Result of FASTA (omim) for
pF1KA0994
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0994, 665 aa
1>>>pF1KA0994 665 - 665 aa - 665 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4965+/-0.000445; mu= 17.8605+/- 0.027
mean_var=64.8781+/-12.800, 0's: 0 Z-trim(110.2): 35 B-trim: 13 in 1/47
Lambda= 0.159230
statistics sampled from 18429 (18458) to 18429 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.582), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 10.010
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_031391 (OMIM: 607935) protein-arginine deiminas ( 665) 4520 1047.8 0
NP_057317 (OMIM: 606755) protein-arginine deiminas ( 664) 2371 554.2 5.7e-157
XP_011539873 (OMIM: 606755) PREDICTED: protein-arg ( 626) 2316 541.5 3.5e-153
NP_037490 (OMIM: 607934) protein-arginine deiminas ( 663) 2301 538.1 4e-152
NP_036519 (OMIM: 180300,605347) protein-arginine d ( 663) 2267 530.3 8.9e-150
XP_016856590 (OMIM: 607934) PREDICTED: protein-arg ( 612) 2237 523.4 9.9e-148
XP_016856591 (OMIM: 607934) PREDICTED: protein-arg ( 612) 2237 523.4 9.9e-148
XP_016855637 (OMIM: 607935) PREDICTED: protein-arg ( 350) 2163 506.3 7.9e-143
XP_016856952 (OMIM: 606755) PREDICTED: protein-arg ( 485) 2033 476.5 1e-133
XP_011539452 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 601) 1905 447.1 8.8e-125
XP_011539454 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 484) 1882 441.8 2.9e-123
XP_016856592 (OMIM: 607934) PREDICTED: protein-arg ( 594) 1670 393.1 1.6e-108
XP_011539459 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 366) 1602 377.4 5.1e-104
NP_997304 (OMIM: 610363) protein-arginine deiminas ( 694) 1347 318.9 3.9e-86
XP_011539609 (OMIM: 607934) PREDICTED: protein-arg ( 471) 1290 305.8 2.4e-82
XP_011539874 (OMIM: 606755) PREDICTED: protein-arg ( 421) 1065 254.1 7.9e-67
XP_011539453 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 563) 1003 239.9 2e-62
XP_011539456 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 397) 996 238.2 4.5e-62
XP_011539455 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 397) 996 238.2 4.5e-62
XP_011539458 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 386) 995 238.0 5.1e-62
XP_011539457 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 392) 995 238.0 5.2e-62
>>NP_031391 (OMIM: 607935) protein-arginine deiminase ty (665 aa)
initn: 4520 init1: 4520 opt: 4520 Z-score: 5607.0 bits: 1047.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4520; 100.0% identity (100.0% similar) in 665 aa overlap (1-665:1-665)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MLRERTVRLQYGSRVEAVYVLGTYLWTDVYSAAPAGAQTFSLKHSEHVWVEVVRDGEAEE
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NP_031 MLRERTVRLQYGSRVEAVYVLGTYLWTDVYSAAPAGAQTFSLKHSEHVWVEVVRDGEAEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 VATNGKQRWLLSPSTTLRVTMSQASTEASSDKVTVNYYDEEGSIPIDQAGLFLTAIEISL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 VATNGKQRWLLSPSTTLRVTMSQASTEASSDKVTVNYYDEEGSIPIDQAGLFLTAIEISL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 DVDADRDGVVEKNNPKKASWTWGPEGQGAILLVNCDRETPWLPKEDCRDEKVYSKEDLKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 DVDADRDGVVEKNNPKKASWTWGPEGQGAILLVNCDRETPWLPKEDCRDEKVYSKEDLKD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 MSQMILRTKGPDRLPAGYEIVLYISMSDSDKVGVFYVENPFFGQRYIHILGRRKLYHVVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 MSQMILRTKGPDRLPAGYEIVLYISMSDSDKVGVFYVENPFFGQRYIHILGRRKLYHVVK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 YTGGSAELLFFVEGLCFPDEGFSGLVSIHVSLLEYMAQDIPLTPIFTDTVIFRIAPWIMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 YTGGSAELLFFVEGLCFPDEGFSGLVSIHVSLLEYMAQDIPLTPIFTDTVIFRIAPWIMT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 PNILPPVSVFVCCMKDNYLFLKEVKNLVEKTNCELKVCFQYLNRGDRWIQDEIEFGYIEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 PNILPPVSVFVCCMKDNYLFLKEVKNLVEKTNCELKVCFQYLNRGDRWIQDEIEFGYIEA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 PHKGFPVVLDSPRDGNLKDFPVKELLGPDFGYVTREPLFESVTSLDSFGNLEVSPPVTVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 PHKGFPVVLDSPRDGNLKDFPVKELLGPDFGYVTREPLFESVTSLDSFGNLEVSPPVTVN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 GKTYPLGRILIGSSFPLSGGRRMTKVVRDFLKAQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMSFVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 GKTYPLGRILIGSSFPLSGGRRMTKVVRDFLKAQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMSFVP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 IPGTKKFLLLMASTSACYKLFREKQKDGHGEAIMFKGLGGMSSKRITINKILSNESLVQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 IPGTKKFLLLMASTSACYKLFREKQKDGHGEAIMFKGLGGMSSKRITINKILSNESLVQE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 NLYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIIDLPALFKMDEDHRARAFFPNMVNMIVLDKDLGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 NLYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIIDLPALFKMDEDHRARAFFPNMVNMIVLDKDLGI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 PKPFGPQVEEECCLEMHVRGLLEPLGLECTFIDDISAYHKFLGEVHCGTNVRRKPFTFKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 PKPFGPQVEEECCLEMHVRGLLEPLGLECTFIDDISAYHKFLGEVHCGTNVRRKPFTFKW
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 WHMVP
:::::
NP_031 WHMVP
>>NP_057317 (OMIM: 606755) protein-arginine deiminase ty (664 aa)
initn: 1976 init1: 1976 opt: 2371 Z-score: 2939.0 bits: 554.2 E(85289): 5.7e-157
Smith-Waterman score: 2371; 51.9% identity (77.1% similar) in 668 aa overlap (1-665:1-664)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MLRERTVRLQYGSRVEAVYVLGTYLWTDVYSAAPAGAQTFSLKHSEHVWVEVVRDGE-AE
: .: ::.. . :: : :. .:.:...: :.. : . . : . . . : ..
NP_057 MSLQRIVRVSLEHPTSAVCVAGVETLVDIYGSVPEGTEMFEVYGTPGVDIYISPNMERGR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 EVATNGKQRWLLSPSTTLRVTMSQASTEASSDKVTVNYYDEEGSIPIDQAGLFLTAIEIS
: : . .:: .. . . :.:.. :.. ....: ..:.. . .:. : :.:: ..::
NP_057 ERADT--RRWRFDATLEIIVVMNSPSNDLNDSHVQISYHSSHEPLPLAYAVLYLTCVDIS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LDVDADRDGVVEKNNPKKASWTWGPEGQGAILLVNCDRETPWLPKEDCRDEKVYSKEDLK
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NP_057 LDCDLNCEGRQDRNFVDKRQWVWGPSGYGGILLVNCDRDDPSCDVQDNCDQHVHCLQDLE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 DMSQMILRTKGPDRLPAGYEIVLYISMSDSDKVGVFYVENPF-FGQRYIHILGRRKLYHV
::: :.:::.:: : ...::. : :. .. ::.. .: . : :.::. :. .
NP_057 DMSVMVLRTQGPAALFDDHKLVLHTSSYDAKRAQVFHICGPEDVCEAYRHVLGQDKVSYE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 VKYTGGSAELLFFVEGLCFPDEGFSGLVSIHVSLLEYMAQDIPLTPIFTDTVIFRIAPWI
: :. : :::::: ::: ::.::.:.::.::. .:. .:::::::.::.::::
NP_057 VPRLHGDEER-FFVEGLSFPDAGFTGLISFHVTLLDDSNEDFSASPIFTDTVVFRVAPWI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 MTPNILPPVSVFVCCMKDNYLFLKEVKNLVEKTNCELKVCFQYLNRGDRWIQDEIEFGYI
:::. :::. :.:: ...: :. : .:..:..:.: .: : ::.:::::::.:.::.
NP_057 MTPSTLPPLEVYVCRVRNNTCFVDAVAELARKAGCKLTICPQAENRNDRWIQDEMELGYV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 EAPHKGFPVVLDSPRDGNLKDFPVKELLGPDFGYVTREPLFESVTSLDSFGNLEVSPPVT
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NP_057 QAPHKTLPVVFDSPRNGELQDFPYKRILGPDFGYVTREPRDRSVSGLDSFGNLEVSPPVV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 VNGKTYPLGRILIGSSFPLSGGRRMTKVVRDFLKAQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMSF
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NP_057 ANGKEYPLGRILIGGNLPGSSGRRVTQVVRDFLHAQKVQPPVELFVDWLAVGHVDEFLSF
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 VPIPGTKKFLLLMASTSACYKLFREKQKDGHGEAIMFKGL-GGMSSKRITINKILSNESL
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NP_057 VPAPDGKGFRMLLASPGACFKLFQEKQKCGHGRALLFQGVVDDEQVKTISINQVLSNKDL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 VQENLYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIIDLPALFKMDEDHRARAFFPNMVNMIVLDKD
.. : . : :.::::..::.::::.: ::::.: ::: : ..: ::::..:::.:: :
NP_057 INYNKFVQSCIDWNREVLKRELGLAECDIIDIPQLFKT-ERKKATAFFPDLVNMLVLGKH
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 LGIPKPFGPQVEEECCLEMHVRGLLEPLGLECTFIDDISAYHKFLGEVHCGTNVRRKPFT
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NP_057 LGIPKPFGPIINGCCCLEEKVRSLLEPLGLHCTFIDDFTPYHMLHGEVHCGTNVCRKPFS
600 610 620 630 640 650
660
pF1KA0 FKWWHMVP
::::.:::
NP_057 FKWWNMVP
660
>>XP_011539873 (OMIM: 606755) PREDICTED: protein-arginin (626 aa)
initn: 1976 init1: 1976 opt: 2316 Z-score: 2871.2 bits: 541.5 E(85289): 3.5e-153
Smith-Waterman score: 2316; 54.9% identity (79.5% similar) in 601 aa overlap (67-665:28-626)
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 AQTFSLKHSEHVWVEVVRDGEAEEVATNGKQRWLLSPSTTLRVTMSQASTEASSDKVTVN
.:: .. . . :.:.. :.. ....: ..
XP_011 MFEVYGTPGVDIYISPNMERGRERADTRRWRFDATLEIIVVMNSPSNDLNDSHVQIS
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 YYDEEGSIPIDQAGLFLTAIEISLDVDADRDGVVEKNNPKKASWTWGPEGQGAILLVNCD
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XP_011 YHSSHEPLPLAYAVLYLTCVDISLDCDLNCEGRQDRNFVDKRQWVWGPSGYGGILLVNCD
60 70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 RETPWLPKEDCRDEKVYSKEDLKDMSQMILRTKGPDRLPAGYEIVLYISMSDSDKVGVFY
:. : .: :..:. .::.::: :.:::.:: : ...::. : :. .. ::.
XP_011 RDDPSCDVQDNCDQHVHCLQDLEDMSVMVLRTQGPAALFDDHKLVLHTSSYDAKRAQVFH
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 VENPF-FGQRYIHILGRRKLYHVVKYTGGSAELLFFVEGLCFPDEGFSGLVSIHVSLLEY
. .: . : :.::. :. . : :. : :::::: ::: ::.::.:.::.::.
XP_011 ICGPEDVCEAYRHVLGQDKVSYEVPRLHGDEER-FFVEGLSFPDAGFTGLISFHVTLLDD
180 190 200 210 220 230
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 MAQDIPLTPIFTDTVIFRIAPWIMTPNILPPVSVFVCCMKDNYLFLKEVKNLVEKTNCEL
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XP_011 SNEDFSASPIFTDTVVFRVAPWIMTPSTLPPLEVYVCRVRNNTCFVDAVAELARKAGCKL
240 250 260 270 280 290
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 KVCFQYLNRGDRWIQDEIEFGYIEAPHKGFPVVLDSPRDGNLKDFPVKELLGPDFGYVTR
.: : ::.:::::::.:.::..:::: .:::.::::.:.:.::: :..::::::::::
XP_011 TICPQAENRNDRWIQDEMELGYVQAPHKTLPVVFDSPRNGELQDFPYKRILGPDFGYVTR
300 310 320 330 340 350
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 EPLFESVTSLDSFGNLEVSPPVTVNGKTYPLGRILIGSSFPLSGGRRMTKVVRDFLKAQQ
:: .::..:::::::::::::..::: :::::::::...: :.:::.:.::::::.::.
XP_011 EPRDRSVSGLDSFGNLEVSPPVVANGKEYPLGRILIGGNLPGSSGRRVTQVVRDFLHAQK
360 370 380 390 400 410
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 VQAPVELYSDWLTVGHVDEFMSFVPIPGTKKFLLLMASTSACYKLFREKQKDGHGEAIMF
:: ::::. :::.:::::::.:::: : : : .:.:: .::.:::.:::: :::.:..:
XP_011 VQPPVELFVDWLAVGHVDEFLSFVPAPDGKGFRMLLASPGACFKLFQEKQKCGHGRALLF
420 430 440 450 460 470
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 KGL-GGMSSKRITINKILSNESLVQENLYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIIDLPALFK
.:. . : :.::..:::..:.. : . : :.::::..::.::::.: ::::.: :::
XP_011 QGVVDDEQVKTISINQVLSNKDLINYNKFVQSCIDWNREVLKRELGLAECDIIDIPQLFK
480 490 500 510 520 530
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 MDEDHRARAFFPNMVNMIVLDKDLGIPKPFGPQVEEECCLEMHVRGLLEPLGLECTFIDD
: ..: ::::..:::.:: : ::::::::: .. :::: .::.:::::::.::::::
XP_011 T-ERKKATAFFPDLVNMLVLGKHLGIPKPFGPIINGCCCLEEKVRSLLEPLGLHCTFIDD
540 550 560 570 580 590
640 650 660
pF1KA0 ISAYHKFLGEVHCGTNVRRKPFTFKWWHMVP
.. :: . ::::::::: ::::.::::.:::
XP_011 FTPYHMLHGEVHCGTNVCRKPFSFKWWNMVP
600 610 620
>>NP_037490 (OMIM: 607934) protein-arginine deiminase ty (663 aa)
initn: 2055 init1: 963 opt: 2301 Z-score: 2852.1 bits: 538.1 E(85289): 4e-152
Smith-Waterman score: 2301; 52.3% identity (76.2% similar) in 669 aa overlap (1-665:1-663)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MLRERTVRLQYGSRVEAVYVLGTYLWTDVYSAAPAGAQTFSLKHSEHVWVEVVRDGEAEE
: .:.:.:. ..:: :.:. .:..: .: ::..: .. : : : .: . ...
NP_037 MAPKRVVQLSLKMPTHAVCVVGVEAHVDIHSDVPKGANSFRVSGSSGVEVFMVYN-RTRV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 VATNGKQRWLLSPSTTLRVTMSQASTEASSDKVTVNYYDEEGSIPIDQAGLFLTAIEISL
:: :: :. .. . :... :: : .. :: :.:. :. . . .. :.::...:::
NP_037 KEPIGKARWPLDTDADMVVSVGTASKELKDFKVRVSYFGEQEDQALGRSVLYLTGVDISL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 DVDADRDGVVEKNNPKKASWTWGPEGQGAILLVNCDRETPWLPKEDCRDEKVYSKEDLKD
.::. : : :.... : .: ::::: ::::::::::.. . : ..: ::.:
NP_037 EVDTGRTGKVKRSQGDKKTWRWGPEGYGAILLVNCDRDNHRSAEPDLTHSWLMSLADLQD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 MSQMILRTKGPDRLPAGYEIVLYISMSDSDKVGVFYVENPFFGQRYIHILGRRKLYHVVK
:: :.: .:::.: ....:: . .::: .: :: ... . : ..:: . : . :.
NP_037 MSPMLLSCNGPDKLFDSHKLVLNVPFSDSKRVRVFCARGGNSLSDYKQVLGPQCLSYEVE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 YTGGSAELLFFVEGLCFPDEGFSGLVSIHVSLLEYMAQDIPLTPIFTDTVIFRIAPWIMT
: :. :.:::: ::: : ::::. :::.. .: . .::::: ::.::::::
NP_037 RQPGEQEIKFYVEGLTFPDADFLGLVSLSVSLVD--PGTLPEVTLFTDTVGFRMAPWIMT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KA0 PNILPPVSVFVCCMKD----NYLFLKEVKNLVEKTNCELKVCFQYLNRGDRWIQDEIEFG
:: :: ..:: . : : ::.... :. :.::.: .: : ::.:::::::.:::
NP_037 PNTQPPEELYVCRVMDTHGSNEKFLEDMSYLTLKANCKLTICPQVENRNDRWIQDEMEFG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 YIEAPHKGFPVVLDSPRDGNLKDFPVKELLGPDFGYVTREPLFESVTSLDSFGNLEVSPP
:::::::.::::.::::. .::::: :..::::::::::: . . .::::::::.::::
NP_037 YIEAPHKSFPVVFDSPRNRGLKDFPYKRILGPDFGYVTREIPLPGPSSLDSFGNLDVSPP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 VTVNGKTYPLGRILIGSSFPLSGGRRMTKVVRDFLKAQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFM
:::.: ::::::::::::: ::::.:...::.::::::::::::::::::.:::::::.
NP_037 VTVGGTEYPLGRILIGSSFPKSGGRQMARAVRNFLKAQQVQAPVELYSDWLSVGHVDEFL
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 SFVPIPGTKKFLLLMASTSACYKLFREKQKDGHGEAIMFKGLGGMSSKRITINKILSNES
.::: : : ::.:: ::: :::.::...:.::: .: :: ..:: .::..:...
NP_037 TFVPTSDQKGFRLLLASPSACLKLFQEKKEEGYGEAAQFDGLK-HQAKR-SINEMLADRH
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 LVQENLYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIIDLPALFKMDEDHRARAFFPNMVNMIVLDK
: ..::. :.:.::::..::.::::.:.::.:.: :: . .. :.::::.::::.:: :
NP_037 LQRDNLHAQKCIDWNRNVLKRELGLAESDIVDIPQLFFL-KNFYAEAFFPDMVNMVVLGK
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 DLGIPKPFGPQVEEECCLEMHVRGLLEPLGLECTFIDDISAYHKFLGEVHCGTNVRRKPF
::::::.:: .. .:::: .:..:::::::.: :::: .::.. ::.:::::::::::
NP_037 YLGIPKPYGPIINGRCCLEEKVQSLLEPLGLHCIFIDDYLSYHELQGEIHCGTNVRRKPF
600 610 620 630 640 650
660
pF1KA0 TFKWWHMVP
::::.:::
NP_037 PFKWWNMVP
660
>>NP_036519 (OMIM: 180300,605347) protein-arginine deimi (663 aa)
initn: 2199 init1: 1057 opt: 2267 Z-score: 2809.9 bits: 530.3 E(85289): 8.9e-150
Smith-Waterman score: 2267; 50.4% identity (76.0% similar) in 668 aa overlap (1-665:1-663)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MLRERTVRLQYGSRVEAVYVLGTYLWTDVYSAAPAGAQTFSLKHSEHVWVEVVRDGEAEE
: . .:. . ..:: :::: :. :.:: .::.. : : :.... :..
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pF1KA0 VATNGKQRWLLSPSTTLRVTMSQASTEASSDKVTVNYYDEEGSIPIDQAGLFLTAIEISL
.: :.. : :.:.. . .::. :: ....:: ..:: . . :. .: :.::..::::
NP_036 KST-GSSTWPLDPGVEVTLTMKVASGSTGDQKVQISYYGPK-TPPV-KALLYLTGVEISL
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.: : : :. . : .::::: ::::::::::::.. ::.:..: ..:::
NP_036 CADITRTGKVKPTRAVKDQRTWTWGPCGQGAILLVNCDRDNLESSAMDCEDDEVLDSEDL
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.::: : : :: : . ... .::... :. ::: :: . .... .:: . :
NP_036 QDMSLMTLSTKTPKDFFTNHTLVLHVARSEMDKVRVFQATRGKLSSKCSVVLGPKWPSHY
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pF1KA0 VKYTGGSAELLFFVEGLCFPDEGFSGLVSIHVSLLEYMAQDIPLTPIFTDTVIFRIAPWI
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NP_036 LMVPGGKHNMDFYVEALAFPDTDFPGLITLTISLLDTSNLELPEAVVFQDSVVFRVAPWI
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pF1KA0 VNGKTYPLGRILIGSS-FPLSGGRRMTKVVRDFLKAQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMS
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pF1KA0 FVPIPGTKKFLLLMASTSACYKLFREKQKDGHGEAIMFKGLGGMSSKRITINKILSNESL
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NP_036 FVPAPDRKGFRLLLASPRSCYKLFQEQQNEGHGEALLFEGI--KKKKQQKIKNILSNKTL
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pF1KA0 VQENLYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIIDLPALFKMDEDHRARAFFPNMVNMIVLDKD
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NP_036 LGIPKPFGPVINGRCCLEEKVCSLLEPLGLQCTFINDFFTYHIRHGEVHCGTNVRRKPFS
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660
pF1KA0 FKWWHMVP
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NP_036 FKWWNMVP
660
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:: :: :. .. . :... :: : .. ::
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: ... . : ..:: . : . :. : :. :.:::: ::: : ::::. :::..
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.::.: .: : ::.:::::::.::::::::::.::::.::::. .::::: :..:::::
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pF1KA0 EAIMFKGLGGMSSKRITINKILSNESLVQENLYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIIDLP
:: .: :: ..:: .::..:... : ..::. :.:.::::..::.::::.:.::.:.:
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:: . .. :.::::.::::.:: : ::::::.:: .. .:::: .:..:::::::.:
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>>XP_016856591 (OMIM: 607934) PREDICTED: protein-arginin (612 aa)
initn: 2055 init1: 963 opt: 2237 Z-score: 2773.2 bits: 523.4 E(85289): 9.9e-148
Smith-Waterman score: 2237; 54.9% identity (77.9% similar) in 605 aa overlap (65-665:13-612)
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 AGAQTFSLKHSEHVWVEVVRDGEAEEVATNGKQRWLLSPSTTLRVTMSQASTEASSDKVT
:: :: :. .. . :... :: : .. ::
XP_016 MVYNRTRVKEPIGKARWPLDTDADMVVSVGTASKELKDFKVR
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:.:. :. . . .. :.::...:::.::. : : :.... : .: ::::: :::::::
XP_016 VSYFGEQEDQALGRSVLYLTGVDISLEVDTGRTGKVKRSQGDKKTWRWGPEGYGAILLVN
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: ... . : ..:: . : . :. : :. :.:::: ::: : ::::. :::..
XP_016 FCARGGNSLSDYKQVLGPQCLSYEVERQPGEQEIKFYVEGLTFPDADFLGLVSLSVSLVD
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.::.: .: : ::.:::::::.::::::::::.::::.::::. .::::: :..:::::
XP_016 ANCKLTICPQVENRNDRWIQDEMEFGYIEAPHKSFPVVFDSPRNRGLKDFPYKRILGPDF
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:::::: . . .::::::::.:::::::.: ::::::::::::: ::::.:...::.:
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pF1KA0 EAIMFKGLGGMSSKRITINKILSNESLVQENLYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIIDLP
:: .: :: ..:: .::..:... : ..::. :.:.::::..::.::::.:.::.:.:
XP_016 EAAQFDGLK-HQAKR-SINEMLADRHLQRDNLHAQKCIDWNRNVLKRELGLAESDIVDIP
470 480 490 500 510
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pF1KA0 ALFKMDEDHRARAFFPNMVNMIVLDKDLGIPKPFGPQVEEECCLEMHVRGLLEPLGLECT
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XP_016 QLFFL-KNFYAEAFFPDMVNMVVLGKYLGIPKPYGPIINGRCCLEEKVQSLLEPLGLHCI
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pF1KA0 FIDDISAYHKFLGEVHCGTNVRRKPFTFKWWHMVP
:::: .::.. ::.::::::::::: ::::.:::
XP_016 FIDDYLSYHELQGEIHCGTNVRRKPFPFKWWNMVP
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>>XP_016855637 (OMIM: 607935) PREDICTED: protein-arginin (350 aa)
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Smith-Waterman score: 2163; 99.7% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (350-665:35-350)
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.:::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FPVKELLGPDFGYVTREPLFESVTSLDSFGNLEVSPPVTVNGKTYPLGRILIGSSFPLSG
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pF1KA0 GRRMTKVVRDFLKAQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMSFVPIPGTKKFLLLMASTSACYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GRRMTKVVRDFLKAQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMSFVPIPGTKKFLLLMASTSACYK
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pF1KA0 LFREKQKDGHGEAIMFKGLGGMSSKRITINKILSNESLVQENLYFQRCLDWNRDILKKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LFREKQKDGHGEAIMFKGLGGMSSKRITINKILSNESLVQENLYFQRCLDWNRDILKKEL
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pF1KA0 GLTEQDIIDLPALFKMDEDHRARAFFPNMVNMIVLDKDLGIPKPFGPQVEEECCLEMHVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLTEQDIIDLPALFKMDEDHRARAFFPNMVNMIVLDKDLGIPKPFGPQVEEECCLEMHVR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLLEPLGLECTFIDDISAYHKFLGEVHCGTNVRRKPFTFKWWHMVP
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>>XP_016856952 (OMIM: 606755) PREDICTED: protein-arginin (485 aa)
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pF1KA0 LLVNCDRETPWLPKEDCRDEKVYSKEDLKDMSQMILRTKGPDRLPAGYEIVLYISMSDSD
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XP_016 MSVMVLRTQGPAALFDDHKLVLHTSSYDAK
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pF1KA0 KVGVFYVENPF-FGQRYIHILGRRKLYHVVKYTGGSAELLFFVEGLCFPDEGFSGLVSIH
.. ::.. .: . : :.::. :. . : :. : :::::: ::: ::.::.:.:
XP_016 RAQVFHICGPEDVCEAYRHVLGQDKVSYEVPRLHGDEER-FFVEGLSFPDAGFTGLISFH
40 50 60 70 80
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pF1KA0 VSLLEYMAQDIPLTPIFTDTVIFRIAPWIMTPNILPPVSVFVCCMKDNYLFLKEVKNLVE
:.::. .:. .:::::::.::.:::::::. :::. :.:: ...: :. : .:..
XP_016 VTLLDDSNEDFSASPIFTDTVVFRVAPWIMTPSTLPPLEVYVCRVRNNTCFVDAVAELAR
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pF1KA0 KTNCELKVCFQYLNRGDRWIQDEIEFGYIEAPHKGFPVVLDSPRDGNLKDFPVKELLGPD
:..:.: .: : ::.:::::::.:.::..:::: .:::.::::.:.:.::: :..::::
XP_016 KAGCKLTICPQAENRNDRWIQDEMELGYVQAPHKTLPVVFDSPRNGELQDFPYKRILGPD
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pF1KA0 FGYVTREPLFESVTSLDSFGNLEVSPPVTVNGKTYPLGRILIGSSFPLSGGRRMTKVVRD
:::::::: .::..:::::::::::::..::: :::::::::...: :.:::.:.::::
XP_016 FGYVTREPRDRSVSGLDSFGNLEVSPPVVANGKEYPLGRILIGGNLPGSSGRRVTQVVRD
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pF1KA0 FLKAQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMSFVPIPGTKKFLLLMASTSACYKLFREKQKDGH
::.::.:: ::::. :::.:::::::.:::: : : : .:.:: .::.:::.:::: ::
XP_016 FLHAQKVQPPVELFVDWLAVGHVDEFLSFVPAPDGKGFRMLLASPGACFKLFQEKQKCGH
270 280 290 300 310 320
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pF1KA0 GEAIMFKGL-GGMSSKRITINKILSNESLVQENLYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIID
:.:..:.:. . : :.::..:::..:.. : . : :.::::..::.::::.: ::::
XP_016 GRALLFQGVVDDEQVKTISINQVLSNKDLINYNKFVQSCIDWNREVLKRELGLAECDIID
330 340 350 360 370 380
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pF1KA0 LPALFKMDEDHRARAFFPNMVNMIVLDKDLGIPKPFGPQVEEECCLEMHVRGLLEPLGLE
.: ::: : ..: ::::..:::.:: : ::::::::: .. :::: .::.:::::::.
XP_016 IPQLFKT-ERKKATAFFPDLVNMLVLGKHLGIPKPFGPIINGCCCLEEKVRSLLEPLGLH
390 400 410 420 430 440
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pF1KA0 CTFIDDISAYHKFLGEVHCGTNVRRKPFTFKWWHMVP
::::::.. :: . ::::::::: ::::.::::.:::
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