Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1008
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1008, 928 aa
1>>>pF1KA1008 928 - 928 aa - 928 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0057+/-0.000929; mu= 18.0988+/- 0.056
mean_var=79.9214+/-15.798, 0's: 0 Z-trim(106.7): 23 B-trim: 39 in 1/48
Lambda= 0.143464
statistics sampled from 9113 (9126) to 9113 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.28), width: 16
Scan time: 4.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45057.1 DIS3 gene_id:22894|Hs108|chr13 ( 928) 6159 1284.9 0
CCDS9447.1 DIS3 gene_id:22894|Hs108|chr13 ( 958) 5459 1140.0 0
CCDS81772.1 DIS3 gene_id:22894|Hs108|chr13 ( 796) 5238 1094.2 0
CCDS10214.1 DIS3L gene_id:115752|Hs108|chr15 ( 971) 964 209.7 2.2e-53
CCDS45286.1 DIS3L gene_id:115752|Hs108|chr15 (1054) 964 209.7 2.4e-53
CCDS58752.1 DIS3L2 gene_id:129563|Hs108|chr2 ( 603) 566 127.2 9.3e-29
CCDS42834.1 DIS3L2 gene_id:129563|Hs108|chr2 ( 885) 566 127.3 1.3e-28
CCDS13527.1 HELZ2 gene_id:85441|Hs108|chr20 (2080) 323 77.2 3.7e-13
CCDS33508.1 HELZ2 gene_id:85441|Hs108|chr20 (2649) 323 77.2 4.6e-13
>>CCDS45057.1 DIS3 gene_id:22894|Hs108|chr13 (928 aa)
initn: 6159 init1: 6159 opt: 6159 Z-score: 6883.1 bits: 1284.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6159; 99.9% identity (99.9% similar) in 928 aa overlap (1-928:1-928)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLKSKTFLKKTRAGGVMKIVREHYLRDDIGCGAPGCAACGGAHEGPALEPQPQDPASSVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MLKSKTFLKKTRAGGVMKIVREHYLRDDIGCGAPGCAACGGAHEGPALEPQPQDPASSVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 PQPHYLLPDTNVLLHQIVSAWRPGTWASVASSLRLPGSLETYVEQEQGENANDRNDRAIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PQPHYLLPDTNVLLHQIVSAWRPGTWASVASSLRLPGSLETYVEQEQGENANDRNDRAIR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 VAAKWYNEHLKKMSADNQLQVIFITNDRRNKEKAIEEGIPAFTCEEYVKSLTANPELIDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VAAKWYNEHLKKMSADNQLQVIFITNDRRNKEKAIEEGIPAFTCEEYVKSLTANPELIDR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LACLSEEGNEIESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRASRENYLEATVWIHGDNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LACLSEEGNEIESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRASRENYLEATVWIHGDNE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEERERML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS45 ENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEETERML
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 KTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGMLSKSDIKESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGMLSKSDIKESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 STLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 STLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 FLPKMPWSITEKDMKNREDLRHLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FLPKMPWSITEKDMKNREDLRHLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 HFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 EILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSANMNDDITTSLRGLNKLAKILKKRRIEKGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSANMNDDITTSLRGLNKLAKILKKRRIEKGAL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 TLSSPEVRFHMDSETHDPIDLQTKELRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TLSSPEVRFHMDSETHDPIDLQTKELRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 HPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKSLAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKSLAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 AVYFCSGMDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLAVAIGADCTYPELTDKHKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AVYFCSGMDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLAVAIGADCTYPELTDKHKL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 ADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEEAYILFVRKNAIVVLIPKYGLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEEAYILFVRKNAIVVLIPKYGLE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 GTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTVFHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLVEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTVFHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLVEP
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KA1 QIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
910 920
>>CCDS9447.1 DIS3 gene_id:22894|Hs108|chr13 (958 aa)
initn: 5995 init1: 5459 opt: 5459 Z-score: 6099.9 bits: 1140.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5927; 94.9% identity (95.4% similar) in 958 aa overlap (1-928:1-958)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLKSKTFLKKTRAGGVMKIVREHYLRDDIGCGAPGCAACGGAHEGPALEPQPQDPASSVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MLKSKTFLKKTRAGGVMKIVREHYLRDDIGCGAPGCAACGGAHEGPALEPQPQDPASSVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90
pF1KA1 PQPHYLLPDTNVLLHQIVSAWRPG-----TWASVASSLR---LP----------------
::::::::::::::::: :. . .: . .: :
CCDS94 PQPHYLLPDTNVLLHQIDVLEDPAIRNVIVLQTVLQEVRNRSAPVYKRIRDVTNNQEKHF
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 ------GSLETYVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHLKKMSADNQLQVIFITNDRRN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 YTFTNEHHRETYVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHLKKMSADNQLQVIFITNDRRN
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 KEKAIEEGIPAFTCEEYVKSLTANPELIDRLACLSEEGNEIESGKIIFSEHLPLSKLQQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KEKAIEEGIPAFTCEEYVKSLTANPELIDRLACLSEEGNEIESGKIIFSEHLPLSKLQQG
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 IKSGTYLQGTFRASRENYLEATVWIHGDNEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 IKSGTYLQGTFRASRENYLEATVWIHGDNEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKS
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 QWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEERERMLKTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGML
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 QWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEETERMLKTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGML
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 SKSDIKESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQASTLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 SKSDIKESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQASTLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNL
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 GDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLSFLPKMPWSITEKDMKNREDLRHLCICSVDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 GDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLSFLPKMPWSITEKDMKNREDLRHLCICSVDP
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 PGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 PGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMV
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 PELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNAEILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 PELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNAEILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSA
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 NMNDDITTSLRGLNKLAKILKKRRIEKGALTLSSPEVRFHMDSETHDPIDLQTKELRETN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 NMNDDITTSLRGLNKLAKILKKRRIEKGALTLSSPEVRFHMDSETHDPIDLQTKELRETN
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 SMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 SMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKS
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 LAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSGMDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSGMDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIR
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 RYADVIVHRLLAVAIGADCTYPELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 RYADVIVHRLLAVAIGADCTYPELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFF
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 KSKGIVSEEAYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KSKGIVSEEAYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTV
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920
pF1KA1 FHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLVEPQIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 FHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLVEPQIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
910 920 930 940 950
>>CCDS81772.1 DIS3 gene_id:22894|Hs108|chr13 (796 aa)
initn: 5238 init1: 5238 opt: 5238 Z-score: 5853.9 bits: 1094.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5238; 99.9% identity (99.9% similar) in 796 aa overlap (133-928:1-796)
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 VEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHLKKMSADNQLQVIFITNDRRNKEKAIEEGIPAF
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MSADNQLQVIFITNDRRNKEKAIEEGIPAF
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 TCEEYVKSLTANPELIDRLACLSEEGNEIESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TCEEYVKSLTANPELIDRLACLSEEGNEIESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFR
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 ASRENYLEATVWIHGDNEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ASRENYLEATVWIHGDNEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHD
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 EGQNEEDVEKEEERERMLKTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGMLSKSDIKESRRHL
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EGQNEEDVEKEEETERMLKTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGMLSKSDIKESRRHL
160 170 180 190 200 210
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 FTPADKRIPRIRIETRQASTLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FTPADKRIPRIRIETRQASTLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEV
220 230 240 250 260 270
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 LLLEHDVPHQPFSQAVLSFLPKMPWSITEKDMKNREDLRHLCICSVDPPGCTDIDDALHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LLLEHDVPHQPFSQAVLSFLPKMPWSITEKDMKNREDLRHLCICSVDPPGCTDIDDALHC
280 290 300 310 320 330
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 RELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLK
340 350 360 370 380 390
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 CDVDRLAFSCIWEMNHNAEILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSANMNDDITTSLRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 CDVDRLAFSCIWEMNHNAEILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSANMNDDITTSLRG
400 410 420 430 440 450
590 600 610 620 630 640
pF1KA1 LNKLAKILKKRRIEKGALTLSSPEVRFHMDSETHDPIDLQTKELRETNSMVEEFMLLANI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LNKLAKILKKRRIEKGALTLSSPEVRFHMDSETHDPIDLQTKELRETNSMVEEFMLLANI
460 470 480 490 500 510
650 660 670 680 690 700
pF1KA1 SVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKSLAESLDQAESPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKSLAESLDQAESPT
520 530 540 550 560 570
710 720 730 740 750 760
pF1KA1 FPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSGMDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSGMDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLA
580 590 600 610 620 630
770 780 790 800 810 820
pF1KA1 VAIGADCTYPELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEEAYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VAIGADCTYPELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEEAYI
640 650 660 670 680 690
830 840 850 860 870 880
pF1KA1 LFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTVFHVFDKVKVKIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTVFHVFDKVKVKIM
700 710 720 730 740 750
890 900 910 920
pF1KA1 LDSSNLQHQKIRMSLVEPQIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LDSSNLQHQKIRMSLVEPQIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
760 770 780 790
>>CCDS10214.1 DIS3L gene_id:115752|Hs108|chr15 (971 aa)
initn: 1195 init1: 378 opt: 964 Z-score: 1071.8 bits: 209.7 E(32554): 2.2e-53
Smith-Waterman score: 1709; 37.2% identity (64.7% similar) in 886 aa overlap (102-912:43-906)
80 90 100 110 120 130
pF1KA1 VLLHQIVSAWRPGTWASVASSLRLPGSLETYVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHLK
:. .:.::. . . :.: :: :: .: .
CCDS10 GRRQYNKLRNLLKDARHDCILFANEFQQCCYLPRERGESMEKWQTRSIYNAAVWYYHHCQ
20 30 40 50 60 70
140 150 160 170 180
pF1KA1 KMSADNQLQVIFITNDRRNKEK--AIEEGIPAFTCEEYVKS----LTANPELIDR-LACL
... ....:.:.. .. . ::. ..: ..:. . : : :: : :
CCDS10 -----DRMPIVMVTEDEEAIQQYGSETEGVFVITFKNYLDNFWPDLKAAHELCDSILQSR
80 90 100 110 120
190 200 210 220 230
pF1KA1 SEEGNEI-ESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRASREN-YLEATVWIHG----D
:. :: :: . ::::: :. ::::: :.:: . .... .:: : ..: :
CCDS10 RERENESQESHGKEYPEHLPLEVLEAGIKSGRYIQGILNVNKHRAQIEAFVRLQGASSKD
130 140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 NEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEERER
.. ..:...:.: ::..: :.:.::::::..: .:.: :.: . . :
CCDS10 SDLVSDILIHGMKARNRSIHGDVVVVELLPKNEW-KGRTVAL-----CENDCDDKASGE-
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 MLKTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGML-SKSDI----KESRRHLFTPADKRIPRI
. :: : ::::::::...::: : . :: .. :.... : :: : :::.:
CCDS10 ----SPSEPM--PTGRVVGILQKNWRDYVVTFPSKEEVQSQGKNAQKILVTPWDYRIPKI
250 260 270 280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 RIETRQASTLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQP
:: :.:: ::. :..: ::.: .: :::::::: :: .:. : : ..:.:... :
CCDS10 RISTQQAETLQDFRVVVRIDSWESTSVYPNGHFVRVLGRIGDLEGEIATILVENSISVIP
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::.: . .: . ::... .. ..:.::: :: . :.:: :: :.::.: : :.:
CCDS10 FSEAQMCEMPVNTPESPWKVSPEEEQKRKDLRKSHL-VFSIDPKGCEDVDDTLSVRTLNN
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pF1KA1 GNLEVGVHIADVSHFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDR
::::.:::::::.::. :.. .: :. :.:: :: ..: ::.: .::..:::: :::
CCDS10 GNLELGVHIADVTHFVAPNSYIDIEARTRATTYYLADRRYDMLPSVLSADLCSLLGGVDR
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: : .::... . :: :. . ...: : .: : :: .:. .. :::
CCDS10 YAVSIMWELDKASYEIKKVWYGRTIIRSAYKLFYEAAQELLDGNLSVVDDIPEFKDLDEK
480 490 500 510 520 530
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..:. : .::. : .. : .. ::: : . :: ..:.. :: : : :
CCDS10 SRQAKLEELVWAIGKLTDIARHVRAKRDGCGALELEGVEVCVQLDDKKNIHDLIPKQPLE
540 550 560 570 580 590
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pF1KA1 LRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKT
..:: : : :.::: ::::: : : ..::::.:: : . : . :..... : :
CCDS10 VHET---VAECMILANHWVAKKIWESFPHQALLRQHPPPHQEFFSELRECAKAKGFFIDT
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. :.::.:::.:..: : .: ::: .::. : .:.:: .: ...::::::: ::
CCDS10 RSNKTLADSLDNANDPHDPIVNRLLRSMATQAMSNALYFSTGSCAEEEFHHYGLALDKYT
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pF1KA1 HFTSPIRRYADVIVHRLLAVAIGADCTYP---ELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRA
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CCDS10 HFTSPIRRYSDIVVHRLLMAAISKDKKMEIKGNLFSNKDLEELCRHINNRNQAAQHSQKQ
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:. . ..::.: ..:: . : .: :.....::..:..:......::
CCDS10 STELFQCMYFKDKDPATEERCISDGVIYSIRTNGVLLFIPRFGIKGAAYLKNKDGLVISC
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850 860 870 880 890
pF1KA1 --------KPNPQLIYDDEIPSLKI--EDTVFHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLV-
::. ....: : :...::.::.: :.: ...: . . ::. ..
CCDS10 GPDSCSEWKPGSLQRFQNKITSTTTDGESVTFHLFDHVTVRISIQASRCHSDTIRLEIIS
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900 910 920
pF1KA1 -EP-QIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
.: .::. . ..:
CCDS10 NKPYKIPNTELIHQSSPLLKSELVKEVTKSVEEAQLAQEVKVNIIQEEYQEYRQTKGRSL
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100 110 120 130 140 150
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CCDS45 LFANEFQQCCYLPRERGESMEKWQTRSIYNAAVWYYHHCQ-----DRMPIVMVTEDEEAI
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160 170 180 190 200
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.. . ::. ..: ..:. . : : :: : : :. :: :: . ::::
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210 220 230 240 250
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260 270 280 290 300 310
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CCDS45 LQKNWRDYVVTFPSKEEVQSQGKNAQKILVTPWDYRIPKIRISTQQAETLQDFRVVVRID
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.: .: :::::::: :: .:. : : ..:.:... :::.: . .: . ::..
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. .. ..:.::: :: . :.:: :: :.::.: : :.:::::.:::::::.::. :..
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.. : .. ::: : . :: ..:.. :: : : :..:: : : :.::: ::
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.: ::: .::. : .:.:: .: ...::::::: :::::::::::.:..::::: .
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820 830 840 850 860
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. : .: :.....::..:..:......:: ::. ....:
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pF1KA1 YAEAQLRIDSANMNDDITTSLRGLNKLAKILKKRRIEKGALTLSSPEVRFHMDSETHDPI
: .:: :.:
CCDS58 YEHAQSMIESPTEKIPAKELPPISPEHSSEEVHQQNADKDGAAHLQASHSPSAEDAEAQP
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pF1KA1 EEYVKSLTANPELIDRLACLSEEGNEIESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRAS
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CCDS42 RGVSAVAGPHDIGASPGDKKSKNRSTRGKKKSIFETYMSKEDVSEGLKRGTLIQGVLRIN
20 30 40 50 60 70
230 240 250 260 270
pF1KA1 RENYLEATVWIHGDNEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQW--VAPSS-----
... :: . . . ...:...:. :::.. :.:.:.:::. .: : : :
CCDS42 PKKFHEAFI---PSPDGDRDIFIDGVVARNRALNGDLVVVKLLPEEHWKVVKPESNDKET
80 90 100 110 120 130
280 290
pF1KA1 ------------------------------VVLHDE--GQNEED------------VEK-
:... . :.. :: :.:
CCDS42 EAAYESDIPEELCGHHLPQQSLKSYNDSPDVIVEAQFDGSDSEDGHGITQNVLVDGVKKL
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pF1KA1 -----EEERER----MLKT----------AVSEKMLKPTGRVVGII-KRNWRPYCGMLSK
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CCDS42 SVCVSEKGREDGDAPVTKDETTCISQDTRALSEKSLQRSAKVVYILEKKHSRAATGFLKL
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CCDS42 LADKNSELFRKYALFSPSDHRVPRIYVPLKDCPQDFVARPKDYANTLFICRIVDWKEDCN
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pF1KA1 YPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLSFLPK-MPWSITEKDMKNRED
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CCDS42 LRKDCIFTIDPSTARDLDDALSCKPLADGNFKVGVHIADVSYFVPEGSDLDKVAAERATS
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CCDS42 VYLVQKVVPMLPRLLCEELCSLNPMSDKLTFSVIWTLTPEGKILDEWFGRTIIRSCTKLS
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: .:: :.: . .... .. .:. .:: :...:. ::: :..
CCDS42 YEHAQSMIESPTEKIPAKELPPISPEHSSEEVHQAVLNLHGIAKQLRQQRFVDGALRLDQ
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pF1KA1 PEVRFHMDSETHDPIDLQTKELRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAP
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CCDS42 LKLAFTLDHETGLPQGCHIYEYRESNKLVEEFMLLANMAVAHKIHRAFPEQALLRRHPPP
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CCDS42 QTRMLSDLVEFCDQMGLPVDFSSAGALNKSLTQTFGDDKYSLARKEVLTNMCSRPMQMAL
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CCDS42 YFCSGLLQDPAQFRHYALNVPLYTHFTSPIRRFADVLVHRLLAAALGYRERLDMAPDTLQ
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CCDS42 KQADHC---NDRRMASKRVQELSTSLFFAVLVKESGPLESEAMVMGILKQAFDVLVLRYG
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CCDS42 VQKRIYCNALALRSHHFQKVGKKPELTLVWEPEDMEQEPAQQVITIFSLVEVVLQAESTA
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pF1KA1 LQHQKIRMSLVEPQIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
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CCDS42 LKYSAILKRPGTQGHLGPEKEEEESDGEPEDSSTS
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pF1KA1 EGQNEEDVEKEEERERMLKTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRN------------WRPYC---
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CCDS13 GRLDCGMAFAGDEVLVQLLSGDKAPEGRLRGRVLGVLKRKRHELAFVCRMDTWDPRIMVP
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CCDS13 INGSVTKIFVAELKDPSQVPIYSLRKGRLQRVGLERLTAEARHSRLFWVQIVLWRQGFYY
650 660 670 680 690 700
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