Result of FASTA (ccds) for pF1KA1079
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1079, 1454 aa
  1>>>pF1KA1079 1454 - 1454 aa - 1454 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6202+/-0.00105; mu= 8.5002+/- 0.063
 mean_var=246.4846+/-52.206, 0's: 0 Z-trim(111.0): 285  B-trim: 6 in 1/53
 Lambda= 0.081692
 statistics sampled from 11723 (12041) to 11723 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.699), E-opt: 0.2 (0.37), width:  16
 Scan time:  5.230

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5654.1 LMTK2 gene_id:22853|Hs108|chr7          (1503) 9621 1148.8       0
CCDS46136.1 LMTK3 gene_id:114783|Hs108|chr19       (1489) 1568 199.7 5.4e-50
CCDS45807.1 AATK gene_id:9625|Hs108|chr17          (1374) 1362 175.4   1e-42
CCDS58607.1 AATK gene_id:9625|Hs108|chr17          (1271) 1231 159.9 4.4e-38
CCDS4886.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6            ( 940)  543 78.7 9.1e-14
CCDS4887.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6            (1014)  543 78.7 9.6e-14
CCDS4885.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6            (1030)  543 78.7 9.7e-14
CCDS4884.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6            (1070)  543 78.7   1e-13
CCDS59021.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6           (1078)  543 78.7   1e-13
CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6            (2347)  525 77.0 7.6e-13
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19          (1370)  480 71.4   2e-11
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19          (1382)  480 71.4 2.1e-11
CCDS10078.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15           ( 803)  474 70.5 2.3e-11
CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15           ( 864)  474 70.5 2.4e-11
CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1           (1297)  477 71.0 2.5e-11
CCDS1241.1 DDR2 gene_id:4921|Hs108|chr1            ( 855)  459 68.7 8.2e-11
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15         (1366)  463 69.4 8.2e-11
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15         (1367)  463 69.4 8.2e-11


>>CCDS5654.1 LMTK2 gene_id:22853|Hs108|chr7               (1503 aa)
 initn: 9654 init1: 9621 opt: 9621  Z-score: 6140.3  bits: 1148.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9621; 99.7% identity (99.9% similar) in 1446 aa overlap (1-1446:1-1446)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MPGPPALRRRLLLLLLVLLIAGSAGAAPLPQTGAGEAPPAAEVSSSFVILCVCSLIILIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MPGPPALRRRLLLLLLVLLIAGSAGAAPLPQTGAGEAPPAAEVSSSFVILCVCSLIILIV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 LIANCVSCCKDPEIDFKEFEDNFDDEIDFTPPAEDTPSVQSPAEVFTLSVPNISLPAPSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LIANCVSCCKDPEIDFKEFEDNFDDEIDFTPPAEDTPSVQSPAEVFTLSVPNISLPAPSQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 FQPSVEGLKSQVARHSLNYIQEIGNGWFGKVLLGEIYTGTSVARVIVKELKASANPKEQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FQPSVEGLKSQVARHSLNYIQEIGNGWFGKVLLGEIYTGTSVARVIVKELKASANPKEQD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 TFLKNGEPYYILQHPNILQCVGQCVEAIPYLLVFEFCDLGDLKAYLRSEQEHMRGDSQTM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TFLKNGEPYYILQHPNILQCVGQCVEAIPYLLVFEFCDLGDLKAYLRSEQEHMRGDSQTM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 LLQRMACEVAAGLAAMHKLHFLHSDLALRNCFLTSDLNVKVGDYGIGFSRYKEDYIETDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LLQRMACEVAAGLAAMHKLHFLHSDLALRNCFLTSDLNVKVGDYGIGFSRYKEDYIETDD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 KKVFPLRWTAPELVTSFQDRLLTADQTKYSNIWSLGVTLWELFDNAAQPYSNLSNLDVLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KKVFPLRWTAPELVTSFQDRLLTADQTKYSNIWSLGVTLWELFDNAAQPYSNLSNLDVLN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 QVIRERDTKLPKPQLEQPYSDRWYEVLQFCWLSPEKRPAAEDVHRLLTYLRLQSQRDSEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QVIRERDTKLPKPQLEQPYSDRWYEVLQFCWLSPEKRPAAEDVHRLLTYLRLQSQRDSEV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 DFEQQWNALKPNTNSRDSSNNAAFPILDHFARDRLGREMEEVLTVTETSQGLSFEYVWEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DFEQQWNALKPNTNSRDSSNNAAFPILDHFARDRLGREMEEVLTVTETSQGLSFEYVWEA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 AKHDHFDERSRGHLDEGLSYTSIFYPVEVFESSLSDPGPGKQDDSGQDVPLRVPGVVPVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 AKHDHFDERSRGHLDEGLSYTSIFYPVEVFESSLSDPGPGKQDDSGQDVPLRVPGVVPVF
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 DAHNLSVGSDYYIQLEEKSGSNLELDYPPALLTTDMDNPERTGPELSQLTALRSVELEES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DAHNLSVGSDYYIQLEEKSGSNLELDYPPALLTTDMDNPERTGPELSQLTALRSVELEES
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 STDEDFFQSSTDPKDSSLPGDLHVTSGPESPFNNIFNDVDKSEDLPSHQKIFDLMELNGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 STDEDFFQSSTDPKDSSLPGDLHVTSGPESPFNNIFNDVDKSEDLPSHQKIFDLMELNGV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 QADFKPATLSSSLDNPKESVITGHFEKEKPRKIFDSEPLCLSDNLMHQDNFDPLNVQELS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QADFKPATLSSSLDNPKESVITGHFEKEKPRKIFDSEPLCLSDNLMHQDNFDPLNVQELS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 ENFLFLQEKNLLKGSLSSKEHINDLQTELKNAGFTEAMLETSCRNSLDTELQFAENKPGM
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS56 ENFLFLQEKNLLKGSLSSKEHINDLQTELKNAGFTEAMLETSCRNSLDTELQFAENKPGL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 SLLQENVSTKGDDTDVMLTGDTLSTSLQSSPEVQVPPTSFETEETPRRVPPDSLPTQGET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SLLQENVSTKGDDTDVMLTGDTLSTSLQSSPEVQVPPTSFETEETPRRVPPDSLPTQGET
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 QPTCLDVIVPEDCLHQDISPDAVTVPVEILSTDARTHSLDNRSQDSPGESEETLRLTESD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QPTCLDVIVPEDCLHQDISPDAVTVPVEILSTDARTHSLDNRSQDSPGESEETLRLTESD
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 SVLADDILASRVSVGSSLPELGQELHNKPFSEDHHSHRRLEKNLEAVETLNQLNSKDAAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SVLADDILASRVSVGSSLPELGQELHNKPFSEDHHSHRRLEKNLEAVETLNQLNSKDAAK
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA1 EAGLVSALSSDSTSQDSLLEDSLSAPFPASEPSLETPDSLESVDVHEALLDSLGSHTPQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EAGLVSALSSDSTSQDSLLEDSLSAPFPASEPSLETPDSLESVDVHEALLDSLGSHTPQK
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 LVPPDKPADSGYETENLESPEWTLHPAPEGTADSEPATTGDGGHSGLPPNPVIVISDAGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LVPPDKPADSGYETENLESPEWTLHPAPEGTADSEPATTGDGGHSGLPPNPVIVISDAGD
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA1 GHRGTEVTPETFTAGSQGSYRDSAYFSDNDSEPEKRSEEVPGTSPSALVLVQEQPLPEPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GHRGTEVTPETFTAGSQGSYRDSAYFSDNDSEPEKRSEEVPGTSPSALVLVQEQPLPEPV
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA1 LPEQSPAAQDSCLEARKSQPDESCLSALHNSSDLELRATPEPAQTGVPQQVHPTEDEASS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LPEQSPAAQDSCLEARKSQPDESCLSALHNSSDLELRATPEPAQTGVPQQVHPTEDEASS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA1 PWSVLNAELSSGDDFETQDDRPCTLASTGTNTNELLAYTNSALDKSLSSHSEGPKLKEPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PWSVLNAELSSGDDFETQDDRPCTLASTGTNTNELLAYTNSALDKSLSSHSEGPKLKEPD
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA1 IEGKYLGKLGVSGMLDLSEDGMDADEEDENSDDSDEDLRAFNLHSLSSESEDETEHPVPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IEGKYLGKLGVSGMLDLSEDGMDADEEDENSDDSDEDLRAFNLHSLSSESEDETEHPVPI
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA1 ILSNEDGRHLRSLLKPTAANAPDPLPEDWKKEKKAVTFFDDVTVYLFDQETPTKELGPCG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ILSNEDGRHLRSLLKPTAANAPDPLPEDWKKEKKAVTFFDDVTVYLFDQETPTKELGPCG
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA1 GEACGPDLSGPAPASGSPYLSRCINSESSTDEEGGGFEWDDDFSPDPFMSKTTSNLLSSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GEACGPDLSGPAPASGSPYLSRCINSESSTDEEGGGFEWDDDFSPDPFMSKTTSNLLSSK
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450                                                  
pF1KA1 PSLPSTLPAFPSHT                                              
       ::: ..                                                      
CCDS56 PSLQTSKYFSPPPPARSTEQSWPHSAPYSRFSISPANIASFSLTHLTDSDIEQGGSSEDG
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

>>CCDS46136.1 LMTK3 gene_id:114783|Hs108|chr19            (1489 aa)
 initn: 1588 init1: 668 opt: 1568  Z-score: 1011.0  bits: 199.7 E(32554): 5.4e-50
Smith-Waterman score: 1719; 30.5% identity (53.0% similar) in 1537 aa overlap (1-1448:30-1474)

                                            10        20        30 
pF1KA1                              MPGPPALRRRLLLLLLVLLIAGSAGAAPLPQ
                                    ::.: ::      .::. . :..  :.:   
CCDS46 MRQVLWLCNVCVTARETRHHLHLPAILDKMPAPGAL------ILLAAVSASGCLASPAHP
               10        20        30              40        50    

                40        50         60        70        80        
pF1KA1 TG--AGEAPPAAEVSSSFVILCVCS-LIILIVLIANCVSCCKDPEIDFKEFEDNFDDEI-
        :   :.:: :   .   :.:  :: :. .: :. .:. :::  .. :::::.   ..  
CCDS46 DGFALGRAPLAPPYA---VVLISCSGLLAFIFLLLTCL-CCKRGDVGFKEFENPEGEDCS
           60           70        80         90       100       110

         90       100       110       120       130         140    
pF1KA1 -DFTPPAEDTPSVQSPAEVFTLSVPNISLPAPSQFQPSVEGLKSQV--ARHSLNYIQEIG
        ..:::::.: : ::  .:. : . ..::: :.  :::   . . .  .:. :.:.::::
CCDS46 GEYTPPAEETSSSQSLPDVYILPLAEVSLPMPAP-QPSHSDMTTPLGLSRQHLSYLQEIG
              120       130       140        150       160         

          150       160       170       180       190       200    
pF1KA1 NGWFGKVLLGEIYTGTSVARVIVKELKASANPKEQDTFLKNGEPYYILQHPNILQCVGQC
       .::::::.::::..  . :.:.::::.:::.: ::  :.....::  :::::.:::.: :
CCDS46 SGWFGKVILGEIFSDYTPAQVVVKELRASAGPLEQRKFISEAQPYRSLQHPNVLQCLGLC
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          210       220       230       240             250        
pF1KA1 VEAIPYLLVFEFCDLGDLKAYLRSEQEHMRGDSQTM------LLQRMACEVAAGLAAMHK
       ::..:.::..:::.::::: :::. :.  .: :  .       ::::. :.: ::: .:.
CCDS46 VETLPFLLIMEFCQLGDLKRYLRA-QRPPEGLSPELPPRDLRTLQRMGLEIARGLAHLHS
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pF1KA1 LHFLHSDLALRNCFLTSDLNVKVGDYGIGFSRYKEDYIETDDKKVFPLRWTAPELVTSFQ
        ...:::::::::.:::::.:..::::.. : :::::  : ..  .::::.::::.  ..
CCDS46 HNYVHSDLALRNCLLTSDLTVRIGDYGLAHSNYKEDYYLTPERLWIPLRWAAPELLGELH
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pF1KA1 DRLLTADQTKYSNIWSLGVTLWELFDNAAQPYSNLSNLDVLNQVIRERDTKLPKPQLEQP
         ....::.. ::::::::::::::. .:::: .::. .::  :.:.. .:: .:.:. :
CCDS46 GTFMVVDQSRESNIWSLGVTLWELFEFGAQPYRHLSDEEVLAFVVRQQHVKLARPRLKLP
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pF1KA1 YSDRWYEVLQFCWLSPEKRPAAEDVHRLLTYL------RLQSQRDSEVDFEQQWNALKPN
       :.: ::..:: ::  : .::.: :..  ::::      :         :    :     .
CCDS46 YADYWYDILQSCWRPPAQRPSASDLQLQLTYLLSERPPRPPPPPPPPRDGPFPWPWPPAH
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pF1KA1 TNSRDSSNNAAFPILDHFARDRLGREMEEVLTVTETSQGLSFEYVWEAAKHDHFDERSRG
       .  : .. .. ::.:: :     : . ..::::::.:.::..: .:: :.        ::
CCDS46 SAPRPGTLSSPFPLLDGFP----GADPDDVLTVTESSRGLNLECLWEKAR--------RG
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pF1KA1 HLDEGLSYTSIFYPVEVFESSLSDPGPGKQDDSGQDVPLRVPGVVPVFDAHNLSVGSDYY
           : .      :.  .. . . :.:  . ..     : .:.:.::..:.. ::.:.::
CCDS46 AGRGGGA------PA--WQPASAPPAPHANPSNPFYEALSTPSVLPVISARSPSVSSEYY
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       :.:::. ::      :  :. .: :  .:   .:.  :  .     . :. ..  :    
CCDS46 IRLEEH-GSP-----PEPLFPNDWDPLDPGVPAPQAPQAPSEVPQLVSETWASPLFPAPR
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         : .::  :.. . ::  ::.   .     : .: :  .     . : .  .   .:. 
CCDS46 PFPAQSSASGSF-LLSGWDPEGRGAGETLAGDPAEVLGERGTAPWVEEEEEEEEGSSPGE
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pF1KA1 LSSSLDNPKESVITGHFEKEKPRKIFDSEPLCLSDNLMHQDNFDPLNVQELSENFLFLQE
        :::: .             . .   .  ::  .: .    .   :.  .  :.   :. 
CCDS46 DSSSLGGGPSRRGPLPCPLCSREGACSCLPLERGDAVAGWGGHPALGCPHPPEDDSSLRA
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pF1KA1 KNLLKGSLSS----------KEHINDLQ----TELKNAGFTEA--------MLETSCRNS
       .   .:::..           : .. :.     .  . :   :           ..   :
CCDS46 E---RGSLADLPMAPPASAPPEFLDPLMGAAAPQYPGRGPPPAPPPPPPPPRAPADPAAS
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pF1KA1 LDTELQFAENKPGMSLLQENVSTKGDDTDVMLTGDTLSTSLQSSPEVQVP-PTSFETEET
        :     :    :.:    . . .: .:.. .. .    .  .. :  :: : .      
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pF1KA1 PR--RVPPDS--LPTQGETQPTCLDVIVPEDCLHQDISPDAVTVPVEILSTDARTHSLDN
       :   : :::   ::  :  .   . : :  . : ...  :..   .   .. :: ..   
CCDS46 PGAPRPPPDPGPLPLPGPREKPTFVVQVSTEQLLMSLREDVTRNLLGEKGATAR-ETGPR
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       ..  .::. :..  :... .::..   :  .:.   : .. : :..    ...:      
CCDS46 KAGRGPGNREKVPGLNRDPTVLGNGKQAPSLSLPVNGVTVLENGDQRAPGIEEKAAENGA
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pF1KA1 ---PFSEDH-------HSHRRLEKNLEAVETLNQLNSKDAAKEAGLVSALSSDSTSQDSL
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       :.   ..  :      ..:   :..    .   ..:  .:.  .    :: :.  .  ..
CCDS46 LRFPRNTERPPETGPWRAPGPWEKTPESWGPAPTIGEPAPETSLE-RAPAPSAVVSSRNG
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        :.    : :::. ::   ::.:   . ..:  :  :     : :.: :.  :   :  .
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CCDS46 GGPGSGVDAKAGWVDN-TRPQPPPPPLPPPPEAQPRRLEPAPPRARPE-VAPEGEPGAPD
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       :     ..  :    .:: ...:      :.: . : :..          :   :.    
CCDS46 S-----RAGGD----TALSGDGD-----PPKPERKG-PEM----------PRLFLDLGPP
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pF1KA1 SGDDFETQDDRPCTLASTGTNTNELLAYTNSALDKSLSSHSEGPKLKEPDIEGKYLGKLG
       .:.. :    :              :.  . ::     .   ::  ..:  ::   :  :
CCDS46 QGNS-EQIKAR--------------LSRLSLALPPLTLTPFPGPGPRRPPWEGADAGAAG
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pF1KA1 VSGMLDLSEDGMDADEEDENSDDS-DEDLRAFNLHSLSSESEDETEHPVPIILSNEDG--
         .    .    . : :::. :.  ::.  : .  .           :::...:. :.  
CCDS46 GEAGGAGAPGPAEEDGEDEDEDEEEDEEAAAPGAAAGPRGPGRARAAPVPVVVSSADADA
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pF1KA1 -RHLRSLLK-PTAANAPDPLPEDWKKEKKAVTFFDDVTVYLFDQETPTKELGPCGGEACG
        : ::.::: : .:. :.    . ....: :.:  :::::::::::::.::.  .     
CCDS46 ARPLRGLLKSPRGADEPE--DSELERKRKMVSFHGDVTVYLFDQETPTNELSVQAPPEGD
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pF1KA1 PDLSGPAPASGSPYLSRCINSESSTDEE-GGGFEWDDDFS--PDPFMSKTTSNLLSSKPS
        : : :      :. .   ..  :.:   ::.::: .::   : :      : . : .:.
CCDS46 TDPSTPPAPPTPPHPATPGDGFPSNDSGFGGSFEWAEDFPLLPPPGPPLCFSRF-SVSPA
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pF1KA1 LPSTLPAFPSHT         
       : .  :               
CCDS46 LETPGPPARAPDARPAGPVEN
     1470      1480         

>>CCDS45807.1 AATK gene_id:9625|Hs108|chr17               (1374 aa)
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                                     .. : .:.:  ::.... :   .:. .:::
CCDS45             MSSSFFNPSFAFSSHFDPDGAPLSELSWPSSLAVVAVSFSGLFAVIVL
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CCDS45 MLACL-CCKKGGIGFKEFENAEGDEYA-ADLAQGSPATAAQNGPDVYVLPLTEVSLPMAK
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CCDS45 QPGRSVQLLKSTDVGRHSLLYLKEIGRGWFGKVFLGEVNSGISSAQVVVKELQASASVQE
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CCDS45 QMQFLEEVQPYRALKHSNLLQCLAQCAEVTPYLLVMEFCPLGDLKGYLRSCRVAESMAPD
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CCDS45 PRT--LQRMACEVACGVLHLHRNNFVHSDLALRNCLLTADLTVKIGDYGLAHCKYREDYF
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CCDS45 VTADQLWVPLRWIAPELVDEVHSNLLVVDQTKSGNVWSLGVTIWELFELGTQPYPQHSDQ
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       .::  ..::.. :::::::.   :::::::.:::::.::.::.::.:: ::.::  ..  
CCDS45 QVLAYTVREQQLKLPKPQLQLTLSDRWYEVMQFCWLQPEQRPTAEEVHLLLSYLCAKGAT
          350       360       370       380       390       400    

        420       430       440                      450       460 
pF1KA1 DSEVDFEQQWNALKPNTNSRDSSNNAA---------------FPILDHFARDRLGREMEE
       ..: .::..: .:.:. ..   . .::               ::.:..:: : .  . ..
CCDS45 EAEEEFERRWRSLRPGGGGVGPGPGAAGPMLGGVVELAAASSFPLLEQFAGDGFHADGDD
          410       420       430       440       450       460    

             470       480       490       500       510       520 
pF1KA1 VLTVTETSQGLSFEYVWEAAKHDHFDERSRGHLDEGLSYTSIFYPVEVFESSLSDPGPGK
       ::::::::.::.::: :::.         ::              .:.: ..::   ::.
CCDS45 VLTVTETSRGLNFEYKWEAG---------RG--------------AEAFPATLS---PGR
          470       480                              490           

                  530       540       550        560               
pF1KA1 ----QDDSGQD-VPLRVPGVVPVFDAHNLSVGSDYYIQLEEKS-GSNLELD------YPP
           :.  . : .:   ::::::..::. :.::.:.:.::: . ... . :       ::
CCDS45 TARLQELCAPDGAP---PGVVPVLSAHSPSLGSEYFIRLEEAAPAAGHDPDCAGCAPSPP
      500       510          520       530       540       550     

     570       580       590       600       610       620         
pF1KA1 ALLTTDMDNPERTGPELSQLTALRSVELEESSTDEDFFQSSTDPKDSSLPGDLHVTSGPE
       :  :.:.:. .  :   ..: :.. .  .   .:  . ...  :.  ::  :    :   
CCDS45 A--TADQDD-DSDGSTAASL-AMEPLLGHGPPVDVPWGRGDHYPR-RSLARDPLCPSRSP
           560        570        580       590        600       610

     630       640        650       660       670       680        
pF1KA1 SPFNNIFNDVDK-SEDLPSHQKIFDLMELNGVQADFKPATLSSSLDNPKESVITGHFEKE
       ::  . .. ..  .::        :     :: : : :: . . : .             
CCDS45 SPSAGPLSLAEGGAEDA-------DW----GVAA-FCPAFFEDPLGT-------------
              620                  630        640                  

      690       700       710       720       730       740        
pF1KA1 KPRKIFDSEPLCLSDNLMHQDNFDPLNVQELSENFLFLQEKNLLKGSLSSKEHINDLQTE
       .:     . :: :.     .:... ..... ..     . .. .... .:  .  .    
CCDS45 SPLGSSGAPPLPLTG----EDELEEVGARRAAQRG---HWRSNVSANNNSGSRCPESWDP
         650       660           670          680       690        

      750       760       770        780        790       800      
pF1KA1 LKNAGFTEAMLETSCRNSLDTELQFAE-NKPGMSLLQ-ENVSTKGDDTDVMLTGDTLSTS
       .. .: .:.     : .  .:     : . ::  ::  . .:..       :     . .
CCDS45 VSAGGHAEG-----CPSPKQTPRASPEPGYPGEPLLGLQAASAQEPGCCPGLPHLCSAQG
      700            710       720       730       740       750   

        810       820           830       840       850       860  
pF1KA1 LQSSPEVQVPPTSFETEET----PRRVPPDSLPTQGETQPTCLDVIVPEDCLHQDISPDA
       :  .: . : :.  ::  .    :.  :  .  ..: : :      ::        ::. 
CCDS45 LAPAPCL-VTPSWTETASSGGDHPQAEPKLATEAEGTTGPRLPLPSVP--------SPSQ
           760        770       780       790       800            

            870       880       890       900       910       920  
pF1KA1 VTVPVEILSTDARTHSLDNRSQDSPGESEETLRLTESDSVLADDILASRVSVGSSLPELG
         .:.   : .: . .  .   :::  .        . . ..   ::: .. .:: ::. 
CCDS45 EGAPLP--SEEASAPDAPDALPDSPTPA--------TGGEVSAIKLASALNGSSSSPEV-
          810         820       830               840       850    

            930       940       950       960       970       980  
pF1KA1 QELHNKPFSEDHHSHRRLEKNLEAVETLNQLNSKDAAKEAGLVSALSSDSTSQDSLLEDS
           . : :::       : . ::.              .:. .  :::. .      : 
CCDS45 ----EAPSSED-------EDTAEAT--------------SGIFTDTSSDGLQARR--PDV
               860                            870       880        

            990      1000      1010       1020         1030        
pF1KA1 LSAPFPASEPSLETPDSLESVDVHEALLDS-LGSHTPQKLVPPD-KPA--DSGYETENLE
       . : : . . .. :::::.:.:.  .  :.     .:.   :   .:   ::::.::: :
CCDS45 VPA-FRSLQKQVGTPDSLDSLDIPSSASDGGYEVFSPSATGPSGGQPRALDSGYDTENYE
         890       900       910       920       930       940     

     1040      1050      1060      1070      1080      1090        
pF1KA1 SPEWTLHPAPEGTADSEPATTGDGGHSGLPPNPVIVISDAGDGHRGTEVTPETFTAGSQG
       :::..:. : ::    :: . .. .  :  :.:   .: . .:   .: .:         
CCDS45 SPEFVLKEAQEGC---EPQAFAELASEGEGPGPETRLSTSLSGL--NEKNP---------
         950          960       970       980         990          

     1100      1110      1120      1130      1140      1150        
pF1KA1 SYRDSAYFSDNDSEPEKRSEEVPGTSPSALVLVQEQPLPEPVLPEQSPAAQDSCL-----
        ::::::::: ..: :  :      .:      .. : ::  ::  .  ... ::     
CCDS45 -YRDSAYFSDLEAEAEATS------GPEKKCGGDRAPGPELGLPSTGQPSEQVCLRPGVS
             1000            1010      1020      1030      1040    

           1160      1170       1180      1190      1200      1210 
pF1KA1 -EARKSQPDESCLSALHNSSDLELR-ATPEPAQTGVPQQVHPTEDEASSPWSVLNAELSS
        ::. : : :  :  :     :.:. ..:::.    :. . :   : ..: .:  .   :
CCDS45 GEAQGSGPGE-VLPPL-----LQLEGSSPEPSTC--PSGLVPEPPEPQGPAKVRPGPSPS
         1050            1060      1070        1080      1090      

            1220      1230      1240      1250      1260      1270 
pF1KA1 GDDFETQDDRPCTLASTGTNTNELLAYTNSALDKSLSSHSEGPKLKEPDIEGKYLGKLGV
        ..:      :  : : : :..:. .  .      ::. .   ..  :      : .:..
CCDS45 CSQFFLL--TPVPLRSEG-NSSEFQGPPGL-----LSGPAPQKRMGGPGTPRAPL-RLAL
       1100        1110       1120           1130      1140        

            1280       1290      1300      1310      1320          
pF1KA1 SGMLDLSEDGMDADEED-ENSDDSDEDLRAFNLHSLSSESEDETEHPVPIILS-NEDGRH
        :.    :   . .::: :.::.:::.:: ....  : .::.:.   ::.... ....:.
CCDS45 PGLPAALEGRPEEEEEDSEDSDESDEELRCYSVQEPSEDSEEEAP-AVPVVVAESQSARN
      1150      1160      1170      1180      1190       1200      

    1330       1340      1350      1360      1370       1380       
pF1KA1 LRSLLK-PTAANAPDPLPEDWKKEKKAVTFFDDVTVYLFDQETPTKELG-PCGGEACGPD
       :::::: :.  .  . . :: ...::::.:::::::::::::.::.::: :  :   .: 
CCDS45 LRSLLKMPSLLS--ETFCEDLERKKKAVSFFDDVTVYLFDQESPTRELGEPFPGAKESPP
       1210        1220      1230      1240      1250      1260    

        1390      1400        1410      1420      1430      1440   
pF1KA1 --LSGPAPASGSPYLSRCINS--ESSTDEEGGGFEWDDDFSPDPFMSKTTSNLLSSKPSL
         : :   . ..:   .  ..  ..:: :::::: :::::   :.:.  ..  ..  :. 
CCDS45 TFLRGSPGSPSAPNRPQQADGSPNGSTAEEGGGFAWDDDF---PLMTAKAAFAMALDPAA
         1270      1280      1290      1300         1310      1320 

          1450                                                
pF1KA1 PSTLPAFPSHT                                            
       :.  :: :. :                                            
CCDS45 PA--PAAPTPTPAPFSRFTVSPAPTSRFSITHVSDSDAESKRGPEAGAGGESKEA
              1330      1340      1350      1360      1370    

>>CCDS58607.1 AATK gene_id:9625|Hs108|chr17               (1271 aa)
 initn: 1848 init1: 1207 opt: 1231  Z-score: 797.2  bits: 159.9 E(32554): 4.4e-38
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             100       110       120         130        140        
pF1KA1 PAEDTPSVQSPAEVFTLSVPNISLPAPSQFQP--SVEGLKS-QVARHSLNYIQEIGNGWF
                                     ::  ::. ::: .:.:::: :..::: :::
CCDS58                            MAKQPGRSVQLLKSTDVGRHSLLYLKEIGRGWF
                                          10        20        30   

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pF1KA1 GKVLLGEIYTGTSVARVIVKELKASANPKEQDTFLKNGEPYYILQHPNILQCVGQCVEAI
       :::.:::. .: : :.:.::::.:::. .::  ::.. .::  :.: :.:::..::.:. 
CCDS58 GKVFLGEVNSGISSAQVVVKELQASASVQEQMQFLEEVQPYRALKHSNLLQCLAQCAEVT
            40        50        60        70        80        90   

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pF1KA1 PYLLVFEFCDLGDLKAYLRSEQ--EHMRGDSQTMLLQRMACEVAAGLAAMHKLHFLHSDL
       :::::.::: :::::.:::: .  : :  : .:  ::::::::: :.  .:. .:.::::
CCDS58 PYLLVMEFCPLGDLKGYLRSCRVAESMAPDPRT--LQRMACEVACGVLHLHRNNFVHSDL
           100       110       120         130       140       150 

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pF1KA1 ALRNCFLTSDLNVKVGDYGIGFSRYKEDYIETDDKKVFPLRWTAPELVTSFQDRLLTADQ
       :::::.::.::.::.::::..  .:.:::. : :.   :::: :::::   .. ::..::
CCDS58 ALRNCLLTADLTVKIGDYGLAHCKYREDYFVTADQLWVPLRWIAPELVDEVHSNLLVVDQ
             160       170       180       190       200       210 

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pF1KA1 TKYSNIWSLGVTLWELFDNAAQPYSNLSNLDVLNQVIRERDTKLPKPQLEQPYSDRWYEV
       :: .:.::::::.::::. ..::: . :. .::  ..::.. :::::::.   :::::::
CCDS58 TKSGNVWSLGVTIWELFELGTQPYPQHSDQQVLAYTVREQQLKLPKPQLQLTLSDRWYEV
             220       230       240       250       260       270 

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pF1KA1 LQFCWLSPEKRPAAEDVHRLLTYLRLQSQRDSEVDFEQQWNALKPNTNSRDSSNNAA---
       .:::::.::.::.::.:: ::.::  ..  ..: .::..: .:.:. ..   . .::   
CCDS58 MQFCWLQPEQRPTAEEVHLLLSYLCAKGATEAEEEFERRWRSLRPGGGGVGPGPGAAGPM
             280       290       300       310       320       330 

                       450       460       470       480       490 
pF1KA1 ------------FPILDHFARDRLGREMEEVLTVTETSQGLSFEYVWEAAKHDHFDERSR
                   ::.:..:: : .  . ..::::::::.::.::: :::.         :
CCDS58 LGGVVELAAASSFPLLEQFAGDGFHADGDDVLTVTETSRGLNFEYKWEAG---------R
             340       350       360       370       380           

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pF1KA1 GHLDEGLSYTSIFYPVEVFESSLSDPGPGK----QDDSGQD-VPLRVPGVVPVFDAHNLS
       :              .:.: ..::   ::.    :.  . : .:   ::::::..::. :
CCDS58 G--------------AEAFPATLS---PGRTARLQELCAPDGAP---PGVVPVLSAHSPS
                          390          400          410       420  

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pF1KA1 VGSDYYIQLEEKS-GSNLELD------YPPALLTTDMDNPERTGPELSQLTALRSVELEE
       .::.:.:.::: . ... . :       :::  :.:.:. .  :   ..: :.. .  . 
CCDS58 LGSEYFIRLEEAAPAAGHDPDCAGCAPSPPA--TADQDD-DSDGSTAASL-AMEPLLGHG
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pF1KA1 SSTDEDFFQSSTDPKDSSLPGDLHVTSGPESPFNNIFNDVDK-SEDLPSHQKIFDLMELN
         .:  . ...  :.  ::  :    :   ::  . .. ..  .::        :     
CCDS58 PPVDVPWGRGDHYPR-RSLARDPLCPSRSPSPSAGPLSLAEGGAEDA-------DW----
      480       490        500       510       520                 

      660       670       680       690       700       710        
pF1KA1 GVQADFKPATLSSSLDNPKESVITGHFEKEKPRKIFDSEPLCLSDNLMHQDNFDPLNVQE
       :: : : :: . . : .             .:     . :: :.     .:... .....
CCDS58 GVAA-FCPAFFEDPLGT-------------SPLGSSGAPPLPLTG----EDELEEVGARR
        530        540                    550           560        

      720       730       740       750       760       770        
pF1KA1 LSENFLFLQEKNLLKGSLSSKEHINDLQTELKNAGFTEAMLETSCRNSLDTELQFAE-NK
        ..   .   .. .... .:  .  .    .. .: .:.     : .  .:     : . 
CCDS58 AAQRGHW---RSNVSANNNSGSRCPESWDPVSAGGHAEG-----CPSPKQTPRASPEPGY
      570          580       590       600            610       620

       780        790       800       810       820           830  
pF1KA1 PGMSLLQ-ENVSTKGDDTDVMLTGDTLSTSLQSSPEVQVPPTSFETEET----PRRVPPD
       ::  ::  . .:..       :     . .:  .: . : :.  ::  .    :.  :  
CCDS58 PGEPLLGLQAASAQEPGCCPGLPHLCSAQGLAPAPCL-VTPSWTETASSGGDHPQAEPKL
              630       640       650        660       670         

            840       850       860       870       880       890  
pF1KA1 SLPTQGETQPTCLDVIVPEDCLHQDISPDAVTVPVEILSTDARTHSLDNRSQDSPGESEE
       .  ..: : :      ::        ::.   .:.   : .: . .  .   :::  .  
CCDS58 ATEAEGTTGPRLPLPSVP--------SPSQEGAPLP--SEEASAPDAPDALPDSPTPA--
     680       690               700         710       720         

            900       910       920       930       940       950  
pF1KA1 TLRLTESDSVLADDILASRVSVGSSLPELGQELHNKPFSEDHHSHRRLEKNLEAVETLNQ
             . . ..   ::: .. .:: ::.     . : :::       : . ::.     
CCDS58 ------TGGEVSAIKLASALNGSSSSPEV-----EAPSSED-------EDTAEAT-----
             730       740       750                   760         

            960       970       980       990      1000      1010  
pF1KA1 LNSKDAAKEAGLVSALSSDSTSQDSLLEDSLSAPFPASEPSLETPDSLESVDVHEALLDS
                .:. .  :::. .      : . : : . . .. :::::.:.:.  .  :.
CCDS58 ---------SGIFTDTSSDGLQARR--PDVVPA-FRSLQKQVGTPDSLDSLDIPSSASDG
                   770       780          790       800       810  

            1020         1030      1040      1050      1060        
pF1KA1 -LGSHTPQKLVPPD-KPA--DSGYETENLESPEWTLHPAPEGTADSEPATTGDGGHSGLP
            .:.   :   .:   ::::.::: ::::..:. : ::    :: . .. .  :  
CCDS58 GYEVFSPSATGPSGGQPRALDSGYDTENYESPEFVLKEAQEGC---EPQAFAELASEGEG
            820       830       840       850          860         

     1070      1080      1090      1100      1110      1120        
pF1KA1 PNPVIVISDAGDGHRGTEVTPETFTAGSQGSYRDSAYFSDNDSEPEKRSEEVPGTSPSAL
       :.:   .: . .:   .: .:          ::::::::: ..: :  :      .:   
CCDS58 PGPETRLSTSLSGL--NEKNP----------YRDSAYFSDLEAEAEATS------GPEKK
     870       880                   890       900             910 

     1130      1140      1150            1160      1170       1180 
pF1KA1 VLVQEQPLPEPVLPEQSPAAQDSCL------EARKSQPDESCLSALHNSSDLELR-ATPE
          .. : ::  ::  .  ... ::      ::. : : :  :  :     :.:. ..::
CCDS58 CGGDRAPGPELGLPSTGQPSEQVCLRPGVSGEAQGSGPGE-VLPPL-----LQLEGSSPE
             920       930       940       950             960     

            1190      1200      1210      1220      1230      1240 
pF1KA1 PAQTGVPQQVHPTEDEASSPWSVLNAELSSGDDFETQDDRPCTLASTGTNTNELLAYTNS
       :.    :. . :   : ..: .:  .   : ..:      :  : : : :..:. .  . 
CCDS58 PSTC--PSGLVPEPPEPQGPAKVRPGPSPSCSQFFLLT--PVPLRSEG-NSSEFQGPPG-
           970       980       990      1000         1010          

            1250      1260      1270      1280       1290      1300
pF1KA1 ALDKSLSSHSEGPKLKEPDIEGKYLGKLGVSGMLDLSEDGMDADEED-ENSDDSDEDLRA
            ::. .   ..  :      : .:.. :.    :   . .::: :.::.:::.:: 
CCDS58 ----LLSGPAPQKRMGGPGTPRAPL-RLALPGLPAALEGRPEEEEEDSEDSDESDEELRC
        1020      1030      1040       1050      1060      1070    

             1310      1320       1330       1340      1350        
pF1KA1 FNLHSLSSESEDETEHPVPIILS-NEDGRHLRSLLK-PTAANAPDPLPEDWKKEKKAVTF
       ....  : .::.:.   ::.... ....:.:::::: :.  .  . . :: ...::::.:
CCDS58 YSVQEPSEDSEEEAP-AVPVVVAESQSARNLRSLLKMPSLLS--ETFCEDLERKKKAVSF
         1080       1090      1100      1110        1120      1130 

     1360      1370       1380        1390      1400        1410   
pF1KA1 FDDVTVYLFDQETPTKELG-PCGGEACGPD--LSGPAPASGSPYLSRCINS--ESSTDEE
       ::::::::::::.::.::: :  :   .:   : :   . ..:   .  ..  ..:: ::
CCDS58 FDDVTVYLFDQESPTRELGEPFPGAKESPPTFLRGSPGSPSAPNRPQQADGSPNGSTAEE
            1140      1150      1160      1170      1180      1190 

          1420      1430      1440      1450                       
pF1KA1 GGGFEWDDDFSPDPFMSKTTSNLLSSKPSLPSTLPAFPSHT                   
       :::: :::::   :.:.  ..  ..  :. :.  :: :. :                   
CCDS58 GGGFAWDDDF---PLMTAKAAFAMALDPAAPA--PAAPTPTPAPFSRFTVSPAPTSRFSI
            1200         1210      1220        1230      1240      

CCDS58 THVSDSDAESKRGPEAGAGGESKEA
       1250      1260      1270 

>>CCDS4886.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6                 (940 aa)
 initn: 297 init1: 133 opt: 543  Z-score: 360.6  bits: 78.7 E(32554): 9.1e-14
Smith-Waterman score: 543; 29.6% identity (61.4% similar) in 389 aa overlap (28-403:555-927)

                  10        20        30          40         50    
pF1KA1    MPGPPALRRRLLLLLLVLLIAGSAGAAPLPQT--GAGEAPPAAEVSS-SFVILCVCS
                                     :.:.   : :  ::   ... .. .  . .
CCDS48 APEDSGRYTCIAGNSCNIKHTEAPLYVVDKPVPEESEGPGSPPPYKMIQTIGLSVGAAVA
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pF1KA1 LIILIV-LIANCVSCCKDPEIDFK-EFEDNFDDEIDFTPPAEDTPSVQSPAEVFTLSVPN
        :: .. :.  : . ::  ... . : :.   . ..  :  .  ::..   ::   :.  
CCDS48 YIIAVLGLMFYCKKRCKAKRLQKQPEGEEPEMECLNGGPLQNGQPSAEIQEEVALTSLG-
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pF1KA1 ISLPAPSQFQPSVEGLKSQVARHSLNYIQEIGNGWFGKVLLGE---IYTGTSVARVIVKE
        : :: .. . :.   : .  : ::. :  .:.. ::.:.:..   .  :.. . :.:: 
CCDS48 -SGPAATNKRHSTSD-KMHFPRSSLQPITTLGKSEFGEVFLAKAQGLEEGVAETLVLVKS
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pF1KA1 LKASANPKEQDTFLKNGEPYYILQHPNILQCVGQCVEAIPYLLVFEFCDLGDLKAYLR-S
       :. : . ..:  : .. : .  :.: :... .: : :: :. .:.:. :::::: .:: :
CCDS48 LQ-SKDEQQQLDFRRELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPHYMVLEYVDLGDLKQFLRIS
              710       720       730       740       750       760

      230       240          250       260       270       280     
pF1KA1 EQEHMRGDSQTMLL-QRMA-C-EVAAGLAAMHKLHFLHSDLALRNCFLTSDLNVKVGDYG
       ...  .  :: .   :..: : .:: :.  . . .:.:.::: :::..... .:::.  :
CCDS48 KSKDEKLKSQPLSTKQKVALCTQVALGMEHLSNNRFVHKDLAARNCLVSAQRQVKVSALG
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pF1KA1 IGFSRYKEDYIETDDKKVFPLRWTAPELVTSFQDRLLTADQTKYSNIWSLGVTLWELFDN
       .. . :. .: .  .  : :::: .:: .       : .: .  :..:..:: .::.: .
CCDS48 LSKDVYNSEYYHFRQAWV-PLRWMSPEAI-------LEGDFSTKSDVWAFGVLMWEVFTH
              830        840              850       860       870  

         350       360       370       380       390        400    
pF1KA1 AAQPYSNLSNLDVLNQVIRERDTKLPKPQLEQPYSDRWYEVLQFCW-LSPEKRPAAEDVH
       . .:... .. .:: . ..   ..::.:   .   .. :...: :: :::. ::.  .. 
CCDS48 GEMPHGGQADDEVLAD-LQAGKARLPQP---EGCPSKLYRLMQRCWALSPKDRPSFSEIA
            880        890          900       910       920        

          410       420       430       440       450       460    
pF1KA1 RLLTYLRLQSQRDSEVDFEQQWNALKPNTNSRDSSNNAAFPILDHFARDRLGREMEEVLT
                                                                   
CCDS48 SALGDSTVDSKP                                                
      930       940                                                

>>CCDS4887.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6                 (1014 aa)
 initn: 297 init1: 133 opt: 543  Z-score: 360.2  bits: 78.7 E(32554): 9.6e-14
Smith-Waterman score: 543; 29.6% identity (61.4% similar) in 389 aa overlap (28-403:629-1001)

                  10        20        30          40         50    
pF1KA1    MPGPPALRRRLLLLLLVLLIAGSAGAAPLPQT--GAGEAPPAAEVSS-SFVILCVCS
                                     :.:.   : :  ::   ... .. .  . .
CCDS48 ERTTVYQGHTALLQCEAQGDPKPLIQWKDKPVPEESEGPGSPPPYKMIQTIGLSVGAAVA
      600       610       620       630       640       650        

           60         70         80        90       100       110  
pF1KA1 LIILIV-LIANCVSCCKDPEIDFK-EFEDNFDDEIDFTPPAEDTPSVQSPAEVFTLSVPN
        :: .. :.  : . ::  ... . : :.   . ..  :  .  ::..   ::   :.  
CCDS48 YIIAVLGLMFYCKKRCKAKRLQKQPEGEEPEMECLNGGPLQNGQPSAEIQEEVALTSLG-
      660       670       680       690       700       710        

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pF1KA1 ISLPAPSQFQPSVEGLKSQVARHSLNYIQEIGNGWFGKVLLGE---IYTGTSVARVIVKE
        : :: .. . :.   : .  : ::. :  .:.. ::.:.:..   .  :.. . :.:: 
CCDS48 -SGPAATNKRHSTSD-KMHFPRSSLQPITTLGKSEFGEVFLAKAQGLEEGVAETLVLVKS
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     170       180       190       200       210       220         
pF1KA1 LKASANPKEQDTFLKNGEPYYILQHPNILQCVGQCVEAIPYLLVFEFCDLGDLKAYLR-S
       :. : . ..:  : .. : .  :.: :... .: : :: :. .:.:. :::::: .:: :
CCDS48 LQ-SKDEQQQLDFRRELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPHYMVLEYVDLGDLKQFLRIS
          780       790       800       810       820       830    

      230       240          250       260       270       280     
pF1KA1 EQEHMRGDSQTMLL-QRMA-C-EVAAGLAAMHKLHFLHSDLALRNCFLTSDLNVKVGDYG
       ...  .  :: .   :..: : .:: :.  . . .:.:.::: :::..... .:::.  :
CCDS48 KSKDEKLKSQPLSTKQKVALCTQVALGMEHLSNNRFVHKDLAARNCLVSAQRQVKVSALG
          840       850       860       870       880       890    

         290       300       310       320       330       340     
pF1KA1 IGFSRYKEDYIETDDKKVFPLRWTAPELVTSFQDRLLTADQTKYSNIWSLGVTLWELFDN
       .. . :. .: .  .  : :::: .:: .       : .: .  :..:..:: .::.: .
CCDS48 LSKDVYNSEYYHFRQAWV-PLRWMSPEAI-------LEGDFSTKSDVWAFGVLMWEVFTH
          900       910        920              930       940      

         350       360       370       380       390        400    
pF1KA1 AAQPYSNLSNLDVLNQVIRERDTKLPKPQLEQPYSDRWYEVLQFCW-LSPEKRPAAEDVH
       . .:... .. .:: . ..   ..::.:   .   .. :...: :: :::. ::.  .. 
CCDS48 GEMPHGGQADDEVLAD-LQAGKARLPQP---EGCPSKLYRLMQRCWALSPKDRPSFSEIA
        950       960        970          980       990      1000  

          410       420       430       440       450       460    
pF1KA1 RLLTYLRLQSQRDSEVDFEQQWNALKPNTNSRDSSNNAAFPILDHFARDRLGREMEEVLT
                                                                   
CCDS48 SALGDSTVDSKP                                                
           1010                                                    

>>CCDS4885.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6                 (1030 aa)
 initn: 297 init1: 133 opt: 543  Z-score: 360.1  bits: 78.7 E(32554): 9.7e-14
Smith-Waterman score: 543; 29.6% identity (61.4% similar) in 389 aa overlap (28-403:645-1017)

                  10        20        30          40         50    
pF1KA1    MPGPPALRRRLLLLLLVLLIAGSAGAAPLPQT--GAGEAPPAAEVSS-SFVILCVCS
                                     :.:.   : :  ::   ... .. .  . .
CCDS48 APEDSGRYTCIAGNSCNIKHTEAPLYVVDKPVPEESEGPGSPPPYKMIQTIGLSVGAAVA
          620       630       640       650       660       670    

           60         70         80        90       100       110  
pF1KA1 LIILIV-LIANCVSCCKDPEIDFK-EFEDNFDDEIDFTPPAEDTPSVQSPAEVFTLSVPN
        :: .. :.  : . ::  ... . : :.   . ..  :  .  ::..   ::   :.  
CCDS48 YIIAVLGLMFYCKKRCKAKRLQKQPEGEEPEMECLNGGPLQNGQPSAEIQEEVALTSLG-
          680       690       700       710       720       730    

            120       130       140       150          160         
pF1KA1 ISLPAPSQFQPSVEGLKSQVARHSLNYIQEIGNGWFGKVLLGE---IYTGTSVARVIVKE
        : :: .. . :.   : .  : ::. :  .:.. ::.:.:..   .  :.. . :.:: 
CCDS48 -SGPAATNKRHSTSD-KMHFPRSSLQPITTLGKSEFGEVFLAKAQGLEEGVAETLVLVKS
            740        750       760       770       780       790 

     170       180       190       200       210       220         
pF1KA1 LKASANPKEQDTFLKNGEPYYILQHPNILQCVGQCVEAIPYLLVFEFCDLGDLKAYLR-S
       :. : . ..:  : .. : .  :.: :... .: : :: :. .:.:. :::::: .:: :
CCDS48 LQ-SKDEQQQLDFRRELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPHYMVLEYVDLGDLKQFLRIS
              800       810       820       830       840       850

      230       240          250       260       270       280     
pF1KA1 EQEHMRGDSQTMLL-QRMA-C-EVAAGLAAMHKLHFLHSDLALRNCFLTSDLNVKVGDYG
       ...  .  :: .   :..: : .:: :.  . . .:.:.::: :::..... .:::.  :
CCDS48 KSKDEKLKSQPLSTKQKVALCTQVALGMEHLSNNRFVHKDLAARNCLVSAQRQVKVSALG
              860       870       880       890       900       910

         290       300       310       320       330       340     
pF1KA1 IGFSRYKEDYIETDDKKVFPLRWTAPELVTSFQDRLLTADQTKYSNIWSLGVTLWELFDN
       .. . :. .: .  .  : :::: .:: .       : .: .  :..:..:: .::.: .
CCDS48 LSKDVYNSEYYHFRQAWV-PLRWMSPEAI-------LEGDFSTKSDVWAFGVLMWEVFTH
              920        930              940       950       960  

         350       360       370       380       390        400    
pF1KA1 AAQPYSNLSNLDVLNQVIRERDTKLPKPQLEQPYSDRWYEVLQFCW-LSPEKRPAAEDVH
       . .:... .. .:: . ..   ..::.:   .   .. :...: :: :::. ::.  .. 
CCDS48 GEMPHGGQADDEVLAD-LQAGKARLPQP---EGCPSKLYRLMQRCWALSPKDRPSFSEIA
            970        980          990      1000      1010        

          410       420       430       440       450       460    
pF1KA1 RLLTYLRLQSQRDSEVDFEQQWNALKPNTNSRDSSNNAAFPILDHFARDRLGREMEEVLT
                                                                   
CCDS48 SALGDSTVDSKP                                                
     1020      1030                                                

>>CCDS4884.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6                 (1070 aa)
 initn: 297 init1: 133 opt: 543  Z-score: 359.9  bits: 78.7 E(32554): 1e-13
Smith-Waterman score: 543; 29.6% identity (61.4% similar) in 389 aa overlap (28-403:685-1057)

                  10        20        30          40         50    
pF1KA1    MPGPPALRRRLLLLLLVLLIAGSAGAAPLPQT--GAGEAPPAAEVSS-SFVILCVCS
                                     :.:.   : :  ::   ... .. .  . .
CCDS48 APEDSGRYTCIAGNSCNIKHTEAPLYVVDKPVPEESEGPGSPPPYKMIQTIGLSVGAAVA
          660       670       680       690       700       710    

           60         70         80        90       100       110  
pF1KA1 LIILIV-LIANCVSCCKDPEIDFK-EFEDNFDDEIDFTPPAEDTPSVQSPAEVFTLSVPN
        :: .. :.  : . ::  ... . : :.   . ..  :  .  ::..   ::   :.  
CCDS48 YIIAVLGLMFYCKKRCKAKRLQKQPEGEEPEMECLNGGPLQNGQPSAEIQEEVALTSLG-
          720       730       740       750       760       770    

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pF1KA1 ISLPAPSQFQPSVEGLKSQVARHSLNYIQEIGNGWFGKVLLGE---IYTGTSVARVIVKE
        : :: .. . :.   : .  : ::. :  .:.. ::.:.:..   .  :.. . :.:: 
CCDS48 -SGPAATNKRHSTSD-KMHFPRSSLQPITTLGKSEFGEVFLAKAQGLEEGVAETLVLVKS
            780        790       800       810       820       830 

     170       180       190       200       210       220         
pF1KA1 LKASANPKEQDTFLKNGEPYYILQHPNILQCVGQCVEAIPYLLVFEFCDLGDLKAYLR-S
       :. : . ..:  : .. : .  :.: :... .: : :: :. .:.:. :::::: .:: :
CCDS48 LQ-SKDEQQQLDFRRELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPHYMVLEYVDLGDLKQFLRIS
              840       850       860       870       880       890

      230       240          250       260       270       280     
pF1KA1 EQEHMRGDSQTMLL-QRMA-C-EVAAGLAAMHKLHFLHSDLALRNCFLTSDLNVKVGDYG
       ...  .  :: .   :..: : .:: :.  . . .:.:.::: :::..... .:::.  :
CCDS48 KSKDEKLKSQPLSTKQKVALCTQVALGMEHLSNNRFVHKDLAARNCLVSAQRQVKVSALG
              900       910       920       930       940       950

         290       300       310       320       330       340     
pF1KA1 IGFSRYKEDYIETDDKKVFPLRWTAPELVTSFQDRLLTADQTKYSNIWSLGVTLWELFDN
       .. . :. .: .  .  : :::: .:: .       : .: .  :..:..:: .::.: .
CCDS48 LSKDVYNSEYYHFRQAWV-PLRWMSPEAI-------LEGDFSTKSDVWAFGVLMWEVFTH
              960        970              980       990      1000  

         350       360       370       380       390        400    
pF1KA1 AAQPYSNLSNLDVLNQVIRERDTKLPKPQLEQPYSDRWYEVLQFCW-LSPEKRPAAEDVH
       . .:... .. .:: . ..   ..::.:   .   .. :...: :: :::. ::.  .. 
CCDS48 GEMPHGGQADDEVLAD-LQAGKARLPQP---EGCPSKLYRLMQRCWALSPKDRPSFSEIA
           1010       1020         1030      1040      1050        

          410       420       430       440       450       460    
pF1KA1 RLLTYLRLQSQRDSEVDFEQQWNALKPNTNSRDSSNNAAFPILDHFARDRLGREMEEVLT
                                                                   
CCDS48 SALGDSTVDSKP                                                
     1060      1070                                                

>>CCDS59021.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6                (1078 aa)
 initn: 261 init1: 133 opt: 543  Z-score: 359.9  bits: 78.7 E(32554): 1e-13
Smith-Waterman score: 543; 29.6% identity (61.4% similar) in 389 aa overlap (28-403:693-1065)

                  10        20        30          40         50    
pF1KA1    MPGPPALRRRLLLLLLVLLIAGSAGAAPLPQT--GAGEAPPAAEVSS-SFVILCVCS
                                     :.:.   : :  ::   ... .. .  . .
CCDS59 APEDSGRYTCIAGNSCNIKHTEAPLYVVDKPVPEESEGPGSPPPYKMIQTIGLSVGAAVA
            670       680       690       700       710       720  

           60         70         80        90       100       110  
pF1KA1 LIILIV-LIANCVSCCKDPEIDFK-EFEDNFDDEIDFTPPAEDTPSVQSPAEVFTLSVPN
        :: .. :.  : . ::  ... . : :.   . ..  :  .  ::..   ::   :.  
CCDS59 YIIAVLGLMFYCKKRCKAKRLQKQPEGEEPEMECLNGGPLQNGQPSAEIQEEVALTSLG-
            730       740       750       760       770       780  

            120       130       140       150          160         
pF1KA1 ISLPAPSQFQPSVEGLKSQVARHSLNYIQEIGNGWFGKVLLGE---IYTGTSVARVIVKE
        : :: .. . :.   : .  : ::. :  .:.. ::.:.:..   .  :.. . :.:: 
CCDS59 -SGPAATNKRHSTSD-KMHFPRSSLQPITTLGKSEFGEVFLAKAQGLEEGVAETLVLVKS
              790        800       810       820       830         

     170       180       190       200       210       220         
pF1KA1 LKASANPKEQDTFLKNGEPYYILQHPNILQCVGQCVEAIPYLLVFEFCDLGDLKAYLR-S
       :. : . ..:  : .. : .  :.: :... .: : :: :. .:.:. :::::: .:: :
CCDS59 LQ-SKDEQQQLDFRRELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPHYMVLEYVDLGDLKQFLRIS
     840        850       860       870       880       890        

      230       240          250       260       270       280     
pF1KA1 EQEHMRGDSQTMLL-QRMA-C-EVAAGLAAMHKLHFLHSDLALRNCFLTSDLNVKVGDYG
       ...  .  :: .   :..: : .:: :.  . . .:.:.::: :::..... .:::.  :
CCDS59 KSKDEKLKSQPLSTKQKVALCTQVALGMEHLSNNRFVHKDLAARNCLVSAQRQVKVSALG
      900       910       920       930       940       950        

         290       300       310       320       330       340     
pF1KA1 IGFSRYKEDYIETDDKKVFPLRWTAPELVTSFQDRLLTADQTKYSNIWSLGVTLWELFDN
       .. . :. .: .  .  : :::: .:: .       : .: .  :..:..:: .::.: .
CCDS59 LSKDVYNSEYYHFRQAWV-PLRWMSPEAI-------LEGDFSTKSDVWAFGVLMWEVFTH
      960       970        980              990      1000      1010

         350       360       370       380       390        400    
pF1KA1 AAQPYSNLSNLDVLNQVIRERDTKLPKPQLEQPYSDRWYEVLQFCW-LSPEKRPAAEDVH
       . .:... .. .:: . ..   ..::.:   .   .. :...: :: :::. ::.  .. 
CCDS59 GEMPHGGQADDEVLAD-LQAGKARLPQP---EGCPSKLYRLMQRCWALSPKDRPSFSEIA
             1020       1030         1040      1050      1060      

          410       420       430       440       450       460    
pF1KA1 RLLTYLRLQSQRDSEVDFEQQWNALKPNTNSRDSSNNAAFPILDHFARDRLGREMEEVLT
                                                                   
CCDS59 SALGDSTVDSKP                                                
       1070                                                        

>>CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6                 (2347 aa)
 initn: 174 init1: 174 opt: 525  Z-score: 344.1  bits: 77.0 E(32554): 7.6e-13
Smith-Waterman score: 535; 30.8% identity (60.5% similar) in 390 aa overlap (122-494:1931-2292)

             100       110       120       130       140       150 
pF1KA1 PAEDTPSVQSPAEVFTLSVPNISLPAPSQFQPSVEGLKSQVARHSLNYIQEIGNGWFGKV
                                     :  .:.: .   :..:.    .:.: ::.:
CCDS51 NEDKELAELRGLAAGVGLANACYAIHTLPTQEEIENLPA-FPREKLTLRLLLGSGAFGEV
             1910      1920      1930       1940      1950         

                 160       170       180       190       200       
pF1KA1 LLGE----IYTGTSVARVIVKELKASANPKEQDTFLKNGEPYYILQHPNILQCVGQCVEA
         :     . .:..  .: :: :: ... .:.  :::... .  ..:::::. .: :.  
CCDS51 YEGTAVDILGVGSGEIKVAVKTLKKGSTDQEKIEFLKEAHLMSKFNHPNILKQLGVCLLN
    1960      1970      1980      1990      2000      2010         

       210       220        230       240        250       260     
pF1KA1 IPYLLVFEFCDLGDLKAYLR-SEQEHMRGDSQTML-LQRMACEVAAGLAAMHKLHFLHSD
        :  ...:. . ::: .::: ...  . :   :.. :  .  ... : . ....::.: :
CCDS51 EPQYIILELMEGGDLLTYLRKARMATFYGPLLTLVDLVDLCVDISKGCVYLERMHFIHRD
    2020      2030      2040      2050      2060      2070         

         270            280       290       300       310       320
pF1KA1 LALRNCFL-----TSDLNVKVGDYGIGFSRYKEDYIETDDKKVFPLRWTAPELVTSFQDR
       :: :::..     ::   ::.::.:.. . ::.:: .   . ..:.:: :::   :..: 
CCDS51 LAARNCLVSVKDYTSPRIVKIGDFGLARDIYKNDYYRKRGEGLLPVRWMAPE---SLMDG
    2080      2090      2100      2110      2120      2130         

              330       340       350       360       370       380
pF1KA1 LLTADQTKYSNIWSLGVTLWELFDNAAQPYSNLSNLDVLNQVIRERDTKLPKPQLEQPYS
       ..:..    :..::.:. .::..  . :::   ::::::: :  .   .:  :. . : .
CCDS51 IFTTQ----SDVWSFGILIWEILTLGHQPYPAHSNLDVLNYV--QTGGRLEPPR-NCP-D
       2140          2150      2160      2170        2180          

              390        400       410       420       430         
pF1KA1 DRWYEVLQFCWLS-PEKRPAAEDVHRLLTYLRLQSQRDSEVDFEQQWNALKPNTNSRDSS
       : :  . : :: . :..::         :. :.:.: .   .:      :.   .::: .
CCDS51 DLWNLMTQ-CWAQEPDQRP---------TFHRIQDQLQLFRNFF-----LNSIYKSRDEA
     2190       2200               2210      2220           2230   

     440       450          460         470       480       490    
pF1KA1 NNAAFPILDHFAR---DRLGREMEEVLTVT--ETSQGLSFEYVWEAAKHDHFDERSRGHL
       ::..  : . :     : .  . .... :.  ::..  ...:.  :..  . .:.:.: :
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