Result of FASTA (omim) for
pF1KA1062
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1062, 2435 aa
1>>>pF1KA1062 2435 - 2435 aa - 2435 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6212+/-0.000427; mu= 16.8315+/- 0.027
mean_var=169.8659+/-35.021, 0's: 0 Z-trim(116.9): 182 B-trim: 589 in 1/53
Lambda= 0.098406
statistics sampled from 28159 (28354) to 28159 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.332), width: 16
Scan time: 21.130
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_006717059 (OMIM: 600047) PREDICTED: ATP-binding (2435) 16202 2314.3 0
NP_001597 (OMIM: 600047) ATP-binding cassette sub- (2436) 16186 2312.0 0
NP_997698 (OMIM: 600047) ATP-binding cassette sub- (2466) 16036 2290.7 0
XP_011516644 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2142) 2484 366.7 1.8e-99
XP_005251833 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2203) 2484 366.7 1.9e-99
XP_016869871 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2242) 2484 366.7 1.9e-99
NP_005493 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) ATP- (2261) 2484 366.7 1.9e-99
XP_005251830 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2263) 2484 366.7 1.9e-99
XP_011516643 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2286) 2484 366.7 1.9e-99
XP_016869867 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2288) 2484 366.7 1.9e-99
XP_016869868 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2288) 2484 366.7 1.9e-99
XP_011516642 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2288) 2484 366.7 1.9e-99
XP_016869870 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2288) 2484 366.7 1.9e-99
XP_011516641 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2288) 2484 366.7 1.9e-99
XP_016869869 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2288) 2484 366.7 1.9e-99
NP_000341 (OMIM: 153800,248200,601691,601718,60411 (2273) 2288 338.9 4.5e-91
XP_006722681 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1365) 2207 327.2 8.9e-88
XP_011525938 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1365) 2207 327.2 8.9e-88
XP_011525934 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1994) 2207 327.3 1.2e-87
XP_016881631 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (2061) 2207 327.4 1.2e-87
XP_011525931 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (2137) 2207 327.4 1.3e-87
XP_011525930 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (2146) 2207 327.4 1.3e-87
NP_061985 (OMIM: 605414,608907) ATP-binding casset (2146) 2207 327.4 1.3e-87
XP_011525932 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (2103) 1691 254.1 1.4e-65
XP_011513438 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4861) 1627 245.3 1.4e-62
XP_011513435 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (5013) 1627 245.3 1.5e-62
XP_011513434 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (5028) 1627 245.3 1.5e-62
NP_689914 (OMIM: 607807) ATP-binding cassette sub- (5058) 1627 245.3 1.5e-62
XP_011513432 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (5059) 1627 245.3 1.5e-62
XP_006722679 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (2128) 1593 240.2 2.2e-61
XP_011513436 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4950) 1447 219.8 7.1e-55
NP_056472 (OMIM: 242500,601277,607800) ATP-binding (2277) 1396 212.3 6e-53
NP_775099 (OMIM: 242500,601277,607800) ATP-binding (2595) 1396 212.3 6.6e-53
XP_011509253 (OMIM: 242500,601277,607800) PREDICTE (2598) 1396 212.3 6.6e-53
XP_011525933 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1997) 1363 207.5 1.4e-51
XP_011513433 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (5028) 1297 198.5 1.8e-48
XP_016881632 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1487) 1159 178.5 5.9e-43
XP_011525937 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1487) 1159 178.5 5.9e-43
XP_011525936 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1487) 1159 178.5 5.9e-43
XP_011525935 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1631) 1159 178.5 6.3e-43
XP_006722680 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1636) 1159 178.5 6.3e-43
XP_011516646 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (1565) 1157 178.2 7.4e-43
NP_001080 (OMIM: 601615,610921) ATP-binding casset (1704) 1139 175.7 4.6e-42
XP_011513444 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4298) 1072 166.5 6.8e-39
XP_011513443 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4329) 1072 166.5 6.8e-39
XP_016867257 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4396) 1072 166.5 6.9e-39
XP_016867256 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4433) 1072 166.5 6.9e-39
XP_011513441 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4456) 1072 166.5 7e-39
XP_011513440 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4468) 1072 166.5 7e-39
XP_011513439 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4602) 1072 166.5 7.1e-39
>>XP_006717059 (OMIM: 600047) PREDICTED: ATP-binding cas (2435 aa)
initn: 16202 init1: 16202 opt: 16202 Z-score: 12431.3 bits: 2314.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 16202; 99.9% identity (100.0% similar) in 2435 aa overlap (1-2435:1-2435)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MGFLHQLQLLLWKNVTLKRRSPWVLAFEIFIPLVLFFILLGLRQKKPTISVKEAFYTAAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MGFLHQLQLLLWKNVTLKRRSPWVLAFEIFIPLVLFFILLGLRQKKPTISVKEAFYTAAP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 LTSAGILPVMQSLCPDGQRDEFGFLQYANSTVTQLLERLDRVVEEGNLFDPARPSLGSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LTSAGILPVMQSLCPDGQRDEFGFLQYANSTVTQLLERLDRVVEEGNLFDPARPSLGSEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 EALRQHLEALSAGPGTSGSHLDRSTVSSFSLDSVARNPQELWRFLTQNLSLPNSTAQALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EALRQHLEALSAGPGTSGSHLDRSTVSSFSLDSVARNPQELWRFLTQNLSLPNSTAQALL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 AARVDPPEVYHLLFGPSSALDSQSGLHKGQEPWSRLGGNPLFRMEELLLAPALLEQLTCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AARVDPPEVYHLLFGPSSALDSQSGLHKGQEPWSRLGGNPLFRMEELLLAPALLEQLTCT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PGSGELGRILTVPESQKGALQGYRDAVCSGQAAARARRFSGLSAELRNQLDVAKVSQQLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PGSGELGRILTVPESQKGALQGYRDAVCSGQAAARARRFSGLSAELRNQLDVAKVSQQLG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LDAPNGSDSSPQAPPPRRLQALLGDLLDAQKVLQDVDVLSALALLLPQGACTGRTPGPPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LDAPNGSDSSPQAPPPRRLQALLGDLLDAQKVLQDVDVLSALALLLPQGACTGRTPGPPA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 SGAGGAANGTGAGAVMGPNATAEEGAPSAAALATPDTLQGQCSAFVQLWAGLQPILCGNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SGAGGAANGTGAGAVMGPNATAEEGAPSAAALATPDTLQGQCSAFVQLWAGLQPILCGNN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 RTIEPEALRRGNMSSLGFTSKEQRNLGLLVHLMTSNPKILYAPAGSEVDRVILKANETFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RTIEPEALRRGNMSSLGFTSKEQRNLGLLVHLMTSNPKILYAPAGSEVDRVILKANETFA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 FVGNVTHYAQVWLNISAKIRSFLEQGRLQQHLRWLQQYVAELRLHPEALNLSLDELPPAL
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FVGNVTHYAQVWLNISAEIRSFLEQGRLQQHLRWLQQYVAELRLHPEALNLSLDELPPAL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 RQDNFSLPSGMALLQQLDTIDNAACGWIQFMSKVSVDIFKGFPDEESIVNYTLNQAYQDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RQDNFSLPSGMALLQQLDTIDNAACGWIQFMSKVSVDIFKGFPDEESIVNYTLNQAYQDN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 VTVFASVIFQTRKDGSLPPHVHYKIRQNSSFTEKTNEIRRAYWRPGPNTGGRFYFLYGFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VTVFASVIFQTRKDGSLPPHVHYKIRQNSSFTEKTNEIRRAYWRPGPNTGGRFYFLYGFV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 WIQDMMERAIIDTFVGHDVVEPGSYVQMFPYPCYTRDDFLFVIEHMMPLCMVISWVYSVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 WIQDMMERAIIDTFVGHDVVEPGSYVQMFPYPCYTRDDFLFVIEHMMPLCMVISWVYSVA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 MTIQHIVAEKEHRLKEVMKTMGLNNAVHWVAWFITGFVQLSISVTALTAILKYGQVLMHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MTIQHIVAEKEHRLKEVMKTMGLNNAVHWVAWFITGFVQLSISVTALTAILKYGQVLMHS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 HVVIIWLFLAVYAVATIMFCFLVSVLYSKAKLASACGGIIYFLSYVPYMYVAIREEVAHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 HVVIIWLFLAVYAVATIMFCFLVSVLYSKAKLASACGGIIYFLSYVPYMYVAIREEVAHD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 KITAFEKCIASLMSTTAFGLGSKYFALYEVAGVGIQWHTFSQSPVEGDDFNLLLAVTMLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KITAFEKCIASLMSTTAFGLGSKYFALYEVAGVGIQWHTFSQSPVEGDDFNLLLAVTMLM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 VDAVVYGILTWYIEAVHPGMYGLPRPWYFPLQKSYWLGSGRTEAWEWSWPWARTPRLSVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VDAVVYGILTWYIEAVHPGMYGLPRPWYFPLQKSYWLGSGRTEAWEWSWPWARTPRLSVM
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 EEDQACAMESRRFEETRGMEEEPTHLPLVVCVDKLTKVYKDDKKLALNKLSLNLYENQVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EEDQACAMESRRFEETRGMEEEPTHLPLVVCVDKLTKVYKDDKKLALNKLSLNLYENQVV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 SFLGHNGAGKTTTMSILTGLFPPTSGSATIYGHDIRTEMDEIRKNLGMCPQHNVLFDRLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SFLGHNGAGKTTTMSILTGLFPPTSGSATIYGHDIRTEMDEIRKNLGMCPQHNVLFDRLT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 VEEHLWFYSRLKSMAQEEIRREMDKMIEDLELSNKRHSLVQTLSGGMKRKLSVAIAFVGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VEEHLWFYSRLKSMAQEEIRREMDKMIEDLELSNKRHSLVQTLSGGMKRKLSVAIAFVGG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 SRAIILDEPTAGVDPYARRAIWDLILKYKPGRTILLSTHHMDEADLLGDRIAIISHGKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SRAIILDEPTAGVDPYARRAIWDLILKYKPGRTILLSTHHMDEADLLGDRIAIISHGKLK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 CCGSPLFLKGTYGDGYRLTLVKRPAEPGGPQEPGLASSPPGRAPLSSCSELQVSQFIRKH
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 VASCLLVSDTSTELSYILPSEAAKKGAFERLFRHLERSLDALHLSSFGLMDTTLEEVFLK
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VASCLLVSDTSTELSYILPSEAAKKGAFERLFQHLERSLDALHLSSFGLMDTTLEEVFLK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 VSEEDQSLENSEADVKESRKDVLPGAEGPASGEGHAGNLARCSELTQSQASLQSASSVGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VSEEDQSLENSEADVKESRKDVLPGAEGPASGEGHAGNLARCSELTQSQASLQSASSVGS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 ARGDEGAGYTDVYGDYRPLFDNPQDPDNVSLQEVEAEALSRVGQGSRKLDGGWLKVRQFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ARGDEGAGYTDVYGDYRPLFDNPQDPDNVSLQEVEAEALSRVGQGSRKLDGGWLKVRQFH
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 GLLVKRFHCARRNSKALFSQILLPAFFVCVAMTVALSVPEIGDLPPLVLSPSQYHNYTQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GLLVKRFHCARRNSKALFSQILLPAFFVCVAMTVALSVPEIGDLPPLVLSPSQYHNYTQP
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 RGNFIPYANEERREYRLRLSPDASPQQLVSTFRLPSGVGATCVLKSPANGSLGPTLNLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RGNFIPYANEERREYRLRLSPDASPQQLVSTFRLPSGVGATCVLKSPANGSLGPTLNLSS
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 GESRLLAARFFDSMCLESFTQGLPLSNFVPPPPSPAPSDSPASPDEDLQAWNVSLPPTAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GESRLLAARFFDSMCLESFTQGLPLSNFVPPPPSPAPSDSPASPDEDLQAWNVSLPPTAG
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA1 PEMWTSAPSLPRLVREPVRCTCSAQGTGFSCPSSVGGHPPQMRVVTGDILTDITGHNVSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PEMWTSAPSLPRLVREPVRCTCSAQGTGFSCPSSVGGHPPQMRVVTGDILTDITGHNVSE
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA1 YLLFTSDRFRLHRYGAITFGNVLKSIPASFGTRAPPMVRKIAVRRAAQVFYNNKGYHSMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YLLFTSDRFRLHRYGAITFGNVLKSIPASFGTRAPPMVRKIAVRRAAQVFYNNKGYHSMP
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA1 TYLNSLNNAILRANLPKSKGNPAAYGITVTNHPMNKTSASLSLDYLLQGTDVVIAIFIIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TYLNSLNNAILRANLPKSKGNPAAYGITVTNHPMNKTSASLSLDYLLQGTDVVIAIFIIV
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA1 AMSFVPASFVVFLVAEKSTKAKHLQFVSGCNPIIYWLANYVWDMLNYLVPATCCVIILFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AMSFVPASFVVFLVAEKSTKAKHLQFVSGCNPIIYWLANYVWDMLNYLVPATCCVIILFV
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA1 FDLPAYTSPTNFPAVLSLFLLYGWSITPIMYPASFWFEVPSSAYVFLIVINLFIGITATV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FDLPAYTSPTNFPAVLSLFLLYGWSITPIMYPASFWFEVPSSAYVFLIVINLFIGITATV
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1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA1 ATFLLQLFEHDKDLKVVNSYLKSCFLIFPNYNLGHGLMEMAYNEYINEYYAKIGQFDKMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ATFLLQLFEHDKDLKVVNSYLKSCFLIFPNYNLGHGLMEMAYNEYINEYYAKIGQFDKMK
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA1 SPFEWDIVTRGLVAMAVEGVVGFLLTIMCQYNFLRRPQRMPVSTKPVEDDVDVASERQRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SPFEWDIVTRGLVAMAVEGVVGFLLTIMCQYNFLRRPQRMPVSTKPVEDDVDVASERQRV
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KA1 LRGDADNDMVKIENLTKVYKSRKIGRILAVDRLCLGVRPGECFGLLGVNGAGKTSTFKML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LRGDADNDMVKIENLTKVYKSRKIGRILAVDRLCLGVRPGECFGLLGVNGAGKTSTFKML
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pF1KA1 TGDESTTGGEAFVNGHSVLKELLQVQQSLGYCPQCDALFDELTAREHLQLYTRLRGISWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TGDESTTGGEAFVNGHSVLKELLQVQQSLGYCPQCDALFDELTAREHLQLYTRLRGISWK
2110 2120 2130 2140 2150 2160
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DEARVVKWALEKLELTKYADKPAGTYSGGNKRKLSTAIALIGYPAFIFLDEPTTGMDPKA
2170 2180 2190 2200 2210 2220
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pF1KA1 RRFLWNLILDLIKTGRSVVLTSHSMEECEALCTRLAIMVNGRLRCLGSIQHLKNRFGDGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RRFLWNLILDLIKTGRSVVLTSHSMEECEALCTRLAIMVNGRLRCLGSIQHLKNRFGDGY
2230 2240 2250 2260 2270 2280
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pF1KA1 MITVRTKSSQSVKDVVRFFNRNFPEAMLKERHHTKVQYQLKSEHISLAQVFSKMEQVSGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MITVRTKSSQSVKDVVRFFNRNFPEAMLKERHHTKVQYQLKSEHISLAQVFSKMEQVSGV
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pF1KA1 LGIEDYSVSQTTLDNVFVNFAKKQSDNLEQQETEPPSALQSPLGCLLSLLRPRSAPTELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LGIEDYSVSQTTLDNVFVNFAKKQSDNLEQQETEPPSALQSPLGCLLSLLRPRSAPTELR
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ALVADEPEDLDTEDEGLISFEEERAQLSFNTDTLC
2410 2420 2430
>>NP_001597 (OMIM: 600047) ATP-binding cassette sub-fami (2436 aa)
initn: 15849 init1: 15849 opt: 16186 Z-score: 12419.1 bits: 2312.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 16186; 99.8% identity (100.0% similar) in 2436 aa overlap (1-2435:1-2436)
10 20 30 40 50
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::
NP_001 MGFLHQLQLLLWKNVTLKRRSPWVLAFEIFIPLVLFFILLGLRQKKPTISVKEVSFYTAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLTSAGILPVMQSLCPDGQRDEFGFLQYANSTVTQLLERLDRVVEEGNLFDPARPSLGSE
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEALRQHLEALSAGPGTSGSHLDRSTVSSFSLDSVARNPQELWRFLTQNLSLPNSTAQAL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAARVDPPEVYHLLFGPSSALDSQSGLHKGQEPWSRLGGNPLFRMEELLLAPALLEQLTC
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240 250 260 270 280 290
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TPGSGELGRILTVPESQKGALQGYRDAVCSGQAAARARRFSGLSAELRNQLDVAKVSQQL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLDAPNGSDSSPQAPPPRRLQALLGDLLDAQKVLQDVDVLSALALLLPQGACTGRTPGPP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASGAGGAANGTGAGAVMGPNATAEEGAPSAAALATPDTLQGQCSAFVQLWAGLQPILCGN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NRTIEPEALRRGNMSSLGFTSKEQRNLGLLVHLMTSNPKILYAPAGSEVDRVILKANETF
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::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRQDNFSLPSGMALLQQLDTIDNAACGWIQFMSKVSVDIFKGFPDEESIVNYTLNQAYQD
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pF1KA1 NVTVFASVIFQTRKDGSLPPHVHYKIRQNSSFTEKTNEIRRAYWRPGPNTGGRFYFLYGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NVTVFASVIFQTRKDGSLPPHVHYKIRQNSSFTEKTNEIRRAYWRPGPNTGGRFYFLYGF
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pF1KA1 VWIQDMMERAIIDTFVGHDVVEPGSYVQMFPYPCYTRDDFLFVIEHMMPLCMVISWVYSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VWIQDMMERAIIDTFVGHDVVEPGSYVQMFPYPCYTRDDFLFVIEHMMPLCMVISWVYSV
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pF1KA1 AMTIQHIVAEKEHRLKEVMKTMGLNNAVHWVAWFITGFVQLSISVTALTAILKYGQVLMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AMTIQHIVAEKEHRLKEVMKTMGLNNAVHWVAWFITGFVQLSISVTALTAILKYGQVLMH
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pF1KA1 SHVVIIWLFLAVYAVATIMFCFLVSVLYSKAKLASACGGIIYFLSYVPYMYVAIREEVAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SHVVIIWLFLAVYAVATIMFCFLVSVLYSKAKLASACGGIIYFLSYVPYMYVAIREEVAH
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pF1KA1 DKITAFEKCIASLMSTTAFGLGSKYFALYEVAGVGIQWHTFSQSPVEGDDFNLLLAVTML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DKITAFEKCIASLMSTTAFGLGSKYFALYEVAGVGIQWHTFSQSPVEGDDFNLLLAVTML
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pF1KA1 MVDAVVYGILTWYIEAVHPGMYGLPRPWYFPLQKSYWLGSGRTEAWEWSWPWARTPRLSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVDAVVYGILTWYIEAVHPGMYGLPRPWYFPLQKSYWLGSGRTEAWEWSWPWARTPRLSV
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pF1KA1 MEEDQACAMESRRFEETRGMEEEPTHLPLVVCVDKLTKVYKDDKKLALNKLSLNLYENQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEEDQACAMESRRFEETRGMEEEPTHLPLVVCVDKLTKVYKDDKKLALNKLSLNLYENQV
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pF1KA1 VSFLGHNGAGKTTTMSILTGLFPPTSGSATIYGHDIRTEMDEIRKNLGMCPQHNVLFDRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSFLGHNGAGKTTTMSILTGLFPPTSGSATIYGHDIRTEMDEIRKNLGMCPQHNVLFDRL
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pF1KA1 TVEEHLWFYSRLKSMAQEEIRREMDKMIEDLELSNKRHSLVQTLSGGMKRKLSVAIAFVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVEEHLWFYSRLKSMAQEEIRREMDKMIEDLELSNKRHSLVQTLSGGMKRKLSVAIAFVG
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pF1KA1 GSRAIILDEPTAGVDPYARRAIWDLILKYKPGRTILLSTHHMDEADLLGDRIAIISHGKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSRAIILDEPTAGVDPYARRAIWDLILKYKPGRTILLSTHHMDEADLLGDRIAIISHGKL
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pF1KA1 KCCGSPLFLKGTYGDGYRLTLVKRPAEPGGPQEPGLASSPPGRAPLSSCSELQVSQFIRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KCCGSPLFLKGTYGDGYRLTLVKRPAEPGGPQEPGLASSPPGRAPLSSCSELQVSQFIRK
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1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA1 HVASCLLVSDTSTELSYILPSEAAKKGAFERLFRHLERSLDALHLSSFGLMDTTLEEVFL
:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HVASCLLVSDTSTELSYILPSEAAKKGAFERLFQHLERSLDALHLSSFGLMDTTLEEVFL
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1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA1 KVSEEDQSLENSEADVKESRKDVLPGAEGPASGEGHAGNLARCSELTQSQASLQSASSVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KVSEEDQSLENSEADVKESRKDVLPGAEGPASGEGHAGNLARCSELTQSQASLQSASSVG
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pF1KA1 SARGDEGAGYTDVYGDYRPLFDNPQDPDNVSLQEVEAEALSRVGQGSRKLDGGWLKVRQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SARGDEGAGYTDVYGDYRPLFDNPQDPDNVSLQEVEAEALSRVGQGSRKLDGGWLKVRQF
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1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA1 HGLLVKRFHCARRNSKALFSQILLPAFFVCVAMTVALSVPEIGDLPPLVLSPSQYHNYTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HGLLVKRFHCARRNSKALFSQILLPAFFVCVAMTVALSVPEIGDLPPLVLSPSQYHNYTQ
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pF1KA1 PRGNFIPYANEERREYRLRLSPDASPQQLVSTFRLPSGVGATCVLKSPANGSLGPTLNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRGNFIPYANEERREYRLRLSPDASPQQLVSTFRLPSGVGATCVLKSPANGSLGPTLNLS
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pF1KA1 SGESRLLAARFFDSMCLESFTQGLPLSNFVPPPPSPAPSDSPASPDEDLQAWNVSLPPTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGESRLLAARFFDSMCLESFTQGLPLSNFVPPPPSPAPSDSPASPDEDLQAWNVSLPPTA
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pF1KA1 GPEMWTSAPSLPRLVREPVRCTCSAQGTGFSCPSSVGGHPPQMRVVTGDILTDITGHNVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPEMWTSAPSLPRLVREPVRCTCSAQGTGFSCPSSVGGHPPQMRVVTGDILTDITGHNVS
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pF1KA1 EYLLFTSDRFRLHRYGAITFGNVLKSIPASFGTRAPPMVRKIAVRRAAQVFYNNKGYHSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EYLLFTSDRFRLHRYGAITFGNVLKSIPASFGTRAPPMVRKIAVRRAAQVFYNNKGYHSM
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pF1KA1 PTYLNSLNNAILRANLPKSKGNPAAYGITVTNHPMNKTSASLSLDYLLQGTDVVIAIFII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTYLNSLNNAILRANLPKSKGNPAAYGITVTNHPMNKTSASLSLDYLLQGTDVVIAIFII
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pF1KA1 VAMSFVPASFVVFLVAEKSTKAKHLQFVSGCNPIIYWLANYVWDMLNYLVPATCCVIILF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VAMSFVPASFVVFLVAEKSTKAKHLQFVSGCNPIIYWLANYVWDMLNYLVPATCCVIILF
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pF1KA1 VFDLPAYTSPTNFPAVLSLFLLYGWSITPIMYPASFWFEVPSSAYVFLIVINLFIGITAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VFDLPAYTSPTNFPAVLSLFLLYGWSITPIMYPASFWFEVPSSAYVFLIVINLFIGITAT
1870 1880 1890 1900 1910 1920
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pF1KA1 VATFLLQLFEHDKDLKVVNSYLKSCFLIFPNYNLGHGLMEMAYNEYINEYYAKIGQFDKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VATFLLQLFEHDKDLKVVNSYLKSCFLIFPNYNLGHGLMEMAYNEYINEYYAKIGQFDKM
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pF1KA1 KSPFEWDIVTRGLVAMAVEGVVGFLLTIMCQYNFLRRPQRMPVSTKPVEDDVDVASERQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSPFEWDIVTRGLVAMAVEGVVGFLLTIMCQYNFLRRPQRMPVSTKPVEDDVDVASERQR
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pF1KA1 VLRGDADNDMVKIENLTKVYKSRKIGRILAVDRLCLGVRPGECFGLLGVNGAGKTSTFKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLRGDADNDMVKIENLTKVYKSRKIGRILAVDRLCLGVRPGECFGLLGVNGAGKTSTFKM
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2100 2110 2120 2130 2140 2150
pF1KA1 LTGDESTTGGEAFVNGHSVLKELLQVQQSLGYCPQCDALFDELTAREHLQLYTRLRGISW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTGDESTTGGEAFVNGHSVLKELLQVQQSLGYCPQCDALFDELTAREHLQLYTRLRGISW
2110 2120 2130 2140 2150 2160
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pF1KA1 KDEARVVKWALEKLELTKYADKPAGTYSGGNKRKLSTAIALIGYPAFIFLDEPTTGMDPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDEARVVKWALEKLELTKYADKPAGTYSGGNKRKLSTAIALIGYPAFIFLDEPTTGMDPK
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pF1KA1 ARRFLWNLILDLIKTGRSVVLTSHSMEECEALCTRLAIMVNGRLRCLGSIQHLKNRFGDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ARRFLWNLILDLIKTGRSVVLTSHSMEECEALCTRLAIMVNGRLRCLGSIQHLKNRFGDG
2230 2240 2250 2260 2270 2280
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pF1KA1 YMITVRTKSSQSVKDVVRFFNRNFPEAMLKERHHTKVQYQLKSEHISLAQVFSKMEQVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YMITVRTKSSQSVKDVVRFFNRNFPEAMLKERHHTKVQYQLKSEHISLAQVFSKMEQVSG
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2340 2350 2360 2370 2380 2390
pF1KA1 VLGIEDYSVSQTTLDNVFVNFAKKQSDNLEQQETEPPSALQSPLGCLLSLLRPRSAPTEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLGIEDYSVSQTTLDNVFVNFAKKQSDNLEQQETEPPSALQSPLGCLLSLLRPRSAPTEL
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2400 2410 2420 2430
pF1KA1 RALVADEPEDLDTEDEGLISFEEERAQLSFNTDTLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RALVADEPEDLDTEDEGLISFEEERAQLSFNTDTLC
2410 2420 2430
>>NP_997698 (OMIM: 600047) ATP-binding cassette sub-fami (2466 aa)
initn: 15849 init1: 15849 opt: 16036 Z-score: 12303.9 bits: 2290.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 16036; 99.8% identity (100.0% similar) in 2414 aa overlap (23-2435:53-2466)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MGFLHQLQLLLWKNVTLKRRSPWVLAFEIFIPLVLFFILLGLRQKKPTISVK
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 ERSWGLEFPPFRWLLGIAGRTHLAALPPFQWVLAFEIFIPLVLFFILLGLRQKKPTISVK
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60 70 80 90 100 110
pF1KA1 E-AFYTAAPLTSAGILPVMQSLCPDGQRDEFGFLQYANSTVTQLLERLDRVVEEGNLFDP
: .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 EVSFYTAAPLTSAGILPVMQSLCPDGQRDEFGFLQYANSTVTQLLERLDRVVEEGNLFDP
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 ARPSLGSELEALRQHLEALSAGPGTSGSHLDRSTVSSFSLDSVARNPQELWRFLTQNLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 ARPSLGSELEALRQHLEALSAGPGTSGSHLDRSTVSSFSLDSVARNPQELWRFLTQNLSL
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 PNSTAQALLAARVDPPEVYHLLFGPSSALDSQSGLHKGQEPWSRLGGNPLFRMEELLLAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 PNSTAQALLAARVDPPEVYHLLFGPSSALDSQSGLHKGQEPWSRLGGNPLFRMEELLLAP
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 ALLEQLTCTPGSGELGRILTVPESQKGALQGYRDAVCSGQAAARARRFSGLSAELRNQLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 ALLEQLTCTPGSGELGRILTVPESQKGALQGYRDAVCSGQAAARARRFSGLSAELRNQLD
270 280 290 300 310 320
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 VAKVSQQLGLDAPNGSDSSPQAPPPRRLQALLGDLLDAQKVLQDVDVLSALALLLPQGAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 VAKVSQQLGLDAPNGSDSSPQAPPPRRLQALLGDLLDAQKVLQDVDVLSALALLLPQGAC
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