Result of FASTA (omim) for
pF1KA1086
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1086, 899 aa
1>>>pF1KA1086 899 - 899 aa - 899 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0103+/-0.000444; mu= -10.0523+/- 0.028
mean_var=666.1934+/-139.516, 0's: 0 Z-trim(124.5): 31 B-trim: 2218 in 1/61
Lambda= 0.049691
statistics sampled from 46390 (46440) to 46390 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.797), E-opt: 0.2 (0.545), width: 16
Scan time: 17.550
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_057191 (OMIM: 615635) zinc finger RNA-binding p (1074) 1480 121.9 1.7e-26
NP_703194 (OMIM: 603182) interleukin enhancer-bind ( 690) 988 86.4 5.2e-16
NP_004507 (OMIM: 603182) interleukin enhancer-bind ( 702) 988 86.4 5.2e-16
NP_001131145 (OMIM: 603182) interleukin enhancer-b ( 706) 988 86.4 5.2e-16
XP_011526287 (OMIM: 603182) PREDICTED: interleukin ( 777) 988 86.5 5.6e-16
XP_006722805 (OMIM: 603182) PREDICTED: interleukin ( 855) 988 86.5 5.9e-16
NP_036350 (OMIM: 603182) interleukin enhancer-bind ( 894) 988 86.5 6.1e-16
XP_016882252 (OMIM: 603182) PREDICTED: interleukin ( 898) 988 86.5 6.1e-16
NP_060090 (OMIM: 603182) interleukin enhancer-bind ( 898) 988 86.5 6.1e-16
XP_011526286 (OMIM: 603182) PREDICTED: interleukin ( 898) 988 86.5 6.1e-16
XP_016870387 (OMIM: 611138) PREDICTED: spermatid p ( 648) 945 83.3 4.2e-15
XP_016870386 (OMIM: 611138) PREDICTED: spermatid p ( 657) 945 83.3 4.2e-15
NP_001164608 (OMIM: 611138) spermatid perinuclear ( 658) 945 83.3 4.2e-15
XP_016870385 (OMIM: 611138) PREDICTED: spermatid p ( 672) 945 83.3 4.3e-15
NP_060857 (OMIM: 611138) spermatid perinuclear RNA ( 672) 945 83.3 4.3e-15
XP_016870384 (OMIM: 611138) PREDICTED: spermatid p ( 672) 945 83.3 4.3e-15
XP_016870383 (OMIM: 611138) PREDICTED: spermatid p ( 672) 945 83.3 4.3e-15
XP_016870382 (OMIM: 611138) PREDICTED: spermatid p ( 674) 945 83.3 4.3e-15
XP_016870381 (OMIM: 611138) PREDICTED: spermatid p ( 674) 945 83.3 4.3e-15
XP_016870379 (OMIM: 611138) PREDICTED: spermatid p ( 674) 945 83.3 4.3e-15
XP_016870380 (OMIM: 611138) PREDICTED: spermatid p ( 674) 945 83.3 4.3e-15
>>NP_057191 (OMIM: 615635) zinc finger RNA-binding prote (1074 aa)
initn: 1760 init1: 908 opt: 1480 Z-score: 596.9 bits: 121.9 E(85289): 1.7e-26
Smith-Waterman score: 2542; 47.1% identity (68.7% similar) in 937 aa overlap (51-890:143-1068)
30 40 50 60 70
pF1KA1 QPHSGQDFAYGSRPQEPVPTATTMATYQDSYSYGQSAA-ARSYEDRPYFQSAALQSGRMT
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NP_057 HTATDYGYTQRQQEAPPPPPPATTQNYQDSYSYVRSTAPAVAYDSKQYYQQPTATAAAVA
120 130 140 150 160 170
80 90 100 110 120 130
pF1KA1 AADSGQPGTQEACGQPSPHGSHSH-------AQPPQQAPIVESGQPASTLSSGYTYPTAT
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NP_057 AAAQPQPSVAETYYQTAPKAGYSQGATQYTQAQQTRQVTAIKPATPSPATTTFSIYPVSS
180 190 200 210 220 230
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 GVQP-ESSASIMTSYPPP-SYNPTCTAYTAPSYPNYDASVYSAASPFYPPAQPPPPPGPP
::: ..:... :: .:. : ..:.. :: .:.:.:::::: .: : .
NP_057 TVQPVAAAATVVPSYTQSATYSTTAVTYSGTSYSGYEAAVYSAASSYYQQQQQQQKQAAA
240 250 260 270 280 290
200 210 220 230 240 250
pF1KA1 QQLPPPPAPAGSGSSPRADSKPPLPSKLPRPKAGPRQLQLHYCDICKISCAGPQTYREHL
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NP_057 AAAAAAATAAWTGTT--FTKKAPFQNKQLKPKQPPKPPQIHYCDVCKISCAGPQTYKEHL
300 310 320 330 340 350
260 270 280 290 300
pF1KA1 GGQKHRKKEAAQKTG---VQPNGSPRGVQAQLHCDLCAVSCTGADAYAAHIRGSKHQKVF
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NP_057 EGQKHKKKEAALKASQNTSSSNSSTRGTQNQLRCELCDVSCTGADAYAAHIRGAKHQKVV
360 370 380 390 400 410
310 320 330 340 350
pF1KA1 KLHAKLGKPIPTLEPAL---ATESPPGAEAKPT-SPTG----------PSVCASSRPAL-
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NP_057 KLHTKLGKPIPSTEPNVVSQATSSTAVSASKPTASPSSIAANNCTVNTSSVATSSMKGLT
420 430 440 450 460 470
360 370 380
pF1KA1 -----------------------AKRPVASKALCEGPPEPQAAGCRPQWGK--------P
::. . : : . :..: . . : :
NP_057 TTGNSSLNSTSNTKVSAVPTNMAAKKTSTPKINFVGGNKLQSTGNKAEDIKGTECVKSTP
480 490 500 510 520 530
390 400 410 420 430
pF1KA1 AQPKLEGPGAPTQGGSKEA-PAGC----SDAQPVGPEYVEEVFSDEGRVLRFHCKLCECS
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NP_057 VTSAVQIPEVKQDTVSEPVTPASLAALQSDVQPVGHDYVEEVRNDEGKVIRFHCKLCECS
540 550 560 570 580 590
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 FNDLNAKDLHVRGRRHRLQYRKKVNPDLPIATEPSSRARKVLEERMRKQRHLAE--ERLE
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NP_057 FNDPNAKEMHLKGRRHRLQYKKKVNPDLQVEVKPSIRARKIQEEKMRKQMQKEEYWRRRE
600 610 620 630 640 650
500 510 520 530
pF1KA1 QLRRWHAERRRLEE-------EPPQD-------VP----PHAPPDWAQPL-LMG-RPESP
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NP_057 EEERWRMEMRRYEEDMYWRRMEEEQHHWDDRRRMPDGGYPHGPPG---PLGLLGVRPGMP
660 670 680 690 700
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 ASAPLQPG--RRPASSDDRHVMCKHATIYPTEQELLAVQRAVSHAERALKLVSDTLAEED
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NP_057 PQ-PQGPAPLRRPDSSDDRYVMTKHATIYPTEEELQAVQKIVSITERALKLVSDSLSEHE
710 720 730 740 750 760
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 RGRREEEGDKRSSVAPQTRVLKGVMRVGILAKGLLLRGDRNVRLALLCSEKPTHSLLRRI
... .: ::. . . :.::::.:::.::::::::::::: :.:::::::...:: ::
NP_057 KNKNKEGDDKKEG--GKDRALKGVLRVGVLAKGLLLRGDRNVNLVLLCSEKPSKTLLSRI
770 780 790 800 810 820
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 AQQLPRQLQMVTEDEYEVSSD-PEANIVISSCEEPRMQVTISVTSPLMREDPSTDPGVEE
:..::.:: ... ..:... :: :...:: ::.:::::..:::..::. . :
NP_057 AENLPKQLAVISPEKYDIKCAVSEAAIILNSCVEPKMQVTITLTSPIIREENMREGDVTS
830 840 850 860 870 880
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 PQA-DAGDVLSPKKCLESLAALRHARWFQARASGLQPCVIVIRVLRDLCRRVPTWGALPA
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NP_057 GMVKDPPDVLDRQKCLDALAALRHAKWFQARANGLQSCVIIIRILRDLCQRVPTWSDFPS
890 900 910 920 930 940
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 WAMELLVEKAVSSAAGPLGPGDAVRRVLECVATGTLLTDGPGLQDPCERDQTDALEPMTL
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NP_057 WAMELLVEKAISSASSPQSPGDALRRVFECISSGIILKGSPGLLDPCEKDPFDTLATMTD
950 960 970 980 990 1000
840 850 860 870 880
pF1KA1 QEREDVTASAQHALRMLAFRQTHKVLGMDLLPPRHRLGARF-----RKRQRGPG--EGEE
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NP_057 QQREDITSSAQFALRLLAFRQIHKVLGMDPLP---QMSQRFNIHNNRKRRRDSDGVDGFE
1010 1020 1030 1040 1050 1060
890
pF1KA1 GAGEKKRGRRGGEGLV
. :.: .
NP_057 AEGKKDKKDYDNF
1070
>>NP_703194 (OMIM: 603182) interleukin enhancer-binding (690 aa)
initn: 969 init1: 666 opt: 988 Z-score: 408.5 bits: 86.4 E(85289): 5.2e-16
Smith-Waterman score: 1144; 53.3% identity (76.3% similar) in 334 aa overlap (548-864:9-342)
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 APPDWAQPLLMGRPESPASAPLQPGRRPASSDDRHVMCKHATIYPTEQELLAVQRAVSHA
.:::::: ::...:::..:: ::: :::.
NP_703 MRPMRIFVNDDRHVMAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHT
10 20 30
580 590 600 610 620
pF1KA1 ERALKLVSDTLAEEDRGRREE----------EGDKRSSVAPQ-----TRVLKGVMRVGIL
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NP_703 ERALKAVSDWIDEQEKGSSEQAESDNMDVPPEDDSKEGAGEQKTEHMTRTLRGVMRVGLV
40 50 60 70 80 90
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 AKGLLLRGDRNVRLALLCSEKPTHSLLRRIAQQLPRQLQMVTEDEYEV-SSDPEANIVIS
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NP_703 AKGLLLKGDLDLELVLLCKEKPTTALLDKVADNLAIQLAAVTEDKYEILQSVDDAAIVIK
100 110 120 130 140 150
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 SCEEPRMQVTISVTSPLMRED-PSTDPGVEEPQADAGDVLSPKKCLESLAALRHARWFQA
. .:: ...:: .:::..::. .. : : :::. .::: .::.::::.::::
NP_703 NTKEPPLSLTIHLTSPVVREEMEKVLAGETLSVNDPPDVLDRQKCLAALASLRHAKWFQA
160 170 180 190 200 210
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 RASGLQPCVIVIRVLRDLCRRVPTWGALPAWAMELLVEKAVSSAAGPLGPGDAVRRVLEC
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NP_703 RANGLKSCVIVIRVLRDLCTRVPTWGPLRGWPLELLCEKSIGTANRPMGAGEALRRVLEC
220 230 240 250 260 270
810 820 830 840 850 860
pF1KA1 VATGTLLTDGPGLQDPCERDQTDALEPMTLQEREDVTASAQHALRMLAFRQTHKVLGMDL
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NP_703 LASGIVMPDGSGIYDPCEKEATDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDP
280 290 300 310 320 330
870 880 890
pF1KA1 LPPRHRLGARFRKRQRGPGEGEEGAGEKKRGRRGGEGLV
:: .
NP_703 LPSKMPKKPKNENPVDYTVQIPPSTTYAITPMKRPMEEDGEEKSPSKKKKKIQKKEEKAE
340 350 360 370 380 390
>>NP_004507 (OMIM: 603182) interleukin enhancer-binding (702 aa)
initn: 969 init1: 666 opt: 988 Z-score: 408.4 bits: 86.4 E(85289): 5.2e-16
Smith-Waterman score: 1144; 53.3% identity (76.3% similar) in 334 aa overlap (548-864:9-342)
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 APPDWAQPLLMGRPESPASAPLQPGRRPASSDDRHVMCKHATIYPTEQELLAVQRAVSHA
.:::::: ::...:::..:: ::: :::.
NP_004 MRPMRIFVNDDRHVMAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHT
10 20 30
580 590 600 610 620
pF1KA1 ERALKLVSDTLAEEDRGRREE----------EGDKRSSVAPQ-----TRVLKGVMRVGIL
::::: ::: . :...: :. : :.. ... : ::.:.::::::..
NP_004 ERALKAVSDWIDEQEKGSSEQAESDNMDVPPEDDSKEGAGEQKTEHMTRTLRGVMRVGLV
40 50 60 70 80 90
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 AKGLLLRGDRNVRLALLCSEKPTHSLLRRIAQQLPRQLQMVTEDEYEV-SSDPEANIVIS
::::::.:: ...:.:::.:::: .:: ..:..: :: ::::.::. .: .: :::.
NP_004 AKGLLLKGDLDLELVLLCKEKPTTALLDKVADNLAIQLAAVTEDKYEILQSVDDAAIVIK
100 110 120 130 140 150
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 SCEEPRMQVTISVTSPLMRED-PSTDPGVEEPQADAGDVLSPKKCLESLAALRHARWFQA
. .:: ...:: .:::..::. .. : : :::. .::: .::.::::.::::
NP_004 NTKEPPLSLTIHLTSPVVREEMEKVLAGETLSVNDPPDVLDRQKCLAALASLRHAKWFQA
160 170 180 190 200 210
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 RASGLQPCVIVIRVLRDLCRRVPTWGALPAWAMELLVEKAVSSAAGPLGPGDAVRRVLEC
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NP_004 RANGLKSCVIVIRVLRDLCTRVPTWGPLRGWPLELLCEKSIGTANRPMGAGEALRRVLEC
220 230 240 250 260 270
810 820 830 840 850 860
pF1KA1 VATGTLLTDGPGLQDPCERDQTDALEPMTLQEREDVTASAQHALRMLAFRQTHKVLGMDL
.:.: .. :: :. ::::.. :::. . :.:::.: :::::::. :: : :::::::
NP_004 LASGIVMPDGSGIYDPCEKEATDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDP
280 290 300 310 320 330
870 880 890
pF1KA1 LPPRHRLGARFRKRQRGPGEGEEGAGEKKRGRRGGEGLV
:: .
NP_004 LPSKMPKKPKNENPVDYTVQIPPSTTYAITPMKRPMEEDGEEKSPSKKKKKIQKKEEKAE
340 350 360 370 380 390
>>NP_001131145 (OMIM: 603182) interleukin enhancer-bindi (706 aa)
initn: 969 init1: 666 opt: 988 Z-score: 408.4 bits: 86.4 E(85289): 5.2e-16
Smith-Waterman score: 1144; 53.3% identity (76.3% similar) in 334 aa overlap (548-864:9-342)
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 APPDWAQPLLMGRPESPASAPLQPGRRPASSDDRHVMCKHATIYPTEQELLAVQRAVSHA
.:::::: ::...:::..:: ::: :::.
NP_001 MRPMRIFVNDDRHVMAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHT
10 20 30
580 590 600 610 620
pF1KA1 ERALKLVSDTLAEEDRGRREE----------EGDKRSSVAPQ-----TRVLKGVMRVGIL
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NP_001 ERALKAVSDWIDEQEKGSSEQAESDNMDVPPEDDSKEGAGEQKTEHMTRTLRGVMRVGLV
40 50 60 70 80 90
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 AKGLLLRGDRNVRLALLCSEKPTHSLLRRIAQQLPRQLQMVTEDEYEV-SSDPEANIVIS
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NP_001 AKGLLLKGDLDLELVLLCKEKPTTALLDKVADNLAIQLAAVTEDKYEILQSVDDAAIVIK
100 110 120 130 140 150
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 SCEEPRMQVTISVTSPLMRED-PSTDPGVEEPQADAGDVLSPKKCLESLAALRHARWFQA
. .:: ...:: .:::..::. .. : : :::. .::: .::.::::.::::
NP_001 NTKEPPLSLTIHLTSPVVREEMEKVLAGETLSVNDPPDVLDRQKCLAALASLRHAKWFQA
160 170 180 190 200 210
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 RASGLQPCVIVIRVLRDLCRRVPTWGALPAWAMELLVEKAVSSAAGPLGPGDAVRRVLEC
::.::. :::::::::::: :::::: : .: .::: ::....: :.: :.:.::::::
NP_001 RANGLKSCVIVIRVLRDLCTRVPTWGPLRGWPLELLCEKSIGTANRPMGAGEALRRVLEC
220 230 240 250 260 270
810 820 830 840 850 860
pF1KA1 VATGTLLTDGPGLQDPCERDQTDALEPMTLQEREDVTASAQHALRMLAFRQTHKVLGMDL
.:.: .. :: :. ::::.. :::. . :.:::.: :::::::. :: : :::::::
NP_001 LASGIVMPDGSGIYDPCEKEATDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDP
280 290 300 310 320 330
870 880 890
pF1KA1 LPPRHRLGARFRKRQRGPGEGEEGAGEKKRGRRGGEGLV
:: .
NP_001 LPSKMPKKPKNENPVDYTVQIPPSTTYAITPMKRPMEEDGEEKSPSKKKKKIQKKEEKAE
340 350 360 370 380 390
>>XP_011526287 (OMIM: 603182) PREDICTED: interleukin enh (777 aa)
initn: 969 init1: 666 opt: 988 Z-score: 407.9 bits: 86.5 E(85289): 5.6e-16
Smith-Waterman score: 1144; 53.3% identity (76.3% similar) in 334 aa overlap (548-864:9-342)
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 APPDWAQPLLMGRPESPASAPLQPGRRPASSDDRHVMCKHATIYPTEQELLAVQRAVSHA
.:::::: ::...:::..:: ::: :::.
XP_011 MRPMRIFVNDDRHVMAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHT
10 20 30
580 590 600 610 620
pF1KA1 ERALKLVSDTLAEEDRGRREE----------EGDKRSSVAPQ-----TRVLKGVMRVGIL
::::: ::: . :...: :. : :.. ... : ::.:.::::::..
XP_011 ERALKAVSDWIDEQEKGSSEQAESDNMDVPPEDDSKEGAGEQKTEHMTRTLRGVMRVGLV
40 50 60 70 80 90
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 AKGLLLRGDRNVRLALLCSEKPTHSLLRRIAQQLPRQLQMVTEDEYEV-SSDPEANIVIS
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XP_011 AKGLLLKGDLDLELVLLCKEKPTTALLDKVADNLAIQLAAVTEDKYEILQSVDDAAIVIK
100 110 120 130 140 150
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 SCEEPRMQVTISVTSPLMRED-PSTDPGVEEPQADAGDVLSPKKCLESLAALRHARWFQA
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XP_011 NTKEPPLSLTIHLTSPVVREEMEKVLAGETLSVNDPPDVLDRQKCLAALASLRHAKWFQA
160 170 180 190 200 210
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 RASGLQPCVIVIRVLRDLCRRVPTWGALPAWAMELLVEKAVSSAAGPLGPGDAVRRVLEC
::.::. :::::::::::: :::::: : .: .::: ::....: :.: :.:.::::::
XP_011 RANGLKSCVIVIRVLRDLCTRVPTWGPLRGWPLELLCEKSIGTANRPMGAGEALRRVLEC
220 230 240 250 260 270
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NP_036 LASGIVMPDGSGIYDPCEKEATDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDP
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pF1KA1 LPPRHRLGARFRKRQRGPGEGEEGAGEKKRGRRGGEGLV
:: .
NP_036 LPSKMPKKPKNENPVDYTVQIPPSTTYAITPMKRPMEEDGEEKSPSKKKKKIQKKEEKAE
340 350 360 370 380 390
>>XP_016882252 (OMIM: 603182) PREDICTED: interleukin enh (898 aa)
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pF1KA1 VATGTLLTDGPGLQDPCERDQTDALEPMTLQEREDVTASAQHALRMLAFRQTHKVLGMDL
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XP_016 LASGIVMPDGSGIYDPCEKEATDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDP
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pF1KA1 LPPRHRLGARFRKRQRGPGEGEEGAGEKKRGRRGGEGLV
:: .
XP_016 LPSKMPKKPKNENPVDYTVQIPPSTTYAITPMKRPMEEDGEEKSPSKKKKKIQKKEEKAE
340 350 360 370 380 390
>>NP_060090 (OMIM: 603182) interleukin enhancer-binding (898 aa)
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520 530 540 550 560 570
pF1KA1 APPDWAQPLLMGRPESPASAPLQPGRRPASSDDRHVMCKHATIYPTEQELLAVQRAVSHA
.:::::: ::...:::..:: ::: :::.
NP_060 MRPMRIFVNDDRHVMAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHT
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NP_060 AKGLLLKGDLDLELVLLCKEKPTTALLDKVADNLAIQLAAVTEDKYEILQSVDDAAIVIK
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NP_060 RANGLKSCVIVIRVLRDLCTRVPTWGPLRGWPLELLCEKSIGTANRPMGAGEALRRVLEC
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NP_060 LASGIVMPDGSGIYDPCEKEATDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDP
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pF1KA1 LPPRHRLGARFRKRQRGPGEGEEGAGEKKRGRRGGEGLV
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NP_060 LPSKMPKKPKNENPVDYTVQIPPSTTYAITPMKRPMEEDGEEKSPSKKKKKIQKKEEKAE
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>>XP_011526286 (OMIM: 603182) PREDICTED: interleukin enh (898 aa)
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pF1KA1 APPDWAQPLLMGRPESPASAPLQPGRRPASSDDRHVMCKHATIYPTEQELLAVQRAVSHA
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XP_011 MRPMRIFVNDDRHVMAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHT
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pF1KA1 ERALKLVSDTLAEEDRGRREE----------EGDKRSSVAPQ-----TRVLKGVMRVGIL
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XP_011 ERALKAVSDWIDEQEKGSSEQAESDNMDVPPEDDSKEGAGEQKTEHMTRTLRGVMRVGLV
40 50 60 70 80 90
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 AKGLLLRGDRNVRLALLCSEKPTHSLLRRIAQQLPRQLQMVTEDEYEV-SSDPEANIVIS
::::::.:: ...:.:::.:::: .:: ..:..: :: ::::.::. .: .: :::.
XP_011 AKGLLLKGDLDLELVLLCKEKPTTALLDKVADNLAIQLAAVTEDKYEILQSVDDAAIVIK
100 110 120 130 140 150
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 SCEEPRMQVTISVTSPLMRED-PSTDPGVEEPQADAGDVLSPKKCLESLAALRHARWFQA
. .:: ...:: .:::..::. .. : : :::. .::: .::.::::.::::
XP_011 NTKEPPLSLTIHLTSPVVREEMEKVLAGETLSVNDPPDVLDRQKCLAALASLRHAKWFQA
160 170 180 190 200 210
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 RASGLQPCVIVIRVLRDLCRRVPTWGALPAWAMELLVEKAVSSAAGPLGPGDAVRRVLEC
::.::. :::::::::::: :::::: : .: .::: ::....: :.: :.:.::::::
XP_011 RANGLKSCVIVIRVLRDLCTRVPTWGPLRGWPLELLCEKSIGTANRPMGAGEALRRVLEC
220 230 240 250 260 270
810 820 830 840 850 860
pF1KA1 VATGTLLTDGPGLQDPCERDQTDALEPMTLQEREDVTASAQHALRMLAFRQTHKVLGMDL
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XP_011 LASGIVMPDGSGIYDPCEKEATDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDP
280 290 300 310 320 330
870 880 890
pF1KA1 LPPRHRLGARFRKRQRGPGEGEEGAGEKKRGRRGGEGLV
:: .
XP_011 LPSKMPKKPKNENPVDYTVQIPPSTTYAITPMKRPMEEDGEEKSPSKKKKKIQKKEEKAE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]