Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1032
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1032, 1703 aa
1>>>pF1KA1032 1703 - 1703 aa - 1703 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9479+/-0.00125; mu= -2.1597+/- 0.075
mean_var=302.7273+/-60.370, 0's: 0 Z-trim(109.0): 63 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.073714
statistics sampled from 10525 (10573) to 10525 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.325), width: 16
Scan time: 4.840
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46013.2 UNC13A gene_id:23025|Hs108|chr19 (1703) 11409 1228.8 0
CCDS6579.1 UNC13B gene_id:10497|Hs108|chr9 (1591) 5497 600.1 2e-170
CCDS83361.1 UNC13B gene_id:10497|Hs108|chr9 (1610) 5497 600.1 2.1e-170
CCDS45264.1 UNC13C gene_id:440279|Hs108|chr15 (2214) 4921 538.9 7.3e-152
>>CCDS46013.2 UNC13A gene_id:23025|Hs108|chr19 (1703 aa)
initn: 11409 init1: 11409 opt: 11409 Z-score: 6570.4 bits: 1228.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11409; 99.9% identity (99.9% similar) in 1703 aa overlap (1-1703:1-1703)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSLLCVGVKKAKFDGAQEKFNTYVTLKVQNVKSTTIAVRGSQPSWEQDFMFEINRLDLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MSLLCVGVKKAKFDGAQEKFNTYVTLKVQNVKSTTIAVRGSQPSWEQDFMFEINRLDLGL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TVEVWNKGLIWDTMVGTVWIPLRTIRQSNEEGPGEWLTLDSQVIMADSEICGTKDPTFHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TVEVWNKGLIWDTMVGTVWIPLRTIRQSNEEGPGEWLTLDSQVIMADSEICGTKDPTFHR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 ILLDTRFELPLDIPEEEARYWAKKLEQLNAMRDQDEYSFQDEQDKPLPVPSNQCCNWNYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ILLDTRFELPLDIPEEEARYWAKKLEQLNAMRDQDEYSFQDEQDKPLPVPSNQCCNWNYF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 GWGEQHNDDPDSAVDDRDSDYRSETSNSIPPPYYTTSQPNASVHQYSVRPPPLGSRESYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GWGEQHNDDPDSAVDDRDSDYRSETSNSIPPPYYTTSQPNASVHQYSVRPPPLGSRESYS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 DSMHSYEEFSEPQALSPTGSSRYASSGELSQGSSQLSEDFDPDEHSLQGSDMEDERDRDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DSMHSYEEFSEPQALSPTGSSRYASSGELSQGSSQLSEDFDPDEHSLQGSDMEDERDRDS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 YHSCHSSVSYHKDSPRWDQDEEELEEDLEDFLEEEELPEDEEELEEEEEEVPDDLGSYAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YHSCHSSVSYHKDSPRWDQDEEELEEDLEDFLEEEELPEDEEELEEEEEEVPDDLGSYAQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 REDVAVAEPKDFKRISLPPAAPGKEDKAPVAPTEAPDMAKVAPKPATPDKVPAAEQIPEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 REDVAVAEPKDFKRISLPPAAPGKEDKAPVAPTEAPDMAKVAPKPATPDKVPAAEQIPEA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 EPPKDEESFRPREDEEGQEGQDSMSRAKANWLRAFNKVRMQLQEARGEGEMSKSLWFKGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EPPKDEESFRPREDEEGQEGQDSMSRAKANWLRAFNKVRMQLQEARGEGEMSKSLWFKGG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 PGGGLIIIDSMPDIRKRKPIPLVSDLAMSLVQSRKAGITSALASSTLNNEELKNHVYKKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PGGGLIIIDSMPDIRKRKPIPLVSDLAMSLVQSRKAGITSALASSTLNNEELKNHVYKKT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LQALIYPISCTTPHNFEVWTATTPTYCYECEGLLWGIARQGMRCTECGVKCHEKCQDLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LQALIYPISCTTPHNFEVWTATTPTYCYECEGLLWGIARQGMRCTECGVKCHEKCQDLLN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 ADCLQRAAEKSSKHGAEDRTQNIIMVLKDRMKIRERNKPEIFELIQEIFAVTKTAHTQQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ADCLQRAAEKSSKHGAEDRTQNIIMVLKDRMKIRERNKPEIFELIQEIFAVTKTAHTQQM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 KAVKQSVLDGTSKWSAKISITVVCAQGLQAKDKTGSSDPYVTVQVGKTKKRTKTIYGNLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KAVKQSVLDGTSKWSAKISITVVCAQGLQAKDKTGSSDPYVTVQVGKTKKRTKTIYGNLN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 PVWEENFHFECHNSSDRIKVRVWDEDDDIKSRVKQRFKRESDDFLGQTIIEVRTLSGEMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PVWEENFHFECHNSSDRIKVRVWDEDDDIKSRVKQRFKRESDDFLGQTIIEVRTLSGEMD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 VWYNLDKRTDKSAVSGAIRLHISVEIKGEEKVAPYHVQYTCLHENLFHFVTDVQNNGVVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VWYNLDKRTDKSAVSGAIRLHISVEIKGEEKVAPYHVQYTCLHENLFHFVTDVQNNGVVK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 IPDAKGDDAWKVYYDETAQEIVDEFAMRYGVESIYQAMTHFACLSSKYMCPGVPAVMSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IPDAKGDDAWKVYYDETAQEIVDEFAMRYGVESIYQAMTHFACLSSKYMCPGVPAVMSTL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 LANINAYYAHTTASTNVSASDRFAASNFGKERFVKLLDQLHNSLRIDLSMYRNNFPASSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LANINAYYAHTTASTNVSASDRFAASNFGKERFVKLLDQLHNSLRIDLSMYRNNFPASSP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 ERLQDLKSTVDLLTSITFFRMKVQELQSPPRASQVVKDCVKACLNSTYEYIFNNCHELYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ERLQDLKSTVDLLTSITFFRMKVQELQSPPRASQVVKDCVKACLNSTYEYIFNNCHELYS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 REYQTDPAKKGEVPPEEQGPSIKNLDFWSKLITLIVSIIEEDKNSYTPCLNQFPQELNVG
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CCDS46 REYQTDPAKKGEVLPEEQGPSIKNLDFWSKLITLIVSIIEEDKNSYTPCLNQFPQELNVG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 KISAEVMWNLFAQDMKYAMEEHDKHRLCKSADYMNLHFKVKWLYNEYVTELPAFKDRVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KISAEVMWNLFAQDMKYAMEEHDKHRLCKSADYMNLHFKVKWLYNEYVTELPAFKDRVPE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 YPAWFEPFVIQWLDENEEVSRDFLHGALERDKKDGFQQTSEHALFSCSVVDVFSQLNQSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YPAWFEPFVIQWLDENEEVSRDFLHGALERDKKDGFQQTSEHALFSCSVVDVFSQLNQSF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 EIIKKLECPDPQIVGHYMRRFAKTISNVLLQYADIISKDFASYCSKEKEKVPCILMNNTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EIIKKLECPDPQIVGHYMRRFAKTISNVLLQYADIISKDFASYCSKEKEKVPCILMNNTQ
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 QLRVQLEKMFEAMGGKELDAEASDILKELQVKLNNVLDELSRVFATSFQPHIEECVKQMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QLRVQLEKMFEAMGGKELDAEASDILKELQVKLNNVLDELSRVFATSFQPHIEECVKQMG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 DILSQVKGTGNVPASACSSVAQDADNVLQPIMDLLDSNLTLFAKICEKTVLKRVLKELWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DILSQVKGTGNVPASACSSVAQDADNVLQPIMDLLDSNLTLFAKICEKTVLKRVLKELWK
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 LVMNTMEKTIVLPPLTDQTMIGNLLRKHGKGLEKGRVKLPSHSDGTQMIFNAAKELGQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LVMNTMEKTIVLPPLTDQTMIGNLLRKHGKGLEKGRVKLPSHSDGTQMIFNAAKELGQLS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 KLKDHMVREEAKSLTPKQCAVVELALDTIKQYFHAGGVGLKKTFLEKSPDLQSLRYALSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KLKDHMVREEAKSLTPKQCAVVELALDTIKQYFHAGGVGLKKTFLEKSPDLQSLRYALSL
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 YTQATDLLIKTFVQTQSAQGLGVEDPVGEVSVHVELFTHPGTGEHKVTVKVVAANDLKWQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YTQATDLLIKTFVQTQSAQGLGVEDPVGEVSVHVELFTHPGTGEHKVTVKVVAANDLKWQ
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 TSGIFRPFIEVNIIGPQLSDKKRKFATKSKNNSWAPKYNESFQFTLSADAGPECYELQVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TSGIFRPFIEVNIIGPQLSDKKRKFATKSKNNSWAPKYNESFQFTLSADAGPECYELQVC
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA1 VKDYCFAREDRTVGLAVLQLRELAQRGSAACWLPLGRRIHMDDTGLTVLRILSQRSNDEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VKDYCFAREDRTVGLAVLQLRELAQRGSAACWLPLGRRIHMDDTGLTVLRILSQRSNDEV
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700
pF1KA1 AKEFVKLKSDTRSAEEGGAAPAP
:::::::::::::::::::::::
CCDS46 AKEFVKLKSDTRSAEEGGAAPAP
1690 1700
>>CCDS6579.1 UNC13B gene_id:10497|Hs108|chr9 (1591 aa)
initn: 7506 init1: 3154 opt: 5497 Z-score: 3173.0 bits: 600.1 E(32554): 2e-170
Smith-Waterman score: 8168; 73.7% identity (86.9% similar) in 1707 aa overlap (1-1697:1-1590)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSLLCVGVKKAKFDGAQEKFNTYVTLKVQNVKSTTIAVRGSQPSWEQDFMFEINRLDLGL
:::::: ::.:::.:. .:::::::::::::::::.::::.::::::::::::.::::::
CCDS65 MSLLCVRVKRAKFQGSPDKFNTYVTLKVQNVKSTTVAVRGDQPSWEQDFMFEISRLDLGL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TVEVWNKGLIWDTMVGTVWIPLRTIRQSNEEGPGEWLTLDSQVIMADSEICGTKDPTFHR
.::::::::::::::::::: :.:::::.::::::: ::.....: :.:::::..:: :.
CCDS65 SVEVWNKGLIWDTMVGTVWIALKTIRQSDEEGPGEWSTLEAETLMKDDEICGTRNPTPHK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KA1 ILLDTRFELPLDIPEEEARYWAKKLEQLNAMRDQDEYSFQDE-QDKPLPVPSNQCCNWNY
::::::::::.::::::::::. : ::.::. ..::: :.: : ::::. . ::
CCDS65 ILLDTRFELPFDIPEEEARYWTYKWEQINALGADNEYSSQEESQRKPLPTAAAQCS----
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 FGWGEQHNDDPDSAVDDRDSDYRSETSNSIPPPYYTTSQPNASVHQYSV--RPPPL----
: .::::::::::::::::::::.::::.:.:::::::::. : : :
CCDS65 F-------EDPDSAVDDRDSDYRSETSNSFPPPYHTASQPNASVHQFPVPVRSPQQLLLQ
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 -GSRESYSDSMHSYE-EFSEPQALSPTGSSRYASSGELSQGSSQLSEDFDPDEHSLQGSD
.::.: .:::.::. .. : .:.:::.::::.:: ..::::::::: :.. :
CCDS65 GSSRDSCNDSMQSYDLDYPERRAISPTSSSRYGSSCNVSQGSSQLSEL---DQYHEQD--
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 MEDERDRDSYHSCHSSVSYHKDSPRWDQDEEELEEDLEDFLEEEELPEDEEELEEEEEEV
.:.:. :: :::::: : .:. : :.:.
CCDS65 -DDHRETDSIHSCHSSHSLSRDGQ-------------AGFGEQEK---------------
290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 PDDLGSYAQREDVAVAEPKDFKRISLPPAAPGKEDKAPVAPTEAPDMAKVAPKPATPDKV
: .. . :..: :. :::.. ::: : :. : :: :
CCDS65 PLEVTGQAEKE--AACEPKEM-----------KED----ATTHPP-----------PDLV
320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 PAAEQIPEAEPPKDEESFRPREDEEGQEGQDSMSRAKANWLRAFNKVRMQLQEARGEGEM
... :. ::: :.:. ... ...:.:.:.:: .:::.:::: .:.
CCDS65 LQKDHF---LGPQ--ESF-PEEN-----ASSPFTQARAHWIRAVTKVRLQLQEIPDDGDP
350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 SKSLWFKGGPGGGLIIIDSMPDIRKRKPIPLVSDLAMSLVQSRKAGITSALASST-LNNE
: :. ::.::: ::::::.:..::.:::::: :::::::::::::.:. : :..:
CCDS65 SLPQWLPEGPAGGLYGIDSMPDLRRKKPLPLVSDL--SLVQSRKAGITSAMATRTSLKDE
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 ELKNHVYKKTLQALIYPISCTTPHNFEVWTATTPTYCYECEGLLWGIARQGMRCTECGVK
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS65 ELKSHVYKKTLQALIYPISCTTPHNFEVWTATTPTYCYECEGLLWGIARQGMRCSECGVK
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 CHEKCQDLLNADCLQRAAEKSSKHGAEDRTQNIIMVLKDRMKIRERNKPEIFELIQEIFA
::::::::::::::::::::: :::::::::::::..::::::::::::::::.:...:.
CCDS65 CHEKCQDLLNADCLQRAAEKSCKHGAEDRTQNIIMAMKDRMKIRERNKPEIFEVIRDVFT
520 530 540 550 560 570
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 VTKTAHTQQMKAVKQSVLDGTSKWSAKISITVVCAQGLQAKDKTGSSDPYVTVQVGKTKK
:.:.::.::::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS65 VNKAAHVQQMKTVKQSVLDGTSKWSAKITITVVCAQGLQAKDKTGSSDPYVTVQVSKTKK
580 590 600 610 620 630
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 RTKTIYGNLNPVWEENFHFECHNSSDRIKVRVWDEDDDIKSRVKQRFKRESDDFLGQTII
:::::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS65 RTKTIFGNLNPVWEEKFHFECHNSSDRIKVRVWDEDDDIKSRVKQRLKRESDDFLGQTII
640 650 660 670 680 690
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 EVRTLSGEMDVWYNLDKRTDKSAVSGAIRLHISVEIKGEEKVAPYHVQYTCLHENLFHFV
:::::::::::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::..
CCDS65 EVRTLSGEMDVWYNLEKRTDKSAVSGAIRLQISVEIKGEEKVAPYHVQYTCLHENLFHYL
700 710 720 730 740 750
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 TDVQNNGVVKIPDAKGDDAWKVYYDETAQEIVDEFAMRYGVESIYQAMTHFACLSSKYMC
::.:..: :.::.:.::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS65 TDIQGSGGVRIPEARGDDAWKVYFDETAQEIVDEFAMRYGIESIYQAMTHFACLSSKYMC
760 770 780 790 800 810
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 PGVPAVMSTLLANINAYYAHTTASTNVSASDRFAASNFGKERFVKLLDQLHNSLRIDLSM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PGVPAVMSTLLANINAYYAHTTASTNVSASDRFAASNFGKERFVKLLDQLHNSLRIDLST
820 830 840 850 860 870
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 YRNNFPASSPERLQDLKSTVDLLTSITFFRMKVQELQSPPRASQVVKDCVKACLNSTYEY
:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 YRNNFPAGSPERLQDLKSTVDLLTSITFFRMKVQELQSPPRASQVVKDCVKACLNSTYEY
880 890 900 910 920 930
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 IFNNCHELYSREYQTDPAKKGEVPPEEQGPSIKNLDFWSKLITLIVSIIEEDKNSYTPCL
::::::.::::.:: : :.:::::::::.::::: ::::::::::::::::::: :
CCDS65 IFNNCHDLYSRQYQL----KQELPPEEQGPSIRNLDFWPKLITLIVSIIEEDKNSYTPVL
940 950 960 970 980 990
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA1 NQFPQELNVGKISAEVMWNLFAQDMKYAMEEHDKHRLCKSADYMNLHFKVKWLYNEYVTE
:::::::::::.::::::.:::::::::.:::.: .:::::::::::::::::.:::: .
CCDS65 NQFPQELNVGKVSAEVMWHLFAQDMKYALEEHEKDHLCKSADYMNLHFKVKWLHNEYVRD
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA1 LPAFKDRVPEYPAWFEPFVIQWLDENEEVSRDFLHGALERDKKDGFQQTSEHALFSCSVV
::... .::::::::: ::.:::::::.:: .::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LPVLQGQVPEYPAWFEQFVLQWLDENEDVSLEFLRGALERDKKDGFQQTSEHALFSCSVV
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA1 DVFSQLNQSFEIIKKLECPDPQIVGHYMRRFAKTISNVLLQYADIISKDFASYCSKEKEK
:::.:::::::::.:::::::.:..::::::::::..::.:::::.:::: .::.:::
CCDS65 DVFTQLNQSFEIIRKLECPDPSILAHYMRRFAKTIGKVLMQYADILSKDFPAYCTKEK--
1120 1130 1140 1150 1160
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA1 VPCILMNNTQQLRVQLEKMFEAMGGKELDAEASDILKELQVKLNNVLDELSRVFATSFQP
.:::::::.:::::::::::::::::::: ::.: :::::::::.:::::: ::..:::
CCDS65 LPCILMNNVQQLRVQLEKMFEAMGGKELDLEAADSLKELQVKLNTVLDELSMVFGNSFQV
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA1 HIEECVKQMGDILSQVKGTGNVPASACSSVAQDADNVLQPIMDLLDSNLTLFAKICEKTV
.:.:::.::.:::.::.::::. .: .:.:::::.::.:.::.::.:::::: .:::::
CCDS65 RIDECVRQMADILGQVRGTGNASPDARASAAQDADSVLRPLMDFLDGNLTLFATVCEKTV
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA1 LKRVLKELWKLVMNTMEKTIVLPPLTDQTMIGNLLRKHGKGLEKGRVKLPSHSDGTQMIF
:::::::::..::::::. :::::::::: :::.::
CCDS65 LKRVLKELWRVVMNTMERMIVLPPLTDQT-------------------------GTQLIF
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1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA1 NAAKELGQLSKLKDHMVREEAKSLTPKQCAVVELALDTIKQYFHAGGVGLKKTFLEKSPD
.:::::..::::::::::::...::::::::..:::::::::::::: ::::::::::::
CCDS65 TAAKELSHLSKLKDHMVREETRNLTPKQCAVLDLALDTIKQYFHAGGNGLKKTFLEKSPD
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KA1 LQSLRYALSLYTQATDLLIKTFVQTQSAQGLGVEDPVGEVSVHVELFTHPGTGEHKVTVK
:::::::::::::.:: ::::::..:..:: ::.:::::::..:.:::::::::::::::
CCDS65 LQSLRYALSLYTQTTDTLIKTFVRSQTTQGSGVDDPVGEVSIQVDLFTHPGTGEHKVTVK
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KA1 VVAANDLKWQTSGIFRPFIEVNIIGPQLSDKKRKFATKSKNNSWAPKYNESFQFTLSADA
:::::::::::.:.::::.::...::. :::::::.::::.:.:::::::.:.: :. .
CCDS65 VVAANDLKWQTAGMFRPFVEVTMVGPHQSDKKRKFTTKSKSNNWAPKYNETFHFLLGNEE
1450 1460 1470 1480 1490 1500
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pF1KA1 GPECYELQVCVKDYCFAREDRTVGLAVLQLRELAQRGSAACWLPLGRRIHMDDTGLTVLR
::: ::::.::::::::::::..::::. ::... .:: ::: ::::.::::.::::.::
CCDS65 GPESYELQICVKDYCFAREDRVLGLAVMPLRDVTAKGSCACWCPLGRKIHMDETGLTILR
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pF1KA1 ILSQRSNDEVAKEFVKLKSDTRSAEEGGAAPAP
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CCDS65 ILSQRSNDEVAREFVKLKSESRSTEEGS
1570 1580 1590
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:::::: ::.:::.:. .:::::::::::::::::.::::.::::::::::::.::::::
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pF1KA1 TVEVWNKGLIWDTMVGTVWIPLRTIRQSNEEGPGEWLTLDSQVIMADSEICGTKDPTFHR
.::::::::::::::::::: :.:::::.::::::: ::.....: :.:::::..:: :.
CCDS83 SVEVWNKGLIWDTMVGTVWIALKTIRQSDEEGPGEWSTLEAETLMKDDEICGTRNPTPHK
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pF1KA1 ILLDTRFELPLDIPEEEARYWAKKLEQLNAMRDQDEYSFQDE-QDKPLPVPSNQCCNWNY
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CCDS83 ILLDTRFELPFDIPEEEARYWTYKWEQINALGADNEYSSQEESQRKPLPTAAAQCS----
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pF1KA1 FGWGEQHNDDPDSAVDDRDSDYRSETSNSIPPPYYTTSQPNASVHQYSV--RPPPL----
: .::::::::::::::::::::.::::.:.:::::::::. : : :
CCDS83 F-------EDPDSAVDDRDSDYRSETSNSFPPPYHTASQPNASVHQFPVPVRSPQQLLLQ
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pF1KA1 -GSRESYSDSMHSYE-EFSEPQALSPTGSSRYASSGELSQGSSQLSEDFDPDEHSLQGSD
.::.: .:::.::. .. : .:.:::.::::.:: ..::::::::: :.. :
CCDS83 GSSRDSCNDSMQSYDLDYPERRAISPTSSSRYGSSCNVSQGSSQLSEL---DQYHEQD--
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pF1KA1 MEDERDRDSYHSCHSSVSYHKDSPRWDQDEEELEEDLEDFLEEEELPEDEEELEEEEEEV
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CCDS83 -DDHRETDSIHSCHSSHSLSRDGQ-------------AGFGEQEK---------------
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pF1KA1 PDDLGSYAQREDVAVAEPKDFKRISLPPAAPGKEDKAPVAPTEAPDMAKVAPKPATPDKV
: .. . :..: :. :::.. ::: : :. : :: :
CCDS83 PLEVTGQAEKE--AACEPKEM-----------KED----ATTHPP-----------PDLV
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pF1KA1 PAAEQIPEAEPPKDEESFRPREDEEGQEGQDSMSRAKANWLRAFNKVRMQLQEARGEGEM
... :. ::: :.:. ... ...:.:.:.:: .:::.:::: .:.
CCDS83 LQKDHF---LGPQ--ESF-PEEN-----ASSPFTQARAHWIRAVTKVRLQLQEIPDDGDP
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pF1KA1 SKSLWFKGGPGGGLIIIDSMPDIRKRKPIPLVSDLAMSLVQSRKAGITSALASST-LNNE
: :. ::.::: ::::::.:..::.:::::: :::::::::::::.:. : :..:
CCDS83 SLPQWLPEGPAGGLYGIDSMPDLRRKKPLPLVSDL--SLVQSRKAGITSAMATRTSLKDE
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pF1KA1 ELKNHVYKKTLQALIYPISCTTPHNFEVWTATTPTYCYECEGLLWGIARQGMRCTECGVK
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CCDS83 ELKSHVYKKTLQALIYPISCTTPHNFEVWTATTPTYCYECEGLLWGIARQGMRCSECGVK
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pF1KA1 CHEKCQDLLNADCLQRAAEKSSKHGAEDRTQNIIMVLKDRMKIRERNKPEIFELIQEIFA
::::::::::::::::::::: :::::::::::::..::::::::::::::::.:...:.
CCDS83 CHEKCQDLLNADCLQRAAEKSCKHGAEDRTQNIIMAMKDRMKIRERNKPEIFEVIRDVFT
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pF1KA1 VTKTAHTQQMKAVKQSVLDGTSKWSAKISITVVCAQGLQAKDKTGSSDPYVTVQVGKTKK
:.:.::.::::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS83 VNKAAHVQQMKTVKQSVLDGTSKWSAKITITVVCAQGLQAKDKTGSSDPYVTVQVSKTKK
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pF1KA1 RTKTIYGNLNPVWEENFHFECHNSSDRIKVRVWDEDDDIKSRVKQRFKRESDDFLGQTII
:::::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS83 RTKTIFGNLNPVWEEKFHFECHNSSDRIKVRVWDEDDDIKSRVKQRLKRESDDFLGQTII
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pF1KA1 EVRTLSGEMDVWYNLDKRTDKSAVSGAIRLHISVEIKGEEKVAPYHVQYTCLHENLFHFV
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CCDS83 EVRTLSGEMDVWYNLEKRTDKSAVSGAIRLQISVEIKGEEKVAPYHVQYTCLHENLFHYL
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CCDS83 TDIQGSGGVRIPEARGDDAWKVYFDETAQEIVDEFAMRYGIESIYQAMTHFACLSSKYMC
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CCDS83 PGVPAVMSTLLANINAYYAHTTASTNVSASDRFAASNFGKERFVKLLDQLHNSLRIDLST
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CCDS83 YRNNFPAGSPERLQDLKSTVDLLTSITFFRMKVQELQSPPRASQVVKDCVKACLNSTYEY
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pF1KA1 IFNNCHELYSREYQTDPAKKGEVPPEEQGPSIKNLDFWSKLITLIVSIIEEDKNSYTPCL
::::::.::::.:: : :.:::::::::.::::: ::::::::::::::::::: :
CCDS83 IFNNCHDLYSRQYQL----KQELPPEEQGPSIRNLDFWPKLITLIVSIIEEDKNSYTPVL
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:::::::::::.::::::.:::::::::.:::.: .:::::::::::::::::.:::: .
CCDS83 NQFPQELNVGKVSAEVMWHLFAQDMKYALEEHEKDHLCKSADYMNLHFKVKWLHNEYVRD
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pF1KA1 LPAFKDRVPEYPAWFEPFVIQWLDENEEVSRDFLHGALERDKKDGFQQTSEHALFSCSVV
::... .::::::::: ::.:::::::.:: .::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LPVLQGQVPEYPAWFEQFVLQWLDENEDVSLEFLRGALERDKKDGFQQTSEHALFSCSVV
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pF1KA1 DVFSQLNQSFEIIKKLECPDPQIVGHYMRRFAKTISNVLLQYADIISKDFASYCSKEKEK
:::.:::::::::.:::::::.:..::::::::::..::.:::::.:::: .::.:::
CCDS83 DVFTQLNQSFEIIRKLECPDPSILAHYMRRFAKTIGKVLMQYADILSKDFPAYCTKEK--
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.:::::::.:::::::::::::::::::: ::.: :::::::::.:::::: ::..:::
CCDS83 LPCILMNNVQQLRVQLEKMFEAMGGKELDLEAADSLKELQVKLNTVLDELSMVFGNSFQV
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CCDS83 RIDECVRQMADILGQVRGTGNASPDARASAAQDADSVLRPLMDFLDGNLTLFATVCEKTV
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CCDS83 LKRVLKELWRVVMNTMERMIVLPPLTDQT-------------------------GTQLIF
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pF1KA1 NAAKELGQLSKLKDHMVREEAKSLTPKQCAVVELALDTIKQYFHAGGVGLKKTFLEKSPD
.:::::..::::::::::::...::::::::..:::::::::::::: ::::::::::::
CCDS83 TAAKELSHLSKLKDHMVREETRNLTPKQCAVLDLALDTIKQYFHAGGNGLKKTFLEKSPD
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pF1KA1 LQSLRYALSLYTQATDLLIKTFVQTQSAQ-------------------GLGVEDPVGEVS
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CCDS83 LQSLRYALSLYTQTTDTLIKTFVRSQTTQVHDGKGIRFTANEDIRPEKGSGVDDPVGEVS
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pF1KA1 VHVELFTHPGTGEHKVTVKVVAANDLKWQTSGIFRPFIEVNIIGPQLSDKKRKFATKSKN
..:.::::::::::::::::::::::::::.:.::::.::...::. :::::::.::::.
CCDS83 IQVDLFTHPGTGEHKVTVKVVAANDLKWQTAGMFRPFVEVTMVGPHQSDKKRKFTTKSKS
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pF1KA1 NSWAPKYNESFQFTLSADAGPECYELQVCVKDYCFAREDRTVGLAVLQLRELAQRGSAAC
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CCDS83 NNWAPKYNETFHFLLGNEEGPESYELQICVKDYCFAREDRVLGLAVMPLRDVTAKGSCAC
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pF1KA1 WLPLGRRIHMDDTGLTVLRILSQRSNDEVAKEFVKLKSDTRSAEEGGAAPAP
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CCDS83 WCPLGRKIHMDETGLTILRILSQRSNDEVAREFVKLKSESRSTEEGS
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CCDS45 HEDLSPWKEWNQGADLGLDSSTQEGFDYETNSLFDQQLDVYNKDLEYLGKCHSDLQD--D
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pF1KA1 QDEYSF-QDEQDKPLPVPSNQCCNWNYFGWGEQHNDDPDSAVDDRDSDYRSETSNSIPPP
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CCDS45 SESYDLTQDDNSSPCPGLDNEPQGQ----WVGQY-DSYQGA----NSNELYQNQNQLSMM
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pF1KA1 YYTTSQPNASVHQYSVRPPPLGSRESYSDSMHSYEEFSEPQALSPTGSSRYASSGELSQG
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CCDS45 YRSQSELQS---DDSEDAPPKSWHSRLSIDL-SDKTFSFPKFGSTLQRAKSALEVVWNKS
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pF1KA1 SSQLSEDFDPDEHSLQGSDMEDERDRDSYHSCHSSVSYHKDSPRWDQDEEELEEDLEDFL
...:: .. . ::.: : : .: . : :: . . :: ::.
CCDS45 TQSLS-GYEDSGSSLMG------RFRTLSQSTANESSTTLDSDVYTEPYYYKAEDEEDYT
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pF1KA1 EEEELPEDEEELEEEEEEVPDDLGSYAQREDVAVAEPK--DFKRISLPPAAPGKEDKAPV
: . ..: . : :.: :.. .: ... .. . . ..: .:..
CCDS45 EP--VADNETDYVEVMEQV---LAKLENRTSITETDEQMQAYDHLSYETPYETPQDEGYD
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pF1KA1 APTEAPDMAKVAPKPATPDKVPAAEQIPEAEPPKDEESFRPREDEEGQEGQDSMSRAKAN
.: : ::. . : : : : .::.. :.. : . . :
CCDS45 GP--ADDMV------SEEGLEPLNETSAEMEIREDENQNIPEQPVEITKPKRIRPSFKEA
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pF1KA1 WLRAFNKVRMQLQEARGEGEMSK-------------------SLWFKGGPGGGLIIIDSM
:::..: .:.: :. :. .: :: :::: ::::
CCDS45 ALRAYKKQMAELEEKILAGDSSSVDEKARIVSGNDLDASKFSALQVCGGAGGGLYGIDSM
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::.:..: .:.: :.::.:. .::.:.. :.. ..::::::: ::.::::::::::.:
CCDS45 PDLRRKKTLPIVRDVAMTLA-ARKSGLSLAMVIRTSLNNEELKMHVFKKTLQALIYPMSS
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: ::::::::::::::::::::::::::::::.: :::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TIPHNFEVWTATTPTYCYECEGLLWGIARQGMKCLECGVKCHEKCQDLLNADCLQRAAEK
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pF1KA1 SSKHGAEDRTQNIIMVLKDRMKIRERNKPEIFELIQEIFAVTKTAHTQQMKAVKQSVLDG
::::::::.::.:: ..:.::::::.:.::.::.:::.: ..: .: ::.:::::::
CCDS45 SSKHGAEDKTQTIITAMKERMKIREKNRPEVFEVIQEMFQISKEDFVQFTKAAKQSVLDG
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pF1KA1 TSKWSAKISITVVCAQGLQAKDKTGSSDPYVTVQVGKTKKRTKTIYGNLNPVWEENFHFE
::::::::.:::: :::::::::::::::::::::::.:.:::::.:::::::.:.:.::
CCDS45 TSKWSAKITITVVSAQGLQAKDKTGSSDPYVTVQVGKNKRRTKTIFGNLNPVWDEKFYFE
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pF1KA1 CHNSSDRIKVRVWDEDDDIKSRVKQRFKRESDDFLGQTIIEVRTLSGEMDVWYNLDKRTD
::::.::::::::::::::::::::.::.::::::::::.:::::::::::::::.::::
CCDS45 CHNSTDRIKVRVWDEDDDIKSRVKQHFKKESDDFLGQTIVEVRTLSGEMDVWYNLEKRTD
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pF1KA1 KSAVSGAIRLHISVEIKGEEKVAPYHVQYTCLHENLFHFVTDVQNNGVVKIPDAKGDDAW
::::::::::.:.:::::::::::::.:::::::::::..:.:..:: ::::..:::.::
CCDS45 KSAVSGAIRLKINVEIKGEEKVAPYHIQYTCLHENLFHYLTEVKSNGGVKIPEVKGDEAW
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pF1KA1 KVYYDETAQEIVDEFAMRYGVESIYQAMTHFACLSSKYMCPGVPAVMSTLLANINAYYAH
::..:...::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS45 KVFFDDASQEIVDEFAMRYGIESIYQAMTHFSCLSSKYMCPGVPAVMSTLLANINAFYAH
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::.::: :::::::::.:::.:.:.::::::::::::::: ::.:::::. ::::::::
CCDS45 TTVSTNIQVSASDRFAATNFGREKFIKLLDQLHNSLRIDLSKYRENFPASNTERLQDLKS
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pF1KA1 TVDLLTSITFFRMKVQELQSPPRASQVVKDCVKACLNSTYEYIFNNCHELYSREYQTDPA
::::::::::::::: ::::::.::.::::::.:::.:::.:::.:::::::. :::.
CCDS45 TVDLLTSITFFRMKVLELQSPPKASMVVKDCVRACLDSTYKYIFDNCHELYSQ--LTDPS
1520 1530 1540 1550 1560 1570
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pF1KA1 KKGEVPPEEQGPSIKNLDFWSKLITLIVSIIEEDKNSYTPCLNQFPQELNVGKISAEVMW
:: ..: :.:::. :::::: .::::.:.::.:::..::: :::::::::.::::::.::
CCDS45 KKQDIPREDQGPTTKNLDFWPQLITLMVTIIDEDKTAYTPVLNQFPQELNMGKISAEIMW
1580 1590 1600 1610 1620 1630
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pF1KA1 NLFAQDMKYAMEEHDKHRLCKSADYMNLHFKVKWLYNEYVTELPAFKDRVPEYPAWFEPF
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CCDS45 TLFALDMKYALEEHENQRLCKSTDYMNLHFKVKWFYNEYVRELPAFKDAVPEYSLWFEPF
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CCDS45 VMQWLDENEDVSMEFLHGALGRDKKDGFQQTSEHALFSCSVVDVFAQLNQSFEIIKKLEC
1700 1710 1720 1730 1740 1750
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 PDPQIVGHYMRRFAKTISNVLLQYADIISKDFASYCSKEKEKVPCILMNNTQQLRVQLEK
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CCDS45 PNPEALSHLMRRFAKTINKVLLQYAAIVSSDFSSHC--DKENVPCILMNNIQQLRVQLEK
1760 1770 1780 1790 1800 1810
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pF1KA1 MFEAMGGKELDAEASDILKELQVKLNNVLDELSRVFATSFQPHIEECVKQMGDILSQVKG
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CCDS45 MFESMGGKELDSEASTILKELQVKLSGVLDELSVTYGESFQVIIEECIKQMSFELNQMRA
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CCDS45 NGNT-TSNKNSAAMDAEIVLRSLMDFLDKTLSLSAKICEKTVLKRVLKELWKLVLNKIEK
1880 1890 1900 1910 1920
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pF1KA1 TIVLPPLTDQTMIGNLLRKHGKGLEKGRVKLPSHSDGTQMIFNAAKELGQLSKLKDHMVR
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CCDS45 QIVLPPLTDQT-------------------------GPQMIFIAAKDLGQLSKLKEHMIR
1930 1940 1950 1960
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CCDS45 EDARGLTPRQCAIMEVVLATIKQYFHAGGNGLKKNFLEKSPDLQSLRYALSLYTQTTDAL
1970 1980 1990 2000 2010 2020
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pF1KA1 IKTFVQTQSAQGLGVEDPVGEVSVHVELFTHPGTGEHKVTVKVVAANDLKWQTSGIFRPF
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CCDS45 IKKFIDTQTSQSRSSKDAVGQISVHVDITATPGTGDHKVTVKVIAINDLNWQTTAMFRPF
2030 2040 2050 2060 2070 2080
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pF1KA1 IEVNIIGPQLSDKKRKFATKSKNNSWAPKYNESFQFTLSADAGPECYELQVCVKDYCFAR
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CCDS45 VEVCILGPNLGDKKRKQGTKTKSNTWSPKYNETFQFILGKENRPGAYELHLSVKDYCFAR
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CCDS45 EDRIIGMTVIQLQNIAEKGSYGAWYPLLKNISMDETGLTILRILSQRTSDDVAKEFVRLK
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pF1KA1 SDTRSAEEGGAAPAP
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CCDS45 SETRSTEESA
2210
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]