FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1006, 1186 aa 1>>>pF1KA1006 1186 - 1186 aa - 1186 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0493+/-0.00104; mu= 14.5480+/- 0.063 mean_var=113.7620+/-23.192, 0's: 0 Z-trim(107.5): 26 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.120247 statistics sampled from 9588 (9605) to 9588 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.638), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16 Scan time: 3.980 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS43137.1 STXBP5L gene_id:9515|Hs108|chr3 (1186) 7980 1396.2 0 CCDS77799.1 STXBP5L gene_id:9515|Hs108|chr3 (1162) 4747 835.3 0 CCDS5211.1 STXBP5 gene_id:134957|Hs108|chr6 (1115) 3405 602.5 1.8e-171 CCDS47499.1 STXBP5 gene_id:134957|Hs108|chr6 (1151) 3399 601.5 3.8e-171 >>CCDS43137.1 STXBP5L gene_id:9515|Hs108|chr3 (1186 aa) initn: 7980 init1: 7980 opt: 7980 Z-score: 7480.9 bits: 1396.2 E(32554): 0 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:::.:.:::::::::::::::::: CCDS52 LINEGALVSALADDTLHLWNLRQKRPAILHSLKFCRERVTFCHLPFQSKWLYVGTERGNI 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 HIVNIESFILSGYVIMWNKAIELSTKTHPGPVVHLSDSPRDEGKLLIGYENGTVVFWDLK ::::.::: :::::::::::::::.:.:::::::.::.: ::::::::.:.::::.:::: CCDS52 HIVNVESFTLSGYVIMWNKAIELSSKSHPGPVVHISDNPMDEGKLLIGFESGTVVLWDLK 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 SKRAELRVYYDEAIHSIDWHHEGKQFMCSHSDGSLTLWNLKSPSRPFQTTIPHGKSQREG ::.:. : :::::::. ::::::::.::::::.::.::..::..: :: ::::. ..: CCDS52 SKKADYRYTYDEAIHSVAWHHEGKQFICSHSDGTLTIWNVRSPAKPVQTITPHGKQLKDG 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 RKSESCKPILKVEYKTCKNSEPFIIFSGGLSYDKACRRPSLTIMHGKAITVLEMDHPIVE .: : ::::::::.:: ...:::::.::::::: . ::: ::.::::. .:::::. ::. 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