Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1091
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1091, 1287 aa
1>>>pF1KA1091 1287 - 1287 aa - 1287 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6967+/-0.000938; mu= 15.6600+/- 0.057
mean_var=86.0225+/-17.508, 0's: 0 Z-trim(106.8): 54 B-trim: 13 in 1/50
Lambda= 0.138283
statistics sampled from 9121 (9175) to 9121 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16
Scan time: 5.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31423.1 DENND5A gene_id:23258|Hs108|chr11 (1287) 8655 1737.3 0
CCDS58119.1 DENND5A gene_id:23258|Hs108|chr11 (1241) 8182 1642.9 0
CCDS76542.1 DENND5B gene_id:160518|Hs108|chr12 (1309) 6155 1238.6 0
CCDS44857.1 DENND5B gene_id:160518|Hs108|chr12 (1274) 6128 1233.2 0
CCDS6491.3 DENND4C gene_id:55667|Hs108|chr9 (1909) 391 88.7 1.6e-16
CCDS83349.1 DENND4C gene_id:55667|Hs108|chr9 (1958) 391 88.7 1.7e-16
CCDS45285.1 DENND4A gene_id:10260|Hs108|chr15 (1863) 353 81.1 3e-14
CCDS53949.1 DENND4A gene_id:10260|Hs108|chr15 (1906) 353 81.1 3.1e-14
CCDS35134.1 DENND1A gene_id:57706|Hs108|chr9 ( 559) 325 75.4 4.8e-13
CCDS35133.1 DENND1A gene_id:57706|Hs108|chr9 (1009) 325 75.4 8.2e-13
CCDS44228.1 DENND4B gene_id:9909|Hs108|chr1 (1496) 318 74.1 3.1e-12
CCDS31427.1 SBF2 gene_id:81846|Hs108|chr11 (1849) 316 73.7 5e-12
CCDS14091.2 SBF1 gene_id:6305|Hs108|chr22 (1893) 312 72.9 8.9e-12
CCDS34947.1 DENND3 gene_id:22898|Hs108|chr8 (1198) 301 70.7 2.7e-11
CCDS7792.1 ST5 gene_id:6764|Hs108|chr11 ( 717) 295 69.4 3.8e-11
CCDS7791.1 ST5 gene_id:6764|Hs108|chr11 (1137) 295 69.5 5.8e-11
>>CCDS31423.1 DENND5A gene_id:23258|Hs108|chr11 (1287 aa)
initn: 8655 init1: 8655 opt: 8655 Z-score: 9323.0 bits: 1737.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8655; 99.9% identity (100.0% similar) in 1287 aa overlap (1-1287:1-1287)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSGGGGGGGSAPSRFADYFVICGLDTETGLEPDELSALCQYIQASKARDGASPFISSTTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSGGGGGGGSAPSRFADYFVICGLDTETGLEPDELSALCQYIQASKARDGASPFISSTTE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 GENFEQTPLRRTFKSKVLARYPENVEWNPFDQDAVGMLCMPKGLAFKTQADPREPQFHAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GENFEQTPLRRTFKSKVLARYPENVEWNPFDQDAVGMLCMPKGLAFKTQADPREPQFHAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 IITREDGSRTFGFALTFYEEVTSKQICSAMQTLYHMHNAEYDVLHAPPADDRDQSSMEDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IITREDGSRTFGFALTFYEEVTSKQICSAMQTLYHMHNAEYDVLHAPPADDRDQSSMEDG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 EDTPVTKLQRFNSYDISRDTLYVSKCICLITPMSFMKACRSVLQQLHQAVTSPQPPPLPL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS31 EDTPVTKLQRFNSYDISRDTLYVSKCICLITPMSFMKACRSVLEQLHQAVTSPQPPPLPL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ESYIYNVLYEVPLPPPGRSLKFSGVYGPIICQRPSTNELPLFDFPVKEVFELLGVENVFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ESYIYNVLYEVPLPPPGRSLKFSGVYGPIICQRPSTNELPLFDFPVKEVFELLGVENVFQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LFTCALLEFQILLYSQHYQRLMTVAETITALMFPFQWQHVYVPILPASLLHFLDAPVPYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LFTCALLEFQILLYSQHYQRLMTVAETITALMFPFQWQHVYVPILPASLLHFLDAPVPYL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 MGLHSNGLDDRSKLELPQEANLCFVDIDNHFIELPEDLPQFPNKLEFVQEVSEILMAFGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MGLHSNGLDDRSKLELPQEANLCFVDIDNHFIELPEDLPQFPNKLEFVQEVSEILMAFGI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 PPEGNLHCSESASKLKRLRASELVSDKRNGNIAGSPLHSYELLKENETIARLQALVKRTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PPEGNLHCSESASKLKRLRASELVSDKRNGNIAGSPLHSYELLKENETIARLQALVKRTG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 VSLEKLEVREDPSSNKDLKVQCDEEELRIYQLNIQIREVFANRFTQMFADYEVFVIQPSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VSLEKLEVREDPSSNKDLKVQCDEEELRIYQLNIQIREVFANRFTQMFADYEVFVIQPSQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 DKESWFTNREQMQNFDKASFLSDQPEPYLPFLSRFLETQMFASFIDNKIMCHDDDDKDPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DKESWFTNREQMQNFDKASFLSDQPEPYLPFLSRFLETQMFASFIDNKIMCHDDDDKDPV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 LRVFDSRVDKIRLLNVRTPTLRTSMYQKCTTVDEAEKAIELRLAKIDHTAIHPHLLDMKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LRVFDSRVDKIRLLNVRTPTLRTSMYQKCTTVDEAEKAIELRLAKIDHTAIHPHLLDMKI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 GQGKYEPGFFPKLQSDVLSTGPASNKWTKRNAPAQWRRKDRQKQHTEHLRLDNDQREKYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GQGKYEPGFFPKLQSDVLSTGPASNKWTKRNAPAQWRRKDRQKQHTEHLRLDNDQREKYI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 QEARTMGSTIRQPKLSNLSPSVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKRMLVEKMGREAVELGHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QEARTMGSTIRQPKLSNLSPSVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKRMLVEKMGREAVELGHG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 EVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLLHYQDNRQRKLTSGSLSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLLHYQDNRQRKLTSGSLSTS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 GILLDSERRKSDASSLMPPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVRLSMEKKLLSRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GILLDSERRKSDASSLMPPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVRLSMEKKLLSRH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 LKQLLSDHELTKKLYKRYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTILIPYHILI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LKQLLSDHELTKKLYKRYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTILIPYHILI
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 VPSKKLGGSMFTANPWICISGELGETQIMQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VPSKKLGGSMFTANPWICISGELGETQIMQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 YAKWLVEYVMVRNEITGHTYKFPCGRWLGKGMDDGSLERILVGELLTSQPEVDERPCRTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YAKWLVEYVMVRNEITGHTYKFPCGRWLGKGMDDGSLERILVGELLTSQPEVDERPCRTP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 PLQQSPSVIRRLVTISPNNKPKLNTGQIQESIGEAVNGIVKHFHKPEKERGSLTLLLCGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PLQQSPSVIRRLVTISPNNKPKLNTGQIQESIGEAVNGIVKHFHKPEKERGSLTLLLCGE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 CGLVSALEQAFQHGFKSPRLFKNVFIWDFLEKAQTYYETLEKNEVVPEENWHTRARNFCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CGLVSALEQAFQHGFKSPRLFKNVFIWDFLEKAQTYYETLEKNEVVPEENWHTRARNFCR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 FVTAINNTPRNIGKDGKFQMLVCLGARDHLLHHWIALLADCPITAHMYEDVALIKDHTLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FVTAINNTPRNIGKDGKFQMLVCLGARDHLLHHWIALLADCPITAHMYEDVALIKDHTLV
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280
pF1KA1 NSLIRVLQTLQEFNITLETSLVKGIDI
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NSLIRVLQTLQEFNITLETSLVKGIDI
1270 1280
>>CCDS58119.1 DENND5A gene_id:23258|Hs108|chr11 (1241 aa)
initn: 8182 init1: 8182 opt: 8182 Z-score: 8813.3 bits: 1642.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8182; 99.9% identity (100.0% similar) in 1215 aa overlap (1-1215:1-1215)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSGGGGGGGSAPSRFADYFVICGLDTETGLEPDELSALCQYIQASKARDGASPFISSTTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSGGGGGGGSAPSRFADYFVICGLDTETGLEPDELSALCQYIQASKARDGASPFISSTTE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 GENFEQTPLRRTFKSKVLARYPENVEWNPFDQDAVGMLCMPKGLAFKTQADPREPQFHAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GENFEQTPLRRTFKSKVLARYPENVEWNPFDQDAVGMLCMPKGLAFKTQADPREPQFHAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 IITREDGSRTFGFALTFYEEVTSKQICSAMQTLYHMHNAEYDVLHAPPADDRDQSSMEDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IITREDGSRTFGFALTFYEEVTSKQICSAMQTLYHMHNAEYDVLHAPPADDRDQSSMEDG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 EDTPVTKLQRFNSYDISRDTLYVSKCICLITPMSFMKACRSVLQQLHQAVTSPQPPPLPL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS58 EDTPVTKLQRFNSYDISRDTLYVSKCICLITPMSFMKACRSVLEQLHQAVTSPQPPPLPL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ESYIYNVLYEVPLPPPGRSLKFSGVYGPIICQRPSTNELPLFDFPVKEVFELLGVENVFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ESYIYNVLYEVPLPPPGRSLKFSGVYGPIICQRPSTNELPLFDFPVKEVFELLGVENVFQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LFTCALLEFQILLYSQHYQRLMTVAETITALMFPFQWQHVYVPILPASLLHFLDAPVPYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LFTCALLEFQILLYSQHYQRLMTVAETITALMFPFQWQHVYVPILPASLLHFLDAPVPYL
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pF1KA1 MGLHSNGLDDRSKLELPQEANLCFVDIDNHFIELPEDLPQFPNKLEFVQEVSEILMAFGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MGLHSNGLDDRSKLELPQEANLCFVDIDNHFIELPEDLPQFPNKLEFVQEVSEILMAFGI
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pF1KA1 PPEGNLHCSESASKLKRLRASELVSDKRNGNIAGSPLHSYELLKENETIARLQALVKRTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PPEGNLHCSESASKLKRLRASELVSDKRNGNIAGSPLHSYELLKENETIARLQALVKRTG
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pF1KA1 VSLEKLEVREDPSSNKDLKVQCDEEELRIYQLNIQIREVFANRFTQMFADYEVFVIQPSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VSLEKLEVREDPSSNKDLKVQCDEEELRIYQLNIQIREVFANRFTQMFADYEVFVIQPSQ
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pF1KA1 DKESWFTNREQMQNFDKASFLSDQPEPYLPFLSRFLETQMFASFIDNKIMCHDDDDKDPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DKESWFTNREQMQNFDKASFLSDQPEPYLPFLSRFLETQMFASFIDNKIMCHDDDDKDPV
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pF1KA1 LRVFDSRVDKIRLLNVRTPTLRTSMYQKCTTVDEAEKAIELRLAKIDHTAIHPHLLDMKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LRVFDSRVDKIRLLNVRTPTLRTSMYQKCTTVDEAEKAIELRLAKIDHTAIHPHLLDMKI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 GQGKYEPGFFPKLQSDVLSTGPASNKWTKRNAPAQWRRKDRQKQHTEHLRLDNDQREKYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GQGKYEPGFFPKLQSDVLSTGPASNKWTKRNAPAQWRRKDRQKQHTEHLRLDNDQREKYI
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730 740 750 760 770 780
pF1KA1 QEARTMGSTIRQPKLSNLSPSVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKRMLVEKMGREAVELGHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QEARTMGSTIRQPKLSNLSPSVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKRMLVEKMGREAVELGHG
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pF1KA1 EVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLLHYQDNRQRKLTSGSLSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLLHYQDNRQRKLTSGSLSTS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 GILLDSERRKSDASSLMPPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVRLSMEKKLLSRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GILLDSERRKSDASSLMPPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVRLSMEKKLLSRH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 LKQLLSDHELTKKLYKRYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTILIPYHILI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LKQLLSDHELTKKLYKRYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTILIPYHILI
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 VPSKKLGGSMFTANPWICISGELGETQIMQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VPSKKLGGSMFTANPWICISGELGETQIMQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 YAKWLVEYVMVRNEITGHTYKFPCGRWLGKGMDDGSLERILVGELLTSQPEVDERPCRTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YAKWLVEYVMVRNEITGHTYKFPCGRWLGKGMDDGSLERILVGELLTSQPEVDERPCRTP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 PLQQSPSVIRRLVTISPNNKPKLNTGQIQESIGEAVNGIVKHFHKPEKERGSLTLLLCGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PLQQSPSVIRRLVTISPNNKPKLNTGQIQESIGEAVNGIVKHFHKPEKERGSLTLLLCGE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 CGLVSALEQAFQHGFKSPRLFKNVFIWDFLEKAQTYYETLEKNEVVPEENWHTRARNFCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CGLVSALEQAFQHGFKSPRLFKNVFIWDFLEKAQTYYETLEKNEVVPEENWHTRARNFCR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 FVTAINNTPRNIGKDGKFQMLVCLGARDHLLHHWIALLADCPITAHMYEDVALIKDHTLV
:::::::::::::::
CCDS58 FVTAINNTPRNIGKDEITSYTTGLPCWLTAPSLHTCMRMWH
1210 1220 1230 1240
>>CCDS76542.1 DENND5B gene_id:160518|Hs108|chr12 (1309 aa)
initn: 3486 init1: 2692 opt: 6155 Z-score: 6627.4 bits: 1238.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6155; 71.7% identity (89.6% similar) in 1264 aa overlap (38-1287:57-1309)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 GGSAPSRFADYFVICGLDTETGLEPDELSALCQYIQASKARDGASPFISSTTEGENFEQT
: :...:. : : : ..:: ::::.:.
CCDS76 LELLTSSNSPASASRSAEITVVSQHAQPGFLYQWLEAD--RHGKSQGAANTTSGENFDQS
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70 80 90 100 110 120
pF1KA1 PLRRTFKSKVLARYPENVEWNPFDQDAVGMLCMPKGLAFKTQADPREPQFHAFIITREDG
::::::::::::.::.:.::::::::::.::::::::.:.::.: ..::::.::::::::
CCDS76 PLRRTFKSKVLAHYPQNIEWNPFDQDAVNMLCMPKGLSFRTQTDNKDPQFHSFIITREDG
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 SRTFGFALTFYEEVTSKQICSAMQTLYHMHNAE-YDVLHAPPADDRDQ--SSMEDGEDTP
:::.::.:::::::::::::.::::::.::::: :. ..: . . :. ::...:. :
CCDS76 SRTYGFVLTFYEEVTSKQICTAMQTLYQMHNAEHYSSVYASSSCSMDSLASSLDEGDTTS
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 VTKLQRFNSYDISRDTLYVSKCICLITPMSFMKACRSVLQQLHQAVTSPQPPPLPLESYI
. ::::.:::::::::::::: ::::::. ::.::.. : ::..:::: :::::::::::
CCDS76 LLKLQRYNSYDISRDTLYVSKSICLITPLPFMQACKKFLIQLYKAVTSQQPPPLPLESYI
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 YNVLYEVPLPPPGRSLKFSGVYGPIICQRPSTNELPLFDFPVKEVFELLGVENVFQLFTC
.:.::::::::::::::: ::: :.:::::. .:::: :.:..:.:::::.::. :.:::
CCDS76 HNILYEVPLPPPGRSLKFYGVYEPVICQRPGPSELPLSDYPLREAFELLGLENLVQVFTC
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 ALLEFQILLYSQHYQRLMTVAETITALMFPFQWQHVYVPILPASLLHFLDAPVPYLMGLH
.:::.::::::: ::::::::: ::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS76 VLLEMQILLYSQDYQRLMTVAEGITTLLFPFQWQHVYVPILPASLLHFLDAPVPYLMGLQ
330 340 350 360 370 380
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 SNGLDDRSKLELPQEANLCFVDIDNHFIELPEDLPQFPNKLEFVQEVSEILMAFGIPPEG
:. :::::::::::::::::::::::::::..::::::..:.::.::.:. :::::::
CCDS76 SKEGTDRSKLELPQEANLCFVDIDNHFIELPEEFPQFPNKVDFIQELSEVLVQFGIPPEG
390 400 410 420 430 440
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NLHCSESASKLKRLRASELVSDKRNGNIAGSPLHSYELLKENETIARLQALVKRTGVSLE
.::::::.:::: . ..::.::.:::. . . ::::: ::::::::::.:::::..:
CCDS76 SLHCSESTSKLKNMVLKDLVNDKKNGNVCTNNISMYELLKGNETIARLQALAKRTGVAVE
450 460 470 480 490 500
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 KLEVRED-PSSNKDLKVQCDEEELRIYQLNIQIREVFANRFTQMFADYEVFVIQPSQDKE
:... . ..::::..:.: ::: ::::.:.::::::::::::::::.:::: .:: :
CCDS76 KMDLSASLGEKDKDLKLHCEEAELRDYQLNVQLREVFANRFTQMFADYEAFVIQTAQDME
510 520 530 540 550 560
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SWFTNREQMQNFDKASFLSDQPEPYLPFLSRFLETQMFASFIDNKIMCHDDDDKDPVLRV
::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::::.::::::: . .. :::.:::
CCDS76 SWLTNREQMQNFDKASFLSDQPEPYLPFLSRFIETQMFATFIDNKIMSQWEE-KDPLLRV
570 580 590 600 610 620
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 FDSRVDKIRLLNVRTPTLRTSMYQKCTTVDEAEKAIELRLAKIDHTAIHPHLLDMKIGQG
::.:.::::: :::.::::::.::::.:. :: ..:: :: :.:::::::::::::::::
CCDS76 FDTRIDKIRLYNVRAPTLRTSIYQKCSTLKEAAQSIEQRLMKMDHTAIHPHLLDMKIGQG
630 640 650 660 670 680
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 KYEPGFFPKLQSDVLSTGPASN-KWTKRNAPAQWRRKDRQKQHTEHLRLDNDQREKYIQE
::: :::::::::::.:::.:: .:..:.: :: :::.: .::.::. :::: ::::.::
CCDS76 KYEQGFFPKLQSDVLATGPTSNNRWVSRSATAQ-RRKERLRQHSEHVGLDNDLREKYMQE
690 700 710 720 730 740
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 ARTMGSTIRQPKLSNLSPSVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKRMLVEKMGREAVELGHGEV
::..:...::::::.:::.:::::: ::::::::::: :::::::::::.:::::::::.
CCDS76 ARSLGKNLRQPKLSDLSPAVIAQTNCKFVEGLLKECRMKTKRMLVEKMGHEAVELGHGEA
750 760 770 780 790 800
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 NITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLLHYQDNRQRKLTSGSLSTSGI
::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::...:: .... :. : .
CCDS76 NITGLEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLIQFQDREEKQE---HLAESPV
810 820 830 840 850
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 LLDSERRKSDASSLMPPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVRLSMEKKLLSRHLK
: ::::::.. ..: ::.:::::::::::..:::::::.::::.:::.::::::.:::
CCDS76 ALGPERRKSDSGVMLPTLRVSLIQDMRHIQNMSEIKTDVGRARAWIRLSLEKKLLSQHLK
860 870 880 890 900 910
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 QLLSDHELTKKLYKRYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTILIPYHILIVP
::::.. ::::::::::::::..:.:::::::::.:::::::::.:::::.:::. .:.:
CCDS76 QLLSNQPLTKKLYKRYAFLRCEEEREQFLYHLLSLNAVDYFCFTSVFTTIMIPYRSVIIP
920 930 940 950 960 970
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 SKKLGGSMFTANPWICISGELGETQIMQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGLYA
:::.....:.:::::.:::::.: .::::.:.::::::::::::::::::::::::: :
CCDS76 IKKLSNAIITSNPWICVSGELGDTGVMQIPKNLLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGLLA
980 990 1000 1010 1020 1030
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 KWLVEYVMVRNEITGHTYKFPCGRWLGKGMDDGSLERILVGELLTSQPEVDE-RPCRTPP
::::. ::::::::::::.::::::::::.:::::::::.:::.:: . : . :::::
CCDS76 KWLVDCVMVRNEITGHTYRFPCGRWLGKGIDDGSLERILIGELMTSASDEDLVKQCRTPP
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA1 LQQSPSVIRRLVTIS---PNNKPKLNTGQIQESIGEAVNGIVKHFHKPEKERGSLTLLLC
:.::.. ::: : :::: :.:::::.::::::.::::::::::::::::.:::
CCDS76 QQKSPTTARRLSITSLTGKNNKP--NAGQIQEGIGEAVNNIVKHFHKPEKERGSLTVLLC
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA1 GECGLVSALEQAFQHGFKSPRLF-KNVFIWDFLEKAQTYYETLEKNEVVPEEN----WHT
:: :::.::::.:.::::: :.: ::::::::.::. .:.:: . ... .:. ..
CCDS76 GENGLVAALEQVFHHGFKSARIFHKNVFIWDFIEKVVAYFETTD--QILDNEDDVLIQKS
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA1 RARNFCRFVTAINNTPRNIGKDGKFQMLVCLGARDHLLHHWIALLADCPITAHMYEDVAL
..::..:.:::..:::::::::::.:::::.::.:: .:: :::.:: ..:::. ::
CCDS76 SCKTFCHYVNAINTAPRNIGKDGKFQILVCLGTRDRLLPQWIPLLAECPAITRMYEESAL
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1260 1270 1280
pF1KA1 IKDHTLVNSLIRVLQTLQEFNITLETSLVKGIDI
..:. ::::::.:::.:.:.:.:: ::.::.:.
CCDS76 LRDRMTVNSLIRILQTIQDFTIVLEGSLIKGVDV
1280 1290 1300
>>CCDS44857.1 DENND5B gene_id:160518|Hs108|chr12 (1274 aa)
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Smith-Waterman score: 6221; 70.5% identity (88.2% similar) in 1307 aa overlap (1-1287:1-1274)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MSGG----GGGGGSAPS--RFADYFVICGLDTETGLEPDELSALCQYIQASKARDGASPF
:::. : :.::.:. ::: :::.::.:...:::::::.
CCDS44 MSGSCAAPGPGSGSSPAACRFAHYFVLCGIDADSGLEPDELA------------------
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 ISSTTEGENFEQTPLRRTFKSKVLARYPENVEWNPFDQDAVGMLCMPKGLAFKTQADPRE
::::.:.::::::::::::.::.:.::::::::::.::::::::.:.::.: ..
CCDS44 ------GENFDQSPLRRTFKSKVLAHYPQNIEWNPFDQDAVNMLCMPKGLSFRTQTDNKD
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pF1KA1 PQFHAFIITREDGSRTFGFALTFYEEVTSKQICSAMQTLYHMHNAE-YDVLHAPPADDRD
::::.:::::::::::.::.:::::::::::::.::::::.::::: :. ..: . . :
CCDS44 PQFHSFIITREDGSRTYGFVLTFYEEVTSKQICTAMQTLYQMHNAEHYSSVYASSSCSMD
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pF1KA1 Q--SSMEDGEDTPVTKLQRFNSYDISRDTLYVSKCICLITPMSFMKACRSVLQQLHQAVT
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CCDS44 SLASSLDEGDTTSLLKLQRYNSYDISRDTLYVSKSICLITPLPFMQACKKFLIQLYKAVT
160 170 180 190 200 210
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pF1KA1 SPQPPPLPLESYIYNVLYEVPLPPPGRSLKFSGVYGPIICQRPSTNELPLFDFPVKEVFE
: :::::::::::.:.::::::::::::::: ::: :.:::::. .:::: :.:..:.::
CCDS44 SQQPPPLPLESYIHNILYEVPLPPPGRSLKFYGVYEPVICQRPGPSELPLSDYPLREAFE
220 230 240 250 260 270
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pF1KA1 LLGVENVFQLFTCALLEFQILLYSQHYQRLMTVAETITALMFPFQWQHVYVPILPASLLH
:::.::. :.:::.:::.::::::: ::::::::: ::.:.:::::::::::::::::::
CCDS44 LLGLENLVQVFTCVLLEMQILLYSQDYQRLMTVAEGITTLLFPFQWQHVYVPILPASLLH
280 290 300 310 320 330
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pF1KA1 FLDAPVPYLMGLHSNGLDDRSKLELPQEANLCFVDIDNHFIELPEDLPQFPNKLEFVQEV
::::::::::::.:. :::::::::::::::::::::::::::..::::::..:.::.
CCDS44 FLDAPVPYLMGLQSKEGTDRSKLELPQEANLCFVDIDNHFIELPEEFPQFPNKVDFIQEL
340 350 360 370 380 390
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pF1KA1 SEILMAFGIPPEGNLHCSESASKLKRLRASELVSDKRNGNIAGSPLHSYELLKENETIAR
::.:. :::::::.::::::.:::: . ..::.::.:::. . . ::::: ::::::
CCDS44 SEVLVQFGIPPEGSLHCSESTSKLKNMVLKDLVNDKKNGNVCTNNISMYELLKGNETIAR
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pF1KA1 LQALVKRTGVSLEKLEVRED-PSSNKDLKVQCDEEELRIYQLNIQIREVFANRFTQMFAD
::::.:::::..::... . ..::::..:.: ::: ::::.:.::::::::::::::
CCDS44 LQALAKRTGVAVEKMDLSASLGEKDKDLKLHCEEAELRDYQLNVQLREVFANRFTQMFAD
460 470 480 490 500 510
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pF1KA1 YEVFVIQPSQDKESWFTNREQMQNFDKASFLSDQPEPYLPFLSRFLETQMFASFIDNKIM
::.:::: .:: :::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::
CCDS44 YEAFVIQTAQDMESWLTNREQMQNFDKASFLSDQPEPYLPFLSRFIETQMFATFIDNKIM
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pF1KA1 CHDDDDKDPVLRVFDSRVDKIRLLNVRTPTLRTSMYQKCTTVDEAEKAIELRLAKIDHTA
. .. :::.:::::.:.::::: :::.::::::.::::.:. :: ..:: :: :.::::
CCDS44 SQWEE-KDPLLRVFDTRIDKIRLYNVRAPTLRTSIYQKCSTLKEAAQSIEQRLMKMDHTA
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pF1KA1 IHPHLLDMKIGQGKYEPGFFPKLQSDVLSTGPASN-KWTKRNAPAQWRRKDRQKQHTEHL
:::::::::::::::: :::::::::::.:::.:: .:..:.: :: :::.: .::.::.
CCDS44 IHPHLLDMKIGQGKYEQGFFPKLQSDVLATGPTSNNRWVSRSATAQ-RRKERLRQHSEHV
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pF1KA1 RLDNDQREKYIQEARTMGSTIRQPKLSNLSPSVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKRMLVEK
:::: ::::.::::..:...::::::.:::.:::::: ::::::::::: :::::::::
CCDS44 GLDNDLREKYMQEARSLGKNLRQPKLSDLSPAVIAQTNCKFVEGLLKECRMKTKRMLVEK
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pF1KA1 MGREAVELGHGEVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLLHYQDNRQ
::.:::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::...:: ..
CCDS44 MGHEAVELGHGEANITGLEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLIQFQDREE
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pF1KA1 RKLTSGSLSTSGILLDSERRKSDASSLMPPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVR
.. :. : . : ::::::.. ..: ::.:::::::::::..:::::::.::::.:
CCDS44 KQ---EHLAESPVALGPERRKSDSGVMLPTLRVSLIQDMRHIQNMSEIKTDVGRARAWIR
820 830 840 850 860 870
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pF1KA1 LSMEKKLLSRHLKQLLSDHELTKKLYKRYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVF
::.::::::.:::::::.. ::::::::::::::..:.:::::::::.:::::::::.::
CCDS44 LSLEKKLLSQHLKQLLSNQPLTKKLYKRYAFLRCEEEREQFLYHLLSLNAVDYFCFTSVF
880 890 900 910 920 930
950 960 970 980 990 1000
pF1KA1 TTILIPYHILIVPSKKLGGSMFTANPWICISGELGETQIMQIPRNVLEMTFECQNLGKLT
:::.:::. .:.: :::.....:.:::::.:::::.: .::::.:.::::::::::::::
CCDS44 TTIMIPYRSVIIPIKKLSNAIITSNPWICVSGELGDTGVMQIPKNLLEMTFECQNLGKLT
940 950 960 970 980 990
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA1 TVQIGHDNSGLYAKWLVEYVMVRNEITGHTYKFPCGRWLGKGMDDGSLERILVGELLTSQ
::::::::::: :::::. ::::::::::::.::::::::::.:::::::::.:::.::
CCDS44 TVQIGHDNSGLLAKWLVDCVMVRNEITGHTYRFPCGRWLGKGIDDGSLERILIGELMTSA
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA1 PEVDE-RPCRTPPLQQSPSVIRRLVTIS---PNNKPKLNTGQIQESIGEAVNGIVKHFHK
. : . ::::: :.::.. ::: : :::: :.:::::.::::::.:::::::
CCDS44 SDEDLVKQCRTPPQQKSPTTARRLSITSLTGKNNKP--NAGQIQEGIGEAVNNIVKHFHK
1060 1070 1080 1090 1100
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA1 PEKERGSLTLLLCGECGLVSALEQAFQHGFKSPRLF-KNVFIWDFLEKAQTYYETLEKNE
:::::::::.::::: :::.::::.:.::::: :.: ::::::::.::. .:.:: . .
CCDS44 PEKERGSLTVLLCGENGLVAALEQVFHHGFKSARIFHKNVFIWDFIEKVVAYFETTD--Q
1110 1120 1130 1140 1150 1160
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pF1KA1 VVPEEN----WHTRARNFCRFVTAINNTPRNIGKDGKFQMLVCLGARDHLLHHWIALLAD
.. .:. .. ..::..:.:::..:::::::::::.:::::.::.:: .:: :::.
CCDS44 ILDNEDDVLIQKSSCKTFCHYVNAINTAPRNIGKDGKFQILVCLGTRDRLLPQWIPLLAE
1170 1180 1190 1200 1210 1220
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pF1KA1 CPITAHMYEDVALIKDHTLVNSLIRVLQTLQEFNITLETSLVKGIDI
:: ..:::. ::..:. ::::::.:::.:.:.:.:: ::.::.:.
CCDS44 CPAITRMYEESALLRDRMTVNSLIRILQTIQDFTIVLEGSLIKGVDV
1230 1240 1250 1260 1270
>>CCDS6491.3 DENND4C gene_id:55667|Hs108|chr9 (1909 aa)
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pF1KA1 QASKARDGASPFISSTTEGENFEQTPLRRTFKSKVLARYPE-NVEWNPFDQDAVGMLCMP
.:. .. :::: . : :.... : ..:.:
CCDS64 KVDKNLNCGMWGSSVFLCYKKSVPASNAIAYKAGLIFRYPEEDYESFPLSESDVPLFCLP
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pF1KA1 KGLAFKTQADPRE----PQFHAFIITREDGSRTFGFALTFYEEVTSKQICSAMQTLYHMH
: ... ::. : : .:..: ......: :. ::: :... : : :.:.
CCDS64 MGATIECW-DPETKYPLPVFSTFVLTGSSAKKVYGAAIQFYEPY-SRELLSEKQ-LMHL-
240 250 260 270 280 290
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pF1KA1 NAEYDVLHAPPADDRDQSSMEDGEDTPVTKLQRFNSYDISRDTLYVSKCICLITPMSFMK
: ::: . . .:. .. ..:::::.. :..
CCDS64 ----------------------GLLTPVERKM------VSK-SINTNKCICLLSHWPFFE
300 310 320
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 ACRSVLQQLHQAVTSPQPPPLPLESYIYNVLYEVPLPPPGRS--LKFSGVYGPIICQRPS
: :. :. ... .: : :::.:..: . . ..:.: : : : .:. .: ..:
CCDS64 AFRKFLMFIYKLSVSG-PHPLPIEKHISHFMQNIPFPSPQRPRILVQLSVHDALILSQPV
330 340 350 360 370 380
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 TNELPLFDFPVKEVFELLGVENVFQLFTCALLEFQILLYSQHYQRLMTVAETITALMFPF
.. ::: . .. :: :: :. .::: .:::.: . : :::...:..:::
CCDS64 STPLPLSGANFSTLLMNLGPENCATLLLFVLLESKILLHSLRPAVLTGVAEAVVAMIFPF
390 400 410 420 430 440
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 QWQHVYVPILPASLLHFLDAPVPYLMGLHSNGLDDRSKLELPQEANLCFVDIDNHFIELP
::: :.:. : :: :.::.:...:. : .: :. : . .: .:.:.... .
CCDS64 QWQCPYIPLCPLSLAAVLSAPLPFIVGVDSRYFD----LHDPPQDVVC-IDLDTNMLYVS
450 460 470 480 490
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 EDLPQFPNKLEFVQEVSEILMAFGIPPEGNLHCSESASKLKRLRASELVSDKRNGNIAGS
.. ..... : .: . :.. : ::.: . :
CCDS64 DE----KKNMNWKQ----------LPKKP---CKNLLSTLKKLYPQL------------S
500 510 520
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 PLHSYELLKENETIARLQALVKRTGVSLEKLEVREDPSSNKDLKVQCDEEELRIYQLNIQ
.:. : .: : ... .. : : .: .. ::...
CCDS64 SVHQ----KTQE------------GSAIDMTPIEADFSWQK-----------KMTQLEME
530 540 550 560
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 IREVFANRFTQMFADYEVFVIQPSQDKESWFTNREQMQNFDKASFLSDQPEPYLPFLSRF
:.:.: ..... :.... .. . : ... ::. .::... . : : . .
CCDS64 IQEAFLRFMASILKGYRTYLRPITEAPSNKATAADSL--FDRQGFLKSRDRAYAKFYTLL
570 580 590 600 610
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 LETQMFASFIDNKIMCHDDDDKDPVLRVFDSRVDKIRLLNVRTPTLRTSMYQKCTTVDEA
.::.: ::.. : .::: : ::. ..:. : : .: . : :
CCDS64 SKTQIFIRFIEE---CSFVSDKDTGLAFFDDCIEKL------FPDKGTEKTDK-VDFDSA
620 630 640 650 660
640 650 660 670
pF1KA1 E--KAIELRLA-KIDHTAI----HPHLLDMKIGQGKYEPGFFPKLQSDVL----------
: . ::: . : .::.. .: : : . :: .::.:. ..
CCDS64 EDTRLIELDDSQKSEHTVFIMPPEPPPDDGKDLSPKYSYKYFPRLDLKLFDRPQELKLCF
670 680 690 700 710 720
680 690 700 710 720 730
pF1KA1 STGPASNKWTKRNAPAQWRRKDRQKQHTEHLRLDNDQREKYIQEARTMGSTIRQPKLSNL
: :..:. :: .: .. .:. .: :
CCDS64 SRHPTGNSITK--SPPLMAKRTKQEIKTAHKLAKRCYTNPPQWAKCLFSHCYSLWFICLP
730 740 750 760 770 780
>>CCDS83349.1 DENND4C gene_id:55667|Hs108|chr9 (1958 aa)
initn: 442 init1: 246 opt: 391 Z-score: 409.8 bits: 88.7 E(32554): 1.7e-16
Smith-Waterman score: 542; 25.6% identity (52.9% similar) in 660 aa overlap (73-708:207-757)
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 QASKARDGASPFISSTTEGENFEQTPLRRTFKSKVLARYPE-NVEWNPFDQDAVGMLCMP
.:. .. :::: . : :.... : ..:.:
CCDS83 KVDKNLNCGMWGSSVFLCYKKSVPASNAIAYKAGLIFRYPEEDYESFPLSESDVPLFCLP
180 190 200 210 220 230
110 120 130 140 150
pF1KA1 KGLAFKTQADPRE----PQFHAFIITREDGSRTFGFALTFYEEVTSKQICSAMQTLYHMH
: ... ::. : : .:..: ......: :. ::: :... : : :.:.
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: ::: . . .:. .. ..:::::.. :..
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: :. :. ... .: : :::.:..: . . ..:.: : : : .:. .: ..:
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pF1KA1 TNELPLFDFPVKEVFELLGVENVFQLFTCALLEFQILLYSQHYQRLMTVAETITALMFPF
.. ::: . .. :: :: :. .::: .:::.: . : :::...:..:::
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.. ..... : .: . :.. : ::.: . :
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.:. : .: : ... .. : : .: .. ::...
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:.:.: ..... :.... .. . : ... ::. .::... . : : . .
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: . ::: . : .::.. .: : : . :: .::.:. ..
CCDS83 EDTRLIELDDSQKSEHTVFIMPPEPPPDDGKDLSPKYSYKYFPRLDLKLFDRPQELKLCF
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CCDS53 LEIQEAFLFFMASILKGYRSY-LRPITQAPSE-TATDAASLFALQAFLRSRDRSHQKFYN
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CCDS35 LPWFEVFYKLLNILADYTTKRQENQW---NELLETLHKLPIPDPGVSVHLS-VHSYFTV-
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CCDS35 TLETPFDDLQSLPNDVISSLKNRLKKVSTTTGDGVARAFLKAQAAFFGSYRNALKIEPEE
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CCDS35 LPWFEVFYKLLNILADYTTKRQENQW---NELLETLHKLPIPDPGVSVHLS-VHSYFTV-
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CCDS35 -PDTRELPSIPENRNLTEYFVAVDVNNMLHLYASMLYERRILIICSKLSTLTACIHGSAA
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CCDS35 MLYPMYWQHVYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHLSLMEKVRNMALD---DVVILNVDTN
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CCDS35 TLETPFDDLQSLPNDVISSLKNRLKKVSTTTGDGVARAFLKAQAAFFGSYRNALKIEPEE
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1287 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 01:20:32 2016 done: Fri Nov 4 01:20:33 2016
Total Scan time: 5.450 Total Display time: 0.490
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]