Result of FASTA (omim) for
pF1KA1080
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1080, 613 aa
1>>>pF1KA1080 613 - 613 aa - 613 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0847+/-0.00033; mu= 6.8272+/- 0.021
mean_var=167.4309+/-33.188, 0's: 0 Z-trim(121.2): 88 B-trim: 327 in 1/60
Lambda= 0.099119
statistics sampled from 37298 (37419) to 37298 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.772), E-opt: 0.2 (0.439), width: 16
Scan time: 9.800
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055859 (OMIM: 606005) ADP-ribosylation factor-b ( 613) 4116 600.7 4.7e-171
XP_016878563 (OMIM: 606005) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 576) 3880 567.0 6.4e-161
XP_016878564 (OMIM: 606005) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 526) 3532 517.2 5.7e-146
NP_037497 (OMIM: 606004) ADP-ribosylation factor-b ( 639) 1242 189.8 2.5e-47
XP_016884249 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 639) 1242 189.8 2.5e-47
NP_001166158 (OMIM: 606004) ADP-ribosylation facto ( 635) 1239 189.3 3.4e-47
XP_005261575 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 631) 1229 187.9 9e-47
NP_619525 (OMIM: 606006) ADP-ribosylation factor-b ( 723) 1184 181.5 8.7e-45
XP_011522865 (OMIM: 606006) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 730) 1184 181.5 8.8e-45
XP_016879874 (OMIM: 606006) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 733) 1184 181.5 8.8e-45
NP_001001560 (OMIM: 606004) ADP-ribosylation facto ( 552) 1106 170.3 1.6e-41
XP_016884251 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 552) 1106 170.3 1.6e-41
XP_011528425 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 648) 1013 157.0 1.8e-37
XP_011528424 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 656) 1013 157.0 1.9e-37
XP_005261574 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 656) 1013 157.0 1.9e-37
XP_006724292 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 566) 985 153.0 2.6e-36
XP_016884250 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 566) 985 153.0 2.6e-36
XP_005261577 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 566) 985 153.0 2.6e-36
NP_001166159 (OMIM: 606004) ADP-ribosylation facto ( 566) 985 153.0 2.6e-36
NP_001278570 (OMIM: 606006) ADP-ribosylation facto ( 651) 912 142.6 4.1e-33
NP_001166174 (OMIM: 606006) ADP-ribosylation facto ( 651) 912 142.6 4.1e-33
XP_016879876 (OMIM: 606006) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 661) 912 142.6 4.1e-33
XP_016879877 (OMIM: 606006) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 661) 912 142.6 4.1e-33
XP_016879878 (OMIM: 606006) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 661) 912 142.6 4.1e-33
XP_011528426 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 569) 877 137.5 1.2e-31
XP_016884253 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 479) 849 133.5 1.6e-30
NP_054720 (OMIM: 606006) ADP-ribosylation factor-b ( 690) 763 121.3 1.1e-26
XP_016879875 (OMIM: 606006) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 700) 763 121.3 1.1e-26
NP_001166175 (OMIM: 606006) ADP-ribosylation facto ( 592) 675 108.7 6e-23
NP_001278571 (OMIM: 606006) ADP-ribosylation facto ( 601) 675 108.7 6.1e-23
XP_016879879 (OMIM: 606006) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 611) 675 108.7 6.2e-23
XP_016884254 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 389) 581 95.1 4.8e-19
XP_005261579 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 389) 581 95.1 4.8e-19
XP_016884252 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 502) 581 95.2 5.9e-19
XP_016879880 (OMIM: 606006) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 534) 456 77.3 1.5e-13
XP_016879881 (OMIM: 606006) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 534) 456 77.3 1.5e-13
XP_005256520 (OMIM: 615519) PREDICTED: TOM1-like p ( 487) 393 68.3 7.1e-11
NP_001076437 (OMIM: 615519) TOM1-like protein 2 is ( 507) 393 68.3 7.4e-11
XP_005256518 (OMIM: 615519) PREDICTED: TOM1-like p ( 536) 393 68.3 7.7e-11
NP_005479 (OMIM: 604700) target of Myb protein 1 i ( 492) 320 57.8 1e-07
NP_001129204 (OMIM: 604700) target of Myb protein ( 493) 320 57.8 1e-07
NP_001275715 (OMIM: 615519) TOM1-like protein 2 is ( 483) 295 54.3 1.2e-06
NP_001119 (OMIM: 603533) AP-1 complex subunit gamm ( 822) 280 52.3 7.9e-06
NP_001025178 (OMIM: 603533) AP-1 complex subunit g ( 825) 280 52.3 7.9e-06
NP_001129201 (OMIM: 604700) target of Myb protein ( 460) 268 50.4 1.6e-05
XP_011535585 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 807) 262 49.7 4.7e-05
NP_001308102 (OMIM: 604701) TOM1-like protein 1 is ( 346) 244 46.9 0.00014
NP_005477 (OMIM: 604701) TOM1-like protein 1 isofo ( 476) 244 47.0 0.00018
XP_016877237 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 404) 242 46.6 0.00019
XP_016877236 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 404) 242 46.6 0.00019
>>NP_055859 (OMIM: 606005) ADP-ribosylation factor-bindi (613 aa)
initn: 4116 init1: 4116 opt: 4116 Z-score: 3192.0 bits: 600.7 E(85289): 4.7e-171
Smith-Waterman score: 4116; 99.8% identity (99.8% similar) in 613 aa overlap (1-613:1-613)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAATAVAAAVAGTESAQGPPGPAASLELWLNKATDPSMSEQDWSAIQNFCEQVNTDPNGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MAATAVAAAVAGTESAQGPPGPAASLELWLNKATDPSMSEQDWSAIQNFCEQVNTDPNGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 THAPWLLAHKIQSPQEKEALYALTVLEMCMNHCGEKFHSEVAKFRFLNELIKVLSPKYLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 THAPWLLAHKIQSPQEKEALYALTVLEMCMNHCGEKFHSEVAKFRFLNELIKVLSPKYLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 SWATGKVKGRVIEILFSWTVWFPEDIKIRDAYQMLKKQGIIKQDPKLPVDKILPPPSPWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SWATGKVKGRVIEILFSWTVWFPEDIKIRDAYQMLKKQGIIKQDPKLPVDKILPPPSPWP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 KSSIFDADEEKSKLLTRLLKSNHPEDLQAANRLIKNLVKEEQEKSEKVSKRVSAVEEVRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KSSIFDADEEKSKLLTRLLKSNHPEDLQAANRLIKNLVKEEQEKSEKVSKRVSAVEEVRS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 HVKVLQEMLSMYRRPGQAPPDQEALQVVYERCEKLRPTLFRLASDTTDDDDALAEILQAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HVKVLQEMLSMYRRPGQAPPDQEALQVVYERCEKLRPTLFRLASDTTDDDDALAEILQAN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DLLTQGVLLYKQVMEGRVTFGNRVTSSLGDIPVSRVFQNPAGCMKTCPLIDLEVDNGPAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DLLTQGVLLYKQVMEGRVTFGNRVTSSLGDIPVSRVFQNPAGCMKTCPLIDLEVDNGPAQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 MGTVVPSLLHQDLAALGISDAPVTGMVSGQNCCEEKRNPSSSTLPGGGVQNPSADRNLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MGTVVPSLLHQDLAALGISDAPVTGMVSGQNCCEEKRNPSSSTLPGGGVQNPSADRNLLD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LLSPQPAPCPLNYVSQKSVPKEVPPGTKSSPGWSWEAGPLAPSPSSQNTPLAQVFVPLES
::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LLSAQPAPCPLNYVSQKSVPKEVPPGTKSSPGWSWEAGPLAPSPSSQNTPLAQVFVPLES
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 VKPSSLPPLIVYDRNGFRILLHFSQTGAPGHPEVQVLLLTMMSTAPQPVWDIMFQVAVPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VKPSSLPPLIVYDRNGFRILLHFSQTGAPGHPEVQVLLLTMMSTAPQPVWDIMFQVAVPK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SMRVKLQPASSSKLPAFSPLMPPAVISQMLLLDNPHKEPIRLRYKLTFNQGGQPFSEVGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SMRVKLQPASSSKLPAFSPLMPPAVISQMLLLDNPHKEPIRLRYKLTFNQGGQPFSEVGE
550 560 570 580 590 600
610
pF1KA1 VKDFPDLAVLGAA
:::::::::::::
NP_055 VKDFPDLAVLGAA
610
>>XP_016878563 (OMIM: 606005) PREDICTED: ADP-ribosylatio (576 aa)
initn: 3880 init1: 3880 opt: 3880 Z-score: 3010.0 bits: 567.0 E(85289): 6.4e-161
Smith-Waterman score: 3880; 99.8% identity (99.8% similar) in 576 aa overlap (38-613:1-576)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 AAVAGTESAQGPPGPAASLELWLNKATDPSMSEQDWSAIQNFCEQVNTDPNGPTHAPWLL
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSEQDWSAIQNFCEQVNTDPNGPTHAPWLL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 AHKIQSPQEKEALYALTVLEMCMNHCGEKFHSEVAKFRFLNELIKVLSPKYLGSWATGKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AHKIQSPQEKEALYALTVLEMCMNHCGEKFHSEVAKFRFLNELIKVLSPKYLGSWATGKV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 KGRVIEILFSWTVWFPEDIKIRDAYQMLKKQGIIKQDPKLPVDKILPPPSPWPKSSIFDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KGRVIEILFSWTVWFPEDIKIRDAYQMLKKQGIIKQDPKLPVDKILPPPSPWPKSSIFDA
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 DEEKSKLLTRLLKSNHPEDLQAANRLIKNLVKEEQEKSEKVSKRVSAVEEVRSHVKVLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DEEKSKLLTRLLKSNHPEDLQAANRLIKNLVKEEQEKSEKVSKRVSAVEEVRSHVKVLQE
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 MLSMYRRPGQAPPDQEALQVVYERCEKLRPTLFRLASDTTDDDDALAEILQANDLLTQGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MLSMYRRPGQAPPDQEALQVVYERCEKLRPTLFRLASDTTDDDDALAEILQANDLLTQGV
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LLYKQVMEGRVTFGNRVTSSLGDIPVSRVFQNPAGCMKTCPLIDLEVDNGPAQMGTVVPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLYKQVMEGRVTFGNRVTSSLGDIPVSRVFQNPAGCMKTCPLIDLEVDNGPAQMGTVVPS
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LLHQDLAALGISDAPVTGMVSGQNCCEEKRNPSSSTLPGGGVQNPSADRNLLDLLSPQPA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
XP_016 LLHQDLAALGISDAPVTGMVSGQNCCEEKRNPSSSTLPGGGVQNPSADRNLLDLLSAQPA
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 PCPLNYVSQKSVPKEVPPGTKSSPGWSWEAGPLAPSPSSQNTPLAQVFVPLESVKPSSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PCPLNYVSQKSVPKEVPPGTKSSPGWSWEAGPLAPSPSSQNTPLAQVFVPLESVKPSSLP
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 PLIVYDRNGFRILLHFSQTGAPGHPEVQVLLLTMMSTAPQPVWDIMFQVAVPKSMRVKLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PLIVYDRNGFRILLHFSQTGAPGHPEVQVLLLTMMSTAPQPVWDIMFQVAVPKSMRVKLQ
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 PASSSKLPAFSPLMPPAVISQMLLLDNPHKEPIRLRYKLTFNQGGQPFSEVGEVKDFPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PASSSKLPAFSPLMPPAVISQMLLLDNPHKEPIRLRYKLTFNQGGQPFSEVGEVKDFPDL
520 530 540 550 560 570
610
pF1KA1 AVLGAA
::::::
XP_016 AVLGAA
>>XP_016878564 (OMIM: 606005) PREDICTED: ADP-ribosylatio (526 aa)
initn: 3532 init1: 3532 opt: 3532 Z-score: 2741.6 bits: 517.2 E(85289): 5.7e-146
Smith-Waterman score: 3532; 99.8% identity (99.8% similar) in 526 aa overlap (88-613:1-526)
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 NGPTHAPWLLAHKIQSPQEKEALYALTVLEMCMNHCGEKFHSEVAKFRFLNELIKVLSPK
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MCMNHCGEKFHSEVAKFRFLNELIKVLSPK
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 YLGSWATGKVKGRVIEILFSWTVWFPEDIKIRDAYQMLKKQGIIKQDPKLPVDKILPPPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YLGSWATGKVKGRVIEILFSWTVWFPEDIKIRDAYQMLKKQGIIKQDPKLPVDKILPPPS
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 PWPKSSIFDADEEKSKLLTRLLKSNHPEDLQAANRLIKNLVKEEQEKSEKVSKRVSAVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PWPKSSIFDADEEKSKLLTRLLKSNHPEDLQAANRLIKNLVKEEQEKSEKVSKRVSAVEE
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 VRSHVKVLQEMLSMYRRPGQAPPDQEALQVVYERCEKLRPTLFRLASDTTDDDDALAEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VRSHVKVLQEMLSMYRRPGQAPPDQEALQVVYERCEKLRPTLFRLASDTTDDDDALAEIL
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 QANDLLTQGVLLYKQVMEGRVTFGNRVTSSLGDIPVSRVFQNPAGCMKTCPLIDLEVDNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QANDLLTQGVLLYKQVMEGRVTFGNRVTSSLGDIPVSRVFQNPAGCMKTCPLIDLEVDNG
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 PAQMGTVVPSLLHQDLAALGISDAPVTGMVSGQNCCEEKRNPSSSTLPGGGVQNPSADRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PAQMGTVVPSLLHQDLAALGISDAPVTGMVSGQNCCEEKRNPSSSTLPGGGVQNPSADRN
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 LLDLLSPQPAPCPLNYVSQKSVPKEVPPGTKSSPGWSWEAGPLAPSPSSQNTPLAQVFVP
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLDLLSAQPAPCPLNYVSQKSVPKEVPPGTKSSPGWSWEAGPLAPSPSSQNTPLAQVFVP
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 LESVKPSSLPPLIVYDRNGFRILLHFSQTGAPGHPEVQVLLLTMMSTAPQPVWDIMFQVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LESVKPSSLPPLIVYDRNGFRILLHFSQTGAPGHPEVQVLLLTMMSTAPQPVWDIMFQVA
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 VPKSMRVKLQPASSSKLPAFSPLMPPAVISQMLLLDNPHKEPIRLRYKLTFNQGGQPFSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VPKSMRVKLQPASSSKLPAFSPLMPPAVISQMLLLDNPHKEPIRLRYKLTFNQGGQPFSE
460 470 480 490 500 510
600 610
pF1KA1 VGEVKDFPDLAVLGAA
::::::::::::::::
XP_016 VGEVKDFPDLAVLGAA
520
>>NP_037497 (OMIM: 606004) ADP-ribosylation factor-bindi (639 aa)
initn: 1570 init1: 932 opt: 1242 Z-score: 970.6 bits: 189.8 E(85289): 2.5e-47
Smith-Waterman score: 1760; 47.8% identity (73.3% similar) in 630 aa overlap (19-601:3-627)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAATAVAAAVAGTESAQGPPGPAASLELWLNKATDPSMSEQDWSAIQNFCEQVNTDPNGP
: .:: .:.::.: .: ::..:..::::.: : .::
NP_037 MEPAMEPETLEARINRATNPLNKELDWASINGFCEQLNEDFEGP
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 THAPWLLAHKIQSPQEKEALYALTVLEMCMNHCGEKFHSEVAKFRFLNELIKVLSPKYLG
: ::::::::::: ::. :::::: ::. ::..::.::.:::::::::::.::::::
NP_037 PLATRLLAHKIQSPQEWEAIQALTVLETCMKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYLG
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 SWATGKVKGRVIEILFSWTVWFPEDIKIRDAYQMLKKQGIIKQDPKLPVDKILPPPSPWP
: .. :::....:.:.:::: .::..:: .::::::::::.:.::::: : .: : : :
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NP_001 KNVIFE-DEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNN
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NP_001 NPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPETWGSL
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pF1KA1 KSSIFDADEEKSKLLTRLLKSNHPEDLQAANRLIKNLVKEEQEKSEKVSKRVSAVEEVRS
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XP_005 KNVIFE-DEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNN
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pF1KA1 HVKVLQEMLSMYRRPGQAPPDQEAL-QVVYERCEKLRPTLFRLASDTTDDDDALAEILQA
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XP_005 NVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALAEILQA
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pF1KA1 NDLLTQGVLLYKQVMEGRVTFGNRVTSSL-GD----IPVSRVFQNPAGCMKTCPLIDLEV
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XP_005 NDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDATAGSIPGSTSALLDLSGLDLPPAGT--TYPAMPTRP
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pF1KA1 DN--GPAQMGTVVPSLLHQDLAALGISD-APVTGMV---SGQNCCE--------------
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XP_005 GEQASPEQPSASV-SLLDDELMSLGLSDPTPPSGPSLDGTGWNSFQSSDATEPPAPALAQ
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pF1KA1 VPPGTKSSPGWSWEA-----GPLAPSPSSQNTP----LAQVFVPLESVKPSSLPPLIVYD
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XP_005 NKSSSCSSPSSSATSLLHTVSPEPPRPPQQPVPTELSLASITVPLESIKPSNILPVTVYD
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pF1KA1 RNGFRILLHFSQTGAPGHPEVQVLLLTMMSTAPQPVWDIMFQVAVPKSMRVKLQPASSSK
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XP_005 QHGFRILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRNIVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTE
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XP_005 LPAFNPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPETWGSL
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>>NP_619525 (OMIM: 606006) ADP-ribosylation factor-bindi (723 aa)
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NP_619 MAEAEGESLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGP
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pF1KA1 THAPWLLAHKIQSPQEKEALYALTVLEMCMNHCGEKFHSEVAKFRFLNELIKVLSPKYLG
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NP_619 QIAVRLLAHKIQSPQEWEALQALTVLEACMKNCGRRFHNEVGKFRFLNELIKVVSPKYLG
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pF1KA1 SWATGKVKGRVIEILFSWTVWFPEDIKIRDAYQMLKKQGIIKQDPKLPVDKIL-PPPSPW
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NP_619 DRVSEKVKTKVIELLYSWTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPPR
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pF1KA1 PKSSIFDADEEKSKLLTRLLKSNHPEDLQAANRLIKNLVKEEQEKSEKVSKRVSAVEEVR
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NP_619 PKNPVFD-DEEKSKLLAKLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVN
170 180 190 200 210 220
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pF1KA1 SHVKVLQEMLSMYRRPGQAPPDQEALQVVYERCEKLRPTLFRLASDTTDDDDALAEILQA
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NP_619 NNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRELMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQA
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pF1KA1 NDLLTQGVLLYKQVMEGRVTFGNRVTSSLGDIPVSRVFQNPAGCMKTCPLIDL-EVD---
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NP_619 SDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLTLPDS------EGNSQCSNQGTLIDLAELDTTN
290 300 310 320 330
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pF1KA1 --------------------------NGPAQM-------GTVVPS-------LLHQDLAA
.:: . .:. :: : ..:
NP_619 SLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDEELLC
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pF1KA1 LGISD-AP-VTGMVS-----------------------GQNCCE-------EKRNPSSST
::..: :: : : : : . ::::.
NP_619 LGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAPSSSS
400 410 420 430 440 450
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pF1KA1 ----LPG--------GGVQNPSADRNLLDL-----LSPQPAPC-P--------------L
:: ..: ::: .:.. :.:. : : :
NP_619 SQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNSALHHL
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pF1KA1 NYVSQ-------------KSVPKEVPPGTKSSPGWSWEAGPLAP-----SPSSQNTP---
. ..: .. .: : . : . .:: .: : .::..:
NP_619 DALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPKG
520 530 540 550 560 570
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::.. :::::.:::: :. .::.::::::.::.. ::.:.: :..
NP_619 PELSLASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTAP
580 590 600 610 620 630
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pF1KA1 QPVWDIMFQVAVPKSMRVKLQPASSSKLPAFSPLMPPAVISQMLLLDNPHKEPIRLRYKL
NP_619 LPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYKL
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>--
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490 500 510 520 530 540
pF1KA1 LIVYDRNGFRILLHFSQTGAPGHPEVQVLLLTMMSTAPQPVWDIMFQVAVPKSMRVKLQP
..:..::: :: .:..:.::::::.:::::
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550 560 570 580 590 600
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:...: :::..:::.:.:..:: :: :: .:::::::: : : .::::: .:: .
NP_619 PSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYKLTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVE
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610
pF1KA1 VLGAA
:
NP_619 QWGNL
720
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::: ::::::.:: ..:: : .::.:.: . .::
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: ::::::::::: ::: :::::: ::..::..::.::.:::::::::::.::::::
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. .. ::: .:::.:.:::. .::. ::.:::.:::.:::...:: .:::. : : : :
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::. .:: ::::::::..::::..:.::: ::.:::..:::.. . .::.::. ..:::
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..:..:.::: : . .. :.: .. ....::. : :::.:::.: :.:..:..::::
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.: :.. . :: ..::.: :. .: .: : .. . : . :::: :.:
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.:: . .:. :: : ..:
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380 390 400
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::..: :: : : : : . ::::.
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:: ..: ::: .:.. :.:. : : :
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440 450 460 470
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. ..: .. .: : . : . .:: .: : .::..:
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::.. :::::.:::: :. .::.::::::.::.. ::.:.: :..
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pF1KA1 LIVYDRNGFRILLHFSQTGAPGHPEVQVLLLTMMSTAPQPVWDIMFQVAVPKSMRVKLQP
..:..::: :: .:..:.::::::.:::::
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:...: :::..:::.:.:..:: :: :. .
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pF1KA1 VLGAA
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720 730
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10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAATAVAAAVAGTESAQGPPGPAASLELWLNKATDPSMSEQDWSAIQNFCEQVNTDPNGP
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XP_016 DRVSEKVKTKVIELLYSWTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPPR
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pF1KA1 PKSSIFDADEEKSKLLTRLLKSNHPEDLQAANRLIKNLVKEEQEKSEKVSKRVSAVEEVR
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XP_016 PKNPVFD-DEEKSKLLAKLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVN
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pF1KA1 SHVKVLQEMLSMYRRPGQAPPDQEALQVVYERCEKLRPTLFRLASDTTDDDDALAEILQA
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XP_016 NNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRELMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQA
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pF1KA1 NDLLTQGVLLYKQVMEGRVTFGNRVTSSLGDIPVSRVFQNPAGCMKTCPLIDL-EVD---
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XP_016 SDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLTLPDS------EGNSQCSNQGTLIDLAELDTTN
290 300 310 320 330
360 370
pF1KA1 --------------------------NGPAQM-------GTVVPS-------LLHQDLAA
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XP_016 SLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDEELLC
340 350 360 370 380 390
380 390 400
pF1KA1 LGISD-AP-VTGMVS-----------------------GQNCCE-------EKRNPSSST
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XP_016 LGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAPSSSS
400 410 420 430 440 450
410 420 430
pF1KA1 ----LPG--------GGVQNPSADRNLLDL-----LSPQPAPC-P--------------L
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XP_016 SQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNSALHHL
460 470 480 490 500 510
440 450 460 470
pF1KA1 NYVSQ-------------KSVPKEVPPGTKSSPGWSWEAGPLAP-----SPSSQNTP---
. ..: .. .: : . : . .:: .: : .::..:
XP_016 DALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPKG
520 530 540 550 560 570
480 490 500 510 520
pF1KA1 ----LAQVFVPLESVKPSSLPPLIVYDRNGFRILLHFSQTGAPGHPEVQVLLLTMMSTAP
::.. :::::.:::: :. .::.::::::.::.. ::.:.: :..
XP_016 PELSLASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTAP
580 590 600 610 620 630
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 QPVWDIMFQVAVPKSMRVKLQPASSSKLPAFSPLMPPAVISQMLLLDNPHKEPIRLRYKL
XP_016 LPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKVSSKEPRGP
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initn: 250 init1: 224 opt: 238 Z-score: 193.9 bits: 46.2 E(85289): 0.00046
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pF1KA1 LIVYDRNGFRILLHFSQTGAPGHPEVQVLLLTMMSTAPQPVWDIMFQVAVPKSMRVKLQP
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XP_016 VTAYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQP
600 610 620 630 640 650
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 ASSSKLPAFSPLMPPAVISQMLLLDNPHKEPIRLRYKLTFNQGGQPFSEVGEVKDFPDLA
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XP_016 PSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKVSSKEPRGPSLRPQLPQIRTSGPPPPSWKCF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]