FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1079, 1454 aa 1>>>pF1KA1079 1454 - 1454 aa - 1454 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7956+/-0.000479; mu= 2.1733+/- 0.029 mean_var=352.2270+/-76.535, 0's: 0 Z-trim(118.5): 666 B-trim: 1568 in 1/55 Lambda= 0.068338 statistics sampled from 30690 (31583) to 30690 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.703), E-opt: 0.2 (0.37), width: 16 Scan time: 18.300 The best scores are: opt bits E(85289) NP_055731 (OMIM: 610989) serine/threonine-protein (1503) 9621 964.6 0 XP_011514283 (OMIM: 610989) PREDICTED: serine/thre (1501) 9594 961.9 0 NP_001073864 (OMIM: 605276) serine/threonine-prote (1374) 1362 150.3 9.8e-35 XP_006722259 (OMIM: 605276) PREDICTED: serine/thre (1326) 1330 147.1 8.5e-34 XP_006722256 (OMIM: 605276) PREDICTED: serine/thre (1326) 1330 147.1 8.5e-34 XP_011523811 (OMIM: 605276) PREDICTED: serine/thre (1333) 1299 144.1 7.1e-33 XP_011523812 (OMIM: 605276) PREDICTED: serine/thre (1318) 1284 142.6 2e-32 XP_016880910 (OMIM: 605276) PREDICTED: serine/thre (1271) 1231 137.3 7.2e-31 NP_004911 (OMIM: 605276) serine/threonine-protein (1271) 1231 137.3 7.2e-31 XP_006722258 (OMIM: 605276) PREDICTED: serine/thre (1207) 1012 115.7 2.2e-24 XP_006722257 (OMIM: 605276) PREDICTED: serine/thre (1324) 947 109.4 2e-22 XP_016880911 (OMIM: 605276) PREDICTED: serine/thre (1152) 803 95.1 3.4e-18 XP_011523813 (OMIM: 605276) PREDICTED: serine/thre (1152) 803 95.1 3.4e-18 NP_690620 (OMIM: 601890) inactive tyrosine-protein ( 940) 543 69.4 1.5e-10 XP_011513068 (OMIM: 601890) PREDICTED: inactive ty ( 948) 543 69.4 1.6e-10 NP_690621 (OMIM: 601890) inactive tyrosine-protein (1014) 543 69.4 1.6e-10 NP_690619 (OMIM: 601890) inactive tyrosine-protein (1030) 543 69.4 1.6e-10 XP_011513067 (OMIM: 601890) PREDICTED: inactive ty (1038) 543 69.4 1.6e-10 NP_002812 (OMIM: 601890) inactive tyrosine-protein (1070) 543 69.4 1.7e-10 NP_001257327 (OMIM: 601890) inactive tyrosine-prot (1078) 543 69.4 1.7e-10 XP_011534355 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2299) 525 68.0 9.6e-10 XP_016866662 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2333) 525 68.0 9.7e-10 XP_016866661 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2334) 525 68.0 9.7e-10 XP_006715611 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2342) 525 68.0 9.7e-10 XP_011534354 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2343) 525 68.0 9.7e-10 NP_002935 (OMIM: 165020) proto-oncogene tyrosine-p (2347) 525 68.0 9.7e-10 XP_011534353 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2348) 525 68.0 9.7e-10 XP_011534352 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2356) 525 68.0 9.8e-10 XP_011534351 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2357) 525 68.0 9.8e-10 XP_011519859 (OMIM: 151520) PREDICTED: leukocyte t ( 824) 481 63.2 9.8e-09 XP_011519858 (OMIM: 151520) PREDICTED: leukocyte t ( 880) 481 63.2 1e-08 XP_016877670 (OMIM: 151520) PREDICTED: leukocyte t ( 885) 481 63.2 1e-08 XP_011526291 (OMIM: 147670,246200,262190,609968,61 (1369) 480 63.3 1.5e-08 NP_001073285 (OMIM: 147670,246200,262190,609968,61 (1370) 480 63.3 1.5e-08 XP_011526290 (OMIM: 147670,246200,262190,609968,61 (1381) 480 63.3 1.5e-08 NP_000199 (OMIM: 147670,246200,262190,609968,61054 (1382) 480 63.3 1.5e-08 NP_996844 (OMIM: 151520) leukocyte tyrosine kinase ( 803) 474 62.5 1.5e-08 XP_016877671 (OMIM: 151520) PREDICTED: leukocyte t ( 837) 474 62.5 1.6e-08 NP_002335 (OMIM: 151520) leukocyte tyrosine kinase ( 864) 474 62.5 1.6e-08 NP_055030 (OMIM: 147671) insulin receptor-related (1297) 477 63.0 1.7e-08 XP_011534356 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2200) 475 63.1 2.8e-08 XP_011519819 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu ( 922) 463 61.5 3.6e-08 XP_011519818 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu (1064) 463 61.5 4e-08 XP_016877628 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu (1246) 463 61.6 4.4e-08 XP_011507889 (OMIM: 191311,271665) PREDICTED: disc ( 855) 459 61.0 4.5e-08 NP_006173 (OMIM: 191311,271665) discoidin domain-c ( 855) 459 61.0 4.5e-08 XP_006711407 (OMIM: 191311,271665) PREDICTED: disc ( 855) 459 61.0 4.5e-08 XP_011507888 (OMIM: 191311,271665) PREDICTED: disc ( 855) 459 61.0 4.5e-08 NP_001014796 (OMIM: 191311,271665) discoidin domai ( 855) 459 61.0 4.5e-08 NP_001278787 (OMIM: 147370,270450) insulin-like gr (1366) 463 61.6 4.7e-08 >>NP_055731 (OMIM: 610989) serine/threonine-protein kina (1503 aa) initn: 9654 init1: 9621 opt: 9621 Z-score: 5144.8 bits: 964.6 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 9621; 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NP_055 PSLQTSKYFSPPPPARSTEQSWPHSAPYSRFSISPANIASFSLTHLTDSDIEQGGSSEDG 1450 1460 1470 1480 1490 1500 >>XP_011514283 (OMIM: 610989) PREDICTED: serine/threonin (1501 aa) initn: 9666 init1: 9435 opt: 9594 Z-score: 5130.4 bits: 961.9 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 9594; 99.6% identity (99.8% similar) in 1446 aa overlap (1-1446:1-1444) 10 20 30 40 50 60 pF1KA1 MPGPPALRRRLLLLLLVLLIAGSAGAAPLPQTGAGEAPPAAEVSSSFVILCVCSLIILIV ::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::: XP_011 MPGPPALRRRLLLLLLVLLIAGSAGAAPLPQTG--EAPPAAEVSSSFVILCVCSLIILIV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KA1 LIANCVSCCKDPEIDFKEFEDNFDDEIDFTPPAEDTPSVQSPAEVFTLSVPNISLPAPSQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 LIANCVSCCKDPEIDFKEFEDNFDDEIDFTPPAEDTPSVQSPAEVFTLSVPNISLPAPSQ 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KA1 FQPSVEGLKSQVARHSLNYIQEIGNGWFGKVLLGEIYTGTSVARVIVKELKASANPKEQD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 FQPSVEGLKSQVARHSLNYIQEIGNGWFGKVLLGEIYTGTSVARVIVKELKASANPKEQD 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KA1 TFLKNGEPYYILQHPNILQCVGQCVEAIPYLLVFEFCDLGDLKAYLRSEQEHMRGDSQTM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 TFLKNGEPYYILQHPNILQCVGQCVEAIPYLLVFEFCDLGDLKAYLRSEQEHMRGDSQTM 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KA1 LLQRMACEVAAGLAAMHKLHFLHSDLALRNCFLTSDLNVKVGDYGIGFSRYKEDYIETDD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 LLQRMACEVAAGLAAMHKLHFLHSDLALRNCFLTSDLNVKVGDYGIGFSRYKEDYIETDD 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KA1 KKVFPLRWTAPELVTSFQDRLLTADQTKYSNIWSLGVTLWELFDNAAQPYSNLSNLDVLN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 KKVFPLRWTAPELVTSFQDRLLTADQTKYSNIWSLGVTLWELFDNAAQPYSNLSNLDVLN 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KA1 QVIRERDTKLPKPQLEQPYSDRWYEVLQFCWLSPEKRPAAEDVHRLLTYLRLQSQRDSEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 QVIRERDTKLPKPQLEQPYSDRWYEVLQFCWLSPEKRPAAEDVHRLLTYLRLQSQRDSEV 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 pF1KA1 DFEQQWNALKPNTNSRDSSNNAAFPILDHFARDRLGREMEEVLTVTETSQGLSFEYVWEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 DFEQQWNALKPNTNSRDSSNNAAFPILDHFARDRLGREMEEVLTVTETSQGLSFEYVWEA 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 pF1KA1 AKHDHFDERSRGHLDEGLSYTSIFYPVEVFESSLSDPGPGKQDDSGQDVPLRVPGVVPVF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 AKHDHFDERSRGHLDEGLSYTSIFYPVEVFESSLSDPGPGKQDDSGQDVPLRVPGVVPVF 480 490 500 510 520 530 550 560 570 580 590 600 pF1KA1 DAHNLSVGSDYYIQLEEKSGSNLELDYPPALLTTDMDNPERTGPELSQLTALRSVELEES :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 DAHNLSVGSDYYIQLEEKSGSNLELDYPPALLTTDMDNPERTGPELSQLTALRSVELEES 540 550 560 570 580 590 610 620 630 640 650 660 pF1KA1 STDEDFFQSSTDPKDSSLPGDLHVTSGPESPFNNIFNDVDKSEDLPSHQKIFDLMELNGV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 STDEDFFQSSTDPKDSSLPGDLHVTSGPESPFNNIFNDVDKSEDLPSHQKIFDLMELNGV 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 pF1KA1 QADFKPATLSSSLDNPKESVITGHFEKEKPRKIFDSEPLCLSDNLMHQDNFDPLNVQELS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 QADFKPATLSSSLDNPKESVITGHFEKEKPRKIFDSEPLCLSDNLMHQDNFDPLNVQELS 660 670 680 690 700 710 730 740 750 760 770 780 pF1KA1 ENFLFLQEKNLLKGSLSSKEHINDLQTELKNAGFTEAMLETSCRNSLDTELQFAENKPGM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. 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XP_006 C--PSGLVPEPPEPQGPAKVRPGPSPSCSQFFLLT--PVPLRSEG-NSSEFQGPPGL--- 1030 1040 1050 1060 1070 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KA1 KSLSSHSEGPKLKEPDIEGKYLGKLGVSGMLDLSEDGMDADEED-ENSDDSDEDLRAFNL ::. . .. : : .:.. :. : . .::: :.::.:::.:: ... 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XP_011 FELGTQPYPQHSDQQVLAYTVREQQLKLPKPQLQLTLSDRWYEVMQFCWLQPEQRPTAEE 280 290 300 310 320 330 410 420 430 440 pF1KA1 VHRLLTYLRLQSQRDSEVDFEQQWNALKPNTNSRDSSNNAA---------------FPIL :: ::.:: .. ..: .::..: .:.:. .. . .:: ::.: XP_011 VHLLLSYLCAKGATEAEEEFERRWRSLRPGGGGVGPGPGAAGPMLGGVVELAAASSFPLL 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 pF1KA1 DHFARDRLGREMEEVLTVTETSQGLSFEYVWEAAKHDHFDERSRGHLDEGLSYTSIFYPV ..:: : . . ..::::::::.::.::: :::. :: . XP_011 EQFAGDGFHADGDDVLTVTETSRGLNFEYKWEAG---------RG--------------A 400 410 420 430 510 520 530 540 550 560 pF1KA1 EVFESSLSDPGPGK----QDDSGQD-VPLRVPGVVPVFDAHNLSVGSDYYIQLEEKS-GS :.: ..:: ::. :. . : .: ::::::..::. :.::.:.:.::: . .. XP_011 EAFPATLS---PGRTARLQELCAPDGAP---PGVVPVLSAHSPSLGSEYFIRLEEAAPAA 440 450 460 470 480 570 580 590 600 610 pF1KA1 NLELD------YPPALLTTDMDNPERTGPELSQLTALRSVELEESSTDEDFFQSSTDPKD . . : ::: :.:.:. . : ..: :.. . . .: . ... :. XP_011 GHDPDCAGCAPSPPA--TADQDD-DSDGSTAASL-AMEPLLGHGPPVDVPWGRGDHYPR- 490 500 510 520 530 540 620 630 640 650 660 670 pF1KA1 SSLPGDLHVTSGPESPFNNIFNDVDK-SEDLPSHQKIFDLMELNGVQADFKPATLSSSLD :: : : :: . .. .. .:: : :: : : :: . . : XP_011 RSLARDPLCPSRSPSPSAGPLSLAEGGAEDA-------DW----GVAA-FCPAFFEDPLG 550 560 570 580 680 690 700 710 720 730 pF1KA1 NPKESVITGHFEKEKPRKIFDSEPLCLSDNLMHQDNFDPLNVQELSENFLFLQEKNLLKG . .: . :: :. .:... ..... .. . .. ... XP_011 T-------------SPLGSSGAPPLPLTG----EDELEEVGARRAAQRG---HWRSNVSA 590 600 610 620 740 750 760 770 780 790 pF1KA1 SLSSKEHINDLQTELKNAGFTEAMLETSCRNSLDTELQFAE-NKPGMSLLQ-ENVSTKGD . .: . . .. .: .:. : . .: : . :: :: . .:.. 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