Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1031
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1031, 977 aa
1>>>pF1KA1031 977 - 977 aa - 977 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4652+/-0.000963; mu= 7.2988+/- 0.058
mean_var=175.6239+/-35.488, 0's: 0 Z-trim(111.0): 25 B-trim: 6 in 1/51
Lambda= 0.096779
statistics sampled from 12055 (12074) to 12055 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.714), E-opt: 0.2 (0.371), width: 16
Scan time: 4.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14013.1 ZC3H7B gene_id:23264|Hs108|chr22 ( 977) 6755 956.1 0
CCDS10550.1 ZC3H7A gene_id:29066|Hs108|chr16 ( 971) 2949 424.7 4.3e-118
>>CCDS14013.1 ZC3H7B gene_id:23264|Hs108|chr22 (977 aa)
initn: 6755 init1: 6755 opt: 6755 Z-score: 5105.5 bits: 956.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6755; 100.0% identity (100.0% similar) in 977 aa overlap (1-977:1-977)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MERQKRKADIEKGLQFIQSTLPLKQEEYEAFLLKLVQNLFAEGNDLFREKDYKQALVQYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MERQKRKADIEKGLQFIQSTLPLKQEEYEAFLLKLVQNLFAEGNDLFREKDYKQALVQYM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EGLNVADYAASDQVALPRELLCKLHVNRAACYFTMGLYEKALEDSEKALGLDSESIRALF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EGLNVADYAASDQVALPRELLCKLHVNRAACYFTMGLYEKALEDSEKALGLDSESIRALF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 RKARALNELGRHKEAYECSSRCSLALPHDESVTQLGQELAQKLGLRVRKAYKRPQELETF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RKARALNELGRHKEAYECSSRCSLALPHDESVTQLGQELAQKLGLRVRKAYKRPQELETF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SLLSNGTAAGVADQGTSNGLGSIDDIETDCYVDPRGSPALLPSTPTMPLFPHVLDLLAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SLLSNGTAAGVADQGTSNGLGSIDDIETDCYVDPRGSPALLPSTPTMPLFPHVLDLLAPL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 DSSRTLPSTDSLDDFSDGDVFGPELDTLLDSLSLVQGGLSGSGVPSELPQLIPVFPGGTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DSSRTLPSTDSLDDFSDGDVFGPELDTLLDSLSLVQGGLSGSGVPSELPQLIPVFPGGTP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LLPPVVGGSIPVSSPLPPASFGLVMDPSKKLAASVLDALDPPGPTLDPLDLLPYSETRLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LLPPVVGGSIPVSSPLPPASFGLVMDPSKKLAASVLDALDPPGPTLDPLDLLPYSETRLD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 ALDSFGSTRGSLDKPDSFMEETNSQDHRPPSGAQKPAPSPEPCMPNTALLIKNPLAATHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ALDSFGSTRGSLDKPDSFMEETNSQDHRPPSGAQKPAPSPEPCMPNTALLIKNPLAATHE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 FKQACQLCYPKTGPRAGDYTYREGLEHKCKRDILLGRLRSSEDQTWKRIRPRPTKTSFVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FKQACQLCYPKTGPRAGDYTYREGLEHKCKRDILLGRLRSSEDQTWKRIRPRPTKTSFVG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SYYLCKDMINKQDCKYGDNCTFAYHQEEIDVWTEERKGTLNRDLLFDPLGGVKRGSLTIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SYYLCKDMINKQDCKYGDNCTFAYHQEEIDVWTEERKGTLNRDLLFDPLGGVKRGSLTIA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 KLLKEHQGIFTFLCEICFDSKPRIISKGTKDSPSVCSNLAAKHSFYNNKCLVHIVRSTSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KLLKEHQGIFTFLCEICFDSKPRIISKGTKDSPSVCSNLAAKHSFYNNKCLVHIVRSTSL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 KYSKIRQFQEHFQFDVCRHEVRYGCLREDSCHFAHSFIELKVWLLQQYSGMTHEDIVQES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KYSKIRQFQEHFQFDVCRHEVRYGCLREDSCHFAHSFIELKVWLLQQYSGMTHEDIVQES
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 KKYWQQMEAHAGKASSSMGAPRTHGPSTFDLQMKFVCGQCWRNGQVVEPDKDLKYCSAKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KKYWQQMEAHAGKASSSMGAPRTHGPSTFDLQMKFVCGQCWRNGQVVEPDKDLKYCSAKA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 RHCWTKERRVLLVMSKAKRKWVSVRPLPSIRNFPQQYDLCIHAQNGRKCQYVGNCSFAHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RHCWTKERRVLLVMSKAKRKWVSVRPLPSIRNFPQQYDLCIHAQNGRKCQYVGNCSFAHS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 PEERDMWTFMKENKILDMQQTYDMWLKKHNPGKPGEGTPISSREGEKQIQMPTDYADIMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PEERDMWTFMKENKILDMQQTYDMWLKKHNPGKPGEGTPISSREGEKQIQMPTDYADIMM
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 GYHCWLCGKNSNSKKQWQQHIQSEKHKEKVFTSDSDASGWAFRFPMGEFRLCDRLQKGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GYHCWLCGKNSNSKKQWQQHIQSEKHKEKVFTSDSDASGWAFRFPMGEFRLCDRLQKGKA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 CPDGDKCRCAHGQEELNEWLDRREVLKQKLAKARKDMLLCPRDDDFGKYNFLLQEDGDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CPDGDKCRCAHGQEELNEWLDRREVLKQKLAKARKDMLLCPRDDDFGKYNFLLQEDGDLA
910 920 930 940 950 960
970
pF1KA1 GATPEAPAAAATATTGE
:::::::::::::::::
CCDS14 GATPEAPAAAATATTGE
970
>>CCDS10550.1 ZC3H7A gene_id:29066|Hs108|chr16 (971 aa)
initn: 2491 init1: 968 opt: 2949 Z-score: 2233.6 bits: 424.7 E(32554): 4.3e-118
Smith-Waterman score: 3060; 46.5% identity (73.8% similar) in 989 aa overlap (2-955:7-969)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MERQKRKADIEKGLQFIQSTL--PLKQEEYEAFLLKLVQNLFAEGNDLFREKDYK
::.::. .:..::::::: : : ::.: ..: ::.::: ::::..::.:..
CCDS10 MSNVSEERRKRQQNIKEGLQFIQSPLSYPGTQEQYAVYLRALVRNLFNEGNDVYREHDWN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 QALVQYMEGLNVADYAASDQVALPRELLCKLHVNRAACYFTMGLYEKALEDSEKALGLDS
... :: :.::.:::: :... .:.:.. ::..:: ::: .::...:.::: . .:.:..
CCDS10 NSISQYTEALNIADYAKSEEILIPKEIIEKLYINRIACYSNMGFHDKVLEDCNIVLSLNA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 ESIRALFRKARALNELGRHKEAYECSSRCSLALPHDESVTQLGQELAQKLGLRVRKAYKR
. .::.::..::..:::.:.::. ..::::.:.:: : .: ::::::::...:::: :
CCDS10 SNCKALYRKSKALSDLGRYKKAYDAVAKCSLAVPQDEHVIKLTQELAQKLGFKIRKAYVR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KA1 PQELETFSLLSNGTAAGVADQGTSNGLG-SIDDIETDCYVDPRG---------SPAL---
. .:: : : .:....:. :..::: : . :: .:..
CCDS10 AE----LSLKS------VPGDGATKALNHSVEDIEPD-LLTPRQEAVPVVSLPAPSFSHE
190 200 210 220
230 240 250 260
pF1KA1 ----LPSTPTMPL---FP-HVLDLLAP---LDSSRTLPSTDSLDDFSDGD-VFGPELDTL
: :.:.::: .: .: . : : .. .: : ..::: :.: ::: :
CCDS10 VGSELASVPVMPLTSILPLQVEESALPSAVLANGGKMPFTMPEAFLDDGDMVLGDELDDL
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 LDSLSLVQGGLSGSGV---PSELPQLIPVFPGGTPLLPPVVGGSIPVSSPL-PPASFGLV
::: .. . :.. : . .. : .: .. :: :..:... :: ::.
CCDS10 LDSAPETNETVMPSALVRGPLQTASVSPSMPFSASLL-----GTLPIGARYAPPPSFSEF
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 MDPSKKLAASVLDALDPPGPTLDPLDLLPYSETRLDALDSFGSTRGSLDKPDSFMEETN-
. : . . ..:. . . . :: . . :.. .:. .. : :.. :
CCDS10 YPPLTSSLEDFCSSLNSFSMSESKRDLSTSTSREGTPLNNSNSSLLLMNGPGSLFASENF
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 ---SQDHRPPSGAQKPAPSPEPCMPNTALLIKNPLAATHEFKQACQLCYPKTGPRAGDYT
:.. : : . .: .... ..:: .:::..::::.:. :.::. :.:
CCDS10 LGISSQPRNDFGNFFGSAVTKP---SSSVTPRHPLEGTHELRQACQICFVKSGPKLMDFT
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 YREGLEHKCKRDILLGRLRSSEDQTWKRIRPRPTKTSFVGSYYLCKDMINKQDCKYGDNC
:. ...::::.:::.::... ::..::.::::::::.. : ::.:::. ...:.:. .:
CCDS10 YHANIDHKCKKDILIGRIKNVEDKSWKKIRPRPTKTNYEGPYYICKDVAAEEECRYSGHC
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 TFAYHQEEIDVWTEERKGTLNRDLLFDPLGGVKRGSLTIAKLLKEHQGIFTFLCEICFDS
:::: :::::::: ::::...:. .: :: . .::. :::.:: : : :::: :::
CCDS10 TFAYCQEEIDVWTLERKGAFSREAFF---GGNGKINLTVFKLLQEHLGEFIFLCEKCFDH
530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 KPRIISKGTKDSPSVCSNLAAKHSFYNNKCLVHIVRSTSLKYSKIRQFQEHFQFDVCRHE
:::.::: .::. ..::. ..:: : .:::::::.: :..::::::.:. . :.:.::::
CCDS10 KPRMISKRNKDNSTACSHPVTKHEFEDNKCLVHILRETTVKYSKIRSFHGQCQLDLCRHE
580 590 600 610 620 630
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 VRYGCLREDSCHFAHSFIELKVWLLQQYSGMTHEDIVQESKKYWQQMEAHAGKASSSMGA
::::::::: : .:::..:::::..:. .:..:. :.::::.:::..::.. :. .:
CCDS10 VRYGCLREDECFYAHSLVELKVWIMQNETGISHDAIAQESKRYWQNLEANVPGAQV-LGN
640 650 660 670 680 690
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 PRTHGPSTFDLQMKFVCGQCWRNGQVVEPDKDLKYCSAKARHCWTKERRVLLVMSKAKRK
:. .....::::.:: :::::.::::. ::::::::: :::.::.. ::: ..:
CCDS10 QIM--PGFLNMKIKFVCAQCLRNGQVIEPDKNRKYCSAKARHSWTKDRRAMRVMSIERKK
700 710 720 730 740 750
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 WVSVRPLPSIRNFPQQYDLCIHAQNGRKCQYVGNCSFAHSPEERDMWTFMKENKILDMQQ
:...::::. ...: :.::: : .:.:::::::::::::::::..::.:::: : ::.:
CCDS10 WMNIRPLPTKKQMPLQFDLCNHIASGKKCQYVGNCSFAHSPEEREVWTYMKENGIQDMEQ
760 770 780 790 800 810
810 820 830 840 850 860
pF1KA1 TYDMWLKKHNPGKPGEGTPISSREGEKQIQMPTDYADIMMGYHCWLCGKNSNSKKQWQQH
:..:::... : . . :..:. :::.::::::.. . .:::.:::: ::.:::: :
CCDS10 FYELWLKSQKNEKSEDIASQSNKENGKQIHMPTDYAEVTVDFHCWMCGKNCNSEKQWQGH
820 830 840 850 860 870
870 880 890 900 910 920
pF1KA1 IQSEKHKEKVFTSDSDASGWAFRFPMGEFRLCDRLQKGKACPDGDKCRCAHGQEELNEWL
:.::::::::: ...: : ::: : : .::: ..: .::.:..:. :::. ::.::
CCDS10 ISSEKHKEKVFHTEDDQYCWQHRFPTGYFSICDRYMNG-TCPEGNSCKFAHGNAELHEWE
880 890 900 910 920 930
930 940 950 960 970
pF1KA1 DRREVLKQKLAKARKDMLLCPRDDDFGKYNFLLQEDGDLAGATPEAPAAAATATTGE
.::..::.:: ::::: :. : :.:::::.::...
CCDS10 ERRDALKMKLNKARKDHLIGPNDNDFGKYSFLFKDLN
940 950 960 970
977 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 20:17:00 2016 done: Wed Nov 2 20:17:00 2016
Total Scan time: 4.350 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]