Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1082
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1082, 1761 aa
1>>>pF1KA1082 1761 - 1761 aa - 1761 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1780+/-0.00099; mu= 11.3085+/- 0.059
mean_var=153.1347+/-30.089, 0's: 0 Z-trim(110.0): 23 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.103642
statistics sampled from 11234 (11253) to 11234 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.682), E-opt: 0.2 (0.346), width: 16
Scan time: 6.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34242.1 KDM3B gene_id:51780|Hs108|chr5 (1761) 11765 1772.3 0
CCDS1990.1 KDM3A gene_id:55818|Hs108|chr2 (1321) 2173 338.0 1.4e-91
CCDS60538.1 JMJD1C gene_id:221037|Hs108|chr10 (2358) 1781 279.5 1e-73
CCDS41532.1 JMJD1C gene_id:221037|Hs108|chr10 (2540) 1781 279.5 1.1e-73
>>CCDS34242.1 KDM3B gene_id:51780|Hs108|chr5 (1761 aa)
initn: 11765 init1: 11765 opt: 11765 Z-score: 9507.0 bits: 1772.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11765; 99.9% identity (100.0% similar) in 1761 aa overlap (1-1761:1-1761)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MADAAASPVGKRLLLLFADTAASASASAPAAAAASGDPGPALRTRAWRAGTVRAMSGAVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MADAAASPVGKRLLLLFADTAASASASAPAAAAASGDPGPALRTRAWRAGTVRAMSGAVP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 QDLAIFVEFDGCNWKQHSWVKVHAEEVIVLLLEGSLVWAPREDPVLLQGIRVSIAQWPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QDLAIFVEFDGCNWKQHSWVKVHAEEVIVLLLEGSLVWAPREDPVLLQGIRVSIAQWPAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 TFTPLVDKLGLGSVVPVEYLLDRELRFLSDANGLHLFQMGTDSQNQILLEHAALRETVNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TFTPLVDKLGLGSVVPVEYLLDRELRFLSDANGLHLFQMGTDSQNQILLEHAALRETVNA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LISDQKLQEIFSRGPYSVQGHRVKIYQPEGEEGWLYGVVSHQDSITRLMEVSVTESGEIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LISDQKLQEIFSRGPYSVQGHRVKIYQPEGEEGWLYGVVSHQDSITRLMEVSVTESGEIK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 SVDPRLIHVMLMDNSTPQSEGGTLKAVKSSKGKKKRESIEGKDGRRRKSASDSGCDPASK
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SVDPRLIHVMLMDNSAPQSEGGTLKAVKSSKGKKKRESIEGKDGRRRKSASDSGCDPASK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 KLKGDRGEVDSNGSDGGEASRGPWKGGNASGEPGLDQRAKQPPSTFVPQINRNIRFATYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KLKGDRGEVDSNGSDGGEASRGPWKGGNASGEPGLDQRAKQPPSTFVPQINRNIRFATYT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 KENGRTLVVQDEPVGGDTPASFTPYSTATGQTPLAPEVGGAENKEAGKTLEQVGQGIVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KENGRTLVVQDEPVGGDTPASFTPYSTATGQTPLAPEVGGAENKEAGKTLEQVGQGIVAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 AAVVTTASSTPNTVRISDTGLAAGTVPEKQKGSRSQASGENSRNSILASSGFGAPLPSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AAVVTTASSTPNTVRISDTGLAAGTVPEKQKGSRSQASGENSRNSILASSGFGAPLPSSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 QPLTFGSGRSQSNGVLATENKPLGFSFGCSSAQEAQKDTDLSKNLFFQCMSQTLPTSNYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QPLTFGSGRSQSNGVLATENKPLGFSFGCSSAQEAQKDTDLSKNLFFQCMSQTLPTSNYF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 TTVSESLADDSSSRDSFKQSLESLSSGLCKGRSVLGTDTKPGSKAGSSVDRKVPAESMPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TTVSESLADDSSSRDSFKQSLESLSSGLCKGRSVLGTDTKPGSKAGSSVDRKVPAESMPT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 LTPAFPRSLLNARTPENHENLFLQPPKLSREEPSNPFLAFVEKVEHSPFSSFASQASGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LTPAFPRSLLNARTPENHENLFLQPPKLSREEPSNPFLAFVEKVEHSPFSSFASQASGSS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 SSATTVTSKVAPSWPESHSSADSASLAKKKPLFITTDSSKLVSGVLGSALTSGGPSLSAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SSATTVTSKVAPSWPESHSSADSASLAKKKPLFITTDSSKLVSGVLGSALTSGGPSLSAM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 GNGRSSSPTSSLTQPIEMPTLSSSPTEERPTVGPGQQDNPLLKTFSNVFGRHSGGFLSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GNGRSSSPTSSLTQPIEMPTLSSSPTEERPTVGPGQQDNPLLKTFSNVFGRHSGGFLSSP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 ADFSQENKAPFEAVKRFSLDERSLACRQDSDSSTNSDLSDLSDSEEQLQAKTGLKGIPEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ADFSQENKAPFEAVKRFSLDERSLACRQDSDSSTNSDLSDLSDSEEQLQAKTGLKGIPEH
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 LMGKLGPNGERSAELLLGKSKGKQAPKGRPRTAPLKVGQSVLKDVSKVKKLKQSGEPFLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LMGKLGPNGERSAELLLGKSKGKQAPKGRPRTAPLKVGQSVLKDVSKVKKLKQSGEPFLQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 DGSCINVAPHLHKCRECRLERYRKFKEQEQDDSTVACRFFHFRRLIFTRKGVLRVEGFLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DGSCINVAPHLHKCRECRLERYRKFKEQEQDDSTVACRFFHFRRLIFTRKGVLRVEGFLS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 PQQSDPDAMNLWIPSSSLAEGIDLETSKYILANVGDQFCQLVMSEKEAMMMVEPHQKVAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PQQSDPDAMNLWIPSSSLAEGIDLETSKYILANVGDQFCQLVMSEKEAMMMVEPHQKVAW
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 KRAVRGVREMCDVCETTLFNIHWVCRKCGFGVCLDCYRLRKSRPRSETEEMGDEEVFSWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KRAVRGVREMCDVCETTLFNIHWVCRKCGFGVCLDCYRLRKSRPRSETEEMGDEEVFSWL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 KCAKGQSHEPENLMPTQIIPGTALYNIGDMVHAARGKWGIKANCPCISRQNKSVLRPAVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KCAKGQSHEPENLMPTQIIPGTALYNIGDMVHAARGKWGIKANCPCISRQNKSVLRPAVT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 NGMSQLPSINPSASSGNETTFSGGGGPAPVTTPEPDHVPKADSTDIRSEEPLKTDSSASN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NGMSQLPSINPSASSGNETTFSGGGGPAPVTTPEPDHVPKADSTDIRSEEPLKTDSSASN
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 SNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKESHSPFGLDSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKESHSPFGLDSF
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 NSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGIPFPPVFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGIPFPPVFS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 TSSAGVKSKASLPNFLDHIIASVVENKKTSDASKRACNLTDTQKEVKEMVMGLNVLDPHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TSSAGVKSKASLPNFLDHIIASVVENKKTSDASKRACNLTDTQKEVKEMVMGLNVLDPHT
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 SHSWLCDGRLLCLHDPSNKNNWKIFRECWKQGQPVLVSGVHKKLKSELWKPEAFSQEFGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SHSWLCDGRLLCLHDPSNKNNWKIFRECWKQGQPVLVSGVHKKLKSELWKPEAFSQEFGD
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 QDVDLVNCRNCAIISDVKVRDFWDGFEIICKRLRSEDGQPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QDVDLVNCRNCAIISDVKVRDFWDGFEIICKRLRSEDGQPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPT
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 RFEDLMENLPLPEYTKRDGRLNLASRLPSYFVRPDLGPKMYNAYGLITAEDRRVGTTNLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RFEDLMENLPLPEYTKRDGRLNLASRLPSYFVRPDLGPKMYNAYGLITAEDRRVGTTNLH
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 LDVSDAVNVMVYVGIPIGEGAHDEEVLKTIDEGDADEVTKQRIHDGKEKPGALWHIYAAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LDVSDAVNVMVYVGIPIGEGAHDEEVLKTIDEGDADEVTKQRIHDGKEKPGALWHIYAAK
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA1 DAEKIRELLRKVGEEQGQENPPDHDPIHDQSWYLDQTLRKRLYEEYGVQGWAIVQFLGDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DAEKIRELLRKVGEEQGQENPPDHDPIHDQSWYLDQTLRKRLYEEYGVQGWAIVQFLGDA
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA1 VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFRLTQEFRHLSNTHTNHEDKLQVKNII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFRLTQEFRHLSNTHTNHEDKLQVKNII
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760
pF1KA1 YHAVKDAVGTLKAHESKLARS
:::::::::::::::::::::
CCDS34 YHAVKDAVGTLKAHESKLARS
1750 1760
>>CCDS1990.1 KDM3A gene_id:55818|Hs108|chr2 (1321 aa)
initn: 3606 init1: 1649 opt: 2173 Z-score: 1757.6 bits: 338.0 E(32554): 1.4e-91
Smith-Waterman score: 3530; 59.6% identity (79.8% similar) in 890 aa overlap (871-1760:505-1320)
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 LMGKLGPNGERSAELLLGKSKGKQAPKGRPRTAPLKVGQSVLKDVSKVKKLKQSGEPFLQ
..:: . .::: : .:.:::.:::: :.:
CCDS19 SALACRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSR--KSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQ
480 490 500 510 520 530
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 DGSCINVAPHLHKCRECRLERYRKFKEQEQDDSTVACRFFHFRRLIFTRKGVLRVEGFLS
: ::.:.. .: :::::::. :: ::: : :: : ::::::::: :...:::::::::.
CCDS19 DDSCVNIVAQLPKCRECRLDSLRKDKEQ-QKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLT
540 550 560 570 580 590
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 PQQSDPDAMNLWIPSSSLAEGIDLETSKYILANVGDQFCQLVMSEKEAMMMVEPHQKVAW
:.. : .:..::.: .. . ::::.:.::::::.::.:::.:.:::::: .:::..:::
CCDS19 PNKYDNEAIGLWLPLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAW
600 610 620 630 640 650
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 KRAVRGVREMCDVCETTLFNIHWVCRKCGFGVCLDCYRLRKSRPRSETEEMGDEEVFSWL
::::.:::::::::.::.::.:::: .::::::.::::.. :.. .. . ..::::
CCDS19 KRAVKGVREMCDVCDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMK----RKNCQQGAAYKTFSWL
660 670 680 690 700
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 KCAKGQSHEPENLMPTQIIPGTALYNIGDMVHAARGKWGIKANCPCISRQNKSVLRPAVT
::.:.: :::::::::::::: :::..::.::..:.:::::::::: .:: : .::
CCDS19 KCVKSQIHEPENLMPTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPASK
710 720 730 740 750 760
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 NGMSQLPSINPSASSGNETTFSGGGGPAPVTTPEPDHVPKADSTDIRSEEPLKTDSSASN
. ..: .. .:.. :... : .:. . :: . . :..
CCDS19 EDLKQ------TSLAGEKPTLGA------VLQQNPSVL-----------EPAAVGGEAAS
770 780 790 800
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 SNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKESHSPFGLDSF
. . ...: :: .. : :.:::::.. ....:.:: .:..: . : .
CCDS19 KPA--GSMKPACPASTSP---LNWLADLTSGNVNKENKEKQPTMPILKNEIKC---LPPL
810 820 830 840 850
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 NSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGIPFPPVFS
.: : . . ::: .: :...:: .. ::.::.:. ::
CCDS19 PPLSKSSTVL-HTFNSTILTPVSNNN---SGFLRNLLNSSTGK-----------------
860 870 880 890
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 TSSAGVKSKASLPNFLDHIIASVVENKKTSDASKRACNLTDTQKEVKEMVMGLNVLDPHT
. :.:. :..:: :.::.:.:: ::: ::: .:: .: ..:.. :
CCDS19 -TENGLKNT---PKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGLT-----IKPSILGFD-----T
900 910 920 930 940
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 SHSWLCDGRLLCLHDPSNKNNWKIFRECWKQGQPVLVSGVHKKLKSELWKPEAFSQEFGD
: ::::.:::::.::.::.::..:::::::::::.:::::.::.:::::::.: .:::.
CCDS19 PHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNSELWKPESFRKEFGE
950 960 970 980 990 1000
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 QDVDLVNCRNCAIISDVKVRDFWDGFEIICKRLRSEDGQPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPT
:.:::::::. ::. . : ::::::: . .::..: .::::::::::::::::::::.
CCDS19 QEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDVPNRLKNEK-EPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPS
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 RFEDLMENLPLPEYTKRDGRLNLASRLPSYFVRPDLGPKMYNAYGLITAEDRRVGTTNLH
::.::: :.::::::.:::.::::::::.::::::::::::::::::: :::. ::::::
CCDS19 RFDDLMANIPLPEYTRRDGKLNLASRLPNYFVRPDLGPKMYNAYGLITPEDRKYGTTNLH
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 LDVSDAVNVMVYVGIPIGEGAHDEEVLKTIDEGDADEVTKQRIHDGKEKPGALWHIYAAK
::::::.::::::::: :. ..:::::::..::.::.: .:. .:::::::::::::::
CCDS19 LDVSDAANVMVYVGIPKGQCEQEEEVLKTIQDGDSDELTIKRFIEGKEKPGALWHIYAAK
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA1 DAEKIRELLRKVGEEQGQENPPDHDPIHDQSWYLDQTLRKRLYEEYGVQGWAIVQFLGDA
:.:::::.:.::.:::::::: :::::::::::::..:::::..:::::::::::::::.
CCDS19 DTEKIREFLKKVSEEQGQENPADHDPIHDQSWYLDRSLRKRLHQEYGVQGWAIVQFLGDV
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA1 VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFRLTQEFRHLSNTHTNHEDKLQVKNII
:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.:::::::::::::.:
CCDS19 VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVI
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1750 1760
pF1KA1 YHAVKDAVGTLKAHESKLARS
::::::::. ::: ::....
CCDS19 YHAVKDAVAMLKASESSFGKP
1310 1320
>--
initn: 410 init1: 142 opt: 417 Z-score: 338.6 bits: 75.4 E(32554): 1.5e-12
Smith-Waterman score: 417; 25.3% identity (55.5% similar) in 510 aa overlap (9-503:13-484)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MADAAASPVGKRLLLLFADTAASASASAPAAAAASGDPGPALRTRAWRAGTVRAMS
::.:.: : : ....: .. . .. : : .::.::.:
CCDS19 MVLTLGESWPVLVGRRFLSLSAADGSDGSHDSWDVERVAEWP--------WLSGTIRAVS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 --GAVPQDLAIFVEFDGCNWKQHSWVKVHAEEVIVLLLEGSLVWAPREDPVLLQGIRVSI
.. .:: . ::::: .:... :..:.. ..:.: .:: : :..: . . :
CCDS19 HTDVTKKDLKVCVEFDGESWRKRRWIEVYSLLRRAFLVEHNLVLAERKSPEISE----RI
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 AQWPALTFTPLVDKLGLGSVVPVEYLLDRELRFLSDANGLHLFQMGTDSQNQILLEHAAL
.::::.:. ::.:: ::::.. :..: :.. ::: . :. .: ..: : .. .
CCDS19 VQWPAITYKPLLDKAGLGSITSVRFLGDQQRVFLSK-DLLKPIQ-DVNSLRLSLTDNQIV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 RETVNALISDQKLQEIFSRGPYSVQGHRVKIYQPEGEEGWLYGVVSHQDSITRLMEVSVT
. .::: . . . .: .. : .::::. . :. ..: . . .. ..:.
CCDS19 SKEFQALIVKHLDESHLLKGDKNLVGSEVKIYSLDPSTQWFSATVINGNPASKTLQVNCE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 ESGEIKSVDPRLIHV-MLMDNSTPQSEGGTLKAVKSSKGKKKRESIEGKDGRRRKSASDS
: .: ::: :::: .. :: . .... . ::: :.... .. .:... . :: :
CCDS19 EIPALKIVDPSLIHVEVVHDNLVTCGNSARIGAVKR-KSSENNGTLVSKQAKSCSEASPS
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pF1KA1 GCDPASKKLKGDRGEVDSNGSDGGEASRGPWKGGNASGEPGLDQRAKQPPS--TFVPQI-
: :... :. : :. : : .. : : :..::. . .::
CCDS19 MC-PVQSVPTTVFKEI----LLGCTAATPPSKDPRQQSTP---QAANSPPNLGAKIPQGC
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pF1KA1 -NRNIRFATYTKENGRTLVVQDEPVGGDTPASFTPYST--ATGQTPLAPEVGGA-----E
.... . : .. ... .: :.. :. .::. . : :.
CCDS19 HKQSLPEEISSCLNTKSEALRTKP--DVCKAGLLSKSSQIGTGDLKILTEPKGSCTQPKT
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pF1KA1 NKEAGKTLEQVGQGIVA-SAAVVTTASSTPNTVRISDTGLAAGTVPEKQKGSRSQASGEN
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CCDS19 NTDQENRLESVPQALTGLPKECLPTKASSKAELEIANP-------PELQKHLEHAPSPSD
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:. ...: .. :.. ::.. ..:: ... :
CCDS19 VSNAPEVKAGVNSDSPNNC------SGKKVEPSALACRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNN
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CCDS19 KIQNAPSRKSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQDDSCVNIVAQLPKCRECRLDSLRKDKEQQK
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. :. .. ..:. : : . . .:. . ... .. .. :.. . .
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.:. . : . ..... .: . . : : . : : .
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..:: .: . ::.::. .. . .:. .. : : ::....
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: : .: ...:. . :: .: :::::::: :::.:: :: : ..
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CCDS60 STDAGIAFAPVYSMGAPSSKSGRTMPNILDDIIASVVENKIPPSKTSKINVKPELKEEPE
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CCDS60 ESIISAVDENNKLYSDIPHSWICEKHILWLKDYKNSSNWKLFKECWKQGQPAVVSGVHKK
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.. ::: :..: .:::...::.::.. .:::...:..:::::: . :: ....:. .::
CCDS60 MNISLWKAESISLDFGDHQADLLNCKD-SIISNANVKEFWDGFEEVSKRQKNKSGETVVL
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pF1KA1 KLKDWPPGEDFRDMMPTRFEDLMENLPLPEYTKRDGRLNLASRLPSYFVRPDLGPKMYNA
:::::: ::::. :::.:.:::...:::::: . .:..::::.::..::::::::.. .:
CCDS60 KLKDWPSGEDFKTMMPARYEDLLKSLPLPEYCNPEGKFNLASHLPGFFVRPDLGPRLCSA
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pF1KA1 YGLITAEDRRVGTTNLHLDVSDAVNVMVYVGIPIGEGAHDEE-VLKTIDEGDADEVTKQR
::...:.:. .::::::..:::.::..::::: :.: .. .:: ..: : :.. ..:
CCDS60 YGVVAAKDHDIGTTNLHIEVSDVVNILVYVGIAKGNGILSKAGILKKFEEEDLDDILRKR
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pF1KA1 IHDGKEKPGALWHIYAAKDAEKIRELLRKVGEEQGQENPPDHDPIHDQSWYLDQTLRKRL
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CCDS60 LKDSSEIPGALWHIYAGKDVDKIREFLQKISKEQGLEVLPEHDPIRDQSWYVNKKLRQRL
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pF1KA1 YEEYGVQGWAIVQFLGDAVFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFRLTQEFRH
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CCDS60 LEEYGVRTCTLIQFLGDAIVLPAGALHQVQNFHSCIQVTEDFVSPEHLVESFHLTQELRL
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CCDS60 LKE-EINYDDKLQVKNILYHAVKEMVRALKIHEDEVEDMEEN
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CCDS41 PENAVNAEASLRRNSPSPWLHQPTPVTSADGIGLLSHIPVRPSSAEPHRPLKITA-HSSP
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pF1KA1 MD-NSTPQSEGGTLKAVKSSKGKKKRESIE---------GKDGRRRKSA--SDSGCDPAS
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CCDS41 NQLQRPPQETGERLNKYKEEHRRILQESIDVAPFTTKIKGLEGERENYSRVASSSSSPKS
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pF1KA1 KKLKGDRGEVDSNGSDGGEASRG-PWKGGNASGEPGLDQRA-KQPPSTFVPQINRNIRFA
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CCDS41 HIIKQDM-DVERSVSDLYKMKHSVPQSLPQSNYFTTLSNSVVNEPPRSYPSKEVSNI---
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CCDS41 -YGDKQSNALAA-----AAANPQTLTSFITSLSKPP--PLIKHQPESEGLVGKIPEHLPH
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CCDS41 QI-ASHSVTTFRNDCRSPTHLTVSSTN-TLRSMPALHRAPVFHPPIHHSLERKEGSYSSL
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pF1KA1 GAPLPSSSQPLTFGSG--RSQSNGVLATENKPLGFSFGCSSAQEAQKDTDLSKNLFFQCM
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CCDS41 SPPTLTPVMPVNAGGKVQESQKPPTLIPEPKDSQANFKSSSEQSLTEMWRPNNNLSKEKT
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CCDS41 EWHVEKSS--GKLQAAMAS-VIVRPSSSTKTDSMPAMQLASKDRVSERSSAGAHKTDCLK
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CCDS41 LAEAGETGRIILPNVNSDSVHTKSEKNFQAVSQGSVPSSVMSAVNTMCNTKTDVITSAAD
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CCDS41 TTSVSSWGGSEVISSLSNTILASTSSECVSSKSVSQPVAQKQECKVSTTAPVTLASSKTG
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CCDS41 STINKANSVGNGQASQTSQPNYHTKLKKAWLTRHSEEDKNTNKMENSGNSVSEIIKPCSV
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CCDS41 NLIASTSSDIQNSVDSKIIVDKYVKDDKVNRRKAKRTYESGSESGDSDESESKSEQRTKR
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CCDS41 QPKPTYKKKQNDLQKRKGEIEEDLKPNGVLSRSAKERSKLKLQSNSNTGIPRSVLKDWRK
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CCDS41 VKKLKQTGESFLQDDSCCEIGPNLQKCRECRLIRSKKGEEPAH--SPVFCRFYYFRRLSF
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1940 1950 1960 1970 1980
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CCDS41 SPE---SDVGTDNK------LTPP-----ESQSPLHWLADLAEQKAREEKKENKEL-TLE
1990 2000 2010 2020 2030
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CCDS41 NQIKEEREQDNSESPNGRTSPLV-------------SQNNEQGSTLRDLLTTTAGKLRVG
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CCDS41 STDAGIAFAPVYSMGAPSSKSGRTMPNILDDIIASVVENKIPPSKTSKINVKPELKEEPE
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CCDS41 ESIISAVDENNKLYSDIPHSWICEKHILWLKDYKNSSNWKLFKECWKQGQPAVVSGVHKK
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CCDS41 KLKDWPSGEDFKTMMPARYEDLLKSLPLPEYCNPEGKFNLASHLPGFFVRPDLGPRLCSA
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CCDS41 YGVVAAKDHDIGTTNLHIEVSDVVNILVYVGIAKGNGILSKAGILKKFEEEDLDDILRKR
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pF1KA1 IHDGKEKPGALWHIYAAKDAEKIRELLRKVGEEQGQENPPDHDPIHDQSWYLDQTLRKRL
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CCDS41 LKDSSEIPGALWHIYAGKDVDKIREFLQKISKEQGLEVLPEHDPIRDQSWYVNKKLRQRL
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pF1KA1 YEEYGVQGWAIVQFLGDAVFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFRLTQEFRH
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CCDS41 LEEYGVRTCTLIQFLGDAIVLPAGALHQVQNFHSCIQVTEDFVSPEHLVESFHLTQELRL
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pF1KA1 LSNTHTNHEDKLQVKNIIYHAVKDAVGTLKAHESKLARS
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CCDS41 LKE-EINYDDKLQVKNILYHAVKEMVRALKIHEDEVEDMEEN
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>--
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20 30 40 50 60 70
pF1KA1 LLFADTAASASASAPAAAAASGDPGPALRTRAWRAGTVRAMS--GAVPQDLAIFVEFDGC
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CCDS41 TRAELVGKRFLCVAVGDEARSERWESGRGWRSWRAGVIRAVSHRDSRNPDLAVYVEFDDL
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pF1KA1 NWKQHSWVKVHAEEVIVLLLEGSLVWAPREDPVLLQGIRVSIAQWPALTFTPLVDKLGLG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]