNSVKVNPAAQPVSSPAQTSLQPGAKYPDVASPTLRRLFG
340 350 360 370 380 390
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pF1KA0 AKAGGKSASAPNTEGVKSSSVMPSPSTTLARQGSLESPSSGTGSMGSAGGLSGSSSPLFN
.: :.. ..:..:.: :. .: .:...::.:.::: :.: ..: ::::::..
CCDS44 GKPT-KQVPIATAENMKNSVVISNPHATMTQQGNLDSPS-GSGVLSS-----GSSSPLYS
400 410 420 430 440
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pF1KA0 KPSDLTTDVISLSHSLASSPASVHSFTSGGLVWAANMSSSSAGSKDTPSYQSMTSLHTSS
: ::. . :::::.:.:: :..:.:..: ::::: ::: ..::..:::::
CCDS44 KNVDLNQS------PLASSPSSAHSAPSNSLTWGTNASSSSAVSKDGLGFQSVSSLHTSC
450 460 470 480 490
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pF1KA0 ESIDLPLSH-----HGSLSGLTTGTHEVQSL--LMRTGSVRSTLSE--------------
::::. :: :.: .:: ..... .:: ..::.::..::::
CCDS44 ESIDISLSSGGVPSHNSSTGLIASSKD-DSLTPFVRTNSVKTTLSESDPHLDRNTLPKKG
500 510 520 530 540 550
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pF1KA0 -RYTPSSRQANQEEGKEWLRSHSTGGLQDTGNQSPLVSPSAMSSSAAGKYHFSNLVSPTN
::::.:. .::..::::::::.::::::. .::. : :...: .. ...::.:.:::.
CCDS44 LRYTPTSQLRTQEDAKEWLRSHSAGGLQDTAANSPFSSGSSVTSPSGTRFNFSQLASPTT
560 570 580 590 600 610
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA0 LSQFNLPGPSMMRSNSIPAQDSSFDLYDDSQLCGSATSLEERPRAISHSGSFRDSMEEVH
..:..: .:.:.:..:. :...: : ::.. .:. ::.:. :..:.::::::..::::
CCDS44 VTQMSLSNPTMLRTHSLSNADGQYDPYTDSRFRNSSMSLDEKSRTMSRSGSFRDGFEEVH
620 630 640 650 660 670
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA0 GSSLSLVSSTSSLYSTAEEKAHSEQIHKLRRELVASQEKVATLTSQLSANAHLVAAFEKS
::::::::::::.::: ::: .:: :.:::::: ::::::..::.::.::::::::::.:
CCDS44 GSSLSLVSSTSSVYSTPEEKCQSE-IRKLRRELDASQEKVSALTTQLTANAHLVAAFEQS
680 690 700 710 720 730
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pF1KA0 LGNMTGRLQSLTMTAEQKESELIELRETIEMLKAQNSAAQAAIQGALNGPDHPPK-----
::::: ::::::::::::.::: :::.:::.:: ::.::::::.:..: :. :
CCDS44 LGNMTIRLQSLTMTAEQKDSELNELRKTIELLKKQNAAAQAAINGVINTPELNCKGNGTA
740 750 760 770 780 790
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pF1KA0 ---DLRIRRQHSSESVSSINSATSHSSIGSGNDADSKKKKKKNWLRSSFKQAFGKKKSTK
::::::::::.:::::::::::::.::. ..::::::.::::::::::::::::: :
CCDS44 QSADLRIRRQHSSDSVSSINSATSHSSVGSNIESDSKKKKRKNWLRSSFKQAFGKKKSPK
800 810 820 830 840 850
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pF1KA0 PPSSHSDIEELTDSSLPASPKLPHNAGDCGSASM-KPSQSASAICECTEAEAEIILQLKS
::::::::.::::::.::::::: :. ::. . . :.: : : :: ..::: ..::..
CCDS44 SASSHSDIEEMTDSSLPSSPKLPHN-GSTGSTPLLRNSHSNSLISECMDSEAETVMQLRN
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:::.::.::::::::::::::.:::.::::::::.::: :::::::::.:. ... .:
CCDS44 ELRDKEMKLTDIRLEALSSAHQLDQLREAMNRMQSEIEKLKAENDRLKSESQGSGC-SRA
920 930 940 950 960 970
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pF1KA0 PSESSSSTSSSSSRQSLGLSLNNLNITEAVSSDILLDDAGDATGHKDG-RSVKIIVSISK
::. : : .: :::.::: ..::.::..: :.::::.:. ...:.: : :::.::...
CCDS44 PSQVSIS---ASPRQSMGLSQHSLNLTESTSLDMLLDDTGECSARKEGGRHVKIVVSFQE
980 990 1000 1010 1020 1030
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pF1KA0 GYGRAKDQKSQAYLIGSIGVSGKTKWDVLDGVIRRLFKEYVFRIDTSTSLGLSSDCIASY
. .:.. . .::: :::::::::::::::.:::::::....: ..:::.:: . .:
CCDS44 EMKWKEDSRPHLFLIGCIGVSGKTKWDVLDGVVRRLFKEYIIHVDPVSQLGLNSDSVLGY
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 CIGDLIRSHNLEVPELLPCGYLVGDNNIITVNLKGVEENSLDSFVFDTLIPKPITQRYFN
::.. ::.. :.:::::::::::.:. :.:..::. ::::::.::..:::::: ::: .
CCDS44 SIGEIKRSNTSETPELLPCGYLVGENTTISVTVKGLAENSLDSLVFESLIPKPILQRYVS
1100 1110 1120 1130 1140 1150
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pF1KA0 LLMEHHRIILSGPSGTGKTYLANKLAEYVITKSGRKKTEDAIATFNVDHKSSKELQQYLA
::.::.:::::::::::::::::.:.::.. . ::. :. .::::::::::::::.:::.
CCDS44 LLIEHRRIILSGPSGTGKTYLANRLSEYIVLREGRELTDGVIATFNVDHKSSKELRQYLS
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 NLAEQCSADNNGVELPVVIILDNLHHVGSLSDIFNGFLNCKYNKCPYIIGTMNQGVSSSP
:::.::...::.:..:.::::::::::.::..::::.:::::.:::::::::::..::.:
CCDS44 NLADQCNSENNAVDMPLVIILDNLHHVSSLGEIFNGLLNCKYHKCPYIIGTMNQATSSTP
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA0 NLELHHNFRWVLCANHTEPVKGFLGRYLRRKLIEIEIERNIRNNDLVKIIDWIPKTWHHL
::.:::::::::::::::::::::::.:::::.: :: .:: .::::::::::.::::
CCDS44 NLQLHHNFRWVLCANHTEPVKGFLGRFLRRKLMETEISGRVRNMELVKIIDWIPKVWHHL
1280 1290 1300 1310 1320 1330
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pF1KA0 NSFLETHSSSDVTIGPRLFLPCPMDVEGSRVWFMDLWNYSLVPYILEAVREGLQMYGKRT
: :::.:::::::::::::: ::.::.:::::: ::::::..::.:::::::::.::.:.
CCDS44 NRFLEAHSSSDVTIGPRLFLSCPIDVDGSRVWFTDLWNYSIIPYLLEAVREGLQLYGRRA
1340 1350 1360 1370 1380 1390
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA0 PWEDPSKWVLDTYPWSSATLPQESPALLQLRPEDVGYESCTSTKEATTSKHIPQTDTEGD
:::::.:::.:::::... .: : ::::::::::... . .:..:::..: .:.:::
CCDS44 PWEDPAKWVMDTYPWAASPQQHEWPPLLQLRPEDVGFDGYSMPREGSTSKQMPPSDAEGD
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1810 1820 1830 1840
pF1KA0 PLMNMLMKLQEAANYSSTQSCDSESTS--HHEDILDSSLESTL
:::::::.::::::::: :: ::.:.: ::.:::::::::::
CCDS44 PLMNMLMRLQEAANYSSPQSYDSDSNSNSHHDDILDSSLESTL
1460 1470 1480 1490
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10 20 30 40 50 60
pF1KA0 PAELSVFRSKEVRRKGACLQKQKSLTNLSLTSDGERRPTVRISNWFGNAAKASQREANYA
. .: .: .. . .: : ..:.. .
CCDS53 PEMPKKSSKIASFIPKGGKLNSAKKEPMAPSHSGIPKPGMKSMPGKSPSAPAPSKEGERS
470 480 490 500 510 520
70 80 90 100 110
pF1KA0 ERRSLSKFLSRSVQSL--YHTSSSAWNLL------PAGGSQSDSEDLEELSARRGLEGES
. .::. : .. .: :.:::. .: :.: . . : . . .:. : .
CCDS53 RSGKLSSGLPQQKPQLDGRHSSSSS-SLASSEGKGPGGTTLNHSISSQTVSGSVGTTQTT
530 540 550 560 570 580
120 130 140 150 160
pF1KA0 DEDSRS----EDENVSSKPSSIS------RSWAEEEGESCLREGTAHLD-EEVILTMLGD
.. : . .. ..:.. . :: .. ::. . ... .. : .: :
CCDS53 GSNTVSVQLPQPQQQYNHPNTATVAPFLYRSQTDTEGNVTAESSSTGVSVEPSHFTKTG-
590 600 610 620 630 640
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 LEQALYTDLLGEDPETRRMRTVKNIADLRQNLEETMSSLRGTQISHSTLETTFDSTVTTE
: .: :::::.::.::::::::::::::::::::::::..:::::::::..::::
CCDS53 --QPALEELTGEDPEARRLRTVKNIADLRQNLEETMSSLRGTQVTHSTLETTFDTNVTTE
650 660 670 680 690 700
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 VNGRTIPNLTSRPTPMTWRLGQACPRLQAGDAPSLGAGYP-RSGTSRFIHTDPSRFMYTT
..::.: .::.::::..:::::. ::::::::::.: ::: :...::::.:. .:..:..
CCDS53 MSGRSILSLTGRPTPLSWRLGQSSPRLQAGDAPSMGNGYPPRANASRFINTESGRYVYSA
710 720 730 740 750 760
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 PLRRAAVSRLGNMSQIDMSEKASSDLDMSS-EVDVGGYMSDGDILGKSLRTDDINSGYMT
:::: .:: ... ..:.:.::....:. . .:. :::::::.:.:..:::::.:::::
CCDS53 PLRRQLASRGSSVCHVDVSDKAGDEMDLEGISMDAPGYMSDGDVLSKNIRTDDITSGYMT
770 780 790 800 810 820
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 DGGLNLYTRSLNRIPD-TATSRDIIQRGVHDVTVDADSWDDSSSVSSGLSDTLDNISTDD
::::.:::: :::.:: :. :. .::.. ::::::::::::::.:::.::.::::
CCDS53 DGGLGLYTRRLNRLPDGMAVVRETLQRNTSLGLGDADSWDDSSSVSSGISDTIDNLSTDD
830 840 850 860 870 880
410 420 430 440 450
pF1KA0 LNTTSSVSSYSNITVPSRKNTQLRTDSEKRSTTDET--WDSPEELKKPEEDFDS--HGDA
.::.::.:::.: . :::: ...::.::.: .... : : ...:: . :: . .
CCDS53 INTSSSISSYANTPASSRKNLDVQTDAEKHSQVERNSLW-SGDDVKKSDGGSDSGIKMEP
890 900 910 920 930 940
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 GGKWKTVSSGLPEDPEKA--GQKASLSVSQTGSWRRGMSAQGGA--P-SRQKAGTSALKT
:.::. : . .. .:. :.: . .::::::::::.:: : : .. .: ..::::
CCDS53 GSKWRRNPSDVSDESDKSTSGKKNPV-ISQTGSWRRGMTAQVGITMPRTKPSAPAGALKT
950 960 970 980 990
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pF1KA0 PG--KTDDAKASEKGKAPLKGSSLQRSPSDAGKSSGDEGKKP-PSGIGRSTATS-SFGFK
:: ::::::.::::. :.:...:::::::.:::::.::: ::. ::.. :::::
CCDS53 PGTGKTDDAKVSEKGRLSPKASQVKRSPSDAGRSSGDESKKPLPSSSRTPTANANSFGFK
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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pF1KA0 KPSGVGSS-AMITSSGATITSGSATLGKIPKSAAIGGKSNAGRKTSLDGSQNQDDVVLHV
: :: ... ::::.::.:.:: ::::::::::.:. ..: ::::.:.::.::::: : .
CCDS53 KQSGSAAGLAMITASGVTVTSRSATLGKIPKSSALVSRS-AGRKSSMDGAQNQDDGYLAL
1060 1070 1080 1090 1100 1110
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pF1KA0 SSKTTLQYRSLPRPSKSSTSGIPGRGGHRSSTSSIDSNVSSKSAGATTSKLREPTKIGSG
::.:.::::::::::::.. . : .:.::::::::::.:::::: . :::::.: . :
CCDS53 SSRTNLQYRSLPRPSKSNSRN--G-AGNRSSTSSIDSNISSKSAGLPVPKLREPSKTALG
1120 1130 1140 1150 1160 1170
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pF1KA0 RSSPVTVNQTDKEKEKVAVSDSESVSLSGSPKSSPTSASACG-AQGLRQPGSKYPDIASP
: : :::::::: ::.:::. .: : .:.. . . :: :::.::::.:::
CCDS53 SSLPGLVNQTDKEKG--ISSDNESVASCNSVKVNPAAQPVSSPAQTSLQPGAKYPDVASP
1180 1190 1200 1210 1220 1230
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pF1KA0 TFRRLFGAKAGGKSASAPNTEGVKSSSVMPSPSTTLARQGSLESPSSGTGSMGSAGGLSG
:.:::::.: :.. ..:..:.: :. .: .:...::.:.::: :.: ..: :
CCDS53 TLRRLFGGKPT-KQVPIATAENMKNSVVISNPHATMTQQGNLDSPS-GSGVLSS-----G
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:::::..: ::. . :::::.:.:: :..:.:..: ::::: ::: ..::.
CCDS53 SSSPLYSKNVDLNQS------PLASSPSSAHSAPSNSLTWGTNASSSSAVSKDGLGFQSV
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.::::: ::::. :: :.: .:: ..... .:: ..::.::..::::
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. .:. ::.:. :..:.::::::..::::::::::::::::.::: ::: .:: :.::::
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:: ::::::..::.::.::::::::::.:::::: ::::::::::::.::: :::.:::.
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..::::::.::::::::::::::::: : ::::::::.::::::.::::::: :. ::
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. . . :.: : : :: ..::: ..::..:::.::.::::::::::::::.:::.:::::
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:.::::.:. ...:.: : :::.::... . .:.. . .::: ::::::::::::::
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..::. ::::::.::..:::::: ::: .::.::.:::::::::::::::::.:.::..
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CCDS53 REGRELTDGVIATFNVDHKSSKELRQYLSNLADQCNSENNAVDMPLVIILDNLHHVSSLG
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.::::.:::::.:::::::::::..::.:::.:::::::::::::::::::::::.::::
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:.: :: .:: .::::::::::.::::: :::.:::::::::::::: ::.::.::::
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CCDS78 RMQSEIEKLKAENDRLKSESQGSGC-SRAPSQVSIS---ASPRQSMGLSQHSLNLTESTS
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CCDS78 VVRRLFKEYIIHVDPVSQLGLNSDSVLGYSIGEIKRSNTSETPELLPCGYLVGENTTISV
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pF1KA0 EDILDSSLESTL
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CCDS78 DDILDSSLESTL
2420
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10 20 30 40 50 60
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.. : . .. ..:.. . :: .. ::. . ... .. : .: :
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CCDS78 --QPALEELTGEDPEARRLRTVKNIADLRQNLEETMSSLRGTQVTHSTLETTFDTNVTTE
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:::: .:: ... ..:.:.::....:. . .:. :::::::.:.:..:::::.:::::
CCDS78 PLRRQLASRGSSVCHVDVSDKAGDEMDLEGISMDAPGYMSDGDVLSKNIRTDDITSGYMT
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CCDS78 GSKWRRNPSDVSDESDKSTSGKKNPV-ISQTGSWRRGMTAQVGITMPRTKPSAPAGALKT
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:: ::::::.::::. :.:...:::::::.:::::.::: ::. ::.. :::::
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: :: ... ::::.::.:.:: ::::::::::.:. ..: ::::.:.::.::::: : .
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CCDS78 SSRTNLQYRSLPRPSKSNSRN--G-AGNRSSTSSIDSNISSKSAGLPVPKLREPSKTALG
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: : :::::::: ::.:::. .: : .:.. . . :: :::.::::.:::
CCDS78 SSLPGLVNQTDKEKG--ISSDNESVASCNSVKVNPAAQPVSSPAQTSLQPGAKYPDVASP
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CCDS78 TLRRLFGGKPT-KQVPIATAENMKNSVVISNPHATMTQQGNLDSPS-GSGVLSS-----G
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CCDS78 SSSPLYSKNVDLNQS------PLASSPSSAHSAPSNSLTWGTNASSSSAVSKDGLGFQSV
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CCDS78 SSLHTSCESIDISLSSGGVPSHNSSTGLIASSKD-DSLTPFVRTNSVKTTLSESPLSSPA
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CCDS78 ASPKFCRSTLPRKQDSDPHLDRNTLPKKGLRYTPTSQLRTQEDAKEWLRSHSAGGLQDTA
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CCDS78 ANSPFSSGSSVTSPSGTRFNFSQLASPTTVTQMSLSNPTMLRTHSLSNADGQYDPYTDSR
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:: ::::::..::.::.::::::::::.:::::: ::::::::::::.::: :::.:::.
CCDS78 ELDASQEKVSALTTQLTANAHLVAAFEQSLGNMTIRLQSLTMTAEQKDSELNELRKTIEL
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..::::::.::: :::::::::::::: : ::::::::.::::::.::::::: :.
CCDS78 IESDSKKKKRKNWVNELRSSFKQAFGKKKSPKSASSHSDIEEMTDSSLPSSPKLPHN-GS
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CCDS78 TGSTPLLRNSHSNSLISECMDSEAETVMQLRNELRDKEMKLTDIRLEALSSAHQLDQLRE
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CCDS78 AMNRMQSEIEKLKAENDRLKSESQGSGC-SRAPSQVSIS---ASPRQSMGLSQHSLNLTE
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CCDS78 STSLDMLLDDTGECSARKEGGRHVKIVVSFQEEMKWKEDSRPHLFLIGCIGVSGKTKWDV
1940 1950 1960 1970 1980 1990
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pF1KA0 LDGVIRRLFKEYVFRIDTSTSLGLSSDCIASYCIGDLIRSHNLEVPELLPCGYLVGDNNI
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CCDS78 LDGVVRRLFKEYIIHVDPVSQLGLNSDSVLGYSIGEIKRSNTSETPELLPCGYLVGENTT
2000 2010 2020 2030 2040 2050
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pF1KA0 ITVNLKGVEENSLDSFVFDTLIPKPITQRYFNLLMEHHRIILSGPSGTGKTYLANKLAEY
:.:..::. ::::::.::..:::::: ::: .::.::.:::::::::::::::::.:.::
CCDS78 ISVTVKGLAENSLDSLVFESLIPKPILQRYVSLLIEHRRIILSGPSGTGKTYLANRLSEY
2060 2070 2080 2090 2100 2110
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CCDS78 IVLREGRELTDGVIATFNVDHKSSKELRQYLSNLADQCNSENNAVDMPLVIILDNLHHVS
2120 2130 2140 2150 2160 2170
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pF1KA0 SLSDIFNGFLNCKYNKCPYIIGTMNQGVSSSPNLELHHNFRWVLCANHTEPVKGFLGRYL
::..::::.:::::.:::::::::::..::.:::.:::::::::::::::::::::::.:
CCDS78 SLGEIFNGLLNCKYHKCPYIIGTMNQATSSTPNLQLHHNFRWVLCANHTEPVKGFLGRFL
2180 2190 2200 2210 2220 2230
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pF1KA0 RRKLIEIEIERNIRNNDLVKIIDWIPKTWHHLNSFLETHSSSDVTIGPRLFLPCPMDVEG
::::.: :: .:: .::::::::::.::::: :::.:::::::::::::: ::.::.:
CCDS78 RRKLMETEISGRVRNMELVKIIDWIPKVWHHLNRFLEAHSSSDVTIGPRLFLSCPIDVDG
2240 2250 2260 2270 2280 2290
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pF1KA0 SRVWFMDLWNYSLVPYILEAVREGLQMYGKRTPWEDPSKWVLDTYPWSSATLPQESPALL
::::: ::::::..::.:::::::::.::.:.:::::.:::.:::::... .: : ::
CCDS78 SRVWFTDLWNYSIIPYLLEAVREGLQLYGRRAPWEDPAKWVMDTYPWAASPQQHEWPPLL
2300 2310 2320 2330 2340 2350
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pF1KA0 QLRPEDVGYESCTSTKEATTSKHIPQTDTEGDPLMNMLMKLQEAANYSSTQSCDSESTS-
::::::::... . .:..:::..: .:.::::::::::.::::::::: :: ::.:.:
CCDS78 QLRPEDVGFDGYSMPREGSTSKQMPPSDAEGDPLMNMLMRLQEAANYSSPQSYDSDSNSN
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pF1KA0 -HHEDILDSSLESTL
::.:::::::::::
CCDS78 SHHDDILDSSLESTL
2420 2430
>>CCDS58126.1 NAV2 gene_id:89797|Hs108|chr11 (2488 aa)
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CCDS58 VSGSVGTTQTTGSNTVSVQLPQPQQQYNHPNTATVAPFLYRSQTDTEGNVTAESSSTGVS
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CCDS58 VEPSHFTKTG---QPALEELTGEDPEARRLRTVKNIADLRQNLEETMSSLRGTQVTHSTL
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CCDS58 ETTFDTNVTTEMSGRSILSLTGRPTPLSWRLGQSSPRLQAGDAPSMGNGYPPRANASRFI
780 790 800 810 820 830
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CCDS58 NTESGRYVYSAPLRRQLASRGSSVCHVDVSDKAGDEMDLEGISMDAPGYMSDGDVLSKNI
840 850 860 870 880 890
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:::::.:::::::::.:::: :::.:: :. :. .::.. ::::::::::::::.
CCDS58 RTDDITSGYMTDGGLGLYTRRLNRLPDGMAVVRETLQRNTSLGLGDADSWDDSSSVSSGI
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:::.::.::::.::.::.:::.: . :::: ...::.::.: .... : : ...:: .
CCDS58 SDTIDNLSTDDINTSSSISSYANTPASSRKNLDVQTDAEKHSQVERNSLW-SGDDVKKSD
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CCDS58 GGSDSGIKMEPGSKWRRNPSDVSDESDKSTSGKKNPV-ISQTGSWRRGMTAQVGITMPRT
1020 1030 1040 1050 1060 1070
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pF1KA0 RQKAGTSALKTPG--KTDDAKASEKGKAPLKGSSLQRSPSDAGKSSGDEGKKP-PSGIGR
. .: ..:::::: ::::::.::::. :.:...:::::::.:::::.::: ::.
CCDS58 KPSAPAGALKTPGTGKTDDAKVSEKGRLSPKASQVKRSPSDAGRSSGDESKKPLPSSSRT
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CCDS58 PTANANSFGFKKQSGSAAGLAMITASGVTVTSRSATLGKIPKSSALVSRS-AGRKSSMDG
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pF1KA0 SQNQDDVVLHVSSKTTLQYRSLPRPSKSSTSGIPGRGGHRSSTSSIDSNVSSKSAGATTS
.::::: : .::.:.::::::::::::.. . : .:.::::::::::.:::::: .
CCDS58 AQNQDDGYLALSSRTNLQYRSLPRPSKSNSRN--G-AGNRSSTSSIDSNISSKSAGLPVP
1200 1210 1220 1230 1240 1250
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CCDS58 KLREPSKTALGSSLPGLVNQTDKEKG--ISSDNESVASCNSVKVNPAAQPVSSPAQTSLQ
1260 1270 1280 1290 1300
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pF1KA0 PGSKYPDIASPTFRRLFGAKAGGKSASAPNTEGVKSSSVMPSPSTTLARQGSLESPSSGT
::.::::.::::.:::::.: :.. ..:..:.: :. .: .:...::.:.::: :.
CCDS58 PGAKYPDVASPTLRRLFGGKPT-KQVPIATAENMKNSVVISNPHATMTQQGNLDSPS-GS
1310 1320 1330 1340 1350 1360
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pF1KA0 GSMGSAGGLSGSSSPLFNKPSDLTTDVISLSHSLASSPASVHSFTSGGLVWAANMSSSSA
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CCDS58 GVLSS-----GSSSPLYSKNVDLNQS------PLASSPSSAHSAPSNSLTWGTNASSSSA
1370 1380 1390 1400 1410
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CCDS58 VSKDGLGFQSVSSLHTSCESIDISLSSGGVPSHNSSTGLIASSKD-DSLTPFVRTNSVKT
1420 1430 1440 1450 1460 1470
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pF1KA0 TLSE-------------------------------------RYTPSSRQANQEEGKEWLR
:::: ::::.:. .::..:::::
CCDS58 TLSESPLSSPAASPKFCRSTLPRKQDSDPHLDRNTLPKKGLRYTPTSQLRTQEDAKEWLR
1480 1490 1500 1510 1520 1530
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 SHSTGGLQDTGNQSPLVSPSAMSSSAAGKYHFSNLVSPTNLSQFNLPGPSMMRSNSIPAQ
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CCDS58 SHSAGGLQDTAANSPFSSGSSVTSPSGTRFNFSQLASPTTVTQMSLSNPTMLRTHSLSNA
1540 1550 1560 1570 1580 1590
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CCDS58 DGQYDPYTDSRFRNSSMSLDEKSRTMSRSGSFRDGFEEESWEKSSVDNFVSRLHSSLHFS
1600 1610 1620 1630 1640 1650
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::::::::::::::.::: ::: .:: :.:::::: ::::::..::.::
CCDS58 LPLFHHARYELVHGSSLSLVSSTSSVYSTPEEKCQSE-IRKLRRELDASQEKVSALTTQL
1660 1670 1680 1690 1700 1710
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.::::::::::.:::::: ::::::::::::.::: :::.:::.:: ::.::::::.:..
CCDS58 TANAHLVAAFEQSLGNMTIRLQSLTMTAEQKDSELNELRKTIELLKKQNAAAQAAINGVI
1720 1730 1740 1750 1760 1770
1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA0 NGPDHPPK--------DLRIRRQHSSESVSSINSATSHSSIGSGNDADSKKKKKKNW---
: :. : ::::::::::.:::::::::::::.::. ..::::::.:::
CCDS58 NTPELNCKGNGTAQSADLRIRRQHSSDSVSSINSATSHSSVGSNIESDSKKKKRKNWVNE
1780 1790 1800 1810 1820 1830
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KA0 LRSSFKQAFGKKKSTKPPSSHSDIEELTDSSLPASPKLPHNAGDCGSASM-KPSQSASAI
:::::::::::::: : ::::::::.::::::.::::::: :. ::. . . :.: : :
CCDS58 LRSSFKQAFGKKKSPKSASSHSDIEEMTDSSLPSSPKLPHN-GSTGSTPLLRNSHSNSLI
1840 1850 1860 1870 1880 1890
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KA0 CECTEAEAEIILQLKSELREKELKLTDIRLEALSSAHHLDQIREAMNRMQNEIEILKAEN
:: ..::: ..::..:::.::.::::::::::::::.:::.::::::::.::: :::::
CCDS58 SECMDSEAETVMQLRNELRDKEMKLTDIRLEALSSAHQLDQLREAMNRMQSEIEKLKAEN
1900 1910 1920 1930 1940 1950
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KA0 DRLKAETGNTAKPTRPPSESSSSTSSSSSRQSLGLSLNNLNITEAVSSDILLDDAGDATG
::::.:. ... .: ::. : :.: :::.::: ..::.::..: :.::::.:. ..
CCDS58 DRLKSESQGSGC-SRAPSQVSI---SASPRQSMGLSQHSLNLTESTSLDMLLDDTGECSA
1960 1970 1980 1990 2000
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KA0 HKDG-RSVKIIVSISKGYGRAKDQKSQAYLIGSIGVSGKTKWDVLDGVIRRLFKEYVFRI
.:.: : :::.::... . .:.. . .::: :::::::::::::::.:::::::....
CCDS58 RKEGGRHVKIVVSFQEEMKWKEDSRPHLFLIGCIGVSGKTKWDVLDGVVRRLFKEYIIHV
2010 2020 2030 2040 2050 2060
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KA0 DTSTSLGLSSDCIASYCIGDLIRSHNLEVPELLPCGYLVGDNNIITVNLKGVEENSLDSF
: ..:::.:: . .: ::.. ::.. :.:::::::::::.:. :.:..::. ::::::.
CCDS58 DPVSQLGLNSDSVLGYSIGEIKRSNTSETPELLPCGYLVGENTTISVTVKGLAENSLDSL
2070 2080 2090 2100 2110 2120
1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KA0 VFDTLIPKPITQRYFNLLMEHHRIILSGPSGTGKTYLANKLAEYVITKSGRKKTEDAIAT
::..:::::: ::: .::.::.:::::::::::::::::.:.::.. . ::. :. .:::
CCDS58 VFESLIPKPILQRYVSLLIEHRRIILSGPSGTGKTYLANRLSEYIVLREGRELTDGVIAT
2130 2140 2150 2160 2170 2180
1550 1560 1570 1580 1590 1600
pF1KA0 FNVDHKSSKELQQYLANLAEQCSADNNGVELPVVIILDNLHHVGSLSDIFNGFLNCKYNK
:::::::::::.:::.:::.::...::.:..:.::::::::::.::..::::.:::::.:
CCDS58 FNVDHKSSKELRQYLSNLADQCNSENNAVDMPLVIILDNLHHVSSLGEIFNGLLNCKYHK
2190 2200 2210 2220 2230 2240
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pF1KA0 CPYIIGTMNQGVSSSPNLELHHNFRWVLCANHTEPVKGFLGRYLRRKLIEIEIERNIRNN
::::::::::..::.:::.:::::::::::::::::::::::.:::::.: :: .::
CCDS58 CPYIIGTMNQATSSTPNLQLHHNFRWVLCANHTEPVKGFLGRFLRRKLMETEISGRVRNM
2250 2260 2270 2280 2290 2300
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pF1KA0 DLVKIIDWIPKTWHHLNSFLETHSSSDVTIGPRLFLPCPMDVEGSRVWFMDLWNYSLVPY
.::::::::::.::::: :::.:::::::::::::: ::.::.:::::: ::::::..::
CCDS58 ELVKIIDWIPKVWHHLNRFLEAHSSSDVTIGPRLFLSCPIDVDGSRVWFTDLWNYSIIPY
2310 2320 2330 2340 2350 2360
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pF1KA0 ILEAVREGLQMYGKRTPWEDPSKWVLDTYPWSSATLPQESPALLQLRPEDVGYESCTSTK
.:::::::::.::.:.:::::.:::.:::::... .: : ::::::::::... . .
CCDS58 LLEAVREGLQLYGRRAPWEDPAKWVMDTYPWAASPQQHEWPPLLQLRPEDVGFDGYSMPR
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1790 1800 1810 1820 1830 1840
pF1KA0 EATTSKHIPQTDTEGDPLMNMLMKLQEAANYSSTQSCDSESTS--HHEDILDSSLESTL
:..:::..: .:.::::::::::.::::::::: :: ::.:.: ::.:::::::::::
CCDS58 EGSTSKQMPPSDAEGDPLMNMLMRLQEAANYSSPQSYDSDSNSNSHHDDILDSSLESTL
2430 2440 2450 2460 2470 2480
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CCDS53 MLHLPLPRSGRTVNFPRSWDESSSISSGLSDASDNLSSEEFNASSSL
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pF1KA0 SSYSNITVPSRKNTQ--LRTDSEKRSTTDE--TWDSPEELKKPEE-DFDSHG---DAG-G
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CCDS53 NSLPSTPTASRRNSTIVLRTDSEKRSLAESGLSWFSESEEKAPKKLEYDSGSLKMEPGTS
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CCDS53 KWRRERPESCDDSSKGGELKKPISLGHPGSLKKGKTPPVAVTSPITHTAQSALKVAGKPE
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.::..::: .:...:::: ::::.. ...:::::::.: ....:::.::: . ..:
CCDS53 -GKATDKGKLAVKNTGLQRSSSDAGRDRLSDAKKPPSGIARPSTSGSFGYKKPPPATGTA
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pF1KA0 MITSSGATITSGSATLGKIPKSAAIGGKSNAGRKTSLDGSQNQDDVVLHVSSKTTLQYRS
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CCDS53 TVMQTG-----GSATLSKIQKSSGIPVKPVNGRKTSLDVSNSAEPGFLAPGARSNIQYRS
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::::.:::. .. : ::: : .:::: : .:.:..: : :.:.::::..:::..:. ::
CCDS53 LPRPAKSSSMSVTGGRGGPRPVSSSIDPSLLSTKQGGLTPSRLKEPTKVASGRTTPAPVN
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:::.::::. ::. ::...::. :::.:.: . :. . ..: .. .:
CCDS53 QTDREKEKAKAKAVALDSDNISLKSIGSPESTPKN------QASHPTATKLAELPPTPLR
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::. : : : . :.:.:. .:: : : . .: . .. .... ::
CCDS53 AT--AKSFVKPPSLANLDKVNSNSLDLPSSSDT--------THASKVPDLHATSSASG--
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pF1KA0 SPLFNKPSDLTTDVISLSHSLASSPASVHSFTSGGLVWAANMSSSSAGSKDTPSYQSMTS
.:: :: .: ::: . ...:... . .. :. . :.: : ....
CCDS53 GPL---PSCFTP-----------SPAPILNINSASFSQGLELMSGFSVPKETRMYPKLSG
450 460 470 480
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pF1KA0 LHTSSESIDLPLSHHGSLSGLT----------TGTHEVQSLLMRTGSVR-----STLSER
:: : ::...:.: ... . : . :.: : .:: : :. .:
CCDS53 LHRSMESLQMPMSLPSAFPSSTPVPTPPAPPAAPTEEETEELTWSGSPRAGQLDSNQRDR
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pF1KA0 YT-PSS----RQANQEEGKEWLRSHSTGGLQDTGNQSPLVSPSAMSSSAAGKYHFSNLVS
: :.. . .::: :: .::. ::: .. .:: : :: :. : ..: ...:.::
CCDS53 NTLPKKGLRYQLQSQEETKERRHSHTIGGLPESDDQSELPSPPALPMSLSAKGQLTNIVS
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pF1KA0 PTNLSQFNLPGPSMMRSNSIPAQDSSFDLYDDSQLCGSATSLEERPRAISHSGSFRDSME
:: . : . ::::::.....:.::. ::. ::. :: :::... .:::::: .
CCDS53 PTAATT-----PRITRSNSIPTHEAAFELYSGSQM-GSTLSLAERPKGMIRSGSFRDPTD
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pF1KA0 EVHGSSLSLVSSTSSLYSTAEEKAHSEQIHKLRRELVASQEKVATLTSQLSANAHLVAAF
.:::: :::.::.:: ::.:::. .::::.:::::: .::::::::::::::::.:::::
CCDS53 DVHGSVLSLASSASSTYSSAEERMQSEQIRKLRRELESSQEKVATLTSQLSANANLVAAF
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pF1KA0 EKSLGNMTGRLQSLTMTAEQKESELIELRETIEMLKAQNSAAQAAIQGALNGPDHPPKDL
:.:: :::.::. :. :::.:..::..:::::..:: .:: :::.::::::. . ::.:
CCDS53 EQSLVNMTSRLRHLAETAEEKDTELLDLRETIDFLKKKNSEAQAVIQGALNASETTPKEL
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pF1KA0 RIRRQHSSESVSSINSATSHSSIGSGNDADSKKKKKKNWLRSSFKQAFGKKKSTKPPSSH
::.::.::.:.::.:: ::::::::..:::.::::::.::::::..::. ::. : ::.
CCDS53 RIKRQNSSDSISSLNSITSHSSIGSSKDADAKKKKKKSWLRSSFNKAFSIKKGPKSASSY
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pF1KA0 SDIEELT--DSSLPASPKLPHNAGDCGSASMKPSQSASAICECTEA--------------
:::::.. ::: :.:::: :.. . .: :.: : :.:. . ::.
CCDS53 SDIEEIATPDSSAPSSPKLQHGSTETASPSIKSSTSSSVGTDVTEGPAHPAPHTRLFHAN
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pF1KA0 -----EAEIILQLKSELREKELKLTDIRLEALSSAHHLDQIREAMNRMQNEIEILKAEND
: . . .:.::: :::.::::::::::.:::.:::.::.:. :: :...::::::
CCDS53 EEEEPEKKEVSELRSELWEKEMKLTDIRLEALNSAHQLDQLRETMHNMQLEVDLLKAEND
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pF1KA0 RLKAETGNTAKPTRPPSESSSSTSSSSSRQSLGLSLNNLNITEAVSSDILLDDAGDATGH
:::. : .. : :.. .:.. :: :.::::.:.. ...:. :. .. :
CCDS53 RLKVAPGPSSGST--PGQVPGSSALSSPRRSLGLALTHSFGPSLADTDLSPMDGISTCGP
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pF1KA0 KDGRSVKIIVSISKGYGRAKDQKSQAYLIGSIGVSGKTKWDVLDGVIRRLFKEYVFRIDT
:. .....: . . : :.: ...: ::::. : .:: .. ..::.:. ..:
CCDS53 KEEVTLRVVVRMPPQHIIKGDLKQQEFFLGCSKVSGKVDWKMLDEAVFQVFKDYISKMDP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KA0 STSLGLSSDCIASYCIGDLIRSHNLEVPELLPCGYLVGDNNIITVNLKGVEENSLDSFVF
...::::.. : .: :. . : . : ::. :: : ::: .:.:::..:. .::.::
CCDS53 ASTLGLSTESIHGYSISHVKRVLDAEPPEMPPCRR--GVNNI-SVSLKGLKEKCVDSLVF
1090 1100 1110 1120 1130
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pF1KA0 DTLIPKPITQRYFNLLMEHHRIILSGPSGTGKTYLANKLAEYVITKSGRKKTEDAIATFN
.::::::. :.:..::..:.:..::::::::::::.:.::::.. .:::. :: ..:::
CCDS53 ETLIPKPMMQHYISLLLKHRRLVLSGPSGTGKTYLTNRLAEYLVERSGREVTEGIVSTFN
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pF1KA0 VDHKSSKELQQYLANLAEQCSADNNGVELPVVIILDNLHHVGSLSDIFNGFLNCKYNKCP
. ..: :.:: ::.:::.: . ... ..:.::.::.: ..::.:.. :: :.:::.:::
CCDS53 MHQQSCKDLQLYLSNLANQIDRETGIGDVPLVILLDDLSEAGSISELVNGALTCKYHKCP
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pF1KA0 YIIGTMNQGVSSSPNLELHHNFRWVLCANHTEPVKGFLGRYLRRKLIEIEIERNIRNNDL
::::: :: :. .:: :: .:: . .:..::..::: :::::::.: . . : ...:
CCDS53 YIIGTTNQPVKMTPNHGLHLSFRMLTFSNNVEPANGFLVRYLRRKLVESDSDINANKEEL
1260 1270 1280 1290 1300 1310
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pF1KA0 VKIIDWIPKTWHHLNSFLETHSSSDVTIGPRLFLPCPMDVEGSRVWFMDLWNYSLVPYIL
....::.:: :.::..::: ::.:: ::: .:: ::. .: :.::.:::: :..::.
CCDS53 LRVLDWVPKLWYHLHTFLEKHSTSDFLIGPCFFLSCPIGIEDFRTWFIDLWNNSIIPYLQ
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pF1KA0 EAVREGLQMYGKRTPWEDPSKWVLDTYPWSSATLPQESPALLQLRPEDVGYESCTSTKEA
:....:....:... :::: .:: :: :: :: :.. : .: : :: .: .: :
CCDS53 EGAKDGIKVHGQKAAWEDPVEWVRDTLPWPSA--QQDQSKLYHLPPPTVGPHSIASPPED
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1790 1800 1810 1820 1830 1840
pF1KA0 TTSKHIPQTDTEGDPLMNMLMKLQEAANYSSTQSCDSESTSHHEDILDSSLESTL
: : .. ..:::: ::.:::::::: .: : :. ::: .:..::
CCDS53 RTVKDSTPSSLDSDPLMAMLLKLQEAANY--IESPDRET------ILDPNLQATL
1440 1450 1460 1470 1480
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10 20
pF1KA0 MQRPAELSVFRSKEV--RRKG----ACLQKQKSL
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CCDS14 RKAAAADGRGMLPKRAKAPGGGGGMAKASAAELKVFKSGSVDSRVPGGPPASNLRKQKSL
40 50 60 70 80 90
30 40 50 60 70 80
pF1KA0 TNLSLTSDGERRPTVRISNWFGNAAKASQREANYAERRS----LSKFLSRSVQSLYHTSS
::::. .:.:.. . .: . ::: . .. . . .:: ::.: .::.....
CCDS14 TNLSFLTDSEKKLQLYEPEWSDDMAKAPKGLGKVGSKGREAPLMSKTLSKSEHSLFQAKG
100 110 120 130 140 150
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pF1KA0 SAWNLLPAGGSQSDSEDLEELSAR-----RGL-----------EGESDEDSRSEDENVSS
: ::::... : .. :: :. .::..:.:: .::
CCDS14 S-----PAGGAKTPLAPLAPNLGKPSRIPRGPYAEVKPLSKAPEAAVSEDGKSDDELLSS
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pF1KA0 KPSSISRSWAEEEGESCLREGTAHLDEEVILTMLGDLEQALYTDLLGEDPETRRMRTVKN
: .. . : ... ... ..: :...:.:::::: :....: :::..: :::.:
CCDS14 KAKAQKSSGPVPSAKGQEERAFLKVDPELVVTVLGDLEQLLFSQML--DPESQRKRTVQN
210 220 230 240 250 260
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 IADLRQNLEETMSSLRGTQISHSTLETT-FDSTVTTEVNGRTIPNLTSRPTPMTWRLGQA
. :::::::::::::::.:..::.:: : .:: ..: :.. .:..: .:..:: ::.
CCDS14 VLDLRQNLEETMSSLRGSQVTHSSLEMTCYDSD---DANPRSVSSLSNRSSPLSWRYGQS
270 280 290 300 310 320
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 CPRLQAGDAPSLGAGYPRSGT-SRFIHTDPSRFMYTTPLRRAAVSRLGNMSQIDMSEKAS
::::::::::.:.. :: . ..: . ... .: :.: :.:...:.... :. .
CCDS14 SPRLQAGDAPSVGGSCRSEGTPAWYMHGERAHYSHTMPMRSP--SKLSHISRLELVESLD
330 340 350 360 370
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 SDLDMSSEVDV-GGYMSDGDILGKSLRTDDINSGYMTDGGLNLYTRSLNRIPDTATSRDI
:: :::. .:::::.:..::.. ::
CCDS14 SD-----EVDLKSGYMSDSDLMGKTMTEDD------------------------------
380 390 400
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 IQRGVHDVTVDADSWDDSSSVSSGLSDTLDNISTDDLNTTSSVSSYSNITVPSRKNTQ--
:.:. .::.:::.::::::. ::.:....:..::..: . . ::.:.
CCDS14 ------DITT---GWDESSSISSGLSDASDNLSSEEFNASSSLNSLPSTPTASRRNSTIV
410 420 430 440 450
430 440 450 460 470
pF1KA0 LRTDSEKRSTTDE--TWDSPEELKKPEE-DFDSHG---DAG-GKWKTVSSGLPEDPEKAG
::::::::: .. .: : : : :.. ..:: . . : .::. .: :.:
CCDS14 LRTDSEKRSLAESGLSWFSESEEKAPKKLEYDSGSLKMEPGTSKWRRERPESCDDSSKGG
460 470 480 490 500 510
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 Q-KASLSVSQTGSWRRGMSAQGGAPSR-QKAGTSALKTPGKTDDAKASEKGKAPLKGSSL
. : .:... :: ..: . .. : ... ::::. :: . .::..::: .:...:
CCDS14 ELKKPISLGHPGSLKKGKTPPVAVTSPITHTAQSALKVAGKPE-GKATDKGKLAVKNTGL
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::: ::::.. ...:::::::.: ....:::.::: . ..: . ..: :::::.
CCDS14 QRSSSDAGRDRLSDAKKPPSGIARPSTSGSFGYKKPPPATGTATVMQTG-----GSATLS
580 590 600 610 620
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pF1KA0 KIPKSAAIGGKSNAGRKTSLDGSQNQDDVVLHVSSKTTLQYRSLPRPSKSSTSGIPG-RG
:: ::..: : ::::::: :.. . : ......::::::::.:::. .. : ::
CCDS14 KIQKSSGIPVKPVNGRKTSLDVSNSAEPGFLAPGARSNIQYRSLPRPAKSSSMSVTGGRG
630 640 650 660 670 680
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pF1KA0 GHRSSTSSID-SNVSSKSAGATTSKLREPTKIGSGRSSPVTVNQTDKEKEKV---AVS-D
: : .:::: : .:.:..: : :.:.::::..:::..:. :::::.::::. ::. :
CCDS14 GPRPVSSSIDPSLLSTKQGGLTPSRLKEPTKVASGRTTPAPVNQTDREKEKAKAKAVALD
690 700 710 720 730 740
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pF1KA0 SESVSLS--GSPKSSPTSASACGAQGLRQPGSKYPDIASPTFRRLFGAKAGGKSASAPNT
:...::. :::.:.: . :. . ..: .. .: ::. : : :
CCDS14 SDNISLKSIGSPESTPKN------QASHPTATKLAELPPTPLRAT--AKSFVKPPSLANL
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CCDS14 DKVNSNSLDLPSSSDT--------THASKVPDLHATSSASG--GPL---PSCFTP-----
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CCDS14 SSPKLQHGSTETASPSIKSSTSSSVGTDVTEGPAHPAPHTRLFHANEEEEPEKKEVSELR
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CCDS14 SELWEKEMKLTDIRLEALNSAHQLDQLRETMHNMQLEVDLLKAENDRLKVAPGPSSGST-
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CCDS14 -PGQVPGSSALSSPRRSLGLALTHSFGPSLADTDLSPMDGISTCGPKEEVTLRVVVRMPP
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CCDS14 SISHVKRVLDAEPPEMPPCRR--GVNNI-SVSLKGLKEKCVDSLVFETLIPKPMMQHYIS
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CCDS14 LLLKHRRLVLSGPSGTGKTYLTNRLAEYLVERSGREVTEGIVSTFNMHQQSCKDLQLYLS
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CCDS14 NLANQIDRETGIGDVPLVILLDDLSEAGSISELVNGALTCKYHKCPYIIGTTNQPVKMTP
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CCDS14 NHGLHLSFRMLTFSNNVEPANGFLVRYLRRKLVESDSDINANKEELLRVLDWVPKLWYHL
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CCDS14 AWEDPVEWVRDTLPWPSAQ--QDQSKLYHLPPPTVGPHSIASPPEDRTVKDSTPSSLDSD
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CCDS14 PLMAMLLKLQEAANY--IESPDRET------ILDPNLQATL
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1842 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 20:04:26 2016 done: Wed Nov 2 20:04:27 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]