FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1082, 1761 aa 1>>>pF1KA1082 1761 - 1761 aa - 1761 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8286+/-0.000419; mu= 7.5659+/- 0.026 mean_var=182.5826+/-36.162, 0's: 0 Z-trim(117.4): 47 B-trim: 11 in 1/56 Lambda= 0.094917 statistics sampled from 29334 (29381) to 29334 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.682), E-opt: 0.2 (0.344), width: 16 Scan time: 19.430 The best scores are: opt bits E(85289) NP_057688 (OMIM: 609373) lysine-specific demethyla (1761) 11770 1625.6 0 XP_011541791 (OMIM: 609373) PREDICTED: lysine-spec (1713) 11367 1570.4 0 XP_011541790 (OMIM: 609373) PREDICTED: lysine-spec (1717) 11367 1570.4 0 XP_016865073 (OMIM: 609373) PREDICTED: lysine-spec (1512) 10135 1401.7 0 XP_005272075 (OMIM: 609373) PREDICTED: lysine-spec (1561) 8775 1215.5 0 XP_006712114 (OMIM: 611512) 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PREDICTED: probable Jm (2358) 1781 257.8 8.7e-67 XP_016871387 (OMIM: 604503) PREDICTED: probable Jm (2358) 1781 257.8 8.7e-67 NP_001269877 (OMIM: 604503) probable JmjC domain-c (2358) 1781 257.8 8.7e-67 NP_001305083 (OMIM: 604503) probable JmjC domain-c (2358) 1781 257.8 8.7e-67 NP_001309181 (OMIM: 604503) probable JmjC domain-c (2502) 1781 257.8 9.1e-67 NP_116165 (OMIM: 604503) probable JmjC domain-cont (2540) 1781 257.8 9.2e-67 XP_011537805 (OMIM: 604503) PREDICTED: probable Jm (2317) 1090 163.2 2.6e-38 NP_005135 (OMIM: 146550,203655,209500,602302) lysi (1189) 301 55.0 5e-06 XP_005273626 (OMIM: 146550,203655,209500,602302) P (1190) 301 55.0 5e-06 NP_060881 (OMIM: 146550,203655,209500,602302) lysi (1134) 266 50.2 0.00013 XP_006716430 (OMIM: 146550,203655,209500,602302) P (1135) 266 50.2 0.00013 >>NP_057688 (OMIM: 609373) lysine-specific demethylase 3 (1761 aa) initn: 11770 init1: 11770 opt: 11770 Z-score: 8714.5 bits: 1625.6 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 11770; 100.0% identity 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 EGSLVWAPREDPVLLQGIRVSIAQWPALTFTPLVDKLGLGSVVPVEYLLDRELRFLSDAN 50 60 70 80 90 100 160 170 180 190 200 210 pF1KA1 GLHLFQMGTDSQNQILLEHAALRETVNALISDQKLQEIFSRGPYSVQGHRVKIYQPEGEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 GLHLFQMGTDSQNQILLEHAALRETVNALISDQKLQEIFSRGPYSVQGHRVKIYQPEGEE 110 120 130 140 150 160 220 230 240 250 260 270 pF1KA1 GWLYGVVSHQDSITRLMEVSVTESGEIKSVDPRLIHVMLMDNSTPQSEGGTLKAVKSSKG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: XP_011 GWLYGVVSHQDSITRLMEVSVTESGEIKSVDPRLIHVMLMDNSAPQSEGGTLKAVKSSKG 170 180 190 200 210 220 280 290 300 310 320 330 pF1KA1 KKKRESIEGKDGRRRKSASDSGCDPASKKLKGDRGEVDSNGSDGGEASRGPWKGGNASGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 KKKRESIEGKDGRRRKSASDSGCDPASKKLKGDRGEVDSNGSDGGEASRGPWKGGNASGE 230 240 250 260 270 280 340 350 360 370 380 390 pF1KA1 PGLDQRAKQPPSTFVPQINRNIRFATYTKENGRTLVVQDEPVGGDTPASFTPYSTATGQT 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XP_006 MCDVCDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRM 10 20 30 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KA1 RKSRPRSETEEMGDEEVFSWLKCAKGQSHEPENLMPTQIIPGTALYNIGDMVHAARGKWG . :.. .. . ..::::::.:.: :::::::::::::: :::..::.::..:.::: XP_006 K----RKNCQQGAAYKTFSWLKCVKSQIHEPENLMPTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWG 40 50 60 70 80 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KA1 IKANCPCISRQNKSVLRPAVTNGMSQLPSINPSASSGNETTFSGGGGPAPVTTPEPDHVP ::::::: .:: : .:: . ..: .. .:.. :... : .:. . XP_006 IKANCPCSNRQFKLFSKPASKEDLKQ------TSLAGEKPTLGA------VLQQNPSVL- 90 100 110 120 130 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KA1 KADSTDIRSEEPLKTDSSASNSNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKE :: . . :... . ...: :: .. : :.:::::.. ....:.:: XP_006 ----------EPAAVGGEAASKPA--GSMKPACPASTSP---LNWLADLTSGNVNKENKE 140 150 160 170 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KA1 AGSLRSVLNKESHSPFGLDSFNSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHS .:..: . : . .: : . . ::: .: :...::. . ::.::.: XP_006 KQPTMPILKNEIKC---LPPLPPLSKSSTVL-HTFNSTILTPVSNNNS---GFLRNLLNS 180 190 200 210 220 230 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KA1 GPGKLPQTPLDTGIPFPPVFSTSSAGVKSKASLPNFLDHIIASVVENKKTSDASKRACNL . :: . :.: . :..:: :.::.:.:: ::: ::: .: XP_006 STGK------------------TENGLK---NTPKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGL 240 250 260 270 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KA1 TDTQKEVKEMVMGLNVLDPHTSHSWLCDGRLLCLHDPSNKNNWKIFRECWKQGQPVLVSG : .: ..:.. : : ::::.:::::.::.::.::..:::::::::::.::: XP_006 T-----IKPSILGFD-----TPHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSG 280 290 300 310 320 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KA1 VHKKLKSELWKPEAFSQEFGDQDVDLVNCRNCAIISDVKVRDFWDGFEIICKRLRSEDGQ ::.::.:::::::.: .:::.:.:::::::. ::. . : ::::::: . .::..: . XP_006 VHHKLNSELWKPESFRKEFGEQEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDVPNRLKNEK-E 330 340 350 360 370 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KA1 PMVLKLKDWPPGEDFRDMMPTRFEDLMENLPLPEYTKRDGRLNLASRLPSYFVRPDLGPK ::::::::::::::::::::.::.::: :.::::::.:::.::::::::.:::::::::: XP_006 PMVLKLKDWPPGEDFRDMMPSRFDDLMANIPLPEYTRRDGKLNLASRLPNYFVRPDLGPK 380 390 400 410 420 430 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KA1 MYNAYGLITAEDRRVGTTNLHLDVSDAVNVMVYVGIPIGEGAHDEEVLKTIDEGDADEVT ::::::::: :::. ::::::::::::.::::::::: :. ..:::::::..::.::.: XP_006 MYNAYGLITPEDRKYGTTNLHLDVSDAANVMVYVGIPKGQCEQEEEVLKTIQDGDSDELT 440 450 460 470 480 490 1600 1610 1620 1630 1640 1650 pF1KA1 KQRIHDGKEKPGALWHIYAAKDAEKIRELLRKVGEEQGQENPPDHDPIHDQSWYLDQTLR .:. .::::::::::::::::.:::::.:.::.:::::::: :::::::::::::..:: XP_006 IKRFIEGKEKPGALWHIYAAKDTEKIREFLKKVSEEQGQENPADHDPIHDQSWYLDRSLR 500 510 520 530 540 550 1660 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KA1 KRLYEEYGVQGWAIVQFLGDAVFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFRLTQE :::..:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::: XP_006 KRLHQEYGVQGWAIVQFLGDVVFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQE 560 570 580 590 600 610 1720 1730 1740 1750 1760 pF1KA1 FRHLSNTHTNHEDKLQVKNIIYHAVKDAVGTLKAHESKLARS ::.::.:::::::::::::.:::::::::. ::: ::.... XP_006 FRYLSQTHTNHEDKLQVKNVIYHAVKDAVAMLKASESSFGKP 620 630 640 650 660 >>XP_016859983 (OMIM: 611512) PREDICTED: lysine-specific (1036 aa) initn: 3307 init1: 1649 opt: 2173 Z-score: 1615.5 bits: 311.3 E(85289): 3e-83 Smith-Waterman score: 3530; 59.6% identity (79.8% similar) in 890 aa overlap (871-1760:220-1035) 850 860 870 880 890 900 pF1KA1 LMGKLGPNGERSAELLLGKSKGKQAPKGRPRTAPLKVGQSVLKDVSKVKKLKQSGEPFLQ ..:: . .::: : .:.:::.:::: :.: XP_016 SALACRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSR--KSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQ 190 200 210 220 230 240 910 920 930 940 950 960 pF1KA1 DGSCINVAPHLHKCRECRLERYRKFKEQEQDDSTVACRFFHFRRLIFTRKGVLRVEGFLS : ::.:.. .: :::::::. :: ::: : :: : ::::::::: :...:::::::::. XP_016 DDSCVNIVAQLPKCRECRLDSLRKDKEQ-QKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLT 250 260 270 280 290 300 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KA1 PQQSDPDAMNLWIPSSSLAEGIDLETSKYILANVGDQFCQLVMSEKEAMMMVEPHQKVAW :.. : .:..::.: .. . ::::.:.::::::.::.:::.:.:::::: .:::..::: XP_016 PNKYDNEAIGLWLPLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAW 310 320 330 340 350 360 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KA1 KRAVRGVREMCDVCETTLFNIHWVCRKCGFGVCLDCYRLRKSRPRSETEEMGDEEVFSWL ::::.:::::::::.::.::.:::: .::::::.::::.. :.. .. . ..:::: XP_016 KRAVKGVREMCDVCDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMK----RKNCQQGAAYKTFSWL 370 380 390 400 410 420 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA1 KCAKGQSHEPENLMPTQIIPGTALYNIGDMVHAARGKWGIKANCPCISRQNKSVLRPAVT ::.:.: :::::::::::::: :::..::.::..:.:::::::::: .:: : .:: XP_016 KCVKSQIHEPENLMPTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPASK 430 440 450 460 470 480 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KA1 NGMSQLPSINPSASSGNETTFSGGGGPAPVTTPEPDHVPKADSTDIRSEEPLKTDSSASN . ..: .. .:.. :... : .:. . :: . . :.. XP_016 EDLKQ------TSLAGEKPTLGA------VLQQNPSVL-----------EPAAVGGEAAS 490 500 510 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KA1 SNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKESHSPFGLDSF . . ...: :: .. : :.:::::.. ....:.:: .:..: . : . XP_016 KPA--GSMKPACPASTSP---LNWLADLTSGNVNKENKEKQPTMPILKNEIKC---LPPL 520 530 540 550 560 570 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KA1 NSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGIPFPPVFS .: : . . ::: .: :...:: .. ::.::.:. :: XP_016 PPLSKSSTVL-HTFNSTILTPVSNNN---SGFLRNLLNSSTGK----------------- 580 590 600 610 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KA1 TSSAGVKSKASLPNFLDHIIASVVENKKTSDASKRACNLTDTQKEVKEMVMGLNVLDPHT . :.:. :..:: :.::.:.:: ::: ::: .:: .: ..:.. : XP_016 -TENGLKNT---PKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGLT-----IKPSILGFD-----T 620 630 640 650 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KA1 SHSWLCDGRLLCLHDPSNKNNWKIFRECWKQGQPVLVSGVHKKLKSELWKPEAFSQEFGD : ::::.:::::.::.::.::..:::::::::::.:::::.::.:::::::.: .:::. XP_016 PHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNSELWKPESFRKEFGE 660 670 680 690 700 710 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KA1 QDVDLVNCRNCAIISDVKVRDFWDGFEIICKRLRSEDGQPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPT :.:::::::. ::. . : ::::::: . .::..: .::::::::::::::::::::. XP_016 QEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDVPNRLKNEK-EPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPS 720 730 740 750 760 770 1510 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KA1 RFEDLMENLPLPEYTKRDGRLNLASRLPSYFVRPDLGPKMYNAYGLITAEDRRVGTTNLH ::.::: :.::::::.:::.::::::::.::::::::::::::::::: :::. :::::: XP_016 RFDDLMANIPLPEYTRRDGKLNLASRLPNYFVRPDLGPKMYNAYGLITPEDRKYGTTNLH 780 790 800 810 820 830 1570 1580 1590 1600 1610 1620 pF1KA1 LDVSDAVNVMVYVGIPIGEGAHDEEVLKTIDEGDADEVTKQRIHDGKEKPGALWHIYAAK ::::::.::::::::: :. ..:::::::..::.::.: .:. .::::::::::::::: XP_016 LDVSDAANVMVYVGIPKGQCEQEEEVLKTIQDGDSDELTIKRFIEGKEKPGALWHIYAAK 840 850 860 870 880 890 1630 1640 1650 1660 1670 1680 pF1KA1 DAEKIRELLRKVGEEQGQENPPDHDPIHDQSWYLDQTLRKRLYEEYGVQGWAIVQFLGDA :.:::::.:.::.:::::::: :::::::::::::..:::::..:::::::::::::::. XP_016 DTEKIREFLKKVSEEQGQENPADHDPIHDQSWYLDRSLRKRLHQEYGVQGWAIVQFLGDV 900 910 920 930 940 950 1690 1700 1710 1720 1730 1740 pF1KA1 VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFRLTQEFRHLSNTHTNHEDKLQVKNII :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.:::::::::::::.: XP_016 VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVI 960 970 980 990 1000 1010 1750 1760 pF1KA1 YHAVKDAVGTLKAHESKLARS ::::::::. ::: ::.... XP_016 YHAVKDAVAMLKASESSFGKP 1020 1030 >>NP_001140160 (OMIM: 611512) lysine-specific demethylas (1321 aa) initn: 3606 init1: 1649 opt: 2173 Z-score: 1613.9 bits: 311.4 E(85289): 3.7e-83 Smith-Waterman score: 3530; 59.6% identity (79.8% similar) in 890 aa overlap (871-1760:505-1320) 850 860 870 880 890 900 pF1KA1 LMGKLGPNGERSAELLLGKSKGKQAPKGRPRTAPLKVGQSVLKDVSKVKKLKQSGEPFLQ ..:: . .::: : .:.:::.:::: :.: NP_001 SALACRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSR--KSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQ 480 490 500 510 520 530 910 920 930 940 950 960 pF1KA1 DGSCINVAPHLHKCRECRLERYRKFKEQEQDDSTVACRFFHFRRLIFTRKGVLRVEGFLS : ::.:.. .: :::::::. :: ::: : :: : ::::::::: :...:::::::::. NP_001 DDSCVNIVAQLPKCRECRLDSLRKDKEQ-QKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLT 540 550 560 570 580 590 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KA1 PQQSDPDAMNLWIPSSSLAEGIDLETSKYILANVGDQFCQLVMSEKEAMMMVEPHQKVAW :.. : .:..::.: .. . ::::.:.::::::.::.:::.:.:::::: .:::..::: NP_001 PNKYDNEAIGLWLPLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAW 600 610 620 630 640 650 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KA1 KRAVRGVREMCDVCETTLFNIHWVCRKCGFGVCLDCYRLRKSRPRSETEEMGDEEVFSWL ::::.:::::::::.::.::.:::: .::::::.::::.. :.. .. . ..:::: NP_001 KRAVKGVREMCDVCDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMK----RKNCQQGAAYKTFSWL 660 670 680 690 700 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA1 KCAKGQSHEPENLMPTQIIPGTALYNIGDMVHAARGKWGIKANCPCISRQNKSVLRPAVT ::.:.: :::::::::::::: :::..::.::..:.:::::::::: .:: : .:: NP_001 KCVKSQIHEPENLMPTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPASK 710 720 730 740 750 760 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KA1 NGMSQLPSINPSASSGNETTFSGGGGPAPVTTPEPDHVPKADSTDIRSEEPLKTDSSASN . ..: .. .:.. :... : .:. . :: . . :.. NP_001 EDLKQ------TSLAGEKPTLGA------VLQQNPSVL-----------EPAAVGGEAAS 770 780 790 800 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KA1 SNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKESHSPFGLDSF . . ...: :: .. : :.:::::.. ....:.:: .:..: . : . NP_001 KPA--GSMKPACPASTSP---LNWLADLTSGNVNKENKEKQPTMPILKNEIKC---LPPL 810 820 830 840 850 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KA1 NSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGIPFPPVFS .: : . . ::: .: :...:: .. ::.::.:. :: NP_001 PPLSKSSTVL-HTFNSTILTPVSNNN---SGFLRNLLNSSTGK----------------- 860 870 880 890 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KA1 TSSAGVKSKASLPNFLDHIIASVVENKKTSDASKRACNLTDTQKEVKEMVMGLNVLDPHT . :.:. :..:: :.::.:.:: ::: ::: .:: .: ..:.. : NP_001 -TENGLKNT---PKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGLT-----IKPSILGFD-----T 900 910 920 930 940 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KA1 SHSWLCDGRLLCLHDPSNKNNWKIFRECWKQGQPVLVSGVHKKLKSELWKPEAFSQEFGD : ::::.:::::.::.::.::..:::::::::::.:::::.::.:::::::.: .:::. NP_001 PHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNSELWKPESFRKEFGE 950 960 970 980 990 1000 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KA1 QDVDLVNCRNCAIISDVKVRDFWDGFEIICKRLRSEDGQPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPT :.:::::::. ::. . : ::::::: . .::..: .::::::::::::::::::::. NP_001 QEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDVPNRLKNEK-EPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPS 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1510 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KA1 RFEDLMENLPLPEYTKRDGRLNLASRLPSYFVRPDLGPKMYNAYGLITAEDRRVGTTNLH ::.::: :.::::::.:::.::::::::.::::::::::::::::::: :::. :::::: NP_001 RFDDLMANIPLPEYTRRDGKLNLASRLPNYFVRPDLGPKMYNAYGLITPEDRKYGTTNLH 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1570 1580 1590 1600 1610 1620 pF1KA1 LDVSDAVNVMVYVGIPIGEGAHDEEVLKTIDEGDADEVTKQRIHDGKEKPGALWHIYAAK ::::::.::::::::: :. ..:::::::..::.::.: .:. .::::::::::::::: NP_001 LDVSDAANVMVYVGIPKGQCEQEEEVLKTIQDGDSDELTIKRFIEGKEKPGALWHIYAAK 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1630 1640 1650 1660 1670 1680 pF1KA1 DAEKIRELLRKVGEEQGQENPPDHDPIHDQSWYLDQTLRKRLYEEYGVQGWAIVQFLGDA :.:::::.:.::.:::::::: :::::::::::::..:::::..:::::::::::::::. NP_001 DTEKIREFLKKVSEEQGQENPADHDPIHDQSWYLDRSLRKRLHQEYGVQGWAIVQFLGDV 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1690 1700 1710 1720 1730 1740 pF1KA1 VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFRLTQEFRHLSNTHTNHEDKLQVKNII :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.:::::::::::::.: NP_001 VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVI 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1750 1760 pF1KA1 YHAVKDAVGTLKAHESKLARS ::::::::. ::: ::.... NP_001 YHAVKDAVAMLKASESSFGKP 1310 1320 >-- initn: 410 init1: 142 opt: 417 Z-score: 314.4 bits: 70.9 E(85289): 9e-11 Smith-Waterman score: 417; 25.3% identity (55.5% similar) in 510 aa overlap (9-503:13-484) 10 20 30 40 50 pF1KA1 MADAAASPVGKRLLLLFADTAASASASAPAAAAASGDPGPALRTRAWRAGTVRAMS ::.:.: : : ....: .. . .. : : .::.::.: NP_001 MVLTLGESWPVLVGRRFLSLSAADGSDGSHDSWDVERVAEWP--------WLSGTIRAVS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KA1 --GAVPQDLAIFVEFDGCNWKQHSWVKVHAEEVIVLLLEGSLVWAPREDPVLLQGIRVSI .. .:: . ::::: .:... :..:.. ..:.: .:: : :..: . . : NP_001 HTDVTKKDLKVCVEFDGESWRKRRWIEVYSLLRRAFLVEHNLVLAERKSPEISE----RI 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 AQWPALTFTPLVDKLGLGSVVPVEYLLDRELRFLSDANGLHLFQMGTDSQNQILLEHAAL .::::.:. ::.:: ::::.. :..: :.. ::: . :. .: ..: : .. . NP_001 VQWPAITYKPLLDKAGLGSITSVRFLGDQQRVFLSK-DLLKPIQ-DVNSLRLSLTDNQIV 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 RETVNALISDQKLQEIFSRGPYSVQGHRVKIYQPEGEEGWLYGVVSHQDSITRLMEVSVT . .::: . . . .: .. : .::::. . :. ..: . . .. ..:. NP_001 SKEFQALIVKHLDESHLLKGDKNLVGSEVKIYSLDPSTQWFSATVINGNPASKTLQVNCE 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 ESGEIKSVDPRLIHV-MLMDNSTPQSEGGTLKAVKSSKGKKKRESIEGKDGRRRKSASDS : .: ::: :::: .. :: . .... . ::: :.... .. .:... . :: : NP_001 EIPALKIVDPSLIHVEVVHDNLVTCGNSARIGAVKR-KSSENNGTLVSKQAKSCSEASPS 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 GCDPASKKLKGDRGEVDSNGSDGGEASRGPWKGGNASGEPGLDQRAKQPPS--TFVPQI- : :... :. : :. : : .. : : :..::. . .:: NP_001 MC-PVQSVPTTVFKEI----LLGCTAATPPSKDPRQQSTP---QAANSPPNLGAKIPQGC 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 pF1KA1 -NRNIRFATYTKENGRTLVVQDEPVGGDTPASFTPYST--ATGQTPLAPEVGGA-----E .... . : .. ... .: :.. :. .::. . : :. NP_001 HKQSLPEEISSCLNTKSEALRTKP--DVCKAGLLSKSSQIGTGDLKILTEPKGSCTQPKT 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KA1 NKEAGKTLEQVGQGIVA-SAAVVTTASSTPNTVRISDTGLAAGTVPEKQKGSRSQASGEN : . . ::.: :.... . : .:. ..:.. :: :: . : . NP_001 NTDQENRLESVPQALTGLPKECLPTKASSKAELEIANP-------PELQKHLEHAPSPSD 400 410 420 430 440 470 480 490 500 510 520 pF1KA1 SRNSILASSGFGAPLPSSSQPLTFGSGRSQSNGVLATENKPLGFSFGCSSAQEAQKDTDL :. ...: .. :.. ::.. ..:: ... : NP_001 VSNAPEVKAGVNSDSPNNC------SGKKVEPSALACRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNN 450 460 470 480 490 500 530 540 550 560 570 580 pF1KA1 SKNLFFQCMSQTLPTSNYFTTVSESLADDSSSRDSFKQSLESLSSGLCKGRSVLGTDTKP NP_001 KIQNAPSRKSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQDDSCVNIVAQLPKCRECRLDSLRKDKEQQK 510 520 530 540 550 560 >>XP_016859982 (OMIM: 611512) PREDICTED: lysine-specific (1321 aa) initn: 3606 init1: 1649 opt: 2173 Z-score: 1613.9 bits: 311.4 E(85289): 3.7e-83 Smith-Waterman score: 3530; 59.6% identity (79.8% similar) in 890 aa overlap (871-1760:505-1320) 850 860 870 880 890 900 pF1KA1 LMGKLGPNGERSAELLLGKSKGKQAPKGRPRTAPLKVGQSVLKDVSKVKKLKQSGEPFLQ ..:: . .::: : .:.:::.:::: :.: XP_016 SALACRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSR--KSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQ 480 490 500 510 520 530 910 920 930 940 950 960 pF1KA1 DGSCINVAPHLHKCRECRLERYRKFKEQEQDDSTVACRFFHFRRLIFTRKGVLRVEGFLS : ::.:.. .: :::::::. :: ::: : :: : ::::::::: :...:::::::::. 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XP_016 EDLKQ------TSLAGEKPTLGA------VLQQNPSVL-----------EPAAVGGEAAS 770 780 790 800 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KA1 SNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKESHSPFGLDSF . . ...: :: .. : :.:::::.. ....:.:: .:..: . : . XP_016 KPA--GSMKPACPASTSP---LNWLADLTSGNVNKENKEKQPTMPILKNEIKC---LPPL 810 820 830 840 850 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KA1 NSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGIPFPPVFS .: : . . ::: .: :...:: .. ::.::.:. :: XP_016 PPLSKSSTVL-HTFNSTILTPVSNNN---SGFLRNLLNSSTGK----------------- 860 870 880 890 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KA1 TSSAGVKSKASLPNFLDHIIASVVENKKTSDASKRACNLTDTQKEVKEMVMGLNVLDPHT . :.:. :..:: :.::.:.:: ::: ::: .:: .: ..:.. : XP_016 -TENGLKNT---PKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGLT-----IKPSILGFD-----T 900 910 920 930 940 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KA1 SHSWLCDGRLLCLHDPSNKNNWKIFRECWKQGQPVLVSGVHKKLKSELWKPEAFSQEFGD : ::::.:::::.::.::.::..:::::::::::.:::::.::.:::::::.: .:::. 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XP_016 HKQSLPEEISSCLNTKSEALRTKP--DVCKAGLLSKSSQIGTGDLKILTEPKGSCTQPKT 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KA1 NKEAGKTLEQVGQGIVA-SAAVVTTASSTPNTVRISDTGLAAGTVPEKQKGSRSQASGEN : . . ::.: :.... . : .:. ..:.. :: :: . : . 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NP_060 EDLKQ------TSLAGEKPTLGA------VLQQNPSVL-----------EPAAVGGEAAS 770 780 790 800 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KA1 SNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKESHSPFGLDSF . . ...: :: .. : :.:::::.. ....:.:: .:..: . : . NP_060 KPA--GSMKPACPASTSP---LNWLADLTSGNVNKENKEKQPTMPILKNEIKC---LPPL 810 820 830 840 850 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KA1 NSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGIPFPPVFS .: : . . ::: .: :...:: .. ::.::.:. :: NP_060 PPLSKSSTVL-HTFNSTILTPVSNNN---SGFLRNLLNSSTGK----------------- 860 870 880 890 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KA1 TSSAGVKSKASLPNFLDHIIASVVENKKTSDASKRACNLTDTQKEVKEMVMGLNVLDPHT . :.:. :..:: :.::.:.:: ::: ::: .:: .: ..:.. : NP_060 -TENGLKNT---PKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGLT-----IKPSILGFD-----T 900 910 920 930 940 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KA1 SHSWLCDGRLLCLHDPSNKNNWKIFRECWKQGQPVLVSGVHKKLKSELWKPEAFSQEFGD : ::::.:::::.::.::.::..:::::::::::.:::::.::.:::::::.: .:::. 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