Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1016
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1016, 728 aa
1>>>pF1KA1016 728 - 728 aa - 728 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0595+/-0.00103; mu= 8.0557+/- 0.062
mean_var=188.3206+/-38.854, 0's: 0 Z-trim(110.8): 103 B-trim: 74 in 1/51
Lambda= 0.093460
statistics sampled from 11752 (11857) to 11752 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.708), E-opt: 0.2 (0.364), width: 16
Scan time: 2.640
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31972.1 LRCH1 gene_id:23143|Hs108|chr13 ( 728) 4851 667.1 2.6e-191
CCDS53866.1 LRCH1 gene_id:23143|Hs108|chr13 ( 696) 4422 609.3 6.4e-174
CCDS53865.1 LRCH1 gene_id:23143|Hs108|chr13 ( 763) 3672 508.2 1.9e-143
CCDS3330.1 LRCH3 gene_id:84859|Hs108|chr3 ( 712) 1227 178.5 3.1e-44
CCDS59175.1 LRCH2 gene_id:57631|Hs108|chrX ( 748) 1127 165.0 3.7e-40
CCDS48155.1 LRCH2 gene_id:57631|Hs108|chrX ( 765) 1127 165.0 3.8e-40
CCDS34706.1 LRCH4 gene_id:4034|Hs108|chr7 ( 683) 1040 153.3 1.2e-36
>>CCDS31972.1 LRCH1 gene_id:23143|Hs108|chr13 (728 aa)
initn: 4851 init1: 4851 opt: 4851 Z-score: 3548.2 bits: 667.1 E(32554): 2.6e-191
Smith-Waterman score: 4851; 99.9% identity (99.9% similar) in 728 aa overlap (1-728:1-728)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MATPGSEPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGGFNLPLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MATPGSEPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGGFNLPLN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 RGLERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RGLERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 SLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 PEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLPLVKFDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS31 PEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLSLVKFDF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 SCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 YLHTMERPHLHQHVEDGKKDSDSGVGSDNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YLHTMERPHLHQHVEDGKKDSDSGVGSDNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 IKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAED
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTDITERSVLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTDITERSVLNL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 YPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIRENSPAVSPTTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIRENSPAVSPTTN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 STAPFGLKPRSVFLRPQRNLESIDPQFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 STAPFGLKPRSVFLRPQRNLESIDPQFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 DLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 ADLCSPCDILQLDFRHIRKTVDTLLALGEKAPPPTSALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ADLCSPCDILQLDFRHIRKTVDTLLALGEKAPPPTSALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYIT
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 YHWNALSA
::::::::
CCDS31 YHWNALSA
>>CCDS53866.1 LRCH1 gene_id:23143|Hs108|chr13 (696 aa)
initn: 4825 init1: 4422 opt: 4422 Z-score: 3235.9 bits: 609.3 E(32554): 6.4e-174
Smith-Waterman score: 4422; 99.0% identity (99.1% similar) in 671 aa overlap (1-671:1-671)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MATPGSEPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGGFNLPLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MATPGSEPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGGFNLPLN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 RGLERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RGLERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 SLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 PEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLPLVKFDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS53 PEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLSLVKFDF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 SCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 YLHTMERPHLHQHVEDGKKDSDSGVGSDNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YLHTMERPHLHQHVEDGKKDSDSGVGSDNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 IKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAED
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTDITERSVLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTDITERSVLNL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 YPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIRENSPAVSPTTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIRENSPAVSPTTN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 STAPFGLKPRSVFLRPQRNLESIDPQFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 STAPFGLKPRSVFLRPQRNLESIDPQFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 DLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 ADLCSPCDILQLDFRHIRKTVDTLLALGEKAPPPTSALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYIT
:: : ::.
CCDS53 EKLCLPHHILEEKGLVKVGITIQALLDITVTKALFT
670 680 690
>>CCDS53865.1 LRCH1 gene_id:23143|Hs108|chr13 (763 aa)
initn: 3672 init1: 3672 opt: 3672 Z-score: 2688.8 bits: 508.2 E(32554): 1.9e-143
Smith-Waterman score: 4756; 95.3% identity (95.3% similar) in 760 aa overlap (1-725:1-760)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MATPGSEPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGGFNLPLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MATPGSEPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGGFNLPLN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 RGLERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RGLERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 SLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 PEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLPLVKFDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS53 PEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLSLVKFDF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 SCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 YLHTMERPHLHQHVEDGKKDSDSGVGSDNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YLHTMERPHLHQHVEDGKKDSDSGVGSDNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 IKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAED
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTDITERSVLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTDITERSVLNL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 YPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIRENSPAVSPTTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIRENSPAVSPTTN
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KA1 STAPFGLKPRS-----------------------------------VFLRPQRNLESIDP
::::::::::: ::::::::::::::
CCDS53 STAPFGLKPRSDPALILPPISFNTLTQAQTWDSSSYSVPSEGDSDNVFLRPQRNLESIDP
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 QFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVA
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 SIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQLDFRHIRKTVDTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQLDFRHIRKTVDTLL
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720
pF1KA1 ALGEKAPPPTSALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYITYHWNALSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ALGEKAPPPTSALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYITYHWNALSA
730 740 750 760
>>CCDS3330.1 LRCH3 gene_id:84859|Hs108|chr3 (712 aa)
initn: 1394 init1: 1024 opt: 1227 Z-score: 907.5 bits: 178.5 E(32554): 3.1e-44
Smith-Waterman score: 1456; 43.3% identity (66.3% similar) in 695 aa overlap (38-634:22-710)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 PQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSG-GFNLP--LNRGLE
: . :: : ..:.: ::. : .:.:.
CCDS33 MAAAGLVAVAAAAEYSGTVASGGNLPGVHCGPSSGAGPGFG-PGSWSRSLD
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 RALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEI
::::::: .: :.::.:::.:::: :: .:::.::..::::.::: :.:.: :::::::
CCDS33 RALEEAAVTGVLSLSGRKLREFPRGAA-NHDLTDTTRADLSRNRLSEIPIEACHFVSLEN
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEI
::::.:::: :::::.::: ::.::.::::::.::. ::.::::::::::::: ::::::
CCDS33 LNLYQNCIRYIPEAILNLQALTFLNISRNQLSTLPVHLCNLPLKVLIASNNKLVSLPEEI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 GQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNK
:.:..::::::::::: ..:.:::.:..::.::::::.: ::.::..:::...::::::
CCDS33 GHLRHLMELDVSCNEIQTIPSQIGNLEALRDLNVRRNHLVHLPEELAELPLIRLDFSCNK
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 VLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSLYLHT
. .::.:.:....::.. :.:::::::::::: ::::::::::.::::.: : .: .
CCDS33 ITTIPVCYRNLRHLQTITLDNNPLQSPPAQICIKGKVHIFKYLNIQACKI--APDLPDYD
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KA1 MERP----HLHQHVEDGKKDS--DSGVGS-DNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEE
.:: :... ... . ::: .: :.:::: :..::.:: . .: . ...: .:
CCDS33 -RRPLGFGSCHEELYSSRPYGALDSGFNSVDSGDKRWSGNEPTDEFS-DLPLRVAEITKE
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 EQIIKEDSCH--RLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEE----RDQFTDRADGLHSEF
... .:.. . : : : . : . . :: .. :: :. :.: :.:
CCDS33 QRLRRESQYQENRGSLVVTNGGVEHDLDQIDYIDSCTAEEEEAEVRQPKGPDPDSLSSQF
350 360 370 380 390 400
420 430 440
pF1KA1 MNY-------------KARA----EDCEELLRI--EEDVHWQTEGIIS--SSKDQ----D
: : : : . :.. : .. : . ...: .:..: :
CCDS33 MAYIEQRRISHEGSPVKPVAIREFQKTEDMRRYLHQNRVPAEPSSLLSLSASHNQLSHTD
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490
pF1KA1 MDI-----AMIEQLREAVDL--LQ-DPNGLSTDITER-SVLNLYPMGSAEALELQDSALN
... ..:. :. ..: :: . . . : .: .::.. . .... . : :.
CCDS33 LELHQRREQLVERTRREAQLAALQYEEEKIRTKQIQRDAVLDFVKQKASQSPQKQHPLLD
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530
pF1KA1 G-----------QIQLETSPVCEVQSDLT------LQSNGSQYSP--NEIREN----SPA
: . . . : .: : :. ..: ..: .. : : :::
CCDS33 GVDGECPFPSRRSQHTDDSALCMSLSGLNQVGCAATLPHSSAFTPLKSDDRPNALLSSPA
530 540 550 560 570 580
540 550 560 570
pF1KA1 VSPTTNSTA---PFGL------KPRSVFLR---------------PQRNLESIDPQFTIR
. . .: : : .. .:.: ..: : . : .:
CCDS33 TETVHHSPAYSFPAAIQRNQPQRPESFLFRAGVRAETNKGHASPLPPSAAPTTDSTDSIT
590 600 610 620 630 640
580 590 600 610 620
pF1KA1 RKMEQMREEK-ELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHV
. ..:::. ::..:::. ::.:::::: :::::: ::::::::.::.::::: ::::
CCDS33 GQNSRQREEELELIDQLRKHIEYRLKVSLPCDLGAALTDGVVLCHLANHVRPRSVPSIHV
650 660 670 680 690 700
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 PSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQLDFRHIRKTVDTLLALGE
:::::
CCDS33 PSPAVVS
710
>>CCDS59175.1 LRCH2 gene_id:57631|Hs108|chrX (748 aa)
initn: 1843 init1: 977 opt: 1127 Z-score: 834.4 bits: 165.0 E(32554): 3.7e-40
Smith-Waterman score: 1872; 48.3% identity (68.9% similar) in 726 aa overlap (37-687:29-737)
10 20 30 40 50
pF1KA1 EPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGG-----------F
:: : :::::::::.:: :
CCDS59 MAASQGGGGNSGGGGCGGGGSSGGCGTAGGGG--GGAGGGGGGGGGTLVVPIPVPTLF
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KA1 NLPLNRG----------------LERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDT
. :. : :.::::::..:: :.::.:::..:: . :.::.::
CCDS59 GQPFPNGPPWNPGSLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGILSLSGRKLRDFP---GSGYDLTDT
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 VQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALP
.:::::.::..:.: .. :. :: ::::::::..::::: :::::::::.::: ::.::
CCDS59 TQADLSRNRFTEIPSDVWLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLNISRNLLSTLP
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 ACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVR
: ::::::..::::: :.:::::.::.:::::.::::: .::::.:.:.::::::.:
CCDS59 KYLFDLPLKVLVVSNNKLVSIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKLHSLRELNIR
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 RNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKG
:: :.:::.:: ::::::.::::::: ::.:.:....:::..:.::::: :::::: ::
CCDS59 RNNLHVLPDELGDLPLVKLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKG
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KA1 KVHIFKYLSIQAC--QIKTADSLYLHTMERPHLHQHVEDGKKD--------SDSGVGSDN
::::::::.:::: . : ::: : .. . : . :. .: :::.::::
CCDS59 KVHIFKYLNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDN
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 GDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQIIKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGD
:.::::.:::::.:::::. .:. ..:: ..:: : . .. :: :
CCDS59 GEKRLSTTEPSDDDTVSLHSQVSE-SNREQTSRNDSHIIGSKTDSQKDQEVY-------D
360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 STNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAEDCEELLRIEEDV----HWQTEGIISSSKDQ
.. . : ..... . :... : : : : .:.. . . : ... ...
CCDS59 FVDPNTEDVAVPEQGNAHIGSFVSFFKGKEKCSEKSRKNEELGDEKRLEKEQLLA--EEE
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480
pF1KA1 DMDIAMIEQLRE-AVDLLQDPN-----GLSTDIT----------ERSV----LN--LYPM
: :. . .::. :..:::. . . ::.. :.:: .: : :.
CCDS59 DDDLKEVTDLRKIAAQLLQQEQKNRILNHSTSVMRNKPKQTVECEKSVSADEVNSPLSPL
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530
pF1KA1 GSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNG---------SQYSPNEIRENSPA
. . :: : . .. : :. :. ::. .:. :. . . ::.
CCDS59 -TWQPLENQKDQIDEQPWPESHPIIW-QSEERRRSKQIRKEYFKYKSMRKSSSGNENDEE
530 540 550 560 570 580
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 VSPTTN-STAPFGLKPRSVFLRPQRN-LESIDPQFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEM
. : . : .::::::::.: : .:. . :: ::.:::::..:::.: ..:::...:
CCDS59 YDRTDGFSHSPFGLKPRSAFSRSSRQEYGAADPGFTMRRKMEHLREEREQIRQLRNNLES
590 600 610 620 630 640
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 RLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEA
:::: : .:.:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS59 RLKVILPDDIGAALMDGVVLCHLANHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLDA
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660 670 680 690 700 710
pF1KA1 CRKLGVPEADLCSPCDILQL-DFRHIRKTVDTLLALGEKAPPPTSALRSRDLIGFCLVHI
:.:::: . :: : ::. . .. ::..:: :
CCDS59 CKKLGVSQERLCLPHHILEERGLVKVGVTVQALLELPTTKASQLSVA
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720
pF1KA1 LFIVLVYITYHWNALSA
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10 20 30 40 50
pF1KA1 EPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGG-----------F
:: : :::::::::.:: :
CCDS48 MAASQGGGGNSGGGGCGGGGSSGGCGTAGGGG--GGAGGGGGGGGGTLVVPIPVPTLF
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KA1 NLPLNRG----------------LERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDT
. :. : :.::::::..:: :.::.:::..:: . :.::.::
CCDS48 GQPFPNGPPWNPGSLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGILSLSGRKLRDFP---GSGYDLTDT
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 VQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALP
.:::::.::..:.: .. :. :: ::::::::..::::: :::::::::.::: ::.::
CCDS48 TQADLSRNRFTEIPSDVWLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLNISRNLLSTLP
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 ACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVR
: ::::::..::::: :.:::::.::.:::::.::::: .::::.:.:.::::::.:
CCDS48 KYLFDLPLKVLVVSNNKLVSIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKLHSLRELNIR
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 RNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKG
:: :.:::.:: ::::::.::::::: ::.:.:....:::..:.::::: :::::: ::
CCDS48 RNNLHVLPDELGDLPLVKLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKG
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KA1 KVHIFKYLSIQAC--QIKTADSLYLHTMERPHLHQHVEDGKKD--------SDSGVGSDN
::::::::.:::: . : ::: : .. . : . :. .: :::.::::
CCDS48 KVHIFKYLNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDN
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330 340 350 360 370 380
pF1KA1 GDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQIIKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGD
:.::::.:::::.:::::. .:. ..:: ..:: : . .. :: :
CCDS48 GEKRLSTTEPSDDDTVSLHSQVSE-SNREQTSRNDSHIIGSKTDSQKDQEVY-------D
360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 STNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAEDCEELLRIEEDV----HWQTEGIISSSKDQ
.. . : ..... . :... : : : : .:.. . . : ... ...
CCDS48 FVDPNTEDVAVPEQGNAHIGSFVSFFKGKEKCSEKSRKNEELGDEKRLEKEQLLA--EEE
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480
pF1KA1 DMDIAMIEQLRE-AVDLLQDPN-----GLSTDIT----------ERSV----LN--LYPM
: :. . .::. :..:::. . . ::.. :.:: .: : :.
CCDS48 DDDLKEVTDLRKIAAQLLQQEQKNRILNHSTSVMRNKPKQTVECEKSVSADEVNSPLSPL
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520
pF1KA1 GSAEALELQDSALNGQIQLETSPVC----------EVQSD------LTLQSNGS----QY
. . :: : . .. : :. :. ..... . .:.:. :
CCDS48 -TWQPLENQKDQIDEQPWPESHPIIWQSEERRRSKQIRKEYFKYKSMRKSSSGNENDEQD
530 540 550 560 570 580
530 540 550 560 570
pF1KA1 SPN-EIRENSPAVSPTTNST-----APFGLKPRSVFLRPQRN-LESIDPQFTIRRKMEQM
: : .. .::. : . : .::::::::.: : .:. . :: ::.:::::..
CCDS48 SDNANMSTQSPVSSEEYDRTDGFSHSPFGLKPRSAFSRSSRQEYGAADPGFTMRRKMEHL
590 600 610 620 630 640
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 REEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPK
:::.: ..:::...: :::: : .:.:::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS48 REEREQIRQLRNNLESRLKVILPDDIGAALMDGVVLCHLANHIRPRSVASIHVPSPAVPK
650 660 670 680 690 700
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 LSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQL-DFRHIRKTVDTLLALGEKAPPPT
::::::::::::::.::.:::: . :: : ::. . .. ::..:: :
CCDS48 LSMAKCRRNVENFLDACKKLGVSQERLCLPHHILEERGLVKVGVTVQALLELPTTKASQL
710 720 730 740 750 760
700 710 720
pF1KA1 SALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYITYHWNALSA
CCDS48 SVA
>>CCDS34706.1 LRCH4 gene_id:4034|Hs108|chr7 (683 aa)
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20 30 40 50 60
pF1KA1 FVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGS-----GGFNLPLNRGLER
:: .::: ... :. .:: :. ::
CCDS34 MAAAVAAPLAAGGEEAAATTSVPGSPGLPGRRSAER
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 ALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEIL
:::::. .: :::: :.::.::: :: ..:::: .:::::.::. ::: :..:::: :
CCDS34 ALEEAVATGTLNLSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEVPEAACQLVSLEGL
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 NLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIG
.:::::.: . :. :: :::::::::::: :: .: :::.:::.::::::.:: .::
CCDS34 SLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLPLRVLIVSNNKLGALPPDIG
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 QLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNKV
: .: .:::: ::. .::... :.:::.:::::: :..::.:: :::::..:::::.:
CCDS34 TLGSLRQLDVSSNELQSLPSELCGLSSLRDLNVRRNQLSTLPEELGDLPLVRLDFSCNRV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 LVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSLYLHTM
::. : ....:::.::..:::::::::.: :::.::::::: .: : .: : .
CCDS34 SRIPVSFCRLRHLQVILLDSNPLQSPPAQVCLKGKLHIFKYLSTEAGQRGSA--LGDLAP
220 230 240 250 260 270
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pF1KA1 ERPHLHQH--VED---GKK-DS--DSGVGS-DNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIME
:: . .:: :.. :. ::: : :.:.:: :..: .:: . :. .:.. .
CCDS34 SRPPSFSPCPAEDLFPGHRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSGNESTDEFS-ELSFRISELAR
280 290 300 310 320 330
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pF1KA1 EEQII---KEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEERDQFTDR-ADGLHSEFM
: . :::. .::. .: . : :.. . : ..: . . : ..
CCDS34 EPRGPRERKEDGSADGDPVQIDFIDSHVP-----GEDEERGTVEEQRPPELSPGAGDRER
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..: :. :: : . :: . ..:... : . : : : ::
CCDS34 APSSRREEPAGEERRRPDTLQLWQER----ERRQQQQSGAWGAPRK---DSLLKP-GL--
390 400 410 420 430
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pF1KA1 DITERSVLNLYPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIRE
:.:. :.: :. : . :: :: ... . ..:. .:
CCDS34 ----RAVV-----GGAAAVSTQ-AMHNG------SPKSSASQAGAAAGQGAPAPAPASQE
440 450 460 470 480
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pF1KA1 NSPAVSPTTNSTA-PFG--LKPRSVFLRP--QRNLESIDPQFTIR-RKMEQMREEKELVE
: ..:.: . :.: .: : ..: : . .:. ..: :.. :. .::.:.
CCDS34 PLPIAGPATAPAPRPLGSIQRPNSFLFRSSSQSGSGPSSPDSVLRPRRYPQVPDEKDLMT
490 500 510 520 530 540
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pF1KA1 QLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRR
:::. .: ::. : :::. :: .::.::.:.:..::::: :::::::::::: : :.
CCDS34 QLRQVLESRLQRPLPEDLAEALASGVILCQLANQLRPRSVPFIHVPSPAVPKLSALKARK
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pF1KA1 NVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQLDFRHIRKTVDTLLALGEKAPPPTSALRSRDLI
:::.:::::::.:::::::::: :.:: : .: ..... .: :: :: :
CCDS34 NVESFLEACRKMGVPEADLCSPSDLLQGTARGLRTALEAVKRVGGKALPPLWP--PSGLG
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pF1KA1 GFCLVHILFIVLVYITYHWNALSA
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CCDS34 GFVVFYVVLMLLLYVTYTRLLGS
670 680
728 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 20:16:17 2016 done: Wed Nov 2 20:16:17 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]