FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1070, 823 aa
1>>>pF1KA1070 823 - 823 aa - 823 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2500+/-0.000853; mu= 16.9469+/- 0.052
mean_var=91.3620+/-18.610, 0's: 0 Z-trim(108.4): 32 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.134181
statistics sampled from 10156 (10187) to 10156 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.663), E-opt: 0.2 (0.313), width: 16
Scan time: 3.840
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3222.1 NLGN1 gene_id:22871|Hs108|chr3 ( 823) 5668 1107.7 0
CCDS11103.1 NLGN2 gene_id:57555|Hs108|chr17 ( 835) 2724 537.8 2.9e-152
CCDS56619.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY ( 648) 2133 423.3 6.4e-118
CCDS14126.1 NLGN4X gene_id:57502|Hs108|chrX ( 816) 2134 423.6 6.8e-118
CCDS14788.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY ( 816) 2133 423.4 7.7e-118
CCDS55442.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX ( 808) 2081 413.3 8.2e-115
CCDS14407.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX ( 828) 2081 413.3 8.4e-115
CCDS55441.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX ( 848) 2081 413.3 8.6e-115
CCDS3198.1 BCHE gene_id:590|Hs108|chr3 ( 602) 854 175.7 2e-43
CCDS43896.1 CEL gene_id:1056|Hs108|chr9 ( 756) 748 155.3 3.7e-37
CCDS45489.1 CES1 gene_id:1066|Hs108|chr16 ( 566) 728 151.3 4.3e-36
CCDS45488.1 CES1 gene_id:1066|Hs108|chr16 ( 567) 723 150.3 8.4e-36
CCDS32450.1 CES1 gene_id:1066|Hs108|chr16 ( 568) 723 150.3 8.4e-36
CCDS54024.1 CES4A gene_id:283848|Hs108|chr16 ( 463) 683 142.6 1.5e-33
CCDS55553.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY ( 256) 546 115.9 8.8e-26
CCDS42174.3 CES4A gene_id:283848|Hs108|chr16 ( 468) 522 111.4 3.7e-24
CCDS45507.1 CES2 gene_id:8824|Hs108|chr16 ( 607) 509 108.9 2.6e-23
CCDS10825.1 CES2 gene_id:8824|Hs108|chr16 ( 623) 509 108.9 2.7e-23
CCDS54025.1 CES4A gene_id:283848|Hs108|chr16 ( 374) 498 106.7 7.6e-23
CCDS34944.1 TG gene_id:7038|Hs108|chr8 (2768) 502 107.9 2.4e-22
CCDS54022.1 CES3 gene_id:23491|Hs108|chr16 ( 568) 483 103.9 8.1e-22
CCDS10826.1 CES3 gene_id:23491|Hs108|chr16 ( 571) 483 103.9 8.1e-22
CCDS54012.1 CES5A gene_id:221223|Hs108|chr16 ( 604) 480 103.3 1.3e-21
CCDS10755.1 CES5A gene_id:221223|Hs108|chr16 ( 525) 476 102.5 1.9e-21
CCDS45490.1 CES5A gene_id:221223|Hs108|chr16 ( 575) 476 102.5 2.1e-21
>>CCDS3222.1 NLGN1 gene_id:22871|Hs108|chr3 (823 aa)
initn: 5668 init1: 5668 opt: 5668 Z-score: 5927.3 bits: 1107.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5668; 100.0% identity (100.0% similar) in 823 aa overlap (1-823:1-823)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MALPRCTWPNYVWRAVMACLVHRGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MALPRCTWPNYVWRAVMACLVHRGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 KIRGIKKELNNEILGPVIQFLGVPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KIRGIKKELNNEILGPVIQFLGVPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 IIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVVSSYVQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKPVMVYIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVVSSYVQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKPVMVYIH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 GGSYMEGTGNLYDGSVLASYGNVIVITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GGSYMEGTGNLYDGSVLASYGNVIVITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TSENIGFFGGDPLRITVFGSGAGGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TSENIGFFGGDPLRITVFGSGAGGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 SSWAVSFQPAKYARMLATKVGCNVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDIQPARYHIAFGPVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSWAVSFQPAKYARMLATKVGCNVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDIQPARYHIAFGPVI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 DGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDGISASDFDFAVSNFVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDGISASDFDFAVSNFVD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NLYGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NLYGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SPTYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAHGDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SPTYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAHGDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 TYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 NKVNLWLELVPHLHNLNDISQYTSTTTKVPSTDITFRPTRKNSVPVTSAFPTAKQDDPKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NKVNLWLELVPHLHNLNDISQYTSTTTKVPSTDITFRPTRKNSVPVTSAFPTAKQDDPKQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 QPSPFSVDQRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTTTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QPSPFSVDQRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTTTN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 DLTHAQEEEIMSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DLTHAQEEEIMSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820
pF1KA1 ITMIPNTIPGIQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ITMIPNTIPGIQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV
790 800 810 820
>>CCDS11103.1 NLGN2 gene_id:57555|Hs108|chr17 (835 aa)
initn: 2539 init1: 1948 opt: 2724 Z-score: 2847.2 bits: 537.8 E(32554): 2.9e-152
Smith-Waterman score: 3535; 62.2% identity (78.2% similar) in 858 aa overlap (12-823:1-835)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MALPRCTWPNYVWRAVMACLV-----HRGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLV
.: .. ::: .:: :.: : : : . ... :.:
CCDS11 MWLLAL-CLVGLAGAQRGGGGPGGGAPGGPGLGLGSLGEERF----PVV
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 ATNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQFLGVPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAP
: .:..::...::::::::::.::::::::.:: : ::::::: :. : .:::: . :
CCDS11 NTAYGRVRGVRRELNNEILGPVVQFLGVPYATPPLGARRFQPPEAPASWPGVRNATTLPP
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KA1 VCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVVSSYVQDQSEDCLYLNIYVPTED-----------
.::::. : :: .:::::::.::.....:::.:::::::::.::::::
CCDS11 ACPQNL-HGALPAIMLPVWFTDNLEAAATYVQNQSEDCLYLNLYVPTEDGPLTKKRDEAT
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210
pF1KA1 ------DIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGNLYDGSVLASYGNVIVITVNYRLGVLGFL
:::: : ::::...:::::::::::..::::::.:::::: :.::::::::::
CCDS11 LNPPDTDIRDPG-KKPVMLFLHGGSYMEGTGNMFDGSVLAAYGNVIVATLNYRLGVLGFL
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 STGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGAGGSCVNLLTLSHYSEG
::::::::::::::: :::::: ::::. ::::: :::.::::::.:::::: :::.:::
CCDS11 STGDQAAKGNYGLLDQIQALRWLSENIAHFGGDPERITIFGSGAGASCVNLLILSHHSEG
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 NRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYARMLATKVGCNVSDTVELVECLQKKP
:::.::::::::.:::.:..:: ::.:.::.::::. :..: ::::..::
CCDS11 ---------LFQKAIAQSGTAISSWSVNYQPLKYTRLLAAKVGCDREDSAEAVECLRRKP
290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 YKELVDQDIQPARYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVEN
.::::::.::::::::::::.::::.::::.:::.::::::::...::::::::::::.
CCDS11 SRELVDQDVQPARYHIAFGPVVDGDVVPDDPEILMQQGEFLNYDMLIGVNQGEGLKFVED
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 IVDSDDGISASDFDFAVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRHNPETRRKTLLA
..:.::.::: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::: : : :::::::
CCDS11 SAESEDGVSASAFDFTVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRDNGEMRRKTLLA
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 LFTDHQWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAHGDEVPYVLGIPMI
::::::::::::::: ::... ::.:::.::::::.. : :::::::::.:::.:.::.
CCDS11 LFTDHQWVAPAVATAKLHADYQSPVYFYTFYHHCQAEGRPEWADAAHGDELPYVFGVPMV
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 GPTELFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWTRY
: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:...
CCDS11 GATDLFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVVWSKF
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 SQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQYTSTTTKVPSTDITFRP
..:.. ::::::::::...:::::: .:::::::::::. .. .:::..: . :
CCDS11 NSKEKQYLHIGLKPRVRDNYRANKVAFWLELVPHLHNLH--TELFTTTTRLPPYATRWPP
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 TRKNSVPVTSAFPTAKQDDPKQQPSP-------FSVDQRDYSTELSVTIAVGASLLFLNI
..: : : :. .: : : :.::::::::::.:::::::::::
CCDS11 RPPAGAPGTRRPPPPATLPPEPEPEPGPRAYDRFPGDSRDYSTELSVTVAVGASLLFLNI
640 650 660 670 680 690
700 710 720 730
pF1KA1 LAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTTTNDLTHA------------QEEEIMSLQMKHTD
:::::::::.:.:.. :: :: . . . . :::..:::.:.
CCDS11 LAFAALYYKRDRRQELRCRRLSPPGGSGSGVPGGGPLLPAAGRELPPEEELVSLQLKRGG
700 710 720 730 740 750
740 750 760 770 780 790
pF1KA1 LDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNTITMIPNTI-PGIQP----L
. : :. :: :::::::::.::.::::::..:...:..:. . : : :
CCDS11 ----GVGADPAEA-LRPACPPDYTLALRRAPDDVPLLAPGALTLLPSGLGPPPPPPPPSL
760 770 780 790 800
800 810 820
pF1KA1 HTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV
: :. : .. : . :: ::::::
CCDS11 HPFGPFPPPPPTATSHNNTLPHPHSTTRV
810 820 830
>>CCDS56619.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY (648 aa)
initn: 2817 init1: 2089 opt: 2133 Z-score: 2230.6 bits: 423.3 E(32554): 6.4e-118
Smith-Waterman score: 3416; 75.6% identity (89.1% similar) in 663 aa overlap (176-823:1-648)
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 VQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGNLYDGSVLASYGNVIV
:::::::::::::::. :::.:::::::::
CCDS56 MVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGNVIV
10 20 30
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 ITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGAGGS
::.:::::.::::::::::::::::::: :::::: ::.: ::::: :.:.::::::.:
CCDS56 ITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGAFGGDPKRVTIFGSGAGAS
40 50 60 70 80 90
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 CVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYARMLATKVGCNVS
::.::::::::: ::::.:: :::::::::::..:::::.:.:: :::::.
CCDS56 CVSLLTLSHYSE---------GLFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRILADKVGCNML
100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 DTVELVECLQKKPYKELVDQDIQPARYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIML
::...::::..: ::::..: : :: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DTTDMVECLKNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIML
150 160 170 180 190 200
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 GVNQGEGLKFVENIVDSDDGISASDFDFAVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTDWAD
:::::::::::..:::..::.. .::::.::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS56 GVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTDWAD
210 220 230 240 250 260
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 RHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAH
..:::::::::.:::::::::::::::::::...::::::::::::::... :.:::.::
CCDS56 KENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEMKPSWADSAH
270 280 290 300 310 320
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 GDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHT
:::::::.::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHT
330 340 350 360 370 380
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 KPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQYTST
::::::::::..:. ::::::::::::::..::::.:: .::::::::::::.: ::.::
CCDS56 KPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNLNEIFQYVST
390 400 410 420 430 440
630 640 650 660 670
pF1KA1 TTKVPSTDITFRP--TRKNSV---PVTSAFPTAKQDDPKQQPSPFSVD----------QR
::::: :.: : ::.. . :.:. . ..::.. .: .. .:
CCDS56 TTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPEDTTVLIETKR
450 460 470 480 490 500
680 690 700 710 720 730
pF1KA1 DYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTTTNDLTHAQEEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::. ::::.::::.:: :.:::
CCDS56 DYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRHPSPQRNTTNDITHIQNEEI
510 520 530 540 550 560
740 750 760 770 780 790
pF1KA1 MSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNTITMIPNTIPG
::::::. . ::::::.. :.. :: .:::::::..::::::.:.::::::::::::. :
CCDS56 MSLQMKQLEHDHECESLQAHDT-LRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPFMTPNTITMIPNTLMG
570 580 590 600 610 620
800 810 820
pF1KA1 IQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV
.::::::.::.::::.: ::.::::::
CCDS56 MQPLHTFKTFSGGQNST-----NLPHGHSTTRV
630 640
>>CCDS14126.1 NLGN4X gene_id:57502|Hs108|chrX (816 aa)
initn: 2831 init1: 2088 opt: 2134 Z-score: 2230.1 bits: 423.6 E(32554): 6.8e-118
Smith-Waterman score: 4052; 74.9% identity (88.8% similar) in 786 aa overlap (53-823:46-816)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 RGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQFLG
:.: ::.:::::.. : ::::::: :.::
CCDS14 PVCVMLNSNVLLWLTALAIKFTLIDSQAQYPVVNTNYGKIRGLRTPLPNEILGPVEQYLG
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 VPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVV
::::.::::::::::::::: :. :::.:::: ::::.. . : . :::.::: :::..
CCDS14 VPYASPPTGERRFQPPEPPSSWTGIRNTTQFAAVCPQHLDERSLLHDMLPIWFTANLDTL
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 SSYVQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGNLYDGSVLASYGN
.:::::.::::::::::::::::.:... ::::::::::::::::::. :::.::::::
CCDS14 MTYVQDQNEDCLYLNIYVPTEDDIHDQNSKKPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGN
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 VIVITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGA
:::::.:::::.::::::::::::::::::: :::::: ::.: ::::: :.:.:::::
CCDS14 VIVITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGAFGGDPKRVTIFGSGA
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 GGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYARMLATKVGC
:.:::.:::::::::: :::.:: :::::::::::..:::::.:.:: ::::
CCDS14 GASCVSLLTLSHYSEG---------LFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRILADKVGC
260 270 280 290 300
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 NVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDIQPARYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYD
:. ::...::::..: ::::..: : :: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NMLDTTDMVECLRNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYD
310 320 330 340 350 360
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 IMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDGISASDFDFAVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTD
::::::::::::::..:::..::.. .::::.::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS14 IMLGVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTD
370 380 390 400 410 420
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 WADRHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWAD
:::..:::::::::.:::::::::::::::::::...::::::::::::::... :.:::
CCDS14 WADKENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEMKPSWAD
430 440 450 460 470 480
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 AAHGDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKF
.:::::::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SAHGDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKF
490 500 510 520 530 540
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 IHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQY
:::::::::::::..:. ::::::::::::::..::::.:: .::::::::::::.: ::
CCDS14 IHTKPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNLNEIFQY
550 560 570 580 590 600
630 640 650 660
pF1KA1 TSTTTKVPSTDITFRP--TRKNSV---PVTSAFPTAKQDDPKQQPSPFSVD---------
.::::::: :.: : ::.. . :.:. . ..::.. .: ..
CCDS14 VSTTTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPEDTTVLIE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 -QRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTTTNDLTHAQE
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::: ::::.::::..: :.
CCDS14 TKRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRRPSPQRNTTNDIAHIQN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 EEIMSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNTITMIPNT
:::::::::. . ::::::.. :.. :: .:::::::..::::::.::::::::::::::
CCDS14 EEIMSLQMKQLEHDHECESLQAHDT-LRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820
pF1KA1 IPGIQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV
. :.:::::::::.::::.: ::.::::::
CCDS14 LTGMQPLHTFNTFSGGQNST-----NLPHGHSTTRV
790 800 810
>>CCDS14788.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY (816 aa)
initn: 2817 init1: 2089 opt: 2133 Z-score: 2229.0 bits: 423.4 E(32554): 7.7e-118
Smith-Waterman score: 3997; 73.9% identity (88.7% similar) in 786 aa overlap (53-823:46-816)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 RGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQFLG
:.: ::.:::.:.. : .:::::: :.::
CCDS14 SVCVMLNSNVLLWITALAIKFTLIDSQAQYPVVNTNYGKIQGLRTPLPSEILGPVEQYLG
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 VPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVV
::::.:::::::::::: :: :. :::::::. ::::.. . : . :::.:::..::..
CCDS14 VPYASPPTGERRFQPPESPSSWTGIRNATQFSAVCPQHLDERFLLHDMLPIWFTTSLDTL
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 SSYVQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGNLYDGSVLASYGN
.:::::.::::::::::: ::::..... ::::::::::::::::::. :::.::::::
CCDS14 MTYVQDQNEDCLYLNIYVPMEDDIHEQNSKKPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGN
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 VIVITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGA
:::::.:::::.::::::::::::::::::: :::::: ::.: ::::: :.:.:::::
CCDS14 VIVITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGAFGGDPKRVTIFGSGA
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 GGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYARMLATKVGC
:.:::.:::::::::: :::.:: :::::::::::..:::::.:.:: ::::
CCDS14 GASCVSLLTLSHYSEG---------LFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRILADKVGC
260 270 280 290 300
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 NVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDIQPARYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYD
:. ::...::::..: ::::..: : :: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NMLDTTDMVECLKNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYD
310 320 330 340 350 360
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 IMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDGISASDFDFAVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTD
::::::::::::::..:::..::.. .::::.::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS14 IMLGVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTD
370 380 390 400 410 420
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 WADRHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWAD
:::..:::::::::.:::::::::::::::::::...::::::::::::::... :.:::
CCDS14 WADKENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEMKPSWAD
430 440 450 460 470 480
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 AAHGDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKF
.:::::::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SAHGDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKF
490 500 510 520 530 540
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 IHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQY
:::::::::::::..:. ::::::::::::::..::::.:: .::::::::::::.: ::
CCDS14 IHTKPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNLNEIFQY
550 560 570 580 590 600
630 640 650 660
pF1KA1 TSTTTKVPSTDITFRP--TRKNSV---PVTSAFPTAKQDDPKQQPSPFSVD---------
.::::::: :.: : ::.. . :.:. . ..::.. .: ..
CCDS14 VSTTTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPEDTTVLIE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 -QRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTTTNDLTHAQE
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::. ::::.::::.:: :.
CCDS14 TKRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRHPSPQRNTTNDITHIQN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 EEIMSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNTITMIPNT
:::::::::. . ::::::.. :.. :: .:::::::..::::::.:.::::::::::::
CCDS14 EEIMSLQMKQLEHDHECESLQAHDT-LRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPFMTPNTITMIPNT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820
pF1KA1 IPGIQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV
. :.::::::.::.::::.: ::.::::::
CCDS14 LMGMQPLHTFKTFSGGQNST-----NLPHGHSTTRV
790 800 810
>>CCDS55442.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX (808 aa)
initn: 3565 init1: 2030 opt: 2081 Z-score: 2174.7 bits: 413.3 E(32554): 8.2e-115
Smith-Waterman score: 3789; 71.6% identity (86.3% similar) in 786 aa overlap (53-823:42-808)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 RGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQFLG
: : :.:::.:: . : .:::::: :.::
CCDS55 LSPKPTVGRSLCLTLWFLSLALRASTQAPAPTVNTHFGKLRGARVPLPSEILGPVDQYLG
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 VPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVV
::::::: ::.:: ::::: :: :::::.: ::::::: . .:::::::::: :::.:
CCDS55 VPYAAPPIGEKRFLPPEPPPSWSGIRNATHFPPVCPQNIHTA-VPEVMLPVWFTANLDIV
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 SSYVQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGNLYDGSVLASYGN
..:.:. .:::::::.::::::::::::. ::::::::::::::::::. :::.::::::
CCDS55 ATYIQEPNEDCLYLNVYVPTEDDIRDSGA-KPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGN
140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 VIVITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGA
:::::.:::.::::::::::::::::::::: ::::::.::::.:::::: ::::::::
CCDS55 VIVITLNYRVGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWVSENIAFFGGDPRRITVFGSGI
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 GGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYARMLATKVGC
:.:::.::::::.::: :::::: :::.:::::::..::.::. .:: ::::
CCDS55 GASCVSLLTLSHHSEG---------LFQRAIIQSGSALSSWAVNYQPVKYTSLLADKVGC
250 260 270 280 290 300
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 NVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDIQPARYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYD
:: :::..:.::..: ::::.:::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::
CCDS55 NVLDTVDMVDCLRQKSAKELVEQDIQPARYHVAFGPVIDGDVIPDDPEILMEQGEFLNYD
310 320 330 340 350 360
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 IMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDGISASDFDFAVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTD
:::::::::::::::..:: .::.:..:::..::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS55 IMLGVNQGEGLKFVEGVVDPEDGVSGTDFDYSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTD
370 380 390 400 410 420
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 WADRHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWAD
:::: :::::::::.::::::::: :.:.:::::. .::::::::::::::. . :::.:
CCDS55 WADRDNPETRRKTLVALFTDHQWVEPSVVTADLHARYGSPTYFYAFYHHCQSLMKPAWSD
430 440 450 460 470 480
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 AAHGDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKF
::::::::::.:.::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS55 AAHGDEVPYVFGVPMVGPTDLFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNKPVPQDTKF
490 500 510 520 530 540
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 IHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQY
:::: ::::::::..:. .:::::::::::::..::::.:: .: .:::::.::.:. .:
CCDS55 IHTKANRFEEVAWSKYNPRDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWKHLVPHLYNLHDMFHY
550 560 570 580 590 600
630 640 650 660
pF1KA1 TSTTTKVPSTD------ITFRPTRKN-SVPVTSAFPTAKQDDPK------QQPSPFSVDQ
:::::::: : :: ::. :. :. . :. .... . :. .:. :..
CCDS55 TSTTTKVPPPDTTHSSHITRRPNGKTWSTKRPAISPAYSNENAQGSWNGDQDAGPLLVEN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 -RDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTT-TNDLTHAQE
:::::::::::::::::::::.::::::::.:::::.. :. :::: . . .: : :
CCDS55 PRDYSTELSVTIAVGASLLFLNVLAFAALYYRKDKRRQEPLRQPSPQRGAGAPELGAAPE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 EEIMSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNTITMIPNT
::. .::. : ::::. ::.. :: . :::::..::::::.:::::::::::::.
CCDS55 EELAALQLGPTH--HECEAGPPHDT-LRLTALPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNS
730 740 750 760 770
790 800 810 820
pF1KA1 IPGIQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV
. :.: :: .:::..: :.: :::::::::
CCDS55 LVGLQTLHPYNTFAAGFNST-----GLPHSHSTTRV
780 790 800
>>CCDS14407.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX (828 aa)
initn: 3571 init1: 2030 opt: 2081 Z-score: 2174.5 bits: 413.3 E(32554): 8.4e-115
Smith-Waterman score: 3739; 69.9% identity (84.1% similar) in 806 aa overlap (53-823:42-828)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 RGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQFLG
: : :.:::.:: . : .:::::: :.::
CCDS14 LSPKPTVGRSLCLTLWFLSLALRASTQAPAPTVNTHFGKLRGARVPLPSEILGPVDQYLG
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 VPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVV
::::::: ::.:: ::::: :: :::::.: ::::::: . .:::::::::: :::.:
CCDS14 VPYAAPPIGEKRFLPPEPPPSWSGIRNATHFPPVCPQNIHTA-VPEVMLPVWFTANLDIV
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180
pF1KA1 SSYVQDQSEDCLYLNIYVPTED--------------------DIRDSGGPKPVMVYIHGG
..:.:. .:::::::.:::::: ::::::. ::::::::::
CCDS14 ATYIQEPNEDCLYLNVYVPTEDGSGAKKQGEDLADNDGDEDEDIRDSGA-KPVMVYIHGG
140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SYMEGTGNLYDGSVLASYGNVIVITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTS
::::::::. :::.:::::::::::.:::.::::::::::::::::::::: ::::::.:
CCDS14 SYMEGTGNMIDGSILASYGNVIVITLNYRVGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ENIGFFGGDPLRITVFGSGAGGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSS
:::.:::::: :::::::: :.:::.::::::.::: :::::: :::.::::
CCDS14 ENIAFFGGDPRRITVFGSGIGASCVSLLTLSHHSEG---------LFQRAIIQSGSALSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 WAVSFQPAKYARMLATKVGCNVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDIQPARYHIAFGPVIDG
:::..::.::. .:: :::::: :::..:.::..: ::::.:::::::::.::::::::
CCDS14 WAVNYQPVKYTSLLADKVGCNVLDTVDMVDCLRQKSAKELVEQDIQPARYHVAFGPVIDG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 DVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDGISASDFDFAVSNFVDNL
:::::::.:::::::::::::::::::::::::::..:: .::.:..:::..::::::::
CCDS14 DVIPDDPEILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVEGVVDPEDGVSGTDFDYSVSNFVDNL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 YGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFGSP
::::::::.::::::::::::::: :::::::::.::::::::: :.:.:::::. .:::
CCDS14 YGYPEGKDTLRETIKFMYTDWADRDNPETRRKTLVALFTDHQWVEPSVVTADLHARYGSP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 TYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAHGDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVMTY
:::::::::::. . :::.:::::::::::.:.::.:::.::::::::::::::::::::
CCDS14 TYFYAFYHHCQSLMKPAWSDAAHGDEVPYVFGVPMVGPTDLFPCNFSKNDVMLSAVVMTY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 WTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRANK
:::::::::::.:::::::::::: ::::::::..:. .:::::::::::::..::::.:
CCDS14 WTNFAKTGDPNKPVPQDTKFIHTKANRFEEVAWSKYNPRDQLYLHIGLKPRVRDHYRATK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KA1 VNLWLELVPHLHNLNDISQYTSTTTKVPSTD------ITFRPTRKN-SVPVTSAFPTAKQ
: .: .:::::.::.:. .::::::::: : :: ::. :. :. . :. ..
CCDS14 VAFWKHLVPHLYNLHDMFHYTSTTTKVPPPDTTHSSHITRRPNGKTWSTKRPAISPAYSN
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700
pF1KA1 DDPK------QQPSPFSVDQ-RDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDV
.. . :. .:. :.. :::::::::::::::::::::.::::::::.:::::..
CCDS14 ENAQGSWNGDQDAGPLLVENPRDYSTELSVTIAVGASLLFLNVLAFAALYYRKDKRRQEP
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KA1 HRRCSPQRTT-TNDLTHAQEEEIMSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMR
:. :::: . . .: : :::. .::. : ::::. ::.. :: . :::::..:
CCDS14 LRQPSPQRGAGAPELGAAPEEELAALQLGPTH--HECEAGPPHDT-LRLTALPDYTLTLR
730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KA1 RSPDDVPLMTPNTITMIPNTIPGIQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV
:::::.:::::::::::::.. :.: :: .:::..: :.: :::::::::
CCDS14 RSPDDIPLMTPNTITMIPNSLVGLQTLHPYNTFAAGFNST-----GLPHSHSTTRV
780 790 800 810 820
>>CCDS55441.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX (848 aa)
initn: 3571 init1: 2030 opt: 2081 Z-score: 2174.4 bits: 413.3 E(32554): 8.6e-115
Smith-Waterman score: 3699; 68.2% identity (82.1% similar) in 826 aa overlap (53-823:42-848)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 RGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQFLG
: : :.:::.:: . : .:::::: :.::
CCDS55 LSPKPTVGRSLCLTLWFLSLALRASTQAPAPTVNTHFGKLRGARVPLPSEILGPVDQYLG
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 VPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVV
::::::: ::.:: ::::: :: :::::.: ::::::: . .:::::::::: :::.:
CCDS55 VPYAAPPIGEKRFLPPEPPPSWSGIRNATHFPPVCPQNIHTA-VPEVMLPVWFTANLDIV
80 90 100 110 120 130
150 160
pF1KA1 SSYVQDQSEDCLYLNIYVPTED--------------------------------------
..:.:. .:::::::.::::::
CCDS55 ATYIQEPNEDCLYLNVYVPTEDVKRISKECARKPNKKICRKGGSGAKKQGEDLADNDGDE
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 --DIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGNLYDGSVLASYGNVIVITVNYRLGVLGFLSTGD
::::::. ::::::::::::::::::. :::.:::::::::::.:::.::::::::::
CCDS55 DEDIRDSGA-KPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGNVIVITLNYRVGVLGFLSTGD
200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 QAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGAGGSCVNLLTLSHYSEGNRWS
::::::::::: ::::::.::::.:::::: :::::::: :.:::.::::::.:::
CCDS55 QAAKGNYGLLDQIQALRWVSENIAFFGGDPRRITVFGSGIGASCVSLLTLSHHSEG----
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 NSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYARMLATKVGCNVSDTVELVECLQKKPYKEL
:::::: :::.:::::::..::.::. .:: :::::: :::..:.::..: :::
CCDS55 -----LFQRAIIQSGSALSSWAVNYQPVKYTSLLADKVGCNVLDTVDMVDCLRQKSAKEL
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 VDQDIQPARYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVENIVDS
:.:::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::..::
CCDS55 VEQDIQPARYHVAFGPVIDGDVIPDDPEILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVEGVVDP
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 DDGISASDFDFAVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRHNPETRRKTLLALFTD
.::.:..:::..::::::::::::::::.::::::::::::::: :::::::::.:::::
CCDS55 EDGVSGTDFDYSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTDWADRDNPETRRKTLVALFTD
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 HQWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAHGDEVPYVLGIPMIGPTE
:::: :.:.:::::. .::::::::::::::. . :::.:::::::::::.:.::.:::.
CCDS55 HQWVEPSVVTADLHARYGSPTYFYAFYHHCQSLMKPAWSDAAHGDEVPYVFGVPMVGPTD
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 LFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWTRYSQKD
:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: ::::::::..:. .:
CCDS55 LFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNKPVPQDTKFIHTKANRFEEVAWSKYNPRD
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630
pF1KA1 QLYLHIGLKPRVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQYTSTTTKVPSTD------ITF
::::::::::::..::::.:: .: .:::::.::.:. .::::::::: : ::
CCDS55 QLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWKHLVPHLYNLHDMFHYTSTTTKVPPPDTTHSSHITR
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680
pF1KA1 RPTRKN-SVPVTSAFPTAKQDDPK------QQPSPFSVDQ-RDYSTELSVTIAVGASLLF
::. :. :. . :. .... . :. .:. :.. :::::::::::::::::::
CCDS55 RPNGKTWSTKRPAISPAYSNENAQGSWNGDQDAGPLLVENPRDYSTELSVTIAVGASLLF
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 LNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTT-TNDLTHAQEEEIMSLQMKHTDLDHECESI
::.::::::::.:::::.. :. :::: . . .: : :::. .::. : ::::.
CCDS55 LNVLAFAALYYRKDKRRQEPLRQPSPQRGAGAPELGAAPEEELAALQLGPTH--HECEAG
730 740 750 760 770
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 HPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNTITMIPNTIPGIQPLHTFNTFTGGQNNT
::.. :: . :::::..::::::.:::::::::::::.. :.: :: .:::..: :.:
CCDS55 PPHDT-LRLTALPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNSLVGLQTLHPYNTFAAGFNST
780 790 800 810 820 830
810 820
pF1KA1 LPHPHPHPHSHSTTRV
:::::::::
CCDS55 -----GLPHSHSTTRV
840
>>CCDS3198.1 BCHE gene_id:590|Hs108|chr3 (602 aa)
initn: 994 init1: 199 opt: 854 Z-score: 892.9 bits: 175.7 E(32554): 2e-43
Smith-Waterman score: 1086; 34.3% identity (60.7% similar) in 618 aa overlap (14-613:4-557)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MALPRCTWPNYVWRAVMACLVHRGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFG
.... :. : : : :::: :. :. ::. ..::. :
CCDS31 MHSKVTIICI--RFLFWFLLLCML-----IGK--SHTEDDI--IIATKNG
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KA1 KIRGIKKELNNEILG-PVIQFLGVPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQ
:.:: .: ..: : :::.::: :: :. ::. :. . :::: :::..: : :
CCDS31 KVRG----MNLTVFGGTVTAFLGIPYAQPPLGRLRFKKPQSLTKWSDIWNATKYANSCCQ
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 NIIDGRLPEVM-LPVWFTNNLDVVSSYVQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKP----
:: : .: .: :. : ::::::::...:. :::
CCDS31 NI-DQSFPGFHGSEMWNPNT---------DLSEDCLYLNVWIPA---------PKPKNAT
100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 VMVYIHGGSYMEGTGNL--YDGSVLASYGNVIVITVNYRLGVLGFLST-GDQAAKGNYGL
:...:.::... ::..: :::. :: :::...:::.:.::::. :. : ::.::
CCDS31 VLIWIYGGGFQTGTSSLHVYDGKFLARVERVIVVSMNYRVGALGFLALPGNPEAPGNMGL
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 LDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGAGGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQR
.: ::.:...::. :::.: .:.:: .::.. :.: :: :.. :: :
CCDS31 FDQQLALQWVQKNIAAFGGNPKSVTLFGESAGAASVSLHLLSPGSHS---------LFTR
200 210 220 230 240
300 310 320 330 340
pF1KA1 AIAQSGTALSSWAV-SFQPAKYARM-LATKVGCNVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDIQP
:: :::. . ::: :. :. . :: .::. . .:...::..: .:.. ..
CCDS31 AILQSGSFNAPWAVTSLYEARNRTLNLAKLTGCSRENETEIIKCLRNKDPQEILLNEAFV
250 260 270 280 290 300
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 ARY----HIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDG
. : . :::..::: . : :.::.: :.: . .:..:::. :: : .: . :
CCDS31 VPYGTPLSVNFGPTVDGDFLTDMPDILLELGQFKKTQILVGVNKDEGTAF---LVYGAPG
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 ISASDFDFAV-SNFVDNL-YGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRHNPETRRKTLLALFTDH
.: .. .. . ..: ..: .: .. .:.: : ::::.: . ::. :..: . :.
CCDS31 FSKDNNSIITRKEFQEGLKIFFPGVSEFGKESILFHYTDWVDDQRPENYREALGDVVGDY
370 380 390 400 410 420
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 QWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAHGDEVPYVLGIPMIGPTEL
... ::. . :..:. ..:: : :. . : : . :: :. .:.:.:.
CCDS31 NFICPALEFTKKFSEWGNNAFFYYFEHRSSKLPWPEWMGVMHGYEIEFVFGLPLERRD--
430 440 450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 FPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQ
:..: . .:: .. :.:::: :.::. :. : ..: ... .:
CCDS31 ---NYTKAEEILSRSIVKRWANFAKYGNPNE----------TQNNS---TSWPVFKSTEQ
490 500 510 520
590 600 610 620 630 640
pF1KA1 LYLHIGLKP-RVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQYTSTTTKVPSTDITFRPTRKN
:: .. . :. . ::.. .: . :..
CCDS31 KYLTLNTESTRIMTKLRAQQCRFWTSFFPKVLEMTGNIDEAEWEWKAGFHRWNNYMMDWK
530 540 550 560 570 580
650 660 670 680 690 700
pF1KA1 SVPVTSAFPTAKQDDPKQQPSPFSVDQRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKD
CCDS31 NQFNDYTSKKESCVGL
590 600
>>CCDS43896.1 CEL gene_id:1056|Hs108|chr9 (756 aa)
initn: 735 init1: 334 opt: 748 Z-score: 780.6 bits: 155.3 E(32554): 3.7e-37
Smith-Waterman score: 977; 34.0% identity (56.8% similar) in 648 aa overlap (55-668:29-612)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 LGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQ-FLGV
: :. : ..:..:.:. .:: .. : :.
CCDS43 MLTMGRLQLVVLGLTCCWAVASAAKLGAVYTEGGFVEGVNKKLG--LLGDSVDIFKGI
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 PYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVVS
:.::: . .. :.: :. .: .: : : : :.. :
CCDS43 PFAAP---TKALENPQPHPGWQGTLKAKNFKKRCLQATI-------------TQD----S
60 70 80 90
150 160 170 180 190
pF1KA1 SYVQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGN--------LYDGS
.: .::::::::.:: . .. . :::..:.::... :.:. ::::
CCDS43 TY---GDEDCLYLNIWVP--QGRKQVSRDLPVMIWIYGGAFLMGSGHGANFLNNYLYDGE
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KA1 VLASYGNVIVITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRI
.:. :::::.: :::.: :::::::: ::::: : .:. :...::. ::::: :
CCDS43 EIATRGNVIVVTFNYRVGPLGFLSTGDANLPGNYGLRDQHMAIAWVKRNIAAFGGDPNNI
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KA1 TVFGSGAGGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYARM
:.:: .:::. :.: ::: :. :::..:::.:::.::: :... .: .:.
CCDS43 TLFGESAGGASVSLQTLSPYN---------KGLIRRAISQSGVALSPWVIQKNPLFWAKK
220 230 240 250 260
320 330 340 350 360
pF1KA1 LATKVGCNVSDTVELVECLQ-KKP------YKELVDQDIQPARYHIAFGPVIDGDVIPDD
.: :::: :.:......::. : :: . : ....: :::::: :: :
CCDS43 VAEKVGCPVGDAARMAQCLKVTDPRALTLAYKVPLAGLEYPMLHYVGFVPVIDGDFIPAD
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 PQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKF----VENIVDSDDGISASDFDFAVSNFV--DNL
: :. .. . : . :.:. .: : . : .. .. :: ::.:. .:
CCDS43 PINLYANAA--DIDYIAGTNNMDGHIFASIDMPAINKGNKKVTEEDFYKLVSEFTITKGL
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 YGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPA-VATADLHSNFGS
: :: :. ::. . :...::.. . :: ...:. .: :. ..: :
CCDS43 RGAKTTFDVYTES-------WAQDPSQENKKKTVVDFETDVLFLVPTEIALAQHRANAKS
390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 P-TYFYAFYHHCQTDQVPAWADAAHGDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVM
:: : : : . : :. : :.:.. ::.: :. :: : .: .: ...
CCDS43 AKTYAYLFSHPSRMPVYPKWVGADHADDIQYVFGKPFATPTGYRP-----QDRTVSKAMI
440 450 460 470 480
550 560 570 580 590
pF1KA1 TYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLK---PRVKEH
.::::::::::::. :. :.. : :. ... ::.: : .:.
CCDS43 AYWTNFAKTGDPNMG---DSAV----PTH-----WEPYTTENSGYLEITKKMGSSSMKRS
490 500 510 520 530
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 YRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQYTSTTTKVPSTDITFRPTRKNS----VPVTS---AF
:.: . : : ...: : .. . . ... : : .: :: :. :
CCDS43 LRTNFLRYWTLTYLALPTVTD--QEATPVPPTGDSEATPVPPTGDSETAPVPPTGDSGAP
540 550 560 570 580 590
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 PTAKQDDPKQQPSPFSVDQRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHR
:. : : : . :
CCDS43 PVPPTGDSGAPPVPPTGDSGAPPVPPTGDSGAPPVPPTGDSGAPPVPPTGDSGAPPVPPT
600 610 620 630 640 650
823 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 20:22:02 2016 done: Wed Nov 2 20:22:02 2016
Total Scan time: 3.840 Total Display time: 0.260
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]