FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1081, 992 aa 1>>>pF1KA1081 992 - 992 aa - 992 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1307+/-0.0015; mu= -0.7984+/- 0.089 mean_var=562.9540+/-118.823, 0's: 0 Z-trim(109.9): 217 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.054055 statistics sampled from 11016 (11200) to 11016 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.344), width: 16 Scan time: 3.230 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS53732.1 ERC1 gene_id:23085|Hs108|chr12 (1088) 6077 490.3 8.8e-138 CCDS46851.1 ERC2 gene_id:26059|Hs108|chr3 ( 957) 3779 311.0 7.2e-84 CCDS76504.1 ERC1 gene_id:23085|Hs108|chr12 (1086) 3122 259.9 2.1e-68 CCDS8508.1 ERC1 gene_id:23085|Hs108|chr12 (1116) 3122 259.9 2.1e-68 >>CCDS53732.1 ERC1 gene_id:23085|Hs108|chr12 (1088 aa) initn: 4720 init1: 4720 opt: 6077 Z-score: 2587.1 bits: 490.3 E(32554): 8.8e-138 Smith-Waterman score: 6077; 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