FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1070, 823 aa 1>>>pF1KA1070 823 - 823 aa - 823 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2500+/-0.000853; mu= 16.9469+/- 0.052 mean_var=91.3620+/-18.610, 0's: 0 Z-trim(108.4): 32 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.134181 statistics sampled from 10156 (10187) to 10156 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.663), E-opt: 0.2 (0.313), width: 16 Scan time: 3.840 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3222.1 NLGN1 gene_id:22871|Hs108|chr3 ( 823) 5668 1107.7 0 CCDS11103.1 NLGN2 gene_id:57555|Hs108|chr17 ( 835) 2724 537.8 2.9e-152 CCDS56619.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY ( 648) 2133 423.3 6.4e-118 CCDS14126.1 NLGN4X gene_id:57502|Hs108|chrX ( 816) 2134 423.6 6.8e-118 CCDS14788.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY ( 816) 2133 423.4 7.7e-118 CCDS55442.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX ( 808) 2081 413.3 8.2e-115 CCDS14407.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX ( 828) 2081 413.3 8.4e-115 CCDS55441.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX ( 848) 2081 413.3 8.6e-115 CCDS3198.1 BCHE gene_id:590|Hs108|chr3 ( 602) 854 175.7 2e-43 CCDS43896.1 CEL gene_id:1056|Hs108|chr9 ( 756) 748 155.3 3.7e-37 CCDS45489.1 CES1 gene_id:1066|Hs108|chr16 ( 566) 728 151.3 4.3e-36 CCDS45488.1 CES1 gene_id:1066|Hs108|chr16 ( 567) 723 150.3 8.4e-36 CCDS32450.1 CES1 gene_id:1066|Hs108|chr16 ( 568) 723 150.3 8.4e-36 CCDS54024.1 CES4A gene_id:283848|Hs108|chr16 ( 463) 683 142.6 1.5e-33 CCDS55553.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY ( 256) 546 115.9 8.8e-26 CCDS42174.3 CES4A gene_id:283848|Hs108|chr16 ( 468) 522 111.4 3.7e-24 CCDS45507.1 CES2 gene_id:8824|Hs108|chr16 ( 607) 509 108.9 2.6e-23 CCDS10825.1 CES2 gene_id:8824|Hs108|chr16 ( 623) 509 108.9 2.7e-23 CCDS54025.1 CES4A gene_id:283848|Hs108|chr16 ( 374) 498 106.7 7.6e-23 CCDS34944.1 TG gene_id:7038|Hs108|chr8 (2768) 502 107.9 2.4e-22 CCDS54022.1 CES3 gene_id:23491|Hs108|chr16 ( 568) 483 103.9 8.1e-22 CCDS10826.1 CES3 gene_id:23491|Hs108|chr16 ( 571) 483 103.9 8.1e-22 CCDS54012.1 CES5A gene_id:221223|Hs108|chr16 ( 604) 480 103.3 1.3e-21 CCDS10755.1 CES5A gene_id:221223|Hs108|chr16 ( 525) 476 102.5 1.9e-21 CCDS45490.1 CES5A gene_id:221223|Hs108|chr16 ( 575) 476 102.5 2.1e-21 >>CCDS3222.1 NLGN1 gene_id:22871|Hs108|chr3 (823 aa) initn: 5668 init1: 5668 opt: 5668 Z-score: 5927.3 bits: 1107.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5668; 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CCDS11 SRELVDQDVQPARYHIAFGPVVDGDVVPDDPEILMQQGEFLNYDMLIGVNQGEGLKFVED 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KA1 IVDSDDGISASDFDFAVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRHNPETRRKTLLA ..:.::.::: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::: : : ::::::: CCDS11 SAESEDGVSASAFDFTVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRDNGEMRRKTLLA 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KA1 LFTDHQWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAHGDEVPYVLGIPMI ::::::::::::::: ::... ::.:::.::::::.. : :::::::::.:::.:.::. CCDS11 LFTDHQWVAPAVATAKLHADYQSPVYFYTFYHHCQAEGRPEWADAAHGDELPYVFGVPMV 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KA1 GPTELFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWTRY : :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:... CCDS11 GATDLFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVVWSKF 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KA1 SQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQYTSTTTKVPSTDITFRP ..:.. ::::::::::...:::::: .:::::::::::. .. .:::..: . : CCDS11 NSKEKQYLHIGLKPRVRDNYRANKVAFWLELVPHLHNLH--TELFTTTTRLPPYATRWPP 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 pF1KA1 TRKNSVPVTSAFPTAKQDDPKQQPSP-------FSVDQRDYSTELSVTIAVGASLLFLNI ..: : : :. .: : : :.::::::::::.::::::::::: CCDS11 RPPAGAPGTRRPPPPATLPPEPEPEPGPRAYDRFPGDSRDYSTELSVTVAVGASLLFLNI 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 pF1KA1 LAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTTTNDLTHA------------QEEEIMSLQMKHTD :::::::::.:.:.. :: :: . . . . :::..:::.:. CCDS11 LAFAALYYKRDRRQELRCRRLSPPGGSGSGVPGGGPLLPAAGRELPPEEELVSLQLKRGG 700 710 720 730 740 750 740 750 760 770 780 790 pF1KA1 LDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNTITMIPNTI-PGIQP----L . : :. :: :::::::::.::.::::::..:...:..:. . : : : CCDS11 ----GVGADPAEA-LRPACPPDYTLALRRAPDDVPLLAPGALTLLPSGLGPPPPPPPPSL 760 770 780 790 800 800 810 820 pF1KA1 HTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV : :. : .. : . :: :::::: CCDS11 HPFGPFPPPPPTATSHNNTLPHPHSTTRV 810 820 830 >>CCDS56619.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY (648 aa) initn: 2817 init1: 2089 opt: 2133 Z-score: 2230.6 bits: 423.3 E(32554): 6.4e-118 Smith-Waterman score: 3416; 75.6% identity (89.1% similar) in 663 aa overlap (176-823:1-648) 150 160 170 180 190 200 pF1KA1 VQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGNLYDGSVLASYGNVIV :::::::::::::::. :::.::::::::: CCDS56 MVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGNVIV 10 20 30 210 220 230 240 250 260 pF1KA1 ITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGAGGS ::.:::::.::::::::::::::::::: :::::: ::.: ::::: :.:.::::::.: CCDS56 ITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGAFGGDPKRVTIFGSGAGAS 40 50 60 70 80 90 270 280 290 300 310 320 pF1KA1 CVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYARMLATKVGCNVS ::.::::::::: ::::.:: :::::::::::..:::::.:.:: :::::. CCDS56 CVSLLTLSHYSE---------GLFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRILADKVGCNML 100 110 120 130 140 330 340 350 360 370 380 pF1KA1 DTVELVECLQKKPYKELVDQDIQPARYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIML ::...::::..: ::::..: : :: :::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 DTTDMVECLKNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIML 150 160 170 180 190 200 390 400 410 420 430 440 pF1KA1 GVNQGEGLKFVENIVDSDDGISASDFDFAVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTDWAD :::::::::::..:::..::.. .::::.::::::::::::::::.:::::::::::::: CCDS56 GVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTDWAD 210 220 230 240 250 260 450 460 470 480 490 500 pF1KA1 RHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAH ..:::::::::.:::::::::::::::::::...::::::::::::::... :.:::.:: CCDS56 KENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEMKPSWADSAH 270 280 290 300 310 320 510 520 530 540 550 560 pF1KA1 GDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHT :::::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 GDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHT 330 340 350 360 370 380 570 580 590 600 610 620 pF1KA1 KPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQYTST ::::::::::..:. ::::::::::::::..::::.:: .::::::::::::.: ::.:: CCDS56 KPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNLNEIFQYVST 390 400 410 420 430 440 630 640 650 660 670 pF1KA1 TTKVPSTDITFRP--TRKNSV---PVTSAFPTAKQDDPKQQPSPFSVD----------QR ::::: :.: : ::.. . :.:. . ..::.. .: .. .: CCDS56 TTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPEDTTVLIETKR 450 460 470 480 490 500 680 690 700 710 720 730 pF1KA1 DYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTTTNDLTHAQEEEI ::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::. ::::.::::.:: :.::: CCDS56 DYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRHPSPQRNTTNDITHIQNEEI 510 520 530 540 550 560 740 750 760 770 780 790 pF1KA1 MSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNTITMIPNTIPG ::::::. . ::::::.. :.. :: .:::::::..::::::.:.::::::::::::. : CCDS56 MSLQMKQLEHDHECESLQAHDT-LRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPFMTPNTITMIPNTLMG 570 580 590 600 610 620 800 810 820 pF1KA1 IQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV .::::::.::.::::.: ::.:::::: CCDS56 MQPLHTFKTFSGGQNST-----NLPHGHSTTRV 630 640 >>CCDS14126.1 NLGN4X gene_id:57502|Hs108|chrX (816 aa) initn: 2831 init1: 2088 opt: 2134 Z-score: 2230.1 bits: 423.6 E(32554): 6.8e-118 Smith-Waterman score: 4052; 74.9% identity (88.8% similar) in 786 aa overlap (53-823:46-816) 30 40 50 60 70 80 pF1KA1 RGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQFLG :.: ::.:::::.. : ::::::: :.:: CCDS14 PVCVMLNSNVLLWLTALAIKFTLIDSQAQYPVVNTNYGKIRGLRTPLPNEILGPVEQYLG 20 30 40 50 60 70 90 100 110 120 130 140 pF1KA1 VPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVV ::::.::::::::::::::: :. :::.:::: ::::.. . : . :::.::: :::.. CCDS14 VPYASPPTGERRFQPPEPPSSWTGIRNTTQFAAVCPQHLDERSLLHDMLPIWFTANLDTL 80 90 100 110 120 130 150 160 170 180 190 200 pF1KA1 SSYVQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGNLYDGSVLASYGN .:::::.::::::::::::::::.:... ::::::::::::::::::. :::.:::::: CCDS14 MTYVQDQNEDCLYLNIYVPTEDDIHDQNSKKPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGN 140 150 160 170 180 190 210 220 230 240 250 260 pF1KA1 VIVITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGA :::::.:::::.::::::::::::::::::: :::::: ::.: ::::: :.:.::::: CCDS14 VIVITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGAFGGDPKRVTIFGSGA 200 210 220 230 240 250 270 280 290 300 310 320 pF1KA1 GGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYARMLATKVGC :.:::.:::::::::: :::.:: :::::::::::..:::::.:.:: :::: CCDS14 GASCVSLLTLSHYSEG---------LFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRILADKVGC 260 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 pF1KA1 NVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDIQPARYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYD :. ::...::::..: ::::..: : :: ::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 NMLDTTDMVECLRNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYD 310 320 330 340 350 360 390 400 410 420 430 440 pF1KA1 IMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDGISASDFDFAVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTD ::::::::::::::..:::..::.. .::::.::::::::::::::::.::::::::::: CCDS14 IMLGVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTD 370 380 390 400 410 420 450 460 470 480 490 500 pF1KA1 WADRHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWAD :::..:::::::::.:::::::::::::::::::...::::::::::::::... :.::: CCDS14 WADKENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEMKPSWAD 430 440 450 460 470 480 510 520 530 540 550 560 pF1KA1 AAHGDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKF .:::::::::.::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 SAHGDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKF 490 500 510 520 530 540 570 580 590 600 610 620 pF1KA1 IHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQY :::::::::::::..:. ::::::::::::::..::::.:: .::::::::::::.: :: CCDS14 IHTKPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNLNEIFQY 550 560 570 580 590 600 630 640 650 660 pF1KA1 TSTTTKVPSTDITFRP--TRKNSV---PVTSAFPTAKQDDPKQQPSPFSVD--------- .::::::: :.: : ::.. . :.:. . ..::.. .: .. CCDS14 VSTTTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPEDTTVLIE 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KA1 -QRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTTTNDLTHAQE .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::: ::::.::::..: :. CCDS14 TKRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRRPSPQRNTTNDIAHIQN 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KA1 EEIMSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNTITMIPNT :::::::::. . ::::::.. :.. :: .:::::::..::::::.:::::::::::::: CCDS14 EEIMSLQMKQLEHDHECESLQAHDT-LRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNT 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 pF1KA1 IPGIQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV . :.:::::::::.::::.: ::.:::::: CCDS14 LTGMQPLHTFNTFSGGQNST-----NLPHGHSTTRV 790 800 810 >>CCDS14788.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY (816 aa) initn: 2817 init1: 2089 opt: 2133 Z-score: 2229.0 bits: 423.4 E(32554): 7.7e-118 Smith-Waterman score: 3997; 73.9% identity (88.7% similar) in 786 aa overlap (53-823:46-816) 30 40 50 60 70 80 pF1KA1 RGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQFLG :.: ::.:::.:.. : .:::::: :.:: CCDS14 SVCVMLNSNVLLWITALAIKFTLIDSQAQYPVVNTNYGKIQGLRTPLPSEILGPVEQYLG 20 30 40 50 60 70 90 100 110 120 130 140 pF1KA1 VPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVV ::::.:::::::::::: :: :. :::::::. ::::.. . : . :::.:::..::.. CCDS14 VPYASPPTGERRFQPPESPSSWTGIRNATQFSAVCPQHLDERFLLHDMLPIWFTTSLDTL 80 90 100 110 120 130 150 160 170 180 190 200 pF1KA1 SSYVQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGNLYDGSVLASYGN .:::::.::::::::::: ::::..... ::::::::::::::::::. :::.:::::: CCDS14 MTYVQDQNEDCLYLNIYVPMEDDIHEQNSKKPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGN 140 150 160 170 180 190 210 220 230 240 250 260 pF1KA1 VIVITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGA :::::.:::::.::::::::::::::::::: :::::: ::.: ::::: :.:.::::: CCDS14 VIVITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGAFGGDPKRVTIFGSGA 200 210 220 230 240 250 270 280 290 300 310 320 pF1KA1 GGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYARMLATKVGC :.:::.:::::::::: :::.:: :::::::::::..:::::.:.:: :::: CCDS14 GASCVSLLTLSHYSEG---------LFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRILADKVGC 260 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 pF1KA1 NVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDIQPARYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYD :. ::...::::..: ::::..: : :: ::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 NMLDTTDMVECLKNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYD 310 320 330 340 350 360 390 400 410 420 430 440 pF1KA1 IMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDGISASDFDFAVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTD ::::::::::::::..:::..::.. .::::.::::::::::::::::.::::::::::: CCDS14 IMLGVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTD 370 380 390 400 410 420 450 460 470 480 490 500 pF1KA1 WADRHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWAD :::..:::::::::.:::::::::::::::::::...::::::::::::::... :.::: CCDS14 WADKENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEMKPSWAD 430 440 450 460 470 480 510 520 530 540 550 560 pF1KA1 AAHGDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKF .:::::::::.::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 SAHGDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKF 490 500 510 520 530 540 570 580 590 600 610 620 pF1KA1 IHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQY :::::::::::::..:. ::::::::::::::..::::.:: .::::::::::::.: :: CCDS14 IHTKPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNLNEIFQY 550 560 570 580 590 600 630 640 650 660 pF1KA1 TSTTTKVPSTDITFRP--TRKNSV---PVTSAFPTAKQDDPKQQPSPFSVD--------- .::::::: :.: : ::.. . :.:. . ..::.. .: .. CCDS14 VSTTTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPEDTTVLIE 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KA1 -QRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTTTNDLTHAQE .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::. ::::.::::.:: :. CCDS14 TKRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRHPSPQRNTTNDITHIQN 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KA1 EEIMSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNTITMIPNT :::::::::. . ::::::.. :.. :: .:::::::..::::::.:.:::::::::::: CCDS14 EEIMSLQMKQLEHDHECESLQAHDT-LRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPFMTPNTITMIPNT 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 pF1KA1 IPGIQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV . :.::::::.::.::::.: ::.:::::: CCDS14 LMGMQPLHTFKTFSGGQNST-----NLPHGHSTTRV 790 800 810 >>CCDS55442.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX (808 aa) initn: 3565 init1: 2030 opt: 2081 Z-score: 2174.7 bits: 413.3 E(32554): 8.2e-115 Smith-Waterman score: 3789; 71.6% identity (86.3% similar) in 786 aa overlap (53-823:42-808) 30 40 50 60 70 80 pF1KA1 RGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQFLG : : :.:::.:: . : .:::::: :.:: CCDS55 LSPKPTVGRSLCLTLWFLSLALRASTQAPAPTVNTHFGKLRGARVPLPSEILGPVDQYLG 20 30 40 50 60 70 90 100 110 120 130 140 pF1KA1 VPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVV ::::::: ::.:: ::::: :: :::::.: ::::::: . .:::::::::: :::.: CCDS55 VPYAAPPIGEKRFLPPEPPPSWSGIRNATHFPPVCPQNIHTA-VPEVMLPVWFTANLDIV 80 90 100 110 120 130 150 160 170 180 190 200 pF1KA1 SSYVQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGNLYDGSVLASYGN ..:.:. .:::::::.::::::::::::. ::::::::::::::::::. :::.:::::: CCDS55 ATYIQEPNEDCLYLNVYVPTEDDIRDSGA-KPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGN 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 pF1KA1 VIVITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGA :::::.:::.::::::::::::::::::::: ::::::.::::.:::::: :::::::: CCDS55 VIVITLNYRVGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWVSENIAFFGGDPRRITVFGSGI 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 pF1KA1 GGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYARMLATKVGC :.:::.::::::.::: :::::: :::.:::::::..::.::. .:: :::: CCDS55 GASCVSLLTLSHHSEG---------LFQRAIIQSGSALSSWAVNYQPVKYTSLLADKVGC 250 260 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 pF1KA1 NVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDIQPARYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYD :: :::..:.::..: ::::.:::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::: CCDS55 NVLDTVDMVDCLRQKSAKELVEQDIQPARYHVAFGPVIDGDVIPDDPEILMEQGEFLNYD 310 320 330 340 350 360 390 400 410 420 430 440 pF1KA1 IMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDGISASDFDFAVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTD :::::::::::::::..:: .::.:..:::..::::::::::::::::.::::::::::: CCDS55 IMLGVNQGEGLKFVEGVVDPEDGVSGTDFDYSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTD 370 380 390 400 410 420 450 460 470 480 490 500 pF1KA1 WADRHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWAD :::: :::::::::.::::::::: :.:.:::::. .::::::::::::::. . :::.: CCDS55 WADRDNPETRRKTLVALFTDHQWVEPSVVTADLHARYGSPTYFYAFYHHCQSLMKPAWSD 430 440 450 460 470 480 510 520 530 540 550 560 pF1KA1 AAHGDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKF ::::::::::.:.::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::: CCDS55 AAHGDEVPYVFGVPMVGPTDLFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNKPVPQDTKF 490 500 510 520 530 540 570 580 590 600 610 620 pF1KA1 IHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQY :::: ::::::::..:. .:::::::::::::..::::.:: .: .:::::.::.:. .: CCDS55 IHTKANRFEEVAWSKYNPRDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWKHLVPHLYNLHDMFHY 550 560 570 580 590 600 630 640 650 660 pF1KA1 TSTTTKVPSTD------ITFRPTRKN-SVPVTSAFPTAKQDDPK------QQPSPFSVDQ :::::::: : :: ::. :. :. . :. .... . :. .:. :.. CCDS55 TSTTTKVPPPDTTHSSHITRRPNGKTWSTKRPAISPAYSNENAQGSWNGDQDAGPLLVEN 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KA1 -RDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTT-TNDLTHAQE :::::::::::::::::::::.::::::::.:::::.. :. :::: . . .: : : CCDS55 PRDYSTELSVTIAVGASLLFLNVLAFAALYYRKDKRRQEPLRQPSPQRGAGAPELGAAPE 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KA1 EEIMSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNTITMIPNT ::. .::. : ::::. ::.. :: . :::::..::::::.:::::::::::::. CCDS55 EELAALQLGPTH--HECEAGPPHDT-LRLTALPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNS 730 740 750 760 770 790 800 810 820 pF1KA1 IPGIQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV . :.: :: .:::..: :.: ::::::::: CCDS55 LVGLQTLHPYNTFAAGFNST-----GLPHSHSTTRV 780 790 800 >>CCDS14407.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX (828 aa) initn: 3571 init1: 2030 opt: 2081 Z-score: 2174.5 bits: 413.3 E(32554): 8.4e-115 Smith-Waterman score: 3739; 69.9% identity (84.1% similar) in 806 aa overlap (53-823:42-828) 30 40 50 60 70 80 pF1KA1 RGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQFLG : : :.:::.:: . : .:::::: :.:: CCDS14 LSPKPTVGRSLCLTLWFLSLALRASTQAPAPTVNTHFGKLRGARVPLPSEILGPVDQYLG 20 30 40 50 60 70 90 100 110 120 130 140 pF1KA1 VPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVV ::::::: ::.:: ::::: :: :::::.: ::::::: . .:::::::::: :::.: CCDS14 VPYAAPPIGEKRFLPPEPPPSWSGIRNATHFPPVCPQNIHTA-VPEVMLPVWFTANLDIV 80 90 100 110 120 130 150 160 170 180 pF1KA1 SSYVQDQSEDCLYLNIYVPTED--------------------DIRDSGGPKPVMVYIHGG ..:.:. .:::::::.:::::: ::::::. :::::::::: CCDS14 ATYIQEPNEDCLYLNVYVPTEDGSGAKKQGEDLADNDGDEDEDIRDSGA-KPVMVYIHGG 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KA1 SYMEGTGNLYDGSVLASYGNVIVITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTS ::::::::. :::.:::::::::::.:::.::::::::::::::::::::: ::::::.: CCDS14 SYMEGTGNMIDGSILASYGNVIVITLNYRVGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWVS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KA1 ENIGFFGGDPLRITVFGSGAGGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSS :::.:::::: :::::::: :.:::.::::::.::: :::::: :::.:::: CCDS14 ENIAFFGGDPRRITVFGSGIGASCVSLLTLSHHSEG---------LFQRAIIQSGSALSS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KA1 WAVSFQPAKYARMLATKVGCNVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDIQPARYHIAFGPVIDG :::..::.::. .:: :::::: :::..:.::..: ::::.:::::::::.:::::::: CCDS14 WAVNYQPVKYTSLLADKVGCNVLDTVDMVDCLRQKSAKELVEQDIQPARYHVAFGPVIDG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KA1 DVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDGISASDFDFAVSNFVDNL :::::::.:::::::::::::::::::::::::::..:: .::.:..:::..:::::::: CCDS14 DVIPDDPEILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVEGVVDPEDGVSGTDFDYSVSNFVDNL 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KA1 YGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFGSP ::::::::.::::::::::::::: :::::::::.::::::::: :.:.:::::. .::: CCDS14 YGYPEGKDTLRETIKFMYTDWADRDNPETRRKTLVALFTDHQWVEPSVVTADLHARYGSP 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KA1 TYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAHGDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVMTY :::::::::::. . :::.:::::::::::.:.::.:::.:::::::::::::::::::: CCDS14 TYFYAFYHHCQSLMKPAWSDAAHGDEVPYVFGVPMVGPTDLFPCNFSKNDVMLSAVVMTY 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KA1 WTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRANK :::::::::::.:::::::::::: ::::::::..:. .:::::::::::::..::::.: CCDS14 WTNFAKTGDPNKPVPQDTKFIHTKANRFEEVAWSKYNPRDQLYLHIGLKPRVRDHYRATK 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KA1 VNLWLELVPHLHNLNDISQYTSTTTKVPSTD------ITFRPTRKN-SVPVTSAFPTAKQ : .: .:::::.::.:. .::::::::: : :: ::. :. :. . :. .. CCDS14 VAFWKHLVPHLYNLHDMFHYTSTTTKVPPPDTTHSSHITRRPNGKTWSTKRPAISPAYSN 610 620 630 640 650 660 660 670 680 690 700 pF1KA1 DDPK------QQPSPFSVDQ-RDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDV .. . :. .:. :.. :::::::::::::::::::::.::::::::.:::::.. CCDS14 ENAQGSWNGDQDAGPLLVENPRDYSTELSVTIAVGASLLFLNVLAFAALYYRKDKRRQEP 670 680 690 700 710 720 710 720 730 740 750 760 pF1KA1 HRRCSPQRTT-TNDLTHAQEEEIMSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMR :. :::: . . .: : :::. .::. : ::::. ::.. :: . :::::..: CCDS14 LRQPSPQRGAGAPELGAAPEEELAALQLGPTH--HECEAGPPHDT-LRLTALPDYTLTLR 730 740 750 760 770 770 780 790 800 810 820 pF1KA1 RSPDDVPLMTPNTITMIPNTIPGIQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV :::::.:::::::::::::.. :.: :: .:::..: :.: ::::::::: CCDS14 RSPDDIPLMTPNTITMIPNSLVGLQTLHPYNTFAAGFNST-----GLPHSHSTTRV 780 790 800 810 820 >>CCDS55441.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX (848 aa) initn: 3571 init1: 2030 opt: 2081 Z-score: 2174.4 bits: 413.3 E(32554): 8.6e-115 Smith-Waterman score: 3699; 68.2% identity (82.1% similar) in 826 aa overlap (53-823:42-848) 30 40 50 60 70 80 pF1KA1 RGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQFLG : : :.:::.:: . : .:::::: :.:: CCDS55 LSPKPTVGRSLCLTLWFLSLALRASTQAPAPTVNTHFGKLRGARVPLPSEILGPVDQYLG 20 30 40 50 60 70 90 100 110 120 130 140 pF1KA1 VPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVV ::::::: ::.:: ::::: :: :::::.: ::::::: . .:::::::::: :::.: CCDS55 VPYAAPPIGEKRFLPPEPPPSWSGIRNATHFPPVCPQNIHTA-VPEVMLPVWFTANLDIV 80 90 100 110 120 130 150 160 pF1KA1 SSYVQDQSEDCLYLNIYVPTED-------------------------------------- ..:.:. .:::::::.:::::: CCDS55 ATYIQEPNEDCLYLNVYVPTEDVKRISKECARKPNKKICRKGGSGAKKQGEDLADNDGDE 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KA1 --DIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGNLYDGSVLASYGNVIVITVNYRLGVLGFLSTGD ::::::. ::::::::::::::::::. :::.:::::::::::.:::.:::::::::: CCDS55 DEDIRDSGA-KPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGNVIVITLNYRVGVLGFLSTGD 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KA1 QAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGAGGSCVNLLTLSHYSEGNRWS ::::::::::: ::::::.::::.:::::: :::::::: :.:::.::::::.::: CCDS55 QAAKGNYGLLDQIQALRWVSENIAFFGGDPRRITVFGSGIGASCVSLLTLSHHSEG---- 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KA1 NSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYARMLATKVGCNVSDTVELVECLQKKPYKEL :::::: :::.:::::::..::.::. .:: :::::: :::..:.::..: ::: CCDS55 -----LFQRAIIQSGSALSSWAVNYQPVKYTSLLADKVGCNVLDTVDMVDCLRQKSAKEL 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KA1 VDQDIQPARYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVENIVDS :.:::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::..:: CCDS55 VEQDIQPARYHVAFGPVIDGDVIPDDPEILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVEGVVDP 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KA1 DDGISASDFDFAVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRHNPETRRKTLLALFTD .::.:..:::..::::::::::::::::.::::::::::::::: :::::::::.::::: CCDS55 EDGVSGTDFDYSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTDWADRDNPETRRKTLVALFTD 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KA1 HQWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAHGDEVPYVLGIPMIGPTE :::: :.:.:::::. .::::::::::::::. . :::.:::::::::::.:.::.:::. CCDS55 HQWVEPSVVTADLHARYGSPTYFYAFYHHCQSLMKPAWSDAAHGDEVPYVFGVPMVGPTD 490 500 510 520 530 540 530 540 550 560 570 580 pF1KA1 LFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWTRYSQKD :::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: ::::::::..:. .: CCDS55 LFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNKPVPQDTKFIHTKANRFEEVAWSKYNPRD 550 560 570 580 590 600 590 600 610 620 630 pF1KA1 QLYLHIGLKPRVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQYTSTTTKVPSTD------ITF ::::::::::::..::::.:: .: .:::::.::.:. .::::::::: : :: CCDS55 QLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWKHLVPHLYNLHDMFHYTSTTTKVPPPDTTHSSHITR 610 620 630 640 650 660 640 650 660 670 680 pF1KA1 RPTRKN-SVPVTSAFPTAKQDDPK------QQPSPFSVDQ-RDYSTELSVTIAVGASLLF ::. :. :. . :. .... . :. .:. :.. ::::::::::::::::::: CCDS55 RPNGKTWSTKRPAISPAYSNENAQGSWNGDQDAGPLLVENPRDYSTELSVTIAVGASLLF 670 680 690 700 710 720 690 700 710 720 730 740 pF1KA1 LNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTT-TNDLTHAQEEEIMSLQMKHTDLDHECESI ::.::::::::.:::::.. :. :::: . . .: : :::. .::. : ::::. CCDS55 LNVLAFAALYYRKDKRRQEPLRQPSPQRGAGAPELGAAPEEELAALQLGPTH--HECEAG 730 740 750 760 770 750 760 770 780 790 800 pF1KA1 HPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNTITMIPNTIPGIQPLHTFNTFTGGQNNT ::.. :: . :::::..::::::.:::::::::::::.. :.: :: .:::..: :.: CCDS55 PPHDT-LRLTALPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNSLVGLQTLHPYNTFAAGFNST 780 790 800 810 820 830 810 820 pF1KA1 LPHPHPHPHSHSTTRV ::::::::: CCDS55 -----GLPHSHSTTRV 840 >>CCDS3198.1 BCHE gene_id:590|Hs108|chr3 (602 aa) initn: 994 init1: 199 opt: 854 Z-score: 892.9 bits: 175.7 E(32554): 2e-43 Smith-Waterman score: 1086; 34.3% identity (60.7% similar) in 618 aa overlap (14-613:4-557) 10 20 30 40 50 60 pF1KA1 MALPRCTWPNYVWRAVMACLVHRGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFG .... :. : : : :::: :. :. ::. ..::. : CCDS31 MHSKVTIICI--RFLFWFLLLCML-----IGK--SHTEDDI--IIATKNG 10 20 30 70 80 90 100 110 pF1KA1 KIRGIKKELNNEILG-PVIQFLGVPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQ :.:: .: ..: : :::.::: :: :. ::. :. . :::: :::..: : : CCDS31 KVRG----MNLTVFGGTVTAFLGIPYAQPPLGRLRFKKPQSLTKWSDIWNATKYANSCCQ 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 NIIDGRLPEVM-LPVWFTNNLDVVSSYVQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKP---- :: : .: .: :. : ::::::::...:. ::: CCDS31 NI-DQSFPGFHGSEMWNPNT---------DLSEDCLYLNVWIPA---------PKPKNAT 100 110 120 130 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 VMVYIHGGSYMEGTGNL--YDGSVLASYGNVIVITVNYRLGVLGFLST-GDQAAKGNYGL :...:.::... ::..: :::. :: :::...:::.:.::::. :. : ::.:: CCDS31 VLIWIYGGGFQTGTSSLHVYDGKFLARVERVIVVSMNYRVGALGFLALPGNPEAPGNMGL 140 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 LDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGAGGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQR .: ::.:...::. :::.: .:.:: .::.. :.: :: :.. :: : CCDS31 FDQQLALQWVQKNIAAFGGNPKSVTLFGESAGAASVSLHLLSPGSHS---------LFTR 200 210 220 230 240 300 310 320 330 340 pF1KA1 AIAQSGTALSSWAV-SFQPAKYARM-LATKVGCNVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDIQP :: :::. . ::: :. :. . :: .::. . .:...::..: .:.. .. CCDS31 AILQSGSFNAPWAVTSLYEARNRTLNLAKLTGCSRENETEIIKCLRNKDPQEILLNEAFV 250 260 270 280 290 300 350 360 370 380 390 400 pF1KA1 ARY----HIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDG . : . :::..::: . : :.::.: :.: . .:..:::. :: : .: . : CCDS31 VPYGTPLSVNFGPTVDGDFLTDMPDILLELGQFKKTQILVGVNKDEGTAF---LVYGAPG 310 320 330 340 350 360 410 420 430 440 450 460 pF1KA1 ISASDFDFAV-SNFVDNL-YGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRHNPETRRKTLLALFTDH .: .. .. . ..: ..: .: .. .:.: : ::::.: . ::. :..: . :. CCDS31 FSKDNNSIITRKEFQEGLKIFFPGVSEFGKESILFHYTDWVDDQRPENYREALGDVVGDY 370 380 390 400 410 420 470 480 490 500 510 520 pF1KA1 QWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAHGDEVPYVLGIPMIGPTEL ... ::. . :..:. ..:: : :. . : : . :: :. .:.:.:. 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