Result of FASTA (ccds) for pF1KA1106
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1106, 1132 aa
  1>>>pF1KA1106 1132 - 1132 aa - 1132 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8725+/-0.00111; mu= 7.4809+/- 0.067
 mean_var=215.8316+/-42.459, 0's: 0 Z-trim(110.7): 18  B-trim: 32 in 1/51
 Lambda= 0.087300
 statistics sampled from 11776 (11784) to 11776 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.684), E-opt: 0.2 (0.362), width:  16
 Scan time:  5.510

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS46222.1 MYT1L gene_id:23040|Hs108|chr2         (1184) 6985 893.5       0
CCDS77378.1 MYT1L gene_id:23040|Hs108|chr2         (1186) 6971 891.8       0
CCDS13558.1 MYT1 gene_id:4661|Hs108|chr20          (1121) 2910 380.3 1.4e-104
CCDS6149.1 ST18 gene_id:9705|Hs108|chr8            (1047) 2249 297.0 1.5e-79


>>CCDS46222.1 MYT1L gene_id:23040|Hs108|chr2              (1184 aa)
 initn: 6955 init1: 6955 opt: 6985  Z-score: 4764.6  bits: 893.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7431; 95.5% identity (95.5% similar) in 1164 aa overlap (21-1132:21-1184)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MEVDTEEKRHRTRSKGVRVPVEPAIQELFSCPTPGCDGSGHVSGKYARHRSVYGCPLAKK
                           ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MEVDTEEKRHRTRSKGVRVPVEPAIQELFSCPTPGCDGSGHVSGKYARHRSVYGCPLAKK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100                    
pF1KA1 RKTQDKQPQEPAPKRKPFAVKADSSSVDECDDSDGTEDMDEKEEDEGEE-----------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::           
CCDS46 RKTQDKQPQEPAPKRKPFAVKADSSSVDECDDSDGTEDMDEKEEDEGEEYSEDNDEPGDE
               70        80        90       100       110       120

                                              110       120        
pF1KA1 -----------------------------------------EEEEEENEDHQMNCHNTRI
                                                :::::::::::::::::::
CCDS46 DEEDEEGDREEEEEIEEEDEDDDEDGEDVEDEEEEEEEEEEEEEEEENEDHQMNCHNTRI
              130       140       150       160       170       180

      130       140       150       160       170       180        
pF1KA1 MQDTEKDDNNNDEYDNYDELVAKSLLNLGKIAEDAAYRARTESEMNSNTSNSLEDDSDKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MQDTEKDDNNNDEYDNYDELVAKSLLNLGKIAEDAAYRARTESEMNSNTSNSLEDDSDKN
              190       200       210       220       230       240

      190       200       210       220       230       240        
pF1KA1 ENLGRKSELSLDLDSDVVRETVDSLKLLAQGHGVVLSENMNDRNYADSMSQQDSRNMNYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ENLGRKSELSLDLDSDVVRETVDSLKLLAQGHGVVLSENMNDRNYADSMSQQDSRNMNYV
              250       260       270       280       290       300

      250       260       270       280       290       300        
pF1KA1 MLGKPMNNGLMEKMVEESDEEVCLSSLECLRNQCFDLARKLSETNPQERNPQQNMNIRQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MLGKPMNNGLMEKMVEESDEEVCLSSLECLRNQCFDLARKLSETNPQERNPQQNMNIRQH
              310       320       330       340       350       360

      310       320       330       340       350       360        
pF1KA1 VRPEEDFPGRTPDRNYSDMLNLMRLEEQLSPRSRVFASCAKEDGCHERDDDTTSVNSDRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VRPEEDFPGRTPDRNYSDMLNLMRLEEQLSPRSRVFASCAKEDGCHERDDDTTSVNSDRS
              370       380       390       400       410       420

      370       380       390       400       410       420        
pF1KA1 EEVFDMTKGNLTLLEKAIALETERAKAMREKMAMEAGRRDNMRSYEDQSPRQLPGEDRKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EEVFDMTKGNLTLLEKAIALETERAKAMREKMAMEAGRRDNMRSYEDQSPRQLPGEDRKP
              430       440       450       460       470       480

      430       440       450       460       470       480        
pF1KA1 KSSDSHVKKPYYDPSRTEKKESKCPTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGCPHKDRVPPEILA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KSSDSHVKKPYYDPSRTEKKESKCPTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGCPHKDRVPPEILA
              490       500       510       520       530       540

      490       500       510       520       530       540        
pF1KA1 MHESVLKCPTPGCTGRGHVNSNRNSHRSLSGCPIAAAEKLAKAQEKHQSCDVSKSSQASD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MHESVLKCPTPGCTGRGHVNSNRNSHRSLSGCPIAAAEKLAKAQEKHQSCDVSKSSQASD
              550       560       570       580       590       600

      550       560       570       580       590       600        
pF1KA1 RVLRPMCFVKQLEIPQYGYRNNVPTTTPRSNLAKELEKYSKTSFEYNSYDNHTYGKRAIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RVLRPMCFVKQLEIPQYGYRNNVPTTTPRSNLAKELEKYSKTSFEYNSYDNHTYGKRAIA
              610       620       630       640       650       660

      610       620       630       640       650       660        
pF1KA1 PKVQTRDISPKGYDDAKRYCKDPSPSSSSTSSYAPSSSSNLSCGGGSSASSTCSKSSFDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PKVQTRDISPKGYDDAKRYCKDPSPSSSSTSSYAPSSSSNLSCGGGSSASSTCSKSSFDY
              670       680       690       700       710       720

      670       680       690       700       710       720        
pF1KA1 THDMEAAHMAATAILNLSTRCREMPQNLSTKPQDLCATRNPDMEVDENGTLDLSMNKQRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 THDMEAAHMAATAILNLSTRCREMPQNLSTKPQDLCATRNPDMEVDENGTLDLSMNKQRP
              730       740       750       760       770       780

      730       740       750       760       770       780        
pF1KA1 RDSCCPILTPLEPMSPQQQAVMNNRCFQLGEGDCWDLPVDYTKMKPRRIDEDESKDITPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RDSCCPILTPLEPMSPQQQAVMNNRCFQLGEGDCWDLPVDYTKMKPRRIDEDESKDITPE
              790       800       810       820       830       840

      790       800       810       820       830       840        
pF1KA1 DLDPFQEALEERRYPGEVTIPSPKPKYPQCKESKKDLITLSGCPLADKSIRSMLATSSQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DLDPFQEALEERRYPGEVTIPSPKPKYPQCKESKKDLITLSGCPLADKSIRSMLATSSQE
              850       860       870       880       890       900

      850       860       870       880       890       900        
pF1KA1 LKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRAKKSGIRIAQSKEDKEDQEPIRCPVPGCDGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRAKKSGIRIAQSKEDKEDQEPIRCPVPGCDGQ
              910       920       930       940       950       960

      910       920       930       940       950       960        
pF1KA1 GHITGKYASHRSASGCPLAAKRQKDGYLNGSQFSWKSVKTEGMSCPTPGCDGSGHVSGSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GHITGKYASHRSASGCPLAAKRQKDGYLNGSQFSWKSVKTEGMSCPTPGCDGSGHVSGSF
              970       980       990      1000      1010      1020

      970       980       990      1000      1010      1020        
pF1KA1 LTHRSLSGCPRATSAMKKAKLSGEQMLTIKQRASNGIENDEEIKQLDEEIKELNESNSQM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LTHRSLSGCPRATSAMKKAKLSGEQMLTIKQRASNGIENDEEIKQLDEEIKELNESNSQM
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

     1030      1040      1050      1060      1070      1080        
pF1KA1 EADMIKLRTQITTMESNLKTIEEENKVIEQQNESLLHELANLSQSLIHSLANIQLPHMDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EADMIKLRTQITTMESNLKTIEEENKVIEQQNESLLHELANLSQSLIHSLANIQLPHMDP
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

     1090      1100      1110      1120      1130  
pF1KA1 INEQNFDAYVTTLTEMYTNQDRYQSPENKALLENIKQAVRGIQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 INEQNFDAYVTTLTEMYTNQDRYQSPENKALLENIKQAVRGIQV
             1150      1160      1170      1180    

>>CCDS77378.1 MYT1L gene_id:23040|Hs108|chr2              (1186 aa)
 initn: 5495 init1: 4725 opt: 6971  Z-score: 4755.1  bits: 891.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7406; 95.4% identity (95.4% similar) in 1164 aa overlap (23-1132:23-1186)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MEVDTEEKRHRTRSKGVRVPVEPAIQELFSCPTPGCDGSGHVSGKYARHRSVYGCPLAKK
                             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MEVDTEEKRHRTRSKGVRVPVEPAIQELFSCPTPGCDGSGHVSGKYARHRSVYGCPLAKK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100                    
pF1KA1 RKTQDKQPQEPAPKRKPFAVKADSSSVDECDDSDGTEDMDEKEEDEGEE-----------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::           
CCDS77 RKTQDKQPQEPAPKRKPFAVKADSSSVDECDDSDGTEDMDEKEEDEGEEYSEDNDEPGDE
               70        80        90       100       110       120

                                              110       120        
pF1KA1 -----------------------------------------EEEEEENEDHQMNCHNTRI
                                                :::::::::::::::::::
CCDS77 DEEDEEGDREEEEEIEEEDEDDDEDGEDVEDEEEEEEEEEEEEEEEENEDHQMNCHNTRI
              130       140       150       160       170       180

      130       140       150       160       170       180        
pF1KA1 MQDTEKDDNNNDEYDNYDELVAKSLLNLGKIAEDAAYRARTESEMNSNTSNSLEDDSDKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MQDTEKDDNNNDEYDNYDELVAKSLLNLGKIAEDAAYRARTESEMNSNTSNSLEDDSDKN
              190       200       210       220       230       240

      190       200       210       220       230       240        
pF1KA1 ENLGRKSELSLDLDSDVVRETVDSLKLLAQGHGVVLSENMNDRNYADSMSQQDSRNMNYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ENLGRKSELSLDLDSDVVRETVDSLKLLAQGHGVVLSENMNDRNYADSMSQQDSRNMNYV
              250       260       270       280       290       300

      250       260       270       280       290       300        
pF1KA1 MLGKPMNNGLMEKMVEESDEEVCLSSLECLRNQCFDLARKLSETNPQERNPQQNMNIRQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MLGKPMNNGLMEKMVEESDEEVCLSSLECLRNQCFDLARKLSETNPQERNPQQNMNIRQH
              310       320       330       340       350       360

      310       320       330       340       350       360        
pF1KA1 VRPEEDFPGRTPDRNYSDMLNLMRLEEQLSPRSRVFASCAKEDGCHERDDDTTSVNSDRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VRPEEDFPGRTPDRNYSDMLNLMRLEEQLSPRSRVFASCAKEDGCHERDDDTTSVNSDRS
              370       380       390       400       410       420

      370       380       390       400       410       420        
pF1KA1 EEVFDMTKGNLTLLEKAIALETERAKAMREKMAMEAGRRDNMRSYEDQSPRQLPGEDRKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EEVFDMTKGNLTLLEKAIALETERAKAMREKMAMEAGRRDNMRSYEDQSPRQLPGEDRKP
              430       440       450       460       470       480

      430       440         450       460       470       480      
pF1KA1 KSSDSHVKKPYY--DPSRTEKKESKCPTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGCPHKDRVPPEI
       ::::::::::::  ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KSSDSHVKKPYYGKDPSRTEKKESKCPTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGCPHKDRVPPEI
              490       500       510       520       530       540

        490       500       510       520       530       540      
pF1KA1 LAMHESVLKCPTPGCTGRGHVNSNRNSHRSLSGCPIAAAEKLAKAQEKHQSCDVSKSSQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LAMHESVLKCPTPGCTGRGHVNSNRNSHRSLSGCPIAAAEKLAKAQEKHQSCDVSKSSQA
              550       560       570       580       590       600

        550       560       570       580       590       600      
pF1KA1 SDRVLRPMCFVKQLEIPQYGYRNNVPTTTPRSNLAKELEKYSKTSFEYNSYDNHTYGKRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SDRVLRPMCFVKQLEIPQYGYRNNVPTTTPRSNLAKELEKYSKTSFEYNSYDNHTYGKRA
              610       620       630       640       650       660

        610       620       630       640       650       660      
pF1KA1 IAPKVQTRDISPKGYDDAKRYCKDPSPSSSSTSSYAPSSSSNLSCGGGSSASSTCSKSSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 IAPKVQTRDISPKGYDDAKRYCKDPSPSSSSTSSYAPSSSSNLSCGGGSSASSTCSKSSF
              670       680       690       700       710       720

        670       680       690       700       710       720      
pF1KA1 DYTHDMEAAHMAATAILNLSTRCREMPQNLSTKPQDLCATRNPDMEVDENGTLDLSMNKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DYTHDMEAAHMAATAILNLSTRCREMPQNLSTKPQDLCATRNPDMEVDENGTLDLSMNKQ
              730       740       750       760       770       780

        730       740       750       760       770       780      
pF1KA1 RPRDSCCPILTPLEPMSPQQQAVMNNRCFQLGEGDCWDLPVDYTKMKPRRIDEDESKDIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RPRDSCCPILTPLEPMSPQQQAVMNNRCFQLGEGDCWDLPVDYTKMKPRRIDEDESKDIT
              790       800       810       820       830       840

        790       800       810       820       830       840      
pF1KA1 PEDLDPFQEALEERRYPGEVTIPSPKPKYPQCKESKKDLITLSGCPLADKSIRSMLATSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PEDLDPFQEALEERRYPGEVTIPSPKPKYPQCKESKKDLITLSGCPLADKSIRSMLATSS
              850       860       870       880       890       900

        850       860       870       880       890       900      
pF1KA1 QELKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRAKKSGIRIAQSKEDKEDQEPIRCPVPGCD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QELKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRAKKSGIRIAQSKEDKEDQEPIRCPVPGCD
              910       920       930       940       950       960

        910       920       930       940       950       960      
pF1KA1 GQGHITGKYASHRSASGCPLAAKRQKDGYLNGSQFSWKSVKTEGMSCPTPGCDGSGHVSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GQGHITGKYASHRSASGCPLAAKRQKDGYLNGSQFSWKSVKTEGMSCPTPGCDGSGHVSG
              970       980       990      1000      1010      1020

        970       980       990      1000      1010      1020      
pF1KA1 SFLTHRSLSGCPRATSAMKKAKLSGEQMLTIKQRASNGIENDEEIKQLDEEIKELNESNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SFLTHRSLSGCPRATSAMKKAKLSGEQMLTIKQRASNGIENDEEIKQLDEEIKELNESNS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

       1030      1040      1050      1060      1070      1080      
pF1KA1 QMEADMIKLRTQITTMESNLKTIEEENKVIEQQNESLLHELANLSQSLIHSLANIQLPHM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QMEADMIKLRTQITTMESNLKTIEEENKVIEQQNESLLHELANLSQSLIHSLANIQLPHM
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

       1090      1100      1110      1120      1130  
pF1KA1 DPINEQNFDAYVTTLTEMYTNQDRYQSPENKALLENIKQAVRGIQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DPINEQNFDAYVTTLTEMYTNQDRYQSPENKALLENIKQAVRGIQV
             1150      1160      1170      1180      

>>CCDS13558.1 MYT1 gene_id:4661|Hs108|chr20               (1121 aa)
 initn: 2422 init1: 1572 opt: 2910  Z-score: 1991.2  bits: 380.3 E(32554): 1.4e-104
Smith-Waterman score: 3312; 48.3% identity (68.9% similar) in 1212 aa overlap (1-1132:1-1121)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MEVDTEEKRHRTRSKGVRVPVEPAIQELFSCPTPGCDGSGHVSGKYARHRSVYGCPLAKK
       : ...:.:: :::::..: : : .  .: ::::::: ::::: :::.::::. .::::::
CCDS13 MSLENEDKRARTRSKALRGPPETTAADL-SCPTPGCTGSGHVRGKYSRHRSLQSCPLAKK
               10        20         30        40        50         

               70        80        90         100                  
pF1KA1 RKTQDKQPQEPAPKRKPFAVKADSSSVDECD--DSDGTEDMDEKEED---------EGEE
       :: .  . .. . :::   .:    ..::    ::::.:: . :. .         :: :
CCDS13 RKLEGAEAEHLVSKRKSHPLKL---ALDEGYGVDSDGSEDTEVKDASVSDESEGTLEGAE
      60        70        80           90       100       110      

     110       120       130               140       150       160 
pF1KA1 EEEEEENEDHQMNCHNTRIMQDTEKDDN--------NNDEYDNYDELVAKSLLNLGKIAE
        :   ..: :. .  . :    ..  .:        ..  :..:. ..: ::::::.:::
CCDS13 AETSGQDEIHRPETAEGRSPVKSHFGSNPIGSATASSKGSYSSYQGIIATSLLNLGQIAE
        120       130       140       150       160       170      

               170       180       190        200       210        
pF1KA1 DAAYRART--ESEMNSNTSNSLEDDSDKNENL-GRKSELSLDLDSDVVRETVDSLKLLAQ
       ..  .      .. . .  . :.. ..   .  :.:. .    :.. : : : . .    
CCDS13 ETLVEEDLGQAAKPGPGIVHLLQEAAEGAASEEGEKGLFIQPEDAEEVVE-VTTER----
        180       190       200       210       220        230     

      220       230       240       250       260       270        
pF1KA1 GHGVVLSENMNDRNYADSMSQQDSRNMNYVMLGKPMNNGLMEKMVEESDEEVCLSSLECL
             :...  ..  :. :...:.. . .   .  ..   :.  :: :::         
CCDS13 ------SQDLCPQSLEDAASEESSKQKGILSHEEEDEEEEEEEEEEEEDEE---------
                   240       250       260       270               

      280       290       300       310       320       330        
pF1KA1 RNQCFDLARKLSETNPQERNPQQNMNIRQHVRPEEDFPGRTPDRNYSDMLNLMRLEEQLS
       ...  .  ..  : . .:.. ... . .... :.  :   :   . .   .: :  :. :
CCDS13 EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAAPDVIFQEDTSHTSAQKAPEL-RGPESPS
        280       290       300       310       320        330     

      340         350       360          370       380       390   
pF1KA1 PRSR--VFASCAKEDGCHERDDDTTSVNS---DRSEEVFDMTKGNLTLLEKAIALETERA
       :. .  :..   ..:   ..:.:: : .:   :.::    ::.::: :::.::::..:..
CCDS13 PKPEYSVIVEVRSDD---DKDEDTHSRKSTVTDESEMQDMMTRGNLGLLEQAIALKAEQV
         340       350          360       370       380       390  

           400       410       420         430       440           
pF1KA1 KAMREKMAMEAGRRDNMRSYEDQSPRQL--PGEDRKPKSSDSHVKKPYY--DPSRTEKKE
       ... :     :          .::   :  ::.  :: ..   :.: ::  ::::.::.:
CCDS13 RTVCEPGCPPA----------EQSQLGLGEPGKAAKPLDT---VRKSYYSKDPSRAEKRE
            400                 410       420          430         

     450       460       470       480       490       500         
pF1KA1 SKCPTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGCPHKDRVPPEILAMHESVLKCPTPGCTGRGHVNS
        :::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::.:::::
CCDS13 IKCPTPGCDGTGHVTGLYPHHRSLSGCPHKDRIPPEILAMHENVLKCPTPGCTGQGHVNS
     440       450       460       470       480       490         

     510       520       530         540       550       560       
pF1KA1 NRNSHRSLSGCPIAAAEKLAKAQEKHQ--SCDVSKSSQASDRVLRPMCFVKQLEIPQYG-
       :::.:::::::::::::::::..::.:  . : ::::. :::.:::::::::::.: :: 
CCDS13 NRNTHRSLSGCPIAAAEKLAKSHEKQQPQTGDPSKSSSNSDRILRPMCFVKQLEVPPYGS
     500       510       520       530       540       550         

        570       580       590       600       610       620      
pF1KA1 YRNNVPTTTPRSNLAKELEKYSKTSFEYNSYDNHTYGKRAIAPKVQTRDISPKGYDDAKR
       :: ::  .:::.::::::::.::..:.: :.: ...::: .:::.:: . :::...    
CCDS13 YRPNVAPATPRANLAKELEKFSKVTFDYASFDAQVFGKRMLAPKIQTSETSPKAFQ----
     560       570       580       590       600       610         

        630       640       650       660       670       680      
pF1KA1 YCKDPSPSSSSTSSYAPSSSSNLSCGGGSSASSTCSKSSFDYTHDMEAAHMAATAILNLS
        :                                     :::..: ::::::::::::::
CCDS13 -C-------------------------------------FDYSQDAEAAHMAATAILNLS
                                               620       630       

        690       700       710       720       730                
pF1KA1 TRCREMPQNLSTKPQDLCATRNPDMEVDENGTLDLSMNKQRPRDSCCP----------IL
       ::: :::.:::::::::  ... :.::::::::::::.:.: :..  :          . 
CCDS13 TRCWEMPENLSTKPQDL-PSKSVDIEVDENGTLDLSMHKHRKRENAFPSSSSCSSSPGVK
       640       650        660       670       680       690      

        740            750       760       770       780           
pF1KA1 TPLEPM-----SPQQQAVMNNRCFQLGEGDCWDLPVDYTKMKPRRIDEDESKDITP----
       .:   .     :  .... . .  : .. : :: :.::::  : :. :.: ..  :    
CCDS13 SPDASQRHSSTSAPSSSMTSPQSSQASRQDEWDRPLDYTK--PSRLREEEPEESEPAAHS
        700       710       720       730         740       750    

             790       800       810       820                     
pF1KA1 ------EDLDPFQEALEERRYPGEVTIPSPKPKYPQCKESKKDLIT--------------
             .: .  .: .:::.::::::. . : :.   :. ::.:.:              
CCDS13 FASSEADDQEVSEENFEERKYPGEVTLTNFKLKF-LSKDIKKELLTCPTPGCDGSGHITG
          760       770       780        790       800       810   

              830       840       850       860       870       880
pF1KA1 -------LSGCPLADKSIRSMLATSSQELKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRAKK
              ::::::::::.:...:. : .::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NYASHRSLSGCPLADKSLRNLMAAHSADLKCPTPGCDGSGHITGNYASHRSLSGCPRAKK
           820       830       840       850       860       870   

              890       900       910       920       930       940
pF1KA1 SGIRIAQSKEDKEDQEPIRCPVPGCDGQGHITGKYASHRSASGCPLAAKRQKDGYLNGSQ
       ::...: .:.:::: : ..:::::: : :::.::::::::::::::::.:::.: ::::.
CCDS13 SGVKVAPTKDDKEDPELMKCPVPGCVGLGHISGKYASHRSASGCPLAARRQKEGSLNGSS
           880       890       900       910       920       930   

              950       960       970       980       990      1000
pF1KA1 FSWKSVKTEGMSCPTPGCDGSGHVSGSFLTHRSLSGCPRATSAMKKAKLSGEQMLTIKQR
       :::::.:.:: .:::::::::::..:::::::::::::::: : ::.::::...:. : .
CCDS13 FSWKSLKNEGPTCPTPGCDGSGHANGSFLTHRSLSGCPRATFAGKKGKLSGDEVLSPKFK
           940       950       960       970       980       990   

             1010      1020      1030      1040      1050      1060
pF1KA1 ASNGIENDEEIKQLDEEIKELNESNSQMEADMIKLRTQITTMESNLKTIEEENKVIEQQN
       .:. .:::::::::..::..::::::.::: :..:..::..::.:::.::::::.::.::
CCDS13 TSDVLENDEEIKQLNQEIRDLNESNSEMEAAMVQLQSQISSMEKNLKNIEEENKLIEEQN
          1000      1010      1020      1030      1040      1050   

             1070      1080      1090      1100      1110      1120
pF1KA1 ESLLHELANLSQSLIHSLANIQLPHMDPINEQNFDAYVTTLTEMYTNQDRYQSPENKALL
       :.:. ::..:::.::.:::::.::::.:: ::::::::.:::.::.:::    :::: ::
CCDS13 EALFLELSGLSQALIQSLANIRLPHMEPICEQNFDAYVSTLTDMYSNQD----PENKDLL
          1060      1070      1080      1090      1100             

             1130  
pF1KA1 ENIKQAVRGIQV
       :.::::::::::
CCDS13 ESIKQAVRGIQV
    1110      1120 

>>CCDS6149.1 ST18 gene_id:9705|Hs108|chr8                 (1047 aa)
 initn: 1341 init1: 722 opt: 2249  Z-score: 1541.7  bits: 297.0 E(32554): 1.5e-79
Smith-Waterman score: 2750; 43.0% identity (67.1% similar) in 1174 aa overlap (1-1132:1-1047)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MEVDTEEKRHRTRSKGVRVPVEPAIQELFSCPTPGCDGSGHVSGKYARHRSVYGCPLAKK
       :....:.:  ::::::..::..  ::::                       .: : .:::
CCDS61 MDAEAEDKTLRTRSKGTEVPMDSLIQEL---------------------SVAYDCSMAKK
               10        20                             30         

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 RKTQDKQPQEPAPKRKPFAVKADSSSVDECDDSDGTEDMDEKEEDEGEEEEEEEENEDHQ
       : ..:.    :. ::: . .:    :      .:  :: ... ::.:  : . . . .. 
CCDS61 RTAEDQALGVPVNKRKSLLMKPRHYS----PKADCQEDRSDRTEDDGPLETHGHSTAEEI
      40        50        60            70        80        90     

              130         140       150       160       170        
pF1KA1 MNCHNTRIMQDTEKDDNN--NDEYDNYDELVAKSLLNLGKIAEDAAYRARTESEMNSNTS
       :     . . .: .....  .:.:. :.::..:::..:::. .... .. .:. .:..  
CCDS61 MIKPMDESLLSTAQENSSRKEDRYSCYQELMVKSLMHLGKFEKNVSVQTVSEN-LNDSGI
         100       110       120       130       140        150    

      180       190       200       210       220       230        
pF1KA1 NSLEDDSDKNENLGRKSELSLDLDSDVVRETVDSLKLLAQGHGVVLSENMNDRNYADSMS
       .::. .::. ..        . . ::  :. .:. .    .     :.. . .:  :: :
CCDS61 QSLKAESDEADE-------CFLIHSDDGRDKIDDSQPPFCSSDDNESNSESAENGWDSGS
          160              170       180       190       200       

           240       250       260       270       280       290   
pF1KA1 Q-----QDSRNMNYVMLGKPMNNGLMEKMVEESDEEVCLSSLECLRNQCFDLARKLSETN
       .     .  :  .::.  .  .   . ..  :.:. .      : .:.: :     ::: 
CCDS61 NFSEETKPPRVPKYVLTDHKKDLLEVPEIKTEGDKFI-----PC-ENRC-D-----SET-
       210       220       230       240             250           

           300       310       320       330       340       350   
pF1KA1 PQERNPQQNMNIRQHVRPEEDFPGRTPDRNYSDMLNLMRLEEQLSPRSRVFASCAKEDGC
        ....::. .         : . : .   .. :.                          
CCDS61 -ERKDPQNALA--------EPLDGNAQP-SFPDV--------------------------
           260               270                                   

           360       370       380       390       400       410   
pF1KA1 HERDDDTTSVNSDRSEEVFDMTKGNLTLLEKAIALETERAKAMREKMAMEAGRRDNMRSY
       .:.:... .: .... .. . .::::.:::.::::..::. ...          ....  
CCDS61 EEEDSESLAVMTEEGSDL-EKAKGNLSLLEQAIALQAERGCVFH----------NTYKEL
      280       290        300       310       320                 

           420       430       440         450       460       470 
pF1KA1 EDQSPRQLPGEDRKPKSSDSHVKKPYYDPS--RTEKKESKCPTPGCDGTGHVTGLYPHHR
       .    ..: :: :. :  :   .. . .    : ::.:.::: :::::::::::::::::
CCDS61 DRFLLEHLAGERRQTKVIDMGGRQIFNNKHSPRPEKRETKCPIPGCDGTGHVTGLYPHHR
       330       340       350       360       370       380       

             480       490       500       510       520       530 
pF1KA1 SLSGCPHKDRVPPEILAMHESVLKCPTPGCTGRGHVNSNRNSHRSLSGCPIAAAEKLAKA
       :::::::: ::: :::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: .
CCDS61 SLSGCPHKVRVPLEILAMHENVLKCPTPGCTGRGHVNSNRNTHRSLSGCPIAAAEKLAMS
       390       400       410       420       430       440       

             540       550       560       570          580        
pF1KA1 QEKHQSCDVSKSSQASDRVLRPMCFVKQLEIPQYGYRNNVPT---TTPRSNLAKELEKYS
       :.:.:  :  ...:  :.. :   .:::.:.       : :.   :.::....:: ::..
CCDS61 QDKNQ-LDSPQTGQCPDQAHRT-SLVKQIEF-------NFPSQAITSPRATVSKEQEKFG
       450        460        470              480       490        

      590       600       610       620       630       640        
pF1KA1 KTSFEYNSYDNHTYGKRAIAPKVQTRDISPKGYDDAKRYCKDPSPSSSSTSSYAPSSSSN
       :. :.: :.: ...::: .   :: :   :  . ..:..   :.: .    .  ::.   
CCDS61 KVPFDYASFDAQVFGKRPLIQTVQGRKTPP--FPESKHF---PNPVK--FPNRLPSA---
      500       510       520         530          540             

      650       660       670       680        690       700       
pF1KA1 LSCGGGSSASSTCSKSSFDYTHDMEAAHMAATA-ILNLSTRCREMPQNLSTKPQDLCATR
            :. ..:    ::..: .  : .:.::.: ::::::::::  . ::.:::.: : .
CCDS61 -----GAHTQSPGRASSYSYGQCSEDTHIAAAAAILNLSTRCREATDILSNKPQSLHA-K
           550       560       570       580       590       600   

       710       720       730            740        750           
pF1KA1 NPDMEVDENGTLDLSMNKQRPRDSCCPILT-----PLEPMSP-QQQAVMNNRCFQ--LGE
       . ..::::::::::::.:.:  :.  :. .     :    :: . .... :  :   : .
CCDS61 GAEIEVDENGTLDLSMKKNRILDKSAPLTSSNTSIPTPSSSPFKTSSILVNAAFYQALCD
            610       620       630       640       650       660  

     760       770       780       790       800       810         
pF1KA1 GDCWDLPVDYTKMKPRRIDEDESKDITPEDLDPFQEALEERRYPGEVTIPSPKPKYPQCK
        . :: :..:.: . .  .: :.  ..        : :::...:::..:::::::  . .
CCDS61 QEGWDTPINYSKTHGKTEEEKEKDPVSS------LENLEEKKFPGEASIPSPKPKL-HAR
            670       680       690             700       710      

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pF1KA1 ESKKDLIT---------------------LSGCPLADKSIRSMLATSSQELKCPTPGCDG
       . ::.:::                     .::::::::...:..:..:::::::::::::
CCDS61 DLKKELITCPTPGCDGSGHVTGNYASHRSVSGCPLADKTLKSLMAANSQELKCPTPGCDG
         720       730       740       750       760       770     

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pF1KA1 SGHITGNYASHRSLSGCPRAKKSGIRIAQSKEDKEDQEPIRCPVPGCDGQGHITGKYASH
       :::.::::::::::::::::.:.:.... .::.::: : ..::: ::::::::.:::.::
CCDS61 SGHVTGNYASHRSLSGCPRARKGGVKMTPTKEEKEDPE-LKCPVIGCDGQGHISGKYTSH
         780       790       800       810        820       830    

      920       930       940       950       960       970        
pF1KA1 RSASGCPLAAKRQKDGYLNGSQFSWKSVKTEGMSCPTPGCDGSGHVSGSFLTHRSLSGCP
       :.::::::::::::.. :::...:::  : :   :: :::.: :::.. :.:::::::::
CCDS61 RTASGCPLAAKRQKENPLNGASLSWKLNKQELPHCPLPGCNGLGHVNNVFVTHRSLSGCP
          840       850       860       870       880       890    

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pF1KA1 RATSAMKKAKLSGEQMLTIKQRASNGIENDEEIKQLDEEIKELNESNSQMEADMIKLRTQ
         ....::.:.: :...::: .:..:::.::::..:::::::::::: ..::::.::.::
CCDS61 LNAQVIKKGKVS-EELMTIKLKATGGIESDEEIRHLDEEIKELNESNLKIEADMMKLQTQ
          900        910       920       930       940       950   

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pF1KA1 ITTMESNLKTIEEENKVIEQQNESLLHELANLSQSLIHSLANIQLPHMDPINEQNFDAYV
       ::.:::::::::::::.:::.:::::.:::.:::.:: :::.::::.: ::.::::.:::
CCDS61 ITSMESNLKTIEEENKLIEQNNESLLKELAGLSQALISSLADIQLPQMGPISEQNFEAYV
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pF1KA1 TTLTEMYTNQDRYQSPENKALLENIKQAVRGIQV
       .:::.::.: .:  ::: :::::.:::::.::.:
CCDS61 NTLTDMYSNLERDYSPECKALLESIKQAVKGIHV
          1020      1030      1040       




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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