Result of FASTA (omim) for
pF1KA1116
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1116, 1271 aa
1>>>pF1KA1116 1271 - 1271 aa - 1271 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.2503+/-0.000549; mu= -21.6270+/- 0.034
mean_var=743.5602+/-155.170, 0's: 0 Z-trim(122.9): 21 B-trim: 870 in 1/60
Lambda= 0.047034
statistics sampled from 41813 (41838) to 41813 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.763), E-opt: 0.2 (0.491), width: 16
Scan time: 12.780
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001273128 (OMIM: 616024) protein SCAF8 isoform (1271) 8658 604.1 2e-171
NP_055707 (OMIM: 616024) protein SCAF8 isoform d [ (1271) 8658 604.1 2e-171
NP_001273123 (OMIM: 616024) protein SCAF8 isoform (1316) 8658 604.1 2e-171
NP_001273117 (OMIM: 616024) protein SCAF8 isoform (1349) 8658 604.1 2.1e-171
NP_001273118 (OMIM: 616024) protein SCAF8 isoform (1337) 8599 600.1 3.3e-170
XP_005261074 (OMIM: 616023) PREDICTED: splicing fa (1088) 1325 106.4 1.1e-21
NP_001138916 (OMIM: 616023) splicing factor, argin (1132) 1325 106.4 1.1e-21
XP_016883904 (OMIM: 616023) PREDICTED: splicing fa (1146) 1325 106.4 1.1e-21
NP_065757 (OMIM: 616023) splicing factor, arginine (1147) 1325 106.4 1.1e-21
XP_006724098 (OMIM: 616023) PREDICTED: splicing fa (1143) 1316 105.8 1.7e-21
XP_016883906 (OMIM: 616023) PREDICTED: splicing fa (1066) 1273 102.9 1.3e-20
XP_016883905 (OMIM: 616023) PREDICTED: splicing fa (1124) 1273 102.9 1.3e-20
NP_001138917 (OMIM: 616023) splicing factor, argin (1125) 1273 102.9 1.3e-20
XP_006724099 (OMIM: 616023) PREDICTED: splicing fa (1121) 1264 102.3 2e-20
>>NP_001273128 (OMIM: 616024) protein SCAF8 isoform d [H (1271 aa)
initn: 8658 init1: 8658 opt: 8658 Z-score: 3198.6 bits: 604.1 E(85289): 2e-171
Smith-Waterman score: 8658; 99.9% identity (100.0% similar) in 1271 aa overlap (1-1271:1-1271)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 PGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 QITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 HQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 GSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLW
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 VGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 TVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 VSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSL
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730 740 750 760 770 780
pF1KA1 SMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 GENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGI
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850 860 870 880 890 900
pF1KA1 IAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNNSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQ
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQ
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910 920 930 940 950 960
pF1KA1 PPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 ALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 IETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 RRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 FGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 GATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270
pF1KA1 PVVESTETEGT
:::::::::::
NP_001 PVVESTETEGT
1270
>>NP_055707 (OMIM: 616024) protein SCAF8 isoform d [Homo (1271 aa)
initn: 8658 init1: 8658 opt: 8658 Z-score: 3198.6 bits: 604.1 E(85289): 2e-171
Smith-Waterman score: 8658; 99.9% identity (100.0% similar) in 1271 aa overlap (1-1271:1-1271)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 PGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 QITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 HQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRS
370 380 390 400 410 420
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pF1KA1 GSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLW
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pF1KA1 VGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 TVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFP
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NP_055 TVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFP
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pF1KA1 VSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSL
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NP_055 VSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSL
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pF1KA1 SMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISS
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pF1KA1 GENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGI
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850 860 870 880 890 900
pF1KA1 IAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNNSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQ
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQ
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910 920 930 940 950 960
pF1KA1 PPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 ALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 IETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 RRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 FGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 GATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270
pF1KA1 PVVESTETEGT
:::::::::::
NP_055 PVVESTETEGT
1270
>>NP_001273123 (OMIM: 616024) protein SCAF8 isoform c [H (1316 aa)
initn: 8658 init1: 8658 opt: 8658 Z-score: 3198.4 bits: 604.1 E(85289): 2e-171
Smith-Waterman score: 8658; 99.9% identity (100.0% similar) in 1271 aa overlap (1-1271:46-1316)
10 20 30
pF1KA1 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQIT
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGAGSCGPSGGECSGRRLFRRRARGLRSDNMEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQIT
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 KAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSN
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 NIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLAST
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 TTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTL
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 QIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFG
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 EDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATP
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 QDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQE
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 AKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSER
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 RAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIP
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 PRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTY
560 570 580 590 600 610
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 IPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQ
620 630 640 650 660 670
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 AEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPP
680 690 700 710 720 730
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 GFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSA
740 750 760 770 780 790
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 LPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNS
800 810 820 830 840 850
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 GILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNNSGLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
NP_001 GILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLG
860 870 880 890 900 910
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 VLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGL
920 930 940 950 960 970
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 IPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQS
980 990 1000 1010 1020 1030
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 VDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPG
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 RPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVY
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 GGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFC
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 REMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPV
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1240 1250 1260 1270
pF1KA1 QNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETEGT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETEGT
1280 1290 1300 1310
>>NP_001273117 (OMIM: 616024) protein SCAF8 isoform a [H (1349 aa)
initn: 8658 init1: 8658 opt: 8658 Z-score: 3198.3 bits: 604.1 E(85289): 2.1e-171
Smith-Waterman score: 8658; 99.9% identity (100.0% similar) in 1271 aa overlap (1-1271:79-1349)
10 20 30
pF1KA1 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQIT
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRSSPRLALPTQCSGRRLFRRRARGLRSDNMEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQIT
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 KAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSN
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 NIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLAST
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 TTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTL
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 QIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFG
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 EDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATP
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 QDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQE
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 AKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSER
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 RAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIP
530 540 550 560 570 580
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 PRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTY
590 600 610 620 630 640
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 IPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQ
650 660 670 680 690 700
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 AEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPP
710 720 730 740 750 760
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 GFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSA
770 780 790 800 810 820
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 LPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNS
830 840 850 860 870 880
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 GILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNNSGLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
NP_001 GILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLG
890 900 910 920 930 940
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 VLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGL
950 960 970 980 990 1000
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 IPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQS
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 VDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPG
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 RPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVY
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 GGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFC
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 REMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPV
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1240 1250 1260 1270
pF1KA1 QNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETEGT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETEGT
1310 1320 1330 1340
>>NP_001273118 (OMIM: 616024) protein SCAF8 isoform b [H (1337 aa)
initn: 8599 init1: 8599 opt: 8599 Z-score: 3176.7 bits: 600.1 E(85289): 3.3e-170
Smith-Waterman score: 8606; 98.3% identity (98.4% similar) in 1292 aa overlap (1-1271:46-1337)
10
pF1KA1 MEAVKTFNSE--------------------
::::::::::
NP_001 SGAGSCGPSGGECSGRRLFRRRARGLRSDNMEAVKTFNSEDCASTPACTDCFSSSMDTRS
20 30 40 50 60 70
20 30 40 50 60
pF1KA1 -LYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSI
80 90 100 110 120 130
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 VRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQ
140 150 160 170 180 190
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 PLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLA
200 210 220 230 240 250
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 AVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANT
260 270 280 290 300 310
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 LTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQ
320 330 340 350 360 370
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 QNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQ
380 390 400 410 420 430
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 QQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRK
440 450 460 470 480 490
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 RSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKAT
500 510 520 530 540 550
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 QQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWA
560 570 580 590 600 610
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVK
620 630 640 650 660 670
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 ETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPG
680 690 700 710 720 730
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 FSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKD
740 750 760 770 780 790
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 VGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIP
800 810 820 830 840 850
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 NDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNIL
860 870 880 890 900 910
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 NNSGILGIQPPSVSNNSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLP
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NNSGILGIQPPSVSNSSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLP
920 930 940 950 960 970
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 PLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGP
980 990 1000 1010 1020 1030
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 FPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISR
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 PPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 EKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDF
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 DDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGD
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pF1KA1 NVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETE
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pF1KA1 GT
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NP_001 GT
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.::: :::::::::::: ..:: : ..: ..: :: :. .:. :. :
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: :. ..:..:::::..:. ::: :.:.. .. ....: . . . : ..
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: :: . :::: : . : :. :: .. ..: .:
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: . : :. . ..: :. . . : :: . ::.:. .: ...:::
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::::..::::: : ::. .:: :::::::.:.:.: :: :.::: ::.:.::..::::
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pF1KA1 IRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAF
.. .: :::::::::::.::..::::...:.:::: ::::::::::::::. :::::::.
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pF1KA1 RALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAE
::::::: :.::...: ::::::::::.:..:::.:::.::::::::.::: ..::.: :
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pF1KA1 GGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQT-------TQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVA
:::.:..:.: .:. . . .: .:..:. :. .:. : : . : :..
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. :.: :. :.: .: :::: . .:::::.: ::::::: .::: . ::
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::.:: :::..:: .::: . : :. . ... .. .:.::...:.
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: .: .. .:: ..: .. . . : : ... ...:: : .
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. . ..:.: :... .::.:: :.: : :: :. :: ..
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. ..:: : .. :: :. :: .. :: : .. .:: . : : :: :
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:: : .: : . : :: :: : .. .::: :: . .::..
XP_005 -GPGPGPGGPEDRDGRQQPPQQPQQQPQPQAPQQPQQQQQQQPPPSQQPPPTQ--QQPQQ
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: .::. .. . :. : .:: .. .. :.: : . :: : : :
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pF1KA1 V-RDVVGRPIDPREGPGRP-PLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP--E
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: .. :. :
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pF1KA1 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKV
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pF1KA1 PGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKN
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pF1KA1 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPD--PW
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NP_001 GVFKIEIIQPLLDMAAGTSN--AAPV-AENVTNNEGSPPPPVK-VSSEPPTQATPNSVPA
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pF1KA1 VSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTA
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NP_001 VPQLPSSDAFAAVAQLFQTTQGQQLQQILQTFQ-QPPKPQSP---ALDNAVMAQVQAITA
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pF1KA1 QL----TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKE------------
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.: . . : .. . : .. .:: ::..... ... ::.:
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: : ..: :: .: : . : :. . ..: :. . .
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pF1KA1 GVEEEVFE---QEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRE
: :: . ::.:. .: ...::: ::::..::::: : ::. .:: :::::::.
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:.:.: :: :.::: ::.:.::..:::: .. .: :::::::::::.::..::::...:.
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pF1KA1 EEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTE
:::: ::::::::::::::. :::::::.::::::: :.::...: ::::::::::.:..
NP_001 EEFGPIESINMIPPRGCAYIVMVHRQDAYRALQKLSRGNYKVNQKSIKIAWALNKGIKAD
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pF1KA1 YKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQT---
:::.:::.::::::::.::: ..::.: ::::.:..:.: .:. . . .: .:..:.
NP_001 YKQYWDVELGVTYIPWDKVKPEELESFCEGGMLDSDTLNPDWKGIPK-KPENEVAQNGGA
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pF1KA1 ----TQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAML--QIPV-APAVPTV-SLVPPAFPVSMPVP
:. .:. : : . : :... :.: :. :.: .: :::: . .:
NP_001 ETSHTEPVSPIPKPLPVPVPPIPVPAPITVPPPQVPPHQPGPPVVGALQPPAFTPPLGIP
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670 680 690 700 710
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::::.: ::::::: .::: . ::::.:: :::..:: .::: . : :. . .
NP_001 PPGFGPGVPPPPPPPPFLRPGFNPMHLPPGFLPPGPPPPITPPVSIPPPHTPPISIPNST
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720 730 740 750 760 770
pF1KA1 LS-MTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQI
.. .. .:.::...:. : .: .. .:: ..: .. .
NP_001 IAGINEDTTKDLSIGN-----------------PIPTVVSGARGNAESGDSV-KMYGSAV
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pF1KA1 SSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSS
. : : ... ...:: : .. . ..:.: :... .::.::
NP_001 PPAAPTNLPTP-PVTQPVSLLGTQG---VAPGPVIGLQAPSTG----LLGARP-------
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pF1KA1 GIIAAQ-PPNILNNSGILGIQPPSVSNNSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLL
:.: : :: :. :: .. . ..:: : .. :: :. :: .
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pF1KA1 GTQPPAGPQN-LPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAP----GPRFPLIQPGIPPQRGI
. :: : .. .:: . : : :: : :: : .: : . : :: ::
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: .. .::: :: . .::.. : .::. .. . :. : .:: ..
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.. :.: : . :: : : : ::. : . : . : :.::. .:
NP_001 RERYGNRNDDRDNSNRDRREWGRRSPDRDRHRDLEER--NRRSSGHRDRERDSRDRESR-
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pF1KA1 PVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP--EKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERG
::. : .. :. : : : : .. :. :
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pF1KA1 RFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRD
NP_001 PAEATSSVEPEKDSGSAAEAPR
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pF1KA1 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKV
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pF1KA1 PGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKN
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XP_016 PGLYVIDSIVRQSRHQFGTDKDVFGPRFSKNITATFQYLYLCPSEDKSKIVRVLNLWQKN
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pF1KA1 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPD--PW
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XP_016 GVFKIEIIQPLLDMAAGTSN--AAPV-AENVTNNEGSPPPPVK-VSSEPPTQATPNSVPA
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pF1KA1 VSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTA
: :. ..:..:::::..:. :::::::..::.: : ::: ::: ....:.::.::
XP_016 VPQLPSSDAFAAVAQLFQTTQGQQLQQILQTFQ-QPPKPQSP---ALDNAVMAQVQAITA
180 190 200 210 220 230
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pF1KA1 QL----TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKE------------
:: : . .. : :: ..:.: :.::::. .. : :: :::
XP_016 QLKTTPTQPSEQKAAFPPPEQKTAFDK-LLDRFDYDDEPEAVEESKKEDTTAVTTTAPAA
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pF1KA1 -IPASQLSHVSESVNNSI---------FHQIAEQLQQ------QNLEHLRQQLLE-QQQP
.: . . : .. . : .. .:: ::..... ... ::.:
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pF1KA1 ---QKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPE--VNLDDSIDIQQQDMDIDEGQD
: : ..: :: .: : . : :. . ..: :. . .
XP_016 MHHQVPLPPNGQMPGFGLL--PTPPFPPMAQPVIPPTPPVQQPFQASFQAQNEPLTQKPH
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pF1KA1 GVEEEVFE---QEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRE
: :: . ::.:. .: ...::: ::::..::::: : ::. .:: :::::::.
XP_016 QQEMEVEQPCIQEVKRHMSDNR-KSRSRSASRSPKRRRSRSGSRSRRSRHR-RSRSRSRD
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440 450 460 470 480 490
pF1KA1 RKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLF
:.:.: :: :.::: ::.:.::..:::: .. .: :::::::::::.::..::::...:.
XP_016 RRRHSPRSRSQERRDREKERERRQKGLPQVKPETASVCSTTLWVGQLDKRTTQQDVASLL
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pF1KA1 EEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTE
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.. .. .:.::...:. : .: .. .:: ..: .. .
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1130 1140
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]