Result of FASTA (omim) for
pF1KA1008
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1008, 928 aa
1>>>pF1KA1008 928 - 928 aa - 928 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7816+/-0.000396; mu= 19.4977+/- 0.025
mean_var=84.4247+/-16.796, 0's: 0 Z-trim(113.8): 30 B-trim: 210 in 1/52
Lambda= 0.139585
statistics sampled from 23347 (23370) to 23347 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.274), width: 16
Scan time: 13.990
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001121698 (OMIM: 607533) exosome complex exonuc ( 928) 6159 1250.8 0
NP_001309277 (OMIM: 607533) exosome complex exonuc ( 835) 5459 1109.8 0
NP_055768 (OMIM: 607533) exosome complex exonuclea ( 958) 5459 1109.9 0
NP_001309278 (OMIM: 607533) exosome complex exonuc ( 796) 5238 1065.3 0
XP_005254203 (OMIM: 614183) PREDICTED: DIS3-like e ( 848) 964 204.6 1.7e-51
NP_588616 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease 1 i ( 971) 964 204.7 1.9e-51
NP_001310865 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease ( 971) 964 204.7 1.9e-51
NP_001310874 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease ( 971) 964 204.7 1.9e-51
NP_001310873 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease (1037) 964 204.7 2e-51
NP_001137160 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease (1054) 964 204.7 2e-51
NP_001310877 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease ( 994) 948 201.5 1.8e-50
NP_001310866 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease ( 928) 945 200.8 2.6e-50
NP_001310870 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease ( 920) 939 199.6 5.9e-50
NP_001310875 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease ( 920) 939 199.6 5.9e-50
NP_001310868 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease ( 920) 939 199.6 5.9e-50
NP_001310867 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease ( 920) 939 199.6 5.9e-50
NP_001310872 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease ( 684) 646 140.5 2.7e-32
NP_001310869 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease ( 684) 646 140.5 2.7e-32
NP_001244210 (OMIM: 267000,614184) DIS3-like exonu ( 603) 566 124.4 1.7e-27
NP_689596 (OMIM: 267000,614184) DIS3-like exonucle ( 885) 566 124.5 2.3e-27
NP_208384 (OMIM: 611265) helicase with zinc finger (2080) 323 75.8 2.5e-12
NP_001032412 (OMIM: 611265) helicase with zinc fin (2649) 323 75.9 3e-12
NP_001244211 (OMIM: 267000,614184) DIS3-like exonu ( 249) 168 44.0 0.0011
>>NP_001121698 (OMIM: 607533) exosome complex exonucleas (928 aa)
initn: 6159 init1: 6159 opt: 6159 Z-score: 6699.0 bits: 1250.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6159; 99.9% identity (99.9% similar) in 928 aa overlap (1-928:1-928)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLKSKTFLKKTRAGGVMKIVREHYLRDDIGCGAPGCAACGGAHEGPALEPQPQDPASSVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLKSKTFLKKTRAGGVMKIVREHYLRDDIGCGAPGCAACGGAHEGPALEPQPQDPASSVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 PQPHYLLPDTNVLLHQIVSAWRPGTWASVASSLRLPGSLETYVEQEQGENANDRNDRAIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PQPHYLLPDTNVLLHQIVSAWRPGTWASVASSLRLPGSLETYVEQEQGENANDRNDRAIR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 VAAKWYNEHLKKMSADNQLQVIFITNDRRNKEKAIEEGIPAFTCEEYVKSLTANPELIDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VAAKWYNEHLKKMSADNQLQVIFITNDRRNKEKAIEEGIPAFTCEEYVKSLTANPELIDR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LACLSEEGNEIESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRASRENYLEATVWIHGDNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LACLSEEGNEIESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRASRENYLEATVWIHGDNE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEERERML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
NP_001 ENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEETERML
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 KTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGMLSKSDIKESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGMLSKSDIKESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 STLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 FLPKMPWSITEKDMKNREDLRHLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLPKMPWSITEKDMKNREDLRHLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 HFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 EILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSANMNDDITTSLRGLNKLAKILKKRRIEKGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSANMNDDITTSLRGLNKLAKILKKRRIEKGAL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 TLSSPEVRFHMDSETHDPIDLQTKELRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLSSPEVRFHMDSETHDPIDLQTKELRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 HPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKSLAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKSLAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 AVYFCSGMDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLAVAIGADCTYPELTDKHKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVYFCSGMDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLAVAIGADCTYPELTDKHKL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 ADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEEAYILFVRKNAIVVLIPKYGLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEEAYILFVRKNAIVVLIPKYGLE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 GTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTVFHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLVEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTVFHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLVEP
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KA1 QIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
910 920
>>NP_001309277 (OMIM: 607533) exosome complex exonucleas (835 aa)
initn: 5459 init1: 5459 opt: 5459 Z-score: 5937.8 bits: 1109.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5459; 99.9% identity (99.9% similar) in 829 aa overlap (100-928:7-835)
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TNVLLHQIVSAWRPGTWASVASSLRLPGSLETYVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEH
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MCYCTRETYVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEH
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LKKMSADNQLQVIFITNDRRNKEKAIEEGIPAFTCEEYVKSLTANPELIDRLACLSEEGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKKMSADNQLQVIFITNDRRNKEKAIEEGIPAFTCEEYVKSLTANPELIDRLACLSEEGN
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 EIESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRASRENYLEATVWIHGDNEENKEIILQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EIESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRASRENYLEATVWIHGDNEENKEIILQG
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 LKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEERERMLKTAVSEKML
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
NP_001 LKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEETERMLKTAVSEKML
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 KPTGRVVGIIKRNWRPYCGMLSKSDIKESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQASTLEGRRII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KPTGRVVGIIKRNWRPYCGMLSKSDIKESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQASTLEGRRII
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 VAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLSFLPKMPWSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLSFLPKMPWSI
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 TEKDMKNREDLRHLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGNAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TEKDMKNREDLRHLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGNAL
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 DQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNAEILKTKFTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNAEILKTKFTK
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SVINSKASLTYAEAQLRIDSANMNDDITTSLRGLNKLAKILKKRRIEKGALTLSSPEVRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVINSKASLTYAEAQLRIDSANMNDDITTSLRGLNKLAKILKKRRIEKGALTLSSPEVRF
460 470 480 490 500 510
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 HMDSETHDPIDLQTKELRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HMDSETHDPIDLQTKELRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNY
520 530 540 550 560 570
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 EILVKAARSRNLEIKTDTAKSLAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSGMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EILVKAARSRNLEIKTDTAKSLAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSGMD
580 590 600 610 620 630
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 NDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLAVAIGADCTYPELTDKHKLADICKNLNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLAVAIGADCTYPELTDKHKLADICKNLNF
640 650 660 670 680 690
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 RHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEEAYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEEAYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKD
700 710 720 730 740 750
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 KPNPQLIYDDEIPSLKIEDTVFHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLVEPQIPGISIPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KPNPQLIYDDEIPSLKIEDTVFHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLVEPQIPGISIPT
760 770 780 790 800 810
910 920
pF1KA1 DTSNMDLNGPKKKKMKLGK
:::::::::::::::::::
NP_001 DTSNMDLNGPKKKKMKLGK
820 830
>>NP_055768 (OMIM: 607533) exosome complex exonuclease R (958 aa)
initn: 5995 init1: 5459 opt: 5459 Z-score: 5936.9 bits: 1109.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5927; 94.9% identity (95.4% similar) in 958 aa overlap (1-928:1-958)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLKSKTFLKKTRAGGVMKIVREHYLRDDIGCGAPGCAACGGAHEGPALEPQPQDPASSVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MLKSKTFLKKTRAGGVMKIVREHYLRDDIGCGAPGCAACGGAHEGPALEPQPQDPASSVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90
pF1KA1 PQPHYLLPDTNVLLHQIVSAWRPG-----TWASVASSLR---LP----------------
::::::::::::::::: :. . .: . .: :
NP_055 PQPHYLLPDTNVLLHQIDVLEDPAIRNVIVLQTVLQEVRNRSAPVYKRIRDVTNNQEKHF
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 ------GSLETYVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHLKKMSADNQLQVIFITNDRRN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YTFTNEHHRETYVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHLKKMSADNQLQVIFITNDRRN
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 KEKAIEEGIPAFTCEEYVKSLTANPELIDRLACLSEEGNEIESGKIIFSEHLPLSKLQQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KEKAIEEGIPAFTCEEYVKSLTANPELIDRLACLSEEGNEIESGKIIFSEHLPLSKLQQG
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 IKSGTYLQGTFRASRENYLEATVWIHGDNEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IKSGTYLQGTFRASRENYLEATVWIHGDNEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKS
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 QWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEERERMLKTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGML
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEETERMLKTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGML
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 SKSDIKESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQASTLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SKSDIKESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQASTLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNL
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 GDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLSFLPKMPWSITEKDMKNREDLRHLCICSVDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLSFLPKMPWSITEKDMKNREDLRHLCICSVDP
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 PGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMV
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 PELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNAEILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNAEILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSA
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 NMNDDITTSLRGLNKLAKILKKRRIEKGALTLSSPEVRFHMDSETHDPIDLQTKELRETN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NMNDDITTSLRGLNKLAKILKKRRIEKGALTLSSPEVRFHMDSETHDPIDLQTKELRETN
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 SMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKS
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 LAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSGMDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSGMDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIR
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 RYADVIVHRLLAVAIGADCTYPELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RYADVIVHRLLAVAIGADCTYPELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFF
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 KSKGIVSEEAYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KSKGIVSEEAYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTV
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920
pF1KA1 FHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLVEPQIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLVEPQIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
910 920 930 940 950
>>NP_001309278 (OMIM: 607533) exosome complex exonucleas (796 aa)
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::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSADNQLQVIFITNDRRNKEKAIEEGIPAF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TCEEYVKSLTANPELIDRLACLSEEGNEIESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFR
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pF1KA1 ASRENYLEATVWIHGDNEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASRENYLEATVWIHGDNEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHD
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::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FTPADKRIPRIRIETRQASTLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKSLAESLDQAESPT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VAIGADCTYPELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEEAYI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTVFHVFDKVKVKIM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDSSNLQHQKIRMSLVEPQIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
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. : :. :: .:. . .... .: . ..::
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. . .. :. .:.::. . . :.: :: :: .: . ... ....:.:..
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.. . ::. ..: ..:. . : : :: : : :. :: :: . ::::
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: :. ::::: :.:: . .... .:: : ..: :.. ..:...:.: ::..:
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pF1KA1 EDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEERERMLKTAVSEKMLKPTGRVVGI
:.:.::::::..: . .:.: :.: . . : . :: : ::::::::
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...::: : . :: .. :.... : :: : :::.::: :.:: ::. :..: ::
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.: .: :::::::: :: .:. : : ..:.:... :::.: . .: . ::..
XP_005 SWESTSVYPNGHFVRVLGRIGDLEGEIATILVENSISVIPFSEAQMCEMPVNTPESPWKV
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pF1KA1 TEKDMKNREDLR--HLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGN
. .. ..:.::: :: . :.:: :: :.::.: : :.:::::.:::::::.::. :..
XP_005 SPEEEQKRKDLRKSHL-VFSIDPKGCEDVDDTLSVRTLNNGNLELGVHIADVTHFVAPNS
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pF1KA1 ALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNA-EILKTK
.: :. :.:: :: ..: ::.: .::..:::: ::: : : .::... . :: :.
XP_005 YIDIEARTRATTYYLADRRYDMLPSVLSADLCSLLGGVDRYAVSIMWELDKASYEIKKVW
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pF1KA1 FTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSA-NMNDDIT-----------TSLRGL----NKLAKIL
. ...: : .: : :: .:. .. ::: ..:. : .::. :
XP_005 YGRTIIRSAYKLFYEAAQELLDGNLSVVDDIPEFKDLDEKSRQAKLEELVWAIGKLTDIA
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600 610 620 630 640
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.. : .. ::: : . :: ..:.. :: : : :..:: : : :.::: ::
XP_005 RHVRAKRDGCGALELEGVEVCVQLDDKKNIHDLIPKQPLEVHET---VAECMILANHWVA
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pF1KA1 KKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKSLAESLDQAESPTFPY
::: : : ..::::.:: : . : . :..... : : . :.::.:::.:..: :
XP_005 KKIWESFPHQALLRQHPPPHQEFFSELRECAKAKGFFIDTRSNKTLADSLDNANDPHDPI
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710 720 730 740 750 760
pF1KA1 LNTLLRILATRCMMQAVYFCSG--MDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLAV
.: ::: .::. : .:.:: .: ...::::::: :::::::::::.:..::::: .
XP_005 VNRLLRSMATQAMSNALYFSTGSCAEEEFHHYGLALDKYTHFTSPIRRYSDIVVHRLLMA
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770 780 790 800 810 820
pF1KA1 AIGADCTYP---ELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEEA
::. : . .: ... : ..:...: :...
XP_005 AISKDKKMEIKGNLFSNKDLEELCRHINNRNQVEM
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pF1KA1 YILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTVFHVFDKVKVK
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:. .:.::. . . :.: :: :: .: .
NP_588 GRRQYNKLRNLLKDARHDCILFANEFQQCCYLPRERGESMEKWQTRSIYNAAVWYYHHCQ
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pF1KA1 KMSADNQLQVIFITNDRRNKEK--AIEEGIPAFTCEEYVKS----LTANPELIDR-LACL
... ....:.:.. .. . ::. ..: ..:. . : : :: : :
NP_588 -----DRMPIVMVTEDEEAIQQYGSETEGVFVITFKNYLDNFWPDLKAAHELCDSILQSR
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pF1KA1 SEEGNEI-ESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRASREN-YLEATVWIHG----D
:. :: :: . ::::: :. ::::: :.:: . .... .:: : ..: :
NP_588 RERENESQESHGKEYPEHLPLEVLEAGIKSGRYIQGILNVNKHRAQIEAFVRLQGASSKD
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pF1KA1 NEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEERER
.. ..:...:.: ::..: :.:.::::::..: .:.: :.: . . :
NP_588 SDLVSDILIHGMKARNRSIHGDVVVVELLPKNEW-KGRTVAL-----CENDCDDKASGE-
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pF1KA1 MLKTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGML-SKSDI----KESRRHLFTPADKRIPRI
. :: : ::::::::...::: : . :: .. :.... : :: : :::.:
NP_588 ----SPSEPM--PTGRVVGILQKNWRDYVVTFPSKEEVQSQGKNAQKILVTPWDYRIPKI
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pF1KA1 RIETRQASTLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQP
:: :.:: ::. :..: ::.: .: :::::::: :: .:. : : ..:.:... :
NP_588 RISTQQAETLQDFRVVVRIDSWESTSVYPNGHFVRVLGRIGDLEGEIATILVENSISVIP
300 310 320 330 340 350
420 430 440 450 460
pF1KA1 FSQAVLSFLP----KMPWSITEKDMKNREDLR--HLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELEN
::.: . .: . ::... .. ..:.::: :: . :.:: :: :.::.: : :.:
NP_588 FSEAQMCEMPVNTPESPWKVSPEEEQKRKDLRKSHL-VFSIDPKGCEDVDDTLSVRTLNN
360 370 380 390 400 410
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pF1KA1 GNLEVGVHIADVSHFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDR
::::.:::::::.::. :.. .: :. :.:: :: ..: ::.: .::..:::: :::
NP_588 GNLELGVHIADVTHFVAPNSYIDIEARTRATTYYLADRRYDMLPSVLSADLCSLLGGVDR
420 430 440 450 460 470
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pF1KA1 LAFSCIWEMNHNA-EILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSA-NMNDDIT--------
: : .::... . :: :. . ...: : .: : :: .:. .. :::
NP_588 YAVSIMWELDKASYEIKKVWYGRTIIRSAYKLFYEAAQELLDGNLSVVDDIPEFKDLDEK
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..:. : .::. : .. : .. ::: : . :: ..:.. :: : : :
NP_588 SRQAKLEELVWAIGKLTDIARHVRAKRDGCGALELEGVEVCVQLDDKKNIHDLIPKQPLE
540 550 560 570 580 590
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pF1KA1 LRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKT
..:: : : :.::: ::::: : : ..::::.:: : . : . :..... : :
NP_588 VHET---VAECMILANHWVAKKIWESFPHQALLRQHPPPHQEFFSELRECAKAKGFFIDT
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. :.::.:::.:..: : .: ::: .::. : .:.:: .: ...::::::: ::
NP_588 RSNKTLADSLDNANDPHDPIVNRLLRSMATQAMSNALYFSTGSCAEEEFHHYGLALDKYT
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pF1KA1 HFTSPIRRYADVIVHRLLAVAIGADCTYP---ELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRA
:::::::::.:..::::: .::. : . .: ... : ..:...: :.. ::..:.
NP_588 HFTSPIRRYSDIVVHRLLMAAISKDKKMEIKGNLFSNKDLEELCRHINNRNQAAQHSQKQ
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pF1KA1 SVAFHTQLFFKSKGIVSEE-----AYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKD------
:. . ..::.: ..:: . : .: :.....::..:..:......::
NP_588 STELFQCMYFKDKDPATEERCISDGVIYSIRTNGVLLFIPRFGIKGAAYLKNKDGLVISC
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pF1KA1 --------KPNPQLIYDDEIPSLKI--EDTVFHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLV-
::. ....: : :...::.::.: :.: ...: . . ::. ..
NP_588 GPDSCSEWKPGSLQRFQNKITSTTTDGESVTFHLFDHVTVRISIQASRCHSDTIRLEIIS
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pF1KA1 -EP-QIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
.: .::. . ..:
NP_588 NKPYKIPNTELIHQSSPLLKSELVKEVTKSVEEAQLAQEVKVNIIQEEYQEYRQTKGRSL
900 910 920 930 940 950
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pF1KA1 VLLHQIVSAWRPGTWASVASSLRLPGSLETYVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHLK
:. .:.::. . . :.: :: :: .: .
NP_001 GRRQYNKLRNLLKDARHDCILFANEFQQCCYLPRERGESMEKWQTRSIYNAAVWYYHHCQ
20 30 40 50 60 70
140 150 160 170 180
pF1KA1 KMSADNQLQVIFITNDRRNKEK--AIEEGIPAFTCEEYVKS----LTANPELIDR-LACL
... ....:.:.. .. . ::. ..: ..:. . : : :: : :
NP_001 -----DRMPIVMVTEDEEAIQQYGSETEGVFVITFKNYLDNFWPDLKAAHELCDSILQSR
80 90 100 110 120
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pF1KA1 SEEGNEI-ESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRASREN-YLEATVWIHG----D
:. :: :: . ::::: :. ::::: :.:: . .... .:: : ..: :
NP_001 RERENESQESHGKEYPEHLPLEVLEAGIKSGRYIQGILNVNKHRAQIEAFVRLQGASSKD
130 140 150 160 170 180
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pF1KA1 NEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEERER
.. ..:...:.: ::..: :.:.::::::..: .:.: :.: . . :
NP_001 SDLVSDILIHGMKARNRSIHGDVVVVELLPKNEW-KGRTVAL-----CENDCDDKASGE-
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pF1KA1 MLKTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGML-SKSDI----KESRRHLFTPADKRIPRI
. :: : ::::::::...::: : . :: .. :.... : :: : :::.:
NP_001 ----SPSEPM--PTGRVVGILQKNWRDYVVTFPSKEEVQSQGKNAQKILVTPWDYRIPKI
250 260 270 280 290
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pF1KA1 RIETRQASTLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQP
:: :.:: ::. :..: ::.: .: :::::::: :: .:. : : ..:.:... :
NP_001 RISTQQAETLQDFRVVVRIDSWESTSVYPNGHFVRVLGRIGDLEGEIATILVENSISVIP
300 310 320 330 340 350
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pF1KA1 FSQAVLSFLP----KMPWSITEKDMKNREDLR--HLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELEN
::.: . .: . ::... .. ..:.::: :: . :.:: :: :.::.: : :.:
NP_001 FSEAQMCEMPVNTPESPWKVSPEEEQKRKDLRKSHL-VFSIDPKGCEDVDDTLSVRTLNN
360 370 380 390 400 410
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pF1KA1 GNLEVGVHIADVSHFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDR
::::.:::::::.::. :.. .: :. :.:: :: ..: ::.: .::..:::: :::
NP_001 GNLELGVHIADVTHFVAPNSYIDIEARTRATTYYLADRRYDMLPSVLSADLCSLLGGVDR
420 430 440 450 460 470
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pF1KA1 LAFSCIWEMNHNA-EILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSA-NMNDDIT--------
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NP_001 YAVSIMWELDKASYEIKKVWYGRTIIRSAYKLFYEAAQELLDGNLSVVDDIPEFKDLDEK
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580 590 600 610 620
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..:. : .::. : .. : .. ::: : . :: ..:.. :: : : :
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..:: : : :.::: ::::: : : ..::::.:: : . : . :..... : :
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. :.::.:::.:..: : .: ::: .::. : .:.:: .: ...::::::: ::
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:::::::::.:..::::: .::. : . .: ... : ..:...: :.. ::..:.
NP_001 HFTSPIRRYSDIVVHRLLMAAISKDKKMEIKGNLFSNKDLEELCRHINNRNQAAQHSQKQ
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:. . ..::.: ..:: . : .: :.....::..:..:......::
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::. ....: : :...::.::.: :.: ...: . . ::. ..
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.: .::. . ..:
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... ....:.:.. .. . ::. ..: ..:. . : : :: : :
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.. ..:...:.: ::..: :.:.::::::..: .:.: :.: . . :
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. :: : ::::::::...::: : . :: .. :.... : :: : :::.:
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:: :.:: ::. :..: ::.: .: :::::::: :: .:. : : ..:.:... :
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::.: . .: . ::... .. ..:.::: :: . :.:: :: :.::.: : :.:
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..:. : .::. : .. : .. ::: : . :: ..:.. :: : : :
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. :.::.:::.:..: : .: ::: .::. : .:.:: .: ...::::::: ::
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:. . ..::.: ..:: . : .: :.....::..:..:......::
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::. ....: : :...::.::.: :.: ...: . . ::. ..
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pF1KA1 -EP-QIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
.: .::. . ..:
NP_001 NKPYKIPNTELIHQSSPLLKSELVKEVTKSVEEAQLAQEVKVNIIQEEYQEYRQTKGRSL
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NP_001 -----DRMPIVMVTEDEEAIQQYGSETEGVFVITFKNYLDNFWPDLKAAHELCDSILQSR
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pF1KA1 SEEGNEI-ESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRASREN-YLEATVWIHG----D
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240 250 260 270 280 290
pF1KA1 NEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEERER
.. ..:...:.: ::..: :.:.::::::..: .:.: :.: . . :
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. :: : ::::::::...::: : . :: .. :.... : :: : :::.:
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::.: . .: . ::... .. ..:.::: :: . :.:: :: :.::.: : :.:
NP_001 FSEAQMCEMPVNTPESPWKVSPEEEQKRKDLRKSHL-VFSIDPKGCEDVDDTLSVRTLNN
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NP_001 YAVSIMWELDKASYEIKKVWYGRTIIRSAYKLFYEAAQELLDGNLSVVDDIPEFKDLDEK
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pF1KA1 ---TSLRGL----NKLAKILKKRRIEK---GALTLSSPEVRFHMDSET--HDPIDLQTKE
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NP_001 RSNKTLADSLDNANDPHDPIVNRLLRSMATQAMSNALYFSTGSCAEEEFHHYGLALDKYT
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pF1KA1 HFTSPIRRYADVIVHRLLAVAIGADCTYP---ELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRA
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NP_001 HFTSPIRRYSDIVVHRLLMAAISKDKKMEIKGNLFSNKDLEELCRHINNRNQAAQHSQKQ
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810 820 830 840
pF1KA1 SVAFHTQLFFKSKGIVSEE-----AYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKD------
:. . ..::.: ..:: . : .: :.....::..:..:......::
NP_001 STELFQCMYFKDKDPATEERCISDGVIYSIRTNGVLLFIPRFGIKGAAYLKNKDGLVISC
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850 860 870 880 890
pF1KA1 --------KPNPQLIYDDEIPSLKI--EDTVFHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLV-
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900 910 920
pF1KA1 -EP-QIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
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NP_001 MLQKREKVLLLRTFQGRTLRIVREHYLRPCVPCHSPLCPQPAAC--SHDGKLL---SSDV
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pF1KA1 ASSVCPQ----PHYL----LPDTN--VLLHQIVSAWRPGTWASVASSLR-----------
. : :. :: .:. . .... .: . ..::
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pF1KA1 -LPGSLET--YVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHLKKMSADNQLQVIFITNDRRNK
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NP_001 LFANEFQQCCYLPRERGESMEKWQTRSIYNAAVWYYHHCQ-----DRMPIVMVTEDEEAI
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pF1KA1 EK--AIEEGIPAFTCEEYVKS----LTANPELIDR-LACLSEEGNEI-ESGKIIFSEHLP
.. . ::. ..: ..:. . : : :: : : :. :: :: . ::::
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NP_001 LEVLEAGIKSGRYIQGILNVNKHRAQIEAFVRLQGASSKDSDLVSDILIHGMKARNRSIH
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pF1KA1 EDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEERERMLKTAVSEKMLKPTGRVVGI
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pF1KA1 IKRNWRPYCGML-SKSDI----KESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQASTLEGRRIIVAID
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NP_001 LQKNWRDYVVTFPSKEEVQSQGKNAQKILVTPWDYRIPKIRISTQQAETLQDFRVVVRID
340 350 360 370 380 390
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pF1KA1 GWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLSFLP----KMPWSI
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NP_001 SWESTSVYPNGHFVRVLGRIGDLEGEIATILVENSISVIPFSEAQMCEMPVNTPESPWKV
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pF1KA1 TEKDMKNREDLR--HLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGN
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NP_001 SPEEEQKRKDLRKSHL-VFSIDPKGCEDVDDTLSVRTLNNGNLELGVHIADVTHFVAPNS
460 470 480 490 500 510
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pF1KA1 ALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNA-EILKTK
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NP_001 YIDIEARTRATTYYLADRRYDMLPSVLSADLCSLLGGVDRYAVSIMWELDKASYEIKKVW
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pF1KA1 FTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSA-NMNDDIT-----------TSLRGL----NKLAKIL
. ...: : .: : :: .:. .. ::: ..:. : .::. :
NP_001 YGRTIIRSAYKLFYEAAQELLDGNLSVVDDIPEFKDLDEKSRQAKLEELVWAIGKLTDIA
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NP_001 RHVRAKRDGCGALELEGVEVCVQLDDKKNIHDLIPKQPLEVHET---VAECMILANHWVA
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pF1KA1 KKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKSLAESLDQAESPTFPY
::: : : ..::::.:: : . : . :..... : : . :.::.:::.:..: :
NP_001 KKIWESFPHQALLRQHPPPHQEFFSELRECAKAKGFFIDTRSNKTLADSLDNANDPHDPI
700 710 720 730 740 750
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pF1KA1 LNTLLRILATRCMMQAVYFCSG--MDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLAV
.: ::: .::. : .:.:: .: ...::::::: :::::::::::.:..::::: .
NP_001 VNRLLRSMATQAMSNALYFSTGSCAEEEFHHYGLALDKYTHFTSPIRRYSDIVVHRLLMA
760 770 780 790 800 810
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pF1KA1 AIGADCTYP---ELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEE-
::. : . .: ... : ..:...: :.. ::..:. :. . ..::.: ..::
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