Result of FASTA (omim) for
pF1KA1114
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1114, 1431 aa
1>>>pF1KA1114 1431 - 1431 aa - 1431 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3875+/-0.000577; mu= 5.6430+/- 0.036
mean_var=303.0842+/-61.090, 0's: 0 Z-trim(115.5): 298 B-trim: 25 in 1/56
Lambda= 0.073670
statistics sampled from 25639 (25948) to 25639 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.607), E-opt: 0.2 (0.304), width: 16
Scan time: 17.830
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011529111 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin i (1431) 9241 997.8 0
XP_006724663 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin i (1431) 9241 997.8 0
XP_016885256 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin i (1431) 9241 997.8 0
XP_011529115 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin i (1431) 9241 997.8 0
NP_001034794 (OMIM: 300132) trophinin isoform 5 [H (1431) 9241 997.8 0
XP_011529113 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin i (1431) 9241 997.8 0
XP_011529110 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin i (1431) 9241 997.8 0
XP_011529114 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin i (1431) 9241 997.8 0
XP_011529116 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin i (1387) 8928 964.6 0
XP_016885257 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin i (1387) 8928 964.6 0
NP_001258113 (OMIM: 300132) trophinin isoform 7 [H (1034) 6714 729.1 4.1e-209
NP_001258112 (OMIM: 300132) trophinin isoform 6 [H ( 962) 6326 687.8 1e-196
XP_016885259 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin i ( 706) 4157 457.2 2.1e-127
NP_057241 (OMIM: 300132) trophinin isoform 2 [Homo ( 706) 4157 457.2 2.1e-127
NP_808224 (OMIM: 300132) trophinin isoform 2 [Homo ( 706) 4157 457.2 2.1e-127
XP_016885258 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin i ( 706) 4157 457.2 2.1e-127
XP_016885260 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin i ( 706) 4157 457.2 2.1e-127
XP_016885262 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin i ( 662) 3844 423.9 2e-117
XP_016885261 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin i ( 662) 3844 423.9 2e-117
NP_808225 (OMIM: 300132) trophinin isoform 4 [Homo ( 309) 1630 188.2 8.2e-47
NP_957516 (OMIM: 300470,300971) melanoma-associate ( 606) 1431 167.4 3e-40
NP_055414 (OMIM: 300470,300971) melanoma-associate ( 606) 1431 167.4 3e-40
NP_803182 (OMIM: 300470,300971) melanoma-associate ( 606) 1431 167.4 3e-40
XP_016885468 (OMIM: 300224) PREDICTED: melanoma-as ( 778) 1331 156.9 5.7e-37
XP_016885467 (OMIM: 300224) PREDICTED: melanoma-as ( 778) 1331 156.9 5.7e-37
XP_011529137 (OMIM: 300224) PREDICTED: melanoma-as ( 778) 1331 156.9 5.7e-37
NP_001005332 (OMIM: 300224) melanoma-associated an ( 778) 1331 156.9 5.7e-37
NP_008917 (OMIM: 300224) melanoma-associated antig ( 778) 1331 156.9 5.7e-37
XP_016885469 (OMIM: 300224) PREDICTED: melanoma-as ( 778) 1331 156.9 5.7e-37
NP_001092270 (OMIM: 300702) melanoma-associated an ( 739) 1330 156.7 6e-37
XP_011529124 (OMIM: 300765) PREDICTED: melanoma-as ( 739) 1330 156.7 6e-37
NP_803881 (OMIM: 300765) melanoma-associated antig ( 739) 1330 156.7 6e-37
XP_016885365 (OMIM: 300765) PREDICTED: melanoma-as ( 739) 1330 156.7 6e-37
NP_110428 (OMIM: 300765) melanoma-associated antig ( 741) 1330 156.7 6e-37
NP_803879 (OMIM: 300765) melanoma-associated antig ( 741) 1330 156.7 6e-37
XP_006724670 (OMIM: 300765) PREDICTED: melanoma-as ( 741) 1330 156.7 6e-37
NP_001258991 (OMIM: 300702) melanoma-associated an ( 741) 1330 156.7 6e-37
NP_001258992 (OMIM: 300702) melanoma-associated an ( 741) 1330 156.7 6e-37
XP_006724671 (OMIM: 300765) PREDICTED: melanoma-as ( 741) 1330 156.7 6e-37
NP_001005333 (OMIM: 300224) melanoma-associated an ( 834) 1331 156.9 6e-37
NP_001229291 (OMIM: 300765) melanoma-associated an ( 757) 824 103.0 9.4e-21
NP_001258990 (OMIM: 300702) melanoma-associated an ( 757) 824 103.0 9.4e-21
XP_011529125 (OMIM: 300765) PREDICTED: melanoma-as ( 647) 815 101.9 1.6e-20
NP_619649 (OMIM: 608243) non-structural maintenanc ( 304) 680 87.2 2e-16
NP_071432 (OMIM: 609267) melanoma-associated antig ( 307) 678 87.0 2.4e-16
NP_065983 (OMIM: 300759) melanoma-associated antig ( 957) 648 84.4 4.7e-15
NP_061939 (OMIM: 176270,605283,615547) MAGE-like p (1249) 639 83.5 1.1e-14
NP_002478 (OMIM: 176270,602117) necdin [Homo sapie ( 321) 615 80.4 2.5e-14
NP_872312 (OMIM: 300761) melanoma-associated antig ( 347) 609 79.8 4.1e-14
NP_002358 (OMIM: 300153) melanoma-associated antig ( 346) 608 79.7 4.4e-14
>>XP_011529111 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin isofo (1431 aa)
initn: 9241 init1: 9241 opt: 9241 Z-score: 5324.9 bits: 997.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9241; 100.0% identity (100.0% similar) in 1431 aa overlap (1-1431:1-1431)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MDRRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MDRRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 PVVNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PVVNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 TTEVTNTQASSVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTEVTNTQASSVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 KGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 DQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 RSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 YFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVIL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 PEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEAR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 AEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 VNFSRGASTRAGFSDGASISFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VNFSRGASTRAGFSDGASISFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 LSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSAT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 FSGGASSGFGGTLSTTAGFSGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FSGGASSGFGGTLSTTAGFSGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 GSPSSSGSFGGTLSTSICFGGSPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSPSSSGSFGGTLSTSICFGGSPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFD
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 GSPSTGAGFGGALNTSASFGSVLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSPSTGAGFGGALNTSASFGSVLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 SALNTNAGYGGAVSTNTDFGGTLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SALNTNAGYGGAVSTNTDFGGTLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 GAVSTSACFSGAPITNPGFGGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GAVSTSACFSGAPITNPGFGGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 GAHGTSLCFGGAPSTSLCFGSASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GAHGTSLCFGGAPSTSLCFGSASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 NGLSTNAGFGGGLNTSAGFGGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NGLSTNAGFGGGLNTSAGFGGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 GGLGTSAGFSGGLGTSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GGLGTSAGFSGGLGTSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 SRPNASFDRGLSTIIGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRPNASFDRGLSTIIGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSG
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA1 PSTSGFSGGPSTGAGFGGGPNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PSTSGFSGGPSTGAGFGGGPNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
1390 1400 1410 1420 1430
>>XP_006724663 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin isofo (1431 aa)
initn: 9241 init1: 9241 opt: 9241 Z-score: 5324.9 bits: 997.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9241; 100.0% identity (100.0% similar) in 1431 aa overlap (1-1431:1-1431)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MDRRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MDRRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 PVVNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PVVNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 TTEVTNTQASSVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TTEVTNTQASSVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 KGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 DQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 RSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 YFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVIL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 PEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEAR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 AEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTN
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pF1KA1 VNFSRGASTRAGFSDGASISFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VNFSRGASTRAGFSDGASISFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGT
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pF1KA1 LSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSAT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GAHGTSLCFGGAPSTSLCFGSASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 NGLSTNAGFGGGLNTSAGFGGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GGLGTSAGFSGGLGTSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SRPNASFDRGLSTIIGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSG
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PSTSGFSGGPSTGAGFGGGPNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
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>>XP_016885256 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin isofo (1431 aa)
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PVVNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_016 AEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SALNTNAGYGGAVSTNTDFGGTLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GAVSTSACFSGAPITNPGFGGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GAHGTSLCFGGAPSTSLCFGSASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NGLSTNAGFGGGLNTSAGFGGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GGLGTSAGFSGGLGTSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRPNASFDRGLSTIIGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSG
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pF1KA1 PSTSGFSGGPSTGAGFGGGPNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PSTSGFSGGPSTGAGFGGGPNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
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>>XP_011529115 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin isofo (1431 aa)
initn: 9241 init1: 9241 opt: 9241 Z-score: 5324.9 bits: 997.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9241; 100.0% identity (100.0% similar) in 1431 aa overlap (1-1431:1-1431)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MDRRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MDRRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDP
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pF1KA1 PVVNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PVVNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALP
70 80 90 100 110 120
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pF1KA1 TTEVTNTQASSVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTEVTNTQASSVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQ
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pF1KA1 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
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pF1KA1 ETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKS
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pF1KA1 KGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNA
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pF1KA1 DQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE
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pF1KA1 RSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDE
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pF1KA1 YFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVIL
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pF1KA1 SVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRP
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pF1KA1 PEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEAR
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pF1KA1 AEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTN
670 680 690 700 710 720
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pF1KA1 VNFSRGASTRAGFSDGASISFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VNFSRGASTRAGFSDGASISFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGT
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pF1KA1 LSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSAT
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pF1KA1 FSGGASSGFGGTLSTTAGFSGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FSGGASSGFGGTLSTTAGFSGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSPSSSGSFGGTLSTSICFGGSPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFD
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pF1KA1 GSPSTGAGFGGALNTSASFGSVLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSPSTGAGFGGALNTSASFGSVLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SALNTNAGYGGAVSTNTDFGGTLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFS
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pF1KA1 GAVSTSACFSGAPITNPGFGGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GAVSTSACFSGAPITNPGFGGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFG
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pF1KA1 GAHGTSLCFGGAPSTSLCFGSASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GAHGTSLCFGGAPSTSLCFGSASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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pF1KA1 NGLSTNAGFGGGLNTSAGFGGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NGLSTNAGFGGGLNTSAGFGGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFG
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pF1KA1 GGLGTSAGFSGGLGTSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GGLGTSAGFSGGLGTSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRPNASFDRGLSTIIGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSG
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PSTSGFSGGPSTGAGFGGGPNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_001 NGLSTNAGFGGGLNTSAGFGGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFG
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NP_001 GGLGTSAGFSGGLGTSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFG
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NP_001 SRPNASFDRGLSTIIGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSG
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSTSGFSGGPSTGAGFGGGPNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
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>>XP_011529113 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin isofo (1431 aa)
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XP_011 MDRRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PVVNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTEVTNTQASSVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNA
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XP_011 DQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSAT
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XP_011 GSPSSSGSFGGTLSTSICFGGSPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_011 NGLSTNAGFGGGLNTSAGFGGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFG
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pF1KA1 GGLGTSAGFSGGLGTSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GGLGTSAGFSGGLGTSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFG
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pF1KA1 SRPNASFDRGLSTIIGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSG
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XP_011 SRPNASFDRGLSTIIGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSG
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KA1 PSTSGFSGGPSTGAGFGGGPNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PSTSGFSGGPSTGAGFGGGPNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
1390 1400 1410 1420 1430
>>XP_011529110 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin isofo (1431 aa)
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pF1KA1 MDRRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MDRRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDP
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pF1KA1 PVVNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PVVNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALP
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pF1KA1 TTEVTNTQASSVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTEVTNTQASSVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQ
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pF1KA1 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
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pF1KA1 ETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKS
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pF1KA1 KGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNA
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370 380 390 400 410 420
pF1KA1 DQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 RSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDE
430 440 450 460 470 480
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pF1KA1 YFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVIL
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pF1KA1 SVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRP
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pF1KA1 PEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEAR
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pF1KA1 AEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTN
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pF1KA1 VNFSRGASTRAGFSDGASISFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VNFSRGASTRAGFSDGASISFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGT
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pF1KA1 LSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSAT
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pF1KA1 FSGGASSGFGGTLSTTAGFSGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FSGGASSGFGGTLSTTAGFSGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFG
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pF1KA1 GSPSSSGSFGGTLSTSICFGGSPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSPSSSGSFGGTLSTSICFGGSPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSPSTGAGFGGALNTSASFGSVLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFG
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pF1KA1 SALNTNAGYGGAVSTNTDFGGTLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SALNTNAGYGGAVSTNTDFGGTLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFS
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pF1KA1 GAVSTSACFSGAPITNPGFGGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GAVSTSACFSGAPITNPGFGGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFG
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pF1KA1 GAHGTSLCFGGAPSTSLCFGSASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GAHGTSLCFGGAPSTSLCFGSASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFG
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pF1KA1 NGLSTNAGFGGGLNTSAGFGGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFG
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XP_011 NGLSTNAGFGGGLNTSAGFGGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFG
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pF1KA1 GGLGTSAGFSGGLGTSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFG
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XP_011 GGLGTSAGFSGGLGTSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFG
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pF1KA1 SRPNASFDRGLSTIIGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRPNASFDRGLSTIIGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSG
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pF1KA1 PSTSGFSGGPSTGAGFGGGPNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PSTSGFSGGPSTGAGFGGGPNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
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>>XP_011529114 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin isofo (1431 aa)
initn: 9241 init1: 9241 opt: 9241 Z-score: 5324.9 bits: 997.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9241; 100.0% identity (100.0% similar) in 1431 aa overlap (1-1431:1-1431)
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pF1KA1 MDRRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MDRRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDP
10 20 30 40 50 60
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pF1KA1 PVVNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PVVNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALP
70 80 90 100 110 120
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pF1KA1 TTEVTNTQASSVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTEVTNTQASSVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQ
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pF1KA1 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
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pF1KA1 ETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 KGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNA
310 320 330 340 350 360
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pF1KA1 DQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE
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pF1KA1 RSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDE
430 440 450 460 470 480
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pF1KA1 YFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVIL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEAR
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pF1KA1 AEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTN
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pF1KA1 VNFSRGASTRAGFSDGASISFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VNFSRGASTRAGFSDGASISFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGT
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pF1KA1 LSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSAT
790 800 810 820 830 840
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pF1KA1 FSGGASSGFGGTLSTTAGFSGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FSGGASSGFGGTLSTTAGFSGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFG
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pF1KA1 GSPSSSGSFGGTLSTSICFGGSPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSPSSSGSFGGTLSTSICFGGSPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFD
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pF1KA1 GSPSTGAGFGGALNTSASFGSVLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSPSTGAGFGGALNTSASFGSVLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 SALNTNAGYGGAVSTNTDFGGTLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SALNTNAGYGGAVSTNTDFGGTLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KA1 GAVSTSACFSGAPITNPGFGGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GAVSTSACFSGAPITNPGFGGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KA1 GAHGTSLCFGGAPSTSLCFGSASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GAHGTSLCFGGAPSTSLCFGSASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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pF1KA1 NGLSTNAGFGGGLNTSAGFGGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NGLSTNAGFGGGLNTSAGFGGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 GGLGTSAGFSGGLGTSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GGLGTSAGFSGGLGTSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 SRPNASFDRGLSTIIGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRPNASFDRGLSTIIGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSG
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA1 PSTSGFSGGPSTGAGFGGGPNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PSTSGFSGGPSTGAGFGGGPNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
1390 1400 1410 1420 1430
>>XP_011529116 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin isofo (1387 aa)
initn: 8928 init1: 8928 opt: 8928 Z-score: 5145.3 bits: 964.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8928; 100.0% identity (100.0% similar) in 1387 aa overlap (45-1431:1-1387)
20 30 40 50 60 70
pF1KA1 QGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDPPVVNRPKKSKTKKA
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MHTLLAATKDSLAMDPPVVNRPKKSKTKKA
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KA1 PIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALPTTEVTNTQASSVTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALPTTEVTNTQASSVTA
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 QPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQNIHAPIANESASSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQNIHAPIANESASSQ
100 110 120 130 140 150
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pF1KA1 ALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITNETASIHTTAASIRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITNETASIHTTAASIRT
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KA1 KKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKSKGKKAASRGPNSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKSKGKKAASRGPNSVS
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KA1 EISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNADQGAQAKIASAQTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNADQGAQAKIASAQTN
280 290 300 310 320 330
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pF1KA1 VSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDERSGSNYRRIPWGRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDERSGSNYRRIPWGRR
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 PAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLE
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 KMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAV
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 IWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHE
520 530 540 550 560 570
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pF1KA1 TSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAV
580 590 600 610 620 630
680 690 700 710 720 730
pF1KA1 AGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFS
640 650 660 670 680 690
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pF1KA1 DGASISFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGTLSTSSSFSSAASIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DGASISFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGTLSTSSSFSSAASIS
700 710 720 730 740 750
800 810 820 830 840 850
pF1KA1 FGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSATFSGGASSGFGGTLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSATFSGGASSGFGGTLS
760 770 780 790 800 810
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pF1KA1 TTAGFSGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFGGSPSSSGSFGGTLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTAGFSGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFGGSPSSSGSFGGTLS
820 830 840 850 860 870
920 930 940 950 960 970
pF1KA1 TSICFGGSPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFDGSPSTGAGFGGALN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TSICFGGSPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFDGSPSTGAGFGGALN
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pF1KA1 TSASFGSVLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFGSALNTNAGYGGAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TSASFGSVLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFGSALNTNAGYGGAVS
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pF1KA1 TNTDFGGTLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFSGAVSTSACFSGAPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TNTDFGGTLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFSGAVSTSACFSGAPI
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pF1KA1 TNPGFGGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFGGAHGTSLCFGGAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TNPGFGGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFGGAHGTSLCFGGAPS
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pF1KA1 TSLCFGSASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFGNGLSTNAGFGGGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TSLCFGSASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFGNGLSTNAGFGGGLN
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pF1KA1 TSAGFGGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFGGGLGTSAGFSGGLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TSAGFGGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFGGGLGTSAGFSGGLG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFGSRPNASFDRGLSTI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSGPSTSGFSGGPSTGA
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GFGGGPNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
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>>XP_016885257 (OMIM: 300132) PREDICTED: trophinin isofo (1387 aa)
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Smith-Waterman score: 8928; 100.0% identity (100.0% similar) in 1387 aa overlap (45-1431:1-1387)
20 30 40 50 60 70
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XP_016 MHTLLAATKDSLAMDPPVVNRPKKSKTKKA
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XP_016 PIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALPTTEVTNTQASSVTA
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XP_016 QPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQNIHAPIANESASSQ
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XP_016 KKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKSKGKKAASRGPNSVS
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XP_016 EISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNADQGAQAKIASAQTN
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XP_016 VSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDERSGSNYRRIPWGRR
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XP_016 PAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLE
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XP_016 KMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAV
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XP_016 IWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHE
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XP_016 TSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFS
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XP_016 DGASISFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGTLSTSSSFSSAASIS
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XP_016 FGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSATFSGGASSGFGGTLS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TTAGFSGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFGGSPSSSGSFGGTLS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TSICFGGSPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFDGSPSTGAGFGGALN
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XP_016 TSASFGSVLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFGSALNTNAGYGGAVS
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XP_016 TNPGFGGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFGGAHGTSLCFGGAPS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFGSRPNASFDRGLSTI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSGPSTSGFSGGPSTGA
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XP_016 GFGGGPNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
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1431 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 10:47:01 2016 done: Thu Nov 3 10:47:04 2016
Total Scan time: 17.830 Total Display time: 0.820
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]