FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1071, 1084 aa 1>>>pF1KA1071 1084 - 1084 aa - 1084 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.9617+/-0.000508; mu= -32.0273+/- 0.032 mean_var=695.2767+/-145.370, 0's: 0 Z-trim(123.1): 53 B-trim: 646 in 1/60 Lambda= 0.048640 statistics sampled from 42216 (42276) to 42216 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.764), E-opt: 0.2 (0.496), width: 16 Scan time: 15.710 The best scores are: opt bits E(85289) XP_011529177 (OMIM: 300410) PREDICTED: angiomotin (1084) 7122 515.7 5.7e-145 XP_005262144 (OMIM: 300410) PREDICTED: angiomotin (1084) 7122 515.7 5.7e-145 NP_001106962 (OMIM: 300410) angiomotin isoform 1 [ (1084) 7122 515.7 5.7e-145 XP_016884778 (OMIM: 300410) PREDICTED: angiomotin ( 675) 4259 314.7 1.2e-84 NP_573572 (OMIM: 300410) angiomotin isoform 2 [Hom ( 675) 4259 314.7 1.2e-84 XP_005262147 (OMIM: 300410) PREDICTED: angiomotin ( 675) 4259 314.7 1.2e-84 NP_001287936 (OMIM: 614657) angiomotin-like protei ( 906) 1889 148.5 1.7e-34 XP_011540928 (OMIM: 614657) PREDICTED: angiomotin- ( 935) 1887 148.3 1.9e-34 NP_570899 (OMIM: 614657) angiomotin-like protein 1 ( 956) 1884 148.1 2.3e-34 XP_005273855 (OMIM: 614657) PREDICTED: angiomotin- ( 985) 1884 148.1 2.3e-34 XP_005273858 (OMIM: 614657) PREDICTED: angiomotin- ( 870) 1881 147.9 2.5e-34 XP_011540930 (OMIM: 614657) PREDICTED: angiomotin- ( 604) 1851 145.7 7.8e-34 XP_011511183 (OMIM: 614658) PREDICTED: angiomotin- ( 779) 1325 108.8 1.2e-22 XP_006713717 (OMIM: 614658) PREDICTED: angiomotin- ( 779) 1325 108.8 1.2e-22 XP_016862069 (OMIM: 614658) PREDICTED: angiomotin- ( 780) 1325 108.8 1.2e-22 XP_016862070 (OMIM: 614658) PREDICTED: angiomotin- ( 780) 1325 108.8 1.2e-22 XP_016862071 (OMIM: 614658) PREDICTED: angiomotin- ( 780) 1325 108.8 1.2e-22 NP_057285 (OMIM: 614658) angiomotin-like protein 2 ( 780) 1325 108.8 1.2e-22 NP_001265612 (OMIM: 614658) angiomotin-like protei ( 837) 1325 108.9 1.3e-22 NP_001265614 (OMIM: 614658) angiomotin-like protei ( 777) 1311 107.9 2.5e-22 XP_006718835 (OMIM: 614657) PREDICTED: angiomotin- ( 677) 1025 87.7 2.4e-16 >>XP_011529177 (OMIM: 300410) PREDICTED: angiomotin isof (1084 aa) initn: 7122 init1: 7122 opt: 7122 Z-score: 2723.7 bits: 515.7 E(85289): 5.7e-145 Smith-Waterman score: 7122; 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100.0% identity (100.0% similar) in 675 aa overlap (410-1084:1-675) 380 390 400 410 420 430 pF1KA1 QQQQQHHHHHHHQQQQQQQPQQQPGEAYSAMPRAQPSSASYQPVPADPFAIVSRAQQMVE :::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 MPRAQPSSASYQPVPADPFAIVSRAQQMVE 10 20 30 440 450 460 470 480 490 pF1KA1 ILSDENRNLRQELEGCYEKVARLQKVETEIQRVSEAYENLVKSSSKREALEKAMRNKLEG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 ILSDENRNLRQELEGCYEKVARLQKVETEIQRVSEAYENLVKSSSKREALEKAMRNKLEG 40 50 60 70 80 90 500 510 520 530 540 550 pF1KA1 EIRRMHDFNRDLRERLETANKQLAEKEYEGSEDTRKTISQLFAKNKESQREKEKLEAELA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 EIRRMHDFNRDLRERLETANKQLAEKEYEGSEDTRKTISQLFAKNKESQREKEKLEAELA 100 110 120 130 140 150 560 570 580 590 600 610 pF1KA1 TARSTNEDQRRHIEIRDQALSNAQAKVVKLEEELKKKQVYVDKVEKMQQALVQLQAACEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 TARSTNEDQRRHIEIRDQALSNAQAKVVKLEEELKKKQVYVDKVEKMQQALVQLQAACEK 160 170 180 190 200 210 620 630 640 650 660 670 pF1KA1 REQLEHRLRTRLERELESLRIQQRQGNCQPTNVSEYNAAALMELLREKEERILALEADMT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 REQLEHRLRTRLERELESLRIQQRQGNCQPTNVSEYNAAALMELLREKEERILALEADMT 220 230 240 250 260 270 680 690 700 710 720 730 pF1KA1 KWEQKYLEENVMRHFALDAAATVAAQRDTTVISHSPNTSYDTALEARIQKEEEEILMANK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 KWEQKYLEENVMRHFALDAAATVAAQRDTTVISHSPNTSYDTALEARIQKEEEEILMANK 280 290 300 310 320 330 740 750 760 770 780 790 pF1KA1 RCLDMEGRIKTLHAQIIEKDAMIKVLQQRSRKEPSKTEQLSCMRPAKSLMSISNAGSGLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 RCLDMEGRIKTLHAQIIEKDAMIKVLQQRSRKEPSKTEQLSCMRPAKSLMSISNAGSGLL 340 350 360 370 380 390 800 810 820 830 840 850 pF1KA1 SHSSTLTGSPIMEEKRDDKSWKGSLGILLGGDYRAEYVPSTPSPVPPSTPLLSAHSKTGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 SHSSTLTGSPIMEEKRDDKSWKGSLGILLGGDYRAEYVPSTPSPVPPSTPLLSAHSKTGS 400 410 420 430 440 450 860 870 880 890 900 910 pF1KA1 RDCSTQTERGTESNKTAAVAPISVPAPVAAAATAAAITATAATITTTMVAAAPVAVAAAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 RDCSTQTERGTESNKTAAVAPISVPAPVAAAATAAAITATAATITTTMVAAAPVAVAAAA 460 470 480 490 500 510 920 930 940 950 960 970 pF1KA1 APAAAAAPSPATAAATAAAVSPAAAGQIPAAASVASAAAVAPSAAAAAAVQVAPAAPAPV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 APAAAAAPSPATAAATAAAVSPAAAGQIPAAASVASAAAVAPSAAAAAAVQVAPAAPAPV 520 530 540 550 560 570 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KA1 PAPALVPVPAPAAAQASAPAQTQAPTSAPAVAPTPAPTPTPAVAQAEVPASPATGPGPHR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 PAPALVPVPAPAAAQASAPAQTQAPTSAPAVAPTPAPTPTPAVAQAEVPASPATGPGPHR 580 590 600 610 620 630 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KA1 LSIPSLTCNPDKTDGPVFHSNTLERKTPIQILGQEPDAEMVEYLI ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 LSIPSLTCNPDKTDGPVFHSNTLERKTPIQILGQEPDAEMVEYLI 640 650 660 670 >>NP_001287936 (OMIM: 614657) angiomotin-like protein 1 (906 aa) initn: 2374 init1: 862 opt: 1889 Z-score: 740.2 bits: 148.5 E(85289): 1.7e-34 Smith-Waterman score: 2643; 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NP_001 TEGRPTVNRANSGQAHKDEALKELKQGHVRSLSERIMQLSLERNGAKQHLPGSG------ 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KA1 QPNDLYKNPTSSSEFYKAQGPLPNQHSLKGMEHRGPPPEYPFKGMPPQSVVCKPQEPGHF ... : . :: : : . : .. :::::::::: .: : : :: : : NP_001 ----------NGKGFKVGGGPSPAQPAGKVLDPRGPPPEYPFKTKQMMSPVSKTQEHGLF 240 250 260 270 280 270 280 290 300 pF1KA1 YSE------HRL------NQPGRTEGQLMRYQHPPEYGA-ARPAQDISLPLSARNSQPHS :.. :.. :: ::. ..::: :::::. .:: : ::. . . : :: NP_001 YGDQHPGMLHEMVKPYPAPQPVRTDVAVLRYQPPPEYGVTSRPCQ---LPFPS-TMQQHS 290 300 310 320 330 310 320 330 340 350 360 pF1KA1 PTSSLTSGGSLPLLQSPPSTRLSPARHPLVPNQGDHSAHLPRPQQHFLPNQAHQGDHYRL : :: ::..: :: ::. :: : :: . : NP_001 PMSSQTSSASGPL----------------------HSVSLPLP----LP--------MAL 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KA1 SQPGLSQQQQQQQQQHHHHHHHQQQQQQQPQQQPGEAYSAMPRAQPSSASYQPVPADPFA . : :: : : :.:: : . : :: NP_001 GAP-------------------------QP---P-------PAASPS----QQLGPDAFA 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KA1 IVSRAQQMVEILSDENRNLRQELEGCYEKVARLQKVETEIQRVSEAYENLVKSSSKREAL :: :::::::::..::: :.:::.: :... .:.: : :.::.:::::.::::..:::.: NP_001 IVERAQQMVEILTEENRVLHQELQGYYDNADKLHKFEKELQRISEAYESLVKSTTKRESL 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 pF1KA1 EKAMRNKLEGEIRRMHDFNRDLRERLETANKQLAEKEYEGSEDTRKTISQLFAKNKESQR .:::::::::::::.::::::::.::::::.::. .:::: :: . . .. ..::: . 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